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帕博利珠单抗治疗晚期非小细胞肺癌反应降低与抗生素预处理的关系
编辑人员丨2天前
目的:分析抗生素(antibiotic, ATB)预处理与晚期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)患者帕博利珠单抗治疗反应及预后的关系。方法:选择2019年1月至2023年1月我院收治的接受帕博利珠单抗治疗92例晚期NSCLC患者,收集临床数据资料,根据治疗开始前30 d内是否接受ATB预处理,将接受ATB预处理17例为观察组,未接受75例为对照组。记录客观缓解率(objective response rate, ORR)、疾病控制率(disease control rate, DCR)、疾病进展、无进展生存期(progression-free survival, PFS)、总生存期(overall survival, OS)。结果:对照组ORR 27例(36.00%)高于观察组2例(11.76%)(P>0.05);对照组DCR 65例(84.00%)高于观察组8例(47.06%)(P<0.05);对照组疾病进展26例(34.67%)低于观察组11例(64.71%)(P<0.05);对照组预后不佳7例(9.33%)低于观察组11例(64.71%)(P<0.05)。经单因素分析,只有肿瘤最大直径≥2.40 cm(OR=1.012,95%CI:1.004~1.951,P=0.043)、ALB≥40.90 g/L(OR=0.406,95%CI:0.172~0.955,P=0.039)和ATB(+)(OR=2.614,95%CI:1.288~5.306,P=0.008)是影响疾病进展的临床因素。多因素COX回归分析发现ATB预处理是病情进展及预后不佳相关的危险因素。Kaplan-Meier绘图分析ATB预处理与晚期NSCLC患者PFS的关系,观察组中位PFS 1.77(0.33~14.00)个月、中位OS 7.17(1.90~14.00)个月短于对照组5.43(0.70~14.03)个月,5.43(2.10~14.47)个月(P<0.05)。结论:帕博利珠单抗治疗晚期NSCLC,治疗前30 d内ATB预处理与治疗后的反应降低具有意义。
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编辑人员丨2天前
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DNMT3B与乳腺癌预后的关系及其生物学机制
编辑人员丨2天前
目的:分析DNA甲基转移酶3B(DNMT3B)在乳腺癌中的表达及其对预后的影响,探究其在乳腺癌发生发展中及潜在靶点作用。方法:通过R语言程序分析TCGA乳腺癌数据库,使用UALCAN、Starbase database、cBioPortal、GeneMANIA、STRING等在线数据库分析DNMT3B在乳腺癌中的表达、诊断和预后价值、肿瘤免疫微环境、GO功能、KEGG信号通路和蛋白相互作用。采用qRT‐PCR检测DNMT3B在常见乳腺癌细胞系和正常乳腺上皮细胞间的表达差异。结果:在线数据库分析及验证实验提示DNMT3B在乳腺癌中高表达,且其高表达不利于乳腺癌患者的生存,提示DNMT3B可能具有诊断价值。通过GO功能、KEGG信号通路和蛋白相互作用以及肿瘤免疫微环境分析,提示DNMT3B参与乳腺癌发生发展的多种机制,可能成为新的治疗靶点。结论:DNMT3B能促进乳腺癌的发生并影响疾病的进展,可能是乳腺癌潜在的肿瘤标志物及治疗靶点。
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编辑人员丨2天前
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超声引导下周围神经阻滞对髋膝关节置换术后恢复的影响
编辑人员丨2天前
目的:探究超声引导下周围神经阻滞(PNB)对择期全髋、膝关节置换术患者术后恢复的影响。方法:数据来源于福建省立医院2012年1月至2021年12月期间首次接受择期全髋或全膝关节置换术的患者,排除非首次进行THA或TKA患者及术后失访或拒绝随访的患者。根据患者是否接受超声引导下PNB,将患者分为PNB组和非PNB组。通过倾向性评分匹配(PSM)使潜在的混杂因素均衡,并使用Kaplan-Meier生存曲线分析PSM后两组术后90 d和1年的全因死亡率,使用卡方检验分析PSM后两组术后并发症的差异。此外,建立 logistic回归模型,评估周围神经阻滞与术后并发症的关系。结果:本研究共纳入1 328例全髋、膝关节置换术患者,其中197例患者接受了超声引导下PNB。通过1∶1 PSM后,成功完成197例配对。与非PNB组的患者相比,接受PNB的患者术后90 d内的全因死亡率显著降低(0% vs 2.5%,χ2=5.046,P=0.025)。此外,PNB组与肺部并发症[优势比(OR)=0.430,95%置信区间(95%CI)(0.216,0.857),P=0.033]以及下肢深静脉血栓形成[OR=0.103,95%CI(0.011,0.954),P=0.042]的风险降低有关。结论:超声引导下周围神经阻滞可显著降低全髋、膝关节置换术患者术后肺部并发症和下肢深静脉血栓形成的风险,同时与较低的90 d全因死亡率相关。
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编辑人员丨2天前
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原发性胶质母细胞瘤瘤内细菌特征基因及其功能研究
编辑人员丨2天前
目的 分析原发性胶质母细胞瘤(GBM)患者肿瘤组织中细菌相关特征基因,并研究肿瘤内细菌相关特征基因在GBM中的功能及作用机制.方法 采用基于癌症基因组图谱(TCGA)数据分析得到的原发性GBM瘤内细菌相关特征基因的公开数据,共152例.根据GBM患者总生存时间的中位数,将其分为低生存组(78例)和高生存组(74例).使用秩和检验评估组间α多样性的差异;采用非度量多维尺度(NMDS)分析和主坐标分析(PCoA)评估组间β多样性的差异;采用线性判别分析(LDA)比较两组GBM样本中丰富度存在显著差异的细菌种类.分别根据各差异细菌相关特征基因的相对丰富度将152例患者分为高丰富度组和低丰富度组,采用Kaplan-Meier法分析高丰富度组与低丰富度组患者生存率的差异.对与良好预后相关的高丰富度细菌相关特征基因GBM样本中显著上调的基因进行基因本体论(GO)生物过程功能注释和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过TCGA转录组测序数据集分析肿瘤免疫微环境景观,应用曼特尔检验分析免疫细胞浸润含量与预后相关细菌特征基因的相关性.所有数据分析均采用R软件,以P<0.05为差异有统计学意义.结果 152例GBM组织中共鉴定出252种细菌相关特征基因,其中234种特征基因在低生存组与高生存组均存在,8种仅存在于低生存组,10种仅存在于高生存组.NMDS和PCoA结果显示,两组的β多样性的差异有统计学意义(P<0.05).LDA显示,高生存组与低生存组的肿瘤组织中细菌相关特征基因的丰富度存在差异(P<0.05),其中脆弱拟杆菌相关特征基因在高生存组的丰富度较高(P<0.05),并与患者的总生存期呈正相关(x2=4.13,P<0.05).功能富集分析显示,肿瘤内脆弱拟杆菌相关特征基因丰富度较高的患者肿瘤组织中高表达与免疫途径相关的基因(P<0.05).曼特尔检验分析结果显示,原发性GBM肿瘤组织中脆弱拟杆菌相关特征基因的丰富度与M1巨噬细胞浸润呈正相关(P<0.05).结论 脆弱拟杆菌相关特征基因在高生存原发性GBM患者肿瘤组织中的丰富度较高,并影响肿瘤的免疫微环境.
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编辑人员丨2天前
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SOX新辅助化疗后腹腔镜胃癌D2根治术与常规根治术治疗进展期胃癌的近期随访比较
编辑人员丨2天前
目的:探讨替吉奥联合奥沙利铂(SOX)新辅助化疗后腹腔镜胃癌D2根治术与常规开腹根治术治疗进展期胃癌患者近期随访结果的差异。方法:回顾性分析2020年1月至2022年9月SOX新辅助化疗后接受手术的91例患者临床资料,46例采用腹腔镜胃癌D2根治术(腔镜组),45例采用开腹根治术(开腹组)。应用SPSS 27.0软件分析数据,围手术期指标、免疫功能等计量资料以()描述,采用独立样本t检验;术后并发症等计数资料使用χ2检验;采用Kaplan-Meier曲线分析患者的生存情况。P<0.05为差异有统计学意义。结果:腔镜组患者胃肠功能恢复时间、住院时间均短于开腹组,术中出血量少于开腹组,手术时间长于开腹组(P<0.05);两组患者淋巴结清扫数目比较,差异无统计学意义(P>0.05);腔镜组患者术后1d、3dCD4+、CD4+/CD8+水平均高于开腹组,CD8+低于开腹组(P<0.05);术后1d、3d腔镜组患者白细胞介素6(IL-6)、降钙素原、C反应蛋白(CRP)水平均低于开腹组(P<0.05);两组患者生存期比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:SOX新辅助化疗后腹腔镜胃癌D2根治术可获得与开腹根治术相当的近期疗效,但腹腔镜胃癌D2根治术具有术中出血量少,住院时间、胃肠功能恢复时间短,术后并发症少,应激反应更轻等优点。
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编辑人员丨2天前
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组织蛋白酶L基因表达与头颈部鳞状细胞癌预后及免疫浸润的关系
编辑人员丨2天前
目的 分析组织蛋白酶L(CTSL)基因表达与头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)预后及免疫浸润的关系.方法 基于癌症和肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达综合数据库(GEO)中的GSE41613、GSE65858、GSE27020 和GSE30784 数据集,分析CTSL基因在HNSCC组织和正常组织中的表达差异.根据最佳截断值将HNSCC患者分为CTSL基因高表达和低表达组.采用单因素和多因素Cox回归分析,确定CTSL基因表达对HNSCC的预后预测价值.利用免疫亚型、ESTIMATE法、CIBERSORT法和基因集变异分析(GSVA)法分析CTSL基因高表达和低表达组HNSCC的免疫浸润差异.利用TCGA数据库和GSE65858 数据集分析不同人乳头状瘤病毒(HPV)感染状态下CTSL基因对HNSCC预后和免疫浸润的影响.利用TCGA数据库进行泛癌分析.结果 在TCGA数据库和GSE30784数据集中,CTSL基因在HNSCC组织中的相对表达量分别为 6.90±1.07 和 9.54±0.87,均高于正常组织(分别为 5.46±1.20 和 7.96±0.59,均 P<0.05).在 TCGA 数据库和GSE65858 数据集中,CTSL基因在HPV阴性HNSCC组织中的相对表达量分别为7.16±0.94 和 8.66±0.54,均明显高于HPV阳性HNSCC组织(分别为 6.10±1.18 和8.41±0.51,均P<0.05).在TCGA数据库和GSE41613、GSE65858、GSE27020 数据集中,单因素Cox回归分析显示,与CTSL基因低表达组比较,CTSL基因高表达组的 HR值分别为 1.64(95%CI:1.24~2.17,TCGA 数据库总生存时间)、1.62(95%CI:1.15~2.28,TCGA数据库无进展生存时间)、2.42(95%CI:1.31~4.46,GSE41613数据集总生存时间)、2.22(95%CI:1.29~3.81,GSE65858数据集总生存时间)和 2.66(95%CI:1.53~4.63,GSE27020 数据集无病生存时间);多因素Cox回归分析显示,与CTSL基因低表达组比较,CTSL基因高表达组的HR值分别为1.55(95%CI:1.17~2.06,TCGA数据库总生存时间)、1.56(95%CI:1.09~2.21,TCGA数据库无进展生存时间)、2.06(95%CI:1.10~3.88,GSE41613 数据集总生存时间)、2.33(95%CI:1.35~4.02,GSE65858 数据集总生存时间)和 2.64(95%CI:1.48~4.72,GSE27020 数据集无病生存时间).CTSL 基因高表达与HNSCC的不良预后有关(均P<0.05).单因素和多因素荟萃分析显示,CTSL基因高表达组的HR值分别为 1.93(95%CI:1.56~2.39)和 1.84(95%CI:1.48~2.29).在TCGA数据库中,免疫浸润分析结果显示,CTSL基因高表达组HNSCC的免疫浸润水平较高,具有更有利的免疫激活表型.在GSE65858 数据集中,不同CTSL基因和HPV感染状态与HNSCC的预后和免疫浸润相关,与HPV阴性且CTSL高表达组比较,HPV阳性且CTSL低表达组患者的预后相对较好(χ2=15.39,P=0.002).在TCGA数据库中,CTSL基因的表达与多形性胶质细胞瘤、肾透明细胞癌、低级别脑胶质瘤、肝细胞癌、肺腺癌、肺鳞癌和葡萄膜黑色素瘤的总生存时间有关(均P<0.05);与多形性胶质细胞瘤、肾透明细胞癌、低级别脑胶质瘤、肺腺癌、肺鳞癌和前列腺癌的无进展生存时间有关,CTSL基因表达越高,患者预后越差(均P<0.05).结论 CTSL基因的表达水平与HNSCC患者的预后和免疫浸润密切相关,并且与不同HPV感染状态具有相互作用.
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编辑人员丨2天前
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基于直肠高分辨MRI的直肠侧系膜分析及其临床价值的研究
编辑人员丨2天前
目的:回顾性分析直肠癌患者行根治术前的直肠高分辨磁共振检查资料,观察患者直肠侧系膜结构并结合临床资料分析其对患者预后的影响。方法:对2017年1月至2018年12月期间在海军军医大学第一附属医院行直肠癌根治术患者的数据进行回顾性分析。收集术前行直肠高分辨磁共振成像(MRI)的患者的影像学资料,根据MRI图像观察直肠系膜筋膜(MRF)双侧的直肠侧系膜结构及直肠中动脉(MRA)并测量相关参数,包含直肠侧系膜中断宽度、直肠中动脉类型和直肠中动脉最大管径,结合临床资料与患者无病生存(DFS)资料进行Cox回归分析,构建患者术前预测模型及绘制Nomogram图和(ROC)曲线。结果:最终258例患者纳入本研究。术前直肠高分辨MRI中所有患者双侧均观察到MRF的中断及MRA走行。MRA可分为4种类型:前外侧型、外侧型、后外侧型、细小分支型。根据术后有无局部复发及远处转移将患者分为复发转移组和未复发转移组。多因素Cox回归分析结果发现右侧直肠中动脉最大管径(HR:3.042,95%CI:1.928~4.798,P<0.001)、mrT分期(HR:3.618,95%CI:1.223~10.705,P=0.021)和右侧侧系膜宽度(HR:1.001,95%CI:1.000~1.001,P=0.012)为患者术后复发转移的预测因素。Nomogram预测模型C-index指数为0.733(95%CI:0.686~0.781)。1、3及5年DFS的AUC分别为0.784、0.808以及0.888。结论:直肠高分辨MRI可观察到直肠侧系膜和直肠中动脉固有存在,右侧侧系膜中断宽度和右侧直肠中动脉最大管径是患者术后复发转移的危险因素。术中更好地处理直肠侧系膜,可能会为患者带来更好的预后,未来仍需要进一步研究。
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编辑人员丨2天前
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EPHA5突变预测肺腺癌免疫检查点抑制剂治疗预后的临床意义
编辑人员丨2天前
目的:分析Eph受体A(Eph receptor A, EPHA)5突变预测肺腺癌(lung adenocarcinoma, LUAD)免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors, ICI)治疗预后的临床意义。方法:通过生物信息学分析癌症药物敏感性基因组学(genomics of drug sensitivity in cancer, GDSC)-LUAD数据集、癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)-LUAD数据集中可能与LUAD患者ICI应答相关的突变基因。选择2020年1月至2021年1月我院接受帕博利珠单抗治疗的96例LUAD患者,收集患者的石蜡包埋组织肿瘤标本和匹配的血液样本,采用二代基因测序。根据检测结果分为EPHA5-WT亚组66例和EPHA5-MT亚组30例。记录患者的客观缓解率(objective response rate, ORR)、疾病控制率(disease control rate, DCR)及无进展生存期(progression-free survival, PFS)。结果:生物信息学分析显示,EPHA5-MT的LUAD患者可从ICI治疗中获益。临床队列分析结果显示,EPHA5-MT亚组LUAD的肿瘤突变负荷值27.34(19.98,53.24)mut/Mb高于EPHA5-WT亚组13.70(10.77,17.75)mut/Mb(P<0.001)。EPHA5-WT亚组ORR 22.73%低于EPHA5-MT亚组33.33%(P>0.05),EPHA5-MT亚组的DCR 86.67%高于EPHA5-WT亚组62.12%(P<0.05)。EPHA5-WT亚组疾病进展36例(54.55%),其中死亡11例。高于EPHA5-MT亚组8例(26.67%),其中死亡4例。单因素及多因素COX回归分析显示,EPHA5-WT相较于EPHA5-MT是LUAD患者ICI治疗后发生疾病进展的危险因素。绘制Kaplan-Meier生存曲线显示,EPHA5-MT组LUAD患者PFS 14.53[5.71~26.23]个月长于EPHA5-WT组7.89(0.59~30.67)个月(P<0.005)。结论:EPHA5-MT是影响LUAD ICI治疗预后的生物标志物。
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编辑人员丨2天前
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超声引导下染色剂标记切缘的梭柱型和圆柱型保乳区段切除术的效果研究
编辑人员丨2天前
目的:研究基于超声引导下染色剂标记切缘的梭柱型或圆柱型保乳区段切除术在早期乳腺癌患者中的应用效果。方法:回顾性分析2019年9月至2020年9月收治的80例早期乳腺癌患者,采用病例配对法分为梭柱型组和圆柱型组,每组患者各40例。梭柱型组患者接受超声引导下染色剂标记切缘的梭柱型保乳区段切除术,圆柱型组患者接受超声引导下染色剂标记切缘的圆柱型保乳区段切除术。采用SPSS 24.0软件处理数据,围手术期指标、疼痛评分和美观效果等计量资料用()表示,采用独立样本t检验;切缘评价和并发症等计数资料用[例(%)]表示,行χ2检验;采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,采用Log-Rank χ2检验。以P<0.05为差异有统计学意义。结果:两组患者染色面积、手术时间、住院时间、切缘情况、乳房顺应性差值、围手术期并发症总发生率比较,差异均无统计学意义(P>0.05);圆柱型组患者乳房凹陷程度和瘢痕评分低于梭柱型组,对称性高于梭柱型组(P<0.05);圆柱型组患者术后即刻疼痛评分低于梭柱型组,术中出血量少于梭柱型组(P<0.05);圆柱型组患者远期并发症总发生率低于梭柱型组(P<0.05);圆柱型组患者无病生存率显著低于梭柱型组(Log-Rank χ2=4.682, P=0.034)。结论:超声引导下染色剂标记切缘后行圆柱型保乳区段切除术治疗早期乳腺癌,对患者机体的损伤小,术后远期并发症发生率低,乳房美观度高,安全有效。
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编辑人员丨2天前
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单细胞和bulk RNA测序的综合分析预测肺鳞状细胞癌治疗反应和预后
编辑人员丨2天前
目的:通过整合单细胞RNA测序(sing-cell RNA sequencing, scRNA-seq)和癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据,探索肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma, LUSC)中差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)和预后相关基因,并构建基于这些基因的预后模型。为了更好地了解LUSC中的免疫微环境(tumor microenvironment, TME),进一步分析了免疫细胞的浸润特征,揭示其与LUSC患者预后的潜在关联。方法:从基因表达综合数据库GEO(GSE118245)中获取LUSC单细胞RNA测序数据,并通过质量控制和数据标准化,鉴定出不同的细胞群体。使用Seurat软件包进行主成分分析(principal component analysis, PCA)和统一流形近似投影(uniform manifold approximation and projection, UMAP)进行降维聚类。基于TCGA数据库中的LUSC患者样本,使用TCGAbiolinks包获取批量RNA测序数据,并对肿瘤样本和正常样本之间的DEGs进行筛选,采用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis, WGCNA)构建基因共表达网络。使用Cox回归和最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator, LASSO)回归构建基于DEGs的预后模型,Kaplan-Meier生存曲线评估患者总生存期(overall survival, OS)。使用CIBERSORT算法评估不同风险组中的免疫细胞浸润比例,比较22种免疫细胞在高风险和低风险组中的差异。结果:从LUSC单细胞数据中质控得到出5 360个细胞,注释为13个不同的细胞群,并通过SingleR注释为8种细胞类型。与对照组相比,LUSC组中的中性粒细胞、CD4+ T细胞和骨骼肌细胞比例显著上升。差异表达基因分析共筛选出3 396个DEGs,其中1 851个基因上调,1 545个基因下调。GO和KEGG富集分析表明,DEGs主要参与细胞周期、感染和补体级联反应等重要生物过程。在TCGA-LUSC数据中,使用WGCNA识别出与LUSC发展显著相关的蓝色模块,在此基础上筛选出61个交集基因进行进一步分析。单因素Cox回归和LASSO回归分析共识别出4个独立的预后相关基因(ITIH3、MME、PLAAT1和ATP13A5),构建了风险评分模型。Kaplan-Meier生存曲线显示高风险组患者的总生存期显著低于低风险组。免疫浸润分析结果表明,高风险组患者肿瘤中的CD8+ T细胞、活化的记忆CD4+ T细胞和滤泡辅助性T细胞比例显著高于低风险组,进一步支持了免疫微环境对LUSC进展的关键作用。结论:通过整合单细胞和TCGA数据,成功鉴定了LUSC中的关键差异表达基因,构建了有效的预后模型。模型在多个验证队列中表现出预后预测,揭示的免疫细胞浸润特征为LUSC的免疫微环境提供了新的见解。免疫细胞在LUSC的发生和进展中发挥重要作用。
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编辑人员丨2天前
