目的:筛选肾透明细胞癌甲基化驱动基因，并基于肾透明细胞癌甲基化驱动基因构建预后分子标签，探索其在肾透明细胞中的预后作用。方法:下载TCGA数据库中肾透明细胞癌基因的表达数据、DNA甲基化数据及临床信息资料。使用R语言MethylMix包综合分析患者的基因表达数据和DNA甲基化数据，筛选甲基化驱动基因，然后随机抽取70%肾透明细胞癌患者的转录组数据，应用LASSO-Cox回归分析构建预后分子标签，取其余30%的数据验证构建分子标签。结果:根据肾透明细胞癌表达谱数据和甲基化数据，筛选得到188种肾透明细胞癌甲基化驱动基因(Cor<－0.3，均 P<0.05)，其中104种低甲基化驱动基因，84种高甲基化驱动基因；基于ccRCC转录组数据和生存数据，发现188种甲基化驱动基因中有91种与ccRCC预后相关的基因(均 P<0.05)。联合临床预后数据采用LASSO-Cox回归分析从中筛选出8种与肾透明细胞癌预后相关甲基化驱动基因EPB41L4B、GOLGA6L2、HHLA2、HOXA2、LINC00944、SPINT2、ZNF382、ZNF888，并联合8种甲基化驱动基因构建预后分子标签：分子标签得分＝0.130004056×EXPEPB41L4B＋0.110026099×EXPGOLGA6L2-0.116610796×EXPHHLA2＋0.438033838×EXPHOXA2＋0.180898961×EXPLINC00944-0.168803405×EXPSPINT2-0.326061874×EXPZNF3821-0.152001589×EXPZNF888。生存曲线分析结果显示，构建的分子标签值在训练组、测试组、全部数据组与ccRCC患者的生存期均显著相关(均 P<0.05)，分子标签值越高患者预后越差。 结论:通过对TCGA数据库的挖掘，筛选得到188种肾透明细胞癌甲基化驱动基因，从中筛选出由8种基因联合组成的预后分子标签与肾透细胞癌患者的预后有显著性关联，为肾透细胞癌精准治疗提供了新的预后模型。

目的:探索膀胱平滑肌细胞在外力牵拉作用下功能改变过程中关键基因和通路的作用。方法:运用生物信息学的方法，包括不同表达分析(DEA)、基因本体(GO)/京都基因与基因组百科全书(KEGG)、激酶和转录因子富集分析、基因富集分析(GSEA)、蛋白互作网络(PPI)等，对编号为GSE1595的基因芯片进行分析筛选出相应的关键基因，随后通过构建小鼠膀胱出口梗阻(BOO)及膀胱出口梗阻解除模型和膀胱平滑肌细胞牵拉实验，通过抽签法将小鼠分为对照组，牵拉组和牵拉+释放组，每组8只C57小鼠，提取相应RNA后进行反转录，随后进一步进行运用独立样本 t检验及曼-惠特尼 U检验进行分析验证。 结果:通过DEA分析共筛选出321个目的基因，其中有180个上调基因和141个下调基因，GO分析显示上调基因主要富集在蛋白去甲基化，调控其他基因表达和代谢过程，而下调基因主要富集在多细胞生物发育、细胞分化和Notch信号通路等。并最终筛选出乳腺癌易感基因1(BRCA1)，周期蛋白依赖激酶抑制因子1B(CDKN1B)，拟南芥驱动蛋白2B基因(KAT2B)，前列腺素内过氧化物酶2(PTGS2)，S期激酶相关蛋白1(SKP1)这五个关键基因。并且发现在细胞实验中发现与对照组比较，牵拉膀胱细胞组BRCA1，KAT2B，PTGS2以及SKP1表达高于对照组(BRCA1为1.336比1.000， t＝4.221， P<0.05；PTGS2为1.338比1.000, t＝4.222， P<0.05)；KAT2B为1.581比1.000， t＝2.863， P<0.05；SKP1为1.466比1.000， t＝4.300， P<0.05)，差异均有统计学意义。在小鼠动物模型中，通过进行外科手术操作，成功造模膀胱梗阻模型，使小鼠膀胱持续充盈牵拉，并随后解除梗阻。进一步检验发现，牵拉组BRCA1，KAT2B以及PTGS2表达高于对照组(BRCA1为1.332比1.000， t＝9.421， P<0.05；KAT2B为1.363比1.000， t＝2.478， P<0.05；PTGS2为2.211比1.000， t＝3.403， P<0.05)，差异均有统计学意义，牵拉组CDKN1B和SKP1表达低于对照组(CDKN1B为0.856比1.000， t＝2.451， P<0.05；SKP1为0.669比1.000， t＝6.814， P<0.05)，差异均有统计学意义。而解除梗阻后，解除梗阻组BRCA1，CDKN1，BKAT2B以及PTGS2表达低于牵拉组(BRCA1为0.625比1.332, t＝11.710， P<0.05；CDKN1B为0.598比0.856, t＝3.397， P<0.05；KAT2B为0.928比1.363, t＝2.943， P<0.05；PTGS2为0.511比2.211， t＝4.735， P<0.05)，差异均有统计学意义。 结论:外力牵拉会导致膀胱平滑肌细胞出现相应的基因改变，另发现一系列可能参与BOO过程的目的基因。

原发性血小板增多症（ET）是费城染色体阴性的慢性骨髓增殖性肿瘤（MPN）中较常见的亚型，年发病率为1~2.5/10万，发病高峰年龄在50~70岁 [1]。ET起源于骨髓造血干/祖细胞的克隆性疾病，表现为巨核细胞过度增殖从而导致血小板计数明显增高 [1]。ET的发病机制为基因突变或其他因素导致JAK-STAT信号通路高度活化 [2]。ET的驱动基因突变包括JAK2 V617F、钙网蛋白基因（CALR）及骨髓增殖性白血病蛋白基因（MPL）突变，分别占50%~60%、15%~35%及2%~4% [3-4]。20%~30%的患者存在MPN非特异性基因突变（包括信号通路、转录因子、DNA甲基化、组蛋白甲基化以及剪接基因等） [5]。

目的:分析经典型BCR-ABL阴性骨髓增殖性肿瘤（MPN）的基因突变及临床特征。方法:应用二代测序方法检测108例初诊BCR-ABL阴性MPN患者[原发性血小板增多症（ET）55例，真性红细胞增多症（PV）24例，原发性骨髓纤维化（PMF）29例]与疾病相关的127个基因突变情况，并分析基因突变与临床特征间的关系。结果:108例MPN患者中，100例（92.59％）检出32种基因共211个突变，人均检出（1.96±1.32）个突变。85.19％（92/108）的患者检出驱动基因（JAK2、CALR、MPL）突变，其中69.56％（64/92）的患者至少检出1种附加基因突变。按突变频率由高到低依次为激活信号通路基因（42.2％，89/211）、DNA甲基化基因（17.6％，36/211）、染色质修饰基因（16.1％，34/211）。PV、ET、PMF三组间激活信号通路基因、表观遗传调节基因、剪接体和RNA代谢基因突变个数差异均有统计学意义，PMF附加基因平均突变数目高于ET及PV患者（1.69±1.39、0.67±0.70、0.87±1.22， χ2＝13.445， P＝0.001）。检出≥3个突变基因患者MPN总症状评估量表（MPN 10评分）（ P＝0.006）、骨髓纤维化程度（ P＝0.015）均较检出<3个突变基因患者高，且HGB水平更低（ P＝0.002）；26例（24.1％）患者检出高危基因突变（HMR），HMR突变的患者具有更低的PLT（ P＝0.017）和HGB水平（ P<0.001），更高的骨髓纤维化程度（ P＝0.010）、MPN10评分（ P<0.001）。PMF患者ASXL1突变频率高于PV患者（37.9％对4.2％， P＝0.005），ASXL1突变的PMF患者具有更低的PLT和HGB水平（ P＝0.029、0.019）。 结论:近七成MPN患者检出至少1种附加基因突变，24.1％检出HMR突变，各亚组有不同的基因突变模式；PMF患者附加基因平均突变数目更多，ASXL1突变频率更高。ASXL1突变的PMF患者PLT和HGB水平更低。

目的:探讨N6-甲基腺苷(m6A)修饰在脂多糖(LPS)诱导的小鼠急性肺损伤(ALI)的变化，并探讨其机制。方法:将12只8~10周龄的C57BL/6雄性小鼠按照随机数字表法分为对照组和LPS组。LPS组给予LPS(5 mg/kg)气管内滴注，对照组给予同等剂量生理盐水气管内滴注，12 h后取材，比较两组小鼠肺组织湿干重比。比较两组小鼠肺组织病理变化。应用实时定量聚合酶链反应(PCR)检测炎性因子和相关基因表达水平。运用m6A甲基化免疫共沉淀测序(meRIP-seq)和RNA测序(RNA-seq)技术检测两组小鼠肺组织的m6A修饰水平和RNA水平，并采用生物信息学对结果综合分析。组间比较采用 t检验。 结果:LPS组小鼠肺湿干重比(7.56±0.34)高于对照组(3.99±0.54)，差异有统计学意义( t＝13.749， P<0.05)，且苏木精-伊红(HE)染色提示炎性细胞浸润和肺间质水肿程度加剧。LPS刺激增加小鼠肺组织炎性因子IL-1β(1.00±0.27比11.76±6.78)、IL-6(1.00±0.16比2.16±0.70)、TNF-α(1.01±0.09比1.93±0.73)的mRNA水平，差异有统计学意义( t＝3.447、3.692、2.843， P<0.05)。meRIP-seq共筛选出772个有表达差异的m6A甲基化位点，其中40.93%的位点显著上调。meRIP-seq和RNA-seq联合分析发现50个差异表达基因，包括B细胞易位基因1(BTG1)、心室区表达PH结构域1(VEPH1)、Toll样受体5(TLR5)和驱动蛋白超家族蛋白26A(KIF26A)等。 结论:m6A修饰在LPS诱导的ALI中发生变化，m6A修饰可能作用于BTG1、VEPH1、TLR5、KIF26A等基因，并在ALI中发挥作用。

目的:通过整合生物信息学分析筛选与肺栓塞相关的遗传和表观遗传表达差异。方法:以2019年就诊与新疆医科大学第三附属医院肺栓塞患者及健康体检者4例作为研究对象，利用高通量测序技术及甲基化芯片技术检测、筛选并整合外周血差异基因组和表观基因组数据来识别致肺栓塞发病的甲基化驱动基因及差异表达基因，行GO及KEGG富集分析。结果:将肺栓塞组和健康对照组间DNA甲基化和基因表达数据进行共表达分析，基因上游区域差异甲基化与基因表达呈负相关，其中共筛选出基因上游区域显著甲基化基因有8个，采用独立样本的T检验及Pearson相关性分析，肺栓塞组中TSS1500显著甲基化基因有6个，分别为TSPO2、C1QA、AQP1、TNFSF9、MIA、STAB1，对应基因的差异表达倍数log2FC分别是1.298，1.629，1.024，2.746，2.539，1.060，基因表达与基因甲基化之间的相关度分别是-0.908，-0.900，-0.824，-0.784，-0.783，-0.779，两组间甲基化差异分别是-0.049，-0.053，-0.048，-0.057，-0.050，-0.053（ P<0.05）。TSS200区域显著甲基化基因有3个，分别为TSPO2，SLCP9A3，SIGLEC1，基因表达差异倍数log2FC分别是1.298，-2.252，1.866，基因表达与基因甲基化之间的相关度分别是-0.860，-0.774，-0.739，两组间甲基化差异分别是-0.051，0.027，-0.048（ P<0.05）。肺栓塞组中在TSS区域有TSPO2、C1QA、AQP1、TNFSF9、MIA、STAB1、SIGLEC1共7个基因呈现低甲基化高表达状态。SLC9A3基因呈现高甲基化低表达。GO功能分析中，在补体活化、免疫反应、激活蛋白级联等得到显著富集。在KEGG信号通路中，免疫系统、细菌感染以及信号分子及相互作用方面得到显著富集，从而调控肺栓塞的发生。 结论:基于DNA甲基化和基因表达的联合分析，发现了肺栓塞发生发展的新思路，后续可进行更加深入的研究。

核酸甲基化是基因表观遗传学修饰的一种重要方式，也是肿瘤最常见的驱动性分子事件。检测核酸甲基化游离形式不但能够对肿瘤进行早期辅助诊断及预后判断，而且可避免传统肿瘤组织活检方法侵入性和肿瘤异质性等问题。本文将回溯游离核酸甲基化检测在肿瘤诊断中的应用现状，剖析游离核酸甲基化检测面临的挑战，并对其临床应用前景进行展望。

表观遗传学是肿瘤发展中的关键事件，可以改变肿瘤驱动基因的表达而导致基因组不稳定，而无需涉及基因本身的序列变化。组蛋白修饰属于表观遗传学的重要部分，在肿瘤的发病机制中起着重要作用。果蝇zeste基因增强子人类同源物2(enhancer of Zeste homolog2，EZH2)是多梳抑制性复合物2(polycomb repressive complex 2，PRC2)的酶催化亚单位，通过诱导组蛋白H3赖氨酸27甲基化(H3K27me3)来改变下游靶基因的表达。除直接作用于H3K27me3外，EZH2还可以通过多种途径调节基因表达。在多种肿瘤中均发现了EZH2的表达上调，而且肿瘤的不良预后也与EZH2表达的异常增高有关。本文综述了EZH2的结构和功能，重点介绍了EZH2在肿瘤发生、发展、转移中的作用，并分析其作为靶点对肿瘤诊断和治疗的指导性意义。

糖尿病周围神经病变(DPN)发病由环境因素驱动,环境因素可诱导表观遗传变化,使其成为环境和基因表达的桥梁.高血糖引起DNA甲基化改变,参与组蛋白修饰的酶活性调节异常,与染色质结构修饰相关,导致DPN基因表达发生改变.本文综述DPN的表观遗传作用研究进展.

肺癌是目前全球及我国恶性肿瘤相关死因均居首的癌种.非小细胞肺癌(NSCLC)作为高度异质性的恶性肿瘤,驱动基因阴性患者的临床获益和总体生存欠理想.目前不同分型的 NSCLC 的生物组织学、基因组学特征、临床结局明显不同,尚缺乏表观基因组学的背景.组蛋白甲基转移酶 NSDs 属于核受体结合 SET 结构域家族成员.NSD2、NSD3 在肺腺癌(LUAD),肺鳞状细胞癌(LUSC)组织中表达上调,其表达与肿瘤进展呈正相关,且利用其含有的 SET结构域主要催化组蛋白 H3 赖氨酸第 36 号位的二甲基化(H3 K36me2),发挥基因转录活性调控作用.组蛋白的甲基化修饰作为表观遗传学中重要的调控机制,在转录调控以及染色质重构等多种生物学过程中发挥重要作用.一些报道已把 NSDs确定为驱动基因,不仅参与肺癌的发生发展,还可能与抗肿瘤治疗抗性有关.深入探究 NSD家族作为生存、预后风险因子在 NSCLC 进展和治疗抗性中的作用机制,有助于提高我们对组蛋白H3K36me2 修饰在 NSCLC中生物学功能的认知及治疗靶点的探索,因此,现对 NSD家族蛋白在 NSCLC中的研究进展进行综合论述.