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口腔鳞状细胞癌组织TRIM14和HOXB7蛋白表达与患者临床病理特征及预后的关系
编辑人员丨2024/3/23
目的 探讨三结构域蛋白 14(TRIM14)、同源异型盒基因B7(HOXB7)蛋白在口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者癌组织中的表达水平与患者临床病理特征及预后的关系.方法 收集 2016 年 1 月至 2018 年 1 月行手术治疗的OSCC患者 148 例的癌组织与癌旁正常组织,免疫组化法分析组织中TRIM14、HOXB7 表达情况;Kaplan-Meier生存曲线分析OSCC患者癌组织TRIM14、HOXB7 表达水平与生存率之间的关系;COX回归分析OSCC患者预后不良的影响因素.结果 OSCC癌组织TRIM14、HOXB7 高表达率均高于癌旁正常组织(P<0.05).OSCC癌组织TRIM14、HOXB7表达与肿瘤T分期、M分期、淋巴结转移、周围组织浸润、分化程度相关(P<0.05).OSCC患者 5 年生存率为 49.32%(73/148),Kaplan-Meier生存曲线表明 TRIM14、HOXB7 高表达患者生存率低于 TRIM14、HOXB7 低表达患者(χ2 = 14.480、24.841,P<0.001).多因素COX分析结果显示,T3-T4 分期、M1 分期、淋巴结转移、周围组织浸润、癌组织TRIM14、HOXB7 高表达均是OSCC患者预后不良的危险因素(P<0.05).结论 OSCC患者癌组织TRIM14 与HOXB7蛋白表达水平均上调,其表达与患者临床病理特征和 5 年生存预后明显相关.
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编辑人员丨2024/3/23
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结直肠癌组织中同源异型盒基因B7蛋白的表达及临床意义
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨同源异型盒基因B7(HOXB7)蛋白在结直肠癌中的表达及其与患者临床病理因素和预后的关系.方法 回顾性分析结直肠癌患者87例,采用RT-PCR法和免疫组织化学法分别检测结直肠癌组织中HOXB7 mRNA和HOXB7蛋白的表达,分析其表达与患者临床病理参数和预后的相关性.结果 HOXB7 mRNA在结直肠癌组织中的相对表达量为(42.4±16.3),显著高于癌旁正常组织的(19.4±7.6),差异有统计学意义(P<0.05);HOXB7蛋白在结直肠癌组织中表达的阳性率为73.9%,显著高于癌旁正常组织的10.3% (P<0.05);HOXB7蛋白表达与患者TNM分期、淋巴结转移和远处转移有显著相关性(P<0.05),且HOXB7蛋白阳性表达的患者具有更差的预后.结论 HOXB7蛋白在结直肠癌组织中表达上调,其高表达与结直肠癌患者的临床病理因素和预后相关.
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编辑人员丨2023/8/6
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HOXB7在胃癌组织中的表达及其临床意义
编辑人员丨2023/8/6
目的:分析同源异型盒基因B7(Homeobox B7,HOXB7)在人胃癌组织中的表达情况,并探讨HOXB7的表达与胃癌患者临床病理特征和预后的关系.方法:收集行手术切除的胃癌组织及对应癌旁组织共120例,采用实时定量PCR(qRT-PCR)技术、蛋白印迹(Westem blot)和免疫组化染色分别检测HOXB7mRNA水平及蛋白水平在胃癌及对应癌旁组织中的表达,通过卡方检验分析HOXB7表达水平与胃癌患者临床病理因素间的相关性,采用单因素及多因素Cox回归模型评估HOXB7在胃癌风险评估中的作用,Kaplan-Meier生存曲线分析HOXB7表达水平与胃癌患者无瘤生存期和总生存期的关系.结果:胃癌组织中HOXB7 mRNA和蛋白表达水平均显著高于对应癌旁组织(P<0.05);HOXB7蛋白表达与肿瘤临床分期、浸润深度及淋巴结转移均具有显著相关性(P<0.05),而与患者性别、年龄、分化程度及远处转移均无显著相关性(P>0.05).单因素和多因素Cox分析提示HOXB7可以作为评估胃癌患者预后的独立风险因素.Kaplan-Meier生存分析结果显示高表达HOXB7的胃癌患者无瘤生存时间和总生存时间均显著低于HOXB7低表达患者组(P<0.01).结论:HOXB7蛋白在胃癌组织中高表达,并与胃癌的恶性表型有关,可能参与胃癌发生及恶性进展过程,可作为判断胃癌患预后的重要参考指标.
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编辑人员丨2023/8/6
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多发性骨髓瘤患者HOXB7 mRNA及其蛋白水平的临床意义
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨多发性骨髓瘤患者同源异型盒基因B7(HOXB7)mRNA及其蛋白水平的临床意义.方法 选取2012年2月至2017年2月该院收治的120例多发性骨髓瘤患者(病例组)和同期在该院体检的35名志愿者(健康组)为研究对象,比较两组研究对象HOXB7 mRNA及其蛋白水平,观察HOXB7 mRNA及其蛋白在不同分期多发性骨髓瘤患者以及伴有髓外浸润多发性骨髓瘤患者中表达情况,并分析HOXB7与多发性骨髓瘤患者临床分期 、髓外浸润情况的关系.结果 病例组HOXB7 mRNA及其蛋白水平高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);Ⅲ 期组HOXB7 mRNA及其蛋白水平高于 Ⅰ 期组 、Ⅱ 期组,Ⅱ 期组相比 Ⅰ 期组也明显较高,差异有统计学意义(P<0.05);伴有髓外浸润多发性骨髓瘤患者HOXB7 mRNA、HOXB7蛋白明显高于无髓外浸润者(P<0.05);多发性骨髓瘤患者临床分期和伴有髓外浸润与HOXB7表达水平呈正相关(r=0.352、0.298,P<0.05),但其与患者性别 、年龄等均无明显相关性(P>0.05).结论 多发性骨髓瘤患者HOXB7 mRNA及其蛋白水平明显上调,HOXB7基因在多发性骨髓瘤疾病发生 、进展和浸润过程中发挥重要作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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神经管缺陷3家系DNA甲基化研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨神经管缺陷(NTDs)家系中全基因组DNA甲基化改变情况及其意义.方法 收集3个NTDs家系,共12例研究对象纳入本研究,以NTDs患者作为病例组,家系中表型正常的成员为对照组.抽取12例研究对象的外周血,提取基因组DNA.使用重亚硫酸盐处理基因组DNA,全基因组扩增方式扩增片段化,置Illumina Infinium人类甲基化450k芯片上,进行杂交、洗脱、延伸、成像,使用iScan软件扫描芯片,Genome Studio读取扫描图像结果.使用Illumina甲基化分析器软件进行数据分析.结果 基因差异甲基化分析显示:差异性甲基化基因位点仅占检出CpG位点的0.2%,617个差异性DNA高甲基化的位点(P<0.05),其中63个DNA甲基化位点P<1×10-4,包括E盒结合锌指蛋白2基因、5,10-亚甲基四氢叶酸脱氢酶1基因等;l04个差异性DNA低甲基化的位点(P<0.05),其中65个DNA甲基化位点P<0.01,包括同源异型盒B7基因、runt相关的转录因子3基因等.聚类分析显示:NTDs患儿呈DNA高甲基化改变的趋势较一致,而对照组呈DNA低甲基化改变的趋势较一致.结论 在NTDs家系中,DNA甲基化异常可能是NTDs发生的危险因素之一.
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编辑人员丨2023/8/6
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miR-182-5p通过HOXB7基因调控膀胱癌细胞的增殖和侵袭迁移
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨微小RNA-182-5p(miR-182-5p)对膀胱癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响及其分子机制.方法 实时荧光定量PCR(qPCR)检测正常膀胱上皮细胞(HUC)和膀胱癌细胞(T24、5637、SW780)中miR-182-5p和同源异型盒基因B7(HOXB7)表达;生物学信息预测和双荧光素酶报告基因实验分析miR-182-5p和HOXB7的靶向关系;蛋白质印迹法(Western Blot)检测过表达miR-182-5p或抑制HOXB7表达对SW780细胞中HOXB7、P53和基质金属蛋白酶-2(MMP-2)蛋白水平的影响;噻唑蓝(MTT)比色法检测细胞增殖,Transwell小室法检测细胞侵袭和迁移.共转染pcDNA-HOXB7和miR-182-5p模拟物,观察过表达HOXB7对miR-182-5p作用于膀胱癌细胞的影响.结果 HUC细胞相比,miR-182-5p在膀胱癌细胞系中表达下调(P<0.05),HOXB7 mRNA和蛋白表达上调(P<0.05).miR-182-5p在SW780细胞中的表达量最低.HOXB7是miR-182-5p的靶基因.miR-182-5p过表达可抑制细胞活力、侵袭和迁移,降低P53和MMP-2蛋白表达量,差异有统计学意义(P<0.05),与抑制HOXB7表达结果相同.过表达HOXB7可以逆转miR-182-5p对膀胱癌细胞增殖、侵袭和迁移的抑制作用.结论 miR-182-5p通过靶向调控HOXB7表达抑制膀胱癌细胞增殖、侵袭和迁移.
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编辑人员丨2023/8/5
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同源异型盒1基因促进乳腺癌细胞增殖和侵袭
编辑人员丨2023/8/5
同源异型盒1 (sine oculis homeobox homolog 1,SIX1)基因参与多种肿瘤调控,在乳腺癌发生发展过程中发挥了重要作用,但具体机制仍有待探讨.本研究目的 在于分析SIX1基因在乳腺癌中的表达情况,研究其在乳腺癌细胞增殖与侵袭过程中所发挥的作用并探讨作用的机制.TCGA数据库和GEPIA2在线数据库分析发现,SIX1在乳腺癌中的表达高于正常组织,且在乳腺癌的不同分子亚型Basal-like、HER2、Luminal A、Luminal B中也证实了这一点(P<0.05);HPA数据库分析发现,SIX1的免疫组化蛋白质表达水平高于正常乳腺组织,SIX1基因在乳腺癌中高表达,差异具有统计学意义(P<0.001).在乳腺癌细胞株MDA-MB-231中,干扰SIX1的表达及在MCF-7中过表达SIX1后,生长曲线及EdU实验结果显示:敲低SIX1后乳腺癌细胞的生长增殖受到抑制,而过表达SIX1则会发挥促进作用(生长曲线实验:P<0.05;EdU实验:P<0.001);Transwell结果表明,SIX1能够增强乳腺癌细胞的侵袭能力(P<0.001).利用TCGA数据库,根据SIX1基因表达值的上下四分位定义SIX1基因高表达及低表达人群,对两组队列进行差异基因分析,发现差异基因与代谢、干细胞调控等通路相关;对敲低SIX1的乳腺癌细胞系进行转录物组测序(RNA-sequencing,RNA-seq),并对测序结果进行一系列生物信息学分析发现,SIX1与代谢、干细胞调控以及EMT等通路密切相关.挑选代表性基因MYC、SNAI2、EGFR,通过已发表的GEO临床数据集以及KM-plot-ter验证靶基因与SIX1表达的相关性及与临床乳腺癌病人的预后关系,我们发现:SIX1与MYC、SNAI2、EGFR表达正相关.高表达的SIX1、MYC、SNAI2与EGFR不利于乳腺癌病人的生存.利用GCBI、GeneMANIA及String在线工具,我们发现了SIX1基因相互作用的蛋白质和相关的lncRNA及miRNA.综上,本研究中初步揭示了SIX1在乳腺癌中发挥的作用及其调控机制,为进一步深入研究该基因提供了线索.
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编辑人员丨2023/8/5
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结直肠癌组织LASS2、HOXB7蛋白表达与凋亡指数及预后的关系分析
编辑人员丨2023/8/5
目的:探讨结直肠癌(CRC)组织人源长寿保障基因2(LASS2)、同源异型盒基因B7(HOXB7)表达与凋亡指数(AJ)及预后的关系.方法:选择2013年10月至2015年4月期间在我院接受治疗的105例CRC患者作为研究对象.检测其CRC组织以及癌旁组织中LASS2、HOXB7表达以及AI,分析LASS2、HOXB7表达与临床病理特征的关系,采用Kaplan-Meier生存曲线分析不同LASS2、HOXB7表达患者总生存率的差异,Cox比例风险回归分析CRC患者预后的影响因素.结果:CRC组织中LASS2阳性率低于癌旁正常组织,而HOXB7阳性率高于癌旁正常组织(P<0.05),CRC组织中AI低于癌旁正常组织(P<0.05).经Spreaman相关性分析显示CRC组织LASS2阳性率和AI呈正相关关系,而HOXB7阳性率和AI呈负相关关系(P<0.05).LASS2表达与临床分期、浸润深度和淋巴结转移有关(P<0.05),而HOXB7表达与临床分期和淋巴结转移有关(P<0.05).HOXB7表达阳性患者的生存率低于HOXB7表达阴性患者,而LASS2表达阳性患者的生存率高于LASS2表达阴性患者(P<0.05).Cox比例风险回归分析结果显示,临床分期为Ⅲ期、有淋巴结转移、LASS2阴性表达、HOXB7阳性表达以及AI<2.0%均是影响CRC患者预后的危险因素(P<0.05).结论:在CRC组织中HOXB7阳性率升高,而LASS2阳性率以及AI下降,且与临床分期以及淋巴结转移密切相关.LASS2、HOXB7表达及AI与CRC患者的生存和预后联系密切.
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编辑人员丨2023/8/5
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冠状动脉粥样硬化性心脏病患者心外膜脂肪组织和皮下脂肪组织之间差异表达基因的生物信息学分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 利用生物信息学方法分析冠状动脉粥样硬化性心脏病(CAD)患者的心外膜脂肪组织(EAT)和皮下脂肪组织之间的差异表达基因,以探索CAD的发病机制.方法 从GEO数据库中下载CAD患者EAT和皮下脂肪组织的转录组测序数据和表达矩阵,包括2个数据集(GSE24425、GSE64554).应用edgeR算法筛选EAT和皮下脂肪组织之间的差异表达基因.针对差异表达基因进行基因本体论分析及京都基因与基因组百科全书信号通路分析,并构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络图.利用Cytoscape3.1.2软件和MCODE插件进行可视化分析并筛选关键基因,并预测可以调控关键基因的微小RNA(miRNA).结果 取两个数据集的交集后共得到76个差异表达基因,包括上调基因41个,下调基因35个,其主要涉及嗜酸性粒细胞趋化性、细胞对脂质的反应、细胞外基质、胚胎骨骼系统发育、上皮管形态发生、上皮细胞分化等生物学过程,且主要富集在细胞因子-细胞因子受体相互作用、朊病毒病、精氨酸和脯氨酸代谢信号通路中.从PPI网络中共获取10个关键基因,包括CC基序趋化因子配体(CCL)2、CCL5、CCL8、CCL21、早期生长反应蛋白2(EGR2)、白细胞介素7受体(IL-7R)、同源异型盒(HOX)A5、HOXB5、HOXB7和HOXC8,其中hsa-miRNA-196a-5p和hsa-miRNA-196b-5p与HOXA5、HOXB7、HOXC8高度相关.结论 CCL2、CCL5、CCL8、CCL21、EGR2、IL-7 R、HOXA5、HOXB5、HOXB7和HOXC8在CAD患者EAT中表达失调,EAT可能通过促炎和免疫途径参与CAD的发生、发展.
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编辑人员丨2023/8/5
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血清核转录因子红系2相关因子2表达与非小细胞肺癌分期和增殖基因表达的相关性分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨血清核转录因子红系2相关因子2(nuclear factor-erythroid 2-related factor 2,Nrf2)表达与非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)分期和增殖基因表达的相关性.方法 选取2018年1月至2020年1月宁夏医科大学总医院收治的120例NSCLC患者为研究对象,根据TNM分期将其分为早期组(Ⅰ期,25例)、中期组(Ⅱ~Ⅲ期,69例)和晚期组(Ⅳ期,26例),选取同期健康志愿者120例纳入对照组.比较四组研究对象血清Nrf2、Kelch样环氧氯丙烷相关蛋白-1(Kelch-like epichlorohydrin-associated protein 1,Keap1)表达水平,比较三组NSCLC患者增殖基因[CD59、配对盒基因6(paired box 6,PAX6)、同源异型盒基因B7(homeobox B7,HOXB7)]信使RNA(messenger RNA,mRNA)的相对表达量,采用Pearson相关分析探讨NSCLC患者血清Nrf2表达水平与增殖基因相对mRNA表达量的关系,绘制受试者操作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC曲线)评价血清Nrf2表达水平评估NSCLC恶性程度的诊断效能.结果 四组研究对象血清Nrf2、Keap1表达水平比较差异均有统计学意义(均P<0.05),且血清Nrf2、Keap1表达水平均为晚期组>中期组>早期组>对照组;三组患者肿瘤组织CD59、PAX6、HOXB7 mRNA相对表达量均显著高于癌旁正常组织(均P<0.05),晚期组肿瘤组织CD59、PAX6、HOXB7 mRNA相对表达量均显著高于早期组和中期组(均P<0.05),中期组肿瘤组织CD59、PAX6、HOXB7 mRNA相对表达量均显著高于早期组(均P<0.05);Pearson相关性分析结果显示,血清Nrf2表达水平与CD59、PAX6、HOXB7 mRNA相对表达量均呈显著正相关(RCD59=0.41,RPAX6=0.37,RHOXB7=0.39,均P<0.05);ROC曲线结果显示,血清Nrf2表达水平评估NSCLC恶性程度的曲线下面积为0.89;当选取血清Nrf2表达水平为18.51 ng/L时,灵敏度和特异度分别为94.8%和89.8%.结论 Nrf2参与了NSCLC的发生、发展,可有效反映肿瘤状态,预测患者病情严重程度.
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编辑人员丨2023/8/5
