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二甲双胍对2型糖尿病患者miRNA表达的影响及作用靶点预测研究
编辑人员丨1天前
目的:研究二甲双胍对2型糖尿病患者微小RNA(miRNA)表达水平的影响,并利用网络药理学进行分析,预测其治疗作用潜在的靶点及途径。方法:筛选本院入院治疗的初发2型糖尿病患者15例,住院期间及出院后均规律服用盐酸二甲双胍片。患者服药6个月后,对比其用药前后血清基质金属蛋白酶(MMP)-9、转化生长因子(TGF)-β1及心肌纤维化相关miRNA的表达水平。对呈现统计学差异表达的miRNA进行基因本体论(GO)和KEGG通路富集分析,并构建差异表达miRNA对应靶基因信使RNA(mRNA)网络图。结果:患者用药后,血清MMP-9水平较用药前明显下降( P<0.05)。二甲双胍可显著下调患者血清人类微小RNA(hsa-miR) 29a-3p、hsa-miR133a-5p、hsa-miR21-5p、hsa-miR30c-5p、hsa-miR1-3p表达水平( P<0.05或 P<0.01)。GO和KEGG分析结果显示,差异表达miRNA主要集中在内质网腔、突触、基膜等细胞组分中,通过胶原分解代谢过程、短时神经元突触可塑性调节、轴突延伸等生物过程来发挥Rho GTP酶(Rho GTPase)结合、参与细胞外基质结构成分等分子功能;其主要富集于糖尿病并发症晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、Wnt信号通路等多种细胞信号转导通路。miRNA-mRNA网络分析结果显示,与差异表达miRNA对应mRNA共230个。 结论:二甲双胍可通过下调相关miRNA表达,参与相关细胞信号通路转导,调控染色质、核酸结合及酶活性过程而发挥其治疗2型糖尿病的作用。
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编辑人员丨1天前
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微小RNA在心肌肥厚中的作用机制及其作为新药靶点的研究进展
编辑人员丨1天前
心肌肥厚是一种常见的生理或病理过程,病理性心肌肥厚可导致心衰、猝死等。微小RNA(miRNA或miR)在心肌肥厚中的作用逐渐引起人们的关注。miR-1在心肌肥厚的发生中具有一定的保护作用。miR-133是建立肥大基因程序的关键因素,对心肌肥厚的发展至关重要。卡维地洛等多种药物可对miR-133的表达起到调控作用。miR-208a在心肌肥厚等多种心血管系统疾病中表达水平的动态变化与疾病的进程和预后密切相关。miR-199a在压力超负荷心肌肥厚中表达上调,且对心肌细胞自噬有抑制作用。miR-200c对心肌细胞具有保护作用。miRNA有可能成为心肌肥厚重要的生物标志物或药物治疗靶点。随着对于包括miRNA在内的非编码RNA研究的深入,其对心肌肥厚发生乃至心衰病理过程的调控将被进一步揭示。
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编辑人员丨1天前
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微小RNA-133b靶向调控多聚嘧啶通道结合蛋白1对乳腺癌细胞生物学行为的影响
编辑人员丨1天前
目的:探讨微小RNA(miR)-133b靶向调控多聚嘧啶通道结合蛋白1(PTBP1)调控乳腺癌细胞生物学的行为机制。方法:选取乳腺癌及癌旁组织标本83例,收集患者临床病理资料,同时选取乳腺癌细胞系(MCF-7)、正常乳腺上皮细胞系(MCF-10A),实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测miR-133b和PTBP1 mRNA表达,分析与临床病理特征的关系,MCF-7细胞分为阴性对照组、miR-133b模拟物(mimic)组、miR-133b inhibitor组、miR-133b mimic+PTBP1沉默组和miR-133b inhibitor+和PTBP1沉默组,噻唑蓝(MTT)实验与流式细胞术分别检测MCF-7细胞增殖及周期的变化,划痕实验和Transwell小室检测细胞迁移及侵袭,蛋白质印迹法(Western blot)检测B细胞淋巴瘤/白血病-2(bcl-2)、bcl-2相关X蛋白(bax)和PTBP1蛋白表达,双荧光素酶实验验证miR-133b对PTBP1的靶向调控机制。多组间比较采用单因素方差分析,两两比较采用LSD- t检验,计数资料采用 χ2检验和Fisher精确检验进行分析。 结果:miR-133b和PTBP1 mRNA在乳腺癌组织(0.94±0.18、4.28±0.27)及乳腺癌细胞的表达水平(1.09±0.22、3.65±0.19)分别明显低于和高于癌旁组织(2.12±0.09、 t=4.343, P<0.05;1.37±0.21、 t=6.006, P<0.05)及MCF-10A细胞(1.99±0.11、 t=5.223, P<0.05;1.15±0.09、 t=5.774, P<0.05)。miR-133b和PTBP1均与TNM分期(1.204±0.057、3.865±0.172, χ2=6.217, P<0.001)和淋巴转移(0.489±0.041、1.632±0.147, χ2=7.031, P<0.001)等明显相关,而与年龄(0.601±0.052、2.008±0.187, χ2=0.261, P>0.05)、分化程度(0.592±0.057、1.994±0.187, χ2=0.274, P>0.05)和病理分级无关(0.587±0.059、1.921±0.172, χ2=0.257, P>0.05)。与阴性对照组比较,miR-133b mimic组增殖率[(35.43±1.74)%、(8.43±0.35)%, F=166.465, P<0.05]、迁移、侵袭细胞数(109±10.562、77±5.751, t=4.663, P<0.05;128±11.624、81±7.251, t=7.453, P<0.05)、bcl-2(2.78±0.32、0.76±0.11, t=4.122, P<0.05)和PTBP1表达(3.45±0.33、0.89±0.26, t=3.154, P<0.05)明显降低,G 1期阻滞明显延长( F=276.872, P<0.05),bax表达明显增加(1.22±0.12、3.39±0.46, t=9.123, P<0.05),miR-133b mimic+PTBP1沉默组变化更为明显(1.22±0.12、7.71±0.23, t=6.009, P<0.05),miR-133b inhibitor组明显逆转上述指标变化(1.22±0.12、0.76±0.11, t=3.334, P<0.05),miR-133b inhibitor+PTBP1沉默组逆转更为明显(1.22±0.12、0.33±0.11, t=5.098, P<0.05)。双荧光素酶实验显示miR-133b可靶向调控PTBP1。 结论:miR-133b靶向调控PTBP1从而抑制乳腺癌细胞增殖、迁移、侵袭并促进细胞凋亡。
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编辑人员丨1天前
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微小RNA-133a在缺血性心力衰竭患者血清中的表达及意义
编辑人员丨1天前
目的:探讨缺血性心力衰竭患者血清微小RNA-133a(micro RNA-133a,miR-133a)表达浓度与心力衰竭各指标的关系及其临床应用价值。方法:选取2018年1月至2019年9月在沈阳市第四人民医院确定诊断为缺血性心力衰竭的80例患者临床资料进行前瞻性分析,根据美国纽约心脏病协会(New York Heart Association,NYHA)分级分为NYHAⅠ级组、Ⅱ级组、Ⅲ级组、Ⅳ级组各20例,选取同期健康体检者20名为健康对照组,采用全自动免疫分析仪检测外周血脑钠肽(brain natriuretic peptide,BNP)浓度,采用超声心动图检测心功能各项指标,采用qRT-PCR检测血清miR-133a表达,比较不同心功能分级miR-133a表达浓度差异,对miR-133a与BNP浓度及超声心动图指标相关性进行分析。结果:血清miR-133a表达在健康对照组(0.167±0.024)、NYHAⅠ级组(0.289±0.012)、NYHAⅡ级组(0.415±0.034)、NYHAⅢ级组(0.981±0.217)、NYHAⅣ级组(1.238±0.249)之间比较,差异有统计学意义( F=106.4, P<0.001);Pearson相关分析显示,miR-133a在NYHAⅡ、Ⅲ、Ⅳ级别中表达浓度均与BNP浓度呈现正相关性( r=0.815,95% CI:0.582~0.924, P<0.001; r=0.465,95% CI:0.029~0.753, P<0.05; r=0.749,95% CI:0.459~0.895, P<0.001)。miR-133与射血分数值为负相关( r=-0.811,95% CI:-0.875~-0.719, P<0.001),与左心室后壁厚度值为正相关( r=0.331,95% CI:0.120~0.513, P<0.01),与左心室内径值为正相关( r=0.845,95% CI:0.764~0.896, P<0.001),与舒张末期容积值为正相关( r=0.705,95% CI:0.572~0.803, P<0.001)。 结论:缺血性心力衰竭患者miR-133a表达浓度升高,并与心功能不良指标具有相关性,具有一定的诊断及预后判断价值。
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编辑人员丨1天前
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微小RNA-142-3p靶向CD133对肝癌细胞增殖、侵袭和干细胞特性的影响
编辑人员丨1天前
目的:观察微小RNA(miR)-142-3p靶向CD133对肝癌细胞增殖、侵袭和干细胞特性的影响。方法:选取郑州大学第二附属医院2017年6月至2019年12月手术切除的肝癌组织和对应的癌旁组织作为研究对象。采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析癌旁组织和肿瘤组织miR-142-3p表达水平。采用慢病毒在MHCC97H肝癌细胞建立miR-142-3p过表达和对照细胞系(miR-142-3p组和对照组),采用细胞计数试剂盒(CCK-8)和EdU染色分析两组细胞增殖;采用Transwell分析两组细胞侵袭;采用软琼脂克隆形成实验分析两组细胞干细胞特性;生物信息学和双荧光素酶报告基因分析miR-142-3p靶基因;采用蛋白质印迹法(Western blot)分析两组增殖、侵袭和干细胞标志物细胞核增殖抗原(Ki-67)、基质金属蛋白酶(MMP)-9、CD133和Nanog蛋白表达水平,组间比较采用 t检验。 结果:miR-142-3p组细胞miR-142-3p表达水平(0.41±0.12)显著低于癌旁组织miR-142-3p表达水平(1.06±0.25),差异有统计学意义( t=3.081, P<0.05)。miR-142-3p组细胞吸光度( A)值(1.63±0.20)低于对照组细胞 A值(2.13±0.22),差异有统计学意义( t=2.918, P<0.05)。miR-142-3p组细胞EdU染色阳性率[(30.48±5.12)%]低于对照组细胞EdU染色阳性率[(87.89±7.28)%],差异有统计学意义( t=3.409, P<0.05)。miR-142-3p组细胞Ki-67蛋白表达水平(0.50±0.13)低于对照组细胞Ki-67表达水平(1.15±0.14),差异有统计学意义( t=2.319, P<0.05)。miR-142-3p组细胞侵袭数量[(67.59±6.01)个]低于对照组细胞侵袭数量[(121.35±6.12)个],差异有统计学意义( t=3.409, P<0.05)。miR-142-3p组细胞MMP-9蛋白表达水平(0.48±0.18)低于对照组细胞MMP-9蛋白表达水平(1.57±0.15),差异有统计学意义( t=2.917, P<0.05)。miR-142-3p组细胞克隆形成率[(31.44±4.51)%]低于对照组细胞克隆形成率[(57.68±7.19)%],差异有统计学意义( t=5.103, P<0.05)。miR-142-3p组细胞Nanog蛋白表达水平(0.51±0.14)低于对照组细胞Nanog蛋白表达水平(1.36±0.17),差异有统计学意义( t=2.514, P<0.05)。生物信息学和双荧光素酶报告基因显示CD133是miR-142-3p的靶基因。miR-142-3p组细胞CD133蛋白表达水平(0.43±0.11)低于对照组细胞CD133蛋白表达水平(1.15±0.13),差异有统计学意义( t=2.514, P<0.05)。 结论:miR-142-3p通过靶向调控CD133表达水平调节着肝癌细胞增殖、迁移和干细胞特性。
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编辑人员丨1天前
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微小RNA-135a抑制骨肉瘤干细胞的迁移、侵袭和自我更新
编辑人员丨1天前
目的:探讨微小RNA(miR)-135a对骨肉瘤干细胞(OSCs)迁移、侵袭和自我更新的影响。方法:微球体筛选移植瘤原代细胞的OSCs(P-OSCs)和Saos-2的OSCs(S-OSCs)。实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测分化群(CD)CD133、CD44、CD24和BMI1的转录水平,蛋白质印迹法(Western blot)检测CD133、CD44、CD24、BMI1和B细胞淋巴瘤2(bcl-2)的蛋白水平。构建miR-135a过表达的P-OSCs或S-OSCs为miR-135a组,相应的阴性病毒转染P-OSCs或S-OSCs为对照组(NC)。划痕、Transwell和球体形成实验分别检测细胞的迁移、侵袭和自我更新能力。采用GraphPad Prism 8.4.2进行分析。结果:miR-135a组P-OSCs和S-OSCs的伤口愈合率[(46.33±11.25)%比(73.46±2.24)%和(31.25±2.61)%比(47.20±1.94)%, t=3.346、8.489,均 P<0.05]、穿膜细胞数[(287.00±34.29)个比(401.33±14.66)个和(255.67±17.02)个比(574.67±31.58)个, t=4.336、12.570,均 P<0.05]、成球率[(1.89±0.44)%比(3.72±0.21)%和(1.57±0.17)%比(2.65±0.05)%, t=5.360、6.789,均 P<0.01]和球体直径均低于NC组[(97.21±8.89) μm比(184.91±15.32) μm和(90.68±7.02) μm比(163.75±14.14) μm, t=7.003、6.546,均 P<0.01]。CD44和bcl-2蛋白在骨肉瘤组织中表达高于骨组织(分别为0.87±0.11比0.46±0.08和1.96±0.69比0.41±0.13, t=4.286、3.126,均 P<0.05),细胞中的表达趋势与组织一致。miR-135a组P-OSCs和S-OSCs中CD44(0.68±0.02比1.02±0.06和0.29±0.01比1.03±0.01, t=9.311、90.630)和bcl-2(0.46±0.01比0.95±0.01和0.41±0.02比0.84±0.01, t=60.010、33.310)的蛋白表达量低于NC组,均 P<0.01。 结论:miR-135能够通过抑制CD44和bcl-2抑制OSCs的迁移、侵袭和自我更新。
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编辑人员丨1天前
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微小RNA-143通过调控Kras表达影响前列腺癌PC-3细胞的增殖与迁移
编辑人员丨1天前
目的:探究微小RNA(miRNA,miR)-143通过调控Kras的表达影响前列腺癌PC-3细胞的增殖与迁移的机制。方法:选用购自美国典型培养物保藏中心细胞株PC-3,保持在补充有10%胎牛血清(Hyclone)的F-12培养基(Hyclone)中。细胞在5%CO 2和37 ℃的湿润环境下生长。根据实验需求对细胞进行实验分组,随机分为PC-3转染组、PC-3对照组。通过细胞计数试剂盒(CCK-8)试剂盒对细胞活力进行测定。通过实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)检测各组细胞中miR-143与Kras mRNA表达;通过蛋白质印迹反应检测各组细胞因子CD133、Oct4、Klf4的蛋白表达情况。组间比较采用单因素方差分析或者重复测量的方差分析,组间两两比较采用LSD- t检验。 结果:RT-qPCR分析各组miR-143 mRA和Kras mRNA表达为:miR-143 mRNA PC-3对照组(1.06±0.02)较PC-3转染组(3.17±0.23)降低;Kras mRNA PC-3对照组(2.75±0.11)较PC-3转染组(1.23±0.03)升高,差异有统计学意义( t=5.167, P<0.05)。蛋白印迹检测发现CD133、Oct4、Klf4的蛋白表达PC-3对照组(2.67±0.11、3.18±0.23、2.84±0.26)较PC-3转染组(1.15±0.03、1.26±0.14、1.18±0.15)升高,差异有统计学意义( t=4.862, P<0.05)。细胞活力检测发现PC-3对照组(1.62±0.14)较PC-3转染组(0.58±0.02)细胞活力值升高,差异有统计学意义( t=4.154, P<0.05)。 结论:miR-143可通过抑制Kras的基因表达来控制前列腺PC-3的增殖及迁移状况,miR-143的高表达可有效抑制前列腺癌细胞的增殖及侵袭。
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编辑人员丨1天前
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miRNA-144-3p靶向调控PAX8基因对甲状腺癌细胞耐药敏感性的影响
编辑人员丨1天前
目的:研究微小RNA-144-3p(miRNA-144-3p)靶向调控配对盒基因8(PAX8)对甲状腺癌细胞顺铂耐药性的影响。方法:体外培养人甲状腺癌细胞株FTC-133,并构建对顺铂耐药的人甲状腺癌细胞株FTC-133,采用反转录PCR(RT-PCR)检测FTC-133细胞和顺铂耐药FTC-133细胞中miRNA-144-3p相对表达量。将顺铂耐药FTC-133细胞分为A组、B组、C组,A组不作任何处理,B组转染空质粒,C组转染pCDNA3. 1+miRNA-144-3p质粒,采用RT-PCR检测各组miRNA-144-3p、PAX8相对表达量,采用MTT法检测各组顺铂耐药细胞的半数抑制浓度(IC 50)值;采用CCK-8法检测各组增殖率,采用流式细胞术检测各组凋亡率。 结果:顺铂耐药FTC-133细胞中miRNA-144-3p相对表达量显著高于FTC-133细胞[(0.93±0.24) vs (0.26±0.04), P<0.05];B组顺铂耐药FTC-133细胞IC 50值、增殖率、凋亡率及miRNA-144-3p、PAX8相对表达量与A组比较差异无统计学意义( P>0.05);C组顺铂耐药FTC-133细胞IC 50值、增殖率及miRNA-144-3p相对表达量显著高于B组( P<0.05),细胞凋亡率、PAX8相对表达量显著低于B组( P<0.05)。 结论:miRNA-144-3p过表达可能通过下调PAX8基因表达而增加甲状腺癌细胞的顺铂耐药性,促进甲状腺癌细胞增殖并抑制其凋亡。
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编辑人员丨1天前
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MicroRNA-133b对烟草提取物诱导的人小气道上皮细胞间充质转化的影响
编辑人员丨1天前
目的:探讨微小RNA(miR)-133b对烟草提取物(CSE)诱导的人小气道上皮细胞间充质转化的影响及其调控机制。方法:基因表达数据库(GEO数据库)中搜索慢性阻塞性肺疾病患者气道上皮细胞miR的表达谱芯片,寻找差异表达的miR并用实时荧光定量聚合酶链反应法(qRT-PCR)验证;小气道上皮细胞(HSAEpiC)根据干预方式不同分为对照组、CSE组、CSE+miR-133b抑制剂转染组(抑制剂组),CSE+miR-133b抑制剂对照转染组(抑制剂对照组)。观察各组细胞形态变化,qRT-PCR法检测各组miR-133b、转化生长因子(TGF)-β1 mRNA、Smad2 mRNA、钙黏附蛋白E(E-cadherin)mRNA与波形蛋白(Vimentin)mRNA,酶联免疫吸附法(ELISA)及免疫印迹法(Western blot)检测细胞上清液及细胞E-cadherin与Vimentin蛋白水平。结果:在GSE53519发现9个差异表达的miR,验证后发现miR-133b在HSAEpiC细胞模型中表达差异最为显著。CSE诱导HSAEpiC细胞形态改变,miR-133b抑制剂能部分逆转细胞形态变化。CSE诱导HSAEpiC细胞上皮表型标志物E-cadherin mRNA及蛋白表达减少、间质表型标志物Vimentin mRNA及蛋白表达增多( F=9.09、12.35、7.57、101.87, P=0.015、0.007、0.023、0.000);miR-133b抑制剂能部分逆转E-cadherin Vimentin mRNA及蛋白表达( F=40.59、27.74、15.87、20.42, P=0.000、0.001、0.004、0.002)。CSE诱导HSAEpiC细胞TGF-β1 mRNA、Smad mRNA表达增多,miR-133b抑制剂部分逆转TGF-β、mRNA、Smad mRNA的改变( F=17.25、64.15, P=0.003、0.000)。 结论:miR-133b可能通过TGF-β/Smad通路调控CSE诱导的HSAEpiC细胞上皮间充质转化。
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编辑人员丨1天前
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精神分裂症患者外周血中mRNA/miRNA网络综合分析
编辑人员丨3周前
目的 探索精神分裂症患者外周血中mRNA/微小核糖核酸(miRNA)网络综合分析.方法 纳入2022年12月至2023年2月就诊于该院的精神分裂患者6例作为实验组,志愿者4例作为对照组.收集两组人群血液样本,采用RNA-seq技术检测mRNA及miRNA的表达水平.最后利用基因表达综合数据库中GSE145554基因集进行生物信息学验证分析.结果 与对照组相比,实验组中共分析出差异mRNA 2 133个,其中包括上调mRNA 1 410个,下调mRNA 723个;差异miRNA 150个,其中包括上调miRNA 72个,下调miRNA 78个.京都基因与基因组百科全书和基因本体论富集的生物学过程和信号途径主要包括哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT)信号通路、坏死性凋亡及内质网中的蛋白质加工信号通路等.结论 PI3K-AKT、mTOR、坏死性凋亡及内质网中的蛋白质加工信号通路参与精神分裂的发生发展过程,为阐明精神分裂症的预防、诊断及治疗提供新的研究方向.
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编辑人员丨3周前
