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子宫内膜异位症患者异位内膜组织中差异表达microRNA的筛选
编辑人员丨2天前
目的:探讨微小 RNA(microRNA,miRNA)在子宫内膜异位症(endometriosis,EMS)患者异位内膜组织中的表达特征。方法:收集2018年4月至2019年10月期间于厦门大学附属第一医院妇产科就诊EMS 患者异位内膜组织和对照组在位内膜组织开展实验。利用Illumina平台的miRNA测序检测内膜组织中 miRNA的表达情况。通过生物信息学分析差异表达的miRNAs及其潜在靶基因在EMS发生、发展中的作用。结合文献挑选6个具有显著差异的miRNAs(miR-98-5p、let-7c-5p、miR-495-3p、miR-200b-3p、miR-200c-3p、miR-148b-3p),应用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)进行验证,并在构建miRNA-基因调控网络后初步验证其潜在靶基因。结果:测序结果显示,相比对照组,EMS患者异位内膜组织中有69个miRNAs出现差异表达(差异倍数>1.5, P<0.05),其中表达上调22个,表达下调47个。基因本体分析显示,差异表达的miRNAs所调控的靶基因在生物学过程中集中在与蛋白质修饰、发育调控、细胞代谢和形态结构等相关。KEGG pathway分析显示,靶基因富集于蛋白质功能、自噬、AGE-RAGE及MAPK信号通路中。qRT-PCR结果显示miR-98-5p、let-7c-5p、miR-200b-3p、miR-200c-3p的表达情况与测序结果一致。miRNA-基因共表达网络显示 miRNAs与所预测的靶基因间的相互关系。miRNAs潜在靶基因的qRT-PCR验证结果显示,miR-200b-3p、miR-200c-3p与 ZEB2呈负相关,miR-98-5p与 PGRMC1呈负相关,miR-98-5p、let-7c-5p与 ADIPOR2呈正相关。 结论:miR-98-5p、let-7c-5p、miR-200b-3p和miR-200c-3p在EMS患者异位内膜组织中存在显著差异表达,可能参与EMS的发生、发展。
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编辑人员丨2天前
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缺氧缺血自然复苏的新生大鼠模型中外周血miRNA的差异表达
编辑人员丨2天前
目的:评估缺氧缺血(HI)自我复苏的新生SD大鼠模型外周血微小RNA(miRNA)指标。方法:3只孕鼠所产幼鼠按窝别分为3组,A组为空白对照组,B组为HI组,C组备用。采用高通量深度测序方法比较对照组和HI组新生4日龄SD大鼠外周血中miRNA的表达谱。应用生物信息学分析研究这些差异表达的miRNA。采用基因本体论(GO)和京都基因与基因组学百科全书(KEGG)分析方法预测相关的细胞信号通路和功能。通过miRBD预测miRNA及与缺氧缺血性脑病(HIBD)相关的靶基因。应用HE染色观察脑组织病理变化。结果:经外周血深度测序后可得到成熟miRNA序列为1 049种。A组miRNA种类为525种;HI组miRNA种类为524种;其中A组有27种miRNA与HI组存在差异,且2组间miRNA种类呈高度相关。HI新生大鼠外周血中有38个miRNA表达异常,并存在显著差异表达(2 -ΔΔCt值>2.5, P< 0.05),其中21个miRNA显著过表达,17个显著低表达。KEGG通路富集分析和GO分析显示这些差异的miRNA与谷氨酸能突触通路、髓鞘脂类代谢、神经活性配体-受体相互作用和血管上皮生长因子(VEGF)信号通路与缺氧/缺血诱导的脑损伤有关,并且过度活化。2组间幼鼠脑组织未见皮质及胼胝体下白质病变、脑室扩大、灰质神经元排列紊乱和明显凋亡。 结论:HI自然复苏模型大鼠外周血中miRNA差异表达提示,miRNA对缺氧缺血有积极的应答。存在高度显著差异的miR-200家族、miR-471家族、miR-429、miR-216和miR-871,与神经系统损伤分子生物学机制有关,有望成为HIBD或HI新的生物学诊断指标,对HI新的治疗靶点的研究探索是有益的。
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编辑人员丨2天前
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血清miR-377-3p、miR-770-3p在糖尿病肾病中的表达及其诊断价值
编辑人员丨2天前
目的:探讨血清miR-377-3p、miR-770-3p在糖尿病肾病(DN)中的表达及其临床应用价值。方法:选取2018年1月至2022年3月在东方市人民医院和海南医学院第二附属收治的216例2型糖尿病患者的临床资料,根据尿白蛋白排泄率(UAER)情况,将2型糖尿病患者分为2型糖尿病无肾病患者组(2型糖尿病组,UAER<20 μg/min,84例)和DN组(UAER>20 μg/min,132例),另选择同时期进行体检的正常者作为对照组(65例)。将132例DN患者分为早期DN组(UAER 20~200 μg/min,70例)和临床期DN组(UAER>200 μg/min,62例)。应用多因素logistic回归分析影响DN发生的危险因素,绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析血清miR-377-3p、miR-770-3p及Cys C水平诊断DN的价值。结果:DN组和2型糖尿病组的糖化血红蛋白、空腹血糖均高于对照组,而高密度脂蛋白胆固醇低于对照组,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。DN组的病程、血肌酐、尿素氮及UAER均明显高于2型糖尿病组,而白蛋白及肾小球滤过率(GFR)均明显低于2型糖尿病组(均 P<0.05)。DN组的血清miR-377-3p、miR-770-3p及Cys C水平均明显高于2型糖尿病组和对照组,差异均有统计学意义(均 P<0.001)。临床期DN组和早期DN组的血清miR-377-3p、miR-770-3p及Cys C水平均明显高于对照组,且临床期DN组的血清miR-377-3p、miR-770-3p及Cys C水平均高于早期DN组,差异均有统计学意义(均 P<0.001)。病程、血肌酐、尿素氮、GFR、UAER、miR-377-3p、miR-770-3p及Cys C是影响DN发生的独立危险因素(均 P<0.05)。三项联合诊断DN的曲线下面积明显高于单项miR-377-3p、miR-770-3p及Cys C诊断,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。DN患者的血清miR-377-3p、miR-770-3p水平与Cys C均呈正相关(均 P<0.001)。 结论:血清miR-377-3p、miR-770-3p水平在DN患者中升高,是DN发生的独立危险因素,联合Cys C检测对DN诊断具有较高的价值。
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编辑人员丨2天前
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基于microRNA表达的多囊卵巢综合征患者痰湿证生物标志物的初筛
编辑人员丨2天前
目的:探索多囊卵巢综合征(PCOS)患者痰湿证的特征性生物标志物,为中医证候诊断的标准化提供理论依据。方法:采用队列研究的方法,收集2018年1月至2019年1月期间在山东中医药大学附属医院行体外受精(IVF)助孕治疗,年龄在20~37岁之间的不孕症患者。将患者分为对照组(A组,20例)、PCOS痰湿组(B组,20例)、PCOS非痰湿组(C组,20例)。采用qRT-PCR法检测3组患者血清、卵泡液、颗粒细胞中miR-183/200/223的表达水平,并用相关性分析评价其与痰湿证的关系。结果:血清中miR-223-3p在B组的相对表达量高于A组和C组,差异均有统计学意义( P均<0.001),并与胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)呈正相关( r=0.595, P=0.04)。卵泡液中miR-223-3p在B组的相对表达量高于A组( P<0.001)及C组( P=0.002),差异均有统计学意义。颗粒细胞中miR-183-5p在B组的相对表达量均高于A组( P=0.004)和C组( P=0.012),差异均有统计学意义,并与HOMA-IR呈正相关( r=0.732, P=0.007);miR-200c-3p在B组的相对表达高于A组( P=0.002)和C组( P=0.001),差异均有统计学意义,并与HOMA-IR呈正相关( r=0.704, P=0.016);miR-223-3p在B组的相对表达量高于A组( P<0.001),在C组的相对表达量也高于A组( P=0.005),差异均有统计学意义,且在B组的相对表达量与HOMA-IR呈正相关( r=0.547, P=0.042); miR-223-5p在B组的相对表达量明显低于A组( P=0.001),在C组的相对表达量也低于A组( P<0.001),差异均有统计学意义,且B组的相对表达量与HOMA-IR呈负相关( r=-0.671, P=0.024)。 结论:PCOS痰湿证有明显的胰岛素抵抗特征,microRNA在PCOS痰湿证患者体内表达存在显著性差异。miR-183-5p、miR-200c-3p与miR-223-5p可能成为诊断PCOS痰湿证卵巢局部的特异性生物标志物。
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编辑人员丨2天前
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血清可溶性血管细胞粘附分子1、微小RNA-126水平与维持性血液透析患者动静脉内瘘狭窄的相关性
编辑人员丨2天前
目的:探讨血清可溶性血管细胞粘附分子1(sVCAM-1)、微小RNA-126水平(miR-126)与维持性血液透析患者动静脉内瘘狭窄的相关性。方法:选取2017年3月至2019年3月于本院行维持性血液透析的200例患者,根据动静脉内瘘有无发生狭窄将其分为内瘘狭窄组(62例)和内瘘非狭窄组(138例)。采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测患者血清sVCAM-1水平,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测患者血清miR-126水平,同时采用自动生化仪检测总胆固醇(TC)、三酰甘油(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、血红蛋白(Hb)、血肌酐(Scr)、血钙、血磷、尿素氮(BUN)、白蛋白(ALB)、C反应蛋白(CRP)等生化指标;分析维持性血液透析动静脉内瘘狭窄与血清sVCAM-1、miR-126水平的相关性及二者的诊断价值;分析影响维持性血液透析患者动静脉内瘘狭窄的因素。结果:内瘘狭窄组的CRP、sVCAM-1水平均高于内瘘非狭窄组(均 P<0.05),miR-126水平低于内瘘非狭窄组( P<0.05);维持性血液透析患者动静脉内瘘发生狭窄与血清sVCAM-1、miR-126水平呈负相关( r=-0.600, P<0.05);血清sVCAM-1、miR-126水平诊断动静脉内瘘狭窄的受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)分别为0.813、0.882,特异度分别为78.3%、75.4%,灵敏度分别为72.6%、87.1%;二者联合诊断的AUC为0.931,特异度为86.2%,灵敏度为87.1%;sVCAM-1高表达、miR-126低表达是维持性血液透析患者动静脉内瘘发生狭窄的危险因素。 结论:血清sVCAM-1、miR-126水平与维持性血液透析患者动静脉内瘘发生狭窄有密切联系。
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编辑人员丨2天前
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微小RNA-200c对人胰腺癌细胞株PANC-1中转化生长因子-β诱导基因-克隆3表达的影响
编辑人员丨2天前
目的:观察微小RNA-200c(miR-200c)对人胰腺癌细胞株PANC-1中转化生长因子-β诱导基因-克隆3(βig-h3)表达的影响。方法:将miR-200c前体片段和阴性对照片段分别转染到PANC-1细胞中。应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测转染后的PANC-1细胞中miR-200c和βig-h3的表达。应用Transwell实验检测转染后PANC-1细胞的侵袭能力。采用 t检验。 结果:转染miR-200c前体片段和阴性对照片段的PANC-1细胞中miR-200c的相对表达值分别为1.00±0.12和0.17±0.06,差异有统计学意义( t=3.008, P<0.05)。βig-h3的相对表达值分别为0.21±0.16和0.71±0.23,差异有统计学意义( t=2.236, P<0.05)。转染miR-200c前体片段和阴性对照片段的PANC-1细胞平均穿膜细胞数分别为(65.00±18.19)和(308.00±5.73)个,差异有统计学意义( t=2.107, P<0.05)。 结论:miR-200c可以抑制胰腺癌细胞的侵袭能力,可能与下调βig-h3的表达有关。
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编辑人员丨2天前
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微小RNA-200家族在肾透明细胞癌中的表达及其临床意义
编辑人员丨2天前
目的:观察微小RNA(miRNA,miR)-200家族在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达,并分析其表达与预后的关系。方法:纳入95例原发ccRCC组织,及其配对的癌旁正常肾组织,另外纳入19例确定为ccRCC远处转移的癌组织。所有组织标本均来自2018年1月至12月,于吉林大学中日联谊医院泌尿外科就诊的ccRCC患者。应用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)分析miR-200家族的3个成员:miR-200b、miR-200c和miR-141在ccRCC组织、正常肾组织,以及远处转移灶中的表达,并在肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中进行验证。应用X-tile算法计算miR-200b、miR-200c和miR-141的最佳临界值,并据此将患者分别分为miR-200b、miR-200c和miR-141高表达和低表达组。应用生物信息学方法分析其生物学功能。应用SPSS 19.0统计软件分析,组间比较采用方差分析。miR-200b、miR-200c和miR-141与无病生存期的关系应用COX多因素回归分析进行分析。结果:与正常肾组织比较,肿瘤组织中miR-200b、miR-200c和miR-141的表达(20.51±14.92、13.95±8.61、0.22±0.11)显著降低,差异有统计学意义( F=5.391、8.443、3.295, P值均<0.01),在转移灶中,miR-200b和miR-141的表达(12.51±6.79、0.11±0.61)进一步降低,差异有统计学意义( F=7.047、2.841, P值均<0.01);miR-200b、miR-200c和miR141与肿瘤大小( F=13.274、15.557、10.492, P<0.05)、TNM分期( F=11.399、8.292、9.879, P<0.05)以及肿瘤复发有相关( F=5.836、6.277、8.519, P<0.05);miR-200b、miR-200c和miR-141的阳性表达是影响ccRCC患者无病生存期的独立危险因素(miR-200b, HR=0.41,95% CI=0.29~0.73, P<0.05;miR-200c, HR=0.46,95% CI=0.22~0.87, P<0.05;miR-141, HR=0.42,95% CI=0.21~0.81, P<0.05);三者共同参与了肿瘤坏死因子相关诱导凋亡配体(TRAIL)通路、磷脂酰肌醇蛋白聚糖通路(GLYPICAN)通路、血管内皮生长因子(VEGF)通路、GLYPICAN-1网络、质膜雌激素受体(PMER)通路和上皮-间充质转化(EMT)通路。 结论:miR-200b、miR-200c和miR-141三者共同参与了多种肿瘤信号传导通路,可作为ccRCC预后的标志物。
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编辑人员丨2天前
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多发性大动脉炎患者血浆外泌体携带的差异微小RNA和蛋白表达谱分析
编辑人员丨2天前
目的:检测初治多发性大动脉炎(TAK)患者血浆外泌体携带的微小RNA和蛋白,分析其在TAK发病机制中的可能作用。方法:选2020年6月至11月北京协和医院风湿免疫科确诊的初治TAK患者10例,另选与之年龄性别匹配的健康对照者5例,分别通过RNA测序和蛋白质谱技术检测血浆外泌体携带的微小RNA和蛋白,筛选出差异表达的微小RNA和蛋白,并对其进行层次聚类分析、功能、信号通路和结构域富集分析,最终筛选出与血管炎有关的微小RNA和蛋白,探究其在TAK发病机制中的可能作用。统计学采用Fisher精确概率检验或 χ2检验。 结果:TAK患者血浆外泌体携带的差异表达的微小RNA 29个,其中miR-101-3p、miR-122-5p、miR-143-3p、miR-185-3p、miR-192-5p、miR-194-5p、miR-19a-3p、miR-19b-3p、miR-20b-5p、miR-21-5p、miR-22-3p、miR-335-5p、miR-34a-5p、miR-3613-5p、miR-548ad-5p、miR-590-3p、miR-7-5p表达上调,miR-1249-3p、miR-141-3p、miR-199a-5p、miR-199b-5p、miR-200a-3p、miR-200c-3p、miR-204-5p、miR-29c-5p、miR-335-3p、miR-381-3p、miR-4433b-5p、miR-584-5p表达下调。差异表达的蛋白357个,其中236个表达上调,121个表达下调,最终筛选前激肽释放酶、激肽原1、桥粒蛋白。结论:血浆外泌体携带的miR-34a-5p、miR-200c-3p、miR-143-3p、miR-22-3p、miR-21-5p、前激肽释放酶、激肽原1、桥粒蛋白可能通过调节血管生理过程、炎症反应、自身免疫等过程参与TAK的发病机制,具有作为TAK生物标志物和治疗靶点的潜在作用。
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编辑人员丨2天前
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氧化应激刺激心肌细胞来源外泌体通过miR-106b-5p促进巨噬细胞M1型极化
编辑人员丨2天前
目的:探讨氧化应激刺激下心肌细胞释放外泌体对巨噬细胞极化的影响及其机制。方法:取H9C2心肌细胞,采用随机数字表法分为0 μmol/L组、100 μmol/L组、200 μmol/L组、300 μmol/L组,分别用相应浓度H 2O 2处理后,各组使用细胞增殖-毒性检测试剂盒(cell counting kit-8, CCK-8)检测细胞活力,Western blot法检测细胞活化形式胱天蛋白酶-3(cleaved-caspase-3)、B淋巴细胞瘤-2(B-cell lymphoma-2, Bcl-2)、B淋巴细胞瘤-2相关X蛋白(B-cell lymphoma-2-associated X protein, Bax)水平变化,流式细胞术检测细胞凋亡情况,根据检测结果选用最适处理浓度进行后续实验。另取H9C2心肌细胞,参考经典的超速离心法,提取正常心肌细胞来源外泌体(normal cardiomyocyte-derived exosomes, NC-exo)及氧化应激心肌细胞来源外泌体(oxidative stress cardiomyocyte-derived exosomes, H-exo),透射电镜观察外泌体形态,Western blot法检测外泌体标志蛋白。激光共聚焦显微镜下观察巨噬细胞对外泌体摄取内化情况。选取正常培养巨噬细胞,按随机数字表法分为对照1组(NC1组)、脂多糖1组(LPS1组)、正常心肌细胞来源外泌体预处理+脂多糖组(LPS+NC-exo组)、氧化应激心肌细胞来源外泌体预处理+脂多糖组(LPS+H-exo组)。LPS1组LPS处理6 h, LPS+NC-exo组、LPS+H-exo组分别加入NC-exo、H-exo预处理24 h再进行LPS处理6 h, NC1组不进行处理。使用Western blot法检测诱导型一氧化碳合酶(inducible nitric oxide synthase, iNOS)、精氨酸酶-1(arginase-1, Arg-1)、CD86、CD206水平,使用实时荧光定量聚合酶链式反应(real time quantitative polymerase chain reaction, RT-qPCR)方法检测IL-6、TNF-α、趋化因子-10(chemokine-10, CXCL-10) mRNA水平。采用RT-qPCR方法检测外泌体miRNA表达量。另取巨噬细胞按随机数字表法分为对照2组(NC2组)、脂多糖2组(LPS2组)、过表达阴性对照+脂多糖组(LPS+mimic-NC组)、过表达miR-106b-5p+脂多糖组(LPS+106b-mimic组)。LPS2组LPS处理6 h,LPS+mimic-NC组、LPS+ 106b-mimic组则分别使用转染试剂mimic-NC、106b-mimic转染24 h再进行LPS处理6 h,NC2组不进行处理。检测iNOS、Arg-1、CD86、CD206水平及IL-6、TNF-α、CXCL-10的mRNA表达水平。 结果:与0 μmol/L组比较,100 μmol/L组、200 μmol/L组、300 μmol/L组凋亡相关蛋白Bax、cleaved-caspase-3水平升高( P<0.05),Bcl-2水平下降( P<0.05),细胞活力下降( P<0.05),细胞凋亡率上升( P<0.05)。经比较,200 μmol/L作为适宜浓度用于后续实验。通过显微镜观察,正常心肌细胞表现为梭形,而200 μmol/L H 2O 2处理后心肌细胞皱缩变形死亡。透射电镜观察可见提取的纳米颗粒呈现圆形并具有双层膜结构,将荧光标记的外泌体加入巨噬细胞中共同培养24 h,可见大量外泌体能够被巨噬细胞摄取。与NC1组比较,LPS1组、LPS+NC-exo组、LPS+ H-exo组iNOS、CD86蛋白水平升高( P<0.05),Arg-1、CD206蛋白水平下降( P<0.05),IL-6、TNF-α、CXCL-10 mRNA水平升高( P< 0.05);与LPS1组比较,LPS+H-exo组iNOS、CD86蛋白水平升高( P<0.05),Arg-1、CD206蛋白水平下降( P<0.05),IL-6、TNF-α、CXCL-10 mRNA水平升高( P<0.05),而LPS+NC-exo组与LPS1组差异无统计学意义( P>0.05)。与NC-exo比较,H-exo中miR-106b-5p表达升高( P<0.05)。与NC2组比较,LPS2组、LPS+mimic-NC组、LPS+106b-mimic组iNOS、CD86蛋白水平升高( P< 0.05),Arg-1、CD206蛋白水平下降( P<0.05),IL-6、TNF-α、CXCL-10 mRNA水平升高( P<0.05);与LPS2组比较,LPS+106b-mimic组iNOS、CD86蛋白水平升高( P<0.05),Arg-1、CD206蛋白水平下降( P<0.05),IL-6、TNF-α、CXCL-10 mRNA水平升高( P< 0.05),而LPS+mimic-NC组与LPS2组比较差异无统计学意义( P>0.05)。 结论:来源于氧化应激心肌细胞的高表达miR-106b-5p的外泌体促进巨噬细胞发生M1型极化。
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编辑人员丨2天前
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达格列净对2型糖尿病早期糖尿病肾病患者尿外泌体微RNA的影响
编辑人员丨2天前
目的:探讨达格列净对2型糖尿病(T2DM)早期糖尿病肾病(DKD)患者尿外泌体微RNA(miRNA)的影响。方法:选取2018年9月至2019年9月于徐州医科大学附属淮安医院内分泌科住院的T2DM早期DKD患者60例。将纳入的患者按照尿微量白蛋白与尿肌酐比值(UACR)进行分组,其中30 mg/g
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编辑人员丨2天前
