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无精子症因子微缺失拓展检测方法在2例性染色体拷贝数异常患者中的应用价值
编辑人员丨5天前
目的:探讨Y染色体无精子症因子(azoospermia factor,AZF)微缺失拓展检测方法在遗传性不育和性发育异常疾病中的应用价值。方法:本研究分别运用多重聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)结合琼脂糖凝胶电泳方法、复合荧光多重PCR毛细管电泳DNA片段分析技术以及染色体核型分析技术对2020年3月就诊于河南省人民医院生殖中心的1例不育症患者(患者1)和2020年4月就诊于河南省人民医院内分泌科的1例性腺发育异常儿童(患者2)进行检测。结果:针对15个序列标签位点(sequence tagged site,STS)对这2例患者进行检测,结果未提示Y染色体AZF微缺失;针对27个STS遗传标记进行拓展检测,结果检测提示患者1位于X染色体长臂的STS位点扩增峰值是X染色体短臂扩增峰值的近3倍(Xqp),X染色体长臂的STR质控位点扩增峰为2个峰,且比值约为2∶1(GATA31E08和DXS6809),TAF9b位点在X染色体长臂扩增峰值与常染色体扩增峰值的比值约为3∶2,该患者X染色体长臂可能存在拷贝数异常。患者2,C03Yp、TAF9b、C01Yq和C11Xp位点在X染色体或Y染色体的扩增峰值与常染色体扩增峰值比值约为1∶1,X染色体的STR质控位点扩增峰为2个峰,且比值约为1∶1(GATA31E08和DXS6795),该患者可能存在X和Y染色体拷贝数异常;染色体核型分析显示患者1染色体核型为47,XY,i(X)(q10);患者2染色体核型为48,XXYY,与AZF微缺失拓展检测结果相印证。结论:与传统AZF检测方法相比,本拓展检测方法不仅可以满足AZF检测需要,还可以提示性染色体拷贝数异常,较染色体核型分析技术,具有操作简捷的特点,可减低临床检验成本及工作量。
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编辑人员丨5天前
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Y-STR非逐步突变机制研究及在男性家系调查的应用展望
编辑人员丨5天前
Y-STR是最常用的男性家系调查遗传标记之一,其突变机制多以经典的逐步突变理论来考量。然而,逐步突变并不能完全解释多步突变、扩增条带数量增减及基因型缺失等现象。非逐步突变的机制如非等位同源重组和基因转换,前者介导DNA复制、缺失产生多带分型及基因型缺失,后者介导二拷贝基因由"杂合子"分型突变为"纯合子"分型。此类突变机制产生的特殊分型可在法庭科学DNA数据库中核心、优选基因座中观察到,并且父子对中稳定遗传、存在一定地域分布差异。经非逐步突变机制产生的特殊分型在男性家系调查中可用于标记、细分大家系,在家系排查设置容差步长、突变率调查时应考虑非逐步突变机制造成特殊分型、多步突变的影响。本文综述非逐步突变机制及其所致特殊分型、多步突变,为其更好应用于男性家系调查提供初步理论基础。
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编辑人员丨5天前
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桂林汉族群体44个Y-STR基因座的突变分析
编辑人员丨5天前
目的:分析桂林汉族群体中44个Y-STR基因座的突变率。方法:应用SureID ? PathFinder荧光检测试剂盒和本实验室建立的8个RM Y-STR复合扩增系统检测631个父子对家系的样本,根据观察到的突变次数除以基因传递次数或减数分裂次数计算突变率。 结果:桂林汉族群体中44个Y-STR基因座观察到184次突变,一步突变与多步突变的比例为25.28∶1;突变率分布在1.56×10 -3~40.63×10 -3之间,平均突变率为6.53×10 -3(95%可信区间:5.60×10 -3~7.50×10 -3)。 结论:不同群体中Y-STR基因座的突变率存在差异,不同群体的RM Y-STR基因座不同。
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编辑人员丨5天前
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DNATyper17+28Y复合扩增体系的法医学验证
编辑人员丨5天前
目的:DNATyper17+28Y复合扩增体系包含16个常染色体短串联重复序列(autosomal short tandem repeat,A-STR)、28个Y染色体短串联重复序列(Y-chromosome short tandem repeat,Y-STR)和1个Amelogenin的复合扩增体系,本研究对该体系进行系列法医学验证后评估其性能指标,为实际应用提供参考。方法:本研究从体系灵敏度、种属特异性、混合样本鉴别能力、准确性、重现性、稳定性、耐受性、PCR扩增条件等方面对该体系进行了系统验证。结果:该体系灵敏度高,特异性好,具有良好的准确性、重现性、稳定性和耐受性。结论:DNATyper17+28 Y复合扩增体系的各项性能指标能满足个体识别、亲缘关系分析、家系排查等检验需求,在法医物证中有应用价值。
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编辑人员丨5天前
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陈旧骨骼牙齿进行复杂亲缘关系分析
编辑人员丨3周前
目的 通过提取陈旧骨骼、牙齿中的DNA进行复杂亲缘关系鉴定.方法 对 1-4 号遗骸的股骨、牙齿进行预处理,在大体系疑难检材 DNA 提取仪上提取,并进行定量;血样采用 96 道全自动工作站提取;所有样本均采用VeriFiler Plus等 5 种不同试剂盒进行扩增检测;对 1 号遗骸、孙 1 进行线粒体全基因组测序;根据检验结果进行亲缘关系分析.结果 根据常染色体STR分型,1 号与 2 号遗骸存在亲缘关系,1 号遗骸与贾 1、贾 2、贾 3、孙 1存在祖孙关系;根据Y染色体STR分型,2 号、3号遗骸与贾1、贾2、贾3倾向来自同一父系,4号遗骸与贾1 等Y-STR分型不一致,不符合同一父系遗传特征;根据mtDNA全基因组检测结果,不排除 1 号遗骸与孙 1 来自同一母系.结论 通过优化预处理、提取方法以及多种检测技术联合应用,并运用多种亲缘评判标准,能够对陈旧的骨骼、牙齿等疑难检材进行复杂亲缘分析.
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编辑人员丨3周前
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疑似父子Y染色体Yp11.2区域大片段共同缺失1例
编辑人员丨3周前
牙釉质蛋白基因(Amelogenin)检测是目前国内外最常用的性别鉴定方法,其检测方法简便、灵敏、快捷,在法医物证学实践中具有较高的应用价值,许多商品化试剂盒包含了Amelogenin基因[1].该基因座中Amelogenin-X比Amelogenin-Y小 6 bp,正常男性会在该基因座出现Amelogenin-X和Amelogenin-Y两个峰[2],如果只有Amelogenin-X一个峰经常会被判定为女性,可能是因为Amelogenin基因的变异或片段缺失而造成性别的误判.本文通过对父子在Amelogenin 基因座均只检测出一个Amelogenin-X等位基因的案例进行分析探究,为涉及性别判定的案件和鉴定提供参考.
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编辑人员丨3周前
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大连汉族群体遗传结构及系统关联性的研究
编辑人员丨2024/4/27
目的 结合大连汉族人群与32个国内外群体的Y-STR单倍型遗传信息,研究其群体遗传结构和系统关联性.方法 采集大连市958位汉族男性志愿者血液样本,应用Y-STR荧光检测试剂盒和毛细管电泳分型技术完成42个基因座的基因分型,计算相关的法医学参数.并基于17个Y-STR基因座计算33个人群间的Nei氏标准遗传距离,绘制主坐标分析图,构建系统发生树.结果 针对42个Y-STR基因座的遗传多态性分析,发现了 10个基因座30种非常规的等位基因.对17个Y-STR基因座的群体遗传学分析证实大连与鞍山汉族人群遗传距离最近,其次为河南、黑龙江、吉林、山东和重庆汉族人群.此外,大连汉族与北川羌族和贵州苗族人群遗传距离相对较近,反而与同居住于辽宁的满族人群遗传距离相对较远.结论 大连汉族与其他人群的遗传距离不完全与民族和地域远近成正比,人口迁徙和民族融合与隔离都会对其产生影响.
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编辑人员丨2024/4/27
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DYS527a/b、DYF387S1a/b基因座多带与Y-SNP单倍群的关联性初探
编辑人员丨2024/1/20
目的 探讨DYS527a/b与DYF387S1a/b基因座多带分型与Y-SNP单倍群的关联性.方法 用YFilerPlus?试剂盒检测昆明地区DYS527a/b基因座为多带的 295 例无关男性样本,获取DYS527a/b、DYF387S1a/b和DYS385a/b等 3 个多拷贝基因座和各单拷贝基因座的基因型及其频率分布;用 42 个Y-SNP位点构成的AIYSNP42试剂盒对上述样本进行Y-SNP单倍群检测,探讨DYS527a/b基因座多带及其构成单倍型与相关单倍群的关联性.结果 295 例样本中DYS527a/b基因座 97.29%为三带分型、2.71%的为四带分型;DYF387S1a/b基因座54.24%的分型为三带、4.75%的分型为四带;DYS448 基因座则检测出13.22%的分型缺失.Y-SNP位点共检测出O-M175 和C-M130 等 7 种单倍群,其中O-M175(135 例)、C-M130(133 例),分别为占 45.76%和 45.08%,而R1-M173、N-M231、D1-M174、J-M304和F-M89单倍群低于13例频率介于4.41%~0.34%之间.不同单倍群下Y-STR分型频率也有所差异.O单倍群下DYS385a/b(12/12,XX)、DYS392(13)、DYS593(16)、DYS393(12),C单倍群下DYS527a/b(19/20/21)、DYS385a/b(11)、DYS593(17)、DYS390(23)、Y_GATA_H4(11)和DYS444(13)等分型高频分布.结论 DYS527a/b基因座多带高频分布于昆明地区C单倍群人群中,较多的C、R1 单倍群样本DYS527a/b与DYF387S1a/b基因座分型同时为多带分型;DYS527a/b、DYF387S1a/b基因座的多带、DYS385a/b基因座及DYS392 等基因座中的高频基因分型在O、C、R1 和N单倍群样本频率分布差异明显,为综合利用各基因座遗传信息与Y-SNP单倍群的关联性进而在父系家系排查中寻找更多的族源、地域信息提供方向.
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编辑人员丨2024/1/20
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人胶质母细胞瘤细胞系Y1203的构建及应用
编辑人员丨2023/11/18
目的 构建一株具备干细胞表型的胶质母细胞瘤细胞系Y1203,用于研究肿瘤细胞干性维持以及治疗耐药的潜在机制.方法 Y1203 细胞来源于一位 49 岁女性胶质母细胞瘤患者复发再手术切除的肿瘤组织.使用Y1203 细胞构建人源胶质母细胞瘤原位及皮下移植(patient derived tumor xenograft,PDX)模型.采用流式细胞术检测不同代数Y1203 细胞的细胞周期.采用实时荧光定量聚合酶链反应检测Y1203 细胞的干细胞标志物转录因子SOX-2(transcription factor SOX-2,SOX2)和细胞黏附分子分化抗原簇-44(cluster of differentiation-44,CD44)表达.基于转录组测序技术(RNA sequencing,RNA-Seq)比较Y1203 细胞和U87 细胞表达谱差异.结果 短串联重复序列(short tandem repeats,STR)鉴定确认Y1203 细胞与患者肿瘤组织同源,且其与ExPASy数据库中涵盖的常见细胞系完全不同.基因检测结果提示异柠檬酸脱氢酶 1(isocitrate dehydrogenase 1,IDH1)无突变,端粒酶反转录酶(telomerase reverse transcriptase,TERT)启动子突变,原癌基因(B-Raf proto-oncogene,BRAF V600E)、抑癌基因(tumor protein p53,TP53)和转录调控因子(ATRX chromatin remodeler,ATRX)基因突变.人胶质母细胞瘤细胞系Y1203 可实现在体外无限增殖并用于建立PDX模型.与其他胶质瘤细胞系相比,Y1203 细胞中高表达的肿瘤干细胞标志物为SOX2 和CD44,并显著富集胶质瘤干细胞相关通路.结论 人胶质母细胞瘤细胞系Y1203 分化低,恶性程度较高,对放射性治疗和化学治疗抵抗性强,具有胶质母细胞瘤干细胞特性.该细胞系的建立为胶质母细胞瘤临床前研究提供了实验基础.
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编辑人员丨2023/11/18
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基于文献计量分析的法医系谱学研究现状与展望
编辑人员丨2023/11/11
目的 法医系谱学是近年来法医遗传学研究前沿之一.本文使用文献计量学方法研究法医系谱学的发展现状、研究热点和科研趋势.方法 在Web of Science和CNKI数据库中分别检索法医系谱学、Y染色体遗传标记相关的英文、中文文献,运用VOSviewer、R语言bibliometrix安装包等工具对发文情况、文献来源、国家(地区)分布、科研机构合作关系、关键词、参考文献共被引关系进行数据统计及可视化分析.结果 获得1999~2023年法医系谱学相关英文文献 176 篇,2007~2023 年中文文献 65 篇,2003~2023 年Y-STR、Y-SNP相关英文文献105 篇,2007~2023 年中文文献 11 篇.在法医系谱学相关的文献中,英文文献发文量最多的国家(地区)是美国(55 篇),中国排名第 7(10 篇);英文文献出现频次排名前五的关键词分别是Forensic genetic genealogy、DNA、Y chromosome、Identification、Forensic genentics,中文文献中的则是家系排查、Y-STR、法医遗传学、法医物证学、Y染色体.在Y-STR、Y-SNP相关的文献中,共涉及 13个民族群体;英文文献中发文量最多的国家是中国(29篇),出现频次排名前五的关键词分别是Y-STR、Y-SNP、Y Chromosome、Diversity、mtDNA.结论 我国基于Y染色体遗传标记的法医系谱学研究发展较快.基于常染色体遗传标记共组片段分析的法医系谱学领域文献数量不多,国际国内合作范围局限,国内研究法医系谱学的科研机构较少.我国法医系谱学领域科研成果在国际的参与度和影响力仍需不断提升.
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编辑人员丨2023/11/11
