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基于网络药理学和分子对接探索参芪五味子抗焦虑的作用机制
编辑人员丨4天前
目的:采用网络药理学和分子对接技术探索参芪五味子抗焦虑(AD)的作用机制。方法:通过TCMSP数据库筛选参芪五味子主要的活性成分,通过TCMSP数据库和SymMap数据库获取其活性成分对应的靶点,利用Cytoscape将药物-有效成分-靶点关系网络进行可视化展示。利用TTD、OMIM、NCBI、Drugbank、GeneCards数据库直接获取焦虑的潜在靶点。基于String数据库构建潜在靶点的相互作用图,利用Cytoscape工具得到关键的靶蛋白。基因本体(GO)富集分析和东京基因组百科全书(KEGG)信号通路分析获取参芪五味子抗焦虑的关键靶点及信号通路。利用AutodockTools软件对关键有效成分和关键靶点蛋白进行分子对接并计算得出其结合能,通过PyMol软件将分子对接结果进行可视化处理。结果:参芪五味子中63个有效成分可通过69个靶点作用于焦虑症。其中以槲皮素、木犀草素、豆甾醇为主要的药物活性成分,丝氨酸苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)蛋白和白介素-6(IL-6)蛋白为关键靶蛋白。分子对接技术验证了这些关键活性成分和关键靶蛋白之间具有良好的结合能力。参芪五味子主要通过调节Toll样受体信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、癌症通路等发挥治疗焦虑症的作用。结论:参芪五味子可能是通过调节AKT1、IL-6等相关靶点,调控炎性反应、细胞凋亡等过程,发挥抗焦虑的作用。
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编辑人员丨4天前
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中药利胆合剂调节氧化应激拮抗婴儿胆汁淤积性肝纤维化的临床观察
编辑人员丨4天前
目的:探讨利胆合剂治疗胆汁淤积性肝纤维化患儿的临床效果。方法:采用前瞻性随机对照研究方法,入选华中科技大学同济医学院附属武汉儿童医院中西医结合科和消化内科2021年1月至12月收治的符合婴儿胆汁淤积性肝纤维化诊断标准的患儿,按照随机数字表法分为常规治疗组和利胆合剂组。常规治疗组按照指南给予常规治疗;利胆合剂组在常规治疗组基础上给予自拟中药复方利胆合剂(组方:茵陈、连翘、熟大黄、制首乌、赤芍、桂枝、枳壳、白术、五味子、鳖甲、甘草)口服、灌肠或鼻饲治疗,每日60 mL,分2~3次给予,共治疗28 d,门诊随访4周。记录两组患者治疗前后血清肝纤维化4项〔Ⅳ型胶原(Ⅳ-C)、透明质酸酶(HA)、Ⅲ型前胶原(PCⅢ)、层黏连蛋白(LN)〕、肝功能及胆汁淤积相关标志物〔总胆红素(TBil)、直接胆红素(DBil)、总胆汁酸(TBA)、碱性磷酸酶(ALP)、γ-谷氨酰转肽酶(γ-GGT)、丙氨酸转氨酶(ALT)、天冬氨酸转氨酶(AST)〕、氧化应激指标〔超氧化物歧化酶(SOD)、丙二醛(MDA)、谷胱甘肽(GSH)〕、瞬时弹性成像(TE)检测肝脏硬度值(LSM)、天冬氨酸转氨酶/血小板比值指数(APRI)以及肝脾回缩时间。结果:观察期间共收治40例胆汁淤积性肝纤维化患儿,其中常规治疗组21例,利胆合剂组19例。两组治疗前血清肝纤维化4项、血清肝功能及胆汁淤积相关标志物、氧化应激指标、LSM及APRI比较差异均无统计学意义。两组治疗后肝纤维化4项、肝功能及胆汁淤积相关标志物、LSM、APRI均较治疗前显著下降,且利胆合剂组上述指标明显低于常规治疗组〔HA(ng/L):165.81±21.57比203.87±25.88,PCⅢ(μg/L):69.86±9.32比81.82±7.39,Ⅳ-C(μg/L):204.14±38.97比239.08±24.93,LN(μg/L):162.40±17.39比190.86±15.97,TBil(μmol/L):37.58±27.63比53.06±45.09,DBil(μmol/L):20.55±19.34比30.08±27.39,ALP(U/L):436.50±217.58比469.60±291.69,γ-GGT(U/L):66.78±35.84比87.00±32.82,ALT(U/L):64.75±50.53比75.20±50.19,AST(U/L):77.25±54.23比96.80±59.77,TBA(μmol/L):74.35±44.44比85.45±39.50,LSM(kPa):5.24±0.39比7.53±3.16,APRI:0.52±0.39比0.98±0.29,均 P<0.05〕。两组治疗后MDA均较治疗前显著下降,SOD和GSH均较治疗前显著升高;其中利胆合剂组SOD明显高于常规治疗组(kU/L:64.56±6.69比51.58±5.98, P<0.05)。此外,利胆合剂组肝脏回缩时间(d:20.13±10.97比24.33±13.46)和脾脏回缩时间(d:25.93±13.01比29.14±14.52)均较常规治疗组明显缩短(均 P<0.05)。 结论:采用利胆合剂中药治疗胆汁淤积性肝纤维化能有效改善患儿的胆汁淤积、肝纤维化、氧化应激指标及临床症状。
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编辑人员丨4天前
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心脉舒一号口服液治疗心脏病分子机制网络药理学研究
编辑人员丨1周前
目的 探讨心脉舒一号口服液治疗心脏病的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取生地黄、天冬、麦冬、酸枣仁、柏子仁、丹参、当归、太子参、茯苓、白芍、五味子11味中药材的活性成分,并进行蛋白质靶点预测;通过GeneCards数据库获取心脏病的相关疾病靶点,通过Venny 2.1.0平台筛选出心脉舒一号口服液活性成分与心脏病的共有靶点;通过Cytoscape 3.9.1软件构建药物-活性成分-靶点网络图及活性成分-疾病靶点网络图,并分析其核心成分;通过String 11.0数据库构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,经Cytoscape 3.9.1软件筛选出关键靶点及核心靶点;通过Metascape数据库进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析及基因生物过程(GO)功能分析;对核心成分与核心靶点进行分子对接验证.结果 共收集到活性成分169种,关键靶点37个,疾病靶点1 097个,活性成分-疾病共有靶点197个.核心成分为槲皮素、木犀草素、熊果酸,核心靶点为环氧合酶2(PTGS2)、钠电压门控通道α亚基5(SCN5A)、溶质载体家族6成员2(SLC6A2).共获得KEGG信号通路17条,主要涉及蛋白解旋酶癌、人类巨细胞病毒感染、晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物多配体受体(AGE-RAGE)信号通路等;GO功能分析条目1 205条,包括生物学过程(BP)944条、分子功能(MF)146条和细胞组分(CC)115条,主要涉及正调控血管内皮细胞迁移、老化、炎性反应、转录阳性调控-DNA模板化、基因表达的负调控、正调控细胞增殖等.分子对接结果显示,核心成分与其核心靶点均有较好的结合活性.结论 心脉舒一号口服液可通过多成分、多靶点、多通路治疗心脏病.
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编辑人员丨1周前
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"肺与大肠相表里"视角下探索肠道菌群与肺癌因果关联及潜在干预中药预测
编辑人员丨2024/8/17
目的 在"肺与大肠相表里"理论指导下采用孟德尔随机化(Mendelianrandomization,MR)明确与肺癌发生具遗传因果效应的肠道菌群,并预测能通过调控肠道菌群干预肺癌的潜在中药.方法 从IEU OpenGWAS数据库获取肠道菌群与肺癌的全基因组关联研究汇总数据.使用R语言TwoSampleMR软件包进行MR分析,以逆方差加权法为主要的遗传因果效应评估方法.对工具变量邻近基因进行功能富集分析以探析相关微生物介导肺癌发生的信号通路.结合CTD和Coremine数据库预测对工具变量邻近基因具有潜在调控作用的中药,统计其性味归经及功效信息.结果 MR分析发现了 10个与肺癌发生具遗传因果效应的肠道菌群,其中变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、毛螺菌科(Lachnospiraceae)、Marvinbryantia、瘤胃球菌科(Ruminococcaceae UCG004)和粪居拟杆菌Bacteroides coprocola菌群与肺癌发生风险降低相关,草酸杆菌科(Oxalobacteraceae)、普氏菌属 7(Prevotella 7)、黑臭杆菌属(Odoribacter)和大肠杆菌 Escherichia coli 菌群与肺癌发生风险升高相关.工具变量邻近基因主要富集在Janus激酶(Janus kinase,JAK)/信号转导和转录激活因子(signal transducer and activator of transcription,STAT)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator activated receptor,PPAR)和磷脂酰肌醇-3-羟激酶(phosphatidylinositol-3-hydroxykinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)等信号通路.潜在调控中药四气以温为主,寒、平次之,五味以苦味为主,甘、辛次之,归经以肝为主,肺、脾、胃和肾次之,功效以清热为主,补虚次之,还包含活血、理气、祛风湿、化痰止咳平喘和利水渗湿等.其中映射频率靠前的代表中药包括人参、马齿苋、生姜、姜黄、郁金、白果、五味子和丹参等.结论 基于"肺与大肠相表里"中医经典理论,采用MR分析发现以厚壁菌门、Marvinbryantia和变形菌门为代表的10种肠道菌群可能通过JAK/STAT、MAPK、PPAR和PI3K/Akt等信号通路介导肺癌发生发展.潜在调控中药主要包括清热药、补虚药、活血药和理气药等.丰富了"肺与大肠相表里"的生物学内涵,将为从"肠道菌群"视角探索肺癌的中医药防治策略提供参考.
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编辑人员丨2024/8/17
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基于数据挖掘探讨中药复方治疗气阴两虚型2型糖尿病的用药规律
编辑人员丨2024/8/17
目的 挖掘中药复方治疗气阴两虚型 2 型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的用药规律.方法 从中国知网、维普中文平台、中国生物医学文献系统、万方知识平台和PubMed数据库检索相关的临床研究,建立数据库,通过SPSS Statistics和SPSS Modeler软件对复方进行药物剂型、频数、药性、药味、归经、剂量、关联规则和系统聚类等分析,深入挖掘处方用药规律.结果 共有241 首复方,175 味中药纳入数据库中.黄芪、生地黄和山药是气阴两虚型T2DM治疗复方使用频率最高的单药.黄芪、山药和丹参在所有复方中的整体应用剂量偏大,而五味子、黄连和甘草的应用剂量偏小.丹参是夹瘀兼证中最常应用的活血化瘀药,黄连和知母是夹热兼证最常应用的清热药,黄连和苍术是夹痰/夹湿兼证应用最高频的除湿药.复方中药的药性以寒性和平性为主,药味以甘味和苦味为主,药物归经以肺经、脾经和肾经居多.气阴两虚型T2DM治疗复方中潜在支持度最高的对药及角药分别是"黄芪-生地黄"和"黄芪-生地黄-山药".高频药物聚类分析显示存在 5 个潜在的核心处方.结论 数据挖掘较为全面地揭示了气阴两虚型T2DM治疗复方的用药规律,为气阴两虚型T2DM的临床和科研工作提供了思路借鉴.
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编辑人员丨2024/8/17
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Box-Behnken响应面法优化"五味子-吴茱萸"药对的提取工艺及含量测定
编辑人员丨2024/8/10
目的:优化"五味子-吴茱萸"药对提取工艺并测定其不同配伍的化学成分含量.方法:利用Box-Behnken设计在单因素考察的基础上考察"五味子-吴茱萸"药对的提取工艺,确定最佳提取工艺,并通过高效液相色谱法测定"五味子-吴茱萸"的化学含量,确定药对的最佳比例.结果:"五味子-吴茱萸"药对最优提取工艺为乙醇体积分数70%,料液比1∶15(g/mL),提取时间60 min,提取次数3次.该提取工艺科学可靠.结论:本研究方法简单可行,可为"五味子-吴茱萸"药对的开发利用及相关研究提供参考.
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编辑人员丨2024/8/10
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基于网络药理学和分子对接探讨参芪五味子胶囊治疗焦虑症的机制
编辑人员丨2024/7/20
[目的]通过网络药理学和分子对接技术探讨参芪五味子胶囊治疗焦虑症的作用机制.[方法]利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)预测和筛选参芪五味子胶囊的主要生物活性成分及其靶点,与GeneCards、OMIM、DisGeNET、TTD数据库检索筛选出的焦虑症疾病靶点交集整合;借助String平台绘制蛋白质相互作用(PPI)网络,并开展基因本体(GO)注释功能与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;依托Cytoscape软件绘制"药物-成分-靶点"以及"成分-靶点-通路"的网络关系图;采用Autodock分子对接技术将关键靶点与参芪五味子胶囊中关键活性成分进行验证.[结果]获得成分靶点 238 个,疾病靶点 919 个,交集靶点 62 个,通过CytoNCA插件筛选出 19 个核心靶点;GO分析表明,主要涉及信号转导、基因表达正调控、同种蛋白结合、细胞外配体门控离子通道活性、苯二氮卓类受体活性等;KEGG分析表明,主要富集通路涵盖AGE-RAGE信号通路、神经活性配体-受体相互作用通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化通路等;分子对接显示,36 组关键靶点与活性成分组合结合能均小于-20.92 kJ/mol,证明结合良好.[结论]参芪五味子胶囊可通过多成分-多靶点-多通路发挥治疗焦虑症的作用,为后续探究参芪五味子胶囊治疗焦虑症提供研究思路.
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编辑人员丨2024/7/20
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从象思维论生脉散防治糖尿病心肌病
编辑人员丨2024/7/6
"象思维"作为中国传统文化元素中隐喻的一部分与中医学发展的进程相伴相随,具有哲学和科学的双重内涵.中医借助"象思维"对诸病临床特征进行"观物取象""取象比类",从而辨证治病"立象尽意".该文通过梳理象思维与中医学的关系引出象思维视角下对糖尿病心肌病发病机制的认识,分别从肺、肝、脾3个方面阐述中医病机及相关意象.生脉散其功用主治与糖尿病心肌病的中医证候相契合,相关中医药研究已日臻完善,因此尝试借用象思维这一工具模型探讨人参、麦冬、五味子各自的药类法象.临床与实验研究的大量文献报道也为生脉散治疗糖尿病心肌病的可行性提供了丰富而又充分的证据.通过回溯传统象思维方式以期更好地梳理认识糖尿病心肌病,从而为其防治提供新的切入点.
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编辑人员丨2024/7/6
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基于网络药理学和实验验证探讨感咳颗粒干预急性肺损伤的作用机制
编辑人员丨2024/6/22
依据感咳颗粒在大鼠体内的入血成分研究基础,结合网络药理学、分子对接和动物实验验证探究感咳颗粒干预急性肺损伤(acute lung injury,ALI)的潜在作用机制.将感咳颗粒的大鼠入血成分导入SwissTargetPrediction平台预测药物靶点,从疾病数据库收集ALI相关靶点,取交集并构建蛋白-蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络筛选核心靶点,随后进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Gnomes,KEGG)通路富集分析.构建"入血成分-靶点-通路-疾病"网络,根据其拓扑参数筛选感咳颗粒干预疾病的核心成分.借助分子对接预测核心成分与关键靶点的结合能力.通过脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)诱导的ALI小鼠模型验证感咳颗粒干预急性肺损伤的关键靶点.PPI拓扑参数分析得到与ALI有关的STAT3、SRC、HSP90AA1、MAPK3、HRAS、MAPK1前6个关键靶点.GO功能分析可知主要与ERK1和ERK2级联、炎症反应、对脂多糖反应等有关;KEGG分析结果显示,主要富集通路显示为MAPK、中性粒细胞胞外诱捕网(neutrophil extracellular trap,NET)形成等.根据"入血成分-靶点-通路-疾病"网络拓扑参数分析筛选出前6个核心成分(五味子酯乙、五味子醇甲、五味子醇乙、哈巴俄苷、异鸢尾黄素、颈花胺).分子对接结果显示6个核心成分和该颗粒含量最高的射干苷与MAPK3、SRC、MAPK1、STAT3关键靶点具有较高的亲和力.体内实验结果表明,与模型组相比,感咳颗粒能有效缓解LPS诱导的小鼠肺组织病理损伤,抑制炎性浸润,降低支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)中总蛋白含量、一氧化氮(nitric oxide,NO)与髓过氧化物酶(myeloperoxidase,MPO)水平,以及肿瘤坏死因子-a(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、干扰素 γ(interferon-γ,IFN-γ)、白细胞介素(interleukin,IL)-1β、IL-6、血管内皮细胞生长因子(vascular endo-thelial growth factor,VEGF)以及趋化因子(C-X-C 基序)配体 1[chemokine(C-X-C motif)ligand 1,CXCL1]含量,显著下调肺组织中淋巴细胞抗原 6G(lymphocyte antigen 6G,Ly6G)、瓜氨酸化组蛋白 3(citrullinated histones 3,Cit-H3)表达水平及 SRC、ERK1/2、STAT3磷酸化蛋白表达水平.综上,感咳颗粒可有效抑制LPS诱导的急性肺损伤炎症反应,保护肺组织,调节炎性因子释放,抑制中性粒细胞浸润及NET形成,作用机制可能与抑制SRC/ERK1/2/STAT3信号通路激活有关.
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编辑人员丨2024/6/22
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基于网络药理学探析五味子防治稽留流产的机制及验证
编辑人员丨2024/5/18
目的:基于网络药理学方法分析五味子防治稽留流产的潜在作用机制,并通过实验进行验证.方法:运用系统药理学方法查找并从中药系统药理学数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP,https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)筛选五味子的活性成分及靶点,查找稽留流产相关基因,确定五味子防治稽留流产的靶点.利用Cytoscape构建"药物成分-靶点"网络,筛选关键化合物.利用String建立蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并通过Cytoscape-CytoNCA拓扑分析筛选核心靶点.通过对靶基因进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析,以预测其可能的信号通路及机制.最后借助人绒毛膜外滋养层细胞系(HTR-8/SVneo)利用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测和蛋白质印迹(Western blotting)检测进行机制验证.结果:从TCMSP数据库中鉴定了 7种五味子活性成分.PPI网络表明雄激素受体(androgen receptor,AR)、雌激素受体(estrogen receptor,ER)、环氧合酶-2(cyclooxygenase-2,COX-2)、核受体辅激活因子 2(nuclear receptor coactivator 2,NCOA2)和乙酰胆碱酯酶(acetylcholine esterase,ACHE)可能是五味子防治稽留流产的核心作用靶点.GO富集分析获得44个细胞生物学过程,KEGG途径富集分析获得2个相关信号通路,主要包括甲状腺激素信号通路和雌激素信号通路;在利用细胞模型验证机制过程中发现,二羟环氧苯并芘[benzo(a)pyren-7,8-dihydrodiol-9,10-epoxide,BPDE]染毒后的细胞中AR、ER和COX-2的蛋白质和(或)mRNA水平高于正常细胞,而先使用五味子乙素(Schisandrin B,Sch B)预处理后再染毒BPDE的细胞中AR、ER和COX-2的蛋白质和(或)mRNA水平均较未用Sch B预处理的细胞降低,而NCOA2和ACHE的蛋白质和(或)mRNA水平变化不明显.结论:五味子可通过抗炎和调节AR、ER发挥防治稽留流产的作用,这一保护作用可能是通过雌激素信号通路来实现的.
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编辑人员丨2024/5/18
