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基于网络药理学及分子对接探讨天麻钩藤饮治疗抽动障碍作用机制
编辑人员丨4天前
目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨天麻钩藤饮治疗抽动障碍(TD)的作用机制.方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM数据库筛选天麻钩藤饮的有效成分和作用靶点,利用GeneCards、CTD、DisGeNET、OMIM、PharmGKB和TTD数据库筛选TD的相关靶点,并通过VENNY2.1.0软件获取天麻钩藤饮治疗TD的交集靶点;使用STRING数据库构建靶点蛋白质互作网络,使用Cytoscape3.7.2软件构建中药-活性成分-靶点网络;运用R软件将关键靶点进行基因本体论(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;采用分子对接技术对主要活性成分和关键靶点的结合能力进行验证.结果:共获得天麻钩藤饮活性成分205个,对应靶点756个,TD相关靶点4 072个.天麻钩藤饮治疗TD关键靶点有V-JUN肉瘤病毒癌基因同源物(JUN)、蛋白激酶B(AKT1)、信号传导转录激活因子(STAT3)、肿瘤蛋白p53(TP53)、V-rel网状内皮细胞病毒癌基因同源物(RELA)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白水解酶3(CASP3)等.GO富集分析得到3 035条生物过程(BP)、166个细胞组成(CC)及307种分子功能(MF).KEGG通路富集分析显示,天麻钩藤饮治疗TD涉及环磷酸腺苷(cAMP)、钙离子信号通路(Calcium)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、白细胞介素-17(IL-17)和肿瘤坏死因子(TNF)等信号通路.分子对接发现主要活性成分(槲皮素、亚麻酸、α-亚麻酸、蔗糖、育亨宾)与关键靶点(JUN、AKT1、STAT3、TP53、RELA、CASP3)具有较好对接活性.结论:天麻钩藤饮治疗TD的作用机制与复方中槲皮素、亚麻酸、α-亚麻酸等成分作用于JUN、AKT1、STAT3、TP53、RELA等靶点调控cAMP、Calcium、MAPK、IL-17和TNF等信号通路有关.
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编辑人员丨4天前
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特异性促炎症消退介质在重症感染免疫调节中的研究进展
编辑人员丨4天前
特异性促炎症消退介质(specialized proresolving mediators,SPMs)是一类由必需脂肪酸衍生而来的脂质介质,具有抗炎/促消退作用。SPMs主要包括脂氧素(lipoxin)、消退素(resolvin)、保护素(protectin)和胞壁质(maresin)。不同种类的SPMs可结合不同受体,如甲酰肽受体2(ALX/FPR2)、G蛋白耦联受体32(DRV1/GPR32)、G蛋白耦联受体18(DRV2/GPR18)或趋化因子样受体1(ERV1/CMKLR1),经核因子-κB、信号传导和转录激活因子、丝裂原活化蛋白激酶信号通路,通过限制中性粒细胞迁移浸润,调节炎性细胞因子表达,增强巨噬细胞吞噬作用发挥促炎症消退作用。SPMs分子在危重疾病严重程度、预后预测和临床干预效能方面具有潜在临床价值。本文就SPMs在重症感染免疫炎症反应中的作用及潜在临床价值作一综述。
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编辑人员丨4天前
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基于单细胞转录组学分析百草枯诱导帕金森病样小鼠大脑小胶质细胞差异基因及其功能
编辑人员丨4天前
目的:基于单细胞转录组测序分析百草枯(PQ)诱导的帕金森病(PD)样小鼠大脑小胶质细胞亚群差异基因和相关信号通路,为阐明PQ致动物大脑PD样改变的机制研究提供线索。方法:于2021年9月,将6周龄C57BL/6雄性小鼠6只随机分为对照组和实验组(每组3只),分别以生理盐水、10.0 mg/kg PQ进行腹腔注射,每3天1次,连续10次注射造模。染毒结束后取小鼠大脑,进行10× Genomics单细胞转录组测序。根据基因表达特征筛选小胶质细胞亚群,进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。进一步筛选实验组和对照组间小胶质细胞亚群的差异基因,利用生物信息学工具进行功能显著性富集分析。采用0、60、90 μmol/L的PQ溶液处理小鼠小胶质细胞(BV2细胞),通过实时荧光定量PCR实验验证差异基因己糖激酶2(Hk2)、ATPase H+转运V0亚基b(Atp6v0b)、神经调节蛋白1(Nrg1)的表达情况。结果:根据特征基因肌醇多磷酸-5-磷酸酶d(Inpp5d)和转化生长因子β受体1(Tgfbr1)将Cluster 7和Cluster 20亚群识别为小胶质细胞亚群,且该亚群反映小胶质细胞活化M2表型。生物信息学分析结果显示,所识别小胶质细胞亚群特征基因均富集到内吞作用;在分子功能方面主要富集跨膜受体蛋白激酶活性和细胞因子结合等功能。Cluster 7亚群上调基因主要富集于溶酶体通路、内吞作用等通路;下调基因主要富集于神经退行性疾病等信号通路。Cluster 20亚群上调基因主要富集于与PD相关的信号通路;下调基因主要富集于环磷酸腺苷(cAMP)信号传导途径、神经系统发育、突触功能等信号通路。实时荧光定量PCR检测结果显示,与0 μmol/L比较,90 μmol/L PQ溶液处理后BV2细胞的Hk2 mRNA和Atp6v0b mRNA表达水平升高,Nrg1 mRNA表达水平降低,差异均有统计学意义( P<0.05)。 结论:小胶质细胞在PQ诱导的PD样小鼠模型中被激活,且向M2表型极化,其功能与溶酶体(内吞)、突触功能及PD相关信号通路的调节有关。
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编辑人员丨4天前
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冠状病毒所致心力衰竭的组学机制分析及药物预测
编辑人员丨4天前
目的:探讨冠状病毒感染所致心力衰竭(心衰)的机制,并预测对其可能有效的药物。方法:在基因表达数据库(GEO)检索冠状病毒和心衰,并筛选符合实验要求的组学数据。采用R语言Limma程序包进行差异表达基因分析,筛选差异表达基因。将两组差异基因导入R语言clusterProfiler包进行基因本体学(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,取两组结果的交集。采用STRING数据库对所有差异表达基因构建蛋白质互作网络并筛选核心基因。最后采用团队自主研发的表观精准治疗预测平台EpiMed预测冠状病毒所致心衰的治疗药物。结果:在GEO数据库检索并筛选得到GSE59185冠状病毒数据集,根据不同的亚型分为wt组、?E组、?3组、?5组、对照组5组样本,差异分析发现各亚组交集上调基因191?个,下调基因18?个。在GEO数据库检索并筛选得到GSE126062心衰数据集,共筛选差异表达基因495?个,其中上调165?个,下调330?个。冠状病毒与心衰差异表达基因富集分析,取交集处理共有GO条目20条,主要富集在病毒反应、病毒防御反应、Ⅰ型干扰素反应、γ干扰素调节、先天免疫反应调节、病毒生命周期负调控、病毒基因组复制调控等;共有5条KEGG通路,主要与肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、白细胞介素(IL)-17信号通路、细胞因子与受体相互作用、Toll样受体信号通路、人类巨细胞病毒感染有关。蛋白互作网络分析筛选出信号传导及转录激活蛋白3、IL-10、IL-17、TNF、干扰素调节因子9、2′, 5′-寡腺苷酸合成酶1、丝裂原活化蛋白激酶3、S-腺苷甲硫氨酸基区域蛋白2、CXC趋化因子配体10、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3共10?个核心基因。EpiMed平台预测可能对冠状病毒所致心衰有效的药物为TNF-α抑制剂、白藜醇、利托那韦、白芍、维甲酸、连翘、鱼腥草等。结论:多个炎症通路的异常活化可能是冠状病毒感染所致心衰的原因,白藜芦醇、利托那韦、维甲酸、白芍、连翘、鱼腥草可能对其具有治疗作用。
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编辑人员丨4天前
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KRAS突变肺腺癌的研究进展
编辑人员丨4天前
鼠类肉瘤病毒癌基因(KRAS)是肺癌的驱动基因,其突变常发生于经表皮生长因子受体-酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)治疗后耐药的肺腺癌中,因患者预后较差且尚未有针对性靶向药物而引起关注。近年研究发现KRAS突变可通过影响信号传导和转录激活因子3(STAT3)、G蛋白偶联受体(GPCR)、程序性死亡受体-配体1(PD-L1)的表达、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)信号通路的活化及多种基因的共突变促进肿瘤进展,影响治疗和预后。新型小分子KRAS G12C抑制剂AMG 510的Ⅰ期临床试验结果为治疗提供了希望。总结KRAS突变肺腺癌的发病机制、预后相关因素、靶向治疗及免疫治疗等,有助于提高对KRAS突变的认识,为后续研究提供思路与依据。
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编辑人员丨4天前
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放疗介导白细胞介素6/信号转导和转录激活因子3信号通路调节食管癌细胞中程序性死亡蛋白配体1的表达
编辑人员丨4天前
目的:探讨放疗调控食管癌细胞程序性死亡蛋白配体1(PD-L1)表达的可能机制。方法:以不同剂量X线照射食管癌细胞株Eca109、Kyse150和TE1,同时设6 Gy照射+AG490组。采用实时荧光定量聚合酶链反应检测细胞中PD-L1 mRNA的表达,采用Western blot检测细胞中PD-L1、信号转导和转录激活因子3(STAT3)和磷酸化细胞信号传导和转录活化因子3(p-STAT3)的蛋白表达,采用酶联免疫吸附试验检测细胞中白细胞介素6(IL-6)的蛋白表达。结果:食管癌细胞Eca109、Kyse150和TE1中,PD-L1 mRNA的表达量分别为2.86±0.30、960.01±21.27和106.78±6.67,均高于正常食管细胞株HET-1A(1.07±0.15,均 P<0.01);PD-L1蛋白的表达量分别为0.091±0.036、1.533±0.079和0.914±0.035,亦均高于正常食管细胞株HET-1A(0.063±0.01,均 P<0.01)。经6 Gy照射后,Eca109、Kyse150和TE1细胞中PD-L1蛋白的表达量峰值分别为0.135±0.007、1.66±0.06和1.32±0.06,均高于0 h组(分别为0.09±0.01、1.21±0.05和0.93±0.03,均 P<0.01);p-STAT3蛋白的表达量峰值分别为1.44±0.26、0.75±0.04和1.92±0.17,均高于0 h组(分别为0.18±0.05、0.48±0.02和0.36±0.06,均 P<0.01)。不同剂量照射后,Eca109、Kyse150和TE1细胞中IL-6蛋白表达均显著增加(均 P<0.01)。IL-6/STAT3信号通路被特异性抑制剂AG490阻断后,6 Gy放射+AG490组Eca109、Kyse150和TE1细胞中PD-L1蛋白的表达水平分别为0.11±0.03、1.07±0.08和0.96±0.11,与相应细胞株的0 Gy照射组(分别为0.09±0.01、0.96±0.05和0.85±0.09)比较,差异均无统计学意义(均 P>0.05);p-STAT3蛋白的表达水平分别为0.76±0.11、0.59±0.06和0.96±0.12,与相应细胞株的0 Gy照射组(分别为0.67±0.08、0.54±0.06和0.84±0.11)比较,差异亦均无统计学意义(均 P>0.05)。 结论:放疗可能通过IL-6/STAT3信号通路调控食管癌细胞的PD-L1表达。
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编辑人员丨4天前
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信号传导及转录活化因子3和Jagged1在骨肉瘤组织的表达及其临床意义
编辑人员丨4天前
目的:探讨信号传导及转录活化因子3(STAT3)和Jagged1在骨软骨瘤组织、骨肉瘤组织的表达及临床意义。方法:选取大庆油田总医院2016年3月至2021年5月30例骨软骨瘤组织和84例骨肉瘤组织标本,采用免疫组织化学法检测上述组织STAT3蛋白和Jagged1蛋白的表达状态,采用 χ2检验分析其与各临床病理因素之间的关系。 结果:STAT3蛋白表达率在骨肉瘤组织和骨软骨瘤组织分别为63.10%(53/84)、13.33%(4/30),两者差异有统计学意义( χ2=21.895, P<0.01);STAT3蛋白表达水平与骨肉瘤恩内金分期(Eneeking分期)、肺转移明显相关( χ2=5.001、5.085, P<0.05)。Jagged1蛋白表达率在骨肉瘤组织和骨软骨瘤组织分别为70.23%(59/84)、10.00(3/30),两者差异有统计学意义( χ2=32.334, P<0.01)。Jagged1蛋白表达水平与骨肉瘤Eneeking分期、肺转移、软组织浸润明显相关( χ2=5.403、4.571、0.161, P<0.05)。 结论:STAT3蛋白和Jagged1蛋白高表达是骨肉瘤侵袭、转移的生物学标志,检测STAT3和Jagged1有助于评估骨肉瘤患者病情进展。
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编辑人员丨4天前
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信号传导及转录活化因子3和X连锁凋亡抑制蛋白在肿瘤组织的表达及其临床意义
编辑人员丨4天前
目的:探讨信号传导及转录活化因子3(STAT3)和X连锁凋亡抑制蛋白(XIAP)在子宫内膜癌组织中的表达,以及两者与子宫内膜癌临床生物学行为的关系。方法:收集惠州市中心人民医院(中山大学附属惠州医院)和广东医科大学附属医院2015年1月至2020年3月25例正常子宫内膜组织、53例子宫内膜癌组织标本,采用免疫组织化学方法检测其中的STAT3和XIAP的表达水平,计数资料各组比较采用 χ2检验。 结果:子宫内膜癌组织中的STAT3阳性表达率为79.25%(42/53),明显高于正常子宫内膜组织阳性表达率[24.00%(6/25)],差异有统计学意义( χ2=21.905, P<0.01);STAT3表达水平与子宫内膜癌组织学分化程度、FIGO分期、淋巴结转移明显相关(分别为 χ2=4.115、5.962、4.862, P<0.05)。子宫内膜癌组织中的XIAP阳性表达率为73.58%(39/53),明显高于正常子宫内膜组织阳性表达率[16.00%(4/25)],差异有统计学意义( χ2=22.772, P<0.01),XIAP表达水平与子宫内膜癌肌层浸润深度、组织学分化程度、FIGO分期、淋巴结转移明显相关(分别为 χ2=6.564、4.369、6.632、6.086, P<0.05)。 结论:STAT3和XIAP在子宫内膜癌组织呈高表达,其对子宫内膜癌的诊断及预后评估有一定指导意义。
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编辑人员丨4天前
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亚低温对大鼠脑缺血再灌注时小胶质细胞极化及JAK2/STAT3信号通路的影响
编辑人员丨4天前
目的:探讨亚低温对大鼠脑缺血再灌注时小胶质细胞极化及酪氨酸激酶2/信号传导及转录活化因子3(JAK2/STAT3)信号通路的影响。方法:清洁级健康雄性SD大鼠45只,8周龄,体质量260~280 g,采用随机数字表法分为3组( n=15):假手术组(S组)、脑缺血再灌注组(I/R组)和亚低温组(H组)。I/R组和H组采用大脑中动脉闭塞法制备脑缺血再灌注损伤模型,阻断2 h后恢复灌注,期间维持直肠温度36~37 ℃;H组于再灌注即刻用75%酒精行体表降温3 h,维持直肠温度32~33 ℃。于再灌注24 h时行改良神经功能缺损评分(mNSS评分),随后麻醉下处死大鼠取脑,TTC染色观察脑梗死体积,采用Western blot法检测M1型标记物诱导型一氧化氮合酶(iNOS)、M2型标记物精氨酸酶1 (Arg-1)、磷酸化JAK2(p-JAK2)及磷酸化STAT3(p-STAT3)表达,采用q-PCR法检测iNOS mRNA和Arg-1 mRNA表达,采用ELISA法检测IL-6和IL-10含量。 结果:与S组相比,其余2组mNSS评分和脑梗死体积升高,大脑缺血半暗带iNOS和Arg-1及其mRNA表达上调,p-JAK2/JAK2比值、p-STAT3/STAT3比值、IL-6和IL-10含量升高( P<0.05);与I/R组相比,H组mNSS评分和脑梗死体积降低,大脑缺血半暗带iNOS及其mRNA表达下调,Arg-1及其mRNA表达上调,p-JAK2/JAK2比值、p-STAT3/STAT3比值和IL-6含量降低,IL-10含量升高( P<0.05)。 结论:亚低温可促进大鼠脑缺血再灌注时小胶质细胞由M1型极化向M2型极化偏移,抑制中枢炎症反应,其机制可能与抑制JAK2/STAT3信号通路有关。
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编辑人员丨4天前
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JAK2/STAT3信号通路在乌司他丁减轻星形胶质细胞氧糖剥夺损伤中的作用
编辑人员丨4天前
目的:评价蛋白酪氨酸激酶2/信号传导和转录活化因子3(JAK2/STAT3)信号通路在乌司他丁减轻星形胶质细胞氧糖剥夺损伤中的作用。方法:选择出生24 h内的SD大鼠,提取原代星形胶质细胞进行培养,采用随机数字表法将星形胶质细胞分为4组( n=14):对照组(C组)、氧糖剥夺组(OGD组)、乌司他丁组(U组)和AG490+乌司他丁组(A+U组)。采用糖氧剥夺10 h的方法建立氧糖剥夺损伤模型。U组于造模前24 h时加入乌司他丁终浓度1 000 U/ml;A+U组于造模前48 h时加入AG490终浓度20 μmol/L,于造模前24 h时加入乌司他丁终浓度1 000 U/ml。各组处理结束后,采用MTS法检测细胞活力,Western blot法检测磷酸化JAK2(p-JAK2)和磷酸化STAT3(p-STAT3)表达,免疫荧光法检测caspase-3表达。 结果:与C组比较,OGD组和A+U组细胞活力降低,p-JAK2和p-STAT3表达下调,caspase-3表达上调,U组细胞活力降低,p-JAK2、p-STAT3和caspase-3表达上调( P<0.05)。与OGD组比较,U组细胞活力升高,p-JAK2和p-STAT3表达上调,caspase-3表达下调( P<0.05),A+U组细胞活力降低,p-JAK2表达上调,p-STAT3表达下调,caspase-3表达下调( P<0.05)。与U组比较,A+U组细胞活力降低,p-JAK2和表达下调,caspase-3表达上调( P<0.05)。 结论:JAK2/STAT3信号通路激活参与了乌司他丁减轻星形胶质细胞氧糖剥夺损伤的过程。
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编辑人员丨4天前
