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基于网络药理学和动物体内试验验证云实感冒合剂对呼吸道合胞病毒作用
编辑人员丨2天前
目的:基于网络药理学和体内试验探讨云实感冒合剂抗呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)的作用机制。方法:网络药理学预测:运用TCMSP、GeneCards等数据库预测云实感冒合剂干预RSV的活性成分及作用靶点。利用Cytoscape 3.2.1软件构建中药成分-疾病靶点网络图。通过STRING数据库分析蛋白质相互作用关系。借助Metascape数据库进行富集分析。采用分子对接技术分析验证网络药理学结果。云实感冒合剂干预RSV感染验证试验:滴鼻法建立RSV小鼠模型,灌胃合剂后检测血常规、肺指数,观察肺组织病理变化,流式细胞术检测外周血T细胞亚群,ELISA检测血清TNF-α、IL-6、IL-1β含量,RT-PCR检测肺组织中TLR4、NF-κB和RSV-N基因mRNA相对水平。结果:分析获得云实感冒合剂有效活性成分41个,抗RSV靶点111个,富集得到167条信号通路,主要是PI3K/AKT、MAPK、Toll-like等信号通路。分子对接结果显示,云实感冒合剂活性成分木犀草素、山奈酚、槲皮素与RSV-G、RSV-F、PI3K、AKT1、Bcl-2结合能均小于0 kcal/mol。体内试验结果显示,与RSV组相比,云实感冒合剂高剂量组白细胞、淋巴细胞计数升高、肺指数降低,差异有统计学意义( P<0.05)。HE染色显示RSV组肺组织增生,肺泡壁变厚,间质内有炎性细胞浸润,利巴韦林组和云实感冒合剂低、中、高剂量组中肺泡大小趋向均匀,肺泡壁厚度均一。与RSV组相比,云实感冒合剂低、中、高剂量组的CD3 +、CD4 +、CD8 + T淋巴细胞数量明显升高,CD4 +/CD8 +T细胞数量比值降低,血清中TNF-α、IL-6、IL-1β含量下降,肺组织中病毒载量和TLR4、NF-κB mRNA水平降低,差异均具有统计学意义( P<0.05)。 结论:云实感冒合剂通过多成分、多靶点、多通路发挥调控RSV感染,主要通过缓解肺组织病理损伤,减轻炎症反应,其机制可能与抑制TLR4/NF-κB通路激活有关。
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编辑人员丨2天前
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基于网络药理学解析临床用中药抗肝纤维化的作用机制和药效物质基础
编辑人员丨2天前
目的:基于网络药理学解析临床常用中药抗肝纤维化主要活性成分及其作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台TCMSP和Swiss Target Prediction获得21味临床常用中药的有效成分和潜在作用靶点;用GEO数据库解析乙型肝炎病毒(HBV)感染、酒精性肝病和非酒精性脂肪性肝病致肝纤维化差异基因,结合肝纤维化细胞外基质生成和逆转关键基因预测中药治疗靶点;采用Cytoscape软件构建“药物-治疗靶点-通路”网络解析中药抗纤维化成分及其作用机制;体外实验考察核心成分对巨噬细胞(THP-1)和肝星状细胞(LX2)的影响。首先对数据进行正态性检验和方差齐性检验,然后对数据两组间的比较采用 t检验,多组间比较行One-Way ANOVA法进行分析。 结果:21味中药含355个单体化合物,对应315个已知药物靶点,基于肝纤维化发生和消退的关键环节结果显示其中57个基因为中药的抗纤维化治疗靶点;“药物-靶点-通路网络”关联分析结果显示槲皮素和山奈酚是多种复方中药最为核心的抗肝纤维化成分,主要通过调控PI3K-Akt、AGE-RAGE、MAPK、肿瘤坏死因子(TNF)和白细胞介素(IL)-17等信号通路中核心基因TNF、蛋白激酶B1、基质金属蛋白酶9、B淋巴细胞瘤2、趋化因子受体2、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3、C-X-C模体趋化因子受体8、V-rel网状内皮细胞病毒癌基因同源物A、MYC和信号传导和转录激活蛋白1改善HBV、酒精性肝病和非酒精性脂肪性肝病疾病进程和纤维化进展;细胞实验显示槲皮素较山奈酚具有更强的抑制炎症型THP-1细胞释放促炎因子IL-1β、IL-6和TNF-α的能力,而山奈酚降低趋化因子趋化因子受体2更为明显。槲皮素和山奈酚明显抑制THP-1介导的LX2细胞增殖,伴随α-平滑肌肌动蛋白、胶原蛋白IA、转化生长因子-β显著降低和半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3、Cleaved-半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3的增加,二者具有协同作用。结论:槲皮素和山奈酚是构成治疗肝纤维化复方中药的基石,为后续多靶点抗肝纤维化药物的研发提供参考。
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编辑人员丨2天前
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基于网络药理学探讨丹皮-赤芍药对治疗脓毒症的作用机制
编辑人员丨2天前
目的:基于网络药理学方法验证丹皮-赤芍药对治疗脓毒症的作用机制。方法:在TCMSP、OMIM、GeneCards等数据库中检索丹皮-赤芍、脓毒症对应靶点,用Cytoscape 3.8.2软件构建"中药材-活性成分-靶点-疾病"分析图,DAVID数据库进行基因本体(GO)与京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,微生信云平台绘制气泡图。结果:丹皮-赤芍药对共有36个有效成分,主要为槲皮素、山奈酚、黄芩苷、β-谷甾醇、豆甾醇、芍药苷等。与脓毒症潜在共有关键靶点96个,其中度值>4.9者为前列腺素G/H合酶2(PTGS2)、转录因子p65(RELA)、磷酸肌醇3激酶(PIK3CG)、细胞凋亡调节因子(BAX)、细胞凋亡调节因子(BCL2)、半胱天冬酶-3(CASP3)。蛋白相互作用(PPI)网络分析结果共有10个重要靶标蛋白,包括RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、白介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、白介素-1β(IL-1β)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、细胞肿瘤抗原p53(TP53)、基质金属蛋白酶-9(MMP9)、CASP3、PTGS2、人超敏C-C趋化因子2(CCL2)。富集分析提示主要信号通路包括脂质与动脉粥样硬化通路、AGE-RAGE信号通路、癌症通路、肿瘤坏死因子信号通路、HIF-1信号通路、IL-17信号通路等。结论:丹皮-赤芍药对可能通过活性成分槲皮素、山奈酚、芍药苷等,作用于PTGS2、RELA、PIK3CG、BAX、BCL2、CASP3等靶蛋白,通过TNF相关信号通路、HIF-1信号通路、IL-17信号通路等产生对脓毒症的干预效应;但尚需进一步实验验证。
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编辑人员丨2天前
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山奈酚逆转慢性粒细胞白血病K562/ADM细胞耐药性及相关机制
编辑人员丨2天前
目的:探讨山奈酚逆转耐多柔比星(ADM)的慢性粒细胞白血病K562/ADM细胞耐药性及相关机制。方法:采用四甲基偶氮唑盐(MTT)法检测ADM作用24 h对K562和K562/ADM细胞的毒性,计算24 h ADM半数抑制浓度( IC50)及耐药倍数。MTT法检测山奈酚作用24 h对K562/ADM细胞的毒性,计算24 h山奈酚5%抑制浓度( IC5)、10%抑制浓度( IC10),以二者确定后续实验山奈酚两组浓度,未经山奈酚处理的细胞为空白对照组。采用MTT法检测空白对照组及山奈酚干预组ADM作用24 h的细胞抑制情况,计算各组24 h的细胞抑制情况,计算各组24 h ADM IC50,空白对照组与山奈酚组 IC50的比值为山奈酚逆转耐药倍数。应用流式细胞术检测山奈酚作用后K562/ADM细胞内ADM荧光强度。采用蛋白质印迹法检测分别经山奈酚、p38-MAPK信号通路特异性抑制剂SB202190、山奈酚和SB202190联用后的K562/ADM细胞耐药蛋白[P糖蛋白(P-gp)、多药耐药相关蛋白1(MRP1)、磷酸化p38(p-p38)、总p38(t-p38)]表达情况。 结果:ADM处理24 h后,K562、K562/ADM细胞 IC50值分别为(0.9±0.6)、(28.1±3.5)μg/ml;相对于K562细胞,K562/ADM细胞对ADM作用24 h的耐药倍数为31.16倍。MTT法检测结果显示,山奈酚呈剂量依赖性抑制K562/ADM细胞增殖,依据 IC5和 IC10,确定以0.5、1.0 μmol/L山奈酚进行后续实验。山奈酚和ADM共同作用24 h后,空白对照组、0.5 μmol/L山奈酚组、1.0 μmol/L山奈酚组K562/ADM细胞24 h ADM IC50分别为(33.7±5.7)、(21.4±0.6)、(15.9±1.8)μg/ml( F=30.85, P<0.05;组内两两比较,均 P<0.05),0.5 μmol/L山奈酚组、1.0 μmol/L山奈酚组K562/ADM细胞24 h逆转耐药倍数分别为1.58、2.12倍。流式细胞术检测示,空白对照组、0.5 μmol/L山奈酚组、1.0 μmol/L山奈酚组K562/ADM细胞内ADM平均荧光强度(MFI)分别为138.4±8.9、154.3±2.2、165.7±4.8,差异有统计学意义( F=161.48, P<0.05)。与空白对照组比较,0.5、1.0 μmol/L山奈酚处理24 h后,K562/ADM细胞的P-gp、MRP1、p-p38蛋白相对表达量均降低(均 P<0.05),而t-p38蛋白表达量差异无统计学意义( P>0.05);SB202190可降低P-gp、MRP1、p-p38蛋白的相对表达量(均 P<0.05);SB202190联合不同浓度山奈酚作用后,K562/ADM细胞P-gp、MRP1、p-p38蛋白的相对表达量未下降( P>0.05)。 结论:山奈酚可能通过抑制p38-MAPK通路降低K562/ADM细胞P-gp、MRP1的相对表达量,实现增加细胞内ADM的蓄积,从而逆转K562/ADM细胞的耐药性。
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编辑人员丨2天前
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基于网络药理学探索梅花草提取物抑制脑胶质瘤的作用机制
编辑人员丨1周前
目的 运用网络药理学技术结合细胞及动物实验探讨梅花草提取物抑制脑胶质瘤恶性增殖的作用机制.方法 通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库筛选梅花草的有效化合物,使用OMIM、Genecards、Pubchem等数据库预测梅花草有效化合物对脑胶质瘤的潜在作用靶点,应用Cytoscape 3.9.1和STRING 11.5数据库构建化合物-靶点网络、蛋白质互作(PPI),筛选出核心基因,运用DAVID 6.8数据库对靶点进行基因本体(GO)的富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)的通路富集分析,并在细胞和动物水平评价相关信号通路和表型变化.结果 梅花草含有14个靶点活性成分,包括Celahin B、Isoboonein、槲皮素(Quercetin)、山奈酚(Kaempferol)、没食子酸、Mussaenin A、金丝桃苷、山奈酚-3-O-β-芸香糖苷(Nicotiflorin)、山奈酚3-O-葡萄糖苷(Astragalin)、槲皮素3-O-葡萄糖苷(Isoquercitrin)、槲皮素 7-O-葡萄糖苷(Quercimeritrin)、山奈酚-7-O-葡萄糖苷(Kaempferol 7-O-glucoside)、槲皮素-3,7-二-O-葡萄糖苷(Quercetin 3,7-diglucoside)、皂苷(Saponin),化合物对应的靶点338个;通过韦恩图将梅花草有效化合物与肿瘤相关的334个关键靶点基因利用DAVID在线分析工具进行肿瘤相关靶点的GO与KEGG分析.GO分析结果表明,梅花草提取物抗脑肿瘤的作用机制可能与炎症状态、缺氧反应、细胞增殖与凋亡等有关;KEGG分析结果发现梅花草有效化合物作用的靶点基因与PI3K/AKT、MAPK、TNF、HIF-1α等抗肿瘤信号通路息息相关,并在细胞及动物水平获得肿瘤的抑制表型和线粒体相关PI3K/AKT关键信号通路的验证.结论 梅花草提取物显著抑制脑胶质瘤细胞的恶性生长,呈现浓度依赖性,其发挥作用可能与PI3K/AKT、线粒体代谢等信号通路有关.
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编辑人员丨1周前
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基于网络药理学和分子对接探讨黄芪治疗早发性卵巢功能不全的机制研究
编辑人员丨1个月前
目的:基于网络药理学和分子对接方法探讨黄芪对早发性卵巢功能不全治疗作用的分子机制.方法:在中药系统药理学数据库TCMSP中筛选黄芪有效成分及药物作用靶点;在Genecards数据库中筛选早发性卵巢功能不全疾病靶点;运用Venny在线工具筛选两者的交互基因;通过Cytoscape3.7.2 软件构建"药物-成分-靶点-疾病"网络关系图;采用String数据库获得蛋白互作(PPI)信息,进一步通过CytoNCA 插件构建蛋白质相互作用网络,筛核心靶点蛋白;利用DAVID数据库对交互基因进行GO富集和KEGG通路富集;使用分子对接技术进一步明确其发挥治疗作用的分子;最后,采用血清饥饿法建立POI细胞模型,给予黄芪中的有效化合物槲皮素进行干预,通过Tunel染色、蛋白质印迹实验(western blotting,WB)对网络药理学预测结果进行实验验证.结果:通过TCMSP数据库筛选出黄芪的32个有效化合物及552个基因靶点,从疾病数据库中筛选出730个早发性卵巢功能不全的疾病靶点,两者共62个交集基因,其中黄芪中的主要活性成分包括槲皮素(quercetin)、异鼠李素(isorhamnetin)、山奈酚(kaempferol)、丁子香萜(Mairin)、芒柄花黄素(formononetin)和芒柄花黄素(astragaloside IV),10个POI的潜在核心靶基因为ALB、INS、AKT1、ACTB、TP53、TNF、ESR1、CASP3、STAT3和PTEN;潜在靶点基因主要参与调控JAK2/STAT3、PI3K/Akt信号通路;分子对接验证了黄芪主要活性化合物与核心蛋白STAT3和Akt1存在较强的结合作用;细胞实验结果发现,黄芪中的重要活性化合物槲皮素能促进JAK2/STAT3信号通路关键分子JAK2及STAT3的磷酸化水平,改变卵巢颗粒细胞凋亡相关蛋白表达水平.结论:网络药理学和分子对接分析表明中药黄芪能通过调节对雌二醇的反应、抑制凋亡过程以及调控JAK-STAT和PI3K-Akt信号通路治疗早发性卵巢功能不全,其机制可能与激活JAK2/STAT3信号通路,抑制卵巢颗粒细胞凋亡相关.
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编辑人员丨1个月前
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山奈酚对高糖诱导的人肾上皮细胞增殖与凋亡的影响
编辑人员丨1个月前
目的 探究山奈酚对高糖诱导人肾上皮细胞(Hkb20)增殖及凋亡的影响.方法 分组培养人肾上皮细胞分为正常糖浓度组(对照组)、高糖组、氯沙坦组(阳性对照)和不同浓度山奈酚组(10 μmol/L、30 μmol/L、50 μmol/L山奈酚与高糖共同作用).采用CCK-8法和AV/PI法应用流式细胞仪分别检测细胞增殖和凋亡情况,qRT-PCR检测TGF-β1和Smad3 mRNA水平的表达,Western blot法检测细胞因子TGF-β1和Smad3蛋白含量.结果 高糖能诱导人肾上皮细胞增殖降低,使细胞凋亡率升高,增加TGF-β1和Smad3 mRNA和蛋白的表达水平(P<0.05).不同浓度山奈酚处理后,山奈酚能显著增强细胞增殖和降低细胞凋亡率.同时TGF-β1和Smad3 mRNA和蛋白的表达水平下降,且呈剂量依赖性(P<0.05).结论 山奈酚可逆转高糖诱导的人肾上皮细胞增殖降低和凋亡增加.这说明山奈酚可能是通过TGF-β1/Smad3信号通路抑制高糖环境下人肾上皮细胞的增殖降低和凋亡增加,从而最终导致肾脏纤维化.
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编辑人员丨1个月前
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整合网络药理学和体外实验探究夏枯草-半枝莲药对治疗乳腺癌的作用及机制
编辑人员丨1个月前
目的 采用网络药理学和体外细胞实验探究夏枯草-半枝莲药对抗乳腺癌的作用机制.方法 运用中药系统药理学数据库与分析平台筛选出夏枯草-半枝莲药对的有效成分和靶点;利用GeneCards、OMIM数据库找到乳腺癌靶点,进而构建药物-活性成分-关键靶点网络和蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络;运用R语言进行GO功能和KEGG通路富集分析以及生存分析;将筛选出的活性成分和核心靶点进行分子对接验证;采用CCK-8法检测细胞活力;EdU、流式实验检测细胞增殖和凋亡情况;Western blot法检测p-AKT1、AKT1、β-catenin和c-MYC的蛋白表达水平.结果 通过数据分析共筛选出有效成分36个,交集靶点105个,其核心成分是槲皮素、木犀草素、山奈酚、汉黄芩素、黄芩素;通过PPI和生存分析得出其关键靶点是AKT1、ESR1、CASP3、MYC;GO分析共包含4 303条富集结果,KEGG分析共包含232条通路;分子对接显示核心成分与关键靶点均具有较强的结合能力.细胞实验证明,核心活性成分槲皮素可以抑制乳腺癌细胞的增殖并促进其凋亡(P<0.05),下调p-AKT1、β-cate-nin和c-MYC蛋白的表达水平(P<0.05).结论 夏枯草-半枝莲药对中活性成分槲皮素可能通过AKT1/β-catenin信号通路来发挥作用,为其治疗乳腺癌的作用机制研究提供了科学参考.
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编辑人员丨1个月前
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基于网络药理学探讨益气化痰活血方治疗冠心病的机制
编辑人员丨1个月前
目的 运用网络药理学研究方法探讨益气化痰活血方治疗冠心病的作用机制.方法 在中药系统药理学分析平台(TCMSP)和中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)筛选益气化痰活血方的成分和靶点;并通过相关数据库检索冠心病相关靶点;通过韦恩图得到益气化痰活血方和冠心病的共同靶点,然后利用STRING网站进行化合物-疾病共同靶点蛋白互作分析;利用David数据库进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.最后,采用Cytoscape3.82 软件构建药物-成分-作用靶点-通路-疾病的网络模型.结果 通过筛选得到益气化痰活血方的潜在主要活性成分 154 个,涉及 71 个疾病作用靶点,主要活性化合物为柚皮素、槲皮素、川陈皮素、山奈酚等,调节机制与脂质和动脉粥样硬化、白细胞介素 17(IL-17)信号通路、细胞凋亡、流体剪切应力和动脉粥样硬化等信号通路有关,从而发挥治疗冠心病的作用.结论 益气化痰活血方治疗冠心病是多成分、多靶点、多途径相互作用的结果,为益气化痰活血方的基础或临床研究提供一定的理论依据.
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编辑人员丨1个月前
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不同成熟度老鹰茶中酚类化合物含量及抗氧化活性研究
编辑人员丨1个月前
为了探究两种不同成熟度老鹰茶中酚类化合物含量及抗氧化活性的差异,以对其进行辨识及质量评价,该研究利用液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)法测定老鹰茶中15 种酚类化合物,采用DPPH自由基清除率、ABTS+自由基清除率、Fe3+还原能力评价两种茶叶抗氧化能力,再通过数据统计分析探讨两种老鹰茶酚类化合物含量及抗氧化活性的差异,并进一步探索老鹰茶中不同酚类化合物对于抗氧化的贡献.结果表明:(1)嫩叶茶中儿茶素、对香豆酸、异槲皮苷、金丝桃苷、烟花苷、紫云英苷、山奈酚、槲皮素、阿福豆苷含量显著高于老叶茶,其中儿茶素、异槲皮苷、紫云英苷平均含量比老叶茶分别高1 039.43、169.12、257.35 mg·100 g-1.聚类分析(HCA)、主成分分析(PCA)、正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)均可将二者区分.(2)方差分析(ANOVA)结果显示在抗氧化能力上,二者在DPPH自由基清除率、ABTS+自由基清除率、Fe3+还原能力之间具有显著性差异,嫩叶茶优于老叶茶.(3)偏最小二乘回归分析(PLSR)法提示老鹰茶中的异槲皮苷、儿茶素、紫云英苷、绿原酸、金丝桃苷、对香豆酸、山奈酚是其发挥抗氧化效能的主要酚类化合物.该研究结果可为老鹰茶的质量控制及应用推广提供一定的参考.
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编辑人员丨1个月前
