目的:探索转录因子（transcription factors, TFs）和结肠癌预后的联系，通过TCGA和GEO双数据库构建预后模型，从而量化患者的风险并指导临床治疗决策。方法:本研究运用TCGA和GEO数据库中结肠癌的转录组和临床数据，先将转录组数据进行基因注释并计算基因表达量，对TCGA和GEO中TFs行差异性分析（| log2FC| >1，P-Value（Fdr）<0.05）。取双数据交集的差异TFs行相关预后分析（ P<0.01）。利用COX多因素分析计算出预后相关TFs的风险系数和其风险值，应用"survival"和"glmnet"包进行COX模型构建TFs预后模型。绘制出序列集和验证集的生存曲线（ P<0.001）及ROC曲线（AUC>0.75），对风险值的分布进行可视化。按风险值分组后计算GSEA富集分析，构建基因集网格，进行靶基因预测，最后进行GO和KEGG的通路富集分析。 结果:取TCGA和GEO数据库两者交集的387个表达差异的TFs绘制热图，火山图及TFs相关的森林图，按照COX多因素分析构建出结肠癌预后模型=0.310×HSF4+0.137×IRX3-0.127× ATOH1+0.290×OVOL3+0.137×HOXC6+0.155×SIX2+0.092×ZNF556-0.444×CXXC5+0.429×TIGD1+0.413×TCF7L1。通过富集分析，结果显示这些预后因子可能直接或间接作用于癌通路，如基础细胞癌与癌症信号通路、局部组织与细胞黏附及细胞外基质等。结论:构建的TFs对结肠癌预后模型可量化结肠癌预后风险，其高风险组是结肠癌预后的独立风险因素，该模型是一种评估结肠癌预后的新方式。

目的:研究RNA结合蛋白Musashi-2(MSI2)在肝细胞癌(HCC)中的作用及相关机制。方法:获取来自癌症基因组图谱数据库(TCGA)和基因型-组织表达数据库(GTEX)的HCC患者mRNA表达数据及相应的临床信息，在50对匹配的肿瘤/正常HCC样本中，评估MSI2的表达水平。进一步通过蛋白质相互作用网络(PPI)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)和RNA互作组百科全书(ENCORI)数据库，探究MSI2如何影响HCC进展。设计3对针对MSI2和β-catenin的短发夹RNA(shRNA)序列，将他们分别克隆到慢病毒载体中，作为敲减质粒分别转染HepG2、MHCC97H和MHCC97L细胞，用于构建MSI2敲减组细胞(HepG2 sh-MSI2组、MHCC97H sh-MSI2组)、β-catenin敲减组细胞(MHCC97L sh-β-catenin组)和各自的阴性对照组细胞(HepG2 sh-Ctrl组、MHCC97H sh-Ctrl组以及MHCC97L sh-Ctrl组)。通过蛋白质印迹法检测MSI2的过表达水平。CCK-8和集落形成实验检测肝癌细胞增殖情况。将HepG2 sh-Ctrl组、HepG2 sh-MSI2组、MHCC97L sh-Ctrl组和MHCC97L sh-β-catenin组细胞悬液分别注射于各组裸鼠的前大腿处皮下，4周后处死裸鼠，取出肿瘤测量体积。 结果:基于TCGA和GTEX数据库的分析显示，MSI2在50对匹配的肿瘤中的表达高于正常样本(2.073±0.767比1.256±0.260)，差异具有统计学差异( P<0.001)。利用PPI、KEGG通路富集以及ENCORI数据库分析MSI2在HCC进展中的潜在机制，结果显示，在HCC中，MSI2与β-catenin( r＝0.455， P<0.001)、转录因子7(TCF7)( r＝0.142， P＝0.006)、淋巴增强因子1(LEF1)( r＝0.246， P<0.001)均呈正相关。与HepG2 sh-Ctrl组相比，HepG2 sh-MSI2组中MSI2、β-catenin、TCF7、LEF1的表达均下调，与MHCC97H sh-Ctrl组相比，MHCC97H sh-MSI2组中MSI2、β-catenin、TCF7、LEF1的表达均下调，差异均具有统计学意义(均 P<0.001)。与MHCC97L sh-Ctrl组相比，MHCC97L sh-β-catenin组中β-catenin的表达下降，差异具有统计学意义( P<0.001)。CCK-8增殖实验结果显示，与HepG2 sh-Ctrl组相比，HepG2 sh-MSI2组肝癌细胞活性降低，与MHCC97H sh-Ctrl组相比，MHCC97H sh-MSI2组肝癌细胞活性降低，与MHCC97L sh-Ctrl组相比，MHCC97L sh-β-catenin组肝癌细胞活性降低，差异均具有统计学意义(均 P<0.001)。集落形成实验结果显示，与HepG2 sh-Ctrl组相比，HepG2 sh-MSI2组肝癌细胞形成集落的能力降低，与MHCC97H sh-Ctrl组相比，MHCC97H sh-MSI2组肝癌细胞形成集落的能力降低，与MHCC97L sh-Ctrl组相比，与MHCC97L sh-β-catenin组肝癌细胞形成集落的能力降低，差异均具有统计学意义(均 P<0.001)。与HepG2 sh-Ctrl组相比，HepG2 sh-MSI2组裸鼠的肿瘤体积减小[(160.19±60.22)mm 3比(480.46±65.28)mm 3]，与MHCC97L sh-Ctrl组相比，MHCC97L sh-β-catenin组裸鼠的肿瘤体积减小[(456.48±38.23)mm 3比(845.67±33.19)mm 3]，差异均具有统计学意义(均 P<0.05)。 结论:MSI2表达上调通过Wnt/β-catenin信号通路促进肝癌细胞增殖。

目的:采用加权基因共表达网络分析（WGCNA）探讨烧伤后瘢痕组织内甲基化基因，发掘瘢痕形成过程中的分子标志物及治疗靶点。方法:采用观察性研究方法。从美国国家生物技术信息中心基因表达综合数据库筛选出同一批次分别进行了mRNA测序和甲基化测序的GSE136906和GSE137134数据集（数据集的样本数均为6），并利用数据集GSE108110（样本数为9）纳入支持向量机及建模分析。采用“Limma”软件包对烧伤后瘢痕和正常组织之间的差异表达基因和差异甲基化基因进行鉴定。使用WGCNA筛选和瘢痕组织临床特征相关性强且基因数目多的模块。对模块内的基因进行功能富集分析并寻找模块内异常甲基化状态的基因，使用受试者操作特征（ROC）曲线判断异常甲基化基因对瘢痕的诊断效能，并使用支持向量机模型进行验证。结果:共鉴定出10个共表达基因模块，棕色模块与烧伤后瘢痕组织形成相关性高且基因数目多。棕色模块内的基因主要富集在雄激素受体信号通路的调控、细胞因子-细胞因子受体相互作用、胰岛素分泌的正调节等方面。棕色模块内显示35个基因甲基化状态异常，ROC曲线（曲线下面积>0.9）与支持向量机模型（准确率为93.3%）表明基因 CCR2、 LMO7、 STEAP4、 NNAT和 TCF7L2具有良好的瘢痕诊断效能。 结论:CCR2、 LMO7、 STEAP4、 NNAT和 TCF7L2可作为烧伤后瘢痕治疗的潜在靶点。

目的:探讨转录因子7类似物2（transcription factor 7-like 2，TCF7L2）基因多态性及表达在绝经后2型糖尿病（type 2 diabetes mellitus，T2DM）合并骨质疏松（osteoporosis，OP）患者中的作用及相关机制。方法:选择2019年1月至2020年6月在宁波大学医学院附属医院就诊的148例绝经后T2DM女性患者作为研究对象。其中合并OP 86例（T2DM+OP组），未合并OP 62例（T2DM组），并纳入同期在本院进行健康体检的100例自然绝经后健康女性作为对照组。抽取空腹静脉血，检测临床和骨代谢指标；采用毛细管电泳和片段分析（SNaPshot）技术对TCF7L2基因的两个SNP位点rs7901695（T>C）、rs290487（C>T）进行分型；采用实时荧光定量聚合酶链式反应检测法测定TCF7L2基因mRNA的相对表达量。构建过表达和沉默慢病毒载体，探究TCF7L2过表达和沉默对大鼠成骨细胞增殖的影响。结果:对于rs7901695位点，T2DM+OP组、T2DM组和对照组间的TT、TC和CC基因型分布差异有统计学意义（ χ2=12.545， P=0.014），3组间的T、C等位基因频率分布差异有统计学意义（ χ2=17.089， P<0.001）。对于rs290487位点，T2DM+OP组、T2DM组和对照组间的CC、CT和TT基因型分布差异有统计学意义（ χ2=10.500， P=0.033），3组间的C、T等位基因频率分布差异有统计学意义（ χ2=14.665， P=0.001）。对于rs7901695位点，携带CC+TC基因型的T2DM+OP患者FPG、TG水平显著高于携带野生型TT基因型的患者（FPG： t=2.559， P=0.014；TG： t=2.034， P=0.036），而血钙和25OHD3水平显著低于后者（血钙： t=3.889， P<0.001；25OHD： t=4.112， P<0.001）；对于rs290487位点，携带TT+CT基因型的T2DM+OP患者血钙、BGP和25OHD3水平均显著低于携带野生型CC基因型的患者，差异有统计学意义（血钙： t=3.751， P<0.001；BGP： t=2.731， P=0.007；25OHD3： t=3.225， P=0.002）。T2DM+OP患者TCF7L2基因mRNA相对表达量显著低于T2DM组和对照组（ F=5.735， P<0.05）；随着rs7901695位点C等位基因的增加，TCF7L2基因mRNA相对表达量逐渐降低（ F=5.723， P<0.05）。此外，TCF7L2过表达的大鼠成骨细胞增殖率显著升高，而TCF7L2沉默的成骨细胞增殖水平显著下降（ F=7.846， P<0.05）。 结论:在绝经后T2DM女性中，TCF7L2基因变异会导致基因表达水平降低，抑制成骨细胞的增殖，从而参与到OP的发病机制中。

目的:通过分析精神分裂症社会隔离饲养模型小鼠杏仁核基因转录水平的改变确定精神分裂症致病基因及相关通路。方法:29只3周龄SPF级C57BL/6J雄性小鼠按照随机数字表法分为对照组(16只)及模型组(13只)，对照组每个透明鼠笼里饲养4只，模型组每个透明鼠笼里饲养1只，每个笼里小鼠可见其周边小鼠，但是无法相互触碰到。2组小鼠均饲养4周，随后1周内完成旷场实验、前脉冲抑制实验及新物体识别实验。实验结束后采用脊椎脱臼法处死小鼠，取杏仁核行转录组测序，通过GO富集分析及KEGG富集分析明确模型组小鼠差异表达基因（DEGs）富集的功能及相关通路。结果:（1）动物实验部分：与对照组小鼠相比，模型组小鼠旷场实验中运动距离显著增加[（1 239.20±106.35） m vs. （1 845.53±143.65） m]，差异有统计学意义（ t=3.464， P=0.002）；实验前5 min在中心区域的活动时间显著减少[（13.15±1.41）s vs. （8.47±1.19） s]，差异有统计学意义（ t=2.464， P=0.020）。与对照组相比，模型组小鼠的78 dB前脉冲抑制缺失[（22.28±1.53）% vs. （14.59±2.76）%]，差异有统计学意义（ t=2.629， P=0.013）；88 dB前脉冲抑制缺失[（32.83±3.39）% vs.（18.44±3.07）%]，差异有统计学意义（ t=3.081， P=0.005）。与对照相比，模型组小鼠测试期新物体识别率显著下降[（80.5±2.2）% vs.（71.0±3.6）%]，差异有统计学意义（ t=2.356， P=0.026）。（2）生信分析部分：共找到96个DEGs，其中表达上调的42个，包含 Th、Crlf1等基因；表达下调的54个，包含 Prkcd等基因。 Th与 Crlf1为正强相关关系（ r=0.940， P=0.018）。GO基因富集分析结果提示DEGs富集在质膜边界细胞投影功能、神经元分化过程、细胞凋亡过程等方向，KEGG富集分析结果提示DEGs富集在WNT信号通路、细胞凋亡通路及酪氨酸代谢通路。蛋白质网络互作分析结果提示Wnt6、Tcf712、Pitx2、Tcf7、Cd4为关键蛋白。 结论:社会隔离饲养模型小鼠杏仁核中 Th、Prkcd、Lrrc74b、Fadd、Wnt6、Ror2、Notum、Tcf7l2等DEGs以及涉及的相关信号通路可能与精神分裂症相关。

目的:对配对盒2( Pax2)相关孤独症谱系障碍(ASD)易感基因进行生物信息学分析，探讨 Pax2基因参与ASD发病的可能机制。 方法:(1)将Pathway Commons数据库中与 Pax2基因相关的基因(606个)和Simons基金会孤独症研究计划(SFARI)数据库中ASD易感基因(1 023个)取交集得到65个 Pax2基因相关ASD易感基因。在基因功能分析网站Metascape对 Pax2基因相关ASD易感基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组数据库(KEGG)通路富集分析。使用Cytoscape软件cytoHubba插件的最大团中心度(MCC)算法，筛选前10个核心 Pax2基因相关ASD易感基因。(2)取3只13周龄雄性Pax2-nestin小鼠(实验组)及3只同龄雄性C57 BL/6J小鼠(对照组)，采用Western blotting实验检测2组小鼠海马组织中谷氨酸受体2B亚基(GluN2B)蛋白的表达。 结果:(1)GO分析显示 Pax2基因相关ASD易感基因在生物学过程(BP)本体主要富集于跨突触信号、行为、脑发育、化学突触传递的调节、胶质细胞再生、小脑形态发育、谷氨酸能突触传递、记忆等子集，在细胞组分(CC)本体主要富集于突触后、树突、β连环蛋白-T细胞因子(TCF)复合物、树突分支等子集，在分子功能(MF)本体主要富集于突触后密度蛋白95/果蝇圆盘大肿瘤抑制蛋白/紧密连接带-1蛋白(PDZ)结合结构域、转录因子结合、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性、谷氨酸受体活性、微管蛋白结合等子集。KEGG通路富集分析显示 Pax2基因相关ASD易感基因主要分布在丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、长时程抑制、谷氨酸能突触等通路。核心 Pax2基因相关ASD易感基因为 Gria1、 Dlg2、 Ntrk2、 Grid2、 Igf1、 Jmjd1c、 Ldb1、 Tcf4、 Tcf7l2、 Adrb2。(2)Western blotting实验显示，对照组、实验组小鼠海马组织中GluN2B蛋白的相对表达量分别为2.36±0.60、0.85±0.44，差异有统计学意义( P<0.05)。 结论:Pax2基因异常可能导致 Pax2基因相关ASD易感基因的表达或功能异常，并通过多种机制参与ASD的发病。

目的 探究长链非编码RNA(LncRNA)转录因子7类似物2(TCF7L2)在表皮生长因子受体基因(EGFR)突变的非小细胞肺癌(NSCLC)组织表达及其与病人临床病理特征和预后相关性.方法 选取2019年3月—2021年6月河北北方学院附属第一医院治疗的EGFR突变NSCLC病人104例为研究对象,分别取其癌组织和癌旁组织应用逆转录PCR(RT-PCR)检测LncRNA TCF7L2的表达,比较不同组织TCF7L2表达及其与临床病理特征和预后的相关性.结果 RT-PCR检测结果显示,癌组织中LncRNA TCF7L2表达量显著高于癌旁组织(t=12.410,P＜0.05).与LncRNA TCF7L2低表达病人比较,高表达者发生淋巴结转移更多、肿瘤体积更大(x2=4.579、7.762,P＜0.05);LncRNA TCF7L2高表达病人6、9和12个月的生存率较低,但差异均无统计学意义(P＞0.05).结论 LncRNA TCF7L2在EGFR突变NSCLC病人癌组织表达高于癌旁组织,且TCF7L2高表达病人的淋巴结转移风险较高、肿瘤体积较大,其生存率可能较低.

目的 探讨河北地区 T2DM 患者转录因子 7 类似物 2(TCF7L2)基因 rs290487、rs7903146位点单核苷酸多态性(SNP)与DKD发生的相关性.方法 选取2020 年1月至2023 年6月于我院内分泌科治疗的T2DM患者 619 例,根据是否合并DKD分为单纯T2DM组(n=317)和T2DM合并DKD组(DKD,n=302),比较两组TCF7L2 rs290487、rs7903146 位点SNP资料,分析SNP与DKD的相关性.结果 两组TCF7L2 基因rs290487、rs7903146 位点基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg遗传平衡(P>0.05),等位基因频数分布均符合Hardy-Weinberg遗传平衡(P>0.05).单因素Logistic回归分析显示,显性模型中TC+CC基因型携带者DKD风险是TT基因型携带者的2.772 倍.多因素Logistic回归分析显示,TC+CC基因型携带者DKD风险是TT基因型携带者的2.837 倍.结论 TCF7L2 基因rs290487 位点TC、CC基因型是DKD发生的危险因素,rs290487 位点基因突变可能与河北地区T2DM患者DKD发生相关.

目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)结肠癌相关转录本2(CCAT2)在高糖培养条件下心肌细胞中的表达变化及通过Wnt/β-catenin信号通路调控心肌细胞损伤和凋亡的机制.方法 体外培养人心肌细胞AC16,将细胞分为4组,对照组、高糖组、高糖+干扰RNA阴性对照组、高糖+干扰RNA组(干扰RNA的靶标为lncRNA CCAT2).采用CCK8法及流式细胞术检测细胞增殖和凋亡率;实时荧光定量PCR(qPCR)检测lncRNA CCAT2、β-catenin、转录因子7类似物2(TCF7L2)、Caspase-3、c-Myc、细胞周期蛋白(Cyclin)D1基因的表达;Western blot检测β-catenin、TCF7L2、CyclinD1蛋白表达;检测细胞培养液中超氧化物歧化酶(SOD)、乳酸脱氢酶(LDH)和天门冬氨酸氨基转移酶(AST)活性.结果 高糖培养条件下的AC16心肌细胞lncRNA CCAT2的基因表达显著高于对照组(P<0.05),同时β-catenin、TCF7L2、Caspase-3、c-Myc、CyclinD1基因表达显著上调(P<0.05),细胞增殖受到抑制(P<0.05),凋亡率增加(P<0.05),细胞培养液中LDH和AST活性显著升高(P<0.05),细胞中SOD活性显著降低(P<0.05).高糖培养条件下,RNA干扰lncRNA CCAT2表达后,细胞增殖增加(P<0.05),细胞凋亡率显著下降(P<0.05),β-catenin、TCF7L2、Caspase-3、c-Myc、CyclinD1基因的表达下调(P<0.05),β-catenin(细胞核)、TCF7 L2、CyclinD1蛋白表达显著下调(P<0.05),β-catenin(细胞质)蛋白表达显著上调(P<0.05).结论 高糖条件下,lncRNA CCAT2可通过Wnt/β-catenin信号通路调控心肌细胞损伤和凋亡.

目的 探讨转录因子7类似物2(transcription factor 7 analogue 2,TCF7L2)的单核苷酸多态性(single nucleotide poly-morphism,SNP)位点与2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)之间的相关性,为个体T2DM发病风险的预测及早期干预提供依据.方法 采用回顾性病例-对照研究,选取2020年新疆维吾尔自治区墨玉县医院维吾尔族150例T2DM患者为病例组,另选取同期健康体检者218例为对照组.采用MGB探针检测两组TCF7L2基因rs7901695位点的基因型,并进行相关问卷调查和生化指标检测.采用Logistic回归模型分析不同遗传模型中基因型与T2DM遗传易感性的关联性.结果 两组在空腹血糖和低密度脂蛋白胆固醇水平方面比较,差异有统计学意义(P＜0.05).两组间TCF7L2基因rs7901695位点的等位基因和基因型分布频率比较,差异均无统计学意义(P＞0.05).多因素Logistic回归分析结果显示,在调整协变量后,TCF7L2基因rs7901695位点CC基因型与T2DM遗传易感性有相关性(P＜0.05).TCF7L2基因rs7901695位点与吸烟、饮酒和高甘油三酯在T2DM中未发现存在交互作用.结论 在新疆维吾尔自治区墨玉县维吾尔族人群中,TCF7L2基因rs7901695位点的多态性与T2DM遗传易感性存在相关性,即CC基因型可能会增加T2DM的发病风险.