-
微RNA-221、微RNA-182-5p及肿瘤坏死因子-α对肺炎支原体感染患儿伴气道高反应的预测价值
编辑人员丨1天前
目的:探讨微RNA(miR)-221、miR-182-5p及肿瘤坏死因子-α(TNF-α)对肺炎支原体(MP)感染患儿气道高反应性(AHR)的预测价值。方法:选取2020年1月至2022年12月我院儿科收治的328例MP感染患儿为研究对象,并按患儿是否伴发AHR分成AHR组( n=118)和非AHR组( n=210)。检测两组的miR-221、miR-182-5p及TNF-α水平,并获取相关临床资料,分析MP感染患儿发生AHR的危险因素,受试者工作特征曲线(ROC)评估miR-221、miR-182-5p及TNF-α对MP感染患儿发生AHR的预测价值。 结果:Logistic分析显示,病程、家族哮喘史、FEV1、FVC、miR-221、miR-182-5p及TNF-α水平均是MP感染患儿发生AHR的独立危险因素( P<0.05)。ROC曲线显示,miR-221、miR-182-5p及TNF-α水平单独及联合预测MP感染患儿发生AHR的AUC分别为0.756、0.861、0.618、0.899,三者联合预测MP感染患儿发生AHR的AUC高于单独预测( P<0.05)。 结论:miR-221、miR-182-5p及TNF-α是MP感染患儿发生AHR的独立危险因素,miR-221、miR-182-5p及TNF-α水平对MP感染患儿发生AHR均具有一定预测价值,三者联合预测时价值更高。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
X射线诱导非小细胞肺癌A549细胞凋亡的适应性反应及相关miRNA筛选的研究
编辑人员丨1天前
目的:研究X射线辐射诱导非小细胞肺癌(NSCLC) A549细胞凋亡的适应性反应,并筛选适应性反应相关的微RNA (miRNA)。方法:将NSCLC A549细胞分为6组,包括50 mGy+20 Gy、200 mGy+20 Gy、20 Gy、50 mGy、200 mGy照射组及对照组(0 Gy),前2组细胞分别用50、200 mGy初始剂量进行照射,培养6 h后用20 Gy的效应剂量进行照射,20 Gy、50 mGy、200 mGy照射组同时进行照射。培养24 h后使用流式细胞仪检测细胞凋亡情况。利用小RNA测序技术筛选差异表达miRNA,并对其靶基因进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路的功能富集分析。采用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)对部分差异表达miRNA进行验证。2组间数据的比较采用Welch t检验。 结果:50 mGy+20 Gy照射组和200 mGy+20 Gy照射组的A549细胞早期凋亡率分别为(1.81±0.11)%和(2.17±0.19)%,低于20 Gy照射组的(4.54±0.23)%,且差异均有统计学意义( t=10.680、8.006,均 P<0.01)。与20 Gy照射组相比,50 mGy+20 Gy照射组和200 mGy+20 Gy照射组共同差异表达趋势miRNA有1个上调(miR-3662)、15个下调(miR-185-3p、miR-1908-5p、miR-1307-5p、miR-182-3p、miR-92a-3p、miR-582-5p、miR-501-3p、miR-138-5P、miR-1260b、miR-484、miR-378d、miR- 193b-3P、miR-127-3p、miR-1303及miR-654-5p)。GO富集分析结果显示,差异表达miRNA调控靶基因功能显著富集于细胞通讯调节、代谢过程的正向调节、代谢信号的调节、酶结合及催化活性等过程。KEGG富集分析结果显示,靶基因相关信号通路显著富集于溶酶体、丝裂原活化蛋白激酶、Ras和内吞作用等信号通路。qRT-PCR检测结果显示,miRNA表达情况与基因芯片结果趋势一致(10个miRNA表达水平得到验证)。 结论:X射线50、200 mGy照射剂量均能诱导NSCLC A549细胞凋亡的适应性反应,并筛选到一组共同差异表达的miRNA,可能在X射线辐射诱导细胞凋亡的适应性反应中发挥了重要作用,有可能成为调节电离辐射生物效应的潜在靶点。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
全反式维甲酸调控miRNA-34a-E2F1-Eag1信号通路抑制骨肉瘤细胞增殖和侵袭的体外研究
编辑人员丨1天前
目的:探讨全反式维甲酸(ATRA)对骨肉瘤143B细胞增殖和侵袭的影响及其可能的调控机制。方法:采用不同浓度ATRA处理人骨肉瘤143B细胞,选取影响细胞增殖的最佳浓度和处理时间。分别采用MTS法、Transwell迁移和侵袭实验检测ATRA处理后143B细胞增殖、迁移和侵袭能力变化。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)和蛋白质印迹法检测ATRA处理后骨肉瘤143B细胞中miRNA-34a(miR-34a)、E2F1和Eag1的表达变化。干扰miR-34a和过表达E2F1,检测143B细胞增殖、侵袭和迁移能力以及miR-34a、E2F1和Eag1表达的变化。结果:ATRA浓度为10 μmol/L、处理72 h对143B细胞增殖的抑制作用最明显。10 μmol/L ATRA作用72 h的迁移细胞数、侵袭细胞数均低于阴性对照组[(73±3)个比(182±5)个, t=21.46, P<0.01;(94±3)个比(203±7)个, t=13.70, P<0.01]。10 μmol/L ATRA可促进143B细胞中miR-34a的表达,抑制Eag1和E2F1的表达(均 P<0.01)。与ATRA组比较,处理72 h后ATRA+miR-34a干扰组可恢复细胞的增殖能力[细胞存活率(41.0±2.2)%比(25.0±3.6)%, t=108.68, P<0.01]。与ATRA组比较,ATRA+miR-34a干扰组可恢复细胞的迁移和侵袭能力[(122±14)个比(64±10)个, t=21.06, P<0.01;(103±10)个比(59±8)个, t=24.27, P<0.01],并可促进细胞中Eag1和E2F1的mRNA和蛋白表达(均 P<0.01)。与ATRA组相比,ATRA+E2F1过表达组可恢复细胞的增殖能力[细胞存活率(40.0±3.4)%比(24.0±3.1)%, t=108.74, P<0.01],可恢复细胞迁移和侵袭能力[(78±12)个比(29±8)个, t=13.52, P<0.01;(75±12)个比(49±10)个, t=6.28, P<0.01)],并促进细胞中Eag1和E2F1的mRNA和蛋白表达(均 P<0.01)。 结论:ATRA通过调控miRNA-34a-E2F1-Eag1信号通路抑制骨肉瘤细胞增殖和侵袭,其可能成为骨肉瘤有效的治疗药物之一。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
肝细胞癌患者射频消融术后24 h超声造影联合血清miRNA-182-5p对消融效果及术后复发的预测价值
编辑人员丨1天前
目的:探讨肝细胞癌(HCC)患者射频消融术后24 h超声造影定量参数联合血清miRNA-182-5p(miR-182-5p)在预测消融效果及术后复发方面的价值。方法:回顾性病例系列研究。回顾性分析泸州市中医医院2018年6月至2020年6月收治的113例行射频消融治疗的HCC患者临床资料。患者均于术后24 h行超声造影检查,记录相关定量参数,包括上升时间(RT)、峰值强度(PI)、达峰时间(TTP)。术后24 h采集患者外周静脉血,采用实时定量聚合酶链反应检测血清miR-182-5p水平。分析患者术后1个月消融效果及术后2年复发情况,比较完全消融组与未完全消融组、复发组与未复发组患者射频消融术后24 h超声造影定量参数与血清miR-182-5p水平。绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析肝癌患者射频消融术后24 h超声造影定量参数与miR-182-5p预测患者消融效果及术后复发的效能。结果:113例患者年龄(47±11)岁,包括男性70例,女性43例。未完全消融组术后24 h超声造影PI、RT、TTP及血清miR-182-5p水平均低于完全消融组[(135.46±19.58)dB比(195.52±23.59)dB、(9.49±1.13)s比(11.99±1.65)s、(11.46±1.79)s比(15.35±2.16)s、0.43±0.11比0.66±0.13],差异均有统计学意义( t值分别为10.84、6.59、7.67、6.53,均 P<0.05)。复发组患者术后24 h超声造影PI、RT、TTP及血清miR-182-5p水平均低于未复发组[(141.74±22.48)dB比(192.46±23.25)dB、(8.16±1.74)s比(12.16±2.12)s、(10.03±1.79)s比(15.49±2.41)s、0.35±0.08比0.67±0.11],差异均有统计学意义( t值分别为8.53、7.53、9.13、11.75,均 P<0.05)。ROC曲线显示,超声造影RT、TTP及血清miR-182-5p预测消融效果的曲线下面积(AUC)分别为0.751、0.802、0.786,三者联合的AUC则为0.890;术后24 h超声造影RT、TTP及血清miR-182-5p预测患者术后复发的AUC分别为0.772、0.782、0.773,三者联合的AUC则为0.882。 结论:HCC患者射频消融术后24 h超声造影RT、TTP以及血清miR-182-5p在预测消融效果及术后复发中具有一定的价值。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
达格列净对2型糖尿病早期糖尿病肾病患者尿外泌体微RNA的影响
编辑人员丨1天前
目的:探讨达格列净对2型糖尿病(T2DM)早期糖尿病肾病(DKD)患者尿外泌体微RNA(miRNA)的影响。方法:选取2018年9月至2019年9月于徐州医科大学附属淮安医院内分泌科住院的T2DM早期DKD患者60例。将纳入的患者按照尿微量白蛋白与尿肌酐比值(UACR)进行分组,其中30 mg/g
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
miR-182靶向调控AQP5基因介导Wnt信号通路对子宫内膜异位症小鼠子宫内膜腺上皮细胞增殖、侵袭的调控机制
编辑人员丨1天前
目的:阐明miR-182靶向调控水通道蛋白5(aquaporin5,AQP5)基因介导Wnt信号通路对子宫内膜异位症(endometrrosis,EMs)小鼠子宫内膜腺上皮细胞增殖、侵袭的影响。方法:构建EMs小鼠模型。取小鼠子宫内膜腺上皮组织并检测组织中miR-182、AQP5的表达。酶联免疫吸附法检测正常和EMs模型小鼠炎性因子表达。随后分离小鼠子宫内膜腺上皮细胞。qRT-PCR和Western blot检测细胞中miR-182、AQP5、Wnt通路相关因子(Wnt-1、β-catenin)的表达。MTT、Transwell分别检测细胞的增殖活力和侵袭能力。结果:与Normal组小鼠相比,EMs组小鼠子宫内膜腺上皮组织中miR-182表达降低,AQP5及Wnt-1、β-catenin表达升高(均 P<0.05)。细胞实验中,过表达miR-182或沉默AQP5能抑制Wnt通路相关因子(Wnt-1、β-catenin)的表达。同时,细胞的增殖活力降低,侵袭能力下降(均 P<0.05)。miR-182 inhibitor组各项指标表达与miR-182 mimic组相反。EMs细胞转染sh-AQP5的影响能被miR-182 inhibitor抵消。 结论:上调miR-182能靶向抑制AQP5的表达,通过抑制Wnt信号通路的激活进而减少EMs小鼠子宫内膜腺上皮细胞的增殖、侵袭。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
基于生物信息学构建胰腺癌患者预后相关miRNA预测模型及其应用价值
编辑人员丨1天前
目的:探讨基于生物信息学构建胰腺癌患者预后相关微小RNA(miRNA)预测模型及其应用价值。方法:采用回顾性队列研究方法。收集肿瘤基因图谱计划(TCGA)数据库(https://cancergenome.nih.gov/)自建库起至2017年9月171例胰腺癌患者的临床病理资料;男93例,女78例;中位年龄为65岁,年龄范围为35~88岁。171例患者中,64例临床病理资料完整。171例患者采用随机抽样法按7∶3比例分为训练集123例和测试集48例。训练集用于构建预测模型,测试集用于验证预测模型效能。从GEO基因公共表达数据库中下载包含9对胰腺癌及对应癌旁组织的miRNA测序数据的数据集GSE41372,从癌组织及癌旁组织差异表达的miRNA中筛选出候选差异表达miRNA,基于训练集患者信息,进行LASSO-COX回归分析,从候选差异表达miRNA中筛选出与生存相关miRNA,将其拟合成一个相对精简的预后相关miRNA模型。分别在训练集和测试集中对构建的预后相关miRNA模型的预测效能进行验证,以受试者工作曲线下面积(AUC)评价模型准确性,以一致性指数(C-index值)评价模型效能。观察指标:(1)患者生存情况。(2)差异表达miRNA筛选结果。(3)预后相关miRNA模型的构建。(4)预后相关miRNA模型的验证。(5)胰腺癌患者临床病理因素比较。(6)影响胰腺癌患者预后的相关因素分析。(7)预后相关miRNA模型与第8版TNM分期预测效能的比较。正态分布的计量资料以 ± s表示,两组间比较采用Student- t检验,多组间比较采用方差分析。偏态分布的计量资料以 M(范围)表示,组间比较采用Mann-Whitney U检验。计数资料以绝对数或百分比表示,组间比较采用 χ2检验。等级资料分析采用秩和检验。采用计数资料相关性分析,挖掘预后相关miRNA模型与患者临床病理参数之间的相关性。采用COX进行单因素及多因素分析,并判断相关性,结果以风险比及95%可信区间表示,风险比<1时,证明该因素为保护因素;风险比>1时,证明该因素为危险因素;风险比=1时,说明对生存无明显影响。采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线并计算生存率,采用Log-rank检验进行生存分析。 结果:(1)患者生存情况:123例训练集患者随访时间为31~2 141 d,中位随访时间为449 d,3、5年总体生存率分别为16.67%、8.06%。48例测试集患者随访时间为41~2 182 d,中位随访时间为457 d,3、5年总体生存率分别为15.63%、9.68%。两组患者3、5年总体生存率比较,差异均无统计学意义( χ2=0.017,0.068, P>0.05)。(2)差异表达miRNA筛选结果:生物信息学分析结果显示,共筛选102个候选差异表达miRNA,其中63个miRNA在癌组织中上调,39个miRNA在癌组织中下调。(3)预后相关miRNA模型的构建:在102个候选差异表达基因中,筛选出5个与生存相关的miRNA。名称分别为miR-21、miR-125a-5p、miR-744、miR-374b、miR-664,差异表达模式(癌组织对比癌旁组织)分别为升高、升高、降低、升高、降低,差异表达倍数分别为4.00、3.43、3.85、2.62、2.35倍。由5个与生存相关miRNA构建的预后表达方程=0.454×miR-21表达量-0.492×miR-125a-5p表达量-0.49×miR-744表达量-0.419×miR-374b表达量-0.036×miR-664表达量。(4)预后相关miRNA模型的验证:在训练集和测试集中,预后相关miRNA模型C-index值分别为0.643和0.642。(5)胰腺癌患者临床病理因素比较:COX分析结果显示,预后相关miRNA模型与肿瘤病理学T分期和肿瘤位置具有相关性( Z=45.481, χ2=10.176, P<0.05)。(6)影响胰腺癌患者预后的相关因素分析:单因素分析结果显示为肿瘤病理学N分期、接受放射治疗、接受分子靶向治疗、预后相关miRNA模型评分是胰腺癌患者预后的相关因素(风险比=2.471,0.290,0.172,2.001,95%可信区间为1.012~6.032,0.101~0.833,0.082~0.364,1.371~2.922, P<0.05)。多因素分析结果显示:接受分子靶向治疗是胰腺癌患者预后的独立保护因素(风险比=0.261,95%可信区间为0.116~0.588, P<0.05);预后相关miRNA模型评分≥1.16分是胰腺癌患者预后的独立危险因素(风险比=1.608,95%可信区间为1.091~2.369, P<0.05)。(7)预后相关miRNA模型与第8版TNM分期预测效能的比较:在训练集中,预后相关miRNA模型对胰腺癌患者3、5年生存时间预测概率与第8版TNM分期比较,差异有统计学意义( Z=-1.671,-1.867, P<0.05)。预后相关miRNA模型与第8版TNM分期AUC分别为0.797、0.935与0.737、0.703,95%可信区间分别为0.622~0.972、0.828~1.042与0.571~0.904、0.456~0.951;C-index值分别为0.643与0.534。在测试集中,预后相关miRNA模型对胰腺癌患者3、5年生存时间预测概率与第8版TNM分期比较,差异有统计学意义( Z=-1.729,-1.923, P<0.05)。预后相关miRNA模型与第8版TNM分期AUC分别为0.750、0.873与0.721、0.703,95%可信区间分别为0.553~0.948、0.720~1.025与0.553~0.889、0.456~0.950;C-index值分别为0.642与0.544。 结论:基于5个与胰腺癌生存相关miRNA构建可用于胰腺癌患者生存预测的预后相关miRNA模型。该模型可与现有TNM分期系统及其他临床病理参数形成互补,为患者提供个体化、准确的生存时间预测,为临床治疗提供参考。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
山茱萸提取物对人前列腺癌PC3细胞增殖、凋亡及Bcl-2和miR-182的影响
编辑人员丨1天前
目的:探讨山茱萸提取物对人前列腺癌PC3细胞增殖、凋亡及B细胞淋巴瘤/白血病-2(Bcl-2)和miR-182的影响。方法:制备山茱萸提取物,根据MTT法确定山茱萸提取物对人前列腺癌PC3细胞的半数抑制浓度。实验分为阴性对照组、阳性对照组、低剂量组、中剂量组和高剂量组。阴性对照组细胞不进行处理;阳性对照组采用终浓度5 mg/L的顺铂干预细胞;低剂量组、中剂量组和高剂量组分别用终浓度为20、40、80 mg/L的山茱萸提取物干预细胞,48 h后,采用流式细胞术检测各组PC3细胞的凋亡率。采用实时荧光定量PCR检测各组PC3细胞中miR-182、Bcl-2和促凋亡因子(Bax) mRNA水平,同时采用蛋白印迹法检测各组PC3细胞中Bcl-2和Bax蛋白水平。结果:随着山茱萸提取物浓度增加,PC3细胞的增殖率降低( P<0.05)。当山茱萸提取物浓度为80 mg/L时,增殖率最先降到50%左右,故选择80 mg/L作为半数抑制浓度。与阴性对照组比较,其余各组细胞的凋亡率、miR-182和Bax mRNA水平、Bax蛋白水平增加,Bcl-2 mRNA和蛋白水平降低,差异均有统计学意义(均 P<0.05);与阳性对照组比较,低、中、高剂量组细胞的凋亡率、miR-182和Bax mRNA水平、Bax蛋白水平降低,Bcl-2 mRNA和蛋白水平增加,且随着山茱萸提取物剂量增加,各指标呈剂量反应关系,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。 结论:山茱萸提取物可诱导PC3细胞凋亡,抑制PC3细胞增殖,其机制可能与山茱萸提取物通过上调miR-182表达进而抑制Bcl-2活性有关。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
长链非编码RNA HAGLR对乳腺癌预后的影响及其竞争性内源RNA互作网络的构建
编辑人员丨1天前
目的:探究长链非编码RNA(lncRNA)HAGLR在乳腺癌中的表达情况及其对乳腺癌预后的影响,并构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络。方法:采用Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology网站检索HAGLR基因染色体定位及转录本表达情况。采用lnclocater网站预测HAGLR亚细胞定位。通过lnCAR数据库分析HAGLR在乳腺癌组织和癌旁组织的差异表达情况,按HAGLR表达水平,将lnCAR数据库患者分为HAGLR高表达组和HAGLR低表达组,采用Kaplan-Meier法分析两组间总生存(OS)及无转移生存情况,并通过UCSC Xena数据库进行验证。通过lnCAR数据库检索HAGLR共表达基因,将排位前200个共表达基因提交至Metascape网站,进行基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,构建蛋白互作网络(PPI)。采用生物信息学在线分析网站starbase预测HAGLR靶向的微RNA(miRNA)和可直接编码蛋白的mRNA,通过Cytoscape3.8软件构建HAGLR的ceRNA网络。结果:HAGLR基因定位于2q31.1,主要分布于细胞质;HAGLR在乳腺癌组织中的表达水平高于癌旁组织,差异有统计学意义( P<0.001)。对lnCAR数据库和UCSC Xena数据库分析均显示,HAGLR高表达组OS较低表达组均差(均 P<0.01);lnCAR数据库中HAGLR高表达组无转移生存较低表达组差( P=0.030)。前200个HAGLR共表达基因中与HAGLR负相关基因129个,与HAGLR正相关基因71个。KEGG通路分析显示,HAGLR与代谢通路、MAPK信号通路、JAK-STAT信号通路及癌症通路有关;GO注释分析显示,HAGLR主要富集在细胞周期、着丝粒复合体组装、有丝分裂进程、蛋白激酶结合、激酶活性的调节、细胞对DNA损伤刺激的反应等多种功能中。hsa-miR-130b-3p、hsa-miR-1245b-5p、hsa-miR-182b-5p、hsa-miR-512-3p、hsa-miR-302b-3p、hsa-miR-185b-5p、hsa-miR-106b-5p为HAGLR靶向miRNA。 结论:HAGLR在乳腺癌组织中高表达,其可能是乳腺癌预后预测的生物标志物。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
miR-182-5p调控初级纤毛的缺失增加甲状腺乳头状癌细胞系TPC-1的迁移
编辑人员丨1天前
目的:探讨miR-182-5p调控初级纤毛的缺失对甲状腺乳头状癌(PTC)细胞系TPC-1迁移的影响。方法:收集10例兰州大学第一医院PTC组织和癌旁组织,qPCR检测癌旁组织、PTC组织和TPC-1细胞中miR-182-5p的表达量,免疫荧光检测初级纤毛的形成;过表达miR-182-5p,qPCR和Western blot检测TPC-1细胞中PI3K的表达量,Transwell实验检测TPC-1细胞迁移数量,免疫荧光检测初级纤毛的形成;siRNA-IFT88干扰TPC-1细胞,Transwell实验检测TPC-1细胞迁移数量,免疫荧光检测初级纤毛的形成,吉姆萨染色检测形态学变化,Western blot检测E-cadherin和N-cadherin的蛋白表达量。结果:与癌旁组织相比,PTC组织中初级纤形成受损;miR-182-5p表达量显著上调。与Nthy-ori3-1相比,TPC-1细胞中初级纤毛的频率减少;miR-182-5p表达量显著上调( P=0.001);miR-182-5p mimic治疗后的TPC-1细胞中PI3K的表达量降低,迁移数量增加( P=0.001),初级纤毛频率降低为27%( P=0.002);siRNA-IFT88治疗后的TPC-1细胞表面初级纤毛变短变细,频率减少( P=0.001),迁移数量增加( P<0.001)。 结论:miR-182-5p通过PI3K通路调控初级纤毛的缺失有助于TPC-1细胞的迁移,初级纤毛的丢失对PTC预后具有不利的影响。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
