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A族链球菌毒力基因调控因子的研究进展
编辑人员丨5天前
A族链球菌(group A streptococcus,GAS)是链球菌中致病性最强的细菌,可引起呼吸道、皮肤软组织感染以及严重的侵袭性感染。GAS产生多种毒力因子,这些毒力因子的表达由多种毒力基因调控因子,如双组份调控系统、单独转录调控因子以及非编码小RNA等共同调控。因此,了解毒力基因调控因子的特性对于GAS致病性的研究具有重要意义,现就部分重要毒力基因调控因子的研究进展做一综述。
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编辑人员丨5天前
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巨噬细胞迁移抑制因子调节登革病毒2型感染诱导人脐静脉内皮细胞自噬的研究
编辑人员丨5天前
目的:研究原代人脐静脉内皮细胞(primary human umbilical vein endothelial cells, HUVEC)被登革病毒2型(dengue virus type 2, DENV2)感染后,巨噬细胞迁移抑制因子(macrophage migration inhibitory factor, MIF)对腺苷酸激活蛋白激酶(adenosine 5′-monophosphate-activated protein kinase,AMPK)/细胞外调节蛋白激酶(extracellular regulated protein kinases,ERK)/雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)自噬信号途径的影响。方法:TCID 50检测DENV2对C6/36细胞的毒力,RT-PCR检测DENV2感染后HUVEC内病毒NS1基因部分片段;透射电子显微镜观察自噬体结构,Western blot检测不同剂量病毒感染HUVEC后对微管关联蛋白Ⅱ(microtubule-associated proteins Ⅱ,LC3-Ⅱ)表达的影响和不同时间MIF的蛋白质水平变化,分析MIF与自噬相关蛋白LC3-Ⅱ的相关性;MIF抑制剂和通路抑制剂分别预处理DENV2感染的HUVEC,Western blot检测MIF、AMPK、ERK、mTOR和LC3-Ⅱ蛋白变化,分析MIF与AMPK自噬通路的关联。 结果:实验用毒株对C6/36细胞的TCID 50为10 -9.09/ml,被感染的HUVEC内可检测病毒NS1基因部分片段序列。不同剂量病毒感染后,在HUVEC内可形成自噬小体或自噬溶酶体,自噬水平有差异。DENV2感染HUVEC引起MIF和LC3-Ⅱ mRNA水平的变化呈正相关,MIF抑制剂的处理影响通路蛋白AMPK、ERK和LC3-Ⅱ的表达,但几乎不影响MIF的蛋白质水平。 结论:DENV2感染HUVEC引起的MIF变化可影响自噬水平,MIF通过调控AMPK/ERK/mTOR途径影响自噬。
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编辑人员丨5天前
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小檗碱对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌全基因组转录水平的影响研究
编辑人员丨5天前
目的:通过转录组测序(RNA-seq)分析小檗碱对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌USA300基因组表达谱的影响,研究小檗碱对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的抑菌机制。方法:基础研究。本研究使用标准菌株USA300,该菌株为中科院上海药物所蓝乐夫课题组2019年所赠送。用1/2最低抑菌浓度(MIC)(64 mg/L)和1/8MIC(16 mg/L)浓度的小檗碱处理和无小檗碱处理耐甲氧西林金黄色葡萄球菌USA300,分析USA300差异基因表达情况。将差异基因筛选条件设为: P值<0.05,且差异倍数>2。采用SPSS 20.0进行统计分析。 结果:通过测序结果发现,高浓度组与正常对照组相比,共有754个差异基因表达,其中上调基因主要为lukD、lukE、ssaA等,下调基因主要为lukF-PV、lukS-PV、clfA、splB~splF、sspA等;低浓度组与正常对照组相比,仅有19个差异基因表达,其中上调基因为speG、scpB、rpsQ等,下调基因为betA、bccT等。结论:本研究USA300转录组基因表达情况,了解经小檗碱作用后差异基因表达情况,推测小檗碱主要通过调控细菌细胞壁水解功能、白细胞毒素及其他毒力因子的表达发挥对MRSA的抑菌作用。
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编辑人员丨5天前
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Tn-seq法筛选高毒力肺炎克雷伯菌新毒力基因
编辑人员丨5天前
目的:建立转座子突变文库,筛选高毒力肺炎克雷伯菌(hypervirulent Klebsiella pneumoniae, hvKp)的新毒力基因。 方法:构建转座子突变文库,血清处理,通过转座子测序(transposon sequencing, Tn-seq)比较分析血清处理前后各基因突变株在文库中丰度变化,并对筛选出的基因进行KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)注释和富集分析。结果:以处理后丰度低于初始丰度20%为界,共筛选出405个基因,其中351个基因在HS11286、NJST258_1、NTUH-K2044和RJF293等4株参考菌株中保守存在,占86.7%,10个基因为NTUH-K2044和RJF293两株高毒力株共有而低毒力株HS11286和NJST258_1缺失;荚膜多糖基因簇中基因如糖基转移酶基因 wzy、聚集蛋白基因 wzi、荚膜转运蛋白基因 wza等突变株在血清处理后不能检出,气杆菌素、沙门氏菌素等铁载体基因簇在各文库中的丰度变化不超过1倍;KEGG注释结果显示,注释最多的基因为参与氨基酸代谢、辅助因子和维生素代谢、碳水化合物代谢等。 结论:Tn-seq是功能基因筛选的可靠方法,本研究成功筛选出405个hvKp的候选新毒力基因,为后续深入研究hvKp的新毒力基因功能和调控机制提供实验依据。
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编辑人员丨5天前
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微生物群体感应系统在皮肤炎症发展中的作用机制
编辑人员丨5天前
群体感应系统是一种依赖于群体密度变化的细胞间通信方式,与皮肤菌群的变化及致病性密切相关。金黄色葡萄球菌致病毒力因子的合成受辅助基因调节(Agr)群体感应系统调控。各类皮肤共生菌如凝固酶阴性葡萄球菌、棒状杆菌属可通过抑制金黄色葡萄球菌的Agr群体感应系统,抑制毒力因子合成,减轻皮肤炎症。本文综述微生物群体感应系统在皮肤炎症中的作用机制及各类群体感应抑制剂。
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编辑人员丨5天前
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不同状态下SAP2和STP1在白念珠菌伊曲康唑耐药中的作用
编辑人员丨1个月前
目的:探讨游离状态和生物膜状态下,毒力因子SAP2、转录因子STP1在临床分离白念珠菌伊曲康唑(ITR)耐药中的作用及其相互关系。方法:实验菌株为临床分离伊曲康唑耐药白念珠菌菌株和敏感菌株各10株。首先,采用PCR方法对游离状态下临床分离白念珠菌伊曲康唑耐药和敏感菌株的SAP2、STP1进行测序,分析基因突变与耐药的关系;之后,利用96孔板构建白念珠菌生物膜;采用RT-PCR方法检测游离状态和生物膜状态下白念珠菌SAP2、STP1、STP1Δ/Δ的mRNA表达水平,比较分析不同状态下SAP2、STP1、STP1Δ/Δ的表达是否具有差异和相关性;进一步通过结晶紫染色法和激光共聚焦显微镜观察白念珠菌生物膜在各时间点的生长形态以及SAP2、STP1、STP1Δ/Δ对其形成能力的影响。结果:SAP2测序显示无错义突变,存在3个同义突变(T276A、G543A和A675C);STP1基因测序发现两个错义突变N394S和D71I,以及2个同义突变C453T、A799G,其中N394S在全部耐药和敏感菌株中都存在,而D71I仅存在于两株敏感菌株中。与敏感菌株相比,白念珠菌耐药菌株和STP1基因缺陷菌株(STP1Δ/Δ)的生物膜形成能力更强;耐药菌株在游离状态和生物膜状态下SAP2和STP1的表达均上调(P<0.05),并且与游离状态相比,耐药菌株和敏感菌株在生物膜状态下二者的表达量均显著升高(P<0.05)。而无论在何种状态下,SAP2和STP1的mRNA表达水平均呈显著正相关。此外,与标准菌株ATCC11006相比,STP1基因缺陷菌株(STP1Δ/Δ)中的SAP2表达在两种状态下也显著上调,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论:生物膜的形成可以使白念珠菌伊曲康唑耐药性增加,但SAP2、STP1基因突变可能与其耐药性无关;游离状态下,SAP2的高表达与白念珠菌ITR的耐药性有关,而无论在游离状态还是生物膜状态下,白念珠菌对ITR的耐药性增加均与STP1有关。此外,STP1对SAP2是具有调控作用的,其机制亟待研究。
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编辑人员丨1个月前
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光滑念珠菌毒力因子Epa黏附素的研究进展
编辑人员丨1个月前
光滑念珠菌为一种常见的念珠菌病病原体,其感染率呈现不断上升的趋势.相较于其他非白念珠菌,光滑念珠菌凭借其较强的适应性黏附能力和生物膜生成能力,其引发的感染往往呈现出更高的致病性.其中,位于菌株细胞壁表面的上皮黏附素(epithelial adhesin,Epa)家族发挥了关键作用,其能够介导菌株与宿主细胞及非生物表面的黏附和生物膜的形成,从而影响菌株的毒力表现.该文从光滑念珠菌毒力因子Epa黏附素的结构、其在菌株致病中的作用以及EPA基因相关分子调控机制等方面,对光滑念珠菌Epa黏附素的相关研究进行综述.
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编辑人员丨1个月前
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绵羊肺炎支原体GH3-3株全基因组测序及生物信息学分析
编辑人员丨1个月前
[目的]全面了解绵羊肺炎支原体GH3-3 株的基因序列,研究其潜在的致病机制及其复制、转录、翻译过程的调控机制.[方法]采用体外培养,利用细菌基因组DNA提取试剂盒提取绵羊肺炎支原体GH3-3 株基因组DNA,进行全基因组测序.[结果]绵羊肺炎支原体GH3-3 株基因组大小为 1 060 772 bp,GC含量为 29.66%,基因组组分分析后发现,GH3-3 株的基因组含有 730 个编码基因,总长度为 914 379 bp,平均长度为 1 252.57 bp,占基因组全长的 86.2%.串联重复序列共 149 个,总长为20 926 bp,占基因组全长的 1.97%.微卫星DNA序列 102 个,tRNA 30 个,rRNA 3 个.在NR、SwissProt、GOG、KEGG、GO、CARD、CAZy、PHI、TCDB、RMS数据库中,分别有 719、459、473、394、449、33、5、180、113、59 个基因被注释;在VFDB数据库中,共注释到了 76 个毒力因子相关的基因.将基因组序列提交至NCBI网站,获得登录号为:PRJNA1051969.[结论]获得了绵羊肺炎支原体GH3-3 株完整的基因组信息,预测和注释了其基因的功能,明确了GH3-3 株以及与国内外其他绵羊肺炎支原体菌株之间的遗传进化关系.
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编辑人员丨1个月前
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粪肠球菌牙本质黏附及其影响因素的研究进展
编辑人员丨2024/7/6
粪肠球菌是难治性根尖周炎(refractory apical periodontitis,RAP)的主要致病菌,该细菌可耐受严苛环境,引发根尖周免疫炎症反应,造成根管内外持续性感染.粪肠球菌黏附于根管牙本质壁形成生物膜,其耐药和抗冲刷能力显著增强,是介导其致病的关键因素.粪肠球菌与牙本质的黏附包括非特异性和特异性黏附,后者由黏附相关毒力因子介导,主要包括肠球菌胶原结合蛋白(adhesin of collagen from enterococci,Ace)、表面蛋白(extracellular surface protein,Esp)、明胶酶(gelatinase,GelE)和丝氨酸蛋白酶(serine prtease,SprE)、菌毛以及聚集物质,且受到多个双组份系统调控.Fsr双组份系统在群体密度增加时可以促进gelE及sprE的表达,GelE进一步减少表面肠球菌胶原结合蛋白Ace,而GrvRS双组份系统则在响应血清环境时直接下调ace的表达.CroRS双组份系统及WalRK双组份系统也可能分别促进和抑制包括ace及gelE在内的多种毒力因子的表达,进而影响粪肠球菌的黏附性.此外,根管机械/化学预备、根管内环境因素等均可对粪肠球菌牙本质黏附产生影响.根管治疗中避免粪肠球菌的引入和使用干扰黏附的药物可以有效预防粪肠球菌的黏附,而多种活化荡洗方法也可以有效增加根管内粪肠球菌的清除率.针对粪肠球菌牙本质黏附关键因子与调控因素为靶点设计合理药物,有望为根管感染控制提供新的思路与手段.本文就粪肠球菌与牙本质的黏附性及其影响因素进行综述.
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编辑人员丨2024/7/6
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幽门螺杆菌毒力因子CagA的基因表达调控机制研究进展
编辑人员丨2024/4/27
全球约有一半人口感染了幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori),特别是发展中国家的感染率极高.目前,幽门螺杆菌感染已被列为胃癌发生的高危因素.幽门螺杆菌感染的致病机制被认为与环境因素、宿主易感性和细菌毒力等因素之间复杂的相互作用有关.文章主要对幽门螺杆菌毒力因子细胞毒素相关基因(cytotoxin-associated gene A,cagA)表达调控的分子机制进行综述,以便更好地理解cagA的致病性,为今后预防和治疗由幽门螺杆菌所引起的疾病提供理论参考.
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编辑人员丨2024/4/27
