目的:分析北京批发市场肉类食品中沙门菌的表型和基因组特征。方法:对分离自北京市批发市场的336株肉类食品来源沙门菌，采用微量肉汤稀释法对25种抗菌药物进行耐药性测试，开展全基因组测序并使用SeqSero2、SISTR软件分析血清型和ST型，使用Abricate软件的CARD、VFDB模块预测菌株的耐药基因和毒力因子，使用沙门菌分子血清分型试剂盒和血清凝集法验证部分疑难菌株血清型。结果:336株沙门菌菌株对萘啶酸、氨苄西林的耐药率分别为62.5%（210/336）和55.1%（185/336），对替加环素、头孢西丁和碳青霉烯类抗菌药物均敏感；207株（61.6%，207/336）为多重耐药株，最高可同时耐受10类药物，最常见耐药谱为NAL-AMP-SAM。共检出24种血清型，主要型别为肠炎（34.5%，116/336）、德尔卑（17.3%，58/336）和印第安纳（10.4%，35/336）；共检出27种ST型，主要型别为ST11，ST型与血清型较为相符。氨基糖苷类、氟喹诺酮类、β-内酰胺类、磺胺类、四环素类耐药基因的携带率均超过48%，耐药基因预测与耐药表型结果一致性较高；共预测出122种毒力基因，其中74种携带率达100%。结论:北京市批发市场肉类食品中沙门菌中多重耐药比例较高、耐药谱复杂，血清型和ST型种类多样，耐药基因和毒力基因携带率较高，耐药表型和基因型较为一致。

目的:分析不同来源德尔卑沙门菌的耐药特征、耐药机制及基因组相似性，初步揭示我国德尔卑沙门菌的群体遗传学特征，发现可能的传播规律或潜在传播途径，为加强沙门菌病监测及防控策略制定提供一定参考。方法:对201株德尔卑沙门菌进行16种抗生素的药物敏感性试验，并对所有菌株进行全基因组测序。最后结合公开数据库中的134株德尔卑沙门菌基因组序列，对335株德尔卑沙门菌进行耐药基因型别和多位点序列分型（MLST）分析，并构建基于核心基因组单核苷酸多态性的系统发育树进行遗传进化分析。结果:201株德尔卑沙门菌对16种抗生素呈现不同程度的耐药，总耐药率为97.51%。不同来源（人、动物、食品）的德尔卑沙门菌对不同种类抗生素耐药率差异有统计学意义（均 P<0.05）。335株德尔卑沙门菌携带耐药基因38种，磷霉素类耐药基因 fosA7携带率为100.00%，氨基糖苷类耐药基因 aac（6'）- Iaa携带率为99.70%。不同种类抗生素耐药基因和耐药表型一致性存在差异，除氨基糖苷类和氯霉素类，其他种类抗生素一致性较好。MLST显示，334株德尔卑沙门菌为ST40型。系统发育树显示存在动物和人、食品和人之间交叉感染的风险以及动物带菌远距离跨省播散的可能，但还需要进一步的流行病学研究。 结论:我国德尔卑沙门菌耐药形势严峻，并且存在交叉传播的风险，提示应加强综合监测及风险评估，防止耐药菌株及耐药元件在动物、食品、人链条中的播散。

目的:了解杭州地区临床和食品来源德尔卑沙门菌的耐药特征，并进行溯源分析。方法:对2015—2020年杭州地区分离的60株德尔卑沙门菌进行药敏分析、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型和全基因组测序，并下载公共数据库基因组进行比较；利用测序数据对菌株进行多位点序列分型(MLST)、核心基因组多位点序列分型(cgMLST)和耐药基因扫描，并构建基于单核苷酸多态性(SNP)位点的系统发育树。结果:杭州地区德尔卑沙门菌临床株和食品株对28种药物的耐药率差异均无统计学意义，多重耐药率为76.7%(46/60)；所有菌株均检出氨基糖苷乙酰转移酶基因 aac(6′)- Iaa和磷霉素耐药基因 fosA7；60株德尔卑沙门菌共分为46种PFGE带型、53种cgMLST(HC2)型别，除1株为ST3220型外，其余均为ST40型；基于439株德尔卑沙门菌(包括60株杭州菌株和379株公共数据库菌株)SNP位点构建的系统发育树显示：部分杭州菌株与东南亚菌株进化距离较近，提示可能存在跨境传播，食品株主要来自猪肉和水产类；其他杭州菌株与北京、广州、湖北、重庆等省市的菌株距离较近，提示可能存在跨省传播，食品株主要来自猪肉、牛肉和鸡肉。 结论:杭州地区德尔卑沙门菌的流行主要由ST40型引起，其多重耐药现象普遍，推测其临床感染与猪牛肉、鸡肉和水产类的消费密切相关，与东南亚地区和境内其他省市可能存在跨地传播。

目的 明确浙江省市售猪肉中非伤寒沙门菌(non-typhoidal Salmonella,NTS)的污染特征、影响因素及血清型分布.方法 2017-2021年在浙江省流通和餐饮环节采集猪肉样品999份,按《GB 4789.4-2016食品安全国家标准食品微生物学检验沙门氏菌检验》开展猪肉中NTS的定性检测和血清学分型,采用MPN计数法进行NTS定量检测.结果 浙江省市售猪肉中NTS检出率为39.94％(339/999),9.32％(26/279)的样品中NTS污染水平＞55 MPN/g,不同猪肉类型、采样场所和采样季节采集的猪肉NTS检出率差异有统计学意义(P＜0.05).猪肉类型、采样季节和采样场所是影响NTS检出的重要因素,夏季是影响阳性猪肉样本中NTS污染水平的显著因素(P＜0.05).445株NTS分离株共分为48种血清型,主要为里森沙门菌(19.33％)、伦敦沙门菌(14.38％)、德尔卑沙门菌(13.48％)和鼠伤寒沙门菌(9.66％).结论 2017-2021年浙江省市售猪肉NTS检出率高,污染程度受多方面因素影响,血清型多样.

目的 了解遵义市食源性沙门菌分型及耐药特征.方法 收集遵义市2020-2022年食源性沙门菌,采用玻片凝集法对沙门菌进行血清分型,利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对沙门菌进行分子分型,采用肉汤稀释法对沙门菌进行耐药监测,应用BioNumerics软件进行数据分析.结果 收集的21株沙门菌分为16种血清型,其中肯塔基沙门菌3株、德尔卑沙门菌2株、肠炎沙门菌2株、希林登沙门菌2株,其余均为1株.PFGE结果显示带型呈现多态性,同源性最高为62.96％.药敏试验结果显示食源性沙门菌对氨苄西林耐药率最高,为71.43％,其次对四环素耐药率达61.90％,多重耐药率为76.19％.结论 遵义市食源性沙门菌血清型和遗传性多样,对抗菌药物的耐药率高,多重耐药严重.

目的 分析2006-2021年温州地区沙门菌感染流行病学特征,为沙门菌感染的防控提供科学依据.方法 对沙门菌进行鉴定确认和血清学分型,并对流行病学特征进行深入分析.结果 2006-2021年在温州地区42 300份食源性疾病腹泻患者中,共分离出沙门菌1 232株,总分离率为2.91％,共鉴定出90个血清型(14个血清群),其中菌群以O∶4(B)、O∶9(D1)、O∶3,10(E1)、O∶8(C2-C3)、O∶7(C1)为主;血清型以鼠伤寒沙门菌、肠炎沙门菌、伦敦沙门菌和德尔卑沙门菌为主;18～60岁、61岁以上和小于2岁婴幼儿是感染的主要人群;春、夏、秋季易感,具有明显的季节性;5～11月是食源性沙门菌检出的高峰期.结论 温州地区沙门菌感染在季节分布、人群分布等方面具有明显的流行病学特征,应该继续加强食源性疾病监测,进一步提高食品安全隐患的早期识别、预警与防控能力.

目的 研究动物源沙门菌耐药及流行特征.方法 对116株动物源沙门菌进行血清学分型、药物敏感试验、耐药基因(簇)检测和多位点序列(MLST)分析.结果 鸡源沙门菌多为ST11克隆肠炎沙门菌和ST17克隆印第安那沙门菌,猪源沙门菌多属于ST40克隆德尔卑沙门菌.ST11克隆主要表现为对氨苄青霉素、萘啶酸、四环素、头孢哌酮耐药,且多数为多重耐药(MDR);ST17克隆多数对9种以上的药物特别是头孢类及氟喹诺酮类耐药,为超级耐药(Super-MDR)克隆.ST11克隆中bla TEM-1-like携带率最高,ST17克隆中bla OXA-1-like、bla CTX-M、bla TEM-1-like及floR、aadA2、sul1及aac(6’)-1b高携带率是其成为超级耐药克隆的主要原因.结论 抗菌药物特别是头孢类、氟喹诺酮类药物在动物生产中应当控制使用,对控制耐药菌的产生及传播有重要意义.

目的 分析辽宁食源性沙门菌血清型、耐药谱及脉冲场凝胶电泳(PFGE)型别,探讨辽宁沙门菌污染的同源性,为食源性疾病溯源和预警提供基础.方法 对辽宁省2015年食品中、食源性疾病中分离的41株沙门菌进行血清学分型、耐药试验、PFGE分子分型,采用BioNumerics version 6.6软件分析,比较同源性.结果 41株菌分为15个血清型,居前三位的是15株肠炎沙门菌、5株德尔卑沙门菌、5株姆班达卡沙门菌(辽宁省内少见血清型);对41株菌进行15种抗生素的耐药试验,对单一一种抗生素的耐药率为100.0％,其中红霉素97.6％,萘啶酸61.0％,氨苄西林53.7％;41株菌共分为18种PFGE带型,带型分布分散,只有两种优势,一种带型包含20株菌,有14株肠炎沙门菌,6株其他沙门菌,相似度为92.7％～100％;另一种包含5株菌,4株姆班达卡沙门菌,1株鼠伤寒沙门菌,相似度为96.6％～100.0％.结论 辽宁省食源性沙门菌的血清型以肠炎沙门菌为主,生肉制品是其主要污染来源;血清型与PFGE图谱带型分布广泛,相同血清型沙门菌的PFGE带型聚集成簇、菌株具有高度同源性;相同PFGE型别的菌株耐药谱一致或相似;沙门菌的耐药情况较严重.

目的 了解市售生肉中食源性沙门菌污染状况、型别特点及耐药性,为食源性沙门菌病的防治提供依据.方法 依据GB 4789.4《食品安全国家标准食品微生物学检验沙门菌检验》及《国家食品微生物风险监测工作手册》进行沙门菌增菌、分离、鉴定、血清分型及药敏试验.结果 淄博市2009-2016年342份市售生肉中,生畜肉沙门菌的检出率为22.6％(26/115),生禽肉为36.6％(83/227);109株沙门菌分属28个血清型别;生畜肉中以德尔卑沙门菌为主(11/26),其分离株高耐药抗生素为四环素、奈啶酮酸、氯霉素;耐3类以上抗生素的多重耐药菌株为19.2％;生禽肉中以肠炎沙门菌(33/83)和印第安纳沙门菌(25/83)为主,其分离株高耐药抗生素为奈啶酮酸、氨苄青霉素、磺胺嘧啶;耐3类以上抗生素的多重耐药菌株达到73.5％.结论 生肉中食源性沙门菌的污染率较高,生畜肉与生禽肉中沙门菌的主要血清型别不同,对多种抗生素均表现出高耐药率及多重耐药性.

目的 研究上海市市售内制品中沙门菌血清型、耐药谱和分子分型特征.方法 2016年1～8月在上海市所辖16个行政区,随机选择1个密集型社区,抽取1家超市或市场作为哨点,定期采集畜、禽类肉制品,按国家食品安全风险评估中心(CFSA)食源性疾病监测方案进行沙门菌分离、血清分型、抗生素定量检测与剂量评估、优势菌的分子分型.结果 606份样品包括猪、鸡、鸭、牛、羊、鹅肉制品,共分离沙门菌158株,总阳性率为26.1％,畜肉和禽肉来源分别占52.5％ (83/158)和47.5％ (75/158).前5位沙门菌血清型依次为肠炎沙门菌、鼠伤寒沙门菌、德尔卑沙门菌、罗森沙门菌和印第安纳沙门菌,畜肉和禽肉来源优势菌型间差异有统计学意义(P＜0.05);菌株对磺胺异噁唑耐药率最高(79.7％,126/158),对链霉素、萘啶酸、氨苄西林、四环素和氯霉素耐药率在38.0％ ～77.8％,多重耐药(MDR)菌株(≥3类)占77.8％ (123/158),猪肉来源沙门菌对庆大霉素、链霉素、磺胺异噁唑、复方新诺明、氯霉素、四环素耐药率均高于鸡肉来源沙门菌,鸡肉来源沙门菌对头孢噻呋、头孢曲松、萘啶酸耐药率均高于猪肉来源沙门菌,差异均有统计学意义(P＜0.05),32.9％ (52/158)的菌株对至少6种抗生素超检测限值;肠炎沙门菌有15个分型,以1型和3型为优势型;鼠伤寒沙门菌有23个分型,具有遗传多样性特征.结论 上海市市售肉制品沙门菌暴露以猪肉和鸡肉来源为主,肉制品中多重耐药沙门菌污染严重.猪肉来源的罗森沙门菌和鸡肉来源的吉韦沙门菌是新输入性的血清型.