冠心病是一类以动脉粥样硬化为病理基础的心血管疾病，慢性炎症是动脉粥样硬化的特征之一。外周血白细胞特别是单个核细胞，在这一过程中发挥了重要作用。最近，在一系列的全表观基因组关联研究（EWAS）中，发现了与冠心病相关的外周血白细胞多个DNA差异甲基化位点，进而提示DNA差异甲基化位点是冠心病新的危险因素。DNA甲基化作为一种常见的表观遗传核酸修饰在冠心病发生发展中的作用不断得到肯定，有成为冠心病预警标志物的潜力，也为冠心病的机制研究提供了新的思路和证据。

目的:探讨酪氨酸激酶抑制剂（TKI）耐药的慢性粒细胞白血病（CML）患者基因突变特征和规律，及其与TKI耐药CML的关系。方法:回顾性病例系列研究。回顾性分析2018年8月至2022年11月在南方医科大学南方医院和汕头大学医学院附属粤北人民医院就诊的TKI耐药CML患者的临床资料和二代测序结果，分析总体及不同疾病阶段患者基因突变情况。结果:共收集60例TKI耐药的CML患者，患者年龄[ M（ Q1， Q3）]41.5岁（32岁，53岁）；男性38例（63.33%），女性22例（36.67%）；慢性期43例，进展期17例（加速期3例，急变期14例）。共30例（50.00%）检测出非ABL1基因突变，包括45次15个非ABL1基因；60例患者中非ABL1突变基因数为1个（0个，2个）。60例患者中，ASXL1突变21例（35.00%），DNMT3A和RUNX1突变各5例（8.33%），SETBP1突变3例（5.00%）；检测出1个和≥2个非ABL1基因突变患者分别占33.33%（20/60）和16.67%（10/60）。进展期和慢性期患者非ABL1基因突变总检出率分别为52.94%（9/17）、48.84%（21/43），≥2个非ABL1基因突变的检出率分别为23.53% （4/17）、13.95%（6/43），但差异均无统计学意义（ χ2＝0.08， P＝0.774； χ2＝0.80， P＝0.370）。60例患者中17例（28.33%）ABL1激酶区突变，其中14例（82.35%）非ABL1基因突变；这17例中，6例进展期患者均非ABL1基因突变，11例慢性期患者中8例非ABL1基因突变，但差异无统计学意义（ P＝0.452）。 结论:TKI耐药的CML患者非ABL1基因突变率较高，并且进展期患者的突变率有高于慢性期患者的趋势，可能与耐药CML患者的BCR-ABL1融合基因异常激活ABL1激酶，导致基因组和表观基因组进一步突变，驱动疾病由慢性期向加速期或急变期进展有关。

脓毒症异质性是影响其临床疗效和预后的关键因素。多组学技术和整合功能生物学发展促进了机器学习和智能算法在脓毒症异质性内在分子机制的研究，经转录组、蛋白质组、表观遗传组以及外泌体特征谱等多角度分析，提出了脓毒症内表型概念，使脓毒症可以分为临床亚型、代谢亚型、免疫亚型等。脓毒症内表型认知逐步拓展至诊断、危重度评估、临床研究患者筛选、个体化诊疗等多个层面，为脓毒症精准干预带来新思路。

肝脏疾病是全球沉重的疾病负担之一，但鉴于其发病机制十分复杂，治疗选择相对受限，所以需要新技术对其发病机制进行深入研究。单细胞测序（SCS）作为一种新兴测序方法，通过对单个细胞的基因组、转录组和表观基因组测序，反映细胞间的异质性，进而揭示疾病发生和发展过程中的复杂机制。SCS在肝病研究中的应用将丰富我们对肝病发病机制的理解，为探索肝病的诊疗方法提供新方向。现主要对SCS技术在肝脏疾病中的研究进展予以综述。

表观遗传修饰基因是一类其产物通过DNA甲基化、组蛋白修饰或染色质重塑修饰表观基因组的基因。越来越多的研究表明，表观遗传修饰基因突变是心脏发育异常相关罕见病的一个重要病因。此类疾病因表观遗传的组成成分改变，常累及包括心脏在内的多个器官系统。由于有效药物的缺乏、心血管畸形的复杂性，患儿的生命健康往往受到威胁。该文回顾了Tatton-Brown-Rahman综合征、歌舞伎综合征、Rubinstein-Taybi综合征、CHARGE综合征和Sifrim-Hitz-Weiss综合征这五种心脏发育异常相关罕见病的分子遗传学进展，主要阐述了相应表观遗传修饰基因突变致心血管畸形的作用机制，为该类疾病的临床诊断和治疗提供更为全面的参考依据。

肝内胆管细胞癌(ICC)是起源于二级胆管近端上皮的高度恶性肿瘤。ICC有多种发病原因，并有广泛的地理差异。其分子机制涉及基因组、表观遗传和基质环境水平等多种分子改变，导致多个信号转导通路失调。病理大体分型有肿块型、管周浸润型、管内生长型3种，肿块＋管周浸润混合型恶性程度最高。ICC早期诊断不易，CA19-9、癌胚抗原等肿瘤指标有一定参考价值，并需要多种影像学检查相互印证诊断。手术切除效果主要取决于肿瘤性质、肿瘤的血管侵犯与否、手术无瘤切缘及是否有淋巴转移等。淋巴结清扫有争议，如明确局部淋巴转移，规范的淋巴结清扫可改善ICC预后。部分ICC患者可通过腹腔镜分期获益；在有经验的中心，微创治疗可为特定的ICC患者提供与开放切除术相似的肿瘤学结局。在极早期ICC患者中，肝移植是可行的，但需要进一步临床验证。

单细胞测序技术是在单细胞水平上，对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项新技术。目前，单细胞测序技术已广泛应用于膀胱癌的研究，通过识别不同的细胞亚群、免疫微环境，开辟了解膀胱细微肿瘤生物学的新途径，并且单细胞测序技术有望通过识别和使用新的生物标志物和靶向治疗，对膀胱癌的诊断和治疗做出重要改变。本文总结单细胞测序技术在膀胱癌的异质性细胞亚群、发生发展规律、免疫微环境和耐药性等方面中最新的研究应用进展。

目的:通过整合生物信息学分析筛选与肺栓塞相关的遗传和表观遗传表达差异。方法:以2019年就诊与新疆医科大学第三附属医院肺栓塞患者及健康体检者4例作为研究对象，利用高通量测序技术及甲基化芯片技术检测、筛选并整合外周血差异基因组和表观基因组数据来识别致肺栓塞发病的甲基化驱动基因及差异表达基因，行GO及KEGG富集分析。结果:将肺栓塞组和健康对照组间DNA甲基化和基因表达数据进行共表达分析，基因上游区域差异甲基化与基因表达呈负相关，其中共筛选出基因上游区域显著甲基化基因有8个，采用独立样本的T检验及Pearson相关性分析，肺栓塞组中TSS1500显著甲基化基因有6个，分别为TSPO2、C1QA、AQP1、TNFSF9、MIA、STAB1，对应基因的差异表达倍数log2FC分别是1.298，1.629，1.024，2.746，2.539，1.060，基因表达与基因甲基化之间的相关度分别是-0.908，-0.900，-0.824，-0.784，-0.783，-0.779，两组间甲基化差异分别是-0.049，-0.053，-0.048，-0.057，-0.050，-0.053（ P<0.05）。TSS200区域显著甲基化基因有3个，分别为TSPO2，SLCP9A3，SIGLEC1，基因表达差异倍数log2FC分别是1.298，-2.252，1.866，基因表达与基因甲基化之间的相关度分别是-0.860，-0.774，-0.739，两组间甲基化差异分别是-0.051，0.027，-0.048（ P<0.05）。肺栓塞组中在TSS区域有TSPO2、C1QA、AQP1、TNFSF9、MIA、STAB1、SIGLEC1共7个基因呈现低甲基化高表达状态。SLC9A3基因呈现高甲基化低表达。GO功能分析中，在补体活化、免疫反应、激活蛋白级联等得到显著富集。在KEGG信号通路中，免疫系统、细菌感染以及信号分子及相互作用方面得到显著富集，从而调控肺栓塞的发生。 结论:基于DNA甲基化和基因表达的联合分析，发现了肺栓塞发生发展的新思路，后续可进行更加深入的研究。

抗磷脂综合征（APS）以动、静脉血栓形成和/或病态妊娠为主要临床特征，并伴有持续抗磷脂抗体（aPL）阳性。但由于APS发病机制复杂，患者aPL谱的表达情况个体差异较大，仅从抗体层面可能无法解决APS诊断、预后判断和风险评估难的问题，需要利用新技术多维度来挖掘APS新型生物标志物。高通量测序（NGS）技术在遗传性疾病和肿瘤等高发体细胞突变的相关疾病应用已较为成熟，因此尝试采用NGS从基因组、转录组、表观组等各方面了解APS研究应用进展。现对NGS技术在APS中的相关研究进行阐述，为筛选APS相关标志物及其发病机制的深入认识提供更多参考。

Background::Epigenetics, and especially DNA methylation, contributes to the pathogenesis of sporadic amyotrophic lateral sclerosis (SALS). This study aimed to investigate the role of DNA methylation in SALS using whole blood of SALS patients.Methods::In total, 32 SALS patients and 32 healthy controls were enrolled in this study. DNA was isolated from whole blood collected from the participants. DNA methylation profiles were generated using Infinium MethylationEPIC BeadChip.Results::We identified 34 significant differentially methylated positions (DMPs) in whole blood from SALS patients, compared with the healthy controls. Of these DMPs, five were hypermethylated and 29 were hypomethylated; they corresponded to 13 genes. For the DMPs, ATAD3B and BLK were hypermethylated, whereas DDO, IQCE, ABCB1, DNAH9, FIGN, NRP1, TMEM87B, CCSAP, ST6GALNAC5, MYOM2, and RUSC1-AS1 were hypomethylated. We also identified 12 differentially methylated regions (DMRs), related to 12 genes (NWD1, LDHD, CIS, IQCE, TNF, PDE1C, LGALS1, CSNK1E, LRRC23, ENO2, ELOVL2, and ELOVL2-AS1). According to data from the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes database, DNAH9 and TNF are involved in the amyotrophic lateral sclerosis (ALS) pathway. Correlation analysis between clinical features and DNA methylation profiling indicated that the methylation level of ELOVL2 and ARID1B was positively associated with the age of onset ( r = 0.86, adjust P = 0.001) and disease duration ( r = 0.83, adjust P = 0.01), respectively. Conclusions::We found aberrant methylation in DMP- and DMR-related genes, implying that many epigenetic alterations, such as the hypomethylation of DNAH9 and TNF, play important roles in ALS etiology. These findings can be helpful for developing new therapeutic interventions.