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微小RNA-224对乳腺癌锁骨上淋巴结转移的影响及其作用机制
编辑人员丨5天前
目的:探讨微小RNA(miR)-224对乳腺癌锁骨上淋巴结转移的影响及其作用机制。方法:选择2018年6月至2019年6月南阳市中心医院收治的45例锁骨上淋巴结转移的乳腺癌和45例无淋巴结转移的乳腺癌作为研究对象。采用转录组织化学方法分析淋巴结转移和无淋巴结转移癌组织中差异表达的miRNA。采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析差异表达的miRNA(miR-224);采用慢病毒介导miRNA阴性对照和miR-224过表达在人乳腺癌细胞(MDA-MB-231)乳腺癌细胞建立对照细胞系(对照组)和miR-224过表达细胞系(miR-224组)。将对照组和miR-224组细胞接种至裸鼠腋下,并于30 d后处死,解剖分析锁骨上淋巴结转移;生物信息学和双荧光素酶报告基因分析miR-224靶基因,蛋白质印迹法(Western blot)分析临床样本和细胞系miRNA靶蛋白(PHLPP)1表达水平,组间比较采用 t检验。 结果:转录组化学结果显示,淋巴结转移乳腺癌组织miR-224表达水平(5.08±0.69)明显高于未淋巴结转移乳腺癌组织(2.10±0.69),差异有统计学意义( t=3.109, P<0.05)。荧光定量PCR结果验证显示,淋巴结转移乳腺癌组织miR-224表达水平(2.98±0.41)高于无淋巴结转移乳腺癌组织miR-224表达水平(1.20±0.31),差异有统计学意义( t=2.839, P<0.05)。miR-224组细胞侵袭数量[(119.49±9.72)个]高于对照组细胞侵袭数量[(69.39±6.09)个],差异有统计学意义( t=4.091, P<0.05)。miR-224组细胞接种移植瘤30 d后淋巴结转移病灶数[(25.98±3.12)个]高于对照组细胞接种移植瘤30 d后淋巴结转移病灶数[(10.54±2.39)个],差异有统计学意义( t=3.001, P<0.05)。PHLPP1是miR-224靶基因。淋巴结转移乳腺癌组织中PHLPP1蛋白表达水平(0.36±0.12)低于未淋巴结转移乳腺癌组织中PHLPP1蛋白表达水平(0.94±0.16),差异有统计学意义( t=2.816, P<0.05)。miR-224组细胞PHLPP1蛋白表达水平(0.50±0.12)低于对照组细胞PHLPP1蛋白表达水平(1.04±0.18),差异有统计学意义( t=2.212, P<0.05)。 结论:miR-224在淋巴结转移的乳腺癌中呈高表达,其可能机制为通过调节PHLPP1蛋白表达参与了乳腺癌的侵袭和转移。
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编辑人员丨5天前
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氧诱导视网膜病变小鼠模型中参与p21调控的miRNA表达谱分析
编辑人员丨5天前
目的:观察氧诱导视网膜病变(OIR)小鼠视网膜组织中miRNA的表达,筛选与p21及视网膜新生血管(RNV)形成相关的miRNA。方法:实验研究。40只健康7日龄C57BL/6J小鼠随机分为正常组和OIR组,每组20只。OIR组构建氧诱导RNV模型,正常组不做任何处理。小鼠17日龄时,处死小鼠,视网膜荧光铺片观察小鼠RNV发生情况;光学显微镜下计数突破视网膜内界膜的血管内皮细胞核。取视网膜组织行miRNA芯片分析,检测正常组与OIR组之间差异表达的miRNA。所得差异miRNA靶基因分别进行基于基因注释(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)的富集分析;通过Targetscan、MiRanda、MicroT-CDS数据库比对筛选可能与p21有关的miRNA及通路。组间两两比较采用独立样本 t检验。 结果:与正常组比较,OIR组小鼠视网膜无灌注区面积、RNV及突破视网膜内界膜的血管内皮细胞核数量增加,差异均有统计学意义( t=18.800、9.025, P<0.05)。与正常组比较,OIR组有统计学差异表达的miRNA 54个,其中,上调、下调者分别为47、7个。从3个数据库与所得差异miRNA的比对结果中共筛选到与p21相关miRNA 13个,按差异倍数从高到低分别为miR-7218-5p、miR-322-5p、miR-224-5p、miR-335-5p、miR-329-3p、miR-362-3p、miR-532-5p、miR-20b-5p、miR-20a-5p、miR-195a-5p、miR-423-5p、miR-497a-5p、miR-129-5p。差异miRNA靶基因富集分析,得到1 112个GO条目及50条KEGG通路,其中50个GO条目和13条KEGG通路与p21相关。 结论:在OIR模型中共筛选出13个与P21相关的miRNA。
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编辑人员丨5天前
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LncRNA MIR503HG通过调控miR-224-5pCHSY1表达对结肠癌细胞放射敏感性的影响
编辑人员丨5天前
目的:探讨长链非编码RNA微小RNA-503宿主基因(LncRNA MIR503HG)通过调控miRNA-224-5p硫酸软骨素合酶1 (miR-224-5pCHSY1 )的表达对结肠癌细胞放射敏感性的影响。方法:选取2019年3月至2022年1月火箭军特色医学中心收治的48例结肠癌患者为组织样本获取对象,进行回顾性分析,其中男性28例、女性20例,年龄(57.43±5.28)岁。根据放疗后的病灶情况将患者分为放射抵抗组(23例)和放射敏感组(25例)。采用实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测2组患者结肠癌组织及各细胞株(CCD841、COLO320、SW480、RKO、HCT116)中LncRNA MIR503HG、miR-224-5pCHSY1的表达情况;构建放射抵抗的结肠癌细胞株HCT116R,将HCT116R细胞株分为过表达LncRNA MIR503HG(MIR503HG)组及其阴性对照组(mimiC-NC)、miR-224-5pCHSY1抑制组(anti-miR-224-5p)及其阴性对照组(anti-miR-NC)、过表达LncRNA MIR503HG+过表达miR-224-5pCHSY1组(MIR503HG+miR-224-5p)、过表达LncRNA MIR503HG+阴性对照组(MIR503HG+miR-NC);通过双荧光素酶报告验证LncRNA MIR503HG与miR-224-5pCHSY1的靶向作用;检测各组细胞的存活分数(SF)和凋亡率。两组间数据的比较使用 t检验。 结果:与放射敏感组相比,放射抵抗组结肠癌组织中LncRNA MIR503HG的相对表达量明显降低(1.40±0.36对0.72±0.17),miR-224-5pCHSY1的相对表达量明显升高(1.06±0.25对1.54±0.27 ),且差异均有统计学意义( t=8.247、6.529,均 P<0.05)。CCD841、COLO320、SW480、RKO、HCT116及HCT116R各细胞株LncRNA MIR503HG的相对表达量分别为2.38±0.06、1.03±0.05、0.87±0.03、0.86±0.02、0.77±0.04、0.54±0.09,miR-224-5pCHSY1的相对表达量分别为0.38±0.06、0.56±0.01、0.59±0.02、0.59±0.05、0.63±0.04、0.82± 0.06,与正常细胞株CCD841相比,结肠癌细胞株COLO320、SW480、RKO、HCT116的LncRNA MIR503HG相对表达量均明显降低( t=2.061、1.665、4.058、6.201,均 P<0.05),miR-224-5pCHSY1的相对表达量均明显增加( t=1.238、1.930、2.037、1.742,均 P<0.05 )。与HCT116细胞株相比,HCT116R的LncRNA MIR503HG相对表达量明显降低[(0.77±0.04)对(0.54±0.09)],miR-224-5pCHSY1的相对表达量明显增加[(0.63±0.04)对(0.82±0.06)],差异均有统计学意义( t=1.267、2.370,均 P<0.05 )。在照射剂量分别为4、6、8 Gy时,MIR503HG组的HCT116R细胞SF明显低于mimic-NC组[(7.25±1.11)%对(11.34±2.65)%、(2.85±0.58)%对(6.08±1.10)%、(0.58±0.05 )%对(3.08±0.84)%],且差异均有统计学意义( t=1.064、1.937、2.650,均 P<0.05 )。过表达LncRNA MIR503HG后,MIR503HG组HCT116R的放射增敏比(SER)为1.399。mimic-NC组、MIR503HG组、mimic-NC+4 Gy组、MIR503HG+4 Gy组的细胞凋亡率分别为(8.10± 0.23)%、(18.44±1.57)%、(17.33±2.35)%、(29.83±1.89)%,与mimic-NC组相比,MIR503HG组、mimic-NC+4 Gy组HCT116R细胞的凋亡率均明显升高,且差异均有统计学意义( t=2.003、1.475,均 P<0.05 )。与anti-miR-NC组相比,anti-miR-224-5p组MIR503HG-Wt的荧光素酶活性明显增加(1.02±0.20对1.60±0.25 ),且差异有统计学意义( t=5.366, P<0.05);miR-224-5pCHSY1与LncRNA MIR503HG结合位点突变后,与anti-miR-NC组相比,anti-miR-224-5p组MIR503HG-Mut的活性无明显变化(0.97±0.25对1.00±0.22),2组间的差异无统计学意义( t=0.291, P> 0.05 )。与mimic-NC组相比,MIR503HG组miR-224-5pCHSY1的表达水平明显降低(1.97±0.13对1.12±0.12),差异有统计学意义( t=3.915, P<0.05)。与anti-miR-NC组相比,anti-miR-224-5p组中miR-224-5pCHSY1的表达水平明显降低(1.99±0.19对0.92±0.18 ),差异有统计学意义( t=2.664 , P<0.05 )。在照射剂量分别为4、6、8 Gy时,anti-miR-224-5p组HCT116R细胞的SF均明显低于anti-miR-NC组[(0.59±0.08 )%对(0.79±0.12)%、(0.39±0.06 )%对(0.67±0.07)%、(0.19±0.04 )%对(0.52±0.04)%],且差异均有统计学意义( t=1.281、2.034、2.911,均 P<0.05)。抑制表达miR-224-5pCHSY1后,anti-miR-224-5p组HCT116R细胞的SER为1.403。anti-miR-NC组、anti-miR-224-5p组、anti-miR-NC+4 Gy组、anti-miR-224-5p+4 Gy组的细胞凋亡率分别为(5.08±0.78)%、(14.48±1.21)%、(13.89±1.36)%、(23.64±1.03)%,与anti-miR-NC组相比,anti-miR-224-5p组与anti-miR-NC+4 Gy组的细胞凋亡率均明显增加,且差异有统计学意义( t= 2.067、1.934,均 P<0.05 );与anti-miR-NC+4 Gy组相比,anti-miR-224-5p+4 Gy组的细胞凋亡率明显增加,差异均有统计学意义( t=4.026 , P<0.05 )。照射剂量为4 Gy时,mimic-NC组、MIR503HG组、MIR503HG+miR-NC组、MIR503HG+miR-224-5p组的SF分别为(0.82±0.17)%、(0.53±0.12)%、(0.54±0.11)%、(0.78±0.15)%,照射剂量为6 Gy时,分别为(0.66±0.13)%、(0.38±0.09)%、(0.35±0.08)%、(0.57±0.10)%,照射剂量为8 Gy时,分别为(0.49±0.10)%、(0.15±0.06)%、(0.13±0.05)%、(0.43±0.11)%,与mimic-NC组相比,照射剂量≥4 Gy时,MIR503HG组HCT116R细胞的SF明显降低( t=1.609、1.533、1.927,均 P<0.05 ),MIR503HG+ miR-NC组HCT116R细胞的SF明显降低( t=1.294、1.490、1.825,均 P<0.05 );与MIR503HG+ miR-NC组相比,照射剂量≥4 Gy时,MIR503HG+miR-224-5p组HCT116R细胞的SF明显增加,且差异均有统计学意义( t=1.573、1.204、1.937,均 P<0.05 ),过表达miR-224-5pCHSY1后,MIR503HG+miR-224-5p组HCT116R细胞的SER为0.825,相比MIR503HG组明显降低。mimic-NC组、MIR503HG组、MIR503HG+miR-NC组、MIR503HG+miR-224-5p组的细胞凋亡率分别为(11.61±2.10)%、(24.97±0.91)%、(24.81±1.27)%、(16.15±1.10)%,与mimic-NC组比较,MIR503HG组和MIR503HG+miR-NC组HCT116R的细胞凋亡率明显增高,且差异有统计学意义( t=2.304、2.159,均 P<0.05 );与MIR503HG+miR-NC组比较,MIR503HG+miR-224-5p组HCT116R的细胞凋亡率明显降低,且差异有统计学意义( t=2.067, P<0.05)。 结论:过表达LncRNA MIR503HG可通过抑制miR-224-5pCHSY1表达增加结肠癌细胞的放射敏感性。
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编辑人员丨5天前
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肾透明细胞癌中miRNA-224-5p靶向NEDD4L调控轴的识别与研究
编辑人员丨5天前
目的:基于生物信息学方法筛选肾透明细胞癌关键基因,识别可能的微RNA(miRNA)-mRNA作用轴,探讨相关基因在肾透明细胞癌组织和细胞中的表达。方法:选取基因表达综合(GEO)数据库基因表达谱GSE40435、GSE71302数据集,肾透明细胞癌TCGA-KIRC数据集来自癌症基因组图谱(TCGA)数据库。采用R软件筛选差异表达的mRNA和miRNA,并对mRNA进行功能富集分析。采用STRING数据库和Cytoscape软件进行蛋白质互作分析。采用Oncomir数据库筛选预后相关的差异表达miRNA。采用TargetScan和miRDB靶基因预测工具筛选miRNA可能调控的靶基因。收集2021年6月至12月山西医科大学第一医院收治的34例肾透明细胞癌患者的组织样本及临床资料,并选择正常肾细胞株293T和肾透明细胞癌细胞株786O。采用实时荧光定量聚合酶链反应检测基因的相对表达量;蛋白质印迹法、免疫组织化学染色法检测目的蛋白的表达水平;双荧光素酶报告基因实验验证基因间的靶向关系。结果:差异分析筛选得到1 351个差异表达mRNA和50个差异表达miRNA。功能富集分析提示肾透明细胞癌中脂肪酸代谢、异生物质代谢等途径被抑制,细胞凋亡、免疫应答途径被激活。蛋白质互作分析提示肾透明细胞癌中信号转导、蛋白泛素化等途径起到关键作用。筛选结果显示miRNA-224-5p(miR-224-5p)与肾透明细胞癌进展关系最紧密,且在肿瘤组织中高表达,其预后相关靶基因为NEDD4L。肾透明细胞癌组织与癌旁组织的NEDD4L mRNA相对表达量分别为0.138±0.103、1.000±0.026( t=46.23, P<0.05);miR-224-5p相对表达量分别为1.000±0.043、0.129±0.108( t=45.28, P<0.05)。不同分级及分期肾透明细胞癌组织NEDD4L mRNA、miR-224-5p的表达差异均有统计学意义(均 P<0.05)。NEDD4L蛋白在肾透明细胞癌中表达降低。293T与786O细胞中NEDD4L基因相对表达量分别为1.000±0.125、0.210±0.044 ( t=17.52, P<0.05);miR-224-5p基因相对表达量分别为0.209±0.049、1.000±0.234( t=10.609, P<0.05)。转染后的293T细胞样本中,miRNA模拟物组与阴性对照组的NEDD4L mRNA相对表达量分别为0.236±0.062、1.000±0.024,差异有统计学意义( t=43.56, P<0.05)。NEDD4L蛋白在miRNA模拟物组中表达降低。双荧光素酶报告基因实验提示NEDD4L是miR-224-5p的直接靶基因。 结论:在肾透明细胞癌中,miR-224-5p靶向调节NEDD4L表达,这一机制可能与肾透明细胞癌的发生、发展有关。
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编辑人员丨5天前
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长链非编码RNA核仁小RNA宿主基因8通过靶向微小RNA-224-3p调控肾癌细胞增殖、侵袭迁移以及顺铂敏感性
编辑人员丨5天前
目的:探讨长链非编码RNA核仁小RNA宿主基因8(lncRNA SNHG8)对肾癌细胞增殖、侵袭、迁移和顺铂敏感性的影响及其分子机制。方法:实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测SNHG8和微小RNA(miR)-224-3p表达水平;蛋白质印迹(Western blot)法检测基质金属蛋白酶-2(MMP-2)、细胞增殖核抗原Ki-67(Ki-67)、裂解半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(cleaved Caspase-3)和多药耐药基因1(MDR1)蛋白表达;四甲基偶氮唑盐比色法(MTT)检测细胞存活率和顺铂半数抑制浓度(IC 50);Transwell检测细胞迁移和侵袭;流式细胞术检测细胞凋亡;荧光素酶报告实验检测SNHG8和miR-224-3p的靶向关系。两组比较采用 t检验。 结果:肾癌细胞系ACHN、786-O和A498中SNHG8高表达(1.05±0.09比4.58±0.47、6.19±0.52、5.37±0.48, t=22.130、29.219、26.538, P<0.05),miR-224-3p低表达(1.02±0.08比0.53±0.07、0.41±0.06、0.47±0.08, t=13.829、18.300、14.584, P<0.05)。与si-con组相比,si-SNHG8组,肾癌细胞786-O中MMP-2、Ki-67、MDR1表达降低,cleaved Caspase-3表达升高,细胞存活率降低[(69.86±6.37)%比(96.42±9.26)%, t=7.089, P<0.05],迁移和侵袭数[(175.64±12.20)个比(292.70±20.45)个、(92.81±8.38)个比(147.24±15.93)个, t=14.748、9.072, P<0.05]降低,凋亡率升高[(19.48±2.28)%比(4.28±0.64)%, t=19.256, P<0.05],顺铂IC 50值降低(1.47±0.14比7.81±0.22, t=19.454, P<0.05)。过表达miR-224-3p后,肾癌细胞786-O中MMP-2、Ki-67、MDR1表达降低,cleaved Caspase-3表达升高,细胞存活率降低[(67.36±8.65)%比(98.24±9.53)%, t=7.198, P<0.05],迁移和侵袭数[(155.81±16.67)个比(274.73±28.61)个、(72.96±8.35)个比(156.61±14.28)个, t=10.774、15.170, P<0.05]降低,凋亡率升高[(18.49±2.28)%比(4.67±0.63)%, t=17.527, P<0.05],顺铂IC 50值降低(1.79±0.15比6.72±0.26, t=49.273, P<0.05)。 结论:沉默SNHG8可抑制肾癌细胞786-O增殖、迁移、侵袭,促进细胞凋亡,增强其对顺铂的敏感性;其机制可能与miR-224-3p有关。
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编辑人员丨5天前
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微小RNA-224通过靶向抑制p21参与调控脂多糖诱导的肺微血管内皮细胞损伤研究
编辑人员丨5天前
目的:探讨miR-224在脂多糖(LPS)诱导的肺微血管内皮细胞(PMVEC)损伤中的作用及机制。方法:分离清洁级BALB/c小鼠(购自浙江大学实验动物中心)原代PMVEC并体外培养,使用1.0 mg/L LPS处理PMVEC以诱导细胞损伤。通过转染miR-224抑制序列或p21的小干扰RNA(siRNA)序列分别下调PMVEC的微小RNA-224(miR-224)及p21表达水平。采用细胞计数试剂盒法及流式细胞仪检测PMVEC的细胞活力变化及凋亡率变化。实时荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)及蛋白质印迹法(Western blot)检测PMVEC的miR-224及p21表达水平。使用双荧光素酶报告实验分析miR-224及p21的靶向关系。两组间的均数比较采用 t检验,多组间的均数两两比较在采用单因素方差分析基础上使用最小显著差异法(LSD)检验。 结果:与未经任何处理的PMVEC比较,LPS处理后细胞相对细胞活力降低至(42.333±7.586)%,凋亡率提高至(32.141±2.449)%,miR-224表达增加至1.791±0.167,p21 mRNA水平降低至0.527±0.058,以上差异有统计学意义( t=8.532、7.261、7.113及8.467, P值均<0.01)。与单纯LPS处理的细胞比较,miR-224下调的细胞在LPS处理后的相对细胞活力增加且凋亡率显著降低,差异有统计学意义( F=62.618、32.643, P<0.01)。抑制p21表达会消除miR-224下调带来的这种保护作用。 结论:miR-224可能通过靶向抑制p21参与调控LPS诱导的PMVEC损伤。抑制miR-224可能有助于脓毒症后急性肺损伤或急性呼吸窘迫综合征的防治。
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编辑人员丨5天前
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血清miR-224-5p在胰腺导管腺癌中的表达及其对临床诊断的意义
编辑人员丨5天前
目的:探讨血清miR-224-5p在PDAC中的表达及其对胰腺癌早期临床诊断的意义。方法:选取青岛市市立医院2018年8月至2020年4月间收治的40例PDAC患者(11例早期PDAC,29例中晚期PDAC)、21例慢性胰腺炎患者和40名健康志愿者为研究对象,应用qRT-PCR方法检测各组血清miR-224-5p水平,分析其与临床病理参数之间的相关性。绘制miR-224-5p、CA19-9及miR-224-5p联合CA19-9检测的受试者工作特征曲线(ROC),计算诊断的灵敏度和特异度。结果:早期PDAC组、中晚期PDAC组、慢性胰腺炎组和健康对照组血清miR-224-5p水平分别为3.21(2.01,4.60)、4.70(3.50,8.26)、1.72(1.02,2.78)、1.38(0.89,2.11),中晚期PDAC组血清miR-224-5p水平显著高于早期PDAC组,早期PDAC组又显著高于慢性胰腺炎组和健康对照组,差异有统计学意义( P值均<0.05)。血清miR-224-5p联合CA19-9、miR-224-5p、CA19-9检测对PDAC的诊断灵敏度依次为95.0%、85.0%、67.5%,特异度依次70.0%、82.5%、87.5%;对早期PDAC的诊断灵敏度依次为90.9%、72.7%、63.6%,特异度依次为72.5%、85.0%、87.5%。血清miR-224-5p联合CA19-9诊断PDAC的灵敏度最高。PDAC患者血清miR-224-5p水平与肿瘤TNM分期、淋巴结转移和远处转移相关( P值均<0.05)。 结论:PDAC患者血清miR-224-5p表达水平明显上调,且与肿瘤TNM分期、淋巴结和远处转移密切相关。血清miR-224-5p及其与CA19-9联合诊断早期PDAC的灵敏度高于单纯CA19-9,可作为早期筛查PDAC潜在的较敏感的生物学标志物。
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编辑人员丨5天前
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丙型肝炎病毒感染者血清微小核糖核酸665和224的表达及其对肝癌的诊断价值
编辑人员丨5天前
目的:探讨HCV感染者血清微小核糖核酸(miR)665及miR-224的表达,分析其对肝癌的诊断价值。方法:选取2017年1月至2020年5月保定市人民医院收治的130例HCV感染者和60例健康体检正常者。HCV感染者根据其诊断结果,分为慢性丙型肝炎(CHC)组54例,肝硬化组46例和肝癌组30例。根据HCV RNA的检测结果,将HCV感染者分为低病毒载量组(34例,HCV RNA<10 3 IU/mL)、中病毒载量组(57例,HCV RNA为10 3~10 6 IU/mL)和高病毒载量组(39例,HCV RNA>10 6 IU/mL)。采用Metavir评分判断HCV感染者肝纤维化程度,F0期29例,F1~F2期56例,F3~F4期45例。应用ROC曲线分析血清miR-665、miR-224及甲胎蛋白(AFP)水平诊断肝癌的价值。 结果:各组miR-665和miR-224水平差异均有统计学意义( F=16.18和11.52, P均<0.001)。肝癌组、肝硬化组和CHC组血清miR-665( q=17.39、13.84和10.25)及miR-224( q=10.29、12.65和12.85)表达水平均明显高于对照组( P均< 0.001)。肝癌组血清miR-665及miR-224表达水平均高于CHC组( q=17.11和15.12)和肝硬化组( q=17.00和14.97)( P均< 0.001)。随着病毒载量的增加和肝纤维化的加重,血清miR-665及miR-224表达水平明显增高,差异有统计学意义( F =14.83、8.71,17.62和11.18, P均<0.001)。ROC曲线显示,miR-665、miR-224及AFP三项联合诊断肝癌的曲线下面积最大(0.963),其灵敏度和特异性为99.2%和90.3%。 结论:HCV感染患者血清miR-665及miR-224表达水平明显升高,miR-665、miR-224及AFP三项联合对HCV感染导致的肝癌具有较好的诊断价值。
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编辑人员丨5天前
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长链非编码RNA FAM224B对大鼠重症肺炎肺组织的保护作用及机制研究
编辑人员丨5天前
目的:探讨过表达长链非编码RNA(lncRNA)FAM224B对大鼠重症肺炎肺组织的保护作用及机制。方法:研究时间为2020年8月至2021年3月,将20只大鼠采用随机数字表法分为肺炎组(重症肺炎模型)和FAM224B组(重症肺炎模型+FAM224B质粒),每组10只。实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)测定肺组织FAM224B水平,酶联免疫吸附测定法(ELISA)检测肺组织匀浆中肿瘤坏死因子α(TNF-α)、白细胞介素(IL)6、IL-1β水平,生物信息学软件starBase v2预测FAM224B的靶基因,qRT-PCR检测肺组织靶基因的表达,Western blot检测肺组织核因子-κB(NF-κB)信号通路蛋白表达。结果:肺炎组、FAM224B组肺组织中FAM224B表达分别为(1.09±0.23)、(10.12±1.52),肺炎组FAM224B表达明显低于FAM224B组( t=15.86, P < 0.01)。肺炎组肺组织匀浆中TNF-α、IL-6、IL-1β分别为(41.53±2.46)μg/L、(34.01±2.53)ng/L、(20.92±1.95)μg/L,FAM224B组分别为(21.71±2.25)μg/L、(17.13±3.01)ng/L、(11.97±1.21)μg/L,两组差异均有统计学意义( t=15.94、14.29、13.89,均 P < 0.01)。FAM224B与miR-34b-5p存在互补结合位点。与肺炎组比较,FAM224B组肺组织中miR-34b-5p表达明显降低( t=15.55, P < 0.01),磷酸化核因子-κB亚单位(p-p65)、磷酸化核因子κB抑制蛋白α(p-IKB-α)蛋白表达降低。 结论:过表达FAM224B通过抑制miR-34b-5p可减轻大鼠重症肺炎肺组织的炎性反应。
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编辑人员丨5天前
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子宫颈癌组织中环状RNA的表达谱及功能分析
编辑人员丨5天前
目的:探究子宫颈癌组织中环状RNA(circRNA)的表达谱,并对差异表达的circRNA进行功能分析。方法:收集2021年2月至8月在郑州大学第二附属医院经病理检查确诊的15例子宫颈癌患者的癌组织及其癌旁组织标本。(1)采用circRNA高通量测序技术分析其中5例子宫颈癌患者的癌组织及其癌旁组织中circRNA的表达谱差异;对显著差异表达circRNA的亲本基因作基因本体(GO)功能注释及京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。(2)将本研究中circRNA高通量测序并筛选出的差异表达circRNA与从美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因表达综合(GEO)数据库下载的基因表达谱GSE102686数据集中筛选出的差异表达circRNA取交集,选择差异倍数最高的3个显著下调和3个显著上调共6个circRNA,即hsa_circ_0079480、hsa_circ_0005480、hsa_circ_0003162和hsa_circ_0084927、hsa_circ_0002151、hsa_circ_0001849,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术验证15例子宫颈癌患者的癌组织及其癌旁组织中6个差异表达circRNA的表达。(3)选择6个差异表达circRNA中经过qRT-PCR技术验证的在子宫颈癌组织及其癌旁组织中表达水平有显著差异( P<0.05)的circRNA进行下一步的功能研究(共有3个差异表达circRNA,即hsa_circ_0005480、hsa_circ_0003162和hsa_circ_0084927),构建小分子干扰RNA(siRNA),转染子宫颈癌细胞系SiHa和HeLa细胞以敲低其表达,实验分为4组,即hsa_circ_0005480敲低组、hsa_circ_0003162敲低组、hsa_circ_0084927敲低组和阴性对照(NC)组,采用活细胞计数(CCK-8)法检测4组SiHa和HeLa细胞的增殖能力。(4)通过Starbase、CircInteractome等数据库预测能够与hsa_circ_0005480、hsa_circ_0003162和hsa_circ_0084927结合的微小RNA(miRNA),构建竞争性内源性RNA(ceRNA)网络,即circRNA-miRNA网络。 结果:(1)高通量测序结果显示,5例子宫颈癌患者的癌组织及其癌旁组织中共检测到26 280个circRNA,有1 421个差异表达的circRNA,其中表达上调774个,表达下调647个。GO功能注释及KEGG信号通路富集分析显示,差异表达circRNA主要富集于血管内皮生长因子(VEGF)、恶性肿瘤中的miRNA、铂类药物耐药性等信号通路。(2)qRT-PCR技术检测显示,hsa_circ_0005480(分别为0.54±0.31、1.03±0.27; t=4.647, P<0.001)和hsa_circ_0003162(分别为0.48±0.45、1.24±0.81; t=3.172, P=0.004)在子宫颈癌组织中的表达水平显著低于其癌旁组织,而hsa_circ_0084927在子宫颈癌组织中的表达水平显著高于其癌旁组织(分别为2.34±0.90、1.11±0.54; t=-4.507, P<0.001)。(3)与NC组细胞(包括SiHa和HeLa细胞)相比,hsa_circ_0005480敲低组细胞的增殖能力显著增强,而hsa_circ_0003162敲低组和hsa_circ_0084927敲低组细胞的增殖能力显著减弱( P均<0.01)。(4)ceRNA网络的构建结果:hsa_circ_0005480可与hsa-miR-224-3p、hsa-miR-522-3p等8个miRNA相互作用;hsa_circ_0003162可与hsa-miR-485-3p、hsa-miR-1243和hsa-miR-1279相互作用;hsa_circ_0084927可与hsa-miR-874-3p、hsa-miR-367-5p等9个miRNA相互作用。 结论:本研究初步阐明了子宫颈癌组织中circRNA的表达谱,对差异表达的circRNA进行验证和功能研究,并构建ceRNA网络,为研究子宫颈癌的发生、发展及治疗靶点提供依据。
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编辑人员丨5天前
