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转运小RNA在胰腺疾病中的研究进展
编辑人员丨1天前
由转运RNA衍生的转运小RNA(tsRNA)是近年来新发现的一类非编码小RNA,它们通过多种不同的机制在生物体中发挥着重要的作用,其在胰腺疾病中的作用也得到了进一步的认识。本文就tsRNA在急性胰腺炎、慢性胰腺炎和胰腺癌中的作用及其机制进行综述。
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编辑人员丨1天前
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tRNA来源的小RNA在心血管疾病中的研究进展
编辑人员丨1天前
转运RNA来源的小RNA(tsRNA)是一类由转运RNA特异性断裂产生的新型非编码RNA,具有多种调控机制,参与多种疾病的发生、发展过程。近年来,多项研究证实tsRNA在心血管疾病中发挥重要作用。该文主要对tsRNA生物学发生、调控机制及其在心血管疾病中的研究进展进行综述,以期为心血管疾病诊治提供新的研究方向。
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编辑人员丨1天前
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tsRNA在急性心肌梗死早期诊断中的价值
编辑人员丨2024/8/10
目的 探讨转运RNA衍生的小RNA(transfer RNA-derived small RNA,tsRNA)在急性心肌梗死(AMI)早期诊断中的价值及其作为AMI诊断标志物的潜能.方法 将年龄及体质量匹配的雄性C57小鼠(8~10周龄)随机分为MI组及对照组(Sham组),每组4只.两组均于建模24 h后提取左室心肌组织RNA,经去修饰预处理,连接人工化接头后扩增,筛选包含15~40个核苷酸的小RNA扩增产物,构建文库并测序,将测序结果与GtRNAdb数据库成熟的tRNA和tRNA前体序列比对,获得在AMI前后心肌中差异表达的tsRNA谱.采用生物信息学分析同一密码子对应的tRNA在AMI前后剪切方式的改变.依据AMI前后tsRNA表达谱差异,获得在AMI后特异性高丰度表达的tsRNA,并在AMI小鼠心肌和血浆中验证,探讨tsRNA作为AMI诊断标志物的潜能.结果 tsRNA表达谱在组内有较好的重复性,组间差异较大.发生 AMI 后,Asn-GTT、Glu-TTC、Gly-ACC、Gly-GCC、His-GTG、Ile-AAT、Ile-GAT、Pro-TGG、Ser-AGA 和 Trp-CCA 在心肌中剪切方式发生改变,生成有明显差异的tsRNA表达谱.与Sham组相比,MI组有268个tsRNA表达上调,1 228个tsRNA 表达下调,且有64个特异性tsRNA.AMI建模第1天,小鼠 tRF-Gly-CCC-2-31、tiRNA-Val-CAC-1-32、tiRNA-Val-AAC-2-32、tiRNA-Glu-TTC-2-32 和 tiRNA-Lys-TTT-1-34 在心肌中特异性表达,其中 tiRNA-Val-AAC-2-32 和 tiRNA-Lys-TTT-1-34在AMI小鼠血浆中特异性高丰度表达,并随AMI持续时间动态变化.结论tsRNA表达谱在AMI前后差异显著,其中在小鼠心肌和血浆中特异性表达的tiRNA-Val-AAC-2-32和tiRNA-Lys-TTT-1-34有AMI诊断潜能,可能在AMI修复过程中发挥重要作用.
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编辑人员丨2024/8/10
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Transfer RNA-derived fragment tRF-23-Q99P9P9NDD promotes progression of gastric cancer by targeting ACADSB
编辑人员丨2024/7/13
Gastric cancer(GC)is one of the most common gastrointestinal tumors.As a newly discovered type of non-coding RNAs,transfer RNA(tRNA)-derived small RNAs(tsRNAs)play a dual biological role in cancer.Our previous studies have demonstrated the potential of tRF-23-Q99P9P9NDD as a diagnostic and prognostic biomarker for GC.In this work,we confirmed for the first time that tRF-23-Q99P9P9NDD can promote the proliferation,migration,and invasion of GC cells in vitro.The dual luciferase reporter gene assay confirmed that tRF-23-Q99P9P9NDD could bind to the 3'untranslated region(UTR)site of acyl-coenzyme A dehydrogenase short/branched chain(ACADSB).In addition,ACADSB could rescue the effect of tRF-23-Q99P9P9NDD on GC cells.Next,we used Gene Ontology(GO),the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG),and Gene Set Enrichment Analysis(GSEA)to find that downregulated ACADSB in GC may promote lipid accumulation by inhibiting fatty acid catabolism and ferroptosis.Finally,we verified the correlation between ACADSB and 12 ferroptosis genes at the transcriptional level,as well as the changes in reactive oxygen species(ROS)levels by flow cytometry.In summary,this study proposes that tRF-23-Q99P9P9NDD may affect GC lipid metabolism and ferroptosis by targeting ACADSB,thereby promoting GC progression.It provides a theoretical basis for the diagnostic and prognostic monitoring value of GC and opens up new possibilities for treatment.
Transfer RNA(tRNA)-derived small RNA(tsRNA) Gastric cancer(GC) Acyl-coenzyme A dehydrogenase short/branched chain(ACADSB) Molecular mechanism...不再出现此类内容
编辑人员丨2024/7/13
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基于潘多拉测序探索劳力性热射病小鼠脑组织非编码小RNA的变化
编辑人员丨2024/7/6
目的 基于潘多拉测序探索劳力性热射病(EHS)小鼠脑组织非编码小RNAs(sncRNAs)的变化.方法 将12只雄性健康C57BL/6J小鼠随机分为对照组(n=6)和模型组(n=6).对照组小鼠不作处理,模型组小鼠采用恒温恒湿箱内跑步建立EHS模型.EHS模型建立后基于脑湿干重检测和HE染色明确EHS小鼠脑损伤.采用潘多拉测序进行组间差异sncRNAs筛选.结果 EHS小鼠脑组织通过PANDORA-Seq共检测2 722个sncRNA;与正常对照组比较,以fold change>2、P<0.05为筛选条件,EHS小鼠脑组织共鉴定到53个显著差异sncRNA,如 mmu-miR-1843b-5p、mmu-miR-490-3p、mmu-miR-1843a-5p、piR-mmu-7796454和tsRNA-1020-MetCAT等;基于小RNA注释软件SPORTS1.1发掘和注释sncRNAs,提供了长度分布图和种类分布雷达图.sncRNAs种类的差异分析和序列的差异分析结果采用热图和火山图展示.结论 sncRNAs失调可能参与EHS小鼠脑损伤的发病机制.
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编辑人员丨2024/7/6
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tRNA来源的小RNA在心血管疾病中的研究进展
编辑人员丨2024/5/25
转运RNA来源的小RNA(tsRNA)是一类由转运RNA特异性断裂产生的新型非编码RNA,具有多种调控机制,参与多种疾病的发生、发展过程.近年来,多项研究证实tsRNA在心血管疾病中发挥重要作用.该文主要对tsRNA生物学发生、调控机制及其在心血管疾病中的研究进展进行综述,以期为心血管疾病诊治提供新的研究方向.
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编辑人员丨2024/5/25
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基于TCGA数据筛选乳腺癌预后相关的tsRNA标志物
编辑人员丨2024/5/18
目的 筛选乳腺癌中差异表达的转运RNA衍生小RNA(tsRNA),构建与乳腺癌患者预后相关的预测模型.方法 收集癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的乳腺癌患者的tsRNA表达谱以及临床相关数据,利用最小绝对值收敛和选择算子算法(LASSO)筛选出关键tsRNA,构建风险评分模型和列线图预测模型.结果 从乳腺癌差异表达的 106 条tsRNA中识别了 11条非零系数的tsRNA,据此构建了评估乳腺癌预后的风险评分模型和列线图预测模型,经测试集和校准曲线证实两模型均具有良好的预测能力.进一步预测上述11 条tsRNA的靶基因,发现其富集了8 条KEGG通路,包括多条与肿瘤的进展相关的通路;经相关性分析发现,NR2C2 和ZNFX1 与tRF-21-YBOZZ7ND的表达水平呈负相关.结论 成功构建了风险评分模型和列线图预测模型,有望为乳腺癌的预后评估提供新的方法.
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编辑人员丨2024/5/18
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tRNA衍生的小RNA在肿瘤中的研究进展
编辑人员丨2023/10/28
tRNA衍生的小RNA(transfer RNA-derived small RNA,tsRNA)是一种在人体组织中稳定表达的新型非编码RNA.目前已知两种tsRNA亚型:tRNA半分子和tRNA衍生片段.高通量测序技术的发展和应用为肿瘤中tsRNA的失调提供了越来越多的证据.tsRNA在肿瘤组织中的异常表达已经被发现与肿瘤的增殖、侵袭和进展有关.这些新发现的tsRNA有很大的潜力作为新的生物标志物和肿瘤治疗的靶点.综述就tsRNA在肿瘤中的最新研究进展进行论述并讨论其潜在临床价值.
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编辑人员丨2023/10/28
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附睾小体功能蛋白及sRNA研究进展
编辑人员丨2023/8/6
精液质量是反映男性生殖健康最基本和最重要的指标.哺乳动物的精子需在附睾中经历一系列复杂的结构与功能的变化才能成熟并具有潜在受精能力.精子成熟是由大量转录因子、激素等信号分子协同调控的复杂生理过程.近年来越来越多的证据表明附睾小体(epididymosomes)中的功能蛋白和sRNAs(small RNAs)可参与调节精子成熟及受精等过程.本文主要综述了附睾小体中功能蛋白及两类主要的sRNAs(tRNAs和miRNAs)的生物学作用,以期为男性不育等疾病的治疗提供一定的理论指导和新的治疗思路.
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编辑人员丨2023/8/6
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父代饮食、运动及应激通过精子中小非编码RNA对子代表型的影响
编辑人员丨2023/8/6
跨代遗传是指环境因素通过对亲代生殖细胞(精子、卵子)的改变,将遗传信息传递给子代,调节子代特定器官和组织中的基因表达,从而影响子代的生长发育和某些疾病的发生、发展.DNA甲基化和组蛋白修饰参与其中,微小RNA (miRNA)、小片段干扰RNA(siRNA)、Piwi蛋白相作用的RNA(piRNA)、tRNA来源片段(tRFs)在内的小非编码RNA(sncRNA)在跨代遗传中扮演了重要角色.不同的饮食摄入方式,包括高脂饮食和饥饿饮食等,分别通过改变精子中miRNA、tsRNA(tRFs中的一种)或siRNA的含量对后代肥胖及糖代谢产生影响;针对父代小鼠的运动干预则可导致精子中miRNA的改变,从而影响后代肥胖及糖代谢表型.此外,在持续慢性应激作用下,父代小鼠精子中miRNA及piRNA的表达发生改变,进而影响子代小鼠的行为、代谢和应激反应.本文对这4类sncRNA及其受父代环境影响经精子跨代遗传的研究进展作了逐一概述.
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编辑人员丨2023/8/6
