Y-STR是最常用的男性家系调查遗传标记之一，其突变机制多以经典的逐步突变理论来考量。然而，逐步突变并不能完全解释多步突变、扩增条带数量增减及基因型缺失等现象。非逐步突变的机制如非等位同源重组和基因转换，前者介导DNA复制、缺失产生多带分型及基因型缺失，后者介导二拷贝基因由"杂合子"分型突变为"纯合子"分型。此类突变机制产生的特殊分型可在法庭科学DNA数据库中核心、优选基因座中观察到，并且父子对中稳定遗传、存在一定地域分布差异。经非逐步突变机制产生的特殊分型在男性家系调查中可用于标记、细分大家系，在家系排查设置容差步长、突变率调查时应考虑非逐步突变机制造成特殊分型、多步突变的影响。本文综述非逐步突变机制及其所致特殊分型、多步突变，为其更好应用于男性家系调查提供初步理论基础。

牙釉质蛋白基因(Amelogenin)检测是目前国内外最常用的性别鉴定方法,其检测方法简便、灵敏、快捷,在法医物证学实践中具有较高的应用价值,许多商品化试剂盒包含了Amelogenin基因[1].该基因座中Amelogenin-X比Amelogenin-Y小 6 bp,正常男性会在该基因座出现Amelogenin-X和Amelogenin-Y两个峰[2],如果只有Amelogenin-X一个峰经常会被判定为女性,可能是因为Amelogenin基因的变异或片段缺失而造成性别的误判.本文通过对父子在Amelogenin 基因座均只检测出一个Amelogenin-X等位基因的案例进行分析探究,为涉及性别判定的案件和鉴定提供参考.

Y染色体短串联重复序列(Y-short tandem repeats,Y-STRs)已被广泛应用到DNA检验领域.然而,由于Y染色体存在较高的结构突变率,可能会导致部分Y-STR等位基因丢失甚至产生特殊的缺失模式,从而影响其在法医学中的应用.位于Y染色体长臂的无精子症因子(azoospermia factor,AZF)与精子发生有关,该区域微缺失可导致不育症.然而Y染色体微缺失人群是否存在特殊的Y-STR缺失模式仍有待研究.本文利用法医学上常用17个Y-STR探讨了85例Y染色体微缺失患者的Y-STR缺失模式.结果显示,单纯AZF a区缺失样本,均存在DYS439-DYS389I-DYS389II基因座无效扩增情况;单纯AZF b区或单纯AZF c区缺失样本存在DYS448基因座无效扩增;复合AZF b+c+d区缺失样本存在DYS385-DYS392-DYS448基因座无效扩增;复合AZF a+b+c+d区缺失样本存在DYS390-Y-GATA-H4-DYS385-DYS392-DYS448基因座无效扩增.因此,本研究结果提示Y-STR缺失模式与Y染色体微缺失有对应关系.

目的 探讨多个Y-STR基因座等位基因分型缺失原因,为法医学实践提供基础数据.方法 使用Y filer-platinum试剂盒对4份样本进行Y-STR分型检测,并使用Y-pathfinder试剂盒进行复核验证,同时常染色体STR分型检测.结果 1号样本含Amel-Y在内10个基因座分型缺失,其在染色体上的位置在6.86-8.78Mb之间;2号样本在DYS385a/b等15个基因座分型缺失,其在染色体上的位置在18.63-25.93Mb;3号样本在DYS533等4个基因座分型缺失,其在染色体上的位置在16.28-17.11Mb;4号样本在DYS387S1a/b等6个基因座分型缺失,其在染色体上的位置在23.78-25.93Mb.2、3、4号样本Amel-Y等位基因分型正常.4个样本分属单倍型类群I2a,G2a,O3,L.结论 4份样本Y染色体多个等位基因缺失STR基因座紧密相连,可能系染色体片段微缺失所致;Y-STR基因座分型缺失存在多样性,在法医工作中应该引起重视.

本文基于插入-缺失多态性(insertion-deletion polymorphism,InDel)遗传标记,从相关文献和dbSNP库中筛选出38个在东亚、欧洲、非洲人群中具有等位基因频率差异的祖先来源InDel位点,同时整合Amelogenin位点和Y染色体STR(DYS439)位点,以辅助未知样本的性别鉴定,采用PCR-CE技术构建了可以区分三大洲际人群的单管直接扩增复合检测体系,该体系可与微流控芯片系统相结合,1.7h内完成DNA样本自动化扩增和电泳分型.利用公共数据库1000Genomes中16个人群1 607名个体的分型数据对筛选的38个InDel位点进行初步评估;同时对构建的38-plex InDels体系的灵敏度、准确性、直接扩增能力进行验证评估;检测5种不同人群的779份样本和215份唾液卡、血卡的直接扩增样本,采用聚类分析和主成分分析方法,评价体系的推断准确性.结果表明该38-plex InDels复合检测体系分型准确,灵敏度达157 pg,能够对唾液卡和血卡直接扩增,可以区分三大洲际人群及其混合人群,能够准确推断待测样本的族群来源、估算祖先成分,且通过集成细胞裂解步骤将有望2h实现“样本进-结果出”式快速自动化InDel分型.

牙釉质蛋白基因(Amelogenin,以下简称Amel)DNA技术是目前普遍采用的性别鉴定技术手段.在X-Y染色体同源引物扩增检测Amel基因图谱上,男性显示为双峰,获得X和Y染色体扩增产物;女性显示为单峰,获得X染色体扩增产物 [1].但Amel-Y 缺失或异常都可导致无法获得Y 染色体扩增产物,从而导致性别的错判,使侦查走向歧途 [2].

目的 通过Y-STR复合扩增技术检测AMELY缺失的男性个体Y染色体的完整性,并对数据库中的STS位点进行筛选并设计引物,检测Y染色体AMEL区域的STS位点缺失情况,为进一步研究中国人口中AMELY的缺失提供数据和理论依据.方法 应用Goldeneye 20A PCR扩增试剂盒、华夏TM白金PCR扩增试剂、Y filer plus试剂盒和Goldeneye 27YB试剂盒进行PCR扩增、通过ABI 3500遗传分析仪进行毛细管电泳以及STR分型.通过UniSTS database和UCSC对Y染色体p11.2区域的多个STS位点进行筛选,部分STS位点自行设计引物,梯度PCR和常规PCR扩增结合琼脂糖凝胶电泳进行STS位点的分析.结果 Goldeneye 20A和华夏TM白金两种试剂盒分型结果均显示两父子AMELY等位基因无效扩增.Y filer plus和27YB试剂盒分型结果显示两父子均在DYS570和DYS576位点无效扩增.STS位点扩增显示两父子的Y染色体缺失的STS位点有BV703904、BV703923、SY2137、SY716、DYS256、DYS267、SY2232、SY2233、DYS261 和 DYS260.结论 AMELY 无效扩增的父子 Yp11.2缺失片段包含了 BV703904-DYS260之间的区域,长度为2.63～2.74 Mb.