目的:研究二甲双胍对2型糖尿病患者微小RNA(miRNA)表达水平的影响，并利用网络药理学进行分析，预测其治疗作用潜在的靶点及途径。方法:筛选本院入院治疗的初发2型糖尿病患者15例，住院期间及出院后均规律服用盐酸二甲双胍片。患者服药6个月后，对比其用药前后血清基质金属蛋白酶(MMP)-9、转化生长因子(TGF)-β1及心肌纤维化相关miRNA的表达水平。对呈现统计学差异表达的miRNA进行基因本体论(GO)和KEGG通路富集分析，并构建差异表达miRNA对应靶基因信使RNA(mRNA)网络图。结果:患者用药后，血清MMP-9水平较用药前明显下降( P<0.05)。二甲双胍可显著下调患者血清人类微小RNA(hsa-miR) 29a-3p、hsa-miR133a-5p、hsa-miR21-5p、hsa-miR30c-5p、hsa-miR1-3p表达水平( P<0.05或 P<0.01)。GO和KEGG分析结果显示，差异表达miRNA主要集中在内质网腔、突触、基膜等细胞组分中，通过胶原分解代谢过程、短时神经元突触可塑性调节、轴突延伸等生物过程来发挥Rho GTP酶(Rho GTPase)结合、参与细胞外基质结构成分等分子功能；其主要富集于糖尿病并发症晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、Wnt信号通路等多种细胞信号转导通路。miRNA-mRNA网络分析结果显示，与差异表达miRNA对应mRNA共230个。 结论:二甲双胍可通过下调相关miRNA表达，参与相关细胞信号通路转导，调控染色质、核酸结合及酶活性过程而发挥其治疗2型糖尿病的作用。

目的:确定肠道病毒A71型(Enterovirus-A71，EV-A71)感染人扁桃体上皮细胞后miRNA表达谱的改变。方法:EV-A71以感染复数为1感染人扁桃体上皮细胞6 h后，采用Trizol提取总RNA，构建小RNA文库，在Illumina NextSeq 500平台进行高通量测序，处理数据后确定差异表达的已知和新型miRNA种类及其靶基因，进行基因本体和信号途径分析；使用psRNATarget预测具有潜在结合EV-A71基因组的差异表达的miRNA种类。实时定量RT-PCR检测差异表达miRNA的变化倍数。结果:通过高通量测序共鉴定61个已知差异表达的miRNA(下调21个、上调40个)和559个新型miRNA，新型miRNA具有典型的前miRNA的二级发卡结构。实时定量RT-PCR确定hsa-miR-517b-3p和hsa-miR-199a-5p的变化倍数与高通量测序结果基本一致。差异表达miRNA靶基因涉及到不同的生物学过程和信号途径。共鉴定出24个差异表达的miRNA(5个已知miRNA，19个新型miRNA)具有与EV-A71结合的潜在"种子序列"。结论:EV-A71感染人扁桃体上皮细胞后引起miRNA表达谱的显著改变，且差异表达的miRNA可能靶向结合EV-A71基因组进而调控EV-A71复制。

目的:探讨Human Napsin-A(NASPA)、肺表面活性物质相关蛋白A(SP-A)及肺表面活性物质相关蛋白D(SP-D)、外泌体hsa-miR-21-5p、血清中hsa-miR-29b-3和hsa-miR-30c-5p在特发性肺纤维化中的变化及其临床意义。方法:选取2015年2月至2019年8月于河南省胸科医院就诊的50例特发性肺纤维化患者(特发性肺纤维化组)资料进行回顾性研究，将同期体检健康者20名作为健康对照组。对比2组患者在NASPA、SP-A、SP-D、hsa-miR-21-5p、hsa-miR-29b-3和hsa-miR-30c-5p表达水平等项目之间的差异。结果:2组一般资料比较差异无统计学意义( P>0.05)，特发性肺纤维化组NASPA、SP-D、hsa-miR-21-5p的表达均要明显高于健康对照组( P<0.05)，SP-A、hsa-miR-29b-3的表达均较健康对照组显著降低( P<0.05)。 结论:血浆中SP-D检测能够作为特发性肺纤维化患者的潜在诊断指标；血浆中NASPA、外泌体hsa-miR-21-5p、血清中hsa-miR-29b-3检测可以作为特发性肺纤维化患者肺部疾病诊断的候选标志物，为临床诊断提供一定的指导作用。

目的:探讨利拉鲁肽对2型糖尿病(T2DM)患者血清miRNA表达谱及相关细胞信号通路蛋白水平的影响。方法:选取唐山市人民医院于2020年10月至2021年10月期间收治的26例T2DM患者，均接受利拉鲁肽治疗，所有患者持续治疗3个月，比对治疗前后血清miRNA变化情况，采用 Pearson相关分析hsa-miR29a-3p变化值与血清基质金属蛋白酶9(MMP-9)、转化生长因子(TGF)-β1变化值的相关性。对治疗前后表达水平变化差异显著的miRNA行基因本体论(GO)和KEGG通路富集分析，以及miRNA-mRNA网络分析。 结果:治疗后患者的糖化血红蛋白A1c(HbAlc)、空腹血糖(FPG)、甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白-胆固醇(LDL-C)、MMP-9以及TGF-β1水平均明显降低，而高密度脂蛋白-胆固醇(HDL-C)水平明显增加( P均<0.05)。治疗后hsa-miR1-3p、hsa-miR21-5p、hsa-miR29a-3p、hsa-miR30c-5p、hsa-miR133a-5p、hsa-miR500-5p、hsa-mi6806-5p均明显降低( P均<0.05)，其中hsa-miR29a-3p降低程度最明显( P<0.001)。 Pearson相关分析显示hsa-miR29a-3p变化值与MMP-9、TGF-β1变化值均呈正相关( r＝0.638，0.586)，差异有统计学意义( P均<0.05)。GO分析结果显示：胶原分解代谢过程、轴突延伸以及细胞黏附占生物过程前3位。细胞组分中内质网腔、突触后密度以及细胞连接占据前3位。分子功能中Rho GTPase结合、细胞外基质结构成分、磷脂酰肌醇3磷酸结合占据前3位。KEGG分析显示：差异表达基因主要富集于晚期糖基化终末产物受体信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、Wnt信号通路( P均<0.05)。miRNA-mRNA网络分析显示差异表达miRNA对应244个靶基因mRNA。 结论:T2DM患者经利拉鲁肽治疗后，血清hsa-miR29a-3p等与炎症、胶原分解代谢过程相关的miRNA表达下调，可能有利于减少患者心肌纤维化。

目的:探讨唾液腺腺样囊性癌(salivary adenoid cystic carcinoma,SACC)微环境中肿瘤相关巨噬细胞(tumor-associated macrophages,TAMs)外泌体miRNAs表达特征,分析其在SACC进展中的作用.方法:将SACC细胞与巨噬细胞共培养,获得SACC相关TAMs.应用超速离心法分别提取以上细胞外泌体,采用透射电镜、Western免疫印迹、外泌体纳米微粒追踪检测进行验证.对TAMs外泌体与对照组巨噬细胞外泌体进行RNA-seq测序,分析差异表达的miRNAs.利用miRanda和RNAhybrid软件对差异miRNAs进行靶基因预测,再对差异miRNAs作用的靶基因的集合分别进行GO和KEGG富集分析.利用qRT-PCR、CCK-8、细胞划痕实验、Transwell实验验证TAMs外泌体miRNAs表达及功能.采用SPSS 22.0软件包对数据进行统计学分析.结果:筛选出1 595个差异表达的miRNAs,其中15个miRNAs表达差异变化具有统计学意义(P＜0.05).差异miRNAs作用靶基因富集分析发现,TAMs外泌体miRNAs靶基因参与调控癌症相关信号通路.qRT-PCR结果显示,TAMs外泌体has-miR-21-5p表达上调最显著.CCK-8、细胞划痕实验和Transwell实验发现,TAMs外泌体hsa-miR-21-5p促进SACC细胞增殖、迁移与侵袭能力.结论:TAMs外泌体hsa-miR-21-5p促进SACC细胞恶性进展.TAMs外泌体miRNAs可能在SACC进展中发挥重要作用,有望为SACC的诊治提供新的策略.

目的 通过生物信息学分析方法寻找溃疡性结肠炎(UC)的差异表达基因(DEGs)及其相应的microRNA(miRNA),筛选参与UC发生发展相关的潜在致病靶点,为寻找UC诊断标志物以及新的治疗靶点提供理论依据.方法 从基因表达数据库(GEO)获取数据集,通过GEO2R对数据集进行分组和筛选DEGs并取交集,再进行PPI、GO、KEGG分析和miRNA预测.结果 GO分析显示其主要集中在中性粒细胞迁移、脂多糖应答、细胞外泌体、CXCR趋化因子受体结合等,KEGG分析显示其主要富集在补体途径凝血通路、IL-17信号通路、百日咳、类风湿性关节炎通路、肿瘤坏死因子信号通路等方面.通过Cytoscape筛选出MCC值前十的hub基因CXCL1、IL1B、TIMP1、CXCL8、IL6、MMP1、SERPINE1、PTGS2、SPP1、MMP2.通过NetworkAnalyst3.0在线网站进行可视化展示,可推断 hsa-mir-204-5p、hsa-mir-146a-5p、hsa-mir-3 3 5-5p、hsa-mir-1-3p、hsa-mir-21-5p 等 5 种 miRNA 在疾病发展中起关键作用.结论 在UC发病机制相关研究中,DEGs与疾病的发生发展密切相关,可通过对基因的富集分析、以及hub基因、关键miRNA筛选为更深入研究UC的发病机制及寻找治疗新靶点提供研究思路和理论依据.

目的 基于生物信息学分析探索影响扩张型心肌病(DCM)干细胞移植疗效的差异表达微小RNA(miRNAs)及其靶基因.方法 本研究筛选术前基线特征相似的DCM患者,以干细胞移植术后左心室射血分数改善＞5％为标准,分为治疗良好组和无效组.通过对两组患者的骨髓间充质干细胞样本进行miRNAs高通量测序,运用edgeR筛选出两组间的差异表达miRNAs,并使用MiRanda、TargetScan和RNAhybrid数据库进行靶基因预测,对预测得到的靶基因进行GO、KEGG及Reactome富集分析.使用STRING数据库和Cytoscape软件,并参考紧密度、介数中心性、度三种拓扑分析方法和韦恩图筛选关键基因.两组间比较采用t检验.结果 本研究共筛选出44个差异表达miRNAs,其中23个上调,21个下调.上调的差异表达miRNAs靶基因有908个,下调的差异表达miRNAs靶基因835个.GO分析结果显示靶基因在生物过程中主要富集在细胞代谢过程的调节,分子功能主要富集在离子结合,细胞组分则主要与细胞膜相关.KEGG通路和Reactome分析发现靶基因主要与调节干细胞多能性的信号通路、RIG-I样受体信号通路和RNA聚合酶Ⅱ转录等相关.此外,韦恩图共筛选出4个关键基因,分别为 MED1、SMAD2、TRAF6、GSK3B,其中 GSK3B 和TRAF6分别为上调的 hsa-miR-1304-3p和下调的hsa-miR-146a-3p靶基因,MED1和SMAD2为下调的hsa-miR-1299靶基因.结论 本研究提供了hsa-miR-1304-3p、hsa-miR-1299、hsa-miR-146a-3p 3 个可能用于提示 DCM 患者干细胞移植预后的差异表达miRNAs,其调控的关键基因MED1、SMAD2、TRAF6、GSK3B及所在通路可能是提高干细胞移植治疗DCM的潜在作用靶点.

目的 探索激素性股骨头坏死(SONFH)基因表达上的差异,筛选出关键致病基因,为SONFH诊疗提供新的靶点.方法 选取我院 2020 年 12 月至 2021 年 6 月SONFH患者和股骨颈骨折患者 18例作为研究对象,SONFH患者设为SONFH组(6 例),股骨颈骨折患者设为对照组(12 例),通过高通量测序筛选出 2 组患者骨组织中差异表达基因(DEGs)以及差异MicroRNAs(miRNAs),利用R软件Clusterprofiler包对DEGs进行富集分析.结合P值选取前 30 位DEGs进行文献调研,筛选关键致病基因,并通过实时荧光定量聚合酶联反应(qRT-PCR)验证其表达.使用MirSNPInTarget、miRWalk和miRDB数据库预测关键致病基因靶向的miRNAs.结果 共得到 735 个DEGs(482 个上调,253 个下调)和 111 个差异miRNAs(34 个上调,77 个下调).P值较低的前 30 位DEGs中,HMOX1 在SONFH组中呈下调表达.qRT-PCR结果显示HMOX1在SONFH组表达低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05).HMOX1 靶向的 2 个关键miRNAs为hsa-miR-21-5p、hsa-miR-148a-3p.结论 HMOX1 可能成为SONFH潜在的关键致病基因之一,参与了SONFH的发生与发展,为SONFH诊疗提供新靶点.

目的 分析甲状腺癌病例的循环miRNA与靶向基因的临床相关性.方法 选取2016年2月15日至2017年5月1日来唐山市工人医院接受治疗的60例甲状腺癌病例作为试验组,同期接受甲状腺病理检查的患者23例作为对照组.观察两组甲状腺组织和外周血中相关miRNA的表达情况,并进行相关因素分析.结果 试验组5个miRNA指标均明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.01),hsa-mir-222的表达最高.一般线性模型分析显示,乳头状瘤、肿瘤浸润、远端转移是hsa-mir-181b-2的独立危险因素;乳头状癌、髓样癌、肿瘤浸润、远端转移及肿瘤直径大于4 cm是hsa-mir-221、hsa-mir-34a、hsa-mir-21表达升高的危险因素;hsa-mir-222在乳头状癌中低表达,髓样癌中高表达,肿瘤浸润、远端转移及肿瘤直径大于4 cm是hsa-mir-222高表达的独立危险因素.结论 hsa-mir-181b-2、hsa-mir-221、hsa-mir-34a、hsa-mir-21、hsa-mir-222均与肿瘤的分化、转移和直径相关.

目的 筛选早期甲状腺乳头状癌(PTC)特征性微小RNA(miRNAs,miR)表达谱,旨在寻找一种无创早期诊断PTC标志物.方法 采用基于实时荧光定量聚合酶反应(PCR)的miRNA芯片分析10例早期PTC特征性miRNAs表达谱,采用10例甲状腺结节组织作对照鉴定和验证PTC特征性标记;同时在100例早期PTC患者术前和术后7d外周血、100例甲状腺结节患者外周血、以及100例健康人外周血标本中进行验证分析.结果 与癌旁正常组织比较,早期甲状腺乳头状癌组织中有20种miRNAs表达存在差异,其中11种miRNAs(hsa-miR-21-5p、hsa-miR-31-5p、miR-34a等)上调、9种miRNAs(hsa-miR-15a-Sp、hsa-miR-16-5p 、hsa-miR-26a-5p等)下调;hsa-miR-181 b-5p在良性甲状腺结节标本中表达上调.hsa-miR-21-5p、hsa-miR-146a-5 p、hsa-miR-155-5p、hsa-miR-221-3p、hsa-miR-222-3p、hsa-miR-181b 6种miRNAs在PTC患者术前血清中的表达显著高于健康对照组(六者在PTC组和健康对照组表达中位数分别为:hsa-miR-21-5p(8.25比3.38)、hsa-miR-146a-5p(13.63比3.42)、hsa-miR-155-5p(10.83比3.49)、hsa-miR-221-3p(18.63比3.82)、hsa-miR-222-3p(22.74比3.92)、hsa-miR-181b(9.52比3.43),均P=0.000.术后7d血清hsa-miR-146a-5p、hsa-miR-221-3 p、hsa-miR-222-3p水平均显著下调(均P=0.000).结论 筛选出hsa-miR-146a-5p、hsa-miR-221-3p、hsa-miR-222-3p 3种miRNAs分子组合作为早期PTC外周血循环miRNAs指纹图谱,有助于PTC早期诊断.