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基于高通量测序技术分析人工圈养成年蜂猴的粪便微生物多样性
编辑人员丨1个月前
目的 研究成年蜂猴的肠道菌群组成情况,以探讨人工圈养蜂猴的健康影响因素.方法 采集4只成年雄性蜂猴的粪便样本,运用细菌16S rDNA通用引物扩增V4区,应用Illumina NovaSeq测序平台对蜂猴粪便微生物进行测序分析,并使用Qiime软件分析样本的复杂度和相似度.基于有效数据分析样本肠道菌群在门、属水平上的物种结构和丰度,同时应用PICRUSt软件进行菌群的代谢功能预测.结果 年龄最小的蜂猴的肠道菌群多样性指数shannon高于其他蜂猴.PCoA分析显示4只蜂猴的样本菌群组成具有一定的相似度.4只蜂猴的粪便中细菌共鉴定出了 12个门、18个纲、28个目、49个科、93个属和59个种.其中,优势菌门是拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes),平均相对丰度分别为46%和28%;拟杆菌属(Bacteroides)、双歧杆菌属(Bifidobacterium)和梭菌属(Fusobacterium)的丰度较高,平均相对丰度分别为33%、6%和6%;有益菌群双歧杆菌属在4个蜂猴粪便样本中都存在,且在年龄较小的蜂猴中相对丰度最高.PICRUSt功能预测分析显示,蜂猴粪便菌群中氨基酸转运和代谢、碳水化合物转运和代谢等功能基因的丰度相对较高.结论 应用Illumina NovaSeq高通量测序技术可以较全面地检测蜂猴的粪便菌群.蜂猴粪便中细菌组成具有丰富的多样性,其中还有许多未被分类鉴定且相对丰度较高的细菌,需要进一步研究.
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编辑人员丨1个月前
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基于动物移动的空间记忆研究进展
编辑人员丨2024/4/27
许多动物类群在家域范围内迁移或长距离季节性迁徙的过程中表现出很强的方向性和规律性,它们可以整合显著的空间线索进行目的地识别、导航,并记忆栖息地内可获得的食物种类、食物斑块的分布以及食物成熟的季节等信息,并构建空间认知地图,表现出空间记忆能力.本文全面梳理了圈养实验、自然环境下的野外实验、自然状态移动轨迹的观测和分析以及数字虚拟实验环境下探索动物空间记忆研究,归纳了上述研究中研究方法的特点和适用范围,并针对未来研究趋势进行展望.多学科交叉,多场景应用以及动物空间记忆生态模型的研发已成为该领域的主要发展趋势.动物空间记忆的研究可以从新的视角深入探讨动物栖息地利用机制、移动的内在驱动因素和生物多样性的维持机制.此外,该研究领域还可为保护濒危物种、缓解人兽冲突及增加圈养动物福利等野生动物管理实践提供科学依据和参考.
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编辑人员丨2024/4/27
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四川王朗国家级自然保护区岩羊肠道菌群组成分析
编辑人员丨2024/3/16
为了揭示四川王朗国家级自然保护区野生岩羊Pseudois nayaur肠道菌群的组成和影响因素,于2023年4-5月收集了保护区内5个分布点的野生种群和成都动物园圈养种群共53份新鲜粪便样品.通过16S V3~V4区通用引物的PCR产物高通量测序,得到7 202 473条序列.序列分析显示,厚壁菌门Firmicutes(65%)和拟杆菌门Bacte-roidota(14%)是主要菌群;α多样性分析显示,外侧坡和大草坪的观察物种指数差异不显著(P>0.05),但均显著低于金草坡和铁板房(P<0.01);β多样性分析显示,圈养种群富集WCHB1_41、Mailhella属和赖氨酸芽孢杆菌属Lysiniba-cillus;外侧坡和大草坪的肠道菌群最相似,马熊沟的变化最大;LEFSe分析结果显示,16个属可用于区分不同地点的野生岩羊.研究结果为保护区不同分布地点岩羊保护策略的制定提供了基础资料和理论指导.
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编辑人员丨2024/3/16
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不同饲养方式对英国短毛猫生长性能及血液指标的影响
编辑人员丨2024/2/3
目的 研究适合实验用猫饲养的方式.方法 将 18 只 7 月龄的英国短毛猫雌猫随机分成 3 组,每组 6 只,分别采用笼养、定期放养以及圈养等 3 种方式进行饲养,实验总共为 8 周.测定并分析比较各组实验猫的体质量、平均日增重、日均采食量、日均饮水量、血液生理生化指标.结果 饲养方式的不同不会对 7~9 月龄实验猫体质量造成显著影响(P>0.05);实验第 1 周,定期放养组平均日增重要显著高于圈养组(P<0.05),第 3 周开始,圈养组和定期放养组在生长性能指标上并没有表现出显著差异;笼养组实验猫体质量增长速度与另外两组相比增长较慢,于第 4、6、8 周分别产生了显著差异(P<0.05),而在日均采食量方面,第 1 周定期放养组显著高于笼养组(P<0.05),第 2 周定期放养组极显著高于圈养组和笼养组(P<0.01),在日均饮水量方面,第 4 周定时放养组显著高于笼养组(P<0.05);淋巴细胞比率(LY%)检测结果显示,圈养组极显著低于定期放养组和笼养组(P<0.01),中性细胞数(NE)检测结果显示,圈养组显著高于笼养组(P<0.05),血小板分布宽度(PDW)检测结果显示,圈养组显著低于定期放养组和笼养组(P<0.05);总胆固醇(T-CH)检测结果显示,圈养组显著低于定期放养组和笼养组(P<0.05).结论 定时放养方式更适合实验用猫的长期饲养.
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编辑人员丨2024/2/3
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圈养条件下新疆马鹿两个亚种的肠道菌群比较分析
编辑人员丨2023/12/30
肠道菌群组成复杂,与宿主肠道内环境动态平衡和健康息息相关.马鹿是鹿科动物中分布最广的种类,亚种分化众多,但现有马鹿肠道菌群研究较少.为丰富马鹿肠道菌群数据,以马鹿的两个亚种为阶元,运用高通量16S rRNA基因测序技术检测了7 头雄性天山马鹿和 7 头雄性塔里木马鹿的肠道微生物,对其核心菌群、结构组成、多样性及肠道微生物的差异进行分析,旨在了解不同马鹿亚种肠道微生物组成差异,为两亚种间肠道菌群的差异提供参考.研究结果表明,塔里木马鹿菌群多样性及丰度低于天山马鹿.厚壁菌门(Fir-micutes)、放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)及拟杆菌门(Bacteroidetes)为两组马鹿的优势菌门.此外,天山马鹿肠道中分解蛋白质、脂质的拟杆菌门和变形菌门相对丰度高于塔里木马鹿,而分解植物纤维的双歧杆菌(Bifidobacterium)、瘤胃球菌科UCG 014(Ruminococcaceae UCG 014)的相对丰度低于塔里木马鹿.本研究对天山马鹿及塔里木马鹿肠道菌群组成进行初步了解,可根据研究结果调整其饲料配比,为马鹿饲养管理的改善提供参考.
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编辑人员丨2023/12/30
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圈养大熊猫肠道乳酸菌分离及益生特性
编辑人员丨2023/12/9
[背景]大熊猫数量稀少、繁殖困难,在其生长过程中极易感染消化系统疾病甚至死亡.[目的]分析圈养大熊猫肠道可培养乳酸菌的群落结构与功能,筛选具有益生特性的乳酸菌菌株,为大熊猫消化系统疾病的预防和肠道微生物研究提供理论参考及菌种资源.[方法]采用 3 种培养基分离大熊猫粪便中的乳酸菌,通过革兰氏染色镜检和过氧化氢试验对分离的菌株进行初步鉴定,基于BOXA1R-PCR图谱遗传多样性选取代表菌株进行 16S rRNA基因测序分析并进行主成分分析(principal component analysis,PCA),同时分析乳酸菌菌株安全性和益生特性.[结果]通过初步鉴定共分离获得 58 株乳酸菌,根据 BOXA1R-PCR 结果挑选 20 株菌进行测序,结果显示20 株菌分属于明串珠菌属(Leuconostoc)、肠球菌属(Enterococcus)、魏斯氏菌属(Weissella)和链球菌属(Streptococcus)这 4 个属,主成分分析结果表明不同年龄段的大熊猫肠道乳酸菌群落结构存在差异.20株乳酸菌均不溶血,17株乳酸菌对 11种抗生素均敏感;11株菌耐pH值 2.0酸性条件,14 株菌对 0.3%的胆盐具有良好的耐受性.5 株菌SW-51、SW-48、MQ-41、SW-58 和MX-23 对 3 种指示菌均具有抑菌效果,50%以上的供试菌株具有自凝聚和共凝聚能力,3 株菌的产酸和生长速率较一致,其中乳酸明串珠菌(Leuconostoc lactis)MX-23 生长最快且产酸能力最强.[结论]大熊猫肠道内蕴藏着丰富的乳酸菌资源,其结构与组成受其年龄影响,具有较好的益生特性和应用前景.
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编辑人员丨2023/12/9
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北京动物园圈养野生动物病原菌分布及耐药性分析
编辑人员丨2023/10/28
对北京动物园2005-2016年病死野生动物病原菌分离的情况统计分析发现,在168种537只动物的935份样本中,307只动物的515份样本分离到病原菌580株,检出率为57.17%;其中,革兰氏阴性菌占62.20%,同时还发现大肠杆菌Escherichia coli、链球菌属Streptococcus、肺炎克雷伯氏菌Klebsiella pneumoniae、魏氏梭菌Clostridium welchii和铜绿假单胞菌Pseudomonas aeruginosa等.病变脏器以肝脏(31.33%)和肺脏(22.46%)最多,肺脏标本的病原菌检出率最高(62.38%),说明呼吸系统疾病在圈养野生动物疾病中的占比较高.部分菌株的药敏试验结果显示,病原菌对磺胺、青霉素的耐药性为25.00%~78.57%,而对头孢曲松、庆大霉素等的耐药性为10.00%~36.36%.本结果可以指导临床治疗用药,避免耐药菌株的产生.
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编辑人员丨2023/10/28
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圈养普氏野马对夏季高温生理应答的非损伤性研究
编辑人员丨2023/8/6
为研究圈养普氏野马Equus przewalskii对夏季高温刺激的生理应答,采用非损伤性取样法和放射性免疫法,随机选取5个圈养家族群中的成年雄马、成年雌马和成年带驹雌马各5匹,对其夏季高温期粪便内糖皮质激素和三碘甲腺原氨酸(T3)代谢产物的水平进行了测定.结果表明:(1)普氏野马在夏季高温期间一直维持在较高的激素水平;(2)不同类群的糖皮质激素代谢产物水平之间的差异有统计学意义(R2.60=22.885,P<0.001),成年雄马>成年雌马>成年带驹雌马;(3)不同类群的T3代谢产物水平之间的差异有统计学意义(F2.60=37.780,P<0.00l),成年雌马>成年雄马>成年带驹雌马;(4)3组组内不同应激程度(THI> 28.9 vs.THI≤28.9)下的激素水平差异无统计学意义,且组别与应激程度不存在交互作用.鉴于圈养普氏野马在夏季高温期不同类群的生理应答水平不同,建议对野马分组、分圈进行管护,防止高温造成意外损失;同时,建议利用非损伤性取样法对罔养普氏野马生理状况进行监测,为管理者进行有效的生存管理提供基础资料.
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编辑人员丨2023/8/6
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饿死1例分析
编辑人员丨2023/8/6
1 案例资料某年7月25日,营口市某刑警大队接到报案称:张某饿死于家中.民警到达派出所后了解到:死者张某33岁,精神不正常,无独自生活能力,常年被圈养于家中.尸表检验女性尸体,身长162cm.发育正常,极度消瘦.头面部及胸腹部尸绿形成.尸斑浅淡,分布于肩背部、臀部及四肢背侧,压之不褪色.尸僵全部缓解.头皮表面未见异常.双眼球睑结膜苍白,未见出血点,角膜轻度混浊,双瞳孔等大正圆,左、右直径均为0.7cm.鼻骨居中,未触及骨折.双侧乳房基本消失,胸廓肋骨印迹明显,腹部凹陷、舟状腹,胸腹部皮肤表面未见异常.外阴萎缩,阴毛稀疏.双上肢前臂上段内侧皮肤青紫变色,大小3.5cm×1.5cm.左前臂上段外侧皮肤青紫变色,大小5cm×2cm.左手掌拇指侧皮肤青紫变色,大小4cm×1.5cm.左手拇指皮肤青紫变色,大小2.5cm×1.5cm.右手掌拇指侧皮肤青紫变色,大小5cm×1.5cm.双手指端青紫色.骶尾部及肛门周围压疮形成,大小12cm×10cm,局部溃烂.左小腿上段前侧皮肤紫黑色,大小7cm×6cm.左小腿中段前外侧陈旧性青紫变色,大小16cm×7cm.右小腿膝关节下、小腿前侧多处皮肤青紫变色,最大一处大小为3.5cm×3.5cm.右小腿上段外侧片状皮肤青紫变色,大小3.5cm×1.5cm.四肢未见骨折.切开左小腿中段前外侧可见在皮肤暗紫红变色区相应部位皮下脂肪片状出血.(图1)
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编辑人员丨2023/8/6
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休情状态下圈养麋鹿昼间冲突行为初步分析
编辑人员丨2023/8/6
为了探讨休情期麋鹿Elaphurus davidianus冲突行为与等级序位的关系以及冲突行为的促发因素,于2015年4月、11月和2016年12月采用扫描取样法对江苏大丰麋鹿国家级自然保护区的圈养麋鹿昼间冲突行为进行了观察,共记录到1 452次冲突行为.结果显示:同年龄阶段雄鹿的等级序位高于雌鹿;同性别的成年体壮个体的等级序位高于未成年个体;麋鹿昼间冲突行为的表达方式与麋鹿自身体表特征有关,冲突行为的表达方式在硬角期、脱角生茸期和茸角硬化期3个阶段之间的差异有高度统计学意义(P<0.01);休情期因争夺食物资源发生冲突行为的比例最高(61.55%),从动者的行为以采食行为比例最高(36.61%),3个阶段之间和上、下午的差异均无统计学意义(P>0.05);休情期内冲突的激烈程度偏低,从动者反抗次数少(20.25%).本文为大丰麋鹿种群的饲养、管理与驯化,以及麋鹿迁地保护提供参考依据.
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编辑人员丨2023/8/6
