目的:比较限制性抗原亲和力酶联免疫法（LAg-Avidity EIA）和集合核酸法评估MSM的HIV-1新发感染率的可行性 。方法:对2016-2017年云南省13个州（市）MSM哨点监测采用滚雪球方法采集样本进行HIV-1抗体检测，确证阳性样本进行LAg-Avidity EIA检测，HIV-1抗体阴性样本进行集合核酸法检测，分别采用LAg-Avidity EIA新发感染算法和集合核酸法检测新发感染算法计算HIV-1新发感染率，并进行结果的比较。结果:研究样本共计5 363份，其中HIV-1抗体阳性样本407份（含既往阳性177份），HIV-1抗体阴性样本4 956份，完成LAg-Avidity EIA检测211份（91.7%），判为新近感染69份；完成集合核酸法检测4 469份，判定为HIV-1感染窗口期8份。LAg-Avidity EIA估算的2016年和2017年HIV-1新发感染率分别为3.36%和4.84%，集合核酸法估算的HIV-1新发感染率分别为3.27%和3.02%，2种方法估算的HIV-1新发感染率差异无统计学意义。结论:LAg-Avidity EIA和集合核酸法估算得到2016-2017年云南省哨点MSM HIV-1新发感染率一致性较好，2种方法用于HIV-1新发感染率的连续监测会有较好的稳定性。

目的:基于生物信息学分析及机器学习探讨主动脉瓣狭窄(AS)与免疫-血管生成相关基因及治疗靶点。方法:从基因表达综合数据库(GEO)、ImmPort数据库、Genecards数据库和MsigDB获得AS与免疫-血管生成相关的差异表达基因，并对其进行基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析，使用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析。对差异表达基因进行最小绝对值收敛和选择算子(LASSO)回归法和支持向量机递归特征消除(SVM-PFE)机器学习，进一步筛选生物标志物，并通过受试者工作特征曲线(ROC)检验其对AS的诊断性能，并进行基因集合富集分析(GSEA)，使用CIBERSORT进行免疫细胞浸润分析。基于starBase、miRDB、miRWalk以及hTFtarget数据库，构建信使核糖核酸-微小核糖核酸-转录因子(mRNA-miRNA-TF)调控网络。通过CTD数据库获得潜在治疗靶点、构建基因-药物网络。结果:筛选到差异表达基因90个，富集分析发现差异基因主要参与了"白细胞迁移"、"细胞趋化"、"细胞因子-细胞因子受体相互作用"等影响免疫调节、细胞周期调控等生物学过程。PPI分析获取84个相关蛋白及548个互作关系。通过机器学习最终筛选出两个关键生物标记物：分泌粒蛋白2(SCG2)、韧黏素-C(TNC)，且对AS具有较好的诊断能力。免疫细胞浸润分析发现巨噬细胞M0在AS组中的浸润水平显著高于对照组，且巨噬细胞M0与M2与SCG2相关性最高。此外，还获得879个mRNA-miRNA-TF调控关系对，253个潜在治疗药物靶点及299个作用关系。结论:筛选出与AS密切相关的免疫-血管生成相关基因及其生物学途径、免疫特征以及治疗靶点，对AS发病机制的探讨、治疗新策略的挖掘具有重要意义。

目的 应用艾滋病病毒(HIV)核酸检测技术,对男男性行为者(MSM)中HIV初筛检测阳性,蛋白印迹试验(WB)确证结果为不确定者和HIV初筛检测阴性者进行筛查,及时诊断MSM中的HIV急性期感染者,尽快启动抗病毒治疗,探索我国MSM中HIV急性期感染筛查诊断和治疗的工作模式.方法 2015年7月至201 6年6月,通过方便样本的招募方式,选取天津地区的MSM 2 000人,同时使用艾滋病第三代和第四代快速检测试剂进行平行检测,阴性样本统一进行集合核酸(HIV Pooled PCR)检测,对酶联免疫吸附试验(ELISA)结果为阴性、WB检测结果为阴性和不确定者接受扩增核酸检测(NAAT),结果为阳性者且检测值≤1 000拷贝/mL,进行1-2周随访,并在随后接受核酸和WB检测,阳性检测者检测值＞1 000拷贝/mL,则重复扩增核酸检测步骤,并最终按照检测结果判定HIV急性期感染者.结果 共招募符合条件的调查对象1 914人,第三代和第四代快速检测试剂同时检测出阳性73人.4例WB不确定结果样本经过两次NAAT检测被诊断为HIV感染.通过集合核酸检测发现3例结果为阳性的样本.共6例HIV急性期样本接受抗病毒治疗,6例接受治疗样本的病毒载量分别降至46拷贝/mL、230拷贝/mL、72拷贝/mL、＜20拷贝/mL、622拷贝/mL和48拷贝/mL.结论 使用第三代快速检测试剂开展HIV急性期检测工作仍具有较大实际意义和可行性,同时在日常HIV检测工作中应充分重视和发挥核酸检测,减少MSM在HIV检测过程中,从其WB确证结果不确定到随访至其WB检测结果阳性中间传播HIV的风险.

目的:预测miR-130b-3p靶基因,并对靶基因的分子功能、生物学进程和信号通路进行富集分析,为深入研究糖尿病肾病相关miR-130b-3p的靶基因功能提供理论基础.方法:通过NCBI和miRbase数据库检索基因.应用Vector NTI软件进行miR-130b-3p序列分析,应用TargetScan,picTar,RNA22,PITA和miRanda软件预测靶基因,通过DAVID和KEGG数据库进行靶基因功能与信号通路富集分析.结果:已知成熟的不同物种miR-130b-3p核酸序列高度保守.靶基因主要富集在核质和细胞溶质,分子功能主要富集在蛋白绑定和转录因子激活.经典的miR-130b-3p靶基因集合明显富集于KEGG数据库中的TGF-β、AMPK和内吞作用等7个信号转导通路.疾病富集分析与糖尿病高度相关.结论:成功预测miR-130b-3p靶基因,部分靶基因参与的功能及信号通路与糖尿病肾病发生发展过程密切相关.

目的 了解天津市MSM人群HIV-1急性期感染的免疫学与病毒学特征,分析不同检测方法对HIV-1急性期感染样本检出情况.方法 2015年10月至2016年10月依托MSM人群志愿者工作组招募MSM,快速法进行HW抗体初筛,初筛阳性样品进一步复检和确证,阴性样品进行HIV-1 RNA集合核酸检测,核酸结果阳性者重新采样测定病毒载量和CD4+T淋巴细胞/CD8+T淋巴细胞计数(CD4/CD8),抗体初筛阴性且两次核酸结果均为阳性者判定为HIV-1急性期感染.采用HIV四代ELISA试剂和P24 ELISA试剂对首次采集的HIV-1急性期感染样本进行检测,比较2种方法检出效果.结果 共招募和调查MSM 3 016例,HIV抗体快速检测阳性193例,确证阳性179例.HIV抗体快速检测阴性2 823例,核酸检测发现17例为HIV-1急性期感染.研究对象HIV-1感染率为6.53％(197/3 016),HIV-1急性期感染率为0.56％(17/3 016).病毒载量为(5.63±1.50) log10拷贝数/ml,CD4为(442.82±268.17)个/μl,CD8为(1 069.65±668.22)个/μl,CD4/CD8比值为(0.49±0.25),HIV-1急性期感染者与慢性期感染者相比,病毒载量、CD4和CD4/CD8比值的差异均有统计学意义(U=148,P＜0.01、U=272,P=0.042和t=3.147,P=0.005),人口学特征仅有职业的差异有统计学意义(x2=11.016,P=0.026).HIV-1急性期感染检测试剂的灵敏度比较,P24 ELISA试剂高于四代ELISA试剂(Fisher精确概率法,P=0.017).结论 MSM人群HW-1急性期感染风险较高,采用P24 ELISA试剂可提高HIV-1急性期感染的检测灵敏度.加强HIV核酸检测是提高感染发现的重要途径.

目的 研究HIV-1 DNA定量检测用于改良集合核酸筛查的可行性.方法 建立荧光定量PCR检测HIV-1DNA的检测技术方法,选取来自深圳市各社区咨询检测点新报告HIV-1抗体阳性者和阴性者血样,从检测样本量、保存条件等方面进行分组研究,寻找确保检出率的基本条件.在此基础上,结合病毒核酸浓缩,确定改良集合检测方案,并对自制的阴性、阳性外部质控品进行检测分析.结果 超敏HIV-1 DNA检测技术在应用于不同病毒载量样本时,全血单次用量200μl/反应实现了全部检出,而100μl以下单次用量在低载量组血样中开始出现少量漏检;血样在室温3d、4℃7d、-20℃4周以内,以及-20℃保存冻融3次以内,均未对超敏HIV-1 DNA定性/定量结果产生明显影响;本实验中通过改良集合核酸检测方案,对所有阳性质控品的检出率达100.0％,而对照组的一级集合样本检出率仅为86.3％(69/80).结论 经过病毒核酸浓缩及超敏HIV-1 DNA检测改良后的集合核酸检测方案可用于人群筛查.

目的 解决新冠病毒感染核酸检测过程中,工作流程复杂、需对被采样人进行手工登记且无法对全流程闭环管理等问题.方法 本文提出了全流程核酸检测管理服务信息系统,该系统集合了预约登记、采样、送检、接收、检测和结果呈现等功能,能够全流程监管核酸采样的每个环节,且系统使用开放式架构,前后端分离保障了各个服务互不影响.结果 系统通过了压力测试表明业务运行平稳,各服务器硬件资源使用率在合理范围,能够对核酸检测工作进行全流程信息化管理.结论 全流程核酸检测管理服务信息系统在17个省进行了部署应用,在应对大规模检测时取得了良好的效果,为疫情防控作出了有力保障.

目的 研究探讨Pooling PCR技术诊断识别病程早期(急性感染期)艾滋病病毒感染者的能力,并评估该方法 是否经济可行、是否可以在部分人群的艾滋病病毒感染状态的诊断中取代艾滋病抗体检测方法.方法收集4家医疗机构留存的4类人群的HIV抗体阴性血样,对血样进行Pooling PCR法检测,并计算人均检测成本.结果 男男同性恋人群HIV核酸阳性率为554.27/万,性病门诊就诊者人群次之,为不低于119.13/万,体检人群没有发现HIV核酸阳性;医疗机构1(结核病防治机构)的其他就诊者人群核酸阳性率(≥85.54/万)要高于医疗机构2的其他就诊者人群(≥21.04/万).4个医疗卫生机构所留存的4类人群的抗体检测阴性样本中有2类人群检出HIV病毒核酸阳性,共检出病程早期(HIV抗体阴性,但核酸阳性)样本3例,其中男男同性恋人群检出2例、性病门诊就诊者人群检出1例.结论 Pooling PCR检测技术方法敏感且经济,适合于在男男同性恋、性病门诊就诊者及结核病病人等HIV高危人群/高度可疑病人中发现病程早期HIV病毒感染者.