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单中心儿童遗传性胰腺炎的临床特点及基因变异分析
编辑人员丨6天前
目的:探讨儿童遗传性胰腺炎(hereditary pancreatitis,HP)的临床特点及基因变异特征。方法:本研究为回顾性研究,以2019年1月至2022年10月湖南省儿童医院收治的7例遗传性胰腺炎患儿为研究对象,收集患儿一般资料、临床表现、基因结果及家系分析等资料。结果:7例患儿中男4例,女3例;发病年龄(7.84±3.27)岁。初次起病时,1例有进食油腻食物史,6例无明显诱因。临床表现:7例均有腹痛,以上腹部及脐周疼痛为主;恶心呕吐6例;无一例腹胀、发热、黄疸及并发症;7例发病时血淀粉酶、脂肪酶、尿淀粉酶均升高3倍以上。7例基因检测结果分别为: PRSS1基因突变1例、 SPINK1+ CFTR联合基因突变1例、 SPINK1基因突变5例。家系分析结果显示:7例患儿直系双亲均无胰腺炎病史。7例均予常规内科保守治疗,其中1例行内镜下逆行胰胆管造影(endoscopic retrograde cholangiopancreatogram,ERCP)+胰管取石并胰管支架治疗。 结论:通过临床症状对儿童HP与其他类型胰腺炎鉴别较为困难,对胰腺炎相关基因进行检测有利于早期诊断; SPINK1基因突变导致儿童HP值得关注和研究。
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编辑人员丨6天前
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Kazal 5型丝氨酸蛋白酶抑制剂基因突变致新生儿Netherton综合征一例并文献复习
编辑人员丨6天前
目的:探讨Kazal 5型丝氨酸蛋白酶抑制剂(serine protease inhibitor of Kazal type 5, SPINK5)基因突变致新生儿Netherton综合征(Netherton syndrome, NS)的临床特征及分子遗传学特点。 方法:回顾性分析2018年11月上海交通大学附属儿童医院收治的1例新生儿NS病例的临床资料,采用高通量测序及Sanger测序对其 SPINK5基因进行分析。在万方数据库、中国知网和PubMed数据库中检索2月龄以内确诊且有 SPINK5基因分析结果的NS病例。结合本例患儿和文献报道的病例,总结新生儿NS的临床特点、基因突变情况、治疗及随访情况。采用描述性统计分析。 结果:本例患儿生后陆续出现全身皮肤弥漫性红斑及脱屑、毛发稀疏、反复感染等表现,实验室检查发现血IgE升高(111 IU/ml),光学显微镜下毛发呈"竹节发"。 SPINK5基因分析发现患儿存在c.2468dup(p.Lys824Glufs*4)和c.377_378del(p.Tys126*)复合杂合突变,家系分析发现患儿的2个突变分别遗传自其父亲和母亲,确诊为 SPINK5基因突变致NS。经抗感染、注射丙种球蛋白、皮肤护理等综合治疗后皮疹好转,但反复感染,后放弃治疗自动出院,生后2月龄死于感染。共检索到NS病例报道11例,合并本例共12例NS新生儿。总结12例患儿最常见临床表现发现,有早期皮肤弥漫性红斑及脱屑12例、感染8例、毛发干结7例、高钠血症性脱水7例、高IgE 5例、生长迟缓4例、呼吸衰竭3例、特应性体质2例、腹泻2例及吞咽不协调、低体温、喘息、高血压、肝衰竭、代谢性碱中毒各1例。 结论:NS由 SPINK5基因突变导致,新生儿期NS临床表现多不典型。生后早期出现全身皮肤弥漫性红斑及脱屑、反复感染、毛发干结,尤其血IgE偏高的患儿,应考虑NS可能,基因检测有助于早期诊断、指导治疗,并为遗传咨询提供依据。
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编辑人员丨6天前
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Spink5基因条件性敲除小鼠模型的构建及表型分析
编辑人员丨6天前
目的:构建Spink5基因条件性敲除小鼠模型并鉴定其表型。方法:采用CRISPR/Cas9技术构建基因型为Mb1 cre/+Spink5 floxp/floxp的B淋巴细胞Spink5基因条件性敲除小鼠(敲除组),以基因型为Mb1 +/+Spink5 floxp/floxp的小鼠为对照组。提取小鼠脾脏单个核细胞并经流式细胞荧光技术分选B淋巴细胞及非B淋巴细胞,然后分别进行基因型鉴定及淋巴上皮Kazal型抑制物(LEKTI)蛋白表达的测定。切取小鼠皮肤行HE染色,测量表皮厚度,免疫荧光染色测定小鼠皮肤LEKTI蛋白荧光强度。组间比较采用配对 t检验或两独立样本 t检验。 结果:基因型鉴定结果表明,成功构建稳定的B淋巴细胞Spink5基因条件性敲除小鼠模型。Western印迹显示,条件性敲除小鼠B淋巴细胞中LEKTI蛋白相对表达量为0.01 ± 0.02,显著低于非B淋巴细胞(0.66 ± 0.11, t = 9.99, P < 0.001)及对照组小鼠B淋巴细胞(1.08 ± 0.13, t = 13.78, P < 0.001)。39只敲除组小鼠中,4只出现皮肤干燥、散在鳞屑性肥厚型斑丘疹。敲除组皮损部位表皮厚度为(90.42 ± 21.31)μm,显著高于其非皮损部位[(29.71 ± 3.63)μm, t = 5.05, P = 0.002]及对照组表皮[(12.42 ± 2.21)μm, t = 6.74, P < 0.001]。免疫荧光检测显示,敲除组皮损处LEKTI蛋白荧光强度为46.21 ± 1.21,非皮损处为46.62 ± 2.13,与对照组(47.69 ± 1.71)差异均无统计学意义( P > 0.05)。 结论:成功构建了B淋巴细胞Spink5基因条件性敲除小鼠模型,为进一步探究Netherton综合征皮肤屏障缺陷伴免疫功能异常的机制提供研究基础。
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编辑人员丨6天前
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新生儿Netherton综合征1例
编辑人员丨6天前
Netherton综合征是一种罕见且严重的常染色体隐性遗传性疾病,由于SPINK5基因变异引起,常于新生儿期发病,先天性鱼鳞病样红皮病、竹节样毛发、特应性体质是该病典型的三大临床特征。本文报道1例经基因检测确诊的新生儿Netherton综合征的临床特点。
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编辑人员丨6天前
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儿童家族性部分脂肪营养不良综合征4型伴反复糖尿病酮症酸中毒1例
编辑人员丨6天前
对1例以糖尿病起病的家族性部分脂肪营养不良综合征4型(FPLD4)患儿临床特征和基因变异特征进行回顾性分析。患儿,男,13岁5个月,糖尿病病程3年余,于2021年11月10日第4次入住苏州大学附属儿童医院,糖尿病病程中反复发生糖尿病酮症酸中毒逐渐出现脂代谢并发症,基因测序结果显示先证者及其母亲携带基因 PLIN1 c.1325delG(p.G442Afs*99)和 SPINK1 c.194+2T>C(p.?)双基因杂合变异。 PLIN1为FPLD4的致病基因,c.1325delG变异目前尚未见文献报道。结合患儿临床表现、家族史及基因检测结果,诊断为FPLD4,同时携带基因 SPINK1 c.194+2T>C(p.?)变异,可能使慢性胰腺炎发生的风险增加。本病例报道丰富了FPLD4的临床特点和基因型数据,基因检测方法的应用使患儿糖尿病分型得到了精准诊断,同时需警惕双基因突变对疾病进展的影响,对制定治疗方案和疾病管理具有重要意义。
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编辑人员丨6天前
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基于单细胞RNA测序的膀胱癌预后风险模型的构建与验证
编辑人员丨6天前
目的:基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)生物信息学分析的预后相关的差异表达基因构建膀胱癌预后风险模型并验证。方法:从基因表达综合(GEO)数据库中下载膀胱癌scRNA-seq数据集GSE135337、GSE129845,数据更新时间分别为2022年、2019年;下载常规转录组数据集GSE13507(数据更新时间为2020年)中165例膀胱癌样本的表达谱及其生存信息。从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载414例膀胱癌样本和19例癌旁样本的表达谱数据及405例膀胱癌患者的临床信息。采用R 4.1.2软件对GEO数据库中的10例膀胱癌单细胞样本进行质量控制及降维聚类并对其进行细胞注释;采用CellChat分析GEO数据库中单细胞数据的细胞间通信。采用单因素Cox比例风险模型分析筛选与膀胱癌预后相关的差异表达基因,并使用LASSO-Cox回归分析构建预后风险模型,计算风险评分。根据中位风险评分,以TCGA数据集中膀胱癌患者为训练集,将患者分为低风险组和高风险组;采用GEO数据库GSE13507数据集为验证集进行验证,通过Kaplan-Meier分析比较训练集、验证集低风险组和高风险组患者的总生存情况。通过时间依赖受试者工作特征(ROC)曲线分析评估预后风险模型的预测效能;采用R 4.1.2软件构建预测患者1、3、5年总生存率的列线图。分析TCGA数据集中膀胱癌患者风险评分与相应临床病理特征之间的关系,并进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析和基因集富集分析(GSEA)。结果:GSE135337和GSE129845数据集中,根据质量控制标准过滤后获得了50 263个细胞,其中43 519个细胞为尿路上皮细胞。尿路上皮细胞与成纤维细胞在膀胱癌微环境中具有更多的细胞交互作用,尿路上皮细胞主要通过中期因子信号通路发送信号。筛选出9个预后相关的差异表达基因(SPINK1、FN1、EFEMP1、ELN、PCOLCE2、TUBA1A、COL14A1、TCF4和TM4SF1)并构建预后风险模型,风险评分=-0.019×SPINK1+0.028×FN1+0.025×EFEMP1+0.023×ELN+0.098×PCOLCE2+0.004× TUBA1A+0.047×COL14A1+0.004×TCF4+0.096×TM4SF1。根据风险评分中位值(1.350),训练集、验证集高风险组(≥1.350)患者OS较低风险组(<1.350)差。ROC曲线分析表明,在训练集与验证集中1、3、5年总生存率的曲线下面积(AUC)均>0.65。根据年龄、分期和预后模型风险评分构建预测患者1、3、5年总生存率的列线图,其校正曲线接近理想曲线。风险评分在>60岁患者,M分期为M 1,N分期为N 1、N 2、N 3,TNM分期为Ⅲ、Ⅳ期时均升高,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。富集分析发现多个显著富集的基因与体液免疫应答、粒细胞趋化、细胞因子-细胞因子受体相互作用和B细胞介导的免疫等功能与通路相关。 结论:基于scRNA-seq数据构建的较为稳定的膀胱癌预后预测模型可为临床评估患者预后提供参考。
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编辑人员丨6天前
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不伴竹节发的不典型迟发Netherton综合征一例
编辑人员丨6天前
患者女,24岁,因躯干、四肢反复起环状红斑、鳞屑伴瘙痒9年就诊。皮损组织病理:角化过度伴灶性角化不全,角层内中性粒细胞聚集,角层下水疱,真皮浅中层血管周围淋巴细胞伴少量嗜酸性粒细胞和中性粒细胞浸润。直接免疫荧光:IgG、IgM、IgA、C3均为阴性。全外显子测序 SPINK5基因显示,第25号外显子发生c.2423C>T(p.T808I)错义变异,第31号外显子c.2965-1G>A剪切位点变异,二者构成的复合杂合关系可能是患者罹患Netherton综合征的原因。结合临床表现及基因检测结果,诊断为Netherton综合征。
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编辑人员丨6天前
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高三酰甘油血症性急性胰腺炎的基因学研究进展
编辑人员丨6天前
随着生活水平的提高和饮食结构的改变,高三酰甘油血症性急性胰腺炎(hypertriglyceridemic acute pancreatitis,HTG-AP)的发病率逐年升高。HTG-AP患者具有年轻化、重症化、预后差、易复发等特点,造成巨大的卫生经济负担。HTG-AP的发生机制尚不明确,基因多态性正受到越来越多的关注。已鉴定出的高三酰甘油血症易感基因有 LPL、APOC2、APOA5、LMF1、GPIHBP1和 GPD1,胰腺炎易感基因有 PRSS1、PRSS2、SPINK1、CTRC、CFTR、CASR、CLDN2、CPA1、CEL、CTRB和 PNLIP。近年来,HTG-AP患者的基因检测不断发现新的易感基因和突变位点。遗传基因异常、遗传易感性与环境危险因素的相互作用影响HTG-AP的发生、病程和结局,基因评估正变得越来越重要,对分子机制、预后评估、药物开发和基因治疗具有重要指导意义。
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编辑人员丨6天前
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Netherton综合征1例
编辑人员丨2周前
患者女,54岁,全身红斑鳞屑、毛发异常出生即有.皮肤科情况:躯干四肢呈红皮病样外观、多环状、匍行性红斑,特异性"双边"鳞屑,干燥、纤细的鱼鳞病样鳞屑,毛发异常表现为:毛发短、脆、无光泽,眉毛、睫毛稀疏.皮损组织病理示:角化过度,角化不全,表皮不规则增厚,细胞间内水肿,真皮内胶原断裂、卷曲、缺失,红细胞外渗,少量炎细胞浸润,部分皮下脂肪变性.基因测序:行全外显子基因检查可检测到SPINK5基因存在一个纯合错义变异c.2423C>T:p.T808I.根据皮肤损害及基因检查,诊断考虑Netherton综合征.治疗上给予丙酸氟替卡松软膏、维A酸乳膏及维生素E乳,比例1∶1混合外用.鉴别诊断:本病需与特应性皮炎、高IgE综合征、红皮病及omenn综合征等鉴别.
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编辑人员丨2周前
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口腔鳞状细胞癌中SPINK5的表达及其对预后的影响
编辑人员丨2024/4/27
目的:深入探讨SPINK5在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)中的表达水平与其临床发展和预后的关系,分析其潜在的机制和临床价值,评估其作为靶向治疗基因的潜力.方法:表达量及临床病理数据来自于TCGA数据库中筛选和获取口腔组织来源的癌症病例样本.分析OSCC临床病理特征及预后和SPINK5的相关性.SPINK5在OSCC组织中的差异表达通过免疫组化进行验证.采用基因功能富集分析(gene set enrich-ment analysis,GSEA)方法预测SPINK5调控的信号通路.结果:SPINK5表达量与OSCC临床预后具有显著相关性(P<0.05).高表达组生存时间较长.SPINK5在正常黏膜组织中的表达量均高于OSCC,且差异有统计学意义(P<0.05).SPINK5差异表达的基因富集到了化学刺激的感官知觉、RNA的基因沉默、RNA介导的翻译抑制导致的基因沉默、气味的感官知觉4个生物学过程,和嗅觉受体活动、转录后基因沉默中涉及的RNA结合、mRNA的3'UTR、嗅觉结合4个分子功能.结论:在OSCC中,SPINK5的表达量相对于正常黏膜组织下调,其表达变化与OSCC的预后密切相关.其可能通过参与和调控OSCC细胞的RNA转录和翻译过程来干预OSCC的发生发展.故SPINK5可能可以作为预测患者预后的有效生物标志物和靶向治疗的靶向基因.
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编辑人员丨2024/4/27
