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大连市842例新生儿听力及耳聋基因联合筛查结果分析
编辑人员丨6天前
目的:通过分析大连地区新生儿听力及耳聋基因联合筛查结果,为防控遗传性耳聋提供参考依据。方法:回顾性纳入2022年1月1日—5月30日在大连市妇女儿童医疗中心(集团)出生的新生儿842例,使用自动脑干诱发电位方法进行听力筛查,同时采集新生儿脐血,使用高通量测序法检测常见遗传性耳聋4个基因[GJB2、GJB3、SLC26A4(PDS)、药物性耳聋相关线粒体基因(MT-RNRI)(12SrRNA)]20个突变位点。结果:842例新生儿中通过听力筛查840例(99.8%);通过听力筛查而未通过耳聋基因筛查36例(4.3%);两者都通过804例(95.5%);两者都未通过2例(0.24%)。检出耳聋基因突变38例,总携带率为4.51%(38/842),其中GJB2、GJB3、SLC26A4(PDS)、MT-RNRI(12SrRNA)杂合突变携带率分别为1.90%、0.24%、1.30%和0.95%,GJB2/GJB3复合杂合突变携带率为0.12%。结论:新生儿听力及耳聋基因联合筛查可以降低听力筛查漏检率,大连地区新生儿耳聋基因携带率为4.51%,以GJB2携带率最高,SLC26A4(PDS)携带率次之。
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编辑人员丨6天前
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联合探针锚定聚合测序法在遗传性耳聋基因检测中的临床应用
编辑人员丨2023/8/6
目的 评估联合探针锚定聚合测序法在临床耳聋基因检测的应用价值.方法 用联合探针锚定聚合测序法对内蒙古自治区妇幼保健院35例耳聋患者样本进行检测,用十五项遗传性耳聋相关基因检测试剂盒(微阵列芯片法)检测结果进行比对,并用Sanger测序法进行验证.结果 联合探针锚定聚合测序法检测结果显示35例样本全部为异常,其中杂合突变27例,纯和突变8例.检测结果与微阵列芯片法和Sanger测序法一致,灵敏度为100%.结论 联合探针锚定聚合测序法准确、快速,在临床耳聋基因检测中有广泛的应用前景.
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编辑人员丨2023/8/6
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耳聋基因突变检测国家参考品的研制
编辑人员丨2023/8/6
目的 建立耳聋基因突变检测国家参考品.方法 收集健康人及含20种不同耳聋基因突变位点的志愿者血清,通过Sanger测序,从中筛选出野生型和突变型的血清样本,分装制备成一套含23份样本的候选耳聋基因突变检测国家参考品.用6个厂家8个耳聋基因突变检测试剂盒对参考品进行验证.参考品的均匀性和稳定性通过联合探针锚定聚合测序法进行检测.结果 各家试剂对大部分参考品的验证结果基本一致.本实验室对参考品在验证过程中新出现的突变位点进行了测序确认.参考品的均匀性和稳定性满足要求.结论 通过协作验证以及均匀性、稳定性评价,该耳聋基因突变检测国家参考品可用于耳聋基因突变检测试剂盒的质量评价.
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编辑人员丨2023/8/6
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内蒙古地区93例非综合征型耳聋患者的基因突变结果分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 分析非综合征型听力障碍儿童耳聋基因突变情况,从分子水平探究该人群聋病的遗传病因和特点.方法 采用联合探针锚定聚合测序法,收集2017年11月至2018年5月在呼和浩特市及周边地区诊断的双侧听力下降、重度至极重度感音神经性耳聋患者93例进行22个耳聋基因、159个位点的检测,同时对其父母进行验证.结果 93例检出耳聋基因突变52例,总阳性检出率为56.0%,GJB2、SLC26A4、MT-RNR1及GJB3基因的突变检出率分别为26.9%、23.7%、3.2% 和2.2%.其中37例为纯合突变或复合杂合突变,12例单杂合突变,还检出MT-RNR1基因突变3例.SLC26A4基因突变的15例中有9例伴前庭导水管扩大.未检测到GJB2、SLC26A4、MT-RNR1及GJB3以外的基因突变;患者中GJB2基因与SLC26A4、MT-RNR1及GJB3基因突变在汉族与其它少数民族(蒙族和回族)的比较中无显著性差异(P>0.05).结论 遗传因素在非综合征型耳聋的致聋病因中所占比例较高,内蒙古地区GJB2基因与其它三类基因(SLC26A4、MT-RNR1、GJB3)突变在不同的民族之间无显著性差异.对于耳聋基因阳性患者定期进行听力学随访意义重大,耳聋基因检测可以为未来新生儿筛查和遗传咨询提供科学依据.
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编辑人员丨2023/8/5
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BRCA基因突变检测的标准化研究
编辑人员丨2023/8/5
目的 使用BRCA基因突变国家参考品,评价BRCA1/2基因突变检测试剂盒(联合探针锚定聚合测序法)的性能.方法 取国家参考品的基因组DNA,进行打断和末端修复,获得片段化的DNA.使用连接酶在DNA两端加上接头.经pre-PCR扩增获得杂交前文库(pre-PCR文库),再用探针特异性捕获含目标区域的DNA片段,经post-PCR扩增获得杂交后文库(post-PCR文库).使用通用测序试剂盒进行测序,得到原始下机数据.通过数据分析,得到国家参考品的BRCA基因变异信息,从而对试剂盒的准确性、特异性和重复性进行评价.结果 试剂盒能够准确检出试剂盒检测范围内的BRCA基因突变位点,并且按照BRCA基因解读规则能够进行正确解读;没有检出其他非标示的致病性或疑似致病性突变位点.使用同一批次试剂盒重复检测国家参考品3次,每次结果均能满足准确性和特异性的要求.结论 BRCA基因突变国家参考品可以用于评价BRCA1/2基因突变检测试剂盒(联合探针锚定聚合测序法)的性能,实现对BRCA基因突变检测的标准化.
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编辑人员丨2023/8/5
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承德市25,205例新生儿聋病易感基因分子流行病学调查分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 首次针对承德市新生儿聋病易感基因携带情况进行分子流行病学调查分析,为承德地区耳聋出生缺陷防控干预提出建议和数据参考.方法 对全市11个区(市)县的25,205例新生儿采用耳声发射法或自动听性脑干诱发电位法进行听力筛查,同时采集足跟血,应用联合探针锚定聚合测序法进行24个基因208个位点常见耳聋基因筛查,对耳聋基因变异频谱进行综合分析.结果 2019年4月-2021年10月间,承德市共25,205例新生儿进行了听力与基因联合筛查,其中38例未通过联合筛查,133例基因筛查通过而听力筛查未通过,2,649例听力筛查通过而基因筛查未通过.聋病易感基因异常携带率10.66%,其中GJB2、SLC26A4、线粒体MT-RNR1和GJB3基因变异携带率较高,分别为7.19%、2.23%、0.98%和0.38%;其次为TMPRSS3、USH2A、OTOF、MARVELD2、MYO15A、MYO7A、DFNA5、LRTOMT,检出率为0.21%,占阳性个体的1.97%.结论 本研究首次在承德地区开展新生儿听力与基因联合筛查,发现承德市新生儿聋病易感基因携带率为10.66%,其中GJB2基因的c.109G>A位点检出率最高,约4.47%,对于携带c.109G>A位点变异的新生儿临床表型迟发的情况,应提供持续的遗传咨询和定期随访,进行提早预防和干预至关重要.
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编辑人员丨2023/8/5
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联合探针锚定聚合测序法检测胎儿染色体非整倍体效果评价
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨联合探针锚定聚合测序法(CPAS)检测胎儿染色体非整倍体的临床检测效果.方法 回顾性分析2018年5月—2021年12月用胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)试剂盒检测的高危孕妇临床数据,与金标准方法进行比对,通过灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、总符合率和一致性系数Kappa(K)值进行方法学评价.结果 14 837例有效孕妇数据中,共检出NIPT阳性44例(0.30%),其中T21阳性22例(0.15%),T18阳性15例(0.10%),T13阳性7例(0.05%).金标准结果中T21/T18/T13阳性共有24例(0.16%),其中T21阳性15例(0.10%),T18阳性7例(0.05%),T13阳性2例(0.01%).T21的灵敏度、特异度分别为100.00%、99.95%,T18的灵敏度、特异度分别为100%、99.95%,T13的灵敏度、特异度分别为100.00%、99.97%.结论 cPAS的NIPT集中筛查方法在高危人群中具有很高的稳定性,和之前的验证研究性能相当.
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编辑人员丨2023/8/5
