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甘肃省首例H7N9禽流感病例流行病学及病原学特征
编辑人员丨3天前
目的:分析甘肃省首例人感染H7N9禽流感病例流行病学特征,为H7N9禽流感防控提供科学依据。方法:采用流行病学调查方法调查甘肃省首例人感染H7N9禽流感病例的发病和就诊经过、可能感染来源、传播途径及暴露因素等,并排查密切接触者实施健康医学观察,同时开展外环境采样检测和疫点消毒。结果:甘肃省确诊的首例人感染H7N9禽流感本地感染病例为82岁男性,城市居民,2017年3月29日因发热、全身乏力前往私人诊所就诊,4月3日到酒泉市医院就诊,有在检出H7N9病毒核酸的活禽销售店附近活动史,咽拭子检测H7N9禽流感病毒核酸阳性;该病例经治疗于发病17 d后治愈出院;9名密切接触者实施为期7 d的医学健康观察,未出现健康异常;强化监测全市共报告流感样病例和不明原因肺炎357例,H7N9禽流感病毒核酸阳性2例。酒泉市发现的3例H7N9病例均有活禽市场暴露史,其中1例死亡。结论:暴露于出现H7N9禽流感病毒的外环境是人感染H7N9主要危险因素,需要加强散养家禽和活禽市场管理;外环境禽流感监测对人感染H7N9禽流感防控具有重要的预警作用。
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编辑人员丨3天前
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军团病发病趋势和感染特征的研究进展
编辑人员丨3天前
军团菌广泛存在于水源和土壤中,是引起社区获得性肺炎的常见病原体。军团病主要由嗜肺军团菌1型引起,其临床表现多样,主要为庞蒂亚克热和肺炎。近年来,部分国家和地区的军团病发病率升高,其原因尚不明确。新型冠状病毒感染疫情期间的公共卫生防控策略也给军团病的发病水平造成了一定影响。为进一步做好军团病的预防控制工作,一方面需逐步建立完善我国军团病监测网络,开展病例监测、外环境监测和病原学监测工作,持续关注军团病疫情动态;另一方面需从病原学、免疫学、生态学等方面开展全面深入的研究。
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编辑人员丨3天前
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甘肃省人感染和外环境来源的H9N2禽流感病毒基因特征分析
编辑人员丨3天前
目的:分析甘肃省发现的人感染H9N2禽流感病毒分离株全基因组特征。方法:对甘肃省2016年流感样病例中发现并确诊的1例人感染H9N2禽流感病毒病例进行病原学分析,并使用MEGA 7.0等软件解析该毒株全基因组特征。结果:该毒株HA、NA、MP、NP、NS、PA、PB1和PB2各个基因片段与甘肃省2014-2019年外环境中分离获得的H9N2禽流感病毒各基因片段高度相似,且均>90%;其HA基因属于BJ/94-like支系,PB2和MP属于G1/97-like支系,PB1、PA、NS和NP基因属于F/98-like支系,MP和PB2与H7N9、H10N8和H5N6亲缘关系较近;氨基酸序列比对发现HA裂解位点呈PSRSSR↓GLF排列,发生H183N和Q226L突变,有7个HA糖基化位点;NA茎部62~64位均缺失ITE 3个氨基酸;M2-31N、NS1-42S、PA-356R和PA-409N突变。结论:人感染H9N2禽流感病毒为偶发感染,但甘肃省外环境中分离的H9N2禽流感病毒具有一系列哺乳动物适应性分子标记,提示人群感染风险较高,需多部门加强监测,共同应对流感大流行。
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编辑人员丨3天前
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北京市通州区外环境禽流感病毒的流行分布及基因特征分析
编辑人员丨3天前
目的:通过对2021—2022年北京市通州区农贸市场的外环境及相关人员标本的禽流感病毒检测结果及基因特征分析,为我市禽流感防控策略提供依据。方法:2021—2022年共采集外环境及食品涂抹标本2 184例,相关人员咽拭子标本124例。利用实时荧光RT-PCR法对标本进行核酸检测,采用illumina二代测序平台对病毒载量高的阳性标本进行全基因组测序,分析其基因特征。结果:实时荧光RT-PCR核酸检测结果显示,外环境及食品涂抹标本检出2例H5N8阳性、78例H7N9阳性、177例H9N2阳性、2例H5N8和H9N2共感染、1例H7N9和H9N2共感染,124例人员标本检测结果均为阴性。对病毒载量高的阳性标本进行全基因组测序分析,1例H5N8病毒的HA基因属于为2.3.4.4分支,HA基因的HA0裂解位点序列为多个连续性碱性氨基酸(REKRRKR/ GLF),2例H7N9病毒的HA基因与Yangtza river delta属于同一分支,HA基因的HA0裂解位点序列为多个连续性碱性氨基酸(VPKRKRTAR/GLF),均属于高致病性禽流感病毒。遗传进化树分析提示,H5N8和H7N9的HA基因与国内报道的病毒株亲缘关系较近。结论:农贸市场是禽流感病毒分布的主要场所,高致病性及低致病性禽流感病毒同时空交叠感染现状,提示应加强禽流感病毒的监测防控工作及防范知识的宣传。
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编辑人员丨3天前
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一起食用被污染田螺引起的霍乱疫情流行病学调查与应急处置分析
编辑人员丨3天前
目的:通过分析一起因食用被污染田螺引起的霍乱疫情进行流调病学调查和应急处置,为霍乱疫情防控提供科学依据。方法:2023年1月1日至6月30日,广州市白云区医疗机构采用现场流行病学方法开展辖区内腹泻病例搜索,对霍乱疫情涉及病例及密切接触者开展流行病学调查,采集可疑食物和可能污染环境样本并开展溯源排查。结果:本次疫情病原体为非产毒O1群小川型霍乱弧菌,涉及确诊病例1例,病例表现为腹泻、稀水样便。现场流调推测可疑饮食史为外带田螺,应急监测采样102份(密接人群肛拭子13份,水产品29份,外环境46份,污水3份,江河水样本11份),其中阳性11份(污水3份,田螺3份,田螺售卖档口外环境涂抹5份),结果均为非产毒O1群小川型霍乱弧菌。结论:本起疫情为霍乱弧菌O1群引起的散发疫情,经流调溯源确定传染源为被污染田螺,传播途径为田螺未加工熟透,经食用后引起发病。本次处置提示对霍乱的高效监测能及时发现并有效阻断霍乱疫情的传播。
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编辑人员丨3天前
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新型冠状病毒肺炎患者周围环境中病毒的监测
编辑人员丨3天前
目的:分析新型冠状病毒肺炎(COVID-19)确诊病例周围环境中病毒的分布。方法:采集COVID-19病例的周围环境标本,包括床扶手、门把手、马桶及洗手池、桌子、储物柜、呼叫器、手机、水杯和衣物,采用实时荧光RT-PCR方法检测病毒。结果:共采集到30例COVID-19确诊病例的150份环境标本,新型冠状病毒核酸阳性6份,检出率为4.00%,14个手机表面上3个检出病毒阳性;30例COVID-19确诊病例中6人外环境标本检出新型冠状病毒,检出率为20.00%。结论:COVID-19患者周围环境中能检出病毒,存在潜在的传播风险。
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编辑人员丨3天前
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湖州市2013—2018年人感染H7N9禽流感病例流行病学特征和外环境监测分析
编辑人员丨3天前
目的:了解湖州市人感染H7N9禽流感病例的流行病学特征及外环境样本检测情况。方法:收集2013—2018年现住址为湖州市的人感染H7N9禽流感确诊病例的流行病学信息,同时采集暴露可疑环境样本进行病原学检测。运用Spearman相关分析法分析发病数与环境阳性检出率的关系。结果:2013—2018年湖州市确诊的人感染H7N9禽流感病例39例,死亡9例,病死率为23.08%。男性多于女性,病例主要60岁以上的老年群体和农民。病例溯源样本阳性检出率为8.47%(30/345),农贸市场活禽交易场所的阳性检出率为25.00%(127/508),发病数与样本、场所检出阳性率的Spearman相关系数分别为0.379和0.392。结论:中老年男性及农民是人感染H7N9禽流感的高发群体,活禽暴露是发病的高危因素。
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编辑人员丨3天前
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贵州省H9N2亚型禽流感病毒血凝素基因遗传特性分析
编辑人员丨3天前
目的:了解贵州省H9N2亚型禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)的流行与遗传变异情况,为AIV的防控提供依据。方法:统计2018年10月—2019年3月贵州省活禽市场外环境AIV检出情况,对选取的H9N2亚型AIV进行基因组的提取、血凝素(hemagglutinin, HA)基因的RT-PCR扩增与测序,并对获得的 HA基因序列进行同源性、遗传进化和关键位点变异分析。 结果:贵州省活禽市场外环境AIV检出率为52.2%,H9N2占阳性的83.7%。H9N2亚型AIV HA基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为91.6%~100.0%和91.0%~100.0%,均属于Y280亚系,G57基因型;与致病性相关的裂解位点序列均为PSRSSRGLF和LSRSSRGLF,符合低致病性AIV的分子特征;与宿主特异性相关的受体结合关键位点存在H191N、E198T/A和Q234L三个位点的突变,具有人样受体结合特征;与毒力相关的糖基化位点均具有7个,其中因突变218位点均存在一个糖基化位点缺失,313位点均存在一个增加。与人感染毒株相比关键位点未发生重要突变。 结论:贵州省活禽市场外环境AIV检出率较高,污染较严重,且以H9N2为优势流行亚型;H9N2亚型AIV均属于Y280亚系,G57基因型,为低致病性AIV,毒株遗传差异在增大,关键氨基酸位点存在变异,具有感染人的风险,故应加强监测该病毒的分子遗传变异情况。
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编辑人员丨3天前
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江苏省扬州市2012—2020年外环境禽流感病毒监测分析
编辑人员丨3天前
目的:了解扬州市2012—2020年外环境禽流感病毒的污染状况,为扬州市禽流感防控工作提供依据。方法:采集扬州市2012—2020年外环境样本,利用实时荧光PCR方法进行禽流感病毒核酸检测,使用Excel 2016和SPSS 22.0软件进行数据汇总和统计分析。结果:3 537份外环境标本中共检出270份阳性标本,总阳性率为7.63%,其中H5、H7、H9、混合感染阳性分别为14、3、158、95份,且不同年度( x2=37.06, P<0.01)、不同月份( x2=97.80, P<0.01)、不同地区( x2=52.36, P<0.01)、不同监测场所( x2=330.67, P<0.01)及不同标本类型( x2=371.16, P<0.01)阳性检出率差异均有统计学意义。 结论:扬州市外环境存在禽流感病毒污染,以H9亚型及混合污染为主,风险主要集中在冬春季和城乡活禽市场。
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编辑人员丨3天前
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新冠病毒核酸在物体表面存留时间研究
编辑人员丨3天前
目的:探索新型冠状病毒奥密克戎变异株污染不同物体表面后,不同温度条件下病毒核酸存留时间及变化规律,为环境样本中新冠病毒核酸检测及相关防控策略制定提供依据。方法 取实验室保存的新冠肺炎奥密克戎变异株感染者咽拭子灭活样本,污染不锈钢、塑料、木材、纸板及棉布等材质的表面,制成模拟污染样本,放置常温及冷藏环境下,分别在第0 d、1 d、3 d、7 d、14 d和第30 d,每种材料每次取出3件样本,浸泡后提取核酸,使用实时荧光PCR法检测新冠病毒核酸。分析不同类型材料表面污染后病毒核酸回收率、核酸可检出时间和Ct值变化。结果 新冠病毒污染后,棉布、塑料和不锈钢核酸的回收率为1.75%~2.90%,木材和纸板较低,分别为0.0021%和0.21%。所有材料模拟样本在第30 d均仍可检测出新冠病毒核酸。不锈钢、木材、纸板及棉布表面病毒核酸Ct值在前7 d内快速上升,随后变化较小。塑料表面病毒核酸Ct值较其它四种材料变化较小。结论 新冠病毒污染物体表面后,第30 d仍可检出病毒核酸,且不同性质的物体表面降解模式不同。在日常环境监测中,应结合核酸检测和其他调查手段,综合评估判定污染物品的病毒传播风险。
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编辑人员丨3天前
