目的:分析DNA甲基转移酶3B（DNMT3B）在乳腺癌中的表达及其对预后的影响，探究其在乳腺癌发生发展中及潜在靶点作用。方法:通过R语言程序分析TCGA乳腺癌数据库，使用UALCAN、Starbase database、cBioPortal、GeneMANIA、STRING等在线数据库分析DNMT3B在乳腺癌中的表达、诊断和预后价值、肿瘤免疫微环境、GO功能、KEGG信号通路和蛋白相互作用。采用qRT‐PCR检测DNMT3B在常见乳腺癌细胞系和正常乳腺上皮细胞间的表达差异。结果:在线数据库分析及验证实验提示DNMT3B在乳腺癌中高表达，且其高表达不利于乳腺癌患者的生存，提示DNMT3B可能具有诊断价值。通过GO功能、KEGG信号通路和蛋白相互作用以及肿瘤免疫微环境分析，提示DNMT3B参与乳腺癌发生发展的多种机制，可能成为新的治疗靶点。结论:DNMT3B能促进乳腺癌的发生并影响疾病的进展，可能是乳腺癌潜在的肿瘤标志物及治疗靶点。

目的:探讨约瑟芬结构域含蛋白2（JOSD2）的表达对肾透明细胞癌增殖与迁移的影响。方法:在Timer、UALCAN，数据库中分析JOSD2在肾癌中的差异表达和预后（ P<0.05）。在Caki-1细胞系中使用成簇的规律间隔短回文重复序列（CRISPR）/Cas9技术导入shRNA敲低JOSD2。设置对照组和稳定JOSD2敲低组（sh1、sh2），通过细胞计数试剂盒（CCK-8）增殖实验、平板克隆实验、Transwell实验分别观察对细胞增殖、迁移能力的影响。采用独立样本 t检验进行组间比较。 结果:生信数据库发现JOSD2在多种肿瘤中异常高表达，其中包括肾透明细胞癌[28.707（22.825～36.424）比20.433（17.507～23.548）， P<0.05]。在敲低JOSD2后，CCK-8结果显示，JOSD2敲低后细胞增殖能力明显低于对照组（3.11±0.08比2.12±0.13， t＝14.64， P<0.05；3.10±0.08比2.18±0.20， t＝10.26， P<0.05）。平板克隆形成实验结果显示，JOSD2敲低后细胞集落形成能力显著低于对照组[（365.0±34.6）个比（217.0±22.0）个， t＝6.948 P<0.05；（365.0±34.6）个比（186.0±38.2）个， t＝7.216， P<0.05]。Transwell实验显示，JOSD2敲低后细胞迁移能力显著低于对照组[（1 234.5±85.1）个比（689.8±58.7）个， t＝10.540， P<0.05；（1 234.5±85.1）个比（635.0±112.3）个， t＝6.967， P<0.05]。 结论:JOSD2在肾癌中表达上调，敲低JOSD2能抑制肾癌细胞增殖和迁移。

目的:通过生物信息学方法筛选出参与肝细胞癌（HCC）进展的核心基因（Hub gene），探讨细胞周期蛋白B2（CCNB2）在HCC发生发展及预后中的潜在作用。方法:从GEO数据库中筛选并下载四个HCC相关数据集，用GEO2R分析数据并鉴定差异表达基因（DEGs）。利用DAVID数据库对DEGs进行GO分析，Cytoscape的ClueGO插件完成KEGG信号通路富集分析，并将DEGs导入STRING数据库建立蛋白相互作用（PPI）网络图，用Cytoscape对PPI网络进行可视化，构建关键模块（cluster）和筛选核心基因。分别使用UCSC数据库和UALCAN数据库完成核心基因在TCGA肝癌中的差异表达分析和生存分析。使用Firebrowse，Oncomine和UALCAN数据库分析核心基因在包括HCC在内的多个肿瘤中的表达。用实时荧光定量PCR（RT-qPCR）检测候选基因在HCC组织和肝癌细胞系中的表达水平。结果:从四个数据集中共鉴定了73个DEGs，包括15个上调基因和58个下调基因。KEGG信号通路富集分析显示DEGs主要富集于肿瘤相关通路。基于DEGs的PPI网络图,筛选了一个关键模块和10个核心基因。CCNB2与NCAPG在多个数据库的肝癌组织中均高表达。CCNB2与NCAPG呈正相关，被认为是与预后相关的关键基因（ P < 0.01）。RT-qPCR结果表明CCNB2在人肝癌组织和细胞系中高表达（ P < 0.01）。 结论:成功筛选出HCC相关的DEGs和核心基因，其中CCNB2在HCC中高表达且与患者生存预后相关，有望成为HCC诊疗和预后的生物标志物。

目的:探讨慢病毒稳定下调腺苷二磷酸核糖基化因子的三磷酸鸟苷酶激活蛋白1(ASAP1)表达对肺腺癌细胞增殖和侵袭的影响。方法:收集郑州大学第一附属医院病理科2022年8月1日至2023年5月1日手术切除肺腺癌及配对癌旁组织各5例，免疫组织化学(IHC)检测ASAP1在人肺腺癌组织中的表达，结合在线数据库(KM-plotter、HPA、UALCAN)分析ASAP1表达与肺腺癌患者预后的关系。在体外用ASAP1阴性对照慢病毒(NC)和ASAP1敲低短发夹RNA慢病毒(ASAP1 KD)感染A549和HCC4006细胞，构建稳定下调ASAP1表达的肺腺癌细胞系。蛋白印迹(WB)检测ASAP1蛋白下调效率，通过平板克隆实验、细胞活力检测试剂盒(CCK-8)、迁移实验、Transwell侵袭实验、蛋白印迹检测下调ASAP1对细胞增殖侵袭的影响和对上皮-间充质转化(EMT)相关蛋白表达的影响，两组间比较采用独立样本 t检验。 结果:ASAP1在人肺腺癌组织中的表达远高于癌旁正常组织(209.70±9.02比48.33±2.89， t＝29.51， P<0.01)，且多个数据库显示ASAP1的表达与患者不良预后明显相关[KM-plotter数据库( P<0.0001)、HPA数据库( P<0.001)、UALCAN数据库( P<0.01)]；体外实验结果显示，较NC组，ASAP1 KD组的ASAP1蛋白表达明显下调(A549细胞株：0.99±0.03比0.36±0.01， t＝27.39， P<0.01；HCC40006细胞株：1.02±0.07比0.27±0.07， t＝11.08， P<0.01)，细胞形成的克隆数量明显减少(A549细胞株：233.70±5.51比33.67±10.02， t＝69.28， P<0.01；HCC4006细胞株：333.3±30.55比50.33±5.508， t＝14.17， P<0.01)，细胞在450nm波长处的吸光度值降低(A549细胞株：1.18±0.06比0.64±0.11， t＝8.20， P<0.05；HCC4006细胞株：0.94±0.04比0.57±0.09， t＝4.79， P<0.05)。此外，ASAP1 KD组穿过小室成功迁移的细胞数量明显减少(A549细胞株：137.00±8.54比19.67±5.03， t＝32.00， P<0.01；HCC4006细胞株：42.67±3.51比12.33±2.51， t＝45.50， P<0.01)，穿过基质胶成功侵袭的细胞数量明显减少(A549细胞株：207.70±9.07比(41.33±4.73， t＝49.17， P<0.01；HCC4006细胞株：35.00±5.00比6.67±1.53， t＝9.39， P<0.01)；ASAP1 KD组EMT相关蛋白E-钙粘蛋白(E-cadherin)表达升高(A549细胞株：0.45±0.2比0.82±0.06， t＝10.58， P<0.01；HCC4006细胞株：0.42±0.06比0.78±0.07， t＝6.59， P<0.01)；N-钙黏蛋白(N-cadherin)表达降低(A549细胞株：0.79±0.05比0.39±0.03， t＝11.67， P<0.01；HCC4006细胞株：0.72±0.06比0.25±0.02， t＝11.91， P<0.01)；波形蛋白(Vimentin)表达降低(A549细胞株：0.69±0.02比0.36±0.01， t＝24.56， P<0.01；HCC4006细胞株：0.79±0.03比0.48±0.02， t＝13.25， P<0.01)。 结论:ASAP1在肺腺癌中高表达并与患者不良预后相关，下调ASAP1表达可抑制肺腺癌细胞的增殖和侵袭。

目的:通过生物信息学分析转录因子E2F1/2/7/8在前列腺癌(PCa)中的生物学作用。方法:在GEPIA数据库中，以50%为界值将E2F1/2/7/8基因表达水平分为低表达组和高表达组，分析E2F1/2/7/8表达差异与PCa患者无病生存率(DFS)的关系。TCGA数据库包含497例PCa和52例正常前列腺组织，UALCAN网站分析TCGA数据库中基因转录水平及其与Gleason评分的关系。分别获取E2F1/2/7/8的相关基因，将4组相关基因取交集绘制韦恩图获得最终相关基因，进一步行GO功能分析和KEGG通路富集分析。结果:E2F1/2/7/8表达水平越低，PCa患者DFS越高(均 P<0.05)。与正常前列腺组织比较，PCa组织中E2F1/2/7表达升高(均 P<0.05)。E2F1/2/7/8表达水平越高，PCa患者的Gleason评分越高(均 P<0.05)。126个最终相关基因的GO功能分析显示，相关基因在生物学过程(BP)方面主要富集于细胞分裂、有丝分裂、姐妹染色体结合、细胞增殖以及DNA复制等，在细胞成分(CC)方面主要富集于细胞核、细胞核质、细胞质以及细胞溶质等，在分子功能(MF)方面主要富集于蛋白结合、ATP及DNA结合等；KEGG富集于细胞周期、卵母细胞减数分裂、孕酮介导的卵母细胞成熟等信号通路。 结论:转录因子家族中E2F1/2/7/8可通过调节细胞周期，发挥致癌基因作用。

目的:探讨腺苷酸环化酶（ADCY）2/4/5/8在皮肤恶性黑色素瘤中的表达、作用及功能机制，验证ADCY2/4/5/8对黑色素瘤细胞A375增殖和迁移的影响。方法:通过基因表达谱分析（GEPIA）和人类蛋白质图谱（HPA）数据库分析ADCY2/4/5/8 mRNA和蛋白的表达以及基因表达与预后的关联，UALCAN、DeMth和cBioPortal数据库分析ADCY2/4/5/8基因甲基化和突变状态，DAVID和STRING数据库对ADCY2/4/5/8基因进行基因富集分析和通路分析。qPCR检测黑色素瘤A375细胞及色素痣FF细胞中ADCY2/4/5/8 mRNA的相对表达。将A375细胞分为实验组和对照组分别转染ADCY2/4/5/8过表达质粒和对照空载体，采用CCK8和Transwell实验检测过表达ADCY2/4/5/8对A375细胞增殖和迁移的影响，qPCR检测过表达ADCY2/4/5/8基因对A375细胞增殖、迁移相关基因mRNA相对表达的影响，Western印迹法检测过表达ADCY2/4/5/8基因对A375细胞环磷酸腺苷（cAMP）信号通路的影响。组间比较采用单因素方差分析和重复测量方差分析，组间两两比较采用LSD- t检验。 结果:GEPIA数据库分析显示，558例正常组织中，ADCY2、ADCY4、ADCY5和ADCY8 mRNA在黑色素瘤组织（ n = 461）中表达下调（ P < 0.01）。对GEPIA数据库中黑色素瘤ADCY2/4/5/8 mRNA的表达分层分析显示，ADCY2 mRNA（ P = 0.015）和ADCY8 mRNA（ P = 0.038）的表达与肿瘤分期相关，表达越低，分期越晚。HPA数据库30例黑色素瘤临床样本和正常组织中，ADCY2/4/5/8蛋白在黑色素瘤组织较正常组织表达降低（ P < 0.001）。UALCAN和DeMth数据库分析显示，与正常组织相比，ADCY2/4/5/8在黑色素瘤组织和转移性黑色素瘤组织中甲基化水平升高（ P < 0.001）。DAVID、STRING分析示，ADCY2/4/5/8基因可能通过激活cAMP信号通路抑制细胞增殖和迁移。qPCR检测显示，A375细胞中ADCY2/4/5/8 mRNA的相对表达均低于FF细胞。CCK8实验显示，培养48、72 h时，过表达ADCY2/4/5/8实验组A375细胞存活率均低于对照组（均 P < 0.05）。Transwell实验显示，过表达ADCY2/4/5/8实验组A375细胞迁移数均低于对照组（均 P < 0.01）。qPCR结果显示，过表达ADCY2/4/5/8实验组A375细胞上皮钙黏蛋白mRNA相对表达高于对照组，Ki67、波形蛋白、神经钙黏蛋白和基质金属蛋白酶2 mRNA相对表达低于对照组（均 P < 0.001）。Western印迹实验显示，过表达ADCY2/4/5/8实验组A375细胞cAMP和磷酸化蛋白激酶A（p-PKA）表达高于对照组（ P < 0.001），实验组与对照组细胞PKA蛋白表达水平差异无统计学意义（ P > 0.05）。 结论:ADCY2/4/5/8在黑色素瘤组织中低表达，过表达时可抑制黑色素瘤细胞的增殖和迁移，可能作为潜在的抑癌基因参与黑色素瘤的进展。

目的:利用生物信息学，研究CXCL13在非小细胞肺癌(NSCLC)中的作用。方法:利用Gepia数据库分析CXCL13在NSCLC患者中mRNA表达。利用Proteinatlas数据库分析CXCL13在NSCLC患者肺中蛋白表达水平并对肺腺癌(LUAD)与肺鳞癌(LUSC)中检测进行比较。通过网页工具TIMER研究CXCL13在NSCLC患者免疫浸润中的作用。CancerSEA分析CXCL13在不同GEO数据集中表达。利用Ualcan数据库分析CXCL13在NSCLC中启动子甲基化情况。结果:Gepia结果显示CXCL13在NSCLC中mRNA的表达明显高于正常组。Proteinatlas结果显示NSCLC癌组织中CXCL13蛋白表达高于正常肺组织。TIMER分析结果显示CXCL13的表达在NSCLC患者中肿瘤纯度呈负相关，与NSCLC患者的B细胞、T细胞CD8 +细胞、Tregs细胞浸润呈正相关( P<0.05)，但相关程度比较低( Rho<0.7)。经多因素Cox回归分析，CXCL13高表达合并高水平T细胞CD8 +细胞浸润组LUSC患者预后好于CXCL13高表达合并低水平T细胞CD8 +细胞浸润组( P<0.05)，CXCL13高表达合并低水平Tregs细胞浸润组LUSC患者预后好于CXCL13高表达合并高水平Tregs细胞浸润组( P<0.05)。CancerSEA分析显示CXCL13表达在NSCLC与转移和侵袭呈正相关，与DNA修复呈负相关。Ualcan分析显示CXCL13在LUAD患者中启动子甲基化呈高甲基化状态，在LUSC患者中呈低甲基化状态。 结论:CXCL13参与NSCLC免疫细胞浸润和肿瘤细胞功能，CXCL13也许可以作为NSCLC免疫治疗的靶点之一。

目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)核旁斑富集转录本1(NEAT1)在鼻咽癌中的表达情况及其对鼻咽癌放疗敏感性的影响.方法 (1)使用UALCAN数据库分析NEAT1在头颈部鳞状细胞癌中的表达情况及其与患者临床分期、预后的关系.(2)利用实时荧光定量PCR检测鼻咽癌组织及正常鼻咽黏膜上皮、人永生化鼻咽上皮细胞NP-69及多株鼻咽癌细胞(CNE-1、CNE-2、CNE-2R、C666-1、C666-1R)中NEAT1的表达情况.(3)使用RNA干扰技术构建NEAT1沉默的CNE-2R细胞[NEAT1-短发夹RNA(shRNA)组],并设立对照组(未转染的CNE-2R细胞)、NEAT1-NC组(转染对照序列的CNE-2R细胞).给予不同放射剂量X线照射后,检测3组CNE-2R细胞的存活率、凋亡率、克隆形成率及放射生物学参数.结果 (1)NEAT1在头颈部鳞状细胞癌组织中呈高表达,且表达水平随着头颈部鳞状细胞癌分期的增加呈升高趋势(P＜0.05),但不同NEA T1表达水平患者的总生存率差异无统计学意义(P＞0.05).(2)相较于正常鼻咽黏膜上皮组织,鼻咽癌组织中NEAT1表达上调(P＜0.05).相较于NP-69细胞,NEAT1在鼻咽癌细胞中的表达上调(P＜0.05),其中CNE-2R细胞中的表达量最高(P＜0.05);放射抗拒性细胞CNE-2R、C666-1R中NEAT]的表达量分别高于放疗敏感性细胞CNE-2、C666-1(P＜0.05).(3)在接受不同剂量X射线照射后,与对照组及NEAT1-NC组比较,NEAT1-shRNA组CNE-2R细胞存活率、克隆形成率及放射生物学参数降低,凋亡率升高(P＜0.05),但对照组与NEAT1-NC组上述指标差异无统计学意义(P＞0.05).结论 lncRNANEAT1在鼻咽癌组织和细胞中呈高表达,与肿瘤分期密切相关,沉默NEAT1的表达可增加鼻咽癌的放疗敏感性.

目的:探究溶质载体家族41成员A3(SLC41A3)在胃癌(GC)组织的表达、临床预后价值以及其对肿瘤细胞侵袭和迁移能力的影响。方法:利用在线生物信息学数据库Oncomine、UALCAN和Kaplan-Meier Plotter探究SLC41A3 mRNA在GC组织中的表达及其与患者预后的关系；然后，分别利用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)和免疫组织化学(IHC)检测96例临床GC组织中SLC41A3 mRNA和蛋白的表达水平，并进一步分析SLC41A3蛋白表达水平与患者临床病理学特征和预后的相关性；最后，检测SLC41A3 mRNA在GC细胞中的表达水平及其对肿瘤细胞侵袭和迁移能力的影响。计量资料采用 t检验，计数资料采用 χ2检验，生存分析采用Log-rank检验和Cox单因素和多因素回归分析。 结果:Oncomine数据库分析显示SLC41A3 mRNA在GC组织中的表达量显著高于正常胃组织(DErrico： t＝4.147， P<0.01；Cho： t＝2.420， P<0.05；Chen： t＝1.687， P<0.05)。UALCAN分析结果分析，SLC41A3 mRNA在GC中的表达与肿瘤分级、N分期和TNM分期相关(均 P<0.05)。Kaplan-Meier Plotter数据库显示，SLC41A3 mRNA高表达组的GC患者的总生存期(OS)明显短于低表达组[219175_s_at：风险比( HR)＝1.86(1.53~2.27)，Log-rank P<0.01；224931_at： HR＝1.67(1.33~2.10)，Log-rank P<0.01]。RT-qPCR和IHC结果证实，GC临床样本中SLC41A3 mRNA和蛋白的表达水平明显高于对应的癌旁组[RT-qPCR：3.768±0.196比1.397±0.089， t＝11.000， P<0.01；IHC：(7.150±0.137)分比(3.910±0.083)分， t＝20.210， P<0.01]，且SLC41A3蛋白在GC中的表达与组织学分级( χ2＝7.055， P<0.01)、T分期( χ2＝4.018， P<0.05)、N分期( χ2＝5.888， P<0.05)、TNM分期( χ2＝8.114， P<0.01)、脉管侵犯( χ2＝4.444， P<0.05)、神经侵犯( χ2＝6.160， P<0.05)明显相关。进一步，Kaplan-Meier分析结果表明，与SLC41A3蛋白低表达比较，高表达组GC患者5年生存率明显低于低表达组(31.7%比61.1%，Log-rank P<0.01)。Cox多因素回归分析结果表明，SLC41A3蛋白高表达是影响GC患者OS的独立危险因素[ HR＝1.984，95%可信区间( CI)：1.102~3.436， P<0.05]。体外细胞实验结果表明，SLC41A3在GC细胞中的表达明显高于正常胃上皮细胞，过表达SLC41A3显著增强胃癌细胞的侵袭和迁移能力。 结论:SLC41A3高表达与GC的恶性进展和患者的不良预后密切相关。

目的:探讨丝氨酸蛋白酶抑制剂E2(SERPINE2)在食管鳞癌细胞迁移和侵袭中的作用及相关分子机制。方法:运用TCGA(http：//gepia.cancer-pku.cn/detail.php和http：//ualcan.path.uab.edu/index.html)数据库对SERPINE2在食管癌中的表达进行分析。采用定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)法检测正常食管上皮细胞NE2、食管鳞癌细胞KYSE30和KYSE150中SERPINE2 mRNA的表达。在KYSE30细胞中转染SERPINE2敲降或过表达质粒，以qRT-PCR法检测表达效果。采用体外迁移侵袭实验分析SERPINE2与食管鳞癌细胞迁移和侵袭的关系。采用免疫荧光、qRT-PCR和Western blot等实验检测SERPINE2与β-catenin和靶基因c-Myc、cyclin D1和CD44表达的相关性。结果:数据库中182例和95例食管癌和食管鳞癌组织样本中，SERPINE2 mRNA在食管癌和食管鳞癌组织中表达均增高( P<0.05)；SERPINE2在食管鳞癌KYSE30和KYSE150细胞中均呈高水平表达( P<0.01)。对照组细胞的迁移和侵袭数分别为(212.66±24.11)个/视野和(136.00±14.42)个/视野，SERPINE2敲降组1细胞的迁移和侵袭数分别为(88.33±9.71)个/视野和(77.00±9.53)个/视野，SERPINE2敲降组2细胞的迁移和侵袭数分别为(66.00±8.00)个/视野和(45.66±3.78)个/视野，与对照组相比，差异均有统计学意义(均 P<0.01)。对照组细胞的迁移和侵袭数分别为(250.00±30.00)个/视野和(203.33±15.27)个/视野，SERPINE2过表达组细胞的迁移和侵袭数分别为(383.33±35.11)个/视野和(246.66±25.16)个/视野，与对照组比较，差异均有统计学意义(均 P<0.01)。SERPINE2过表达组细胞中β-catenin表达上调，p-β-catenin表达下调，β-catenin转录活性增强，c-Myc、cyclin D1和CD44 mRNA表达上调。在对照组和SERPINE2过表达组细胞培养基中分别加入iCRT14后，对照组和SERPINE2过表达组细胞的迁移数分别为(200.00±36.05)个/视野和(258.33±22.54)个/视野，侵袭数分别为(160.00±17.32)个/视野和(188.33±25.65)个/视野，与未加入iCRT14组比较，差异均有统计学意义(均 P<0.01)。 结论:SERPINE2在食管鳞癌细胞中表达增高，通过激活β-catenin在促进食管鳞癌细胞迁移和侵袭中发挥重要的作用。