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卵巢子宫内膜异位症miRNA及mRNA的表达检测及调控网络分析
编辑人员丨1周前
目的:采用高通量测序检测卵巢子宫内膜异位症微小RNA(microRNA,miRNA)及mRNA的表达,分析miRNA-mRNA调控网络关系,探索卵巢子宫内膜异位症的发生机制。方法:回顾性分析2017年3月至2018年3月在中南大学湘雅医院因卵巢子宫内膜异位症行手术的患者20例,取异位内膜及配对在位内膜组织,提取总RNA,分别进行miRNA测序及mRNA测序,获得差异miRNA及mRNA表达谱。运用Targetscan、miRDB数据库预测差异miRNA可能结合的mRNA,并与差异mRNA取交集,获得候选mRNA,采用Cytoscape软件进行miRNA-mRNA调控网络分析,采用DAVID数据库进行基因功能富集(GO)分析和信号通路(pathway)分析。结果:与在位内膜比较,异位内膜差异表达的miRNA有369个(197个上调,172个下调),差异表达的mRNA 3 765个(1 975个上调,1 790个下调)。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)证实miR-202-5p、miR-514a-5p在异位内膜表达高于在位内膜( P<0.05),而miR-375-3p、miR-449b-5p在异位内膜表达低于在位内膜( P<0.05),与测序结果相符合。生物信息学发现与这4个miRNA相关的候选mRNA主要富集于核内甾体激素受体结合、跨膜受体及蛋白激酶激活等生物学过程。KEGG通路富集显示其参与了多种信号通路,如TGFβ信号通路、细胞黏附分子信号通路、Wnt信号通路、Rap1信号通路。 结论:miRNA及mRNA在子宫内膜异位症差异表达,二者相互作用通过多种通路参与子宫内膜异位症的发生发展。
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编辑人员丨1周前
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CASC19调控miR-449b-5p表达对子宫颈癌细胞增殖、凋亡和辐射敏感性的影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨癌易感性候选基因19(CASC19)调控微小RNA-449b-5p(miR-449b-5p)的表达后对子宫颈癌细胞增殖、凋亡和辐射敏感性的影响。方法:(1)培养子宫颈癌细胞系HeLa细胞,予不同剂量(分别为0、2、4、6、8 Gy)的X线照射,实时荧光定量PCR技术检测HeLa细胞中CASC19 mRNA和miR-449b-5p的表达水平。(2)不同条件处理后HeLa细胞增殖、凋亡、辐射敏感性及其相关蛋白表达的检测,其中,不同处理条件包括沉默CASC19表达、过度表达miR-449b-5p、下调miR-449b-5p并沉默CASC19表达,相关蛋白包括细胞周期蛋白D1(cyclin D1)、活化的半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(cleaved-caspase-3)和组蛋白变异体H2AX(γ-H2AX);采用四甲基偶氮唑蓝(MTT)比色法检测细胞增殖情况,流式细胞仪检测细胞凋亡情况,细胞克隆形成实验检测细胞的辐射敏感性(以存活分数表示)。(3)采用双荧光素酶报告基因实验(结果以荧光素酶活性表示)和实时荧光定量PCR技术验证CASC19和miR-449b-5p之间的靶向调控关系。结果:(1)随着X线照射剂量(0、2、4、6、8 Gy)的增加,HeLa细胞中CASC19 mRNA的表达水平逐渐升高( F=502.681, P=0.000),miR-449b-5p的表达水平逐渐降低( F=202.936, P=0.000)。(2)沉默CASC19表达、过度表达miR-449b-5p后,HeLa细胞的存活率显著降低( P<0.05),凋亡率显著升高( P<0.05),存活分数显著降低( P<0.05),cyclin D1蛋白的表达水平显著降低( P<0.05),cleaved-caspase-3和γ-H2AX蛋白的表达水平显著升高( P<0.05);下调miR-449b-5p并沉默CASC19表达后,HeLa细胞的存活率显著升高( P<0.05),凋亡率显著降低( P<0.05),存活分数显著升高( P<0.05),cyclin D1、γ-H2AX蛋白的表达水平显著升高( P<0.05),cleaved-caspase-3的表达水平显著降低( P<0.05)。(3)与对照比较,过度表达miR-449b-5p可显著降低CASC19基因野生型HeLa细胞的荧光素酶活性(分别为1.00±0.09、0.37±0.05, P<0.01),而对CASC19基因突变型HeLa细胞的荧光素酶活性无显著影响(分别为0.92±0.07、0.94±0.05, P>0.05)。与对照比较,沉默CASC19表达后HeLa细胞中miR-449b-5p的表达水平显著升高(分别为1.00±0.12、4.84±0.49, P<0.05),过度表达CASC19后HeLa细胞中miR-449b-5p的表达水平显著降低(分别为1.00±0.09、0.38±0.04, P<0.05)。 结论:HeLa细胞中CASC19可负调控miR-449b-5p的表达,下调miR-449b-5p表达可部分逆转沉默CASC19对HeLa细胞增殖、凋亡及辐射敏感性的影响。
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编辑人员丨1周前
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某矿井下作业人员外周血血浆miRNAs表达研究
编辑人员丨1周前
目的:探讨氡对矿井下作业人员外周血血浆miR-16、miR-106b、miR-449a、let-7g、miR-21、miR-221、miR-34a表达的影响。方法:采用简单随机抽样法分别选取矿井下作业人员(井下组)46名和矿井上作业人员(对照组)38名。采用实时荧光定量PCR(qPCR)方法,检测研究对象外周血血浆中miRNAs的相对表达水平。比较miRNAs在井下组和对照组外周血血浆中的差异表达,分析miRNAs的差异性表达与累积剂量等因素的关系。结果:井下组外周血血浆miR-106b、miR-21、miR-221明显高于对照组( Z=-2.32、-2.47、-2.79, P<0.05),其倍数变化(Fc)分别为1.61、1.75、1.30;miR-16、miR-449a、let-7g、miR-34a高于对照组,但差异无统计学意义( P>0.05)。控制年龄、体质量指数(BMI)、吸烟等因素后,miR-16、miR-106b、let-7g、miR-21、miR-221的差异性表达和氡暴露累积剂量呈正相关( t=2.50、3.31、2.60、2.95、3.25, P<0.05),而miR-449a、miR-34a的表达改变与氡暴露累积剂量无显著相关( P>0.05)。 结论:miR-106b、miR-21、miR-221可能具有作为氡致辐射损伤的早期标志物的潜在价值。
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编辑人员丨1周前
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基于生物信息学构建胰腺癌患者预后相关miRNA预测模型及其应用价值
编辑人员丨1周前
目的:探讨基于生物信息学构建胰腺癌患者预后相关微小RNA(miRNA)预测模型及其应用价值。方法:采用回顾性队列研究方法。收集肿瘤基因图谱计划(TCGA)数据库(https://cancergenome.nih.gov/)自建库起至2017年9月171例胰腺癌患者的临床病理资料;男93例,女78例;中位年龄为65岁,年龄范围为35~88岁。171例患者中,64例临床病理资料完整。171例患者采用随机抽样法按7∶3比例分为训练集123例和测试集48例。训练集用于构建预测模型,测试集用于验证预测模型效能。从GEO基因公共表达数据库中下载包含9对胰腺癌及对应癌旁组织的miRNA测序数据的数据集GSE41372,从癌组织及癌旁组织差异表达的miRNA中筛选出候选差异表达miRNA,基于训练集患者信息,进行LASSO-COX回归分析,从候选差异表达miRNA中筛选出与生存相关miRNA,将其拟合成一个相对精简的预后相关miRNA模型。分别在训练集和测试集中对构建的预后相关miRNA模型的预测效能进行验证,以受试者工作曲线下面积(AUC)评价模型准确性,以一致性指数(C-index值)评价模型效能。观察指标:(1)患者生存情况。(2)差异表达miRNA筛选结果。(3)预后相关miRNA模型的构建。(4)预后相关miRNA模型的验证。(5)胰腺癌患者临床病理因素比较。(6)影响胰腺癌患者预后的相关因素分析。(7)预后相关miRNA模型与第8版TNM分期预测效能的比较。正态分布的计量资料以 ± s表示,两组间比较采用Student- t检验,多组间比较采用方差分析。偏态分布的计量资料以 M(范围)表示,组间比较采用Mann-Whitney U检验。计数资料以绝对数或百分比表示,组间比较采用 χ2检验。等级资料分析采用秩和检验。采用计数资料相关性分析,挖掘预后相关miRNA模型与患者临床病理参数之间的相关性。采用COX进行单因素及多因素分析,并判断相关性,结果以风险比及95%可信区间表示,风险比<1时,证明该因素为保护因素;风险比>1时,证明该因素为危险因素;风险比=1时,说明对生存无明显影响。采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线并计算生存率,采用Log-rank检验进行生存分析。 结果:(1)患者生存情况:123例训练集患者随访时间为31~2 141 d,中位随访时间为449 d,3、5年总体生存率分别为16.67%、8.06%。48例测试集患者随访时间为41~2 182 d,中位随访时间为457 d,3、5年总体生存率分别为15.63%、9.68%。两组患者3、5年总体生存率比较,差异均无统计学意义( χ2=0.017,0.068, P>0.05)。(2)差异表达miRNA筛选结果:生物信息学分析结果显示,共筛选102个候选差异表达miRNA,其中63个miRNA在癌组织中上调,39个miRNA在癌组织中下调。(3)预后相关miRNA模型的构建:在102个候选差异表达基因中,筛选出5个与生存相关的miRNA。名称分别为miR-21、miR-125a-5p、miR-744、miR-374b、miR-664,差异表达模式(癌组织对比癌旁组织)分别为升高、升高、降低、升高、降低,差异表达倍数分别为4.00、3.43、3.85、2.62、2.35倍。由5个与生存相关miRNA构建的预后表达方程=0.454×miR-21表达量-0.492×miR-125a-5p表达量-0.49×miR-744表达量-0.419×miR-374b表达量-0.036×miR-664表达量。(4)预后相关miRNA模型的验证:在训练集和测试集中,预后相关miRNA模型C-index值分别为0.643和0.642。(5)胰腺癌患者临床病理因素比较:COX分析结果显示,预后相关miRNA模型与肿瘤病理学T分期和肿瘤位置具有相关性( Z=45.481, χ2=10.176, P<0.05)。(6)影响胰腺癌患者预后的相关因素分析:单因素分析结果显示为肿瘤病理学N分期、接受放射治疗、接受分子靶向治疗、预后相关miRNA模型评分是胰腺癌患者预后的相关因素(风险比=2.471,0.290,0.172,2.001,95%可信区间为1.012~6.032,0.101~0.833,0.082~0.364,1.371~2.922, P<0.05)。多因素分析结果显示:接受分子靶向治疗是胰腺癌患者预后的独立保护因素(风险比=0.261,95%可信区间为0.116~0.588, P<0.05);预后相关miRNA模型评分≥1.16分是胰腺癌患者预后的独立危险因素(风险比=1.608,95%可信区间为1.091~2.369, P<0.05)。(7)预后相关miRNA模型与第8版TNM分期预测效能的比较:在训练集中,预后相关miRNA模型对胰腺癌患者3、5年生存时间预测概率与第8版TNM分期比较,差异有统计学意义( Z=-1.671,-1.867, P<0.05)。预后相关miRNA模型与第8版TNM分期AUC分别为0.797、0.935与0.737、0.703,95%可信区间分别为0.622~0.972、0.828~1.042与0.571~0.904、0.456~0.951;C-index值分别为0.643与0.534。在测试集中,预后相关miRNA模型对胰腺癌患者3、5年生存时间预测概率与第8版TNM分期比较,差异有统计学意义( Z=-1.729,-1.923, P<0.05)。预后相关miRNA模型与第8版TNM分期AUC分别为0.750、0.873与0.721、0.703,95%可信区间分别为0.553~0.948、0.720~1.025与0.553~0.889、0.456~0.950;C-index值分别为0.642与0.544。 结论:基于5个与胰腺癌生存相关miRNA构建可用于胰腺癌患者生存预测的预后相关miRNA模型。该模型可与现有TNM分期系统及其他临床病理参数形成互补,为患者提供个体化、准确的生存时间预测,为临床治疗提供参考。
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编辑人员丨1周前
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艾司氯胺酮对肝癌细胞恶性生物学行为的影响及作用机制实验研究
编辑人员丨1个月前
目的:探讨艾司氯胺酮对肝癌细胞恶性生物学行为的影响及可能的作用机制.方法:收集26例肝癌患者的癌组织和癌旁组织.实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测肝癌组织和细胞微小RNA(miR)-449b-5p和转化生长因子-β诱导因子同源盒2(TGIF2)mRNA表达.选取上述基因变化最显著的细胞进行后续实验.将肝癌SK-Hep-1细胞分为对照组(正常培养)、艾司氯胺酮-L组(1 mmol/L艾司氯胺酮处理)、艾司氯胺酮-H组(2 mmol/L艾司氯胺酮处理)、艾司氯胺酮-H+inhibitor NC组(转染inhibitor NC+2 mmol/L艾司氯胺酮处理)、艾司氯胺酮-H+miR-449b-5p inhibitor组(转染miR-449b-5p inhibitor+2 mmol/L艾司氯胺酮处理).细胞计数试剂盒(CCK-8)法检测细胞增殖.划痕实验检测细胞迁移能力.Transwell实验检测细胞侵袭能力.流式细胞术检测细胞凋亡情况.Western blot检测细胞中肿瘤增殖细胞核抗原(Ki-67)、半胱氨酸蛋白酶-3(Cleaved caspase-3)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)、血管内皮生长因子A(VEGF-A)、TGIF2蛋白表达量.双荧光素酶报告基因实验验证miR-449b-5p和TGIF2的靶向关系.结果:肝癌组织和细胞TGIF2 mRNA表达水平升高,miR-449b-5p表达水平降低(均P<0.05).与对照组比较,艾司氯胺酮-L组、艾司氯胺酮-H组以及艾司氯胺酮-H+inhibitor NC组SK-Hep-1细胞中miR-449b-5p表达水平、细胞凋亡率及Cleaved caspase-3蛋白表达水平升高,TGIF2 mRNA表达水平、OD450值(24、48 h)、细胞划痕愈合率、细胞侵袭数及Ki-67、MMP-9、VEGF-A、TGIF2蛋白表达水平降低(均P<0.05).与艾司氯胺酮-H+inhibitor NC 组比较,艾司氯胺酮-H+miR-449b-5p inhibitor 组 SK-Hep-1 细胞miR-449b-5p表达水平、细胞凋亡率及Cleaved caspase-3蛋白表达水平降低,TGIF2 mRNA表达水平、OD450值(24、48 h)、细胞划痕愈合率、细胞侵袭数及Ki-67、MMP-9、VEGF-A、TGIF2蛋白表达水平升高(均P<0.05).miR-449b-5p mimic+TGIF2-WT组荧光素酶活性低于miR-NC+TGIF2-WT组(P<0.05).结论:艾司氯胺酮通过上调miR-449b-5p/TGIF2轴抑制肝癌细胞的恶性生物学行为.
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编辑人员丨1个月前
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基于转录组测序筛选多囊卵巢综合征外周血中差异表达基因及miRNA
编辑人员丨2024/7/6
目的:基于转录组测序并结合生物信息学技术分析多囊卵巢综合征(P-COS)患者与健康人群全血样本来源的微阵列数据,筛选差异表达基因及miRNA,为PCOS的临床诊疗提供新见解.方法:从GEO数据库筛选并下载GSE54248 数据集,利用R软件limma包筛选PCOS组与对照组的差异表达基因,并对其进行GO和KEGG富集分析.使用在线分析工具STRING数据库用于分析蛋白质-蛋白质相互作用,并通过Cytoscape构建PPI互作网络,使用CytoHubba插件中的MCC、Degree、Closeness、Bottleneck四种算法计算后取交集识别Hub基因.通过NetworkAnalyst构建Hub基因的靶向miRNA网络图.qRT-PCR法检测PCOS 组及对照组外周血中 IL-1β、FCGR3A、CD79B、CD27 和 CD52 表达.结果:从GSE54248 数据集中共筛选鉴定出 98 个差异表达基因,其中 55 个上调基因,43 个下调基因.GO富集分析表明,差异基因生物学过程主要集中于蛋白质自身磷酸化、白细胞介导的免疫、淋巴细胞介导的免疫、免疫反应调节信号通路等.KEGG显著富集了3 个信号通路,分别为原发性免疫缺陷、造血细胞系及Th17 细胞分化.结合PPI网络与CytoHubba的四种算法的结果,得到了IL-1β、FCGR3A、CD79B、CD27 和CD52 这 5个Hub基因.结合miRNA-靶基因的共表达网络,有5 种miRNAs,包括hsa-miR-375、hsa-miR-34a-p、hsa-miR-126-3p、hsa-miR-146a-5p及hsa-miR-449a等被预测可能是PCOS患者外周血中关键的miRNA分子.qRT-PCR结果证实,与对照组相比,PCOS组患者外周血中IL-1β表达升高(P<0.05),FCGR3A、CD79B、CD27 表达均显著升高(P<0.01).结论:本研究通过公共数据库挖掘鉴定出IL-1β、FCGR3A、CD79B、CD27 可能作为关键基因参与PCOS的病理生理过程,并通过生物信息学分析鉴定了5 个可能调控PCOS的miRNA.该结果将为进一步阐明PCOS的发生发展机制提供新思路,也将为PCOS提供新的药物靶点和诊疗思路.
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编辑人员丨2024/7/6
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呼吸窘迫综合征新生患儿血浆中miRNAs的差异性表达及临床意义
编辑人员丨2024/4/27
目的 探讨呼吸窘迫综合征(Respiratory distress syndrome,RDS)新生患儿血浆miR-NAs的差异表达及意义.方法 选取68例RDS新生患儿、15例健康新生儿为研究对象,随机各选取6例进行血浆测序,用反转录聚合酶链反应(Reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)检测血浆 miRNAs表达.鉴定出差异表达最显著的两个 miRNAs进行后续研究,用RT-PCR检测RDS 发作期、出院时、出院后1个月时的miRNAs水平.用受试者工作特征曲线(Receiver operating characteristic curve,ROC)分析发作期时血浆miRNAs表达水平诊断RDS严重程度的价值.分析发作期时miRNAs表达水平与动脉血氧分压(Partial pressure of oxygen,PaO2)、二氧化碳分压(Partial pressure of carbon dioxide,PaCO2)、吸氧分数(Fraction of oxygen uptake,FiO2)、氧合指数(PaO2/FiO2)、肌酸激酶同工酶(Creatine kinase isoenzyme,CK-MB)、乳酸脱氢酶(Lactic dehydrogenase,LDH)、超氧化物歧化酶(Superoxide dismutase,SOD)、丙二醛(Malondialdehyde,MDA)水平的相关性.结果 测序结果显示,RDS新生患儿与健康新生儿血浆中共1 230种差异表达miRNAs,其中693种表达上调,537种表达下调.miRNA-200b及miR-NA-449差异表达倍数>20,是差异性表达最显著的miRNAs.出院后1个月时RDS新生患儿血浆miRNA-200b及miRNA-449的表达水平均低于发作期和出院时(P<0.05),且出院时水平低于发作期(P<0.05).血浆 miRNA-200b、miRNA-449诊断RDS的曲线下面积(Area under curve,AUC)分别为0.702、0.763,灵敏度分别为73.6%、76.9%,特异度分别为69.8%、72.8%.血浆miRNA-200b与miRNA-449相对表达水平分别与PaO2、PaO2/FiO2 呈负相关(P<0.05),与PaCO2、FiO2 呈正相关(P<0.05).miRNA-200b、miRNA-449分别与CK-MB、LDH、MDA呈正相关(P<0.05),与SOD呈负相关(P<0.05).结论 RDS新生患儿血浆miRNAs有明显异常表达,其中miRNA-200b、miRNA-449差异较为显著,二者在RDS新生患儿血浆中表达水平升高,且与呼吸功能损伤、心肌损伤和氧化应激损伤相关.
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编辑人员丨2024/4/27
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上调miR-449a表达对肝癌细胞生长和侵袭能力的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的:探讨miR-449a在肝癌(HCC)细胞中的表达及其对HCC细胞生物学行为的影响.方法:用qRT-PCR检测miR-449a在正常肝细胞L02和4种HCC细胞株(HepG2、Hep3B、SMMC-7721和Bel-7402)的表达.用脂质体法将miR-449a模拟物或阴性对照序列转染HCC细胞后,分别用CCK-8法、流式细胞术、Transwell小室实验检测细胞增殖、细胞周期、侵袭能力的变化,并观察以上两种不同转染的HCC细胞在裸鼠体内的成瘤情况.结果:miR-449a在4种HCC细胞株的表达水平均明显低于L02细胞(均P<0.05),其中在Bel-7402细胞表达的水平最低.与转染阴性对照序列的Bel-7402细胞比较,转染miR-449a模拟物的Bel-7402细胞增殖活性明显降低、G1/S期阻滞明显增加、穿室细胞数明显减少(均P<0.05);与转染阴性对照序列的Bel-7402细胞比较,转染miR-449a模拟物的Bel-7402细胞在裸鼠体内成瘤后的移植瘤质量与体积均明显减小(0.748 g vs.1.234 g;33.667 mm3 vs.1400.500 mm3,均P<0.05).结论:HCC细胞中miR-449a表达降低,上调miR-449a表达可以抑制HCC细胞在体内外的生长.
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编辑人员丨2023/8/6
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ZIC5在前列腺癌中的表达及意义
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究ZIC5(Zic family member 5)在前列腺癌中的异常表达及其对前列腺癌生物学表型的影响.方法 实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time PCR)检测ZIC5在前列腺癌组织标本和对应癌旁正常组织、PC3和LNCaP细胞株及正常前列腺上皮中的表达水平.siRNA干扰ZIC5后,CCK-8法和Transwell试验检测前列腺癌细胞PC3和LNCaP的增殖、迁移和侵袭.生物信息学分析可能调控ZIC5的miRNA并进行验证.结果 ZIC5在前列腺癌组织中表达水平上升(t=4.2,P<0.001),并且与Gleason评分分级具有相关性(P<0.05),在前列腺癌细胞株中表达水平显著高于正常前列腺癌上皮(P<0.01).前列腺癌细胞株 PC3和 LNCaP 中siRNA干扰ZIC524 h后,细胞增殖减慢,迁移和侵袭能力被抑制.生物信息学及双荧光素酶报告显示,ZIC5受miR-449家族调控,ZIC5与miR-449家族在前列腺癌标本中表达水平呈负相关(ZIC5 vs miR-449a: r=-0.64,P<0.05,ZIC5 vs miR-449b,r=-0.52,P<0.05),双荧光素酶报告基因检测显示miR-449家族结合ZIC53'UTR.异常表达的ZIC5可激活EMT通路,干扰ZIC5和过表达miR-449可抑制ZIC5蛋白表达,并逆转前列腺癌细胞中EMT状态.结论 ZIC5受miR-449家族调控,促进前列腺癌生长和侵袭.
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编辑人员丨2023/8/6
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铁蓄积性骨量下降小鼠微小RNA筛选及靶基因预测
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨铁蓄积小鼠骨量下降与微小RNA(miRNA,miR)差异性表达的关系.方法 12周龄雄性ICR小鼠(n=12)随机分为两组:铁蓄积组(FAC组)及对照组(Con组),分别腹腔注射枸橼酸铁胺(FAC)及等量生理盐水,干预8周后检测血清铁蛋白,微计算机断层扫描技术(Micro-CT)检测小鼠股骨骨量,并分析相关骨结构参数.小鼠全血分离白细胞提取RNA,进行TaqmanmiRNA芯片检测表达谱差异,实时荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)检测验证差异miRNA.利用Targetscan及miRDB数据库预测差异miRNA的下游靶基因,并对预测的下游靶基因进行生物信息学分析,包括细胞成分、生物过程、分子功能和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析.结果 FAC组干预8周后,血清铁蛋白[(218.2 ±29.5) μg/L]相较于对照组[(30.6±9.9)μg/L]明显升高(P =0.000).股骨三维重建示铁蓄积小鼠骨质结构破坏,骨量、骨小梁厚度(Tb.Th)及骨体积分数(BV/TV)显著下降(P=0.001、0.005、0.021),而骨小梁间隙(Tb.Sp)升高(P=0.000).miRNA芯片结果:初步筛选出20个miRNA表达上调:mmu-miR-29b-3p、mmu-miR-324-3p、mmu-miR-133a-5p、mmu-miR-214-5p、mmu-miR-22-3p、mmu-miR-34a-5p、mmu-miR-31-5p、mmu-miR-143-5p、mmu-miR-423-3p、mmu-miR-223、mmu-miR-155、mmu-miR-106a、mmu-miR-2861、mmu-miR-148a、mmu-miR-96、mmu-miR-449a-5p、mmu-miR-423-Sp、mmu-miR-204-5p、mmu-miR-211、mmu-miR-23b及7个miRNA表达下调:mmu-miR-1 8a-3p、mmu-miR-223-3p、mmu-miR-199a-5p、mmu-miR-196a-5p、mmu-miR-30c-5p、mmu-miR-15b、mmu-miR-130b.其中mmu-miR-423-5p表达差异最为显著,q-PCR验证结果显示miR-423-5p的表达趋势与测序结果一致.Targetscan和miRDB预测并筛选miR-423-5p下游靶基因共91个.生物信息学分析表明miR-423-5p的靶基因在磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)、Rap1、Ras及丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路上出现聚集.结论 铁蓄积导致的骨量下降可能与miR-423-5p差异性表达相关.
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编辑人员丨2023/8/6
