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微小RNA-153-3p/α-突触核蛋白轴通过抑制破骨细胞分化调节骨质疏松症的机制
编辑人员丨1周前
目的:探讨微小RNA(miR)-153-3p如何与α-突触核蛋白(snca)相互作用影响小鼠的骨质疏松进程。方法:采用切除双侧卵巢构建骨质疏松(OVX)小鼠模型(品系),通过苏木精-伊红(HE)染色明确病理学改变。通过实时荧光定量反转录聚合酶链反应、免疫蛋白印记实验和免疫组织化学染色对目标基因的信使RNA(mRNA)及蛋白表达进行定量。核因子-κB活化因子受体配体(RANKL)处理小鼠单核巨噬细胞白血病细胞(RAW264.7细胞)后,显微镜下观察细胞形态,噻唑蓝(MTT)法评价细胞活力,Transwell实验检测破骨细胞迁移能力;双荧光素酶实验验证miR-153-3p与snca的相互作用。结果:snca在OVX小鼠中低表达( t=11.436, P<0.05),miR-153-3p在OVX小鼠中高表达( t=15.833, P<0.05)。抑制miR-153-3p或过表达snca抑制骨质疏松,snca在RANKL诱导的RAW264.7细胞中低表达( t=11.796, P<0.05),miR-153-3p在RANKL诱导的RAW264.7细胞中高表达( t=10.448, P<0.05)。过表达snca抑制破骨细胞分化[抗酒石酸酸性磷酸酶(TRAP): t=7.493, P<0.05;Cathepsin K: t=9.536, P<0.05;基质金属蛋白酶(MMP)-9: t=20.371, P<0.05;MMP-2: t=31.924, P<0.05]。miR-153-3p通过抑制snca表达促进破骨细胞分化( F=123.390, P<0.05),过表达snca能恢复过表达miR-153-3p的效果( F=136.515, P<0.05)。双荧光素酶及蛋白检测实验结果表明miR-153-3p能负向调控snca的表达( F=92.528, P<0.05)。 结论:抑制miR-153-3p通过促进snca表达抑制破骨细胞功能,进而抑制小鼠体内骨质疏松进程。
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编辑人员丨1周前
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长链非编码RNA FMO4-AS5调控miRNA-620表达对肾癌细胞增殖能力、细胞周期和免疫逃逸的影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨长链非编码RNA FMO4-AS5调控miRNA-620(miR-620)表达对肾癌细胞增殖能力、细胞周期和免疫逃逸的影响。方法:通过cBioPortal在线数据库(数据更新至2022年1月)分析FMO4-AS5在肾癌组织(323例)和正常肾组织(153例)中的表达水平。采用LncBook预测软件分析FMO4-AS5直接靶向结合的微小RNA(miRNA)。实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测正常肾小管上皮细胞HK-2和肾癌细胞株ACHN、CAKI1、786-P、A498中FMO4-AS5的相对表达水平,选择FMO4-AS5相对表达水平最高的786-P细胞进行后续实验。将786-P细胞分为对照组和si-FMO4-AS5组,分别转染0.4 μg pcDNA-si-NC质粒和0.4 μg pcDNA-si-FMO4-AS5质粒。采用平板克隆实验检测两组786-P细胞的增殖能力,流式细胞术检测786-P细胞周期,酶联免疫吸附试验(ELISA)检测白细胞介素1β(IL-1β)、干扰素γ(IFN-γ)、单核细胞趋化蛋白1(MCP-1)水平。采用双荧光素酶报告基因实验验证FMO4-AS5和miR-620的靶向关系。蛋白质印迹法检测786-P细胞中JAK1-STAT3信号通路相关蛋白和细胞周期蛋白CDK9、cyclin T1的表达。结果:cBioPortal在线数据库中,肾癌组织中FMO4-AS5相对表达水平高于正常肾脏组织( P<0.01)。肾癌细胞株ACHN、CAKI1、786-P、A498中FMO4-AS5相对表达水平分别为2.79±0.30、4.47±0.41、7.26±0.52、3.65±0.74,均较肾小管上皮细胞HK-2细胞高(1.03 ± 0.22)(均 P<0.01)。对照组和si-FMO4-AS5组细胞克隆形成数分别为(226±17)个和(54±16)个,si-FMO4-AS5组细胞克隆形成数低于对照组( t=7.15, P<0.01)。与对照组比较,si-FMO4-AS5组G 0/G 1期细胞比例增高( t=5.25, P<0.01),G 2/M期、S期细胞比例均降低( t=3.32, P<0.05; t=5.35, P<0.01)。对照组和si-FMO4-AS5组MCP-1分别为(2.01±0.17)pg/ml和(5.54±0.52)pg/ml,IFN-γ分别为(1.51±0.49)pg/ml和(3.71±0.29)pg/ml,IL-1β分别为(1.28±0.19)pg/ml和(3.21±0.38)pg/ml,si-FMO4-AS5组MCP-1、IFN-γ、IL-1β水平均较对照组增高(均 P<0.01)。双荧光素酶报告基因实验显示,FMO4-AS5与miR-620存在靶向关系。si-FMO4-AS5组786-P细胞中JAK1、STAT3、CDK9、cyclin T1蛋白表达水平均低于对照组。 结论:FMO4-AS5在肾癌中高表达,沉默FMO4-AS5通过上调miR-620表达降低JAK1-STAT3信号通路活性,抑制肾癌786-P细胞的增殖、细胞周期和免疫逃逸。
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编辑人员丨1周前
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基于GEO芯片和生物信息学分析构建脓毒症相关ceRNA网络
编辑人员丨1周前
目的:基于生物信息学方法,利用基因表达数据库(GEO)分析脓毒症相关长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA表达谱,结合微小RNA(miRNA)数据库进行竞争性内源RNA(ceRNA)网络分析。方法:从GEO数据库下载脓毒症相关lncRNA数据集,使用生物信息分析工具对数据集进行基因表达差异分析,得到差异表达lncRNA(DElncRNA)和差异表达mRNA(DEmRNA),并绘制聚类热图。通过miRNA结合图谱数据库(miRcode)预测与DElncRNA结合的miRNA,并检索miRNA靶基因数据库TargetScan、miRDB和mirTarBase筛选出同时满足3个数据库的靶mRNA,比对后得到lncRNA-miRNA-mRNA相互作用关系,导入调控网络可视化软件CytoScape中得到ceRNA网络。将ceRNA网络中的DEmRNA导入基因与蛋白质相互作用检索数据库(STRING),绘制基因编码蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图。对DEmRNA进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:在GEO数据库中通过检索、筛选获得两个脓毒症相关lncRNA芯片数据集,分别为GSE89376和GSE145227。差异分析显示,GSE89376数据集中老年脓毒症组有14个DElncRNA、359个DEmRNA,成人脓毒症组有8个DElncRNA、153个DEmRNA;GSE145227数据集中儿童脓毒症组有1 232个DElncRNA、1 224个DEmRNA。聚类热图显示,脓毒症组与对照组lncRNA和mRNA的表达存在明显差异;通过筛选的miRNA构建ceRNA网络,发现多个DElncRNA和DEmRNA参与了脓毒症的ceRNA网络。PPI网络图显示有多个基因编码蛋白相互作用,且分别与多个基因编码蛋白形成多节点的相互作用网络。在对相关基因进行功能注释及富集分析后发现,在核受体活性、配体激活的转录因子活性、类固醇激素受体活性等功能相关基因上可能存在串扰机制,并通过叉头框转录因子(FoxO)、Janus激酶/信号转导与转录激活因子(JAK/STAT)、p53、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)等信号通路发挥作用。结论:通过构建脓毒症相关lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA网络,结合通路分析发现,脓毒症中存在多个lncRNA和mRNA参与ceRNA网络,并在多个重要信号通路上发挥作用。
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编辑人员丨1周前
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微小RNA-153在砷致肝细胞凋亡过程中的表达变化及其调控作用
编辑人员丨1周前
目的:探讨砷诱导内质网应激致肝细胞凋亡过程中微小RNA-153(miR-153)表达变化及调控组蛋白H3第4位赖氨酸(H3K4)甲基转移酶(SET7/9)和组蛋白H3K4一甲基化(H3K4me1)水平变化的机制。方法:体外培养人正常肝细胞(L-02细胞),根据不同处理方式分为对照、砷处理、砷+阴性转染、砷+ miR-153上调和砷+ miR-153下调组,其中砷+阴性转染、砷+ miR-153上调和砷+ miR-153下调组转染质粒与转染试剂均按照3 μg∶8 μl进行转染。24 h后,砷处理、砷+阴性转染、砷+ miR-153上调和砷+ miR-153下调组再以100 μmol/L亚砷酸钠(NaAsO 2)作为终浓度处理24 h;对照组加入与NaAsO 2等体积的磷酸盐缓冲液(PBS)处理24 h。采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测各组细胞miR-153表达水平;流式细胞术检测各组细胞凋亡和周期情况;实时无标记细胞动态分析(RTCA)仪检测细胞增殖情况;蛋白免疫印迹法(Western blot)检测各组细胞内质网标志蛋白葡萄糖调节蛋白78(GRP78)、SET7/9及H3K4me1蛋白表达水平。 结果:各组细胞miR-153表达水平比较,差异有统计学意义( F = 10.73, P < 0.05)。与对照组[(41.10 ± 6.08)%]比较,砷处理组miR-153表达水平[(4.35 ± 0.20)%]明显降低( P < 0.05);与砷+阴性转染组[(10.00 ± 2.40)%]比较,砷+ miR-153上调组miR-153表达水平[(157.70 ± 42.70)%]明显升高( P < 0.05),砷+ miR-153下调组miR-153表达水平[(4.20 ± 0.28)%]明显降低( P < 0.05)。各组细胞总凋亡率、G1期细胞比例比较,差异有统计学意义( F = 29.69、104.32, P均< 0.05)。与对照组比较,砷处理、砷+ miR-153上调、砷+ miR-153下调组细胞总凋亡率、G1期细胞比例明显升高( P均< 0.05);与砷+阴性转染组比较,砷+ miR-153上调组细胞总凋亡率、G1期细胞比例明显下降( P均< 0.05),砷+ miR-153下调组细胞总凋亡率、G1期细胞比例明显升高( P均< 0.05)。各组细胞增殖率比较差异有统计学意义( F = 799.35, P < 0.05)。与对照组比较,砷处理、砷+ miR-153上调、砷+ miR-153下调组细胞增殖率明显下降( P均< 0.05);与砷+阴性转染组比较,砷+ miR-153上调组细胞增殖率升高( P < 0.05),砷+ miR-153下调组细胞增殖率下降( P < 0.05)。各组细胞SET7/9、GRP78和H3K4me1蛋白表达水平比较,差异有统计学意义( F = 78.52、52.13、54.32, P均< 0.05)。与对照组比较,砷处理组SET7/9、GRP78和H3K4me1蛋白表达水平明显升高( P均< 0.05);与砷+阴性转染组比较,砷+ miR-153上调组SET7/9、GRP78和H3K4me1蛋白表达水平明显下降( P均< 0.05),砷+ miR-153下调组SET7/9、GRP78和H3K4me1蛋白表达水平明显升高( P均< 0.05)。 结论:miR-153在砷诱导内质网应激致肝细胞凋亡过程中具有重要作用,其表达和调控与SET7/9和H3K4me1水平变化有关。
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编辑人员丨1周前
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甲状腺乳头状癌组织微小RNA-93-5p、微小RNA-98-5p表达与临床病理特征和增殖、侵袭基因表达的关系研究
编辑人员丨2024/7/13
目的:研究甲状腺乳头状癌(PTC)组织微小核糖核酸-93-5p(miR-93-5p)、微小RNA-98-5p(miR-98-5p)表达与临床病理特征和增殖、侵袭基因表达的关系.方法:选取2020年10月到2023年10月在广东省中医院行手术切除的PTC患者153例作为研究对象,收集术中切除的癌组织以及癌旁组织.检测并比较癌组织与癌旁组织miR-93-5p、miR-98-5p及增殖基因、侵袭基因mRNA表达水平,分析miR-93-5p及miR-98-5p表达与PTC患者临床病理特征的关系.利用Pearson法分析miR-93-5p、miR-98-5p表达水平与增殖基因、侵袭基因mRNA表达的相关性.结果:癌组织的miR-93-5p表达水平较癌旁组织更高,miR-98-5p表达水平较癌旁组织更低(P<0.05).miR-93-5p高表达PTC患者TNM分期Ⅲ~IV期、有淋巴结转移及低分化的比例较miR-93-5p低表达PTC患者更高(P<0.05).miR-98-5p低表达PTC患者TNM分期Ⅲ~Ⅳ期、有淋巴结转移及低分化的比例较miR-98-5p高表达PTC患者更高(P<0.05).癌组织的增殖基因程序性细胞死亡因子4(PDCD4)及蛋白磷酸酶4调节亚基(PP4R1)水平较癌旁组织更低(P<0.05),侵袭基因金属蛋白酶解离素9(ADAM9)及Bcl-6共抑制因子样蛋白(BCORL1)水平较癌旁组织更高(P<0.05).Pearson法分析结果显示,miR-93-5p表达与增殖基因PDCD4及PP4R1表达水平呈负相关,与侵袭基因ADAM9及BCORL1表达水平呈正相关.miR-98-5p表达水平与增殖基因PDCD4及PP4R1水平呈正相关,与侵袭基因ADAM9及BCORL1表达水平呈负相关.结论:PTC患者癌组织miR-93-5p表达升高,miR-98-5p表达降低,与TNM分期、淋巴结转移及分化程度等临床病理特征有关,还可促进PTC癌细胞增殖、侵袭.
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编辑人员丨2024/7/13
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结肠癌病人血清miR-448和miR-153表达对肠道菌群及免疫功能的影响
编辑人员丨2024/7/6
目的 探讨结肠癌病人血清微小RNA-448(miR-448)和微小RNA-153(miR-153)表达对肠道菌群及免疫功能的影响.方法 2020年2月~2023年2月期间收治的127例结肠癌病人作为研究组,89例结肠良性病变病人作为结肠良性病变组,同期本院体检的127例健康者作为对照组.以血清miR-448(1.12)和miR-153(0.98)表达水平的中位数为临界值将研究组病人分为miR-448高表达组(63例)、miR-448低表达组(64例),miR-153高表达组(64例)、miR-153低表达组(63例).Pearson法分析血清miR-448和miR-153表达水平与结肠癌病人肠道菌群、免疫功能指标的相关性;受试者工作特征(ROC)曲线分析血清miR-448和miR-153对结肠癌的诊断价值.结果 研究组、结肠良性病变组、对照组大肠杆菌、双歧杆菌、双歧杆菌/大肠杆菌比值以及免疫球蛋白IgG、IgM、IgA比较,差异有统计学意义(P<0.05);研究组血清miR-448表达水平为(1.25± 0.22),高于对照组的(1.09±0.03)和结肠良性病变组的(1.18±0.15),血清miR-153表达水平为(0.89±0.12)低于对照组的(1.03±0.17)和结肠良性病变组的(0.96±0.16);血清miR-448、miR-153 高表达和低表达组大肠杆菌、双歧杆菌、双歧杆菌/大肠杆菌比值、IgG、IgM、IgA表达水平比较,差异有统计学意义(P<0.05);血清miR-448、miR-153与大肠杆菌、双歧杆菌、双歧杆菌/大肠杆菌比值有相关性(r=0.657,-0.742,-0.753;r=-0.711,0.813,0.771,P<0.05);IgG、IgM、IgA 与血清 miR-448 呈正相关(r=0.686,0.709,0.744),与 miR-153 呈负相关(r=-0.690,-0.841,-0.769,P<0.05);血清miR-448和miR-153联合检测诊断结肠癌的AUC为0.845,优于各自单独检测(Z二者联合-miR-448=4.561、Z二者联合-miR-153=2.426,P=0.000、0.015).结论 结肠癌病人血清 miR-448 和 miR-153表达水平与肠道菌群及免疫功能有相关性,二者联合对结肠癌具有较高的诊断价值.
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编辑人员丨2024/7/6
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微小RNA-30b和微小RNA-31与卵巢癌患者肿瘤标志物的相关性分析
编辑人员丨2024/6/8
目的 探讨微小RNA-30b(miR-30b)、微小RNA-31(miR-31)与卵巢癌患者肿瘤标志物糖链抗原153(CA153)、糖链抗原125(CA125)及癌胚抗原(CEA)水平的相关性.方法 选取2020年7月-2021年7月肿瘤医院收治的卵巢癌患者70例、卵巢良性肿瘤患者50例.取所有卵巢癌、卵巢良性肿瘤患者手术治疗前血清标本,取手术切除卵巢良性肿瘤患者肿瘤组织及卵巢癌患者癌组织标本进行免疫组化染色,RT-PCR法检测miR-30b、miR-31表达,酶联免疫吸附实验法检测CA153、CA125及CEA水平,Pearson相关性分析miR-30b、miR-31表达与CA153、CA125及CEA水平相关性.结果 卵巢癌组织中miR-30b表达较高(t=-15.87,P<0.001),miR-31表达低于卵巢良性肿瘤组织(t=28.58,P<0.001).与肿瘤直径≤3 cm、1+Ⅱ期、无远处转移、高及中分化患者相比,肿瘤直径>3 cm、Ⅲ+Ⅳ期、有远处转移及低分化患者miR-30b表达较高(P<0.05),miR-31表达较低(P<0.05);卵巢癌患者血清CA153、CA125、CEA水平高于卵巢良性肿瘤患者(t=24.68,21.42、28.82,均P<0.05).卵巢癌患者miR-30b表达与CA153、CA125及CEA水平呈正相关;miR-31表达与CA153、CA125及CEA水平呈负相关;卵巢癌组织中miR-30b、miR-31表达呈负相关(P<0.05).结论 miR-30b在卵巢癌表达较高,miR-31表达较低,且与卵巢癌患者病理组织特征、肿瘤标志物水平有关.miR-30b、miR-31在卵巢癌组织中表达具有一定相关性,并且二者表达与肿瘤标志物水平具有相关性.
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编辑人员丨2024/6/8
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子宫颈癌患者血清miR-153、miR-211水平变化及对术后生存情况的影响
编辑人员丨2024/1/20
目的 探讨子宫颈癌患者血清miR-153、miR-211 水平变化及对术后生存情况的影响.方法 选取2016 年5 月至2018 年5 月我院收治的子宫颈癌患者102 例为观察组,同期健康体检的正常女性58 例为对照组.比较两组血清miR-153、miR-211 水平,分析子宫颈癌患者血清miR-153、miR-211 水平与病理特征的相关性,Cox回归分析子宫颈癌患者术后生存的影响因素,受试者工作特征(ROC)曲线分析血清miR-153、miR-211 水平对子宫颈癌患者术后生存情况的预测价值.结果 观察组患者血清miR-153、miR-211 水平低于对照组(P<0.05).不同临床分期、淋巴结转移、深肌层浸润、分化程度、宫旁浸润、脉管浸润子宫颈癌患者血清miR-153、miR-211 水平比较,差异有统计学意义(P<0.05).Cox回归分析显示,将深肌层浸润、分化程度、宫旁浸润、脉管浸润控制后,临床分期、淋巴结转移及血清miR-153、miR-211 低水平均为影响子宫颈癌患者术后生存的独立危险因素(P<0.05).ROC曲线显示,miR-153、miR-211 联合预测子宫颈癌患者术后生存情况的AUC值最大,为0.853,对应敏感度为88.48%,特异度为 67.90%.结论 子宫颈癌患者血清miR-153、miR-211 水平与术后生存情况关系密切,检测血清miR-153、miR-211 水平对临床评估子宫颈癌患者术后生存情况具有积极意义.
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编辑人员丨2024/1/20
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微小RNA-10b及糖类抗原153在早期乳腺癌中的诊断价值
编辑人员丨2024/1/13
目的 探讨微小RNA(miRNA)-10b及糖类抗原(CA)153 在早期乳腺癌中的诊断价值.方法 选取2019年3月至2020年3月河南省南乐中兴医院收治的53例乳腺癌早期患者作为患病组,另选同期 52名健康体检者为健康组,对比2 组血清miRNA-10b及CA153水平,分析并对比二者对早期乳腺癌的诊断价值.结果 2 组年龄、月经情况、CA125、CA199 等水平比较差异无统计学意义(P>0.05);患病组的miRNA-10b、CA153水平[5.7±1.5、(36±20)U/ml]均高于健康组[3.4±1.4、(13±10)U/ml],差异有统计学意义(P<0.05);受试者工作特征(ROC)曲线分析后miRNA-10b、CA153 曲线下面积分别为 0.894、0.817,具有较好的诊断价值(t=8.009、7.689,P均<0.05).结论 miRNA-10b和CA153 水平与早期乳腺癌发展具有密切的联系,对早期乳腺癌诊断具有较高的特异度和敏感度,可以通过观察miRNA-10b、CA153水平变化对乳腺癌患者进行病情诊断.
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编辑人员丨2024/1/13
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乳腺癌患者龙贝逍遥散治疗后血清miR-145表达量变化及与血清肿瘤标志物的关系研究
编辑人员丨2023/12/9
[目的]分析乳腺癌患者龙贝逍遥散治疗后血清微小RNA-145(miR-145)表达量变化及与血清肿瘤标志物的关系.[方法]选取北京航天总医院普外科2016年1月至2021年1月接诊的100例乳腺癌肝郁气滞型患者展开回顾性研究,根据治疗方法的不同将其分为对照组和观察组,每组各50例.对照组给予新辅助CAF化疗(C:环磷酰胺;A:多柔比星;F:氟尿嘧啶)治疗,观察组在对照组的基础上联合龙贝逍遥散治疗,每疗程为21 d,共治疗3个疗程.比较2组患者的疾病控制率、血清miR-145表达量、血清肿瘤标志物、不良反应总发生率.Pearson分析血清miR-145与血清肿瘤标志物的关系,比较观察组中有效组与无效组血清miR-145表达量、血清肿瘤标志物水平,绘制受试者工作曲线(ROC),计算曲线下面积(AUC),分析血清miR-145、肿瘤标志物对新辅助CAF化疗联合龙贝逍遥散临床疗效的预测价值.[结果](1)治疗3个疗程后,观察组的疾病控制率为86.00%(43/50),明显高于对照组的54.00%(47/50),组间比较,差异有统计学意义(P<0.01).(2)治疗后,2组患者的血清miR-145表达量均较治疗前明显升高(P<0.05),且观察组的升高幅度明显优于对照组(P<0.01).(3)治疗后,2组患者的血清糖类抗原153(CA153)、糖类抗原125(CA125)、癌胚抗原(CEA)水平均较治疗前明显降低(P<0.05),且观察组的降低幅度均明显优于对照组(P<0.01).(4)观察组的不良反应总发生率为20.00%(10/50),对照组为16.00%(8/50),组间比较,差异无统计学意义(P>0.05).(5)Pearson分析,血清miR-145与血清CA153、CA125、CEA均呈负相关性(P<0.001),r值分别为-4.014、-3.986、-4.086.(6)有效组血清miR-145表达量高于无效组(P<0.01),血清CA153、CA125、CEA水平低于无效组(P<0.01).(7)血清miR-145、肿瘤标志物联合检测预测新辅助CAF化疗联合龙贝逍遥散临床疗效的AUC是0.799(95%CI:0.716-0.963),灵敏度、特异度均高于单独检测(P<0.001).[结论]龙贝逍遥散可提高对乳腺癌的疾病控制率,上调血清miR-145表达量,降低血清肿瘤标志物水平,且不增加不良反应,具有一定的安全性;乳腺癌患者血清miR-145与肿瘤标志物存在一定的相关性,联合检测可提高对治疗方案的预测效能,具有一定的参考价值.
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编辑人员丨2023/12/9
