目的:通过生物信息学方法,揭示肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的异质性,探讨铁死亡相关基因与HCC肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)的关系,并构建基于铁死亡相关基因的预后模型,为预防HCC患者复发提供新的思路.方法:基于TCGA数据库和NODE数据库,利用非负矩阵分解聚类分析鉴定分子亚型,通过ESTIMATE算法和CIBERSORT算法用于构建免疫评分,利用Cox回归进行拟合风险评估模型并计算风险得分,并基于风险得分及临床信息构建列线图,利用体外实验验证mRNA的表达水平.结果:HCC的异质性体现为两种不同铁死亡相关的免疫分子亚型,其免疫评分差异显著(P＜0.001).筛选出G6PD、KIF20A、RRM2和TXN四个最佳候选铁死亡相关基因,并进行拟合构建风险评估模型,列线图对HCC患者的复发具有良好的预测能力.体外实验提示四个最佳候选基因均在人肝癌细胞表达水平增高(P＜0.05).结论:HCC可分为两种分子亚型,分子亚型与HCC的复发有关,铁死亡在TME中可能起着关键作用.四个铁死亡相关基因可能是预防HCC复发的潜在因素,预后模型对HCC复发有一定的预测价值.

目的 通过基于基因表达综合(GEO)数据集的生物信息学方法筛选和分析甲型H1N1流感病毒性肺炎的潜在生物标志物.方法 从GEO数据库获取甲型H1N1流感病毒性肺炎的数据集,并筛选差异表达基因,使用STRING 12.0数据库和Cytoscape 3.9.1软件对这些差异表达基因进行分析并筛选出Hub基因,使用DAVID数据库对这些差异表达基因进行功能富集分析.结果 筛选出1 019个差异表达基因,其中上调基因522个,下调基因497个.富集结果显示,这些差异表达基因的功能主要富集于细胞质、蛋白质磷酸化、免疫应答、补体成分、激酶活性、T细胞受体信号通路及FoxO信号通路等.最终确定了 CDK1、CCNA2、CCNB2、CDC20、TOP2A、KIF20A、DLGAP5、BUB1、KIF11和TPX2为Hub基因.结论 本研究阐明了 10个Hub基因(CDK1、CCNA2、CCNB2、CDC20、TOP2A、KIF20A、DLGAP5、BUB1、KIF11 和 TPX2)有可能作为甲型H1N1流感病毒性肺炎诊断和治疗的潜在生物标志物,但仍需更多的实验来进一步探索这些Hub基因在甲型H1N1流感病毒性肺炎中的具体机制.

Background::Gastric cancer (GC) is one of the most globally prevalent cancers in the world. The pathogenesis of GC has not been fully elucidated, and there still lacks effective targeted therapeutics. The influence of altered kinesin superfamily protein 22 (KIF22) expression in GC progression is still unclearly. The aim of this study was to investigate the KIF22 effects on GC and related mechanisms.Methods::Gastric carcinoma tissues and matching non-cancerous tissues were collected from patients with GC who have accepted a radical gastrectomy in Lanzhou University Second Hospital from May 2013 to December 2014. The expression of KIF22 was examined in GC of 67 patients and 20 para-carcinoma tissues by immunochemical staining. The relationship between the expression of KIF22 and clinicopathologic characteristics was next investigated in the remaining 52 patients except for 15 patients who did not complete follow-up for 5 years. Cell viability was performed via 3-(4,5-dimethyl-2-thiazolyl)-2,5-diphenyl-2-H-tetrazolium bromide (MTT) test and colony formation assay in the MGC-803 and BGC-823 GC cells. Cell scratch and trans-well invasion assay was performed to assess migration ability in the MGC-803 and BGC-823 GC cells. Gene set enrichment analysis (GSEA) pathway enrichment analysis was performed to explore the potential functions. Cell cycle was detected by flow cytometry. In addition, the two GC cell lines were used to elucidate the underlying mechanism of KIF22 in GC in vitro via assessing the effects on mitogenactivated protein kinase and extracellular regulated protein kinases (MAPK/ERK) signal transduction pathway-related expressions by Western blotting assays. The differences were compared by t tests, one-way analysis of variance, and Chi-squared tests. Results::The study showed that KIF22 was up-regulated in GC, and KIF22 high expression was significantly related to differentiation degree ( χ2 = 12.842, P = 0.002) and poorly overall survivals. GSEA pathway enrichment analysis showed that KIF22 was correlated with the cell cycle. Silence of KIF22 decreased the ability of the proliferation and migration in gastric cells, induced G1/S phase cell cycle arrest via regulating the MAPK-ERK pathways. Conclusions::KIF22 protein level was negatively correlated with prognosis. KIF22 knockdown might inhibit proliferation and metastasis of GC cells via the MAPK-ERK signaling pathway.

嗜铬细胞瘤/副神经节瘤(pheochromocytomes and paragangliomas，PCC/PGL)是分别产生于肾上腺髓质的嗜铬细胞和自主性副神经节的、少见的神经内分泌腺肿瘤，部分PCC/PGL由基因的突变引起。PCC/PGL具有广泛的遗传异质性，有20多个易感基因的突变可引起PCC/PGL。易感基因可分为两类，第一类基因，如 SDHx(succinate dehydrogenase，SDH)、 VHL、 PHD2、 FH、 IDH、 HIF2A和 MDH2通过"伪缺氧"信号转导通路使嗜铬细胞发生转化，第二类基因，如 RET、 NF1、 KIF1Bβ、 MAX和 TMEM127等，则通过激酶信号转导通路使嗜铬细胞发生转化。本文综述了 SDHx(包括 SDHD、 SDHC、 SDHB、 SDHA、 SDHAF1和 SDHAF2基因)引起的PCC/PGL的基因型与临床表现型的关系、遗传异质性以及其在临床应用方面的研究进展，并对目前尚未完全揭晓的PCC/PGL发病的分子机制进行了简单的介绍，以期对研究PCC/PGL的发病机制、传递规律及其诊断、病情恶化风险评估和发现潜在的治疗手段有所启示，也可以为临床遗传咨询的改进提供理论参考。

目的:探讨驱动蛋白20A（KIF20A）和程序性细胞死亡因子4（PDCD4）与食管癌临床病理特征的关系。方法:收集2021年5月至2023年11月于广东医科大学附属医院诊治的81例食管癌患者的癌组织和癌旁组织标本，通过免疫组织化学法检测KIF20A和PDCD4在食管癌组织和癌旁组织中表达，应用 χ2检验评价其表达与食管癌临床病理特征的关系。 结果:KIF20A在食管癌组织中表达率76.54%（62/81），明显高于癌旁组织中表达率23.46%（19/81），差异有统计学意义（ χ2＝45.654， P<0.01）。PDCD4在食管癌组织中表达率43.21%（35/81），明显低于癌旁组织中表达率86.42%（70/81），差异有统计学意义（ χ2＝33.158， P<0.01）。KIF20A表达水平与食管癌患者性别、年龄无明显相关（ χ2＝0.002、0.055， P>0.05），KIF20A表达水平与食管癌患者组织学分化程度、TNM分期、淋巴结转移明显相关（ χ2＝7.481、6.067、5.284， P<0.05）。PDCD4表达水平与食管癌患者性别、组织学分化程度、年龄无明显相关（ χ2＝0.036、0.040、0.210， P>0.05），PDCD4表达水平与食管癌患者TNM分期、淋巴结转移明显相关（ χ2＝5.044、5.620， P<0.05）。 结论:食管癌组织中KIF20A呈高表达、PDCD呈低表达，KIF20A和PDCD4在食管癌发生、发展过程中起重要作用。

目的:观察分析父母均存在家族性渗出性玻璃体视网膜病变（FEVR）相关基因变异的34个家系的临床和遗传学特点。方法:队列研究。2010年1月至2018年12月在上海交通大学附属新华医院眼科及天津医科大学眼科医院眼科就诊并行基因检测的722例FEVR患者中父母均存在FEVR相关基因变异的34个FEVR家系（先证者34例67只眼，其父母68例136只眼）纳入研究。先证者及其父母均行适合各自年龄的全面眼科检查，包括BCVA、眼压、眼轴、裂隙灯显微镜、间接检眼镜、FFA或眼底彩色照相、广域眼底照相检查。根据疾病严重程度将临床表现分为严重表型和轻微表型。纳入34例40岁以上正常健康者作为对照组。采集家系成员及对照组受检者外周血样，对已知参与FEVR的基因FZD4、LRP5、NDP、TSPAN12、ZNF408和KIF11进行高通量测序分子遗传学分析。采用Kruskal-Wallis检验分析基因变异类型与临床表型之间的关系。采用 χ2检验比较FEVR患者群和正常人群FEVR基因变异的差异。 结果:34例先证者67只眼中，严重表型48只眼（71.64% ），轻微表型19只眼（28.36% ）。先证者患者父母68例136只眼中，正常表型76只眼（55.88% ），轻微表型60只眼（44.12% ），未见严重表型。在34例先证者中共检测到FEVR相关基因65种变异，以LRP5突变最为常见（64.61% ），其次是FZD4 （12.31% ）、NDP （10.77% ）、TSPAN12 （6.15% ）、ZNF408(4.62%）和KIF11 （1.54%）基因突变。FEVR相关基因变异以错义突变最常见；但相关性分析结果显示，变异类型与临床表型的严重性无显著相关性（ H=1.775， P=0.620）。65种变异中，21种为已报道突变，44种为本研究新发现的变异。携带单个致病基因多个突变位点20例39只眼，携带2个致病基因突变13例26只眼，携带3个致病基因突变1例2只眼。先证者在LRP5、NDP、ZNF408、FZD4、TSPAN12、KIF11基因上的突变率明显高于对照组，差异有统计学意义（ χ2=64.702， P<0.001 ）。 结论:父母均存在FEVR相关基因突变的家系，其突变基因主要以LRP5最为多见，其次分别为FZD4、NDP、TSPAN12、ZNF408、KIF11。FEVR相关基因突变类型以错义突变最为常见，但临床表型与基因变异类型无明显相关。大多先证者临床表型严重，而携带FEVR致病基因变异的父母大多表现为正常或轻微表型。

目的:通过生物信息学寻找经肝动脉化疗栓塞(TACE)治疗肝细胞癌患者疗效的差异基因(DEGs)并深入分析其功能。方法:从基因表达数据库(GEO)中下载微阵列数据集GSE104580；利用在线工具GEO2R筛选DEGs；运用R语言"ClusterProfiler"数据包对筛选得到的TACE疗效的DEGs进行GO功能和KEGG通路富集分析；使用STRING数据库构建关键差异基因的蛋白质互作网络，应用Cytoscape软件筛选出TACE疗效差异的关键DEGs。利用UALCAN和GEPIA数据库分别对TACE疗效差异关键DEGs的表达和生存进行分析，使用Log-rank检验方法。结果:439个基因在TACE治疗肝细胞癌中表达有明显差异，其中上调基因228个，下调基因217个；差异基因的富集及其通路主要包括白细胞介素17 (IL-17)信号通路、肿瘤转录失调和视黄醇代谢等生物过程；Cytoscape共筛选出10个TACE疗效差异的关键DEGs。最后通过多数据库综合分析发现，筛选出的10个TACE疗效差异的关键DEGs均与肝细胞癌患者预后密切相关。高表达组CDK1、TOP2A、CDC20、BUB1、KIF2C、DLGAP5、CENPF、TPX2、BIRC5和TTK肝癌患者总体生存率均显著低于低表达组患者，其结果具有统计学意义( P<0.05)。 结论:筛选出的10个基因对TACE治疗肝细胞癌患者的耐药分子机制以及进行个体化精准治疗提供依据。

1例因自幼双眼上睑抬起困难伴眼球运动受限患者就诊。检查发现双眼上睑下垂，眼球向各个方向转动受限。诊断为双眼先天性眼外肌纤维化。基因检测出1个致病基因突变位点KIF21A-ex20 c.2821C>T（p.Arg941Trp），为杂合错义突变。

目的:探讨驱动蛋白家族20A(KIF20A)和星形细胞上调基因-1(AEG-1)与原发性肝癌(PLC)临床病理特征关系。方法:采用免疫组织化学法检测2011年2月～2019年8月广东医科大学附属医院收治69例PLC、33例肝硬化和17例正常肝组织中KIF20A和AEG-1表达，各组间比较采用 χ2检验。 结果:KIF20A在正常肝组织、肝硬化组织与PLC组织中的阳性表达率分别为5.88%(1/17)、33.33%(11/33)、73.91%(51/69)，两两之间比较差异有统计学意义( t＝ 4.635、26.407、15.422， P<0.05)，KIF20A表达水平与PLC血管浸润和TNM分期明显相关( t＝6.067、7.753， P<0.05)；AEG-1在正常肝组织、肝硬化组织与PLC组织中的阳性表达率分别为11.76%(2/17)、42.42%(14/33)、72.46%(50/69)，两两之间比较差异有统计学意义( t＝ 4.847、21.022、8.618， P<0.05)，AEG-1表达水平与PLC血管浸润、肿瘤大小、TNM分期明显相关( t＝ 4.804、6.355、6.355， P<0.05)。 结论:检测KIF20A和AEG-1有助于评估PLC患者病情。

目的:探讨驱动蛋白家族成员20A（KIF20A）在人表皮生长因子受体2（HER2）过表达型乳腺癌中的表达和临床意义。方法:回顾性分析82例HER2过表达型乳腺癌病例的临床病理特征资料。用免疫组织化学的方法检测组织中KIF20A的表达，分析HER2过表达型乳腺癌中KIF20A的表达及与临床病理特征的关系。通过生物信息学的方法分析KIF20A在HER2过表达型乳腺癌组织及癌旁正常组织中的mRNA水平，并分析其表达与患者的生存率间的关系。结果:KIF20A的阳性表达在胞核，成棕黄色颗粒。在HER2过表达型乳腺癌组织中，KIF20A阳性高表达率为57.3%，而在癌旁组织中主要是低表达或无表达。KIF20A高表达与肿瘤大小和pTNM分期显著相关，而与年龄和肿瘤分级的相关性无统计学意义。生物信息学分析结果提示侵袭性乳腺癌中KIF20A高表达与不良的无疾病生存期显著相关。结论:KIF20A在HER2过表达型乳腺癌中存在异常表达，与HER2过表达型乳腺癌肿瘤分级和pTNM分期相关，并且KIF20A高表达提示预后不良。