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基于宏基因组二代测序的儿童肺炎支原体耐药基因位点分析
编辑人员丨6天前
目的:通过宏基因组二代测序(mNGS)分析肺炎支原体(MP)耐药基因位点。方法:回顾性队列研究,分析2022年11月至2023年10月通过mNGS检测MP阳性的697份(686例)临床标本(包含痰液、肺泡灌洗液、血液)。根据标本送检科室分为重症监护病房(ICU)送检组和非ICU送检组,组间比较采用 χ2检验及Mann-Kendall趋势检验,分析MP耐药基因位点检出率差异及其随着时间的变化趋势。 结果:697份标本中ICU送检组164份、非ICU送检组533份。MP耐药基因位点检出率为44.3%(309/697),检出的MP耐药基因位点均为A2063G。697份标本中痰液、肺泡灌洗液、血液的MP耐药基因位点检出率分别为53.1%(34/64)、45.2%(263/582)、1/17。ICU送检组MP耐药基因位点检出率为50.0%(82/164),痰液、肺泡灌洗液、血液标本MP耐药基因位点检出率分别为75.0%(18/24)、48.4%(62/128)、1/5,痰液MP耐药基因位点检出率高于肺泡灌洗液( χ2=5.72, P=0.017)。非ICU送检组MP耐药基因位点检出率为42.6%(227/533),痰液、肺泡灌洗液MP耐药基因位点检出率分别为40.0%(16/40)、44.3%(201/454),血液标本未检出(0/12),肺泡灌洗液与痰液检出率比较差异无统计学意义( χ2=0.27, P=0.602)。2022年11月至2023年10月逐月统计总体送检标本( Z=3.99)、ICU送检组( Z=2.93)、非ICU送检组( Z=3.01)MP耐药基因位点的检出率均呈现上升趋势(均 P<0.01)。与MP共同检出的细菌中肺炎链球菌检出率最高,为15.5%(108/697),共同检出的病毒中EB病毒检出率最高,为17.6%(123/697)。 结论:2022年11月至2023年10月MP耐药基因位点检出率呈上升趋势。ICU送检中痰液标本耐药基因位点检出率较高。MP阳性检出的耐药基因位点均为A2063G,未检出新的耐药基因位点。
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编辑人员丨6天前
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儿童支原体肺炎并发器官功能障碍危险因素
编辑人员丨6天前
目的:分析总结儿童重症难治性支原体肺炎(severe refractory mycoplasma pneumoniae pneumonia, SRMPP)的临床特征,探讨其并发肺外器官功能障碍的危险因素。方法:回顾性总结2017年7月至2019年6月上海市儿童医院重症医学科收治的SRMPP的患儿临床资料,根据是否发生肺外脏器功能障碍分为肺外器官障碍组和单纯呼吸功能障碍组,比较两组临床特征与实验室指标的差异,Logistic回归筛选出发生肺外脏器功能障碍的危险因素。结果:两年间PICU合计收治SRMPP 107例,并发胸腔积液44例(41.1%),塑型性支气管17例(15.9%),支原体耐药基因位点(2063, 2064)阳性104例(97.2%),住院病死率2.8%(3/107)。107例SRMPP患儿发生肺外脏器功能障碍51例(47.7%),其中心血管功能障碍43例(40.2%)、凝血功能障碍13例(12.1%)、胃肠功能障碍11例(10.3%)、肾功能障碍4例(3.7%)、脑功能障碍4例(3.7%)、肝功能障碍3例(2.8%),多器官功能障碍综合征16例(15.0%)。与单纯呼吸功能障碍组相比,肺外脏器功能障碍组毛细血管渗漏综合征发生率高(52.9% vs. 17.9%, P<0.001),毛细血管渗漏指数上升[11.71(4.63, 27.07) vs. 5.78(2.07, 15.71), P=0.019],血白蛋白下降低[(32.2±5.6)g/L vs. (34.7±6.7)g/L, P=0.041],凝血酶原时间明显延长[12.7(11.7, 13.8)s vs. 12.0(11.4, 13.0)s, P=0.009]。Logistic回归结果显示发生毛细血管渗漏综合征( OR=0.278,95% CI 0.102~0.759, P=0.013)和凝血酶原时间延长( OR=1.443,95% CI 1.018~2.046, P=0.039)是SRMPP并发肺外脏器功能障碍的独立危险因素。 结论:儿童SRMPP约半数发生肺外脏器功能障碍,常见循环、凝血和胃肠障碍。发生毛细血管渗漏综合征及凝血酶原时间延长是SRMPP并发肺外脏器功能障碍的独立危险因素。
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编辑人员丨6天前
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肺炎支原体肺炎支气管肺泡灌洗液中23S rRNA耐药基因阳性患儿的临床及支气管镜下特点
编辑人员丨6天前
目的:探讨肺炎支原体肺炎支气管肺泡灌洗液(BALF)中23S rRNA耐药基因阳性患儿的临床及支气管镜下特点,发现能够早期识别肺炎支原体耐药性的临床指标。方法:回顾性分析中国医科大学附属盛京医院小儿呼吸内科2017年10月至2018年6月确诊为肺炎支原体肺炎的61例住院患儿的临床资料,对其进行纤维支气管镜检查,并留取BALF,检测BALF中23S rRNA V区基因的2063位点突变情况,分为耐药基因阳性组和耐药基因阴性组,比较不同组别患儿的临床表现、相关实验室数据、影像学资料、纤维支气管镜的镜下表现。采用 t检验、秩和检验、 χ2检验、 Fisher′ s确切概率法、多因素 Logistic回归分析等统计学方法对数据进行分析。 结果:61例患儿中耐药基因阳性组38例(62.30%),耐药基因阴性组23例(37.70%)。2组患儿性别及年龄差异均无统计学意义(均 P>0.05)。耐药基因阳性患儿的住院天数及发热时间长于耐药基因阴性组,更容易出现难治性肺炎支原体肺炎(RMPP)及肺外并发症,差异有统计学意义( P<0.05),低氧血症差异无统计学意义( P>0.05)。2组患儿白细胞(WBC)、C反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)、D-二聚体(D-D)、白细胞介素6(IL-6)比较差异均有统计学意义(均 P<0.05)。除耐药基因阳性组WBC水平低于耐药基因阴性组,其余实验室检查结果耐药基因阳性组均高于耐药基因阴性组;血清乳酸脱氢酶(LDH)及BALF中IL-6水平比较差异无统计学意义( P>0.05)。对几种有统计学意义的实验室指标进行 Logistic回归分析,发现WBC识别耐药基因的敏感性更高,最佳临界值为8.55×10 9/L,D-D识别耐药基因的特异性更高,最佳临界值为523 μg/L。耐药基因阳性组中35例(92.11%)影像学表现为大面积肺实变/肺不张,耐药基因阴性组为13例(56.52%),差异有统计学意义( P<0.05)。耐药基因阳性组主要表现为黏膜糜烂、坏死,痰栓/塑型性痰栓及支气管炎性狭窄[19例(50.00%)],耐药基因阴性组以黏膜纵行皱襞、絮状及黏性分泌物表现为主[14例(60.88%)],差异有统计学意义( P<0.05)。 结论:23S rRNA V区基因发生点突变与肺炎支原体肺炎患儿的临床特征密切相关,发生A2063G突变的患儿更容易发生RMPP及肺外并发症,影像学和支气管镜下表现更重。血液中WBC及D-D水平的高低对早期识别耐药性具有一定意义,耐药基因阳性的肺炎支原体肺炎引起的全身过度免疫炎症反应需要引起重视。
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编辑人员丨6天前
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肺炎支原体的感染治疗及对大环内酯类药物的耐药现状和机制
编辑人员丨6天前
肺炎支原体( Mycoplasma pneumoniae, Mp)是导致社区获得性肺炎的重要病原体。大环内酯类药物是治疗肺炎支原体肺炎( Mycoplasma pneumoniae pneumonia, MPP)的首选用药,对大环内酯类药物耐药的肺炎支原体(macrolide-resistant Mycoplasma pneumoniae, MRMP)引起的肺炎将考虑使用二线四环素类或喹诺酮类药物。MRMP的检出率在世界范围内急剧增加。来自国内外的数据表明,MRMP在亚洲地区如日本、中国、韩国等高度流行。 Mp耐药机制主要是23S rRNA Ⅴ区A2063G位点的突变,此外核糖体蛋白L4和L22基因突变、核糖体甲基化修饰以及外排泵的形成也是其耐药机制。本文系统归纳MPP治疗、 Mp对大环内酯类药物耐药的流行病学及其机制的研究进展。
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编辑人员丨6天前
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2016年至2019年北京住院儿童肺炎支原体感染流行病学特征和耐药性
编辑人员丨6天前
目的:研究2016年至2019年北京地区住院儿童肺炎支原体(MP)感染流行病学特征和耐药性,以期为儿童肺炎支原体肺炎(MPP)的防治提供依据。方法:回顾性分析2016年1月至2019年9月在北京儿童医院住院治疗的8 691例社区获得性肺炎患儿的临床资料,采用实时荧光核酸恒温扩增检测技术(SAT)试剂盒检测MP感染情况,采用MP核酸及耐药突变位点检测试剂盒(荧光PCR法)检测MP耐药情况。计数资料采用 χ2检验进行分析。 结果:8 691例行SAT检测的患儿中,MP总检出率为28.10%(2 442/8 691例)。2016年至2019年MP检出率分别为26.23%、31.36%、27.84%、26.57%,2017年检出率明显高于其他年份( χ2=16.11, P<0.05)。女性患儿MP检出率为29.65%(1 107/3 733例),明显高于男性患儿的26.93%(1 335/4 958例) ( χ2=7.85, P<0.05)。夏秋季MP检出率分别为32.21%(726/2 254例)、39.76%(852/2 143例),明显高于春冬季的17.00%(327/1 924例)、22.66%(537/2 370例)( χ2=315.15, P<0.001)。学龄前期和学龄期MP检出率分别为35.06%(732/2 088例)、37.71%(1 160/3 076例),明显高于婴儿期和幼儿期[11.20%(232/2 072例)、22.01%(318/1 445例)]( χ2=509.89, P<0.001)。1 524例行荧光PCR耐药基因检测的患儿中,1 386例发生耐药基因突变,耐药率为90.94%。2016年至2019年MP耐药率分别为88.19%、90.93%、90.56%和92.90%。MP耐药率不受性别、年龄和季节的影响。 结论:MP四季均可检出,以夏秋季检出率最高;女性患儿检出率高于男性患儿;MP检出率随年龄的增加逐渐升高,学龄前期和学龄期检出率较高;MP耐药率居高不降。
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编辑人员丨6天前
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肺炎支原体耐药在难治性肺炎支原体肺炎患儿发病中的作用
编辑人员丨6天前
目的:研究苏州地区肺炎支原体(MP)耐药情况,并试图说明MP耐药与难治性肺炎支原体肺炎(RMPP)之间的关系。方法:选取2013年10月至2014年9月在苏州大学附属儿童医院呼吸科确诊MPP而住院治疗的82例患儿,其中48例应用阿奇霉素治疗(10 mg/kg,1次/d,静脉滴注5~7 d),临床症状及胸部影像学仍持续进展,临床确诊为RMPP的患儿(RMPP组)作为试验组,另外34例应用大环内酯类抗生素(MA)治疗有效,确诊为普通肺炎支原体肺炎(GMPP)(GMPP组),从这些患儿气道分泌物中提取MP DNA,并对红霉素作用靶位MP 23S rRNA的2063和2064位点突变进行测序,并根据耐药基因测序结果将其分为MA耐药组(MRMP组)及MA敏感组(MSMP组)。比较2组患儿临床特点。结果:在MRMP组中,PMPP发生率为62.2%(46/74例),而MSMP组中,PMPP发生率为25.0%(2/8例),2组患儿耐药基因MP 23S rRNA点突变对RMPP的发生无显著影响( χ2=2.719, P=0.099)。相对于MRMP组,MSMP组患儿发热时间更短,糖皮质激素的应用更少。2组患儿在胸部影像学检查以及一些化验结果,如白细胞总数及分类、C反应蛋白(CRP)、丙氨酸转氨酶(ALT)、乳酸脱氢酶(LDH)和肌酸激酶同工酶(CK-MB)等方面差异均无统计学意义。 结论:MP肺炎发热持续超过1周,提示MP耐药的可能,MP对MA耐药并未加剧RMPP的发生。通过胸部影像学特征及检验结果方面的差异来判断MP是否耐药并不可靠。
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编辑人员丨6天前
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肺炎支原体肺炎患儿肺炎支原体基因分型及对大环内酯类抗生素耐药基因突变的分析
编辑人员丨6天前
目的:分析社区获得性肺炎(CAP)患儿肺炎支原体(MP)感染发生与基因分型以及大环内酯类耐药基因突变分型的流行病学特征,为儿童肺炎支原体肺炎(MPP)的防治提供依据。方法:检测佛山市三水区妇幼保健院2018年1月至2021年12月住院的620例CAP患儿MP感染情况,对MP阳性者行P1限制性片段长度多态性分析(P1-RFLP),分析阳性者及P1 Ⅰ型、P1 Ⅱ型在不同年份、性别、年龄、季节中分布的差异。检测MP对大环内酯类药物耐药基因突变情况,分析23SrRNA结构域A2063G、A2064G突变在不同年份、性别、年龄、季节中分布的差异。结果:620例CAP患儿中,198例MP阳性,感染率为31.94%。2018至2021年各年MP阳性率差异不大。女性感染率高于男性。MP感染率随年龄增长逐渐升高,以学龄前期、学龄期感染率最高。夏秋季感染率明显高于春冬季。198例患儿中,P1-RFLP分型P1-Ⅰ型157例(79.29%),P1-Ⅱ型41例(20.71%)。Ⅰ型、Ⅱ型在不同年份、性别、年龄、季节中分布差异不大。对其中143例患儿行大环内酯类药物耐药检测,其中125例出现耐药,总体耐药率为87.41%。125例耐药基因突变患儿中,A2063G突变66例(52.80%),A2064G突变53例(42.40%)。耐药基因突变率及两型突变位点在不同年份、性别、年龄、季节之间分布差异不大。结论:本院儿童CAP中MP感染率为31.94%,以女性较为常见,以学龄前期、学龄期感染率最高,夏秋季为高发季节。P1-RFLP分型不受年度、性别、年龄、季节的影响。儿童MP耐药基因突变率居高不降,耐药基因突变分型不受年度、性别、年龄、季节的影响。
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编辑人员丨6天前
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RNA与DNA检测方法在肺炎支原体感染诊断中的应用比较
编辑人员丨6天前
目的:比较RNA与DNA核酸检测方法在肺炎支原体(MP)感染早期诊断及疗效监测中的应用价值。方法:收集2018年1月至12月在首都儿科研究所附属儿童医院呼吸内科住院肺炎患儿的呼吸道标本。采用MP核酸及耐药突变位点检测试剂盒进行DNA检测,采用MP核酸检测试剂盒进行RNA检测。结果:进行MP-DNA检测的1 994例标本中,阳性检出率为42.1%(840/1 994例),其中96.0%(806/840例)的MP阳性标本存在大环内酯类耐药基因突变。进行MP-RNA检测的1 624例标本中,阳性检出率为33.9%(551/1 624例)。758例标本同时进行了MP-DNA与MP-RNA检测,MP-DNA检测的阳性率为43.1%(327/758例),MP-RNA检测的阳性率为36.7%(278/758例),差异有统计学意义( χ2=6.60, P=0.01)。2种检测方法有613例(80.9%,613/758例)标本的检测结果是一致的,Kappa值为0.604。MP-DNA检测阳性的患儿,1周后复查,MP-DNA转阴率为36.1%(22/91例);MP-RNA检测为阳性的患儿复查,MP-RNA转阴率为70.1%(47/67例),差异有统计学意义( χ2=33.20, P<0.01)。 结论:2018年北京地区MP阳性检出率依然处于较高水平。MP-DNA与MP-RNA检测方法的检测结果具有较好的一致性,但MP-RNA检测方法更适用于MP感染的早期诊断,可以监测MP转归及药物疗效。
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编辑人员丨6天前
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儿童难治性肺炎支原体肺炎的早期临床特点及相关危险因素
编辑人员丨1个月前
目的 分析总结儿童难治性肺炎支原体肺炎(refractory Mycoplasma pneumoniae pneumonia,RMPP)的早期临床特征,并探讨其相关危险因素.方法 回顾性分析2020-2023年在武汉儿童医院重症医学科住院的518例肺炎支原体肺炎患儿的临床资料,根据病情严重程度和治疗情况,将其分为RMPP组(127例)和普通组(391例),比较2组患儿临床特征和相关实验室指标的差异,logistic回归筛选出难治性肺炎支原体肺炎的相关危险因素.结果 2组患儿性别、体质量、发病季节及个人或家族过敏史比较,差异无统计学意义(P>0.05),按照年龄分组,婴幼儿组(<3岁)RMPP发病率(18.92%)低于学龄前组(3~6岁,47.88%)和学龄组(>6岁,33.20%)(P<0.05),学龄前组与学龄组比较,差异无统计学意义.RMPP组患儿发生高热的概率、发热持续时间、大环内酯类药物使用时间均高于普通组(P<0.05),2组患儿气促、腹泻、惊厥、皮疹的发生率比较,差异有统计学意义(P<0.05).RMPP组患儿白细胞计数、C反应蛋白、降钙素原、乳酸、尿素氮、丙氨酸转氨酶、D-二聚体、白细胞介素-6水平均高于普通组,差异有统计学意义(P<0.001).普通组患儿有308例患儿完成支原体DNA检测,支原体耐药位点阳性率为57.47%(177/308),明显低于RMPP组(76.38%,97/127),差异有统计学意义(P<0.001).RMPP组患儿合并细菌病毒混合感染率(59.84%)高于普通组(P<0.001).RMPP组患儿肺实变、肺不张、胸腔积液的病例数均高于普通组(P<0.001).多因素logistic回归分析显示,发热持续时间、细菌合并病毒感染、支原体耐药基因位点阳性与RMPP的发生具有独立相关性.结论 RMPP以3岁以上儿童为主,多发于秋冬季,其早期临床症状并不典型,患儿如使用大环内酯类药物后发热持续不退、存在细菌合并病毒感染或出现肺外并发症(腹泻、惊厥、皮疹),临床医生需高度警惕RMPP的发生,建议尽早完善支原体耐药基因位点检测,有助于早期识别RMPP.
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编辑人员丨1个月前
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2015上半年与2016上半年儿童肺炎支原体感染流行及分子特征分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 通过比较北京部分地区2015年1—6月间与2016年1—6月间儿童肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,Mp)的阳性检出率及其分子流行特征,获得2015年下半年Mp阳性检出率升高前后两个不同时间Mp感染的流行规律及特征.方法 选取2015年1月至6月及2016年1月至6月首都儿科研究所附属儿童医院呼吸道感染住院患儿呼吸道标本,提取上述标本中病原体DNA后采用real-time PCR法进行Mp repMp1基因检测;阳性标本分别进行改良的多位点可变数目串联重复序列分析[multiple-locus variable-number tandem-repeat(VNTR) analysis,MLVA]及限制性片段长度多态性分析(restriction fragment length polymorphism analysis,P1-RFLP),同时对标本的23S rRNA耐药突变位点进行检测.结果 2015年1—6月间271例肺炎患儿中,50例(18.5%) 经 real-time PCR检测为Mp阳性,2016年1—6月间283例肺炎患儿中,99例(35%) 经real-time PCR检测为Mp阳性;2015年1—6月间50例Mp阳性标本中48例为M4-5-7-2/P1型,仅有2例为M3-5-6-2/P2型,大环内酯类耐药基因突变率为92%(46/50),2016年1—6月间99例Mp阳性标本中82例为M4-5-7-2/P1型,2例为M4-5-7-3/P1型,15例为M3-5-6-2/P2型,大环内酯类耐药率为83.8%(83/99).结论在2015年下半年Mp阳性检出率出现升高趋势后,2016年1—6月间与2015年同期相比,Mp的阳性检出率持续升高;同时M4-5-7-2/P1基因型比例降低,M3-5-6-2/P2基因型升高;大环内酯类耐药基因突变率较前期相比有所下降.
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编辑人员丨2023/8/6
