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淮安市H3N2亚型流感病毒全基因组序列的遗传特征分析
编辑人员丨6天前
目的:了解江苏省淮安市H3N2亚型流感病毒的生物学特性和变异情况,为流感疫情防控与疫苗研发提供参考依据。方法:选取4株2022年淮安市流感监测网络实验室分离的流感毒株,通过全基因组核酸提取、文库构建,应用Nanopore三代测序平台对H3N2亚型毒株进行全基因组序列测定,利用生物信息学软件比对基因组序列相似性、构建系统发育树,解析氨基酸变异特征。结果:8个基因节段之间的核苷酸相似性为97.1%~100.0%,相似性差异最大的是HA基因(97.1%~99.9%),差异最小的是MP基因(98.6%~99.9%)。核苷酸位点变异频率最高和最低的节段分别是HA基因(3.06%)和MP基因(1.43%),不同基因节段核苷酸变异率有统计学意义( χ2=14.293, P=0.046)。HA和NA基因发育树拓扑结构基本一致,3株隶属3C.2a1b.2a.1a进化簇,1株独立属于3C.2a1b.1b进化分支且糖基化位点相较于另外3株在HA1蛋白142NWT、149NGT和NA蛋白436NLS位点发生丢失。4株淮安株均对NA抑制剂和金刚烷胺类药物敏感。 结论:1株淮安株抗原性发生了改变,与当年疫苗株匹配性较低,建议持续加强H3N2流感病毒的基因监测,为流感防控及流感疫苗筛选提供科学依据。
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编辑人员丨6天前
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天津市婴儿发育性髋关节发育不良的筛查结果及危险因素分析
编辑人员丨6天前
目的:探讨天津市婴儿发育性髋关节发育不良(developmental dysplasia of the hip,DDH)的B超筛查Graf分型结果及危险因素。方法:回顾性分析2013年1月至2020年12月利用妇幼卫生保健三级管理和天津市妇幼卫生信息操作系统对生后6~8周的婴儿进行早期髋关节B超筛查的资料。筛查采用"初筛-复筛-确诊治疗"的"2+1"模式。统计筛查阳性率和不同年份、不同Graf分型患儿转诊治疗时的年龄,比较不同性别、胎次、胎位、生产方式、胎龄、出生体重、家族史患儿阳性率的差异,并采用二分类变量logistic回归分析筛选DDH的危险因素。结果:筛查婴儿807 889名,检出B超Graf分型Ⅱa型及以上阳性2 039例(2 841髋),检出阳性率为2.52‰(2 039/807 889)。异常髋中Ⅱa(+)型685髋、Ⅱa(-)型959髋、Ⅱb型367髋、Ⅱc型262髋、D型227髋、Ⅲ型265髋、Ⅳ型76髋;占比最多的依次为Ⅱa(-)型(33.76%,959/2 841)、Ⅱa(+)型(24.11%,685/2 841)、D型及以上型(19.99%,568/2 841)。左侧髋异常率为2.02‰(1 632/807 889),大于右侧的1.50‰(1 209/807 889),侧别差异有统计学意义(χ 2=63.09, P<0.001)。女婴髋异常率为3.27‰(2 541/777 272),大于男婴的0.36‰(300/838 506),性别差异有统计学意义(χ 2=1 947.87, P<0.001)。男婴DDH阳性率0.50‰(209/419 253)、女婴4.71‰(1 830/388 636),男女婴检出比为1∶8.76,不同性别DDH阳性率的差异有统计学意义(χ 2=1 420.10, P<0.001)。不同胎位(头位/臀位)、生产方式(顺产/剖宫产)、出生体重(正常/低体重)、家族史(有DDH/无DDH)患儿DDH阳性率的差异均有统计学意义( P<0.05),不同胎次(第一胎/第二胎及以上)、胎龄(足月/早产)患儿DDH阳性率的差异均无统计学意义( P>0.05)。Logistic回归分析结果显示,女婴( OR=10.50, P<0.001)和胎位为臀位( OR=3.40, P<0.001)是DDH发生的独立危险因素,早产( OR=0.91, P<0.001)为DDH的保护因素。各年份不同B超Graf分型患儿转诊治疗年龄的差异均有统计学意义( P<0.05)。 结论:经"初筛-复筛-确诊治疗"的"2+1"筛查模式,天津市生后6~8周婴儿B超筛查DDH的阳性率为2.52‰,女婴、左侧髋阳性率更高。B超Graf分型越严重的患儿转诊治疗的年龄越小。女婴、胎位为臀位者更容易发生DDH,早产使发生DDH的风险降低。
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编辑人员丨6天前
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Delta样典型Notch配体3基因在脑胶质瘤中的表达及其临床意义
编辑人员丨6天前
目的:研究Delta样典型Notch配体3(DLL3)基因在脑胶质瘤中的表达特征及其临床意义,进而探索其在脑胶质瘤中的生物学功能。方法:回顾性分析中国脑胶质瘤基因组图谱计划数据库(CGGA)的两套mRNA测序数据集及其匹配的临床数据,其中数据集1包含325例样本,数据集2包含693例样本。应用R软件分析DLL3在不同世界卫生组织(WHO)分级、不同分子分型脑胶质瘤的表达模式,并应用免疫组织化学染色检测方法验证DLL3蛋白在不同WHO级别脑胶质瘤中的表达水平。通过Kaplan-Meier生存曲线评价DLL3不同表达水平的脑胶质瘤患者的生存差异。采用单因素和多因素Cox回归分析法分析影响脑胶质瘤患者总体生存期的因素。通过Pearson相关性检验分析与DLL3表达相关的基因。采用功能富集分析方法分析与DLL3表达相关基因的生物学功能。结果:在数据集1中,DLL3的表达随着WHO级别的升高而下调,差异有统计学意义( P<0.001);DLL3在异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变型患者中的表达量高于IDH野生型患者( P<0.001);DLL3在IDH野生型患者中的表达量低于IDH突变型且染色体1p/19q共缺失患者和IDH突变型且染色体1p/19q非共缺失患者( P<0.001);DLL3在O 6-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化患者中的表达量高于非甲基化患者( P<0.001);通过免疫组织化学染色方法验证DLL3表达随着WHO级别的升高而下调( P<0.01);DLL3的上述结果在数据集2中得到相似结果。在两个数据集中,DLL3高表达组患者的总体生存期均长于低表达组患者(均 P<0.01)。多因素Cox回归分析结果显示,WHO分级(WHO Ⅲ级: HR=2.861,95% CI:1.910~4.287;Ⅳ级: HR=4.655,95% CI:3.010~7.199)、染色体1p/19q共缺失( HR=0.439,95% CI:0.293~0.657)以及DLL3高表达( HR=0.593,95% CI:0.427~0.823)均为脑胶质瘤患者预后的独立影响因素(均 P<0.001)。与DLL3表达相关的基因有661个(| r|≥0.4, P<0.05);生物信息学分析提示,DLL3可能与脑胶质瘤患者的轴突发生、突触组织、负向调控神经系统发育等功能相关。 结论:随着脑胶质瘤病理学级别的升高,DLL3的表达水平下调;DLL3表达水平与脑胶质瘤患者的生存期密切相关,可作为判断脑胶质瘤患者预后的潜在指标和治疗靶点。
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编辑人员丨6天前
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甲胎蛋白高表达和低表达肝细胞肝癌的基因表达谱差异分析
编辑人员丨6天前
目的:探讨甲胎蛋白(AFP)高表达和低表达肝细胞肝癌(HCC)中的差异表达基因表达谱,为HCC的分子机制研究及预后判断提供理论依据。方法:从肿瘤基因图谱计划(TCGA)公共数据库获得368例包含完整临床信息的HCC转录组数据,根据组织AFP mRNA表达四分位数将样本分为AFP高表达组和AFP低表达组,每组各92例。应用R软件中的DEseq2包进行差异表达基因分析,应用ClusterProfiler包对差异表达基因进行基因本体论(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,应用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白相互作用网络,筛选关键基因。采用单样本基因集富集分析方法,通过R软件GSVA包对特征基因进行富集评分,根据得分定义特征基因集表达情况。利用RNAseq数据和实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)进行独立数据集验证和组织验证。结果:TCGA数据分析显示,AFP高表达与HCC低分化、患者人种有关(均 P<0.05)。生物信息学分析共获得1 382个差异表达基因,其中931个基因在AFP高表达组织中表达上调,451个基因表达下调。GO功能分析显示,AFP高表达组织中高表达的基因主要与附属肢体发育、肢体发育、骨架系统发育等过程有关,而低表达基因则与异源物代谢、类固醇代谢、细胞对异生物刺激反应等代谢相关过程有关。KEGG通路分析显示,AFP高表达组织中高表达的基因主要参与原发性免疫缺陷、神经活性配体-受体相互作用、细胞因子-细胞因子受体相互作用通路,而低表达基因主要与视黄醇代谢、化学致癌作用、类固醇激素的生物合成等通路相关。鉴定出1个预后相关特征基因集,该基因集包括AURKB、TTK、CENPA、UBE2C、HJURP、KIF15,其高表达与HCC患者的无复发生存和总生存有关,且特征基因集富集分数与AFP表达呈正相关( r=0.475, P<0.001)。RNAseq数据验证结果与TCGA数据分析结果基本一致。RT-qPCR检测结果显示,特征基因集中AURKB、KIF15和UBE2C在AFP高表达HCC组织中显著高表达,其表达虽然与HCC患者的无病生存、总生存无关,但AFP低表达组患者的无病生存曲线和总生存曲线均在AFP高表达组患者之上。 结论:AFP高表达和AFP低表达HCC在基因表达谱上存在较大差异。筛选出的特征基因集可能协同AFP共同促进HCC的发生发展,其对解释不同水平AFP HCC的作用机制有一定作用,并为HCC的预后判断提供了新的思路和依据。
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编辑人员丨6天前
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早产儿视网膜病变激光光凝术后角膜地形图状况
编辑人员丨6天前
目的::观察早产儿视网膜病变(ROP)激光光凝术后儿童角膜地形图的改变。方法::病例对照研究。收集2015年9月至2018年4月于深圳市眼科医院行激光光凝术后的ROP儿童25例(50眼)为ROP组,同时收集年龄匹配的足月儿童23例(46眼)为对照组。2组儿童均行最佳矫正视力(BCVA)检查,统计分析时转换为LogMAR视力。Sirius眼前节分析系统测量2组儿童的各种角膜参数:角膜前后表面不同直径角膜曲率的最大值(K1)和最小值(K2)、平均角膜曲率(Avg);角膜前后表面不同直径的陡峭半径(rs)、平坦半径(rf)、非球面参数(e)。数据采用独立样本 t检验进行分析。 结果::ROP组儿童BCVA(LogMAR) (0.24±0.25)较对照组儿童(0.07±0.10)差,2组间差异有统计学意义( t=3.20, P=0.003)。ROP组儿童角膜前后表面不同直径范围的角膜屈光力均比对照组儿童大,差异有统计学意义[K1(角膜前表面3、5、7 mm,角膜后表面3、5、7 mm): t=3.139、3.050、2.710,-4.216、-3.821、-2.474;K2: t=2.816、2.688、2.286,-4.252、-3.883、-3.178;Avg: t=3.190、3.041、2.649,-4.848、-4.271、-3.121。均 P<0.05]。ROP组儿童角膜前后表面不同直径范围的角膜形态与对照组儿童比较差异均有统计学意义[rf(角膜前表面6、8 mm,角膜后表面6、8 mm): t=3.395、3.354,-4.427、-4.613;rs: t=2.928、2.807,-4.055、-4.175;e: t=3.437、3.991,2.268、4.355,均 P<0.05]。 结论::Sirius眼前节分析系统是研究ROP激光光凝术后全角膜发育方面的有利工具。ROP激光光凝术后早产儿儿童与足月产儿童相比,角膜前后表面不同范围的屈光力更大,BCVA更差,在视觉发育过程中更易发生屈光不正等视功能改变。
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编辑人员丨6天前
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18氟-氟代脱氧葡萄糖正电子发射体层摄影/CT显像联合MRI高分辨成像在局灶性皮质发育不良合并难治性癫痫中的诊断价值
编辑人员丨6天前
目的:探讨 18氟-氟代脱氧葡萄糖( 18F-FDG)正电子发射体层摄影(PET)/CT与MRI高分辨成像在局灶性皮质发育不良(FCD)合并难治性癫痫患者中的诊断价值及显像特点。 方法:回顾性分析2017年1月至2022年12月于济宁医学院附属医院就诊的42例FCD合并难治性癫痫患者的临床资料,所有患者术前均行头颅 18F-FDG PET/CT显像及MRI高分辨成像,并对图像进行PET/MRI异机融合。采用卡方检验、 Kappa一致性检验比较PET/CT、MRI、PET/MRI异机融合对患者癫痫灶的定位效能;根据患者性别、病灶部位、癫痫灶病理类型、癫痫发作类型、疗效进行分组,采用独立样本 t检验、方差分析比较不同亚组间FCD合并难治性癫痫患者的最大标准摄取值(SUVmax)、放射性分布不对称指数(AI)之间的差异。 结果:在42例患者中,MRI、PET/CT、PET/MRI异机融合检查的阳性率分别为85.7%(36/42)、95.2%(40/42)、100.0%(42/42),致痫灶定侧率分别为71.4%(30/42)、92.9%(39/42)、95.2%(40/42),定位率分别为57.1%(24/42)、81.0%(34/42)、88.1%(37/42)。MRI与PET/CT对致痫灶的定侧率及定位率差异(χ 2=6.574、5.570; P=0.010、0.018)及与PET/MRI异机融合的病灶阳性率、致痫灶定侧率及定位率差异(χ 2=6.385、8.571、10.118; P=0.012、0.003、0.001)均有统计学意义。MRI与PET/CT的病灶阳性率及PET/CT与PET/MRI异机融合的病灶阳性率、致痫灶定侧率及定位率差异均无统计学意义(χ 2=2.184、2.024、0.210、0.819; P=0.139、0.155、0.647、0.365)。将PET/CT、PET/MRI异机融合显像对致痫灶的定位情况行 Kappa一致性检验,得出 Kappa=0.721,提示两者在致痫灶定位上较为一致。颞叶型癫痫患者的SUVmax值低于、AI值高于颞叶外型患者(分别为7.4±1.3比9.6±1.6、15.5±2.6比12.9±2.4; t=5.154、6.083; P=0.001、0.001)。疗效良好组(根据Engel疗效分级系统,Ⅰ~Ⅱ级为疗效良好)患者的SUVmax值高于、AI值低于疗效不佳组(Engel疗效分级系统,Ⅲ~Ⅳ级为疗效不佳)患者(分别为9.5±1.9比7.9±2.1、13.5±3.3比14.8±3.0; t=2.789、3.722; P=0.042、0.029)。不同性别、病理类型、发作类型患者间的SUVmax值、AI值差异均无统计学意义(均 P>0.05)。 结论:不同类型FCD合并难治性癫痫患者的影像学显像特征存在差异,PET/MRI异机融合在FCD合并难治性癫痫患者中的诊断效能优于MRI,且与PET/CT在致痫灶定位上较为一致。
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编辑人员丨6天前
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Chiari畸形Ⅰ型患者后颅窝MRI特点研究
编辑人员丨6天前
目的:探讨Chiari畸形Ⅰ型(CMI)患者后颅窝MRI的特征性改变及其发病机制。方法:选取福建省立医院南院神经外科自2013年1月至2017年12月行后颅窝减压术治疗的110例CMI患者作为CMI组,选取同期门诊30例健康体检者作为对照组,应用图像存储与传输系统(PACS)测量所有受试者MRI T2加权像上后颅窝的骨性、神经结构。根据小脑扁桃体下疝的程度将CMⅠ患者分为Ⅰ度组、Ⅱ度组、Ⅲ度组,比较CMI组和对照组、不同小脑扁桃体下疝分度组患者临床资料和测量数据的差异。采用二分类Logistic回归分析CMI发病的独立影响因素。采用相关性检验分析CMI患者小脑扁桃体下疝程度、是否合并脊髓空洞与其他临床资料和测量数据的相关性。结果:(1)与对照组比较,CMI组患者的后颅窝斜坡长度、枕上长度、后颅窝高径长度均降低,斜坡倾斜角减少、颅脊角增大,差异均有统计学意义( P<0.05)。二分类Logistic回归分析结果显示枕上长度、斜坡倾斜角是CMI发病的独立危险因素( OR=0.057, 95%CI:0.005~0.650, P=0.021; OR=0.730, 95%CI:0.592~0.902, P=0.004)。(2)与Ⅰ度组比较,Ⅱ度组、Ⅲ度组患者的枕骨大孔前后径长度增加,斜坡倾斜角减小,差异均有统计学意义( P<0.05)。CMI患者的小脑扁桃体下疝程度与体质量指数(BMI)、斜坡倾斜角呈负相关关系( r=-0.214, P=0.045; r=-0.271, P=0.006),与枕骨大孔前后径长度、颅脊角呈正相关关系( r=0.336, P=0.001; r=0.282, P=0.004)。CMI患者是否合并脊髓空洞与斜坡长度呈正相关关系( r=0.235, P=0.018)。 结论:CMI患者后颅窝骨性发育异常导致容积狭小,不能适应正常发育的后脑神经组织,枕上长度的缩短和斜坡倾斜角变小是CMI的先天因素;颅脊角可能是小脑扁桃体下疝的后天因素,寰枕、寰枢关节退行性变可能参与颅脊角的改变。
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编辑人员丨6天前
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先天性膈疝患儿术后生长发育评估
编辑人员丨6天前
目的:评估先天性膈疝(congenital diaphragmatic hernia,CDH)患儿术后生长发育情况,探讨与生长发育相关的危险因素。方法:收集2008年1月至2017年12月在上海交通大学医学院附属新华医院小儿外科治疗痊愈出院并在门诊随访的87例先天性膈疝患儿资料,包括患儿明确诊断时孕周、娩出孕周、性别、Apgar评分、出生体重、肝脏位置、入院时血气分析、手术方式、缺损大小分级、是否需要补片修补和转归情况等。按照2006年世界卫生组织儿童生长标准,使用年龄别体重和年龄别身高评价膈疝患儿术后生长发育情况。年龄别身高和(或)年龄别体重处于小于2个标准差(standard deviations, SD)区间定义为生长发育迟缓,将患儿分为生长发育迟缓组和生长发育正常组,进行对比分析。资料采用SPSS 17.0软件进行统计学分析。结果:87例CDH患儿中,男51例,女36例,左侧69例,右侧18例。出生体重(3298.6±485.7)g,肝脏疝入22例(25.3%),需要补片修补8例(9.2%)。平均随访时间42.3个月(6~120个月)。8例(9.20%)年龄别体重<-2SD,6例(6.90%)年龄别身高<-2SD;生长发育迟缓组9例(10.3%),正常组78例(89.7%)。进一步临床资料分析中显示,生长发育迟缓组患儿出生体重较小( P<0.001),呼吸机维持时间较长( P<0.001),术中需要补片修补的概率较大( P=0.034),住院周期较长( P=0.006),且术后并发症高发( P=0.003),以呼吸系统并发症为主。多因素回归分析显示生长发育迟缓的独立危险因素为出生体重、呼吸机维持时间和术后呼吸系统并发症。 结论:膈疝术后部分患儿存在生长发育落后,其危险因素为出生体重、呼吸系统并发症和呼吸机维持时间。
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编辑人员丨6天前
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儿童社区获得性脓毒性休克后身体和心理社会健康相关生活质量改变的轨迹和危险因素
编辑人员丨6天前
目的:评估社区获得性脓毒性休克后1年内儿童健康相关生活质量(HRQL)中身体和心理社会领域的情况,并探索不良身体和心理社会HRQL预后的相关因素。设计:儿童脓毒症后生活评估二次分析(secondary analysis of the life after pediatric sepsis evaluation,LAPSE)。场所:美国12家学术型PICUs。对象:家庭监护者认为不存在严重基础发育残疾且自社区获得性脓毒性休克住院中存活的≥1月且<18岁患儿。干预措施:家庭监护者完成患儿基线(反映入院前状态),入院后7 d及1,3,6和12个月时的儿童生活质量问卷(Pediatric Quality of Life Inventory,PedsQLTM,2~18岁儿童)或PedsQLTM婴儿量表(<2岁)。较高的PedsQLTM身体和心理社会健康总结得分表明HRQL较好。测量方法与主要结果:204名儿童中58名(28.2%)有复杂慢性合并症。复杂慢性合并症患儿基线身体HRQL(62.7±22.6 vs.84.1±19.7, P<0.001)和心理社会HRQL(68.4±14.1 vs.81.2±15.3, P<0.001)明显低于参考常量,而未合并慢性病的患儿基线得分接近参考常量。合并复杂慢性病的儿童恢复到基线HRQL,而未合并患儿则未恢复(身体HRQL 75.3±23.7 vs 83.2±20.1, P=0.008;心理社会HRQL 74.5±18.7 vs 80.5±17.9, P=0.006)年龄<2岁与较高的12月时身体HRQL独立相关,PICU住院期间被医护人员怀疑神经损伤和存在神经检查异常与较低的12月时身体HRQL独立相关。针对颅内压增高的治疗以及1月时应用医疗装置和较低的12月时心理社会HRQL独立相关。 结论:尽管许多患儿可恢复到基线水平,社区获得性脓毒性休克患儿随后1年内的身体和心理社会HRQL仍较参考常量降低。HRQL较差的危险因素包括住院期间发生神经系统并发症以及入院后一月时仍依赖医疗装置。
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编辑人员丨6天前
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基于深度学习的骨龄评估系统对生长发育异常儿童骨龄评测的准确性
编辑人员丨6天前
目的:探讨基于深度学习的人工智能(AI)系统评估生长发育异常儿童骨龄的准确性。方法:回顾性连续收集2020年1月至2021年12月于贵州医科大学附属医院就诊的生长发育异常儿童的左手腕部X线正位片,共入组717例儿童,男266例、女451例,年龄2~18(11±3)岁。基于Tanner Whitehouse 3(TW3)-RUS(尺骨、桡骨、短骨)和TW3-Carpal(腕骨)法,由3名高年资医师评测骨龄,并取3者的均值作为参考标准。由AI系统(深睿医疗Dr.Wise骨龄预测软件)和2名低年资放射科医师(医师1、医师2)独立评测骨龄,并分别计算骨龄结果与参考标准骨龄之间误差在0.5年内的准确度、1年内的准确度、平均绝对误差(MAE)和均方根误差(RMSE)。以配对样本 t检验比较AI系统和低年资医师间的MAE。采用组内相关系数(ICC)评价AI系统、低年资医师评测骨龄与参考标准骨龄之间的一致性。绘制Bland-Altman图,计算AI评测骨龄与参考标准骨龄之间95%一致性界限。 结果:对TW3-RUS骨龄,与参考标准相比,AI系统、医师1、医师2误差在0.5年内的准确度分别为75.3%(540/717)、62.1%(445/717)、66.2%(475/717),误差在1年内的准确度分别为96.9%(695/717)、86.3%(619/717)、89.1%(639/717),MAE分别为0.360、0.565、0.496年,RMSE分别为0.469、0.634、0.572年。对TW3-Carpal骨龄,与参考标准相比,AI系统、医师1、医师2误差在0.5年内的准确度分别为80.9%(580/717)、65.1%(467/717)、71.7%(514/717),误差在1年内的准确度分别为96.0%(688/717)、87.3%(626/717)、90.4%(648/717),MAE分别为0.330、0.527、0.455年,RMSE分别为0.458、0.612、0.538年。AI系统TW3-RUS和TW3-Carpal骨龄评测的MAE均小于医师1、医师2,差异均有统计学意义( P均<0.001)。AI、医师1、医师2评测骨龄结果与参考标准之间均具有较好的一致性(ICC均>0.950)。Bland-Altman图显示AI系统对TW3-RUS和TW3-Carpal骨龄评测的95%一致性界限分别为-0.75~1.02岁、-0.86~0.91岁。 结论:AI系统对生长发育异常患儿骨龄评测的准确度接近高年资医师,优于低年资医师,且与高年资医师的一致性良好。
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编辑人员丨6天前
