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非小细胞肺癌顺铂耐药相关微小RNA的生物信息学分析
编辑人员丨5天前
目的:筛选非小细胞肺癌(NSCLC)顺铂耐药相关微小RNA(miRNA,miR)并分析其生物学功能。方法:从高通量基因表达数据库(GEO)中搜索并下载与非小细胞肺癌顺铂耐药相关的miRNA芯片数据,并通过Targetscan和miRanda预测miRNA的靶基因,对靶基因行基因本体(GO)生物学进程分析,京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析,并构建蛋白与蛋白相互作用网络图(PPI);进一步对KEGG通路行网路分析,并结合与顺铂耐药存在显著相关性的miRNA,构建miR-KEGG网路。组间数据比较采用 t检验。 结果:共筛选到GSE84200、GSE43249和GSE56036 3个数据库,总计23个与顺铂耐药相关的miRNA。Targetscan和miRanda共同预测的靶基因共计914个。GO功能富集分析表明这些基因主要以蛋白结合,信号传导和正性调节基因转录等生物学过程相关。KEGG通路分析显示这些基因主要参与丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)和磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)等信号通路。PPI网路分析结合关键基因分析显示p53为关键基因。miR-KEGG网络分析显示miR-195-5p和miR-424-5p在顺铂耐药中发挥重要作用。结论:miR-195-5p和miR-424-5p可能在顺铂耐药中发挥重要作用,生物学分析预测有助于进一步认识miRNA在非小细胞肺癌顺铂耐药中的功能。
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编辑人员丨5天前
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微小RNA-424-5p靶向驱动蛋白家族成员23促进肝癌细胞对索拉非尼的敏感性
编辑人员丨5天前
目的:探索微小RNA-424-5p/驱动蛋白家族成员23(miR-424-5p/KIF23)轴对肝癌细胞恶性表型及其对索拉非尼敏感性的影响。方法:实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和/或蛋白免疫印迹法检测miR-424-5p和KIF23在肝癌组织及癌旁组织、人肝癌细胞HepG2及正常肝细胞LO2中的表达情况。将分别转染miR-424-5p模拟物(mimic)和miR-424-5p mimic 对照(NC)的HepG2细胞作为miR-424-5p mimic组和mimic NC组;将分别转染KIF23过表达载体pcDNA3.1-KIF23和空载体pcDNA3.1的HepG2细胞作为OE-KIF23组和Vector对照组,将同时转染miR-424-5p mimic和过表达载体pcDNA3.1-KIF23的HepG2细胞作为mimic+OE-KIF23组。将KIF23-3’UTR野生型载体(KIF23-WT)和突变型载体(KIF23-MT)分别与miR-424-5p mimic和mimic NC进行共转染,并用双荧光素酶报告实验验证miR-424-5p与KIF23的靶向关系;细胞计数试剂盒(CCK-8)检测各组HepG2细胞增殖及其对索拉非尼的敏感性;流式细胞术评估各组HepG2细胞凋亡情况;Transwell和划痕实验检测各组HepG2细胞迁移和侵袭能力。组间数据比较采用 t检验或方差分析。 结果:与癌旁组织和正常肝细胞相比,肝癌组织和肝癌细胞的miR-424-5p均显著下调(相对表达量分别为0.604±0.121,0.585±0.064),KIF23显著上调(相对表达量分别为5.451±1.834,2.482±0.545), P值均<0.05。miR-424-5p mimic可抑制肝癌细胞的增殖、迁移和侵袭,促进肝癌细胞的凋亡( P值均<0.05)。过表达KIF23可促进肝癌细胞的增殖、迁移和侵袭,抑制肝癌细胞的凋亡( P值均<0.05)。与mimic NC和KIF23-WT共转染组HepG2细胞相比,mimic和KIF23-WT共转染组HepG2细胞的荧光素酶活性显著降低(相对荧光强度分别为:3.668±0.091、2.629±0.056, P<0.01),而mimic和KIF23-MT共转染组与mimic NC和KIF23-MT共转染组细胞的荧光素酶活性相比,差异无统计学意义。miR-424-5p mimic可逆转过表达KIF23对肝癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的促进作用( P值均<0.05)。索拉非尼对mimic+OE-KIF23组和OE-KIF23组HepG2细胞的抑制率分别为47.491%±3.863%和36.246%±6.063%( t=3.027, P<0.05)。 结论:miR-424-5p可通过靶向调控KIF23的表达水平抑制肝癌细胞的增殖、迁移和侵袭,并提高肝癌细胞对索拉非尼的敏感性。
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编辑人员丨5天前
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微小RNA-424通过抑制细胞分裂周期37样蛋白1促进人肝癌细胞侵袭和增殖的分子机制
编辑人员丨5天前
目的:探讨微小RNA-424(miR-424)通过细胞分裂周期37样蛋白1(CDC37L1)调控人肝癌细胞增殖和侵袭的分子机制。方法:选取2018年1月至2020年12月漳州正兴医院收集的68例人肝癌患者的肿瘤组织和癌旁组织。采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测目标基因的表达水平。运用人肝癌细胞系HepG2作为研究对象,外源性转染改变其miR-424表达水平,利用Transwell实验、划痕实验和细胞计数试剂盒(CCK-8)分析3组细胞的迁移和增殖能力差异。采用生物信息学预测miR-424的靶基因并利用双荧光报告基因实验检测其与靶基因的相互作用,两组间的比较采用 t检验,多组的组间比较采用One-way ANOVA。 结果:人肝癌患者的癌旁组织中,miR-424的表达水平(0.95±0.15)明显低于肿瘤组织(2.24±0.32, P<0.01)。miR对照组细胞吸光度值(Day 2:0.67±0.12;Day 3:0.92±0.11),明显低于miR-424模拟物组(Day 2:0.89±0.15, P<0.01;Day 3:1.21±0.12, P<0.01),同时,明显高于miR-424抑制物组(Day 2:0.48±0.13, P<0.01;Day 3:0.73±0.09, P<0.01)。miR对照组划痕两侧细胞的距离[Day 2:(8.72±0.712) mm;Day 3:(6.33±0.52) mm]明显高于miR-424模拟物组[Day 2:(5.21±0.68) mm, P<0.05;Day 3:(4.05±0.33), P<0.01],同时明显低于miR-424抑制物组[Day 2:(13.12±2.042) mm, P<0.01;Day 3:(8.12±0.45) mm, P<0.01]。miR对照组单位面积穿过微孔膜细胞的数量[(39.23±8.11)个]明显低于miR-424模拟物组[(82.50±5.28)个, P<0.01],同时明显高于miR-424抑制物组[(32.25±4.94)个, P<0.01]。CDC37L1是miR-424的靶基因,转染miR对照的HepG2细胞CDC37L1表达水平(0.97±0.12)明显高于miR-424模拟物组细胞(0.62±0.13, P<0.01),同时显著低于miR-424抑制物组细胞(2.74±0.32, P<0.01)。同时,癌旁组织中CDC37L1表达水平(1.73±0.25)明显高于人肝癌组织(1.01±0.13, P<0.01)。miR-424和CDC37L1的表达水平之间呈明显负相关( r=-0.648, P<0.01)。 结论:人肝癌细胞中miR-424表达显著升高,从而下调CDC37L1的表达,进而促进肿瘤细胞的增殖、迁移及侵袭能力。
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编辑人员丨5天前
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LncRNA MCM3AP-AS1调节miR-424-5p/PSAT1轴对乳腺癌恶性进展的影响
编辑人员丨1个月前
目的:探讨长链非编码核糖核酸(lncRNA)微小染色体维持蛋白3相关蛋白-反义链1(MCM3AP-AS1)调节微小核糖核酸(miR)-424-5p/磷酸丝氨酸氨基转移酶1(PSAT1)轴对乳腺癌恶性进展的影响.方法:采用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)法检测人正常乳腺上皮细胞MCF-10A和乳腺癌细胞株MDA-MB-231、BT549、BT20中LncRNA MCM3AP-AS1、miR-424-5p和PS AT1信使核糖核酸(mRNA)的表达水平.构建LncRNA MCM3AP-AS1低表达模型、miR-424-5p敲低与过表达模型,并使用RT-qPCR方法验证转染模型构建的成功.分别采用四氮甲基唑蓝(MTT)法、Transwell实验检测乳腺癌细胞株的增殖、迁移、侵袭能力.免疫印迹法检测各组MDA-MB-231细胞中细胞周期蛋白D1(CyclinD1)、E-钙黏蛋白(E-cadherin)、N-钙黏蛋白(N-cadherin)和PS AT1蛋白的表达.经生物信息学分析后,采用双荧光素酶报告基因实验与RNA免疫共沉淀(RIP)实验分别验证LncRNA MCM3AP-AS1与miR-424-5p、miR-424-5p与PSAT1之间的靶向关系.结果:在乳腺癌细胞株MDA-MB-231、BT549、BT20 中 MCM3AP-AS1、PSAT1 mRNA 的表达水平显著高于 MCF-10A(P<0.05),miR-424-5p 表达水平显著低于MCF-10A(P<0.05).敲低MCM3AP-AS1或过表达miR-424-5p均可以降低MDA-MB-231细胞的吸光度(OD490)值、细胞迁移数目和细胞侵袭数目、CyclinD1、N-cadherin和PS AT1蛋白表达水平(P<0.05),提高细胞E-cadherin蛋白表达水平(P<0.05).敲低miR-424-5p的表达逆转了下调MCM3AP-AS1对MDA-MB-231细胞增殖、迁移和侵袭以及相关蛋白表达的影响.双荧光素酶报告基因实验与RIP实验证实MCM3AP-AS1靶向负调控miR-424-5p表达,miR-424-5p靶向负调控PSAT1的表达.结论:LncR-NA MCM3AP-AS1在乳腺癌中呈高表达,其低表达可通过靶向调节miR-424-5p/PSAT1轴抑制乳腺癌的恶性进展.
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编辑人员丨1个月前
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脓毒症并发急性肾损伤患儿血清中miR-93-5p和miR-424-5p的表达及临床意义
编辑人员丨2024/4/6
目的 探讨血清中微小RNA-93-5p(miR-93-5p)和微小RNA-424-5p(miR-424-5p)在脓毒症并发急性肾损伤(S-AKI)患儿中的表达水平及其临床意义.方法 选取2019年11月至2021年11月南阳市中心医院综合ICU收治的116例脓毒症患儿作为研究对象,根据脓毒症患儿是否并发AKI分为AKI组60例和非AKI组56例;比较两组患儿的一般资料和血清miR-93-5p、miR-424-5p及肾功能指标[血肌酐(Scr)、胱抑素C(Cys-C)]水平;采用Pearson法分析S-AKI患儿血清miR-93-5p、miR-424-5p与肾功能指标的相关性;采用多因素Logistic回归分析脓毒症患儿并发AKI的影响因素;采用受试者工作特征曲线(ROC)分析血清miR-93-5p、miR-424-5p水平对脓毒症患儿并发AKI的诊断价值.结果 AKI组患儿的尿量为(1.52±0.31)mL·kg-·1 h-1、血清miR-93-5p表达水平为0.62±0.14,均明显低于非AKI组的(1.87±0.36)mL·kg-·1 h-1、(1.02±0.21),急性生理学与慢性健康状况评分(APACHEⅡ评分)、序贯器官衰竭评分(SOFA评分)、血清miR-424-5p表达水平、Scr、Cys-C水平分别为(17.35±5.01)分、(5.77±1.80)分、(2.36±0.51)、(182.84±43.31)μmol/L、(1.63±0.39)mg/L,明显高于非AKI组的(14.96±4.12)分、(5.10±1.41)分、(1.01±0.23)、(91.51±28.34)μmol/L、(0.96±0.28)mg/L,差异均有统计学意义(P<0.05);经Pearson法分析结果显示,S-AKI患儿血清miR-93-5p与Scr、Cys-C呈负相关(r=-0.621、-0.720,P<0.05),miR-424-5p与Scr、Cys-C呈正相关(r=0.503、0.538,P<0.05);经多因素Logistic回归分析结果显示,miR-424-5p、Scr、Cys-C是影响脓毒症患儿并发AKI的危险因素,miR-93-5p是保护因素(P<0.05);经ROC分析结果显示,血清miR-93-5p、miR-424-5p以及两者联合诊断脓毒血症患儿并发AKI的AUC分别为0.856、0.860、0.949,联合诊断的敏感度为90.00%,特异性为91.07%,两者联合优于血清miR-93-5p、miR-424-5p各自单独诊断(Z 两者联合-miR-93-5p=2.897、Z 两者联合-miR-424-5p=2.706,P=0.004、P= 0.007).结论 S-AKI患儿血清miR-93-5p水平显著下调,miR-424-5p水平显著上调,两者联合诊断脓毒血症患儿并发AKI具有更高价值.
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编辑人员丨2024/4/6
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lncRNA NEAT1调节miR-424-5p/ELK4轴对ox-LDL诱导的血管内皮细胞损伤、Lp-PLA2和CRP水平的影响
编辑人员丨2024/3/30
目的:探讨长链非编码 RNA核旁斑组装转录本 1(lncRNA NEAT1)在氧化型低密度脂蛋白(ox-LDL)诱导的血管内皮细胞损伤中的分子机制和功能.方法:收集健康人和动脉粥样硬化(AS)病人血液标本并通过实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测血清中 lncRNA NEAT1、微小 RNA-424-5p(miR-424-5p)和 ETS域蛋白 4(ELK4)mRNA表达水平.体外培养人脐静脉内皮细胞(HUVEC),qRT-PCR和蛋白免疫印迹法(Western Blot)检测细胞中lncRNA NEAT1、miR-424-5p和ELK4表达情况;细胞计数试剂盒(CCK-8)法和膜联蛋白 V-异硫氰酸荧光素/碘化丙啶(Annexin V-FITC/PI)法检测 HUVEC细胞增殖活力和凋亡情况;酶联免疫吸附法(ELISA)测定HUVEC中乳酸脱氢酶(LDH)释放量、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和白细胞介素(IL)-1β含量、脂蛋白磷脂酶A2(Lp-PLA2)和C反应蛋白(CRP)水平;采用双荧光素酶报告基因测定 lncRNA NEAT1、miR-424-5p和 ELK4 之间的靶向相互作用.进行动物实验以评估 lncRNA NEAT1在体内 AS进展中的作用.结果:lncRNA NEAT1在 AS病人血清和ox-LDL诱导的 HUVEC中显著上调(P<0.05).lncRNA NEAT1的沉默可削弱 ox-LDL引发的细胞毒性,降低 Lp-PLA2和CRP水平,并减少ApoE-/-小鼠的脂质异常分泌(P<0.05).miR-424-5p是 lncRNA NEAT1在调节 ox-LDL诱导的 HUVEC损伤中的功能介质,ELK4是miR-424-5p的直接靶标(P<0.05).miR-424-5p的抑制或ELK4的过表达逆转了lncRNA NEAT1沉默对ox-LDL诱导的HUVEC细胞损伤的影响(P<0.05).结论:沉默lncRNA NEAT1可通过调控 miR-424-5p/ELK4轴保护 HUVEC免受 ox-LDL触发的细胞毒性,降低 Lp-PLA2和 CRP水平.
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编辑人员丨2024/3/30
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微小RNA-424-5P靶向调控HMGA1基因对胃癌细胞生长、侵袭的影响
编辑人员丨2023/11/11
目的 研究微小RNA(miR)-424-5P对高迁移率族蛋白(HMG)A1 的靶向调控及对胃癌细胞增殖、迁移的作用.方法 将人胃癌BGC-823 细胞复苏后,应用 10%胎牛血清,在 5%二氧化碳和 37℃培养箱中进行培养,应用miR-424-5P抑制物(inhibitor)转染的BGC-823 细胞列为anti-miR-424-5P组.应用阴性对照进行转染的BGC-823 细胞列为anti-NC组,不进行转染的BGC-823 细胞列为对照组,细胞转染后各组继续在培养箱中培养.应用qRT-聚合酶链反应(PCR)检测各组miR-424-5P的相对表达水平;应用四甲基噻唑蓝(MTT)研究miR-424-5P对细胞增殖的影响;应用划痕实验检测miR-424-5P对细胞迁移的影响;应用transwell实验研究miR-424-5P对细胞侵袭的影响.应用免疫印迹实验对各组HMGA1 蛋白相对表达水平进行检测.结果 转染 48 h后qRT-PCR结果表明,anti-miR-424-5P组miR-424-5P相对表达量明显低于对照组和anti-NC组(P<0.05).对BGC-823 细胞进行转染 48 h后,miR-424-5P OD值显著低于anti-NC组和对照组(P<0.05).与anti-NC组和对照组相比,anti-miR-424-5P组迁移距离显著较低(P<0.05).与anti-NC组和对照组相比,anti-miR-424-5P 组迁移数量显著较少(P<0.05).与对照组和anti-NC组比较,anti-miR-424-5P组HMGA1 蛋白的表达水平显著较高(P<0.05).结论 miR-424-5P能够靶向调控HMGA1 对胃癌细胞的生长、侵袭,可为胃癌的治疗提供新的靶点和治疗策略.
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编辑人员丨2023/11/11
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胎盘微血管指数、子宫动脉血流参数联合血清微小RNA预测胎儿生长受限价值
编辑人员丨2023/10/28
目的:探究胎盘微血管指数、子宫动脉血流参数联合血清miR-424、miR-221预测胎儿生长受限(FGR)临床价值.方法:回顾性收集2020年1月-2022年8月本院产前检查并分娩的孕中期孕妇163例临床资料,其中正常妊娠为正常组(n=96例),诊断为FGR为FGR组(n=67例).两组孕妇于孕14~21周行彩色多普勒超声检查,获得胎盘血管指数[血管化指数(VI)、血流指数(FI)、血管化-血流指数(VFI)]、自动动脉血流参数[动脉血流收缩期峰值流速/舒张末期峰值流速(S/D)、搏动指数(PI)、阻力指数(RI)],实时荧光定量PCR法检测血清miR-424、miR-221表达量;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析各指标对FGR的诊断价值.结果:FGR组VI、VFI值低于正常组,两组FI值无差异(P>0.05).FGR 组 S/D、PI、RI 值均高于正常组,FGR 组血清 miR-424(0.29±0.14)、miR-221(1.68±0.25)表达量均高于正常组(0.13±0.07、1.02±0.20)(P<0.05).ROC 曲线分析显,VI、VFI、S/D、PI、RI、miR-424、miR-221诊断 FGR 的曲线下面积(AUC)分别为 0.818、0.856、0.764、0.679、0.862、0.793、0.856,联合检测的 AUC 为 0.962,灵敏度91.0%、特异度90.6%,联合检测的诊断价值高于单独检测.结论:胎盘微血管指数、子宫动脉血流参数与血流miR-424、miR-221表达联合检测,对预测孕妇发生FGR有较高价值,可作为临床评估母婴预后的有效指标.
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编辑人员丨2023/10/28
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肺炎支原体感染诱发哮喘患儿血清中miR-424-5p和CX3CL1表达水平及与预后预测价值研究
编辑人员丨2023/8/19
目的 检测肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,MP)感染诱发哮喘患儿血清中微小核糖核酸(micro RNA,miR)-424-5p和CX3CL1 表达水平及其与患儿预后的关系.方法 选取 2020 年 3 月~2021 年 5 月在内江市第一人民医院进行治疗的MP感染患儿128例作为研究对象,根据是否诱发哮喘分为哮喘组(n=82)和MP组(n=46),另选取50 例健康儿童作为对照组.分别比较哮喘组、MP组和对照组血清miR-424-5p,CX3CL1,IgE,IL-6,TNF-α水平和肺功能指标;根据哮喘患儿预后情况分为预后良好组(n=50)和预后不良组(n=32),分析哮喘患儿预后情况与临床病理特征的关系;采用Kaplan-Meier法分析MP诱发哮喘患儿血清中miR-424-5p和CX3CL1表达与患儿预后的关系;采用多因素Logisitic回归分析MP诱发哮喘患儿预后的影响因素.结果 对照组、MP组和哮喘组血清miR-424-5p(0.95±0.26,1.12±0.35,1.34±0.39),CX3CL1(0.47±0.08,0.62±0.17,0.91±0.22 ng/ml),Ig E(22.64±5.74,41.26±8.91,52.31±10.26 IU/ml),IL-6(5.26±0.90,8.24±1.07,9.14±1.18 ng/L)和 TNF-α(55.27±10.54,88.56±18.67,105.26±26.48 pg/ml)水平依次升高,差异具有统计学意义(F=20.287,103.274,174.470,205.317,87.349,均P<0.05).对照组、MP组和哮喘组肺功能指标VC(80.24±19.35,62.35±15.48,51.26±12.38 ml),FVC(78.35%±18.29%,60.21%±16.34%,48.36%±11.73%)和FEV1(63.31%±17.26%,44.26%±10.31%,38.69%±9.58%)依次降低,差异具有统计学意义(F=54.943,61.821,63.006,均P<0.05).哮喘患儿预后良好组血清Ig E,IL-6,TNF-α,miR-424-5p和CX3CL1 水平均明显低于预后不良组,差异具有统计学意义(t=3.825,6.137,3.086,4.003,6.044,均P<0.05).Kaplan-Meier法分析显示,血清miR-424-5p低表达组和CX3CL1 低表达组患儿预后良好率高于高表达组(χ2=4.377,4.172,均P<0.05).多因素Logistic回归分析结果显示,Ig E,IL-6,TNF-α,miR-424-5p和CX3CL1水平为MP诱发哮喘患儿预后的影响因素(P<0.05).结论 MP诱发哮喘患儿血清miR-424-5p和CX3CL1水平上调,且二者水平变化与患儿预后情况密切相关.
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编辑人员丨2023/8/19
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1型糖尿病患者外周血单个核细胞miR-146a、miR-150和miR-424的异常表达及临床意义
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨微小RNA(miR-150、miR-146a、miR-181a、miR-424、miR-142-3p)在T1DM患者外周血单个核细胞(PBMCs)中的表达情况及临床意义.方法 应用实时荧光定量聚合酶反应检测69例T1DM患者、46例T2DM患者和56名健康对照者(NC) PBMCs miRNAs的表达水平.应用受试者工作特征(ROC)曲线评价有差异表达的miRNAs对T1DM的诊断价值,同时将其表达量与临床指标进行相关性分析.结果 与NC组和T2DM组比较,T1DM组PBMCs中miR-146a、miR-424、miR-150相对表达量降低(P<0.05).T1DM组和NC组ROC曲线下面积(AUC)分别为(0.860±0.061)、(0.905±0.058)和(0.844±0.066);T1DM组和T2DM组AUC分别为(0.868±0.068)、(0.921±0.064)和(0.698±0.065);与GADAb抗体阴性者比较,miR-146a、miR-150、miR-424在GADAb抗体阳性的T1DM患者中进一步下降.结论 miR-146a、miR-150、miR-424在T1DM患者PBMCs中低表达,可能与自身免疫状态有关,有助于早期发现T1DM患者.
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编辑人员丨2023/8/6
