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非编码RNA N6-甲基腺苷修饰在糖尿病及其并发症中的作用
编辑人员丨1周前
非编码RNA(ncRNA)作为糖尿病表观遗传学的一种常见形式,在糖尿病的发生发展中扮演着重要角色。N6-甲基腺苷(m6A)是腺嘌呤(A)第6位氮原子被甲基转移酶催化形成的一种RNA甲基化修饰。m6A是已知最丰富的ncRNA修饰方式,可调控靶标RNA代谢的大多数过程,包括RNA的成熟、剪接、翻译和RNA稳定性等,从而调节下游信号通路并改变细胞生理功能。现有研究表明,ncRNA m6A修饰中在糖尿病等多种疾病中发挥重要作用。该文总结了ncRNA m6A修饰在糖尿病及其并发症中的作用,并展望未来ncRNA m6A修饰在糖尿病发生发展中的研究方向,为科学研究提供参考。
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编辑人员丨1周前
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SR蛋白家族在细胞凋亡过程中的作用及机制
编辑人员丨1周前
细胞凋亡是多基因严格控制的程序性细胞死亡方式,与多种疾病的发生发展密切相关,目前,凋亡调控的确切机制尚不完全清楚。参与细胞凋亡外源性或内源性调控的相关基因在转录水平可被选择性剪接产生不同的亚型,从而增加了细胞凋亡调控的复杂性。丝氨酸/精氨酸(SR)蛋白是前体信使RNA(pre-mRNA)剪接所需的基本剪接因子,作为选择性剪接的关键调节器,在细胞凋亡调控过程中具有重要的作用。人类SR蛋白家族根据被发现的时间顺序分别命名为富丝氨酸/精氨酸剪接因子1-12(SRSF1-12),由于其自身的特殊结构域,它们在细胞凋亡中的调控作用及机制不尽相同。本文主要综述SR蛋白家族成员在细胞凋亡中的作用和调控机制。
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编辑人员丨1周前
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急性髓系白血病全外显子组测序基因突变特点及其与疗效的关系
编辑人员丨1周前
目的:探讨急性髓系白血病(AML)患者全外显子组测序(WES)基因突变特点及其与疗效的关系。方法:回顾性分析2014年12月至2019年9月安徽医科大学第二附属医院收治的30例AML患者资料,总结WES结果及疾病类型、疾病分型、遗传学预后分层、疗效等情况,比较不同临床特征和遗传学预后分层患者突变类型及突变频率。结果:30例AML患者中26例(86.7%)至少发生1个基因突变,其中突变频率>10.0%的基因依次为NRAS、RUNX1、TET2、CEBPA、IDH2、ASXL1,这些突变基因的功能涉及信号通路、转录因子、表观遗传、RNA剪接及其他生物学功能,19例(63.3%)在突变方式上呈现为多种组合的联合突变。在年龄、性别、疾病类型、疾病分型及遗传学预后分层各组中突变率差异均无统计学意义(均 P>0.05)。融合基因阳性8例中突变7例,平均突变频率175.0%(14/8);融合基因阴性22例中突变19例,平均突变频率213.6%(47/22);两组间突变频率差异有统计学意义( P=0.001)。持续缓解14例中突变11例,平均突变频率157.1%(22/14);复发10例中突变9例,平均突变频率200.0%(20/10);原发耐药5例均发生突变,平均突变频率300.0%(15/5);3组间突变频率差异有统计学意义( P=0.009)。 结论:通过WES分析发现,大多数AML患者存在复杂的联合基因突变,且基因突变频率越高提示预后越差。
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编辑人员丨1周前
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成骨不全胎儿2例的 COL1A1与 COL1A2基因变异分析
编辑人员丨1周前
目的:探讨2例成骨不全症(OI)胎儿的临床表型及遗传学特征,明确致病原因。方法:收集分别在2021年6月11日和2021年10月16日就诊于潍坊医学院附属医院的2例中孕期超声诊断疑似OI胎儿的临床资料信息。采集孕妇羊水及胎儿父母、亲属外周血样品提取基因组DNA,对2例胎儿进行全外显子组测序(WES),对候选变异进行Sanger家系验证。针对可能影响pre-mRNA剪接的变异,利用minigene体外分析变异位点附近外显子的剪接方式,对变异的致病性进行判定。结果:胎儿1在胎龄17 +6周超声显示双侧肱骨和股骨发育落后2周余,四肢长骨多发骨折、成角畸形。胎儿2在胎龄23周超声显示双侧肱骨和股骨发育分别落后1 +周和4周,双侧股骨和胫腓骨弯曲。WES结果显示胎儿1的 COL1A1基因第49外显子存在c.3949_3950insGGCATGT(p.N1317Rfs*114)杂合变异,该变异导致翻译提前终止,胎儿父母外周血中未检出该变异。根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)变异评级指南,c.3949_3950insGGCATGT变异评级为致病性变异(PVS1+PS2+PM2_Supporting)。胎儿2的 COL1A2基因第26内含子中存在父源的c.1557+3A>G杂合变异,剪接报告基因分析提示该变异使 COL1A2基因pre-mRNA第26外显子发生跳跃,导致mRNA转录本第1 504~1 557位编码序列整码缺失及其编码蛋白第502~519位氨基酸缺失,根据ACMG变异评级指南,c.1557+3A>G杂合变异评级为致病性变异(PS3+PM1+PM2_Supporting+PP3+PP5)。 结论:COL1A1基因c.3949_3950insGGCATGT变异、 COL1A2基因c.1557+3A>G变异分别可能为2例OI胎儿的遗传学原因。 COL1A1基因c.3949_3950insGGCATGT的发现丰富了成骨不全致病基因变异谱。
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编辑人员丨1周前
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中国汉族Wagner综合征一家系临床与分子遗传学研究
编辑人员丨1周前
目的:探讨中国汉族Wagner综合征一家系的临床特征及致病原因,分析 VCAN基因变异与患者表型的关系。 方法:采用家系调查研究方法,于2020年1月在厦门大学附属厦门眼科中心收集中国汉族Wagner综合征一家系共3代3名成员,其中患者5例,各代均有发病。所有家系成员均接受全面的病史采集和眼科常规检查,包括视力、眼压、裂隙灯显微镜眼前节检查、直接检眼镜检查等;先证者和部分患者采用眼前节照相检查眼前节情况,经彩色眼底照相、光相干断层扫描检查眼底情况,采用超声生物显微镜检查房角情况。采集所有成员外周静脉血并提取基因组DNA,通过高通量目标区域捕获测序和Sanger测序进行致病基因变异分析验证,采用美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)指南对变异位点进行评分,通过蛋白结构和功能预测网站PredictProtein对变异位点结构和功能进行预测。结果:该Wagner综合征家系符合常染色体显性遗传方式,所有患者均无全身病史和其他异常表现,眼部病变共同特征为悬韧带异常、早发白内障、玻璃体空腔、玻璃体浓缩、玻璃体腔中面纱状增生膜、视网膜脉络膜萎缩变薄、牵拉性视网膜脱离、视网膜色素沉着。先证者已行双眼白内障手术,术后出现双眼人工晶状体脱位。遗传学分析发现该家系中 VCAN基因上的1个杂合剪接位点变异c.9265+1G>A,与疾病表型共分离,ACMG指南评级为可能致病性变异。蛋白质功能预测结果显示,该变异碱基对取代可引起截短1 754个氨基酸的蛋白质产物形成,导致单倍体剂量不足,糖胺聚糖附着位点严重减少,使得Versican蛋白功能出现异常。 结论:本研究在国内首次报道了中国Wagner综合征一家系,通过分子遗传学分析确定了该家系存在 VCAN基因c.9265+1G>A杂合变异。
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编辑人员丨1周前
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RNA选择性剪接对肿瘤细胞放射敏感性影响的研究进展
编辑人员丨1周前
放射治疗是恶性肿瘤最主要的治疗方式之一,放射敏感性是影响肿瘤患者放疗疗效的关键因素,也一直是研究的热点。选择性剪接是基因表达过程中转录后关键的调控步骤,选择性剪接可以使前体mRNA产生多种不同的剪接异构体,进而产生不同的蛋白质,它们在维持机体正常生命活动中起着至关重要的作用。肿瘤细胞相对正常细胞而言,有着更高比例的剪接失调事件发生。选择性剪接的失调,可以导致基因组不稳定性、血管生成等病理过程的发生,从而导致疾病的进展。肿瘤细胞中发生的异常剪接事件,可以作为新的治疗靶点。本文将对RNA选择性剪接、剪接事件与放射敏感性相关研究,以及研究展望进行综述。
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编辑人员丨1周前
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乳腺癌中环状RNA的研究进展
编辑人员丨1周前
环状RNA(circRNA)是一类由前体信使RNA(mRNA)反剪接产生的序列保守的闭合环形RNA。与线性RNA不同,circRNAs不需要3’和5’端,这有助于其抗外切酶消化,具有序列保守性和组织特异性。circRNAs可以作为miRNA海绵或与RNA相关蛋白结合并调节基因转录,直接或间接影响乳腺癌相关基因的表达。最新研究结果显示,部分circRNAs有可以表达蛋白质的开放阅读框,也可以对乳腺癌细胞的增殖、侵袭与凋亡产生作用。越来越多的证据表明,circRNAs以细胞类型、组织或发育阶段特有的方式表达,并且也在病理条件下表达。甚至circRNAs的异常表达与多种癌症有关,如乳腺癌、肝细胞癌、淋巴腺癌、结直肠癌、胰腺癌和膀胱癌,它有可能成为癌症治疗所需的新型生物标志物和治疗靶点。近年来,circRNAs在肿瘤治疗和肿瘤早期检测中的作用成为了一个研究热点,其中就包括乳腺癌相关性环状RNA。本文就circRNAs的发现、产生机制、生物学功能进行综述,探讨circRNAs在乳腺癌中的研究进展以及外泌体circRNAs目前最新进展,并进行问题展望。
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编辑人员丨1周前
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应用全外显子组测序技术进行小耳畸形核心家系新生突变分析
编辑人员丨1周前
目的:在中国汉族小耳畸形核心家系中评估基因新生突变模式在散发小耳畸形中的作用,寻找可能的致病性新生突变。方法:选取2017年3月至2018年7月就诊于中国医学科学院整形外科医院的24个中国单纯小耳畸形核心家系。其中小耳畸形患者24例,年龄6~10岁,男15例,女9例,均为单侧小耳畸形,包括左侧15例,右侧9例。获知情同意后,抽取患者及其未患病双亲的外周血,对24个单纯小耳畸形患者及其未患病双亲进行全外显子组测序,筛选位于基因编码区及经典剪接位点的新生突变,观察每例患者外显子区的新生突变数量。对筛选到的新生突变依美国医学遗传学与基因组学会变异分类标准进行分类,使用ExAc数据库、VarCards数据库、Human Splicing Finder 3.1在线软件分别对丧失功能突变、错义突变和同义突变进行变异特征判断,结合小鼠基因组信息数据库查询同源基因在小鼠鳃弓部位的表达情况、使用David6.8生物信息数据库对候选基因进行通路富集分析,使用在线人类孟德尔疾病遗传数据库查询候选基因与人类疾病之间的对应关系,从而对不同变异进行变异功能和基因功能2方面的致病性评估。结果:24个小耳畸形家系中共检测到23个新生突变,每个患者检测到0~3个外显子区新生突变,与正常人相比未见明显增加。突变类型包括错义突变12个、同义突变8个以及无义突变、起始密码子突变、整码插入突变各1个。其中LRP12基因无义突变依指南分类为致病变异。使用多种生物信息学软件及数据库对所有新生突变进行分析,未见明显的致病性特征。结论:小耳畸形患者中并没有发现明显的新生突变负担加重,尽管致病基因可能通过新生突变模式在小耳畸形中致病,但新生突变模式可能不是小耳畸形致病的主要遗传模式。
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编辑人员丨1周前
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环状RNA与心血管疾病的研究进展
编辑人员丨1周前
环状RNA(circRNA)是一类新型的非编码RNA,由前体RNA反向地首尾剪接形成。circRNA可以通过作为miRNA的海绵、调控基因转录、与线性RNA竞争、编码蛋白质、调控蛋白质功能等方式发挥作用。现总结环状RNA的生物合成和功能方面的最新研究成果,对其在心肌梗死、心力衰竭、动脉粥样硬化、心肌纤维化、心房颤动、高血压等心血管疾病中的作用及机制进行综述,为诊断和治疗心血管疾病提供新思路。
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编辑人员丨1周前
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结直肠癌中RNA结合蛋白的新作用
编辑人员丨1周前
RNA结合蛋白(RNA binding protein,RBP)是转录后调节的关键参与者。RNA结合蛋白的RNA结合域(RBD)具有功能多样和结构灵活的特点,使得RBP能够控制大量基因的转录水平。RBP调控方式包括与RNA结合,调节RNA的剪接、修饰、转运、定位、降解和翻译等。RNA结合蛋白表达水平的改变,往往会引起一系列连锁反应,甚至诱发肿瘤的产生。近年来,RBP与癌症的相关研究众多,我们回顾了结直肠癌中几种抑癌和促癌的RNA结合蛋白的作用机理,期望未来发现更多的RNA结合蛋白并构建更加庞大的调节网络,为临床结直肠癌患者的治疗提供新的方向。
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编辑人员丨1周前
