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ANXA6基因单核苷酸多态性及其表达水平与慢性牙周炎的关联性研究
编辑人员丨2024/1/20
目的:探讨膜联蛋白 A6(AnnexinA6,ANXA6)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)及其表达水平与慢性牙周炎的相关性.方法:选择 2022 年 1 月~2022 年 12 月于新疆医科大学第二附属医院口腔科就诊的142 例慢性牙周炎患者作为研究对象,并选择同期于我院进行健康体检的150 名牙周健康者作为健康对照组.对ANXA6 基因的 2 个SNP位点rs11960458(C>T)、rs4958897(C>T)进行基因分型.采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)对ANXA6 基因mRNA相对表达水平进行测定.结果:慢性牙周炎患者和健康对照组的性别、年龄、BMI、吸烟史和饮酒史比较差异均无统计学意义(P>0.05).对于rs11960458 位点,慢性牙周炎组和健康对照组CC、CT和TT基因型分布比较有统计学差异(P=0.002);两组相加模型和显性模型比较有统计学意义(P<0.05).对于rs4958897 位点,两组 CC、CT 和 TT 基因型分布和遗传模型分布均无统计学差异(P>0.05).两组rs11960458 位点C、T基因等位基因频率比较差异有统计学意义(P=0.005),而rs4958897 位点C、T基因等位基因频率比较差异无统计学意义(P=0.089).慢性牙周炎患者ANXA6 基因mRNA相对表达水平显著高于健康对照组(P<0.05).应用ANXA6 基因mRNA相对表达水平区分慢性牙周炎患者和健康对照人群曲线下面积(area under the curve,AUC)为 0.876(95%CI 0.835~0.916,P<0.001),灵敏度和特异度分别为 72.5%和 89.3%.rs11960458 位点CT、TT基因型的患者ANXA6基因mRNA相对表达水平均显著高于CC基因型(P<0.05),但CT、TT基因型ANXA6 基因mRNA相对表达水平比较无统计学差异(P>0.05).结论:ANXA6基因rs11960458变异及其基因表达水平与慢性牙周炎的发生有关.
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编辑人员丨2024/1/20
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微芯片电泳技术鉴定金银花和山银花
编辑人员丨2023/10/28
目的 利用微芯片电泳技术对金银花和不同基原山银花进行鉴定.方法 根据忍冬科植物的基因序列变异位点分别设计出金银花和山银花的特异性聚合酶链式反应(PCR)引物,运用等位基因特异聚合酶链式反应(AS-PCR),对各药材的DNA进行特异性扩增,并应用全自动微芯片电泳技术对扩增产物进行分析.结果 使用金银花PCR引物时,金银花可扩增出约468 bp的特征性DNA片段,而不同基原的山银花几乎没有该片段;使用山银花PCR引物时,不同基原的山银花均扩增出约331bp的特征性DNA片段,而金银花几乎没有该片段.结论 本方法可对金银花和不同基原的山银花进行快速准确的鉴定,为中药DNA分子鉴定技术的拓展应用提供参考.
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编辑人员丨2023/10/28
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结合珠蛋白基因多态性与2型糖尿病合并周围神经病变的相关性研究
编辑人员丨2023/9/16
目的 探讨结合珠蛋白(Hp)基因多态性与2型糖尿病(T2DM)并发周围神经病变(DPN)的相关性.方法 选取2016年1月至2020年1月石家庄市第二医院住院的258例T2DM患者为研究对象,根据有无DPN分为单纯T2DM组(对照组)和T2DM并发DPN组(DPN组).采用序列特异性引物聚合酶链式反应(PCR-SSP)技术进行Hp基因分型,比较两组临床生化指标水平及Hp等位基因、基因型分布情况,分析T2DM患者并发DPN的独立危险因素.结果 与对照组比较,DPN组T2DM病程更长,空腹血糖(FPG)、胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)、高密度脂蛋白-胆固醇(HDL-C)、血清总胆红素(TBiL)水平更高,血红蛋白(Hb)水平更低,差异有统计学意义(P<0.05).DPN组Hp显性模型(Hp2-2±Hp2-1vs.Hp1-1)比例高于对照组(P<0.05).Hp与Hb呈正相关(P<0.05).多因素logistic回归分析显示,T2DM病程、TBiL和Hp2是导致T2DM患者并发DPN的影响因素(P<0.05).结论 携带Hp2的T2DM患者更易出现DPN.
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编辑人员丨2023/9/16
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双向等位基因特异性PCR与限制性片段长度多态性基因分型方法比较
编辑人员丨2023/8/6
目的:比较双向等位基因特异性PCR(Bi-PASA)法与聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(RFLP)法对EZH2基因单核苷酸多态性(SNPs)位点rs887569基因分型结果有无差异,并用Bi-PASA法对EZH2基因rs17171119位点基因分型后分析与结直肠癌(CRC)易感性的相关性.方法:提取96名CRC患者与100名体检健康者的外周血DNA,分别用Bi-PASA法与聚合PCR-RFLP法检测EZH2基因单核苷酸多态性(SNPs)位点rs887569基因型,对两种分型结果进行比较;使用Bi-PASA法对EZH2基因rs17171119位点进行基因分型后用病例-对照方法分析该SNPs在中国人群中的分布.结果:Bi-PASA与PCR-RFLP对EZH2基因rs887569位点基因分型的准确率分别为99.5%和100%;EZH2基因的rs17171119 SNPs位点多态性与结直肠癌易感性无显著相关性(P=0.938,OR=0.846,95%CI:0.586-1.221).结论:Bi-PASA是一种简单有效检测SNPs的方法,分型结果较为可靠;rs17171119 SNPs位点多态性与结直肠癌易感性无关,但本结论还有待更大样本量基因分型的验证.
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编辑人员丨2023/8/6
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人类白细胞抗原基因型的胚胎植入前遗传学诊断
编辑人员丨2023/8/6
目的 建立人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)基因配型,为开展HLA配型的胚胎植入前遗传学诊断(preimplantation genetic diagnosis,PGD)联合或不联合单基因病的临床工作提供技术支持.方法 采用多重置换扩增(multiple displacement amplification,MDA)的方法扩增3~5个滋养层细胞的全基因组,并用多重聚合酶链式反应(PCR)方法扩增多个短串联重复多态性(polymorphic short tandem repeat,STR)位点,通过毛细管电泳技术验证STR位点的特异性.结果 微量细胞全基因组的扩增成功率为93.75%,筛选了HLA基因的5个杂合度高、特异性强的STR位点,等位基因脱扣(allele drop-out,ADO)率为10.34%.结论 微量细胞MDA结合多重PCR的方法可以同时检测HLA-A、HLA-B、DRA、DQB位点,扩增成功率高,ADO率低,可以有效地筛选出相匹配的胚胎,为同胞患儿提供造血干细胞来源具有可行性.
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编辑人员丨2023/8/6
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KIR3DL1基因内含子一个新缺失位点在中国九个民族中的多态性
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨一个KIR3DL1基因内含子区变异在我国不同民族人群中的多态性和分布特点.方法 采用聚合酶链式反应-序列特异性引物PCR (PCR-SSP)结合DNA测序,对来自云南、贵州、西藏和内蒙古地区9个民族10个人群共676例样本的KIR3DL1基因内含子区多态性进行分析.结果 中国不同地区的民族人群中均发现KIR3DL1基因内含子2/3区存在一个4bp缺失位点,在不同民族中的基因频率为0-6.56%,其中以汉族和仡佬族较多,藏族和蒙古族较少,在不同人群之间的差异具有统计学意义.结论 KIR3DL1基因内含子2/3区域4bp缺失位点在中国不同地区和民族人群中有多态性,且不同民族间的缺失型等位基因分布存在明显差异,环境因素和民族源流可能在这种差异性形成过程中起作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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TBX20基因多态性与先天性心脏病的关系
编辑人员丨2023/8/6
目的:探讨心脏发育相关基因T-box20 (TBX20)的多态性与先天性心脏病(CHD)的关系.方法:从美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库获得TBX20基因序列,并预测多态性候选基因座.收集80例CHD患儿(研究组)和80例健康儿童(对照组)的外周血,提取DNA,进行限制性片段长度多态性聚合酶链式反应(RFLP-PCR),设计特异性基因引物.对PCR的结果进行分析以鉴定扩增子之间的差异.结果:发现TBX20基因单核苷酸多态性位点(SNP位点)为rs3999950:c.774T>C(Ala265Ala).研究组TC基因型频率高于对照组,且C等位基因频率亦高于对照组(P<0.05).TC基因型的优势比(OR)为8.12,表明TC基因型可增加CHD的发病风险.结论:TBX20基因的SNP位点rs3999950可能与CHD有关.
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编辑人员丨2023/8/6
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PCR-荧光探针法检测汾阳地区女性亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 运用PCR-荧光探针法技术对汾阳地区女性进行亚甲基四氢叶酸还原酶基因(MTHFR)分型检测,以指导临床个体补充叶酸提供科学依据,并为了解汾阳地区人群MTHFR基因分型遗传构成提供基础数据.方法 EDTA抗凝管收集医院就诊女性的外周血2ml,提取其中的DNA并结合荧光定量聚合酶链式反应,运用探针检测MTHFR基因677C/T多态性位点的基因型,对本地女性群体该位点碱基C/T的分布频率进行统计学分析.结果 汾阳地区女性群体中携带CC、CT、TT基因型频率为16.2%,47.9%和35.9%;C和T等位基因频率分别为40.1%和59.9%.结论 本研究说明,PCR-探针法是一种快速的,多样本检测方法,利用探针的特异性对亚甲基四氢叶酸还原酶基因位点进行特异性检测.
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编辑人员丨2023/8/6
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洞南省2011-2016年HIV感染长期不进展者人类白细胞抗原基因多态性分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 分析河南省HIV感染长期不进展者(LTNP)病程进展及人类白细胞抗原(HLA)基因多态性特征.方法 采用回顾性研究,对河南省2011-2016年检测及随访信息完整的48例LTNP进行分析,探讨随访期间CD4+T淋巴细胞计数(CD4)、病毒载量(VL)的变化情况.采用聚合酶链式反应-序列特异性寡核苷酸探针技术(PCR-SSOP)对LTNP及健康对照的HLA-A、HLA-B和HLA-DRB1基因位点多态性进行分析.结果 2011-2016年48例LTNP 6次随访检测发现,CD4的四分位数从601.00(488.50 ~ 708.72)个/μl降低至494.00(367.00 ~ 672.00)个/μl,差异有统计学意义(P<0.05).log10VL的四分位数从3.40(2.87~3.97)上升到3.48(2.60~4.37),差异无统计学意义(P>0.05).HLA基因位点多态性分析显示,HLA-B* 13:02、HLA-B*40:06位点多分布在LTNP中(P<0.05),而HLA-B*46:01、HLA-DRB1*09:01在健康对照中常见(P<0.05).结论 河南省LTNP CD4有逐年下降的趋势,HLA-B *13:02、HLA-B*40:06等位基因位点可能与延缓本地区LTNP疾病进程有关.
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编辑人员丨2023/8/6
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人类白细胞抗原DQA1、DQB1基因多态性与弓形虫病感染的关联分析
编辑人员丨2023/8/6
目的:探讨杭州汉族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA) DQA1、DQB1基因多态性与弓形虫(Toxoplasma gondii)感染的关联性.方法:采用病例-对照配对研究及聚合酶链式反应序列特异性引物(PCR-SSP)分型技术,对43例弓形虫感染者以及43例对照组进行HLA-DQA1、HLA-DQB1等位基因分型,并进行基因频率、疾病发生相对危险率(OR)分析.结果:与对照组相比,弓形虫感染组HLA-DQA1*0302、HLA-DQB1 * 0301基因表现频率均显著增高(Pc <0.05);而HLA-DQB1* 0504基因表现频率则显著降低(Pc <0.05).结论:HLA-DQA1*0302、HLA-DQB1*0301等位基因与杭州地区汉族人群的弓形虫易感性相关;HLA-DQB1* 0504基因频率可能与弓形虫感染的抵抗性相关联.
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编辑人员丨2023/8/6