-
一例idic(15)来源的嵌合型标记染色体的遗传学分析
编辑人员丨1周前
目的:应用细胞遗传学和分子生物学检测方法明确1例嵌合型标记染色体患者的核型及其来源。方法:抽取患者的外周血样,进行染色体核型分析、基因芯片检测和荧光原位杂交检测。结果:染色体分析结果显示患者核型为mos 47,XX,+mar [45]/48,XX, +2mar[3]/ 46,XX[52];基因芯片检测结果为arr[hg19]15q11.1q11.2(20 161 372-24 314 675)×3,重复片段约4.15 Mb;荧光原位杂交显示约50%的细胞含有的标记染色体为一条包含有双份D15Z1探针位点片段的衍生双着丝粒15号标记染色体。此标记染色体未包含Prader-Willi syndrome/Angelman syndrome综合征的 SNRPN和 PML探针位点片段。 结论:当患者的核型与其表型不一致时,将细胞遗传学与分子生物学技术相结合,可以明确患者的核型和基因定位,为其后续治疗提供更精准的遗传咨询。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
一例Pallister-Killian综合征的无创产前检测及遗传学诊断
编辑人员丨1周前
目的:联合应用无创产前检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)、染色体核型分析和染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)对一例新发的胎儿额外小标记染色体(supernumerary small marker chromosome,sSMC)进行产前筛查与诊断,分析其基因型与表型的对应关系,为遗传咨询提供依据。方法:对孕妇应用NIFTY ?常规版和全因版两种试剂盒进行外周血游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)检测,通过羊膜腔穿刺术获取胎儿细胞,进行染色体核型分析和基于单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP-array)的拷贝数变异(copy number variation,CNV)分析,并用荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)进行验证。 结果:NIFTY ?常规版和全因版均提示胎儿12号染色体存在dup(chr12:707 334~33 308 759)异常,其中全因版拷贝数异常区域T-Score值为6.823,高于常规版的3.9535,高于正常阈值±3;羊水细胞常规G显带分析提示胎儿核型为47,XY,+mar;SNP-array结果显示胎儿为arr [hg19]12p13.33p11.1(173 786~34 385 641)×4;FISH证实该sSMC来自12号染色体短臂。综合上述结果考虑胎儿为新发的Pallister-Killian综合征。 结论:NIPT技术对产前筛查Pallister-Killian综合征具有一定的价值。联合多种检测技术有助于明确sSMC的来源。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
光学基因组图谱分析技术在不良生育史患者遗传学病因分析中的应用
编辑人员丨1周前
目的:探讨光学基因组图谱分析(OGM)技术在不良生育史患者遗传学病因分析中的价值。方法:选取2022年6月至2023年6月因不良生育史在南通大学附属医院就诊的4例患者(其中女性3例、男性1例)作为观察对象。所有对象均接受了400条带水平的G显带染色体核型分析和单核苷酸多态性微阵列(SNP array)技术检测;采用550条带水平的染色体核型分析对其中1例进行了验证;采用染色体C显带、N显带和荧光原位杂交(FISH)技术共同验证了另1例患者;综合判断得出4例患者均存在染色体结构变异后,采用OGM技术进行回顾性检测分析。结果:OGM技术能够准确识别隐匿性倒位inv(7)(q22.3q21.2)、复杂嵌合型X染色体缺失45,X[77]/46,X,der(X)dup(X)(q28q21.31)del(X)(q28)[32]、Y染色体无精子因子(AZF)基因区域微缺失del(Y)(q11.223q11.23);无法识别人类参考基因组中的空白区域,如核型46,XX,4qh,4qs中的随体及异染色质等。结论:OGM技术能够检测参考基因组空白区和无标记区域以外的平衡和(或)非平衡性的多种染色体畸变,可以作为新型诊断工具来分析不良生育史患者染色体显微及亚显微水平的改变。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
内源性一氧化氮对血管内皮细胞超氧化物歧化酶1活性及细胞凋亡的影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨内源性一氧化氮(NO)对人脐静脉内皮细胞(HUVECs)超氧化物歧化酶1(SOD1)活性及内皮细胞凋亡的调节作用。方法:以HUVECs为研究对象,采用内皮型一氧化氮合酶(eNOS)短发夹RNA (shRNA)慢病毒转染对内皮细胞eNOS进行敲低,HUVECs分为4组:空载体组(scramble)、转染eNOS shRNA组(eNOS shRNA)、转染eNOS shRNA+硝普钠(SNP)组(eNOS shRNA+SNP)及转染eNOS shRNA+SNP+三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP)组(eNOS shRNA+SNP+TCEP)。采用Western blot法检测eNOS蛋白表达和SOD1二聚体/单体蛋白表达,采用酶联免疫吸附法检测SOD酶活性,采用NO荧光探针法检测内皮细胞NO水平,采用二氢乙锭(DHE)检测内皮细胞超氧化物阴离子水平,采用原位末端转移酶标记技术检测内皮细胞凋亡情况。结果:与空载体组相比,eNOS shRNA组中内源性NO水平(2.690±0.420比15.029±2.193, P<0.01)、eNOS蛋白表达(1.000±0.778比3.141±0.199, P<0.01)、SOD1二聚体/单体比例(4.6±1.0比7.6±2.0, P<0.05)和SOD活性[(0.432±0.254) Carmen′s unit/10 4 cell比(1.000±0.116) Carmen′s unit/10 4 cell, P<0.01]均显著降低,细胞内超氧阴离子水平(11.180±1.560比6.146±1.007, P<0.01)和HUVECs凋亡水平[75.0(55.0,100.0)%比0(0,0)%, P<0.01]均显著增加。与eNOS shRNA组相比,eNOS shRNA+SNP组中内源性NO含量(16.705±0.116比2.690±0.420, P<0.01)、SOD1二聚体/单体比例(7.3±2.0比4.6±1.0, P<0.05)和SOD活性[(0.737±0.060) Carmen′s unit/10 4 cell比(0.432±0.254) Carmen′s unit/10 4 cell, P<0.05]均显著增加,细胞内超氧阴离子水平(6.897±1.648比11.180±1.560, P<0.01)和HUVECs凋亡水平[0(0,0)%比75.0(55.0,100.0)%, P<0.01]均显著下降。与eNOS shRNA+SNP组相比,eNOS shRNA+SNP+TCEP组中SOD1二聚体/单体比例(4.4±0.9比7.3±2.0, P<0.05)和SOD活性[(0.214±0.084) Carmen′s unit/10 4 cell比(0.737±0.060) Carmen′s unit/10 4 cell, P<0.01]均显著降低,超氧阴离子水平(10.917±1.552比6.897±1.640, P<0.01)和HUVECs凋亡水平[63.6(55.0,90.0)%比0(0,0)%, P<0.01]均显著增加;但NO水平(16.112±0.926比16.705±0.116, P>0.05)无明显变化。 结论:内源性NO通过上调SOD1二聚体/单体比例,增强SOD活性,抑制活性氧积累,从而有效对抗人脐静脉内皮细胞凋亡。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
两种产前诊断技术对于检测羊水细胞染色体嵌合的性能比较
编辑人员丨1周前
目的:探讨染色体核型分析和单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism microarray,SNP-array)检测对于发现羊水嵌合体的价值。方法:回顾分析羊水诊断发现胎儿为染色体嵌合体并进行SNP-array检测的74例孕妇的资料。结果:在74例嵌合体中,12例为假性嵌合体,62例为真性嵌合体,后者包括罗伯逊易位嵌合体1例、缺失嵌合体3例、标记染色体嵌合体4例、常染色体非整倍体嵌合体19例、性染色体非整倍体嵌合体30例、等臂染色体嵌合体5例。结论:染色体核型分析与SNP-array对于诊断嵌合体各有优缺点。当二者结果不一致时,可进一步采用荧光原位杂交进行验证。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
产前细菌人工染色体标记-磁珠鉴别/分离技术在染色体非整倍体及微缺失/微重复综合征诊断中的应用
编辑人员丨1周前
目的:探讨细菌人工染色体标记-磁珠鉴别/分离技术在产前诊断中的适应证及应用价值。方法:采集2016年4月至2020年12月在济宁市妇幼保健计划生育服务中心进行产前诊断的3 579例单胎:高龄产妇(年龄≥35岁)、血清学产前筛查高风险/临界风险、无创基因检测(NIPT)高风险、超声指标异常、不良妊娠史的羊水样本进行细菌人工染色体标记-磁珠鉴别/分离技术(BoBs)检测,同步进行G显带染色体核型分析检测。核型分析或BoBs检测出的非整倍体异常/微缺失/微重复样本根据需要进行荧光原位杂交(FISH)/单核苷酸多态性(SNP)微阵列验证。结果:(1)高龄、NIPT高风险、血清学筛查高风险指征样本占比89.44%(3 201/3 579),非整倍体异常检出率96.19%(202/210),微缺失/微重复异常检出率87.5%(28/32),合计异常检出率95.04%(230/242);超声指标异常、不良妊娠史、中孕期血清学筛查临界风险指征样本占比10.66%,检出非整倍体及微重复/微缺失的异常占4.96%。(2)BoBs检出198份常见染色体非整倍体(13/18/21/X/Y)异常,12例≥20%的嵌合体,与核型结果一致;2份21-三体、3份X/Y、7份探针检测范围外的2、7、8、9、10、20、mar染色体核型嵌合、8份臂间倒位和5份易位由染色体核型分析检出。BoBs检测对5种非整倍体的敏感度为94.6%(210/222),特异度为100%,假阴性率5.4%(12/222)。BoBs检出32份微缺失/微重复,染色体核型分析检出9份。G显带染色体核型分析与BoBs检测联合应用相较于单一的染色体核型分析,额外检出9.4%(23/244)阳性样本。结论:单纯高龄、NIPT高风险、血清学筛查高风险指征的样本更适合作为BoBs在产前诊断应用的适应证。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
15q11.2-q14新发额外标记染色体嵌合重复患儿临床表型及遗传学分析
编辑人员丨1周前
目的:明确1例智力低下、发育异常、语言交流障碍患儿遗传学病因,并对其临床表型进行遗传学分析。方法:采用患儿及其父母外周血进行常规G显带染色体核型分析及单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP array)检测。结果:患儿染色体核型为47,XY,+mar[44]/46,XX[20],SNP array检测结果显示患儿约65%的细胞在15q11.2-q14区段存在11.5 Mb(22,770,421-34,671,762)片段的嵌合重复,该区域涉及5个断裂点(break point,BP)的3个区间:BP1-BP2(15q11.2)区间重复;BP2-BP3(15q11.2-q13.1)经典重复区间Prader Willi综合征(Prader Willi syndrome,PWS)/Angelman综合征(Angelman syndrome,AS)区间重复;远端的BP4-BP5(15q13.2-q13.3)重复。父母染色体核型分析未见异常,SNP array在全染色体基因组范围内未检测到染色体片段拷贝数的异常变化。结论:患儿15q11.2-q14发生的嵌合重复性额外小标记染色体(small supernumerary marker chromosomes,sSMCs)为新发突变。该患儿的临床表型与15q11.2-q14区段的重复涉及的基因相关,可为遗传咨询提供帮助。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
额外标记染色体所致过度生长综合征一个家系的遗传学分析
编辑人员丨1周前
目的:应用多种遗传学检测技术对1个额外标记染色体(sSMC)所致过度生长综合征家系进行遗传学分析,明确其致病原因,探讨sSMC的起源及重组形式。方法:选取2021年8月31日于嘉兴市妇幼保健院就诊的1个过度生长综合征家系为研究对象,应用染色体核型分析、单核苷酸多态性微阵列(SNP array)及荧光原位杂交(FISH)技术,对该家系各成员进行染色体鉴定。结果:结合染色体核型分析、SNP array及FISH检测结果,先证者及其妹妹的核型为47,XX,+neo(15)(qter→q25.3:)mat,其母亲的核型为47,XX,del(15)(q25.3:),+neo(15)(qter→q25.3:),其父亲的核型未见异常。结论:联合多种遗传学检测技术可鉴定sSMC的来源,为遗传咨询提供可靠的依据。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
DLL3基因遗传多态性与先天性巨结肠易感性的相关性分析
编辑人员丨1周前
目的:探讨 DLL3基因多态性与先天性巨结肠(hirschsprung's disease,HSCR)易感性之间的关系。 方法:采用病例对照研究方法,选取2009-2012年上海交通大学医学院附属新华医院小儿外科收治的104例HSCR病例(HSCR组)和151例就诊于小儿外科而无慢性便秘病史的对照病例(对照组)作为研究对象。采用MassARRAY的方法检测 DLL3基因5个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点的多态性分布,统计分析不同等位基因、基因型以及单倍型与HSCR易感性之间的相关性。 结果:HSCR组5个SNP位点rs3786951、rs958728、rs2304214、rs3212276、rs10412931基因型、等位基因频率与对照组比较,差异无统计学意义( P>0.05)。rs3786951-rs958728-rs2304214-rs3212276-rs10412931组遗传标记具有强LD(linkage disequilibrium)(D'>0.7)。HSCR组GGTAC单倍型携带频率为11.9%,高于对照组的6.4%,该单倍型与HSCR的发生显著相关(rs3786951-rs958728-rs2304214-rs3212276-rs10412931, P=0.049, OR=1.87,95% CI 0.99~3.50)。 结论:DLL3基因中,由5个SNP位点rs3786951、rs958728、rs2304214、rs3212276、rs10412931构成的GGTAC单倍型与HSCR易感性相关,单个SNP位点与HSCR之间无显著相关性。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
单精子测序结合PCR-反向点杂交技术在1例东南亚缺失型α地中海贫血患者胚胎植入前遗传学检测中的应用
编辑人员丨1周前
目的:探讨单精子测序结合PCR-反向点杂交(PCR-reverse dot blot,PCR-RDB)技术在东南亚缺失型α地中海贫血胚胎植入前遗传学检测中的应用价值。方法:选取2020年4月24日就诊于广州医科大学附属第三医院妇产科的一对东南亚缺失型α地中海贫血携带者夫妇,针对男方无法提供家系成员样本的情况,本案例采用上游法结合显微操作移液管挑选其5份单精子样本并进行全基因组扩增,通过PCR-RDB技术确定男方单精子样本的地中海贫血基因分型,在-- SEA区域的上下游1 Mb范围内选择单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP)作为遗传标记,进行二代测序分析构建双亲单体型。对6份囊胚活检样本进行全基因组扩增后行二代测序,通过单体型分析胚胎是否携带致病变异,并选取非患病囊胚进行移植。孕20周抽羊水进行产前诊断,验证与单基因病胚胎植入前遗传学检测(preimplantation genetic testing for monogenetic disease,PGT-M)结果是否一致。 结果:女方的致病变异来源于其母亲,男方5份单精子样本的地中海贫血基因分型结果显示有4份为野生型。单精子测序筛选出男方有效位点10个,女方家系连锁分析得到女方有效位点6个,PGT-M结果显示4枚囊胚为αα/-- SEA,2枚为-- SEA/-- SEA,产前诊断结果显示胎儿基因型为αα/-- SEA,与PGT-M结果一致,并于孕40周分娩一健康女婴。 结论:对于家系不全的男性东南亚缺失型α地中海贫血携带者,可采用单精子测序结合PCR-RDB技术筛选SNP位点,通过连锁分析行PGT-M。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
