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基于MaxEnt和ArcGIS的山西省蒙古黄芪适宜性区划研究
编辑人员丨1周前
目的 掌握影响蒙古黄芪生长的主要环境因子,对蒙古黄芪在山西省适宜区分布进行预测,为山西省蒙古黄芪资源的合理布局提供参考.方法 采用山西省"第四次中药资源普查"数据库收录的蒙古黄芪样点经纬度信息,查询中国数字植物标本馆及检索文献记录补充,将筛选后的347个蒙古黄芪样点分布数据和环境因子添加到最大熵(MaxEnt)模型中运行,筛选出影响蒙古黄芪地理分布的主要环境因子及贡献率.应用地理信息系统软件ArcGIS对山西省蒙古黄芪生态适宜区进行划分.结果 建立的MaxEnt模型受试者工作特征曲线下面积为0.909,表明模型预测结果准确.共筛选出19个环境因子,其中气候因子是影响蒙古黄芪分布最重要的环境因子,其次是生物因子与地形因子,土壤因子的影响最小.山西省蒙古黄芪潜在适宜区主要分布在省内北部山区,呈现从北到南适宜等级逐渐降低的趋势,在当前气候条件下山西省蒙古黄芪最适宜区面积为15 424 km2,适宜区面积为19 856 km2,次适宜区面积为59 436 km2,不适宜区面积为61 894 km2.结论 基于MaxEnt模型和ArcGIS软件预测山西省蒙古黄芪适宜区分布状况,对山西省蒙古黄芪资源的保护与合理布局具有一定参考价值.
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编辑人员丨1周前
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磁共振T2*mapping序列联合纹理特征参数对绝经后骨质疏松症的诊断价值
编辑人员丨1周前
目的:探讨磁共振T2*mapping序列联合纹理特征参数在诊断女性绝经后骨质疏松症(postmenopausal osteoporosis,PMOP)中的应用价值.方法:回顾性分析2019年3月至2021年4月某院收治的50例PMOP患者(作为骨质疏松组)的临床资料,另选择50例绝经后骨量正常(骨密度>120 mg/cm3)的体检者为骨量正常组和50例绝经后骨量减少(80 mg/cm3<骨密度<120 mg/cm3)者为骨量减少组.3组均行磁共振腰椎常规序列及T2*mapping扫描,提取图像纹理特征.对比3组腰椎T2*值及纹理特征参数(能量、对比、相关、逆差距及熵),采用Spearman相关性分析腰椎T2*(值、纹理特征参数与女性发生POMP的相关性,通过多因素Logistics回归分析确定女性发生PMOP的独立预测因子,采用ROC曲线分析T2*mapping序列联合纹理特征参数对PMOP的诊断效能,构建发生POMP的列线图预测模型并对模型进行验证.结果:3组腰椎T2*值、能量、对比、相关、逆差距及熵比较,差异有统计学意义(P<0.05).Spearman相关分析结果显示,腰椎T2*值、对比及熵与发生POMP呈显著正相关关系,能量、相关及逆差距与发生POMP呈显著负相关关系(P<0.05).T2*值、能量、对比、相关、逆差距及熵均为POMP发生的独立预测因子(P<0.05).T2*mapping序列联合纹理特征参数诊断的AUC、敏感度及特异度均优于单项参数诊断.列线图预测模型预测女性发生POMP的概率为75.00%,经验证模型具有较高的区分度、校准能力和净获益率.结论:磁共振T2*mapping序列联合纹理特征参数对女性发生POMP的诊断效能良好,T2*值、能量、对比、相关、逆差距及熵可作为临床筛选POMP高危人群的敏感指标.
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编辑人员丨1周前
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增强CT灰度共生矩阵预测cN0期甲状腺乳头状癌中央区淋巴结转移
编辑人员丨1周前
目的 探讨增强CT灰度共生矩阵预测cN0期甲状腺乳头状癌中央区淋巴结转移的价值.资料与方法 回顾性分析2020年1月—2021年12月徐州市中心医院经临床、手术病理确诊的cN0期甲状腺乳头状癌患者55例,根据术后病理结果分为中央区淋巴结转移阳性组34例、阴性组21例,患者术前均行颈部CT双期增强检查.采用Image J软件分别提取动、静脉期肿瘤最大层面灰度共生矩阵参数(能量、对比、相关、逆差矩、熵)并比较两组各参数的差异,使用受试者工作特征曲线评估参数的预测效能.结果 两组间动脉期能量、熵及静脉期熵差异有统计学意义(t/Z=-2.140、2.753、2.736,P<0.05),其他参数差异均无统计学意义(P>0.05).动脉期能量、动脉期熵、静脉期熵、动脉期能量动脉期熵联合预测中央区淋巴结转移的曲线下面积分别为 0.672、0.706、0.686、0.734,动脉期能量动脉期熵联合预测效能最佳,敏感度和特异度分别为 76.47%、66.67%.结论 增强CT灰度共生矩阵有助于术前预测cN0期甲状腺乳头状癌患者中央区淋巴结转移,动脉期参数能量联合熵的预测效能最佳.
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编辑人员丨1周前
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鱼腥草挥发性成分"印迹模板"特征研究
编辑人员丨1周前
目的 通过对 144批不同产地、不同采收时间鱼腥草根部挥发性成分"印迹模板"的定量分析,阐明其特征,为中药印迹质量评价提供理论参考和实验依据.方法 采集全国不同产地不同采收期的鱼腥草,用水蒸气蒸馏法获取根部挥发油,通过GC-MS法获得指纹图谱并建立相应的成分数据库.对各批鱼腥草挥发性成分"印迹模板"进行定量表征,获得其分子连接性指数(molecu-lar connectivity index,MCI)、物芯指数(core index,CI)、总量统计矩参数、信息熵、信息量等参数.结果 各批样品化学成分种类、数目、含量有较大差异,各批样品间峰面积、信息量变化很大(RSD值分别为 68.67%、79.72%),峰数变化较大(RSD值为 22.03%);而信息熵、总量统计一阶矩、物芯指数(Xvp零阶、Xvp一阶、Xvp二阶)的变化不大(RSD值分别为 16.17%、13.32%、5.46%、6.38%、6.03%).结论 鱼腥草生长过程中以"印迹模板"为中心修饰而成的具体成分及含量是随时随域变化,整体表现为"变"与"不变"规律,其印迹性质量评价可为中药更全面准确的质量控制提供新方法.
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编辑人员丨1周前
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全体积CT纹理分析预测ESWL治疗输尿管结石疗效的临床应用价值
编辑人员丨1周前
目的:探讨全体积CT纹理分析(CTTA)预测体外冲击波碎石术(ESWL)治疗输尿管结石疗效的临床应用价值。方法:回顾性分析2018年6月至2022年6月在无锡市人民医院门诊行ESWL治疗的86例输尿管结石患者的临床资料,ESWL术后2周复查,未见结石残留或者残留结石长径<3 mm者纳入成功组(53例),否则纳入失败组(33例)。提取整个结石全体积的每一个像素CT值,计算出全体积CT纹理参数。分析全体积CT纹理参数和ESWL疗效的相关性。结果:ESWL的治疗成功率为61.63%。结石HU值、结石体积与ESWL的疗效显著相关(均 P<0.05)。成功组的全体积CT纹理参数中75百分位数和熵、均值、中值、全距、极大值、和、25百分位数、75百分位数均低于失败组(均 P<0.05)。 结论:全体积CT纹理参数中,熵、均值、中值、全距、极大值、和、25百分位数、75百分位数有望被用来预测ESWL的疗效。
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编辑人员丨1周前
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CT纹理分析参数对桥本氏甲状腺炎伴发甲状腺结节良恶性的鉴别诊断价值
编辑人员丨1周前
目的:研究CT纹理分析(computed tomography texture analysis,CTTA)参数对桥本氏甲状腺炎(Hashimoto’s thyroiditis,HT)伴发甲状腺结节良恶性的鉴别诊断价值。方法:选取2020年5月至2021年10月南京市中西医结合医院放射科HT伴发甲状腺结节患者110例均行CTTA,统计CTTA参数(熵值、峰态及偏度),以病理诊断结果为"金标准"。统计病理检查结果,比较良恶性甲状腺结节的一般临床特征及CTTA参数,采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)分析CTTA参数对甲状腺结节的诊断价值。结果:经临床病理检查,110例HT背景下甲状腺结节患者中恶性43(39.09%)例,其中乳头状癌22例、滤泡癌13例、髓样癌6例、恶性淋巴瘤2例;良性67(60.91%)例,其中结节性甲状腺肿32例、HT结节20例、甲状腺腺瘤8例、局灶性炎症7例。恶性甲状腺结节患者促甲状腺激素水平、形态不规则、边界模糊、钙化占比均高于良性患者( t/ χ2=13.167、18.364、20.180、17.621, P均<0.001);HT背景下良恶性甲状腺结节患者CTTA参数峰态、偏度比较,差异无统计学意义( t=1.633、1.382, P=0.105、0.170);恶性甲状腺结节患者熵值高于良性,差异有统计学意义( t=9.862, P<0.001)。经ROC分析显示,熵值诊断甲状腺结节良恶性的Cut-off值为6.28,AUC值分别为0.909,95% CI为0.839~0.955,灵敏度为86.05%(37/43),特异度为88.06%(69/67)。 结论:HT伴发良恶性甲状腺结节患者CTTA参数具有一定差异,且CTTA参数对甲状腺结节良恶性具有一定诊断价值。
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编辑人员丨1周前
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基于临床和增强CT影像组学的列线图术前预测EB病毒相关性胃癌的价值
编辑人员丨1周前
目的:探讨基于临床和增强CT影像组学的列线图术前预测EB病毒(EBV)相关性胃癌的价值。方法:回顾性分析经手术病理证实的136例胃癌患者资料,男100例、女36例,年龄[ M( Q1, Q3)]65(53,71)岁。根据EBV编码的小RNA原位杂交技术测定的结果分为EBV阳性组( n=32)和EBV阴性组( n=104)。所有患者术前均行多期CT增强扫描。按7∶3比例将患者分为训练组( n=95)和验证组( n=41)。利用MaZda软件提取增强CT图像的影像组学特征。采用组内相关系数(ICC)、方差分析和最小绝对收缩与选择算法(LASSO)回归进行影像组学特征降维,计算影像组学评分(Radscore)。联合临床资料、形态学特征及影像组学评分建立列线图模型。根据受试者工作特征曲线下面积(AUC)评价列线图的预测效能,决策曲线评价列线图的临床净获益,根据训练组和验证组的数据绘制校准曲线对列线图进行验证。 结果:经筛选后,最终得到6个最优的影像组学特征,包括灰度均值、偏度、S(1,0)熵和、S(1,1)对比度、99%灰度百分位、S(2,2)角二阶矩。在训练组和验证组中,EBV阳性组的Radscore高于EBV阴性组(训练组:3.78±0.83 比 2.80±0.98;验证组:3.81±0.47 比 2.94±0.95)(均 P<0.05)。影像组学模型在训练组和验证组的AUC分别为0.773(95% CI:0.612~0.962)、0.792(95% CI:0.597~0.927),灵敏度和特异度分别为63.6%和93.1%、70.0%和87.1%;临床和影像组学的列线图模型在训练组和验证组的AUC分别为0.883(95% CI:0.644~0.984)、0.851(95% CI:0.715~0.996),列线图模型的预测效能更佳(均 P<0.05)。 结论:基于临床和影像组学的列线图模型对EB病毒相关性胃癌具有较好的预测效能。
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编辑人员丨1周前
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动态增强磁共振成像纹理分析对乳腺癌新辅助化疗效果的预测与评估
编辑人员丨1周前
目的:探讨基于动态增强磁共振成像(DCE-MRI)的纹理分析对乳腺癌新辅助化疗疗效的预测与评估价值。方法:回顾性分析山西省肿瘤医院2014年9月至2018年10月在新辅助化疗前后均行DCE-MRI且经病理确诊的63例乳腺癌患者的临床资料,根据病理检查结果,将患者分为治疗有效组(40例)和治疗无效组(23例),使用Omni-Kinetics软件测量新辅助化疗前及新辅助化疗4~8个周期后DCE-MRI容量转移常数(Ktrans)图的纹理参数,参数采用( ± s)或中位数( P25, P75)表示,采用独立样本 t检验或Mann-Whitney U检验对两组纹理参数进行统计分析,并绘制受试者工作特征曲线,根据曲线下面积(AUC)评估DCE-MRI Ktrans图的纹理参数对乳腺癌新辅助化疗疗效的预测效能。 结果:拟采用33个纹理参数,最终保留了29个。63例患者新辅助化疗前后有22个纹理参数差异均有统计学意义(均 P<0.05);新辅助化疗前治疗有效组与治疗无效组间有9个纹理参数差异均有统计学意义(均 P<0.05),包括均匀性[0.17(-0.06,0.34),0.39(0.22,0.48), Z=-2.955, P<0.01]、直方图能量[169.88(129.36,288.77),116.22(93.77,151.95), Z=3.241, P<0.01]及直方图熵[6.33(5.71,6.69),6.68(6.52,6.97), Z=-2.991, P<0.01]等;新辅助化疗后治疗有效组与治疗无效组间有8个纹理参数差异均有统计学意义(均 P<0.05),包括直方图熵(6.00±0.71,6.46±0.49, t=-2.720, P<0.01)、熵(6.81±1.40,8.02±1.48, t=-3.238, P<0.01)、Haralick熵[0.49±0.10,0.55±0.10, Z=-2.613, P<0.01]、灰度不均匀性(GLN)[1.68(1.42,3.37),4.92(3.58,8.50), Z=-3.897, P<0.01]及游程长度不均匀性(RLN)[100.38(65.31,305.75),359.75(176.75,655.00), Z=-4.033, P<0.01]等;治疗有效组与治疗无效组新辅助化疗前后有8个参数变化率的差异均有统计学意义(均 P<0.05),主要包括ΔGLN[-0.72(-0.78,-0.60),-0.23(-0.55,0.36), Z=-4.554, P<0.01]、ΔRLN[-0.71(-0.85,-0.52),-0.33(-0.48,-0.10), Z=-4.454, P<0.01]及Δ高灰度游程强度(HGLRE)[1.28(0.39,3.46),0.11(-0.24,0.86), Z=3.184, P<0.01]等。新辅助化疗后GLN、RLN、ΔGLN及ΔRLN的AUC分别为0.80、0.81、0.85及0.84。 结论:基于DCE-MRI Ktrans图的部分纹理参数对乳腺癌新辅助化疗的疗效有预测及评估作用。
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编辑人员丨1周前
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安徽省2020年柯萨奇病毒A组4型分离株全基因组序列分析
编辑人员丨1周前
目的:了解安徽省柯萨奇病毒A组4型(coxsackievirus A4,CV-A4)毒株全基因组序列变异及分子进化情况,为今后手足口病的病原学监测和科学防治提供理论依据。方法:采用一代测序法对2020年5株CV-A4分离株进行全基因组测序。运用MEGA11.0对5株CV-A4分离株,32株CV-A4代表株和肠道病毒A71型(Enterovirus A71,EV-A71)原型株BrCr基于VP1区构建系统进化树,对分离株以及肠道病毒A组(enterovirus A,EV-A)原型代表株基于P1、P2、P3区分别构建系统进化树;选用DNAStar进行毒株VP1区氨基酸序列比对,使用BioEdit7.2进行氨基酸置换熵分析并作氨基酸位点熵值图,使用SimPlot3.5和RDP4对CV-A4分离株和EV-A原型代表株进行重组分析,使用DnaSP6软件进行分离株和参考代表株的选择压力分析。结果:系统进化树显示:分离株属于C2亚型,与中国大陆地区流行的CV-A4毒株属于同一分支,C2亚型分支的毒株氨基酸序列同源性为97.30%~100%,分离株同原型相比,均有6个氨基酸变异位点。选择压力分析表明C2亚型的CV-A4毒株受负选择压力的影响,置换熵分析编码区氨基酸序列有25个易突变位点,占比1.14%,毒株进化主要依赖重组。重组分析表明分离株在P2、P3区域与多种EV-A原型株发生不同区段的重组,与CV-A5原型株重组区段较长,尤其在3A-3C区段,P1是相对保守的区段。结论:安徽省CV-A4在P2、P3区与其他EV-A原型株发生频繁重组事件,应对安徽省CV-A4的分子进化研究继续保持密切关注。
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编辑人员丨1周前
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不同焦虑水平舰艇士兵的知觉警觉和脑电α波的变化分析
编辑人员丨1周前
目的:分析不同焦虑水平舰艇兵知觉警觉和脑电α波,为焦虑情绪早期心理干预方法研究探索理论依据。方法:采用问卷法用症状自评量表(symptom checklist 90, SCL-90)进行评定,将焦虑因子分>2.5分的舰艇兵纳入初选对象,通过交谈法与观察法进一步用汉密尔顿焦虑量表(Hamilton anxiety scale, HAMA)测评,HAMA得分超过14分,焦虑症状持续表现2~3个月者,在排除躯体疾病,确定处于焦虑状态的舰艇兵42人设为研究组;HAMA得分小于14分,无知觉歪曲、紧张、恐惧害怕症状,确定焦虑状态的舰艇兵30人设为对照组。对2组人员进行脑电α波、脑缺氧状态、脑疲劳等脑功能分析,并对全部结果进行比较。结果:SCL-90躯体化和精神病性因子分研究组明显高于对照组,差异有统计学意义(均 P<0.05);总分、强迫症状、人际关系敏感、抑郁、焦虑、敌对、恐惧、偏执及饮食睡眠因子评分差异无统计学意义(均 P>0.05),精神焦虑、躯体焦虑差异有统计学意义(均 P<0.05)。2组脑电α波各频平均值比较,α波11、12 Hz高频率差异有统计学意义(均 P<0.05),8、9、10 Hz波段均率差异无统计学意义(均 P>0.05)。α波背景主频、缺氧状态差异有统计学意义(均 P<0.05),主次频差值、熵值、总谱系、疲劳状态差异无统计学意义(均 P>0.05)。 结论:不同焦虑水平舰艇兵焦虑知觉警觉敏感性不同,焦虑知觉警觉敏感性增高时本体感觉更明显,脑电α波高频率是α波背景主频。
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编辑人员丨1周前
