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弗氏枸橼酸杆菌中发现介导 blaKPC-2传播的新型质粒及比较基因组学分析
编辑人员丨1周前
目的:探讨来自弗氏枸橼酸杆菌的产碳青霉烯酶的新型不相容群组质粒pNY2385-KPC的耐药机制及基因结构特征。方法:从宁波市医疗中心李惠利医院急诊病房的发热患者尿液样本中获得1株多药耐药菌。采用16S rRNA基因扩增和平均核苷酸一致性(ANI)进行菌种鉴定;采用全自动细菌鉴定及药敏分析系统检测细菌MIC值;通过“三代”测序方法获得基因组序列,然后通过BLASTP/BLASTN、RefSeq、ConservedDomains、ResFinder、Isfinder等对基因功能进行详细注释及比较基因组学分析。结果:弗氏枸橼酸杆菌NY2385携带的质粒pNY2385-KPC为一种新型不相容群组质粒,包含 blaKPC-2,具有接合转移(Ⅳ型分泌系统)基因,可发生接合转移。NCBI中共检索到同型质粒15个,来源于弗氏枸橼酸杆菌、黏质沙雷菌、大肠埃希菌、阴沟肠杆菌、肺炎克雷伯菌和植生拉乌尔菌等细菌,为泛宿主质粒。通过对来自弗氏枸橼酸杆菌中6个该新型质粒进行序列比较分析,发现该新型质粒结构具有一定的保守性,具有携带 blaKPC-2的Tn 6296变体结构,而且质粒pCF1807-3同时具有 repApNY2385-KPC和 repAIncX8。 结论:弗氏枸橼酸杆菌中的pNY2385-KPC型质粒均携带 blaKPC-2耐药基因,分为 repApNY2385-KPC单复制子和 repApNY2385-KPC/ repAIncX8双复制子两种亚型,属于泛宿主质粒,作为可移动遗传元件促进了 blaKPC-2的传播。
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编辑人员丨1周前
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新生儿解鸟氨酸拉乌尔菌败血症7例并文献复习
编辑人员丨1周前
目的:探讨新生儿解鸟氨酸拉乌尔菌败血症的临床特征。方法:回顾性分析湖南省儿童医院新生儿科2010年1月至2020年12月诊断为新生儿解鸟氨酸拉乌尔菌败血症患儿的临床资料,在PubMed、Web of Science、Embase数据库、万方数据库、中国期刊全文数据库、国家科技图书文献中心、中国科技论文在线检索新生儿解鸟氨酸拉乌尔菌败血症相关文献,检索时间均为建库至2020年12月31日,总结新生儿解鸟氨酸拉乌尔菌败血症临床特点及治疗情况。结果:研究期间共确诊7例患儿,男6例,女1例,早产儿6例,足月小样儿1例。反应差6例,发热5例,呼吸困难3例。合并坏死性小肠结肠炎4例,先天性肠旋转不良、先天性空肠闭锁、肠粘连肠狭窄各1例,4例有手术史。白细胞增多3例,白细胞减少1例,均有血小板减少及炎性指标升高。7例患儿均治愈或好转出院。共纳入4篇文献4例新生儿,男3例,女1例,早产儿2例。皮肤潮红、呼吸困难各3例,发热2例,反应差1例。1例因先天性心脏病手术治疗。白细胞减少2例,白细胞增多1例,血小板减少2例,炎性指标升高3例。1例因感染性休克死亡,其余3例均治愈或好转出院。结论:新生儿解鸟氨酸拉乌尔菌败血症多发生于合并肠道疾患、有手术等侵袭性操作病史、抵抗力低下的早产或足月小样儿以及合并先天性畸形的新生儿,多数抗感染治疗效果好,如合并感染性休克预后不良。
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编辑人员丨1周前
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在开放气道下ARDS治疗前后肺部微生态的变化
编辑人员丨1周前
目的:分析急性呼吸窘迫综合征(ARDS)患者治疗前后肺部微生态的异同,根据不同预后,寻找ARDS患者肺部微生态在疾病转归中的变化规律。方法:采用回顾性研究方法,选择2019年2月至2020年1月江门市中心医院重症监护病房(ICU)收治的重症肺炎导致ARDS患者作为研究对象。将患者分为治疗前组(24例)、治疗后存活组(17例)、治疗后死亡组(7例);以同期本院ICU收治的存在轻度肺部感染的非ARDS患者为对照组(25例)。分析并比较4组患者肺部微生态的异同,筛选与ARDS死亡相关的可能致病菌(潜在的死亡危险因素)及ARDS生存相关的益生菌(潜在的生存保护因素)。结果:病原微生物方面,治疗后死亡组大肠埃希菌和白色念珠菌的阳性检出率较治疗后存活组明显升高〔57.1%(4/7)比5.9%(1/17),57.1%(4/7)比0% (0/7),均 P<0.05〕。而在背景菌筛选中,治疗前组较治疗后存活组、治疗后死亡组较治疗后存活组、治疗后死亡组较对照组同时减少的菌属可能是肺部益生菌(潜在的ARDS生存保护因素),结果筛选出共同的菌属为氢化杆菌属〔治疗前组比治疗后存活组:62.5% (15/24)比94.1%(16/17),治疗后死亡组比治疗后存活组:14.3%(1/7)比94.1%(16/17),治疗后死亡组比对照组:14.3%(1/7)比96.0%(24/25),均 P<0.05〕。治疗后死亡组较治疗前组、治疗后死亡组较治疗后存活组、治疗后死亡组较对照组同时增加的菌属为可能的肺部致病菌(潜在的ARDS死亡危险因素),结果筛选出共同的菌群有爱德华菌属、肠杆菌属、埃希杆菌属、克雷伯菌属、克吕沃尔菌属、莱略特菌、泛菌属、拉乌尔菌属等肠杆目菌群。 结论:肺部病原微生物中大肠埃希菌或白色念珠菌增加,或背景菌出现肠杆目菌群增多可能是ARDS患者死亡的危险因素。氢化杆菌属可能是ARDS患者存活的保护因素,能否作为ARDS的新治疗手段值得继续探讨。
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编辑人员丨1周前
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肺炎克雷伯菌肝脓肿患者临床特征分析
编辑人员丨2024/2/3
目的 回顾分析总结细菌性肝脓肿(PLA),特别是肺炎克雷伯菌(KP)肝脓肿患者病原学、影像学表现和治疗效果,以提高对该病的诊治水平.方法 2017 年1 月~2022 年5 月我院收治的PLA患者110 例,给予抗感染和超声引导下穿刺抽脓治疗,行血或/和脓液培养.采用化学发光法检测血清高敏C反应蛋白(hs-CRP),采用双抗体夹心免疫发光法检测血清降钙素原(PCT);采用Clauss法检测血清纤维蛋白原.结果 在本组110 例PLC患者中,血培养或脓液培养阳性70 例(63.6%),其中KP 48 例(68.6%),大肠杆菌7 例(10.0%),链球菌4 例(5.7%),葡萄球菌3 例(4.3%),粪肠球菌3 例(4.3%),屎肠球菌2 例(2.8%),解鸟氨酸拉乌尔菌、肠炎沙门氏菌和奇异变形杆菌各 1 例(4.3%);在 70例细菌培养阳性的PLA患者中,肺炎克雷伯菌肝脓肿(KPLA)48 例,非肺炎克雷伯菌肝脓肿(N-KPLA)22 例;KPLA组年龄为58(49,66)岁,显著年轻于N-KPLA组[65(61,74)岁,P<0.05];KPLA组合并糖尿病、胆系手术史和胆系感染发生率分别为56.2%、8.3%和14.6%,与N-KPLA组的22.7%、27.3%和45.4%比,差异显著(P<0.05);KPLA组血肌酐(sCr)、高敏C反应蛋白(hs-CRP)、降钙素原(PCT)和纤维蛋白原分别为88.7(60.8,115.4)μmol/L、170.5(86.3,240.5)mg/L、20.2(9.8,31.5)ng/L和6.4(5.0,7.8)g/L,与N-KPLA组[分别为100.3(62.3,145.0)μmol/L、132.6(60.6,181.2)mg/L、26.8(13.4,40.6)ng/L和5.3(4.3,7.1)g/L]比,差异具有统计学意义(P<0.05);影像学检查发现,KPLA组薄壁脓腔、脓腔分隔、脓液液化发生率分别为83.3%、62.5%和97.9%,均显著高于N-KPLA组的54.5%、31.8%和72.7%(P<0.05);在48 例KPLA患者中,短期治愈率为70.8%,在N-KPLA患者为59.1%,两组住院时间分别为20(15,28)d和22(16,28)d(P>0.05).结论 在PLA患者中,常见的病原体为KP,了解其发病和脓腔特征,给予抗感染和穿刺抽脓治疗,大多预后良好.
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编辑人员丨2024/2/3
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医院污水中高度耐碳青霉烯肠杆菌科细菌
编辑人员丨2023/8/6
目的 医院污水汇集了来自医院的所有排泄物及液体,是耐药基因的重要储存库.目前,高度耐碳青霉烯肠杆菌科细菌(CRE)是最严重的耐药威胁之一,本研究致力于研究医院污水中高度耐药CRE的流行情况以及碳青霉烯酶基因类型.方法 医院污水涂布于含美罗培南(32μg/mL)的显色平板,得到可能的高度耐药CRE,PCR法检测blaNDM、blaKPC、blaGEs、blaOXA-48、blaIMP、blaIMI和blaVIM等常见碳青霉烯酶的编码基因,并对检出的基因进行全序列测序.通过ERIC-PCR分析克隆相关性;将同一克隆的菌株通过扩增和测序gyrB鉴定到菌种.结果 污水中获得96株高度耐药CRE,它们来自于30个不同的克隆,包括14株弗氏柠檬酸杆菌、6株肺炎克雷伯菌、4株丙二酸盐阴性柠檬酸杆菌、2株植生拉乌尔菌、2株解鸟氨酸拉乌尔菌、1株布氏柠檬酸杆菌和1株大肠埃希菌.所有的CRE均携带有blaKPC-2,其中一株弗氏柠檬酸杆菌同时携带blaNDM-1.结论 医院污水中存在多种类型的高度耐药CRE,以弗氏柠檬酸杆菌最为常见,它们携带的碳青霉烯酶主要为blaKPC-2.因此医院污水可能作为耐药菌的储存库,使耐药基因的易于传播,应予以高度的重视.
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编辑人员丨2023/8/6
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2株耐碳青霉烯类植生拉乌尔菌耐药基因检测分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究耐碳青霉烯类抗菌药物的植生拉乌尔菌耐药机制.方法 收集2014年10月-2015年03月临床分离的两株来自痰液标本耐碳青霉烯类植生拉乌尔菌,采用Vitek2-compact全自动微生物分析仪进行细菌鉴定,并用16S rRNA进行菌株确认,采用E-test进行药敏试验,用PCR扩增检测碳青霉烯酶(KPC、GES、IMI、NDM、VIM、IMP、SIM、OXA-48)、超广谱 β 内酰胺酶(TEM、S HV、CTX-M、VEB、PER)、质粒介导的喹诺酮耐药基因(qnrA、qnrB、qnrS、aac(6')-Ib-cr)以及 Ⅰ 类整合子可变区结构,Southern杂交方法检测2株菌株质粒相关情况.结果 1号菌株携带blaK PC-2和qnrB4耐药基因,Ⅰ 类整合子基因盒种类为arr-3-dfrA27;2号菌株携带blaIM P-4、blaTEM-1、blaCTX-M-3、blaSHV-12、qnrS1和aac(6')-Ib-cr等耐药基因,但无相关整合子基因盒结构.质粒分析发现blaKPC-2和blaIM P-4均位于54kb-60kb可结合质粒上.结论 两株耐碳青霉烯类泛耐药植生拉乌尔菌分别产KPC-2和IM P-4型碳青霉烯酶,需加强耐药监测,避免多重耐药菌播散.
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编辑人员丨2023/8/6
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1例解鸟氨酸拉乌尔菌引起的伤口感染的治疗及文献复习
编辑人员丨2023/8/6
目的 提高对解鸟氨酸拉乌尔茵的临床认识.方法 对1例解鸟氨酸拉乌尔茵引起的伤口感染患者的临床资料进行回顾性分析,并复习相关文献.结果 本例患者因车祸伤致右大腿上段疼痛、肿胀伴功能活动受限1Oh就诊,术后伤口分泌物培养示解鸟氨酸拉乌尔菌,经左氧氟沙星治疗后病情恢复.结论 解鸟氨酸拉乌尔茵正慢慢成为一个新兴的医院获得性感染病原菌,特别是在进行侵入性操作之后.该细菌应引起临床及感控的重视,早期对这些菌株进行识别和采取适当措施进行感染管理,控制其蔓延是非常必要的.
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编辑人员丨2023/8/6
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一株四环素高效降解菌的分离及降解特性
编辑人员丨2023/8/6
四环素类抗生素在养殖业中广泛使用引起药物残留,给环境及人类健康带来了深远影响.从利用四环素类抗生素作为饲料添加剂的养猪厂底泥中,筛选获得一株能够高效降解四环素的细菌XY-1,经革兰氏染色、形态学观察、生理生化及16S rDNA序列分析等,确定该菌株属于拉乌尔菌属,命名为Raoultellasp.XY-1.采用高效液相色谱(HPLC)测定了菌株XY-1对四环素的降解能力,结果表明,该菌株最佳降解条件是温度为25℃,初始pH值为7.0,在此最佳条件下,XY-1在第8天时生长量最大且四环素降解率最高达到70.68%.对XY-1的四环素耐药基因进行了初步探究,首次在该菌株中检测到两种四环素耐药基因tet(D)和tet(E).
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编辑人员丨2023/8/6
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解鸟氨酸拉乌尔菌致儿童感染5例报告并文献复习
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨儿童感染解鸟氨酸拉乌尔菌的临床特征和治疗.方法 回顾性分析5例感染解鸟氨酸拉乌尔菌患儿的临床资料,在PubMed、Web of Science、中国知网、维普数据库和万方数据库中检索解鸟氨酸拉乌尔菌感染的儿童病例,检索时间均为建库至2018年6月15日,复习相关文献.结果 男3例.2例合并先天性发育畸形,分别为3、6月龄;免疫相关性疾病2例,分别为11和16岁;颅脑恶性肿瘤1例,11岁.4例有呼吸机辅助通气史;4例有发热;3例血培养阳性,2例痰培养阳性;3例WBC升高明显,1例WBC降低.2例予环丙沙星,1例予阿米卡星,2例予头孢类抗生素,5例均病情好转出院.共检索到8篇英文文献,报告了9例解鸟氨酸拉乌尔菌感染患儿,与本文报告的5例合并后共14例.年长患儿的原发病以肿瘤性和免疫系统疾病为主,婴幼儿感染者多合并先天性发育畸形;发热为主要症状,新生儿感染以呼吸困难和低氧血症为主要表现,多伴有皮肤潮红和全身红斑;多伴有WBC明显升高;6例行呼吸机辅助通气,5例有留置导尿管,3例行手术治疗或化疗,1例多次行血液净化;血培养为主要鉴定方法,该菌对头孢三代、美罗培南、阿米卡星、环丙沙星和左氧氟沙星敏感度较高;抗感染治疗预后大多良好,合并脓毒症患者可并发多功能脏器衰竭而死亡.结论 儿童感染解鸟氨酸拉乌尔菌多以血源性感染为主,先天性多发畸形、肿瘤和免疫功能低下者易感,有创操作提高感染该菌风险,抗生素优先选择头孢三代、碳青霉烯类、喹诺酮类和氨基糖苷类,选用敏感抗生素治疗预后较好,合并脓毒症者预后较差.
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编辑人员丨2023/8/6
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47例感染性先天性耳前瘘管患者分泌物细菌培养及药敏学分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 明确先天性耳前瘘管感染的致病菌和敏感药物.方法 对我科三年来入院的耳前瘘管分泌物病原菌培养阳性的47例感染性先天性耳前瘘管患者分泌物培养和药敏结果 进行汇总并分析.结果47例患者分泌物共培养出菌群51株,其中2例可疑污染;正常菌群占34.7%.致病菌中:革兰阳性球菌占81.3%,葡萄球菌占68.8%,其他革兰阳性球菌占12.5%;革兰阴性杆菌占12.5%;真菌占3.1%;植生拉乌尔菌占3.1%.未成年组患者革兰阳性球菌构成比显著高于成年组,差异有统计学意义.金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌是主要检出菌,分别占34.4%、25.0%.对青霉素、红霉素、克林霉素耐药率高,达80%以上;对左氧氟沙星等喹诺酮类抗生素及四环素敏感性好,敏感率均为80%以上.结论 金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌为先天性耳前瘘管感染的常见病原菌;不同年龄段患者临床经验性用药应区别对待;所有患者均需根据药敏结果调整用药;警惕多重耐药菌及真菌感染!
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编辑人员丨2023/8/6
