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北京市2021—2022年流行季首起乙型流感疫情的血凝素基因分析
编辑人员丨6天前
目的:分析2021—2022年流行季北京市首起乙型流感Victoria系(BV)疫情的病毒血凝素(HA)的基因变异和进化特征以及与流感疫苗株的匹配性。方法:采集北京市朝阳区某小学乙型流感疫情流感样病例的咽拭子标本,提取核酸后利用二代测序技术进行测序分析。应用BioEdit分析HA基因的核苷酸和氨基酸变异位点,采用Mega 6.0软件中的NJ模式构建HA基因的遗传进化树并分析。结果:通过二代测序获得了2株BV的HA基因全长序列。与本年度的疫苗株HA基因相比较,疫情株有9个氨基酸位点发生变异,其中6个变异位点位于3个不同的抗原决定簇。遗传进化树分析显示疫情株HA基因位于Clade 1A.3a2分支,与2021—2022年度北半球推荐的流感疫苗株(B/Washington/02/2019)不在同一分支。结论:本起BV疫情毒株的HA基因在抗原表位发生多处变异,必需加强BV流感的监测与变异规律分析,为BV防控策略的制定提供有力的数据支撑。
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编辑人员丨6天前
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2017—2021年贵州省乙型流感病毒遗传进化分析
编辑人员丨6天前
目的:了解贵州省乙型流感病毒BY系和BV系毒株 HA和 NA基因分子进化特征,为流感的科学防控提供依据。 方法:统计贵州省2017—2021年流感各型别阳性比例,提取乙型流感病毒核酸,RT-PCR扩增 HA和 NA基因,进行序列测定14株,并从GISAID获取83株序列,对合计97株乙型流感病毒的序列进行同源性、遗传进化和氨基酸位点变异分析。 结果:贵州省存在甲型、BY系和BV系流感病毒的流行,BV系为优势流行型别;BY系流感病毒 HA和 NA基因与参考疫苗株B/PHUKET/3073/2013相比同源性分别为98.7%~99.4%和98.4%~99.6%,BV系毒株与参考疫苗株B/Colorado/06/2017相比分别为98.3%~99.3%和98.9%~99.6%;贵州省BY系毒株主要属于Y3遗传群, HA基因处于Y3-H1~2两个分支, NA基因处于Y3-N1~3三个分支,发现3株Y3系内重配株;BV系毒株主要属于V1A-2遗传群, HA基因处于V1A-2 H1~4四个分支, NA基因处于V1A-2 N1~5五个分支,发现20株V1A-2系内重配株,未发现系间重配株;关键氨基酸位点变异分析显示抗原决定簇区域位点Y3遗传群无突变,V1A-2遗传群4个主要的抗原决定簇均存在点突变且190螺旋存在移码突变,耐药位点均未发生突变。 结论:贵州省流感流行型别多样,乙型流感病毒与疫苗株同源性差异在增大, HA和 NA基因已进化出不同分支,基因序列存在多种形式的突变,存在系内重配株和新的变种,应持续加强乙型流感病毒的监测研究。
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编辑人员丨6天前
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2017—2020年上海市松江区乙型流感病毒病原学特征分析
编辑人员丨6天前
目的:分析上海市松江区2017—2020年乙型流感病毒流行情况及其血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因特征。方法:使用实时荧光逆转录-聚合酶链式反应检测流感病毒疑似病例的标本,乙型流感病毒阳性标本接种犬肾细胞和鸡胚培养病毒。对乙型流感毒株HA和NA基因测序,序列进行基因进化及氨基酸变异分析,采用神经氨酸酶抑制实验研究毒株对奥司他韦和扎那米韦的敏感性。结果:2017—2020年度松江区乙型流感病毒阳性率为14.24%(506/3 554),主要流行季为冬春季,呈现B/Victoria和B/Yamagata亚型交替流行的特点。松江B/Victoria流行株主要位于1A(△3)B进化分支,少数位于1A及1A(△2)分支,与疫苗株B/Brisbane/60/2008相比,流行株HA和NA核苷酸同源性分别在97.62%~98.19%、98.11%~98.78%,1A(△3)B分支HA蛋白抗原决定簇区突变主要发生在120环和160环。B/Yamagata流行株均位于3进化分支,与疫苗株B/Phuket/3073/2013相比,HA(NA)核苷酸同源性98.71%~99.04%(98.69%~99.27%),未发现抗原决定簇区氨基酸改变。神经氨酸酶抑制实验显示,所测的乙型流感病毒对奥司他韦和扎那米韦均敏感。结论:2017—2020年乙型流感病毒流行株与疫苗株抗原性匹配度不佳,需持续做好乙型流感病毒监测及病原学特征分析,为流感疫苗筛选及药物研发提供科学依据。
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编辑人员丨6天前
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重组病毒蛋白纳米颗粒治疗肺腺癌作用
编辑人员丨6天前
目的:研究基于乙型肝炎病毒核心蛋白的嵌合病毒蛋白纳米颗粒对肺腺癌动物模型的免疫治疗作用,为肺腺癌的纳米治疗技术提供依据。方法:将人上皮细胞生长因子受体-2(human epidermal growth factor receptor-2,HER-2)B细胞抗原决定簇插入乙肝核心蛋白(hepatitis B core protein,HBc)的主要免疫显性区域(Major Immunodominant region,MIR),利用大肠杆菌进行表达纯化后,得到重组蛋白纳米颗粒HBc-HER2。将此重组蛋白纳米颗粒免疫小鼠肺腺癌皮下瘤模型,通过检测其血清中HER-2抗体水平及抗体型别,评价此纳米颗粒免疫原性。通过小鼠皮下瘤大小变化评价肿瘤治疗效果。结果:得到了纯度较高的HBc-HER2重组蛋白,且电镜观察显示其形成了HBc-HER2纳米颗粒,动物实验表明免疫原性强,能够诱导机体产生高滴度的针对HER-2的抗体,并有良好的肿瘤治疗作用。结论:基因重组的HBc-HER2在小鼠肺腺癌皮下瘤模型中有明显的抑制肿瘤作用,为肺腺癌的纳米治疗技术提供了依据。
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编辑人员丨6天前
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2009—2024年山东省甲型H1N1流感病毒血凝素基因进化分析
编辑人员丨6天前
目的:描述并分析山东省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒血凝素(hemagglutinin, HA)基因的多样性,探讨其遗传变异规律,为流感监测、疫情防控和疫苗株匹配度提供科学参考。方法:从GISAID流感数据平台下载2009—2024年流感疫苗推荐株和各分支代表株的HA基因序列,与山东省分离的298株甲型H1N1流感病毒株HA基因序列进行系统发育分析和氨基酸位点变异分析。利用IQ-TREE在线工具的最大似然法(maximum likelihood, ML)构建系统进化树,利用MegAlign软件查看氨基酸位点变异,同时采用NetNGlyc 1.0在线软件预测HA基因潜在的糖基化位点。结果:298株山东省甲型H1N1流感病毒的HA基因同源性为91.2%~100.0%,序列进化分支随时间推移亲缘关系渐远,但进化方向与其他省份大致相同。HA基因氨基酸变异在各年度均有发生,抗原决定簇是其主要变异区域。结论:山东省2009—2024年流感病毒分离株的HA基因仍处于不断进化过程,持续监测流感病毒流行趋势和进化方向对预警流感病毒大流行至关重要。
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编辑人员丨6天前
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淋病奈瑟菌脂寡糖疫苗研究进展
编辑人员丨6天前
淋病奈瑟菌感染所致淋病是最常报告的传染病之一,随着淋病奈瑟菌抗生素耐药性的不断增加,淋病感染已成为全球重要的公共卫生问题,迫切需要开发安全有效的疫苗。脂寡糖(Lipooligosaccharide,LOS)存在于革兰阴性细菌外膜表面,其包含许多重要的抗原决定簇。近些年,大量研究表明LOS可能成为淋病奈瑟菌疫苗及其免疫疗法的最有潜力靶点。本文将就LOS结构、在淋病奈瑟菌感染作用机制、LOS疫苗研究进展以及面临的挑战进行综述,以期为后续相关研究提供参考。
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编辑人员丨6天前
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江苏省2019—2022年乙型流感病毒Victoria系HA基因特征分析
编辑人员丨6天前
目的:分析江苏省2019—2022年乙型流感病毒Victoria系流行特征,了解其基因变异情况,监测江苏省流感活动水平和流行趋势。方法:通过"中国流感监测信息系统"收集的江苏省2019—2022年流感样病例监测数据,选取16株乙型流感病毒Victoria系毒株进行全基因组测序,利用MEGA 7软件构建进化树并进行HA基因序列特征分析。结果:江苏省2019—2022年监测到的流感病毒中乙型流感病毒Victoria系占绝对优势。16株标本株中2019—2020年度的毒株在V1A.3早期分支,而2021—2022年度的毒株则聚类在3a.2亚型分支。与疫苗株相比,2019—2020及2020—2021年度的毒株发生了1个氨基酸位点的改变并增加了1个糖基化位点,而2021—2022年度的毒株则存在多个位点变异,其中H122Q、A127T、R133G、P144L、N150K、S194D及K200R位于抗原决定簇上。结论:江苏省乙型流感病毒Victoria系在多处基因位点发生了变异,提示对该亚型变异的持续监测至关重要,可为疫苗的更新提供重要依据。
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编辑人员丨6天前
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脑炎心肌炎病毒3C蛋白酶抗体的制备和检测
编辑人员丨6天前
目的:制备脑炎心肌炎病毒(Encephalomyocarditis virus, EMCV)的3C蛋白酶抗体并检测抗体特异性反应位点。方法:构建原核表达载体pQE30-3C,将蛋白进行体外原核表达,免疫纯种BALB/c小鼠,制备单克隆抗体,通过Western blot检测制备的抗体与3C蛋白结合的特异性,通过免疫荧光和Western blot检测抗体与EMCV病毒中表达的3C蛋白酶结合的特异性。原核表达具有不同抗原性的EMCV 3C的3个不同片段,并通过Western blot检测单克隆抗体与EMCV 3C蛋白酶不同片段的反应特异性。结果:单克隆抗体与原核表达的3C蛋白酶反应良好,通过Western blot可以检测到病毒中表达的3C蛋白,通过免疫荧光也可以检测到EMCV病毒中的3C蛋白。通过与3C片段的反应发现,单克隆抗体与C端反应,即抗体针对的是C端处的抗原决定簇。结论:成功制备EMCV 3C蛋白酶的抗体,能与原核表达的3C蛋白和病毒3C蛋白反应,且针对的是C端的抗原决定簇。
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编辑人员丨6天前
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北京市2022—2023年甲型H3N2流感病毒流行特征与血凝素基因变异分析
编辑人员丨6天前
目的:掌握2022—2023年北京市流感流行特征及甲型H3N2流感病毒血凝素(hemagglutinin, HA)基因、抗原性变异情况,为北京市流感防控提供科学依据。方法:对北京市2022年第14周至2023年第20周流感病原学监测结果进行统计分析,并选取不同时间、不同人群来源79株甲型H3N2流感病毒,通过HA基因扩增测序及抗原性分析实验,分析其基因变异和进化特征。结果:2022年第14周至2023年第20周,北京市流感病原学监测流感样病例咽拭子24 244份,检出流感病毒核酸阳性4 987份,其中甲型H3N2流感病毒2 749份,检出阳性率为11.34%。79株毒株中50株(63.29%)为疫苗株的低反应株,2022年8~11月毒株中94.44%为低反应株,2023年2~3月毒株中54.10%为低反应株,两者差异有统计学意义( χ2=8.079, P=0.004)。79株甲型H3N2流感病毒HA基因序列与疫苗株A/Darwin/9/2021相比,核苷酸相似度为97.47%~98.47%,氨基酸相似度为97.05%~98.17%。基因进化分析显示2022年8~11月分离的18株毒株均分布在3C.2a1b.2a.1a.1分支,2023年2~3月分离的61株则均分布在3C.2a1b.2a.2a.3a.1分支。与疫苗株相比存在多位点变异,分布于A、B、C、D、E多个抗原决定簇及受体结合位点处。所有毒株存在8NST、22NGT、38NAT、45NSS、63NCT、126NWT、133NGT、246NST、285NGS、483NET潜在的糖基化位点,1株毒株165NVT位点缺失;2023年2~3月的55株毒株122NES缺失。 结论:2022年第14周至2023年第20周北京市监测到的甲型H3N2流感病毒HA基因位点多处发生变异,对该亚型变异的持续监测至关重要。
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编辑人员丨6天前
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2021—2022年流感监测季北京市乙型Victoria系流感病毒血凝素基因特性和抗原性分析
编辑人员丨6天前
目的:分析2021—2022年流感监测季北京市乙型Victoria系流感病毒(BV)的血凝素(hemagglutinin, HA)基因特性、抗原性及与流感疫苗组分株的匹配性。方法:采集2021—2022年流感监测季流感样病例(influenza like-illness, ILI)咽拭子样本经MDCK和鸡胚培养分离流感病毒,提取病毒核酸后测序。应用MEGA5.0进行病毒HA基因的核苷酸和氨基酸变异,采用maximum likelihood方法构建HA基因的遗传进化树,在线预测N-糖基化位点。SWISS-MODEL同源建模,建立BV毒株HA的蛋白质三维空间模拟图。通过血凝抑制(hemagglutination inhibition, HI)试验,进行毒株的抗原性分析。结果:共收集402株BV毒株,选取58株测序获得HA基因全长序列,与本年度的疫苗组分BV株(B/Washington/02/2019)HA基因相比较显示,有27个氨基酸位点发生变异,其中11个变异位点位于4个不同的抗原决定簇。遗传进化树分析显示:3个进化分支的毒株共同流行,其中54株(54/58,93.10%)HA基因位于Clade 1A.3a2分支,2株(2/58,3.45%)位于Clade 1A.3a1分支上,2株(2/58,3.45%)与2021—2022年度疫苗组分BV株在同一分支Clade 1A.3。其中2株相对于疫苗组分BV株增加一个197位糖基化位点,其余56株的糖基化位点未发现变化。抗原性分析结果显示:35株为疫苗组分BV株的类似株(35/58, 60.34%),23株为低反应株(23/58,39.66%)。结论:2021—2022流感监测季有3个进化分支的BV毒株在北京市人群中共同流行,其中Clade 1A.3a2毒株为优势株(93.10%),且与疫苗组分BV株进化距离有一定的偏离;占比近四成(39.66%)的毒株为疫苗低反应株。本研究结果提示,持续监测流感流行毒株的变异,及时为疫苗组分株筛选提供实验室依据,是应对流感大流行的基本技术保证。
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编辑人员丨6天前
