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单细胞测序数据分析瘢痕疙瘩和局限性硬皮病组织中周细胞的差异
编辑人员丨6天前
目的:探讨瘢痕疙瘩和局限性硬皮病组织中周细胞的异质性及其演化轨迹差异,为研究2种皮肤纤维化疾病的致病机制和治疗靶点提供新的线索。方法:选取GEO和GSA-Human数据库中的3例局限性硬皮病、4例瘢痕疙瘩及其对应的邻近正常皮肤样本细胞的单细胞转录组测序数据,绘制数据的表达矩阵。采用R语言的Seurat 4.3.0包进行处理后分群绘制 t-SNE可视化图谱。采用Monocle 2.24.0包对其中的周细胞进行拟时序轨迹分析。 结果:瘢痕疙瘩和局限性硬皮病皮肤组织无监督聚类为19个不同的细胞群体,其中周细胞为C7、C11群,高表达PDGFRB和RGS5基因,占总细胞数的7.53%。周细胞进一步可分为8个亚群,拟时序分析发现基因表达变化主要有细胞命运1(fate 1)和细胞命运2(fate 2)2个分支轨迹,依照时序周细胞可分为5个状态(S1~S5);其中S4占前分支的绝大部分,代表最初状态的周细胞;S5构成细胞命运1分支的大部分,代表分化较早期状态的周细胞;S1、S2、S3构成命运2分支的大部分,其中S3代表分化中期状态的周细胞,而S1、S2则代表分化晚期状态的周细胞。在正常皮肤中,各分化状态的周细胞均匀分布,而瘢痕疙瘩周细胞主要分布于前支(S4)、分支1(S5)及分支2中的前一部分(S3),分别代表初始、早期及分化中期的细胞状态,分支基因表达动态分析显示其高表达SOX4、COL4A1、COL6A3、AHR、CXCL3和IL1R1等基因;而局限性硬皮病的周细胞主要分布于分支2的中后部分(S1、S2),代表分化末期的细胞,高表达ACTA2和MYH11等基因。结论:瘢痕疙瘩和局限性硬皮病中周细胞具有异质性以及不同的演化轨迹;瘢痕疙瘩周细胞更具有干细胞样特性,通过高表达与细胞干性、上皮-间质转换、侵袭性和免疫微环境调控相关的基因,对其侵袭性和复发的病理特性发挥重要作用;而局限性硬皮病中周细胞可能主要转分化为肌成纤维细胞,导致其纤维化病理表型。
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编辑人员丨6天前
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对"PARP抑制剂不良事件概况:提交给FAERS自发报告的分析"的评论
编辑人员丨6天前
美国FDA不良事件报告系统(FAERS)收集的是医务人员、消费者和制造商的自发报告。观察到、听到或认定自己经历过药物不良反应的个体都可能会报告,因此同一事件可能会有多个来源的报告。重复报告是FAERS数据发掘的主要局限性之一,删除重复报告是数据分析(尤其是报告比数不相称分析)的先决条件。
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编辑人员丨6天前
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Humphery视野计青光眼诊治新程序24-2C与30-2的应用比较
编辑人员丨6天前
目的::比较开角型青光眼患者的24-2C与30-2程序视野检测结果,结合光学相干断层扫描(OCT)的黄斑部节细胞分析(GCA),评估并证明24-2C程序对检测青光眼中央视野损害的作用。方法::前瞻性自身对照研究。连续纳入2022年7月—2023年2月确诊为原发性开角型青光眼或正常眼压性青光眼患者50例(50眼)。所有受检眼进行24-2C和30-2程序视野检查。记录并比较受检眼视野检查的检测时间、视野参数(平均偏差、模式标准差、视野指数)、青光眼半视野检测结果以及局限性视野缺损检出率。所有受检眼进行黄斑OCT GCA检查。采用配对秩和检验、卡方检验、Spearman相关性分析、Bland-Altman一致性分析以及Kappa一致性分析等进行数据分析。结果::24-2C与30-2这2种程序的视野检测各参数(VFI视野指数、MD平均偏差、PSD模式标准偏差)的绝对数值差异均有统计学意义(均 P<0.05),但二者的以上参数存在明显相关性( r=0.92、0.86、0.93,均 P<0.001),并且一致性良好。24-2C程序视野检测有64.0%(32/50)的眼在中央10°范围内存在局限性视野缺损,明显高于30-2程序的30%(15/50) ( P<0.001)。24-2C程序检测时间明显短于30-2程序[(168±37)s vs.(255±57)s],但二者点数与检测部位均不相同,故检测时间无可比性。24-2C与30-2这2种检测程序与OCT GCA的一致性方面(视野P<5%暗点、视野P<1%暗点)比较显示,24-2C程序均好于30-2程序(P<5%暗点,24-2C、30-2程序的Kappa值分别是0.28和0.14;P<1%暗点,24-2C、30-2程序的Kappa值分别是0.13和0.09)。与2种视野检测程序相比,OCT的GCA程序在中央区域结构上发现更多异常(86%) ( P<0.001)。 结论::与30-2程序相比,24-2C程序在中央10°视野范围内检测视野缺损的能力更强、与OCT GCA的一致性更好,并且检测时间较短,在青光眼中央视野缺损检测方面,24-2C程序更优于30-2程序。
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编辑人员丨6天前
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基于下一代测序的基因融合检测技术在肿瘤伴随诊断中的研究进展
编辑人员丨6天前
基因融合是促肿瘤发展的基因组机制之一,也是影响患者预后不良的重要原因。基因融合的检测对于肿瘤生物标志物的识别、癌症亚型分类以及最终的临床用药指导至关重要,适宜的方法有助于肿瘤早期诊断及避免无效用药。传统的检测方法包括荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)、免疫组化(immunohistochemical,IHC)、逆转录PCR(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)以及下一代测序技术(next generation sequencing,NGS)。下一代测序主要有全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)、转录组测序(whole transcriptome sequencing,WTS)和目标区域测序(杂交捕获法/扩增子法)等技术。在临床伴随诊断的应用中,检测方法的选择需要综合考虑可操作性、时间和费用以及数据分析所需的专业知识水平等因素。本文综合阐述针对基因融合的不同检测方法、技术原理以及各自优点和局限性,为基因融合检测方法的选择提供参考依据。
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编辑人员丨6天前
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广州市某医科院校医学生在线学习现状调查与分析
编辑人员丨6天前
目的:探究新型冠状病毒肺炎疫情期间广州某医科院校医学生在线学习现状,为高校改善在线医学教育提供依据。方法:2020年3月27日至2020年4月10日,采用滚雪球抽样法和方便抽样法,使用自编问卷,调查广州市某医科院校医学生在线学习现状。使用SPSS 25.0进行数据分析,应用频率和百分比(%)对计数资料进行描述。结果:调查显示,63.8%的医学生日均学习时长3~6 h;在线学习平台中,中国大学MOOC使用率最高(1 230人,占比92.9%);56.0%的医学生自评线上学习效果一般;视疲劳(1 051人/79.4%)、家中缺乏学习氛围无法集中注意力(960人/72.5%)、课程开展的平台不同导致操作不便(940人/71.0%)是影响学习效果的主要因素;32.2%的医学生不喜欢全面线上教学;由于线上实验课教学的局限性,61.0%的医学生表示实验课的学习效果受到影响。结论:全面线上教学具有一定局限性,应从高校教师、教学平台、学生自身、高校管理部门4个方面采取相应措施,助力在线医学教学发展。
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编辑人员丨6天前
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人工神经网络在脊柱外科中的应用进展
编辑人员丨2024/5/11
目前在脊柱外科领域,人工神经网络凭借着对医学图像分析和患者数据分析的出色表现被众多研究者重视,其在预测患者并发症风险、诊断患者脊柱相关疾病、开发小鼠病理模型等临床和科研方面的准确性及实用性越来越高,重要性日益显著.但是,人工神经网络尚未被大多数脊柱外科医师充分认知.该文就人工神经网络在脊柱外科的图像分析、临床诊断及治疗等方面的研究进行综述,阐述人工神经网络在脊柱外科中的应用,并探讨其应用的局限性和未来发展方向.
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编辑人员丨2024/5/11
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基于多模态影像的机器学习与深度学习在帕金森病诊治中的应用进展
编辑人员丨2024/2/3
帕金森病是一种常见的神经系统退行性疾病,在出现临床症状时已经不可逆,所以早期诊断显得尤为重要.随着人工智能技术的发展,机器学习与深度学习已广泛用于医学数据分析和神经影像自动化诊断研究.本文将综述基于多模态影像的机器学习与深度学习在帕金森病早期诊断、分类研究以及功能预测中的应用情况,并对其局限性作出阐述,以及对未来的发展趋势进行展望.
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编辑人员丨2024/2/3
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针灸相关疗法治疗慢性前列腺炎有效性的网状Meta分析
编辑人员丨2023/9/16
目的 采用贝叶斯网状Meta分析的方法系统评价和比较不同针灸相关疗法治疗慢性前列腺炎的效果.方法 系统检索PubMed、Cochane Library、中国知网(CNKI)、万方数据库(Wanfang)、维普数据库(VIP)及中国生物医学文献数据库(CBM)中关于针灸相关疗法治疗慢性前列腺炎的随机对照试验(RCT),检索时限为2000年1月1日至2022年1月19日.先由2名研究者独立筛选文献、提取数据及应用Cochrane系统评价手册评估文献质量,然后使用R4.2.0软件进行数据分析.结果 最终纳入38篇RCT研究,总样本量3313例,共涉及26种干预措施;网状Meta分析结果显示,在降低慢性前列腺炎症状指数(NIH-CPSI)评分方面,效果最优的前3位干预措施依次为:针刺+西药+中药灌肠、针刺+温热灸、针刺+电针+中成药.在提高临床疗效总有效率方面,效果最优的前3位干预措施依次为:针刺+西药+中药灌肠、针刺+中药+中药灌肠、针刺+中成药.结论 与常规西药治疗方案比较,针灸相关疗法在改善慢性前列腺炎相关症状,以及提高临床疗效方面具有良好的效果;联合疗法治疗效果优于单一疗法.由于纳入文献的研究设计及样本量等存在局限性,本研究的结论还需大量的多中心、大样本RCT研究进一步验证.
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编辑人员丨2023/9/16
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加强信息系统建设保障空气污染对人群健康影响监测安全有效运行
编辑人员丨2023/8/6
多年来我国在空气污染健康影响方面已开展了大量的流行病学、毒理学等相关科学研究,尤其是流行病学研究,确定了特定时点或时期与特定范围内个体或人群中空气污染与疾病或健康状况的关联[1-2];但研究结果无论是覆盖范围还是研究周期都存在一定的局限性,最重要的是不能及时反映采取空气污染控制措施后健康效应的变化,限制了科研成果是对管理和政策制定的支撑作用.为此, 2013年国家卫生与计划生育委员会疾病预防与控制局启动了空气污染对人群健康影响监测项目,在统一的监测方案下,进行连续系统的监测工作.空气污染人群健康影响监测信息系统实现了对数据的采集、存储和管理,通过数据分析,了解空气污染健康影响及变化趋势,评估空气污染的健康风险,为科学制定污染控制措施和干预效果评价提供依据.
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编辑人员丨2023/8/6
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经阴道三维彩超在宫腔粘连筛查及治疗中的临床价值研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨三维彩超应用于薄型子宫内膜患者宫腔粘连(IUA)筛查的优势.方法 回顾性分析我院生殖门诊收治的、平素监测卵泡过程中提示子宫内膜薄的120例患者的临床资料,患者均进一步行经阴道三维彩超、宫腔镜检查,对检查结果进行数据分析,比较3种方法用于IUA筛查的准确性.结果 120例子宫内膜薄的患者应用宫腔镜检查确诊IUA患者83例,二维彩超提示IUA的患者仅5例,三维彩超提示IUA的患者78例.三维彩超的确诊率为宫腔镜确诊率的93.98%.二维彩超对IUA的检出率(4.17%)显著低于三维彩超和宫腔镜检查(分别为65.oo%和69.17%)(P<0.05).且三维彩超对轻度IUA的检出率(85.19%)及中重度IUA的检出率(98.21%)均显著高于二维彩超(P<0.01),但其局限性在于不能明确分度.结论 经阴道三维彩超成像能初步显示IUA的部位,可做为薄型子宫内膜患者IUA的初步筛查及术后评估手段.
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编辑人员丨2023/8/6
