陆地生态系统碳储量变化与区域土地利用变化密切相关,预测未来不同情景下区域碳源/汇变化对土地利用管理决策及发掘碳汇潜力具有重要意义.本研究基于松花江流域上游2000-2020年土地利用数据,采用CA-Markov模型预测了现状发展情景、经济发展情景和生态保护情景下土地利用空间格局;采用修正后的碳密度数据,运用InVEST模型Carbon模块评估松花江上游流域2000-2050年5期碳储量及碳源、碳汇变化.结果表明:2000-2020年松花江上游流域碳储量整体呈下降趋势,共减少168.4×108kg;2000-2020年,松花江上游流域林地面积减少以及建设用地和耕地扩张是促使碳储量减少的主要原因;2030年和2050年在现状发展情景和经济发展情景模式下,碳储量减幅较大;生态保护情景下碳储量明显增加,较2020年分别增加441.5×108和658.1×108kg,说明该情景下土地利用格局固碳能力较强.该研究结果可为松花江上游流域土地利用格局优化以及碳储生态服务功能可持续发展提供科学依据.

目的:运用生物信息学方法挖掘农药慢性暴露诱导的差异表达基因（DEGs）及其富集的信号通路，探索其潜在致病机制和关键基因。方法:于2021年7月，从基因表达综合数据库（GEO）中下载与农药毒效应相关的高通量基因表达谱数据，样本来源为长期接触农药的美洲男性农场工人和其他行业工人，获取DEGs；利用R软件clusterProfiler包对所选择的DEGs进行GO、KEGG及基因集富集分析（GSEA）；采用STRING、Cytoscape等工具对其进行蛋白质相互作用网络的构建及可视化分析；借助MCODE及Cytohubba等分析得到基因功能模块，从而筛选出核心基因。结果:共筛选出GSE30335数据集的DEGs 189个，其中上调基因101个，下调基因88个。GO、KEGG及GSEA结果显示，DEGs主要富集于神经元投射发育调控、运动调节、核糖体蛋白合成等生物学功能及以帕金森病为代表的复杂神经系统疾病相关的通路上。综合筛选发现，KLF1为农药暴露的核心基因，其差异表达倍数为0.456（ t=-3.82， P=0.021）。 结论:长期农药暴露可造成接触人群多个基因的差异表达，可能通过下调KLF1并经由其介导的一系列生物学途径参与神经系统的病理学改变。

目的:分析丙氨酸转氨酶（ALT）正常的慢性乙型肝炎患者肝脏病理炎症及纤维化情况，并探索其与相关临床指标的关系。方法:回顾性收集2016年8月至2019年12月就诊于河南省人民医院感染科的721例ALT正常初治慢性乙型肝炎患者，所有患者均进行肝组织穿刺活检。收集患者性别、年龄、肝功能指标、血常规指标、HBsAg水平、HBeAg状态、HBV DNA水平、脾脏厚度及凝血酶原时间，分析患者一般数据情况，分别利用单因素和多因素分析方法确定影响患者肝穿刺炎症纤维化程度的因素，利用受试者操作特征曲线（ROC）评价所建立的多因素预测模型。检验水准取α=0.05。结果:721例慢性乙型肝炎患者年龄（36.1±9.7）岁、男女比例1.28/1。721例患者炎症纤维化情况分级主要集中在G1S1（349例）、G1S2（132例）、G2S2（119例）、G2S1（57例）；其中G1S1有349例（占48.4%），G/S≥2者372例（占51.6%）。主要表现为轻中度炎症及纤维化，重度G/S≥3者仅64例（占8.88%）。分析721例患者相关临床指标分层与肝病理炎症和纤维化的关系，其中仅HBsAg水平（以4 log 10 IU/ml为界限分层）差异有统计学意义（炎症分级 χ2=6.182， P=0.013，纤维化分级 χ2=36.534， P=0.001）。对可能影响患者肝组织病理G/S≥2的相关临床指标进行单因素分析，显示患者的年龄、白蛋白、γ-谷氨酰转移酶（GGT）、血小板、凝血酶原时间（PT）、脾脏厚度及HBsAg水平比较均有统计学意义（ P值均<0.05）；进一步进行多因素分析，结果显示年龄、GGT、PT、脾脏厚度差异均有统计学差异（ P值均<0.05）。根据多因素分析建立预测模型，并绘制的ROC曲线下面积为0.642，取灵敏度与特异度之和最大时的点截断值Logit P=0.497，诊断灵敏度为60.6%，诊断特异度为64.5%，约登指数为0.252。 结论:ALT正常慢性乙型肝炎患者超过半数存在明显炎症及纤维化，需要及时抗病毒治疗。其中年龄、GGT、PT及脾脏厚度可帮助综合评估患者肝脏炎症和纤维化状态，但缺少准确的预测模型，提示更多的有助于预测此类患者炎症和纤维化状态的有效指标尚待发掘，对于ALT正常患者仍要积极进行肝穿刺活检以明确诊断及时治疗。

目的:利用生物信息学分析肾嫌色细胞癌基因表达谱芯片，寻找肾嫌色细胞癌发生的关键基因。方法:从GEO数据库下载肾嫌色细胞癌基因芯片数据GSE15641和GSE11151，利用R软件中的"affy"、"limma"等R软件包进行差异表达基因筛选，结合DAVID和STRING在线生物信息学工具对差异表达基因进行调控网络分析并构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络，通过Cytoscape软件中的Cytohubba插件筛选Hub基因。结果:共筛选出肾嫌色细胞癌差异表达基因261个，包括194个表达下调基因，67个表达上调基因。对差异表达基因进行基因富集(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析以挖掘其生物学功能，其中GO富集分析中的生物学过程(BP)主要富集于细胞分泌、糖异生和细胞增殖调控；在细胞组成(CC)主要富集于细胞外泌体、细胞质膜及其组成部分；在分子功能(MF)主要富集于肝素结合，在KEGG通路分析中主要富集于代谢通路、抗体的生物合成、蛋白质消化吸收、肾素-血管紧张素系统等。利用在线生物信息学工具构建PPI网络，通过Cytoscape软件中的Cytohubba插件筛选前10位Hub基因，分别是胡椒酸和肌氨酸氧化酶(PIPOX)、羟基酸氧化酶2(HAO2)、犬尿氨酸-3-单加氧酶(KMO)、溶质转运家族2成员2(SLC2A2)、甲酰亚胺基转移酶环脱氨酶(FTCD)、血管生成素(ANG)、催化多肽-1(APOBEC1)互补因子(A1CF)、重组表达醛脱氢酶8A1(ALDH8A1)、维生素D结合蛋白(GC)、血浆富含组氨酸糖蛋白(HRG)。结论:利用生物信息学方法分析肾嫌色细胞癌的差异表达基因，可有效发掘这些差异表达基因的相互作用信息，为肾嫌色细胞癌的治疗提供新的思路。

目的:采用加权基因共表达网络分析（WGCNA）探讨烧伤后瘢痕组织内甲基化基因，发掘瘢痕形成过程中的分子标志物及治疗靶点。方法:采用观察性研究方法。从美国国家生物技术信息中心基因表达综合数据库筛选出同一批次分别进行了mRNA测序和甲基化测序的GSE136906和GSE137134数据集（数据集的样本数均为6），并利用数据集GSE108110（样本数为9）纳入支持向量机及建模分析。采用“Limma”软件包对烧伤后瘢痕和正常组织之间的差异表达基因和差异甲基化基因进行鉴定。使用WGCNA筛选和瘢痕组织临床特征相关性强且基因数目多的模块。对模块内的基因进行功能富集分析并寻找模块内异常甲基化状态的基因，使用受试者操作特征（ROC）曲线判断异常甲基化基因对瘢痕的诊断效能，并使用支持向量机模型进行验证。结果:共鉴定出10个共表达基因模块，棕色模块与烧伤后瘢痕组织形成相关性高且基因数目多。棕色模块内的基因主要富集在雄激素受体信号通路的调控、细胞因子-细胞因子受体相互作用、胰岛素分泌的正调节等方面。棕色模块内显示35个基因甲基化状态异常，ROC曲线（曲线下面积>0.9）与支持向量机模型（准确率为93.3%）表明基因 CCR2、 LMO7、 STEAP4、 NNAT和 TCF7L2具有良好的瘢痕诊断效能。 结论:CCR2、 LMO7、 STEAP4、 NNAT和 TCF7L2可作为烧伤后瘢痕治疗的潜在靶点。

目的:探讨垂体生长激素(GH)细胞腺瘤中差异表达的微小RNAs(miRNAs)及其靶基因的生物学功能和两者的调控关系。方法:利用miRDB、miRwalk、Targetscan7.2及starbase数据库对差异表达的miRNAs进行靶基因预测并对靶基因进行GO、KEGG和蛋白-蛋白相互作用网(PPI)分析，随后筛选出有意义的核心靶基因，取核心靶基因和数据库的mRNAs测序结果进行对比，构建可视化的miRNAs-靶基因调控关系网。结果:以蛋白相互作用程度≥20为标准，本研究得到113个上调的miRNAs核心靶基因和128个下调的miRNAs核心靶基因，进一步取交集得到13个目的核心靶基因，这些基因主要涉及的通路为泛素介导蛋白水解通路，其相对应的调控miRNAs为miR-15b、miR-365、miR-32-3p、miR-486-5p。结论:本研究应用生物信息学分析工具构建了与GH细胞腺瘤密切相关的miRNAs-核心靶基因相互调控网，发掘了一些可能与GH细胞腺瘤发病机制和病理过程有关的蛋白和通路。

宏基因组学利用新一代高通量测序技术，以特定环境下病原体基因组为研究对象，在分析病原体多样性、种群结构、进化关系的基础上，进一步探究病原体的群体功能活性、相互作用及其与环境之间的关系，发掘潜在的生物学意义。目前，绝大部分的宏基因组学研究都集中在临床价值评价，宏基因组检测临床应用前分析性能确认的研究相对空白，北京协和医院检验科研究团队结合多年病原宏基因组检测的经验和国内外相关研究成果，就病原宏基因组项目医院本地化开展前的性能确认工作，从临床预期用途、方法学建立、性能确认、标准操作作业书4个方面提出了具体的实施方案，具体包含：标本类型和病原体范围、生物信息流程建立、生物信息分析参考盘制备和评估、湿实验流程的建立、背景核酸数据模型的建立、参考盘制备和全流程的性能确认等。

不良饮食是慢性非传染性疾病最重要的可控危险因素之一，但通过随机对照试验定量阐明具体饮食因素与健康结局的因果关联面临很多困难。近年来，因果推断的迅速发展为充分利用和发掘观察性研究数据，产生高质量的营养流行病学研究证据提供了有力的理论和方法工具。其中，因果图模型通过整合大量先验知识将复杂的因果关系系统可视化，提供了识别混杂和确定因果效应估计策略的基础框架，基于不同的因果图，可选择调整混杂、工具变量或中介分析等不同的分析策略。本文对因果图模型的思想和各种分析策略的特点及其在营养流行病学研究中的应用进行介绍，旨在促进因果图模型在营养领域的应用，为后续研究提供参考和建议。

目的:系统评价和整合慢性心力衰竭患者自我护理体验，为构建慢性心力衰竭患者自我护理干预方案提供借鉴。方法:计算机检索PubMed、PsycINFO、Web of Science、Embase、CINAHL、Cochrane Library及中国知网、中国生物医学文献数据库、万方医学网数据库、维普数据库等中英文数据库，收集关于慢性心力衰竭患者自我护理体验的质性研究，检索时限为建库至2021年1月31日。采用澳大利亚Joanna Briggs Institute循证医疗保健中心定性研究质量评价标准进行文献质量评价，采用汇集性方法对纳入文献进行整合。结果:最终纳入13篇文献，提炼出50个研究结果，将相似结果整合后得出7个新类别，综合为2个整合结果。整合结果1：慢性心力衰竭患者实施自我护理过程中受多种因素影响；整合结果2：随着时间的推移，患者开始与疾病共存，通过发掘内心正性心理感受，利用个人信念选择积极应对，实现自我价值。结论:慢性心力衰竭患者在疾病自我护理过程中受多种影响因素制约，医护人员应重视患者在自我护理管理过程中的需求，给予针对性的支持与帮助，调动其自我管理的积极性。

目的:筛选轮状病毒非结构蛋白2(nonstructural protein 2, NSP2)与宿主细胞的互作蛋白，为抗病毒靶标的发掘提供理论依据。方法:NSP2-pGEX-6P-1重组质粒转化 E. coli BL21(DE3)，IPTG诱导表达，GST亲和层析法获得NSP2-GST纯化蛋白，Western blot进行验证。将NSP2-GST及GST纯化蛋白作为靶蛋白，通过GST pull-down捕获与MA104宿主细胞互作的差异蛋白。经银染后，将差异条带通过蛋白质胶内酶解及质谱法筛选出相应蛋白质，借助Protein Pilot平台过滤肽段，由Paragon算法获得蛋白质名称和相关的生物学功能。通过蛋白质互作网络图和GO功能注释分析，展示互作蛋白间的潜在联系。同时，利用HDOCK软件对排名前三的蛋白质进行分子对接预测，结合对接分数和置信分数加以验证，揭示蛋白质间的可视化对接模型。 结果:SDS-PAGE和Western blot表明NSP2重组蛋白纯化成功。经GST pull-down联合蛋白质谱鉴定，筛选出PKM2等10种可能与NSP2互作的宿主蛋白质；GO分析及互作图展示出RPS4X、EZR、SUPT16H、EIF2S3介导分子表达，PKM2、LDHA、ATP5A1参与能量代谢，HSP90、ACTB、ANXA2参与生物运动过程，并且彼此之间存在功能联系及互作网络。分子对接显示出PKM2、HSP90、RPS4X与NSP2存在互作关系，相互作用力强，能够形成稳定结构。结论:成功发现宿主细胞中PKM2、HSP90、RPS4X等蛋白质与NSP2存在互作关系，为轮状病毒感染过程的探究及相关防控策略的制定提供参考。