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卵巢子宫内膜异位症miRNA及mRNA的表达检测及调控网络分析
编辑人员丨1天前
目的:采用高通量测序检测卵巢子宫内膜异位症微小RNA(microRNA,miRNA)及mRNA的表达,分析miRNA-mRNA调控网络关系,探索卵巢子宫内膜异位症的发生机制。方法:回顾性分析2017年3月至2018年3月在中南大学湘雅医院因卵巢子宫内膜异位症行手术的患者20例,取异位内膜及配对在位内膜组织,提取总RNA,分别进行miRNA测序及mRNA测序,获得差异miRNA及mRNA表达谱。运用Targetscan、miRDB数据库预测差异miRNA可能结合的mRNA,并与差异mRNA取交集,获得候选mRNA,采用Cytoscape软件进行miRNA-mRNA调控网络分析,采用DAVID数据库进行基因功能富集(GO)分析和信号通路(pathway)分析。结果:与在位内膜比较,异位内膜差异表达的miRNA有369个(197个上调,172个下调),差异表达的mRNA 3 765个(1 975个上调,1 790个下调)。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)证实miR-202-5p、miR-514a-5p在异位内膜表达高于在位内膜( P<0.05),而miR-375-3p、miR-449b-5p在异位内膜表达低于在位内膜( P<0.05),与测序结果相符合。生物信息学发现与这4个miRNA相关的候选mRNA主要富集于核内甾体激素受体结合、跨膜受体及蛋白激酶激活等生物学过程。KEGG通路富集显示其参与了多种信号通路,如TGFβ信号通路、细胞黏附分子信号通路、Wnt信号通路、Rap1信号通路。 结论:miRNA及mRNA在子宫内膜异位症差异表达,二者相互作用通过多种通路参与子宫内膜异位症的发生发展。
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编辑人员丨1天前
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miR-199b在人结直肠癌中的表达及其与患者临床病理特征和预后的关系
编辑人员丨1天前
目的:探讨miR-199b与结直肠癌患者临床病理特征以及预后的关系。方法:收集2011年3—12月于中国医学科学院肿瘤医院接受治疗的202例结直肠癌患者的癌组织及癌旁正常组织,采用实时荧光定量PCR方法检测结直肠癌组织及相应癌旁正常组织中miR-199b的表达水平,生存分析采用Kaplan-Meier法和Log rank检验,受试者工作特征(ROC)曲线评估miR-199b预测结直肠癌患者预后的价值。结果:结直肠癌组织中miR-199b的相对表达水平(-7.88±0.11)低于癌旁正常组织(-6.49±0.12, P<0.001)。伴有淋巴结转移的结直肠癌组织中miR-199b的表达水平(-7.51±0.14)高于无淋巴结转移的结直肠癌组织(-8.23±0.17, P<0.001)。miR-199b在Ⅰ~Ⅱ期、Ⅲ期和Ⅳ期结直肠癌组织中相对表达水平逐渐升高,分别为-8.26±0.17、-7.70±0.16、-6.57±0.27,差异有统计学意义( P<0.001)。miR-199b高表达组患者的5年生存率(75.6%)低于低表达组患者(84.6%, P=0.045)。ROC曲线显示,当miR-199b为-7.965时,曲线下面积为0.578(95% CI:0.468~0.688)。 结论:结直肠癌组织中高表达miR-199b与结直肠癌患者TNM分期晚、淋巴结转移以及不良预后有关,miR-199b可能作为结直肠癌患者术后疾病进展及预后的潜在标志物。
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编辑人员丨1天前
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miR-211-5p和miR-202-3p在抑郁症患者中的表达及其与患者病情程度和认知功能的关系
编辑人员丨1天前
目的 探究微小核糖核酸-211-5p(miR-211-5p)和微小核糖核酸-202-3p(miR-202-3p)在抑郁症患者中的表达及其与患者病情程度和认知功能的关系.方法 选取2021年1月至2023年6月郑州大学第一附属医院精神科收治的92例确诊为抑郁症的患者为抑郁症组,同期选取本院体检健康(精神状态正常)的志愿者92例为对照组.根据抑郁自评量表(SDS)分为轻度抑郁组(SDS:53~62分)45例、中度抑郁组(SDS:63~72分)30例、重度抑郁组(SDS:73分及以上)17例.根据简易智力状态检查量表(MMSE)评分分为轻度认知功能障碍组(MMSE:21~26分)24例、中度认知功能障碍组(MMSE:10~20分)40例、重度认知功能障碍组(MMSE:1~9分)28例.实时荧光定量聚合酶链反应检测miR-211-5p和miR-202-3p水平.血清miR-211-5p、miR-202-3p水平对抑郁症的诊断价值采用ROC曲线进行分析.血清miR-211-5p、miR-202-3p水平与病情程度及认知功能的关系采用Spearman相关性分析.结果 抑郁症患者血清miR-211-5p水平低于对照组,miR-202-3p水平高于对照组(P<0.05).miR-211-5p、miR-202-3p联合诊断抑郁症的AUC高于miR-211-5p(Z=4.701,P<0.001)、miR-202-3p(Z=2.275,P=0.023)单独诊断的AUC.与轻度抑郁组相比,中度抑郁组和重度抑郁组miR-211-5p水平依次降低,与轻度抑郁组相比,中度抑郁组和重度抑郁组miR-202-3p水平依次升高.不同认知功能抑郁症患者血清miR-211-5p水平比较:重度认知功能障碍组<中度认知功能障碍组<轻度认知功能障碍组;miR-202-3p水平比较:重度认知功能障碍组>中度认知功能障碍组>轻度认知功能障碍组(P<0.05).Spearman相关性分析显示,抑郁症患者血清miR-211-5p水平与病情程度及认知功能损害呈负相关,miR-202-3p水平与病情程度及认知功能损害呈正相关(P<0.05).结论 抑郁症患者血清miR-211-5p低表达,miR-202-3p高表达,二者与病情程度及认知功能有关,有成为抑郁症辅助诊断生物学指标的潜力.
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编辑人员丨1天前
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子宫内膜癌组织miR-155、miR-202表达与增殖侵袭基因表达、临床病理参数和预后的关系
编辑人员丨1周前
目的:探讨子宫内膜癌(EC)组织中微小核糖核酸-155(miR-155)、微小核糖核酸-202(miR-202)表达情况与增殖侵袭基因表达、临床病理参数和预后的关系.方法:选择2015年10月至2018年10月在本院进行手术治疗的EC患者135例为观察组,另选择同期因子宫肌瘤行全子宫切除术的患者135例为对照组,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测并比较两组miR-155、miR-202 及增殖基因(Cdk4、Cdk6、Efemp2、DJ-1、RRM2)、侵袭基因(Dkk1、Ezh2、HMGB1)表达情况,分析 EC 组织miR-155、miR-202表达与患者临床病理参数的关系.采用Kaplan-Meier生存曲线分析miR-155、miR-202高表达组与低表达组的5年累积生存率.结果:观察组miR-155、Ezh2、HMGB1、Cdk4、Cdk6、DJ-1、RRM2相对表达量高于对照组,miR-202、Dkk1、Efemp2相对表达量低于对照组(P<0.05).miR-155的相对表达量与Cdk4、Cdk6、DJ-1、RRM2、Ezh2、HMGB1呈正相关,与Efemp2、Dkk1 呈负相关(P<0.05);miR-202 相对表达量与 Efemp2、Dkk1 呈正相关,与 Cdk4、Cdk6、DJ-1、RRM2、Ezh2、HMGB1呈负相关(P<0.05).EC患者肿瘤FIGO分期越高、分化程度越低、肌层浸润越深及有淋巴结转移患者miR-155的相对表达量越高,miR-202的相对表达量越低(P<0.05).高miR-155组5年总生存率为68.66%,低于低miR-155组的87.50%(P<0.05);高miR-202组5年生存率为91.80%,高于低miR-202组的65.71%(P<0.05).结论:EC组织中miR-155表达升高,miR-202表达降低,与增殖侵袭基因表达、FIGO分期、分化程度、肌层浸润深度及有淋巴结转移有明显的相关性,miR-155表达越高、miR-202表达越低,患者预后越差.
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编辑人员丨1周前
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miR-532-3p、MAPK、Nrf2表达与非小细胞肺癌患者对EGFR-TKIs耐药的关系研究
编辑人员丨1个月前
目的 探讨血清微小核糖核酸-532-3p(miR-532-3p)、有丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、核因子E2相关因子2(Nrf2)表达情况与非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体-酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKIs)治疗耐药的关系.方法 回顾性选取2021年1月—2023年7月张家口市第一医院收治的198例EGFR基因突变非小细胞肺癌EGFR-TKIs治疗耐药患者作为耐药组,另选同期收治的202例非耐药患者作为非耐药组.比较两组血清miR-532-3p、MAPK、Nrf2表达水平,用Pearson相关性分析EGFR基因突变非小细胞肺癌EGFR-TKIs治疗耐药患者血清miR-532-3p、MAPK、Nrf2表达的相关性,并予以多因素Logistic回归分析EGFR基因突变非小细胞肺癌EGFR-TKIs耐药的危险因素.结果 耐药组血清miR-532-3p表达水平高于非耐药组(P<0.05),血清MAPK、Nrf2表达水平低于非耐药组(P<0.05).Pearson相关性分析结果显示,EGFR基因突变非小细胞肺癌EGFR-TKIs耐药患者血清miR-532-3p 与血清 MAPK、Nrf2 均呈负相关(r=-0.612、-0.598,P<0.05),血清 MAPK 与 Nrf2 呈正相关(r=0.499,P<0.05).多因素Logistic回归分析结果显示,血清miR-532-3p表达水平上调、血清MAPK、Nrf2表达水平下调是EGFR基因突变非小细胞肺癌EGFR-TKIs耐药的独立危险因素(OR=3.089、2.217、3.428,P<0.05).结论 EG-FR基因突变非小细胞肺癌EGFR-TKIs耐药的发生与血清miR-532-3p上调、MAPK、Nrf2下调密切相关,检测三者表达水平可能成为非小细胞肺癌治疗过程中的关键生物治疗靶点.
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编辑人员丨1个月前
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miR-202在生殖调控中的研究进展
编辑人员丨2024/6/15
微小RNA(microRNA,miRNA)可调控细胞的增殖、分化、凋亡和代谢等生物过程,参与生物的生殖发育过程.作为let-7家族的一员,miR-202具有高度保守的碱基序列,提示miR-202在不同物种中的功能和调控作用可能相似.其可参与多种机体的病理生理过程,如减缓肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭,调控T细胞分化,参与调控神经发育和神经退行性疾病.还可参与配子的发生与成熟,调控生殖生理过程.综述miR-202在精子发生、卵泡发育及生殖内分泌中的调控作用.
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编辑人员丨2024/6/15
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阿尔茨海默症患者血清miR-211和miR-202表达水平及其与认知功能、焦虑抑郁情绪的相关性研究
编辑人员丨2024/4/27
目的 分析阿尔茨海默症(Alzheimer's disease)患者血清微小核糖核酸(microRNA,miR)-211 和miR-202表达水平及与认知功能、焦虑抑郁情绪的相关性研究.方法 选取2019年3月~2022年3月河北燕达医院收治的阿尔茨海默症患者90例作为研究组,根据临床痴呆评定量表(clinical dementia rating,CDR)评分将患者分为轻度组(n=24)、中度组(n=48)和重度组(n=18).另选取同期健康体检者90例作为对照组,比较血清miR-211和miR-202表达水平.Pearson法和Spearman法分析血清miR-211,miR-202 以及二者与认知功能、焦虑抑郁情绪的相关性,采用Logistic回归分析阿尔茨海默症的影响因素.结果 与对照组比较,研究组血清miR-211(0.59±0.16 vs 1.01±0.31)、miR-202(0.35±0.10 vs 1.00±0.32)表达水平降低,差异具有统计学意义(t=11.422,18.393,均P<0.05).轻度、中度和重度组血清miR-211(0.73±0.21,0.62±0.17,0.32±0.08)表达水平、miR-202(0.51±0.15,0.33±0.10,0.19±0.04)表达水平、简易精神状态检查量表(mini-mental state examination,MMSE)评分(22.54±1.41分,19.35±1.01分,16.23±1.00分)和蒙特利尔认知评估量表(montreal cognitive assessment,MoCA)评分(25.35±2.60分,18.59±1.32分,16.59±1.24分)逐渐降低,差异具有统计学意义(F=32.006,46.917,163.048,163.703,均P<0.05).与轻度组比较,重度组、中度组血清miR-211,miR-202,MMSE和MoCA评分降低,差异具有统计学意义(t=3.685~25.375,均P<0.05).轻度、中度和重度组Hamilton焦虑量表(hamilton anxiety scale,HAMA)评分(12.34±1.27 分,20.59±2.09 分,31.29±2.19分)和Hamilton抑郁量表(hamilton depression scale,HAMD)评分(14.35±2.13分,23.89±2.20分,35.35±1.21分)逐渐升高,差异具有统计学意义(F=496.059,553.939,均P<0.05).根据Pearson相关性分析得知,miR-211 与miR-202 呈正相关(r=0.615,P<0.05).根据Spearman相关性分析得知,miR-211 和miR-202 与MMSE和MoCA呈显著正相关(r=0.539~0.585,均P<0.05);与HAMA和HAMD呈显著负相关(r=-0.651~-0.539,均P<0.05).根据Logistic回归分析得知miR-211[OR(95%CI):5.321(1.648~17.180)]和miR-202[OR(95%CI):3.158(1.989~5.012)]低表达是影响阿尔茨海默症的危险因素(均P<0.05).结论 阿尔茨海默症患者血清miR-211 和miR-202表达水平降低,且miR-211 和miR-202与认知功能、焦虑抑郁情绪密切相关.
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编辑人员丨2024/4/27
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肺腺癌转录本1及其信号通路与非小细胞肺癌的关系研究进展
编辑人员丨2024/4/6
转移相关肺腺癌转录本1(MALAT1)最初被发现在早期非小细胞肺癌(NSCLC)中过表达.MALAT1因其结构的特殊性呈现的半衰期使其在NSCLC组织或血液中被检测到,并在NSCLC发生、发展中起关键作用.MALAT1的表达与NSCLC的肿瘤大小、分期、转移和远处浸润显著相关.MALAT1可促进NSCLC进展,其机制为下调miR-202表达,通过miR-185-5p上调鼠双微体4表达,下调叉头框蛋白P3泛素化影响轧棉厂复合亚基1转录;靶向miR-374b-56上调富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子7表达;靶向miR-200a上调锌指E盒结合同源盒因子家族表达.因此,MALAT1可作为NSCLC患者早期诊断、病情评估、预后预测的生物标志物.
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编辑人员丨2024/4/6
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阿尔茨海默病患者血清miR-202-5p、PCSK9的表达水平及其临床意义
编辑人员丨2024/3/16
目的 探讨阿尔茨海默病(AD)患者血清miR-202-5p、前蛋白转化酶枯草杆菌蛋白酶/kexin 9 型(PCSK9)的表达水平及其临床意义.方法 选取 79 例AD患者为AD组,39 名体检健康者为对照组.检测两组血清miR-202-5p、PCSK9 水平,分析AD患者血清miR-202-5p、PCSK9 水平与血清β淀粉样蛋白(Aβ)1-40、Aβ1-42水平和简易精神状态检查(MMSE)量表评分的相关性,并评估血清miR-202-5p、PCSK9 水平单独及联合对AD的诊断价值.结果 AD组血清Aβ1-42、miR-202-5p水平及MMSE量表评分低于对照组,血清Aβ1-40、PCSK9 水平高于对照组(P<0.05).AD患者血清miR-202-5p水平与血清Aβ1-40、PCSK9 水平呈负相关,与血清Aβ1-42 水平、MMSE量表评分呈正相关(P<0.05);血清PCSK9 水平与血清Aβ1-40 水平呈正相关,与血清Aβ1-42 水平、MMSE量表评分呈负相关(P<0.05).血清miR-202-5p、PCSK9 水平联合诊断AD 的曲线下面积大于二者单独诊断(P<0.05).结论 AD患者血清miR-202-5p水平降低、血清PCSK9 水平升高,二者水平变化可能与AD患者Aβ沉积和认知功能受损有关,或可作为AD的辅助诊断指标.
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编辑人员丨2024/3/16
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基质金属蛋白酶1在头颈部鳞癌中的表达水平及微RNA调节的生物信息学研究
编辑人员丨2023/10/21
目的 分析头颈部鳞癌(含皮肤鳞癌)中基质金属蛋白酶1(MMP1)和微RNA(miRNA)表达水平并筛选目标miRNA.方法 下载GEO相关数据,比较头颈部鳞癌MMP1表达水平.利用miRanda、TargetScan7.2和miRDB软件在线预测miRNA,进一步与miRTarBase结果做比对,获得目标miRNA并进行验证.分析目标miRNA与MMP1的相互关系.结果 与正常组织或不典型增生病变相比,MMP1在头颈部鳞癌(含皮肤鳞癌)组织中高表达,MMP1可参与癌变整个发展过程,并促进HNSCC转移;在线预测共获得3个目标miRNAs:miR-202、miR-326和miR-488,其中miR-202 mirSVR评分最高.相反,与正常组织相比,miR-202头颈部鳞癌(含皮肤鳞癌)中,miR-202表达水平明显低于正常组织,从正常皮肤-KIN1/2-KIN3-cSCC,miR-202可参与疾病整个发展过程.相关分析显示miR-202表达与MMP1呈负相关(r=-0.14,P<0.05).结论 MMP1在头颈部鳞癌(含皮肤鳞癌)组织中高表达,miR-202低表达,miR-202可能是调节MMP1的真实miRNA,二者呈负相关.
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编辑人员丨2023/10/21
