毛霉病是由接合菌门毛霉菌目真菌引起的感染，好发于免疫缺陷及血液肿瘤疾病患儿，死亡率高，为导致儿童白血病患者死亡的重要原因之一。据文献报道，儿童血液肿瘤性疾病患者中毛霉病的发生率为2.2%~6.9% [1,2]。早期识别诊断、及时启动有效抗感染治疗、手术清除感染灶为治疗成功的关键因素。本研究回顾性分析我中心确诊的6例儿童急性白血病合并毛霉病的病例资料，探讨临床特点、诊断、治疗及转归，为临床积累经验。

目的 利用高量测序方法探究生防细菌对丹参植株根际和根表土壤真菌群落多样性的影响.方法 向丹参植株根部施入生防细菌DS-R5,培养45d后采集根际和根表土壤样品提取总DNA,扩增样品基因组DNA的V4-V5区后进行双端测序,利用生物信息学解析生防细菌对丹参植株根际和根表土壤真菌群落多样性的影响.结果 菌株DS-R5处理后增加了根际和根表土壤真菌群落的多样性和丰度;根际土壤共有物种种类大于根表土壤,说明菌株DS-R5处理后根际土壤处理与对照物种种类更接近,而对根表土壤中的微生物物种影响较大.真菌群落结构组成分析结果表明,不同土壤样品在门水平上共有优势真菌主要有子囊菌门、接合菌门、担子菌门和未分类;相比根表土壤对照样品,根表土壤处理样品中子囊菌门丰度下降了 13.0％,接合菌门丰度升高了 69.2％;根际土壤处理样品相比根际土壤对照样品,子囊菌门和接合菌门丰度分别升高了 5.9％和8.9％,但二者差异无统计学意义.在属水平上,根表土壤样品经菌株DS-R5处理后提高了有益菌属的丰度,同时降低了有害菌属的丰度.结论 丹参植株施入生防细菌后,改变了根际土壤和根表土壤中微生物群落结构和多样性,本研究结果可以为利用生防细菌防控丹参根腐病提供理论参考.

探究生防菌枯草芽孢杆菌Ya-1 对辣椒枯萎病的防治效果,及对辣椒受尖孢镰刀菌侵染后根际真菌群落和多样性的影响.以枯草芽孢杆菌Ya-1 为接种菌,探究了枯草芽孢杆菌Ya-1 对辣椒枯萎病的防治效果,并通过高通量测序研究了接种前,接种后 10 d,20 d时受尖孢镰刀菌侵染后辣椒根际真菌群落变化.与FOC处理(C)相比,Ya-1+FOC(D)在第 10 天和第 20 天的相对防治效果分别为77.93%和77.26%.同时接种枯草芽孢杆菌Ya-1和辣椒枯萎病菌组真菌α多样性在10 d和20 d时真菌香农指数均高于接种辣椒枯萎病菌组.在进行处理后真菌群落组成发生了显著变化,同一时间点处理组和对照组真菌群落具有显著差异,接种辣椒枯萎病菌组和同时接种辣椒枯萎病菌和枯草芽孢杆菌Ya-1 组也具有显著差异(P<0.05).各处理土壤优势真菌种群分别为子囊菌门、接合菌门、担子菌门.在 10 d和 20 d,接种病原菌(OTU_1)相对丰度在接种辣椒枯萎病原菌组和同时接种辣椒枯萎病菌组和枯草芽孢杆菌Ya-1 组间具有显著差异,相比较接种辣椒枯萎病原菌组,OTU_1 相对丰度降低,被孢霉菌(Mortierella)的相对丰度升高.相比较对照组,接种辣椒枯萎病菌处理后连接数减少,而在加入枯草芽孢杆菌Ya-1 处理后,正连接数降低.枯草芽孢杆菌Ya-1 处理对辣椒枯萎病有较好的防治效果,同时它也改变了接种病原菌辣椒根际真菌群落多样性和结构,降低了真菌群落的复杂度和根际土壤中病原菌的丰度.

目的 分析鼠伤寒沙门菌的耐药情况及分子特征,为临床治疗和感染防控提供依据.方法 对我院分离的鼠伤寒沙门菌CYEY-S001,采用VITEK2-Compact全自动微生物分析系统和K-B纸片法对药敏结果进行检测.通过全基因组测序分析其基因和分子特征,并进行质粒接合试验,研究质粒的可转移性.利用碳青霉烯酶表型试验检测其实所含的碳青霉烯酶类型,PCR确认其携带的耐药基因,质粒复制子分型确定质粒类型.结果 该鼠伤寒沙门菌CYEY-S001对除氨曲南之外的青霉素类、头孢菌素类和碳青霉烯类抗生素全部耐药,全基因组测序分析表明其为ST34型鼠伤寒沙门菌,含有blaNDM-5、aac(6)-laa、floR、cmlA1、sul3和tet(A)等多种耐药基因.携带的质粒类型为IncHI2,blaNDM-5位于该质粒上,可通过水平转移,结合子获得了与鼠伤寒沙门菌完全一致的耐药结果.3种碳青霉烯酶表型试验均正确识别出了其携带碳青霉烯酶的类型为金属β-内酰胺酶.结论 碳青霉烯耐药鼠伤寒沙门菌对感染治疗和预防控制带来了新的挑战.新发现的IncH12-blaNDM-5质粒存在向其他细菌物种横向传播的风险.

手参Gymnadenia conopsea是一种地生兰科植物,也是中国传统中药材之一.研究以ITS1为目标序列,应用Illumina MiSeq高通量测序技术对北京地区松山和百花山的手参内生真菌区系组成进行测定分析.结果表明,从手参的根中获得有效序列50 420条,209个可操作分类单元(OTUs),分属于3门9纲28目54科,包括盘菌纲Pezizomycetes(3个OTU)、伞菌纲Agaricomycetes(21个OTU)、锤舌菌纲Leotiomycetes(18个OTU)、粪壳菌纲Sordariomycetes(51个OTU)、接合菌纲Zygomycetes(18个OTU)、银耳纲Tremellomycetes(19个OTU)、散囊菌纲Eurotiomycetes(22个OTU)、酵母纲Saccharomycetes(8个OTU)、座囊菌纲Dothideomycetes(14个OTU).其中,百花山手参根中内生真菌优势类群是鸡油菌目Cantharellales (38.62％)和柔膜菌目Helotiales (24.64％)真菌;松山手参的优势内生菌类群是盘菌目Pezizales (66.19％)和鸡油菌目Cantharellales (29.75％)真菌.这些结果利于系统了解手参根部内生真菌区系组成以及优势内生真菌类群,为今后开展相关内生真菌在手参人工繁育中的应用奠定了基础.

研究氮沉降和降雨变化对土壤真菌群落结构的互作效应,对未来预测多个气候变化因子对草地生态系统的交互作用具有重要意义.以施氮和灌溉模拟氮沉降和降雨增加,采用裂区设计,应用高通量测序技术,研究8个氮添加水平(0、15、30、50、100、150、200、300 kg N hm-2 a-1)和2个水分添加水平(不灌溉、模拟夏季增雨100 mm灌溉)对土壤真菌群落结构的影响.结果表明,氮素和水分添加后,土壤真菌群落中占优势的门类分别为接合菌门Zygomycota(22.0％-48.9％)、担子菌门Basidiomycota(7.8％-18.5％)、子囊菌门Ascomycota(9.4％-20.1％)、球囊菌门Glomeromycota(0.7％-3.1％)、壶菌门Chytridiomycota(0.1％-1.3％).常规降雨条件下,随着氮添加水平升高,接合菌门相对丰度呈现出先升高后降低的趋势,N50处理最高;子囊菌门相对丰度在高氮添加时(N100-N300)呈升高趋势.而在氮素和水分同时添加条件下,随着氮添加水平升高,接合菌门相对丰度呈降低趋势,子囊菌门相对丰度变化则不明显.在相同的氮添加水平下,水分添加使接合菌门相对丰度增加,而担子菌门、子囊菌门、球囊菌门和壶菌门的相对丰度降低.在不同氮素和水分添加条件下,有5个土壤真菌门类11个真菌纲相对丰度变化显著.接合菌门的Mortierella属,担子菌门的Entolomataceae科和Geastrum属相对丰度变化极显著,可作为土壤真菌群落结构变化的指示种.PCoA分析结果也表明氮素和水分添加改变了土壤真菌群落结构.植物-土壤-微生物系统的结构方程模型结果表明,植物群落组成及植物物种丰富度的变化是土壤真菌群落结构发生变化的主要影响因素,土壤无机氮及pH的变化主要通过影响植物群落间接影响真菌群落,其对真菌群落的直接影响则较小.综上,氮素和水分添加改变了土壤真菌群落结构,且两者存在明显的互作效应,水分添加可改变氮添加对土壤真菌群落的影响.

目的 探究强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)患者肠道真菌菌群的多样性特征,分析健康人群与AS患者肠道真菌的结构差异.方法 收集17例健康人群新鲜粪便样本和24例AS患者新鲜粪便样本,分别称为HC组和AS组,提取两组粪便样本总DNA;根据真菌ITS2区设计引物进行扩增,利用Illumina HiSeq PE250平台进行ITS2高通量测序;测序结果经过Reads拼接,OTUs (operational taxonomic units)聚类,Alpha和主成分分析,物种组成统计,显著性差异分析,最终得到样本物种信息.结果 对肠道真菌菌群进行Alpha分析,各多样性指标中,shannon和observed_species指数差异有统计学意义(P＜0.05),其余指数差异均无统计学意义,故不能明确两组间多样性的差异.主成分分析提示差异显著.对肠道真菌结构进行分析,门的水平分析显示,担子菌门(Basidiomycota)在HC组和AS组中差异显著,接合菌门(Zygomycota)在两组间差异极显著;纲和属的水平分析显示,Ascomycota_unidentified纲在两组中差异显著,伞菌纲(Agaricomycetes)、Incertae_sedis_10纲、Orbiliomycetes纲差异极显著.Agaricomycetes_ unidentified_1属、Amphinema属、Geoglossales_unidentified_1属、腔块菌属(Hydnotrya)差异显著,鹅膏菌属(Amanita)和锁瑚菌属(Clavulina)差异极显著.结论 本实验证实了在AS患者中存在肠道真菌菌群失调,其特征是生物多样性和结构的改变,揭示肠道真菌也可能在AS发病中发挥作用.

研究水稻-油菜双序列复种免耕、翻耕稻田土壤真菌的多样性.采用MiSeq 高通量测序方法,对湖南安乡(AX)、农大(ND)、南县(NX)3个相同处理试验点免耕、翻耕土壤样品进行ITS 区高通量测序、多样性比较分析、物种组成分析及样品聚类分析.结果表明6个样品共得到真菌优化序列221105条,分属于1356个OTU,真菌种类覆盖7门、121科、230属;指数分析表明NT样品菌群相对丰度及群落多样性均略高于CT样品;在门水平上各试验点菌群结构相似,前三位为子囊菌门、接合菌门和担子菌门,但是同一试验点NT样品子囊菌相对丰度均低于CT样品,接合菌和担子菌相对丰度均高于CT样品.科属水平比较表明,3个试验点NT样品被孢霉科相对丰度比CT样品的大3-5倍,毛壳菌科的相对丰度小1-2倍;NT样品Carpoligna、栓菌属(Trametes)、网孢菌属 (Filobasidium)、被孢霉属(Mortierella)的序列数明显大于 CT样品,毛壳属(Chaetomium)、柄孢壳菌属(Podospora)及瓜亡革菌属(Thanatephorus)的序列数明显小于CT样品.土壤理化因子测定表明NT样品的有机质、全氮及速效钾含量均高于CT样品.本研究得出水稻-油菜双序列复种免耕、翻耕稻田土壤样品真菌物种组成丰富,不同耕作方式土壤真菌种群结构存在差异,菌群组成及丰度对土壤理化因子有一定影响.

长期连作导致哈密瓜土传真菌病害大面积发生,微生物肥料的施用可为防治土传真菌病害发挥积极作用.应用高通量测序技术深入分析微生物肥料对设施长期连作哈密瓜根际土壤真菌多样性和群落组成的影响.结果表明,在苗期、开花坐果期和成熟期,微生物肥料处理比对照操作分类单位OTU (Operational taxonomic units)分别高出24.5％、11.3％和82.1％;微生物肥料处理哈密瓜根际真菌物种数、真菌群落丰度和多样性指数,均随生育期呈先降低后增加的变化趋势,而对照处理均表现为持续降低,且在成熟期,各项指数差异显著;主坐标(Principal co-ordinatesanalysis,PCoA)分析表明微生物肥料处理与对照哈密瓜根际真菌群落结构随生育期推进,其差异愈发明显;微生物肥料处理和对照哈密瓜根际优势真菌均主要由子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Badidiomycota)组成,且以子囊菌门(Ascomycota)种类最多,施微生物肥料处理优势真菌中还存在壶菌门、接合菌门、球囊菌门和一些未明确分类的真菌;样品中丰度排名前35的属共分为A、B、C、D四大类群,A类群和B类群多为致病菌,分别在NM3和NM1含量较高,C类群和D类群多为植物益生菌,分别在M3和M1含量较高.综上所述,微生物肥料改变了哈密瓜根际优势真菌组成,与对照相比,在苗期和成熟期降低了根际病原真菌数量,且繁衍了大量有益真菌,这可能是微生物肥料发挥促生防病效应,克服或减缓哈密瓜连作障碍的最主要原因.

毛霉隶属接合菌亚门中的接合菌亚纲,毛霉病是较为少见的侵袭性真菌感染,其起病急,进展快,诊断治疗困难,病死率在40％ ～ 70％[1].美国一项跨度5年(2001-2006年)的研究显示,在接受器官移植和造血干细胞移植患者中,毛霉病年发病率分别是0.07％和0.29％[2].我国1998-2007年的研究报道侵袭性肺真菌感染依次为肺曲霉病37.9％,肺念珠菌病34.2％,肺隐球菌病15.6％,肺孢子菌病4.8％,肺毛霉病2.1％[2].毛霉感染的危险因素除了常见的免疫抑制人群外,还包括一些较为特殊的因素,如糖尿病酮症酸中毒、输血导致的铁过载和创伤等[4].