眼表直接暴露在外部环境中，容易受到各种抗原和病原体的影响，眼表微生物群参与免疫耐受、代谢和上皮屏障功能的调节。微生物组成在维持健康和疾病发生中都起着重要作用，微生物分布失衡可能导致某些疾病的发生。体内微生物的组成主要是细菌。在微生物组学研究中，最初主要集中在胃肠道、口腔、鼻腔、皮肤和泌尿生殖道5个部位。随着16S核糖体核糖核酸基因(16SrRNA)高通量测序及宏基因测序分子生物学检测技术的发展，眼表细菌群落与疾病的关系成为研究热点。眼表不同部位细菌群落的分布有一定差异，菌群存在也具有垂直分布的特点。年龄、性别、地理环境等因素对眼表菌群的组成和功能有一定影响，眼局部重复使用抗生素可增加眼表的耐药菌群。不同类型的干眼、角膜炎、睑缘炎等眼表疾病与眼表菌群的改变有一定关系。本文主要就正常眼表菌群的组成、分布、影响因素及眼表菌群与干眼、角膜炎、睑缘炎等眼表疾病的关系进行综述，以期为眼表疾病发生机制的研究提供新的认识，同时为眼表疾病的治疗提供指导依据。

目的:探索尘肺病患者及接尘者下呼吸道菌群组成，进一步比较分析两者菌群差异及菌群间的关联。方法:于2020年5月至2021年1月，通过前瞻性多中心横断面研究，选取同期就诊于联勤保障部队第九二〇医院呼吸与危重症医学科和昆明市同仁医院呼吸内科，行支气管肺泡灌洗治疗的尘肺病患者及接尘者人群。共纳入24例尘肺病患者（尘肺病组），以16例接尘者（接尘组）为对照，收集2组患者肺泡灌洗液，利用16SrRNA基因V3-V4测序技术及生物信息分析平台，测定并分析其微生物结构组成差异及菌群间的关联。结果:与接尘组比较，尘肺病组患者肺泡灌洗液门水平菌群丰度排名前5的菌门相同，依次为：变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、梭杆菌门、放线菌门。与接尘组比较，尘肺病组患者属水平菌群丰度排名前5的菌属不同，接尘组分别为：假单胞菌属、普氏菌属、链球菌属、无色杆菌属、奈瑟氏菌属，尘肺病组分别为：假单胞菌属、无色杆菌属、链球菌属、罗尔斯通菌属、普氏菌属。Alpha多样性分析结果显示，与接尘组比较，尘肺病组患者菌群多样性有差异（ P<0.05），菌群均匀度差异无统计学意义（ P>0.05）；β多样性显示，两组间菌群结构差异有统计学意义（ P<0.05）。单因素菌群关联网络分析示，在尘肺病组及接尘组厚壁菌门和拟杆菌门与其他物种之间相关性较高，呈正相关；变形菌门与其他物种之间相关性较高，呈负相关。 结论:尘肺病患者及接尘者下呼吸道菌群结构及相对丰度不同，尘肺病患者下呼吸道菌群多样性增加，差异可能与疾病状态有关。

目的:探讨老年与中青年食管鳞癌（esophageal squamous cell carcinoma， ESCC）患者食管组织的菌群特征及差异，以助于研究老年ESCC患者潜在的生物标志物。方法:采用回顾性研究，选取2018年7月至2019年7月在湖北省十堰市太和医院确诊的72例ESCC患者，其中老年组49例（≥60岁，男性40例，女性9例），中青年组23例（<60岁，男性21例，女性2例），以同期消化内镜中心20名胃镜检查无异常的健康体检者作为对照组（年龄范围35~78岁，中位年龄57岁，男性16名，女性4名）。收集ESCC患者病变食管组织和健康对照组中段食管组织、提取基因组DNA，对细菌16SrRNA基因序列V4高变区扩增，采用Illumina HiSeq测序技术，对比分析老年和中青年ESCC患者菌群特点。采用QIIME和Rstudio软件分析序列数据，统计学方法采用非参数Kruskal-Wallis检验或Wilcoxon秩和检验。结果:两组患者菌群Shannon指数［5.17（4.53，5.95）比4.79（3.74，5.97）］、Simpson指数［0.94（0.91，0.96）比0.92（0.83，0.96）］和Chao1 ［343.55（259.76，570.59）比329.16（268.88，648.00）］指数相似，差异无统计学意义（ Z=-0.791、-1.057、-0.380，均 P>0.05）；Beta多样性老年组与中青年组亦无明显差异（PC1=19.14%、PC2=6.95%， PPC1=0.67、 PPC2=0.42）。在门水平，中青年组丰度前五的菌门依次为厚壁菌门（ Firmicutes）、拟杆菌门（ Bacteroidetes）、变形菌门（ Proteobacteria）、放线菌门（ Actinobacteria）和梭杆菌门（ Fusobacteria），老年组患者丰度最高的五个门分别是厚壁菌门（ Firmicutes）、拟杆菌门（ Bacteroidetes）、变形菌门（ Proteobacteria）、梭杆菌门（ Fusobacteria）和放线菌门（ Actinobacteria）；两组差异显著的是梭杆菌门（ Fusobacteria）（ Q=0.596， P<0.05）。在属水平，中青年组丰度前五的菌属依次为：普雷沃菌属（ Prevotella）、拟杆菌属（ Bacteroides）、链球菌属（ Streptococcus）、月形单胞菌属（ Selenomonas）和韦荣球菌属（ Veillonella）；而老年组丰度前五的分别是普雷沃菌属（ Prevotella）、拟杆菌属（ Bacteroides）、链球菌属（ Streptococcus）、月形单胞菌属（ Selenomonas）和嗜血杆菌属（ Haemophilus），两组有显著差异的为梭杆菌属（ Fusobacterium）（ Q=0.938， P<0.05）。基于未观测状态重建的群落系统发育研究（PICRUSt）功能预测，老年组患者氨酰tRNA生物合成（ Aminoacyl.tRNA.biosynthesis）、核苷酸切除修复（ Nucleotide.excision.repair）、核糖核酸聚合酶（ RNA.polymerase）、核糖体（ Ribosome）、克拉维酸生物合成（ Clavulanic.acid.biosynthesis）、光合作用（ Photosynthesis）和光合作用蛋白（ Photosynthesis.proteins）丰度较中青年组降低（均 Q=0.734， P<0.05）。 结论:老年ESCC患者食管菌群与中青年患者的Alpha多样性和Beta多样性无明显差异，但老年患者梭菌属菌群丰度增高。

目的:探讨女性泌尿道宿主、环境、微生物菌群间的关系及宿主反应性变化，证明泌尿道存在特征性菌群；探讨菌群变化与尿路感染的关系，对尿路感染诊疗产生观念性改变。方法:临床资料收集于2018年2月至2018年3月期间，应用16SrRNA基因测序对健康绝经后(A组，5例)、健康育龄期(B组，5例)及尿路感染的绝经后女性(C组，14例)尿液进行菌群测定，分析泌尿道菌群结构和组成的多样性及差异性。结果:女性尿液中包含种类繁多的微生物菌群，构成多样化，个体差异明显，一般以一种或两种菌种占优势，健康育龄期、绝经后女性组优势菌种主要为乳酸杆菌属、加德纳菌属及鞘氨醇单胞菌属，而鞘氨醇单胞菌属在尿路感染绝经后女性组丰度则明显下降；同时，尿路感染组优势菌群主要为肠杆菌科及乳酸杆菌属，且肠杆菌科丰度明显高于另外两组；而乳酸杆菌属丰度水平在健康育龄期组则明显高于绝经后两组。结论:女性泌尿道菌群以乳酸杆菌属为优势菌，绝经后尿路感染女性泌尿道菌群表现为乳酸杆菌属、鞘氨醇单胞菌属显著减少及肠杆菌科丰度增加，提示这可能是引起绝经后妇女尿路感染发病率升高的重要原因，为诊断尿路感染及非抗菌素手段治疗尿路感染提供思路。

目的 探讨幽门螺杆菌对四环素的耐药性,对四环素耐药菌株进行耐药基因突变位点分析,为临床根除幽门螺杆菌选择敏感抗生素以及为患者个体化治疗提供参考.方法 分离培养胃黏膜组织中的幽门螺杆菌,采用琼脂稀释法进行幽门螺杆菌四环素药物敏感性检测,聚合酶链反应(PCR)法扩增四环素耐药菌株的16S rRNA基因,测序并对其基因突变位点进行分析.结果 成功分离幽门螺杆菌82株,四环素耐药菌株5株,耐药率为6％.本地区幽门螺杆菌的四环素耐药基因为AGA926-928CGA的单碱基突变,另外2株耐药菌株分别发生了 G970A的突变及A1119G的突变.结论 本地区幽门螺杆菌临床菌株四环素耐药率较低.16S rRNA基因中的A926C突变与幽门螺杆菌对四环素耐药有关.

目的 探究重性抑郁症(major depressive disorder,MDD)患者肠道菌群特征,并分析其与炎症因子和汉密尔顿24项抑郁评定量表(Hamilton depression scale-24,HAMD-24))评分的相关性.方法 研究共纳入符合纳入、排出标准的首发未治疗的MDD患者58例以及性别、年龄与之匹配的健康对照者(healthy controls,HCs)50例.采用HAMD-24评估所有受试者的抑郁症状严重程度,采用16SrRNA基因测序法评估肠道菌群的组成.使用酶联免疫吸附试验检测外周血中C反应蛋白(C-reactive protein,CRP)、白细胞介素-1β、白细胞介素-6及肿瘤坏死因子-α水平,采用Spearman相关性分析评估肠道菌群与炎症因子和HAMD-24评分的相关性.结果 MDD组的CRP水平显著高于HC组(t=8.353,P＜0.050).Alpha多样性分析(Shannon指数、Simpson指数及Pielou指数)显示MDD组和HC组的肠道菌群差异有统计学意义(H=8.529、8.893、10.825,均P＜0.050),beta多样性分析显示两组菌群分布差异有统计学意义(F=3.997,P＜0.050).进一步线性判别分析发现,在属水平上,MDD组的双歧杆菌属、布劳特菌属、粪球菌属、巨单胞菌属及Dorea相对丰度较高,HC组的拟杆菌属、粪杆菌属、罗氏菌属及小杆菌属相对丰度较高.Spearman相关性分析结果显示布劳特菌属和粪球菌属与CRP和HAMD-24评分呈正相关(r=0.258、0.284、0.235,0.262,均P＜0.050),粪杆菌属和罗氏菌属与CRP呈负相关(r=-2.030、-0.221,均P＜0.050).结论 MDD患者的肠道菌群发生改变,血浆CRP水平升高,且发生改变的肠道菌群与血浆CRP水平和HAMD-24评分密切相关.

目的 探究壮宣饮通过调节p38 丝裂原活化蛋白激酶(p38 mitogen-activated protein kinase,p38 MAPK)信号介导的肠道菌群治疗小儿甲型流感病毒H1N1 肺炎的机制.方法 取BALB/c小鼠采用H1N1 流感病毒尿囊液滴鼻法制备 H1N1 肺炎小鼠模型,随机分为 5 组:模型组,壮宣饮低、中、高剂量组,壮宣饮高剂量(28.66 g·kg-1)+茴香霉素(10 mg·kg-1)组.对照组采用同法滴入等体积无菌生理盐水.使用壮宣饮和茴香霉素分组处理后,测定各组小鼠肺系数并以HE染色检测其肺与大肠组织病理形态;以 16SrRNA基因测序检测各组小鼠肠道菌群结构差异改变;以酶联免疫吸附法(ELASA)测定各组小鼠肺泡灌洗液(BALF)及大肠组织中炎症因子肿瘤坏死因子α(TNF-α)、白细胞介素(IL)-4、IL-6、IL-1β水平;以蛋白免疫印迹法检测各组小鼠肺与大肠组织中p38 MAPK通路相关蛋白表达.结果 与对照组比较,模型组小鼠肺与大肠组织发生明显病理损伤,肺系数,肺与大肠病理评分,ACE指数,Shannon指数,梭菌目丰度,肺泡灌洗液与大肠组织中TNF-α、IL-4、IL-6、IL-1β水平,肺与大肠组织p-p38 MAPK/p38 MAPK水平均升高(P＜0.05);拟杆菌目丰度降低(P＜0.05).与模型组比较,壮宣饮低、中、高剂量组小鼠肺与大肠组织病理损伤均减轻,肺系数,肺与大肠病理评分,ACE指数,Shannon指数,梭菌目丰度,肺泡灌洗液与大肠组织TNF-α、IL-4、IL-6、IL-1β水平,肺与大肠组织p-p38 MAPK/p38 MAPK水平均降低(P＜0.05),且均呈剂量依赖性(P＜0.05).拟杆菌目丰度均升高(P＜0.05),与壮宣饮高剂量组比较,壮宣饮高剂量+茴香霉素组小鼠肺与大肠组织病理损伤加重,肺系数,肺与大肠病理评分,ACE指数,Shannon指数,梭菌目丰度,肺泡灌洗液与大肠组织TNF-α、IL-4、IL-6、IL-1β水平,肺与大肠组织p-p38 MAPK/p38 MAPK水平均升高(P＜0.05);拟杆菌目丰度降低(P＜0.05).结论 壮宣饮可通过抑制p38 MAPK信号激活而改善H1N1 肺炎小鼠肠道菌群失衡,从而抑制小鼠炎症并减轻其肺与大肠组织损伤,对小儿H1N1 肺炎起到治疗作用.

目的 探究长期适量饮酒对大鼠血脂、肝脏和肠道菌群的影响.方法 40只雄性SD大鼠(SPF级,200～220g)按体重随机分为对照组、白酒组、葡萄酒组、黄酒组和酒基组,每组8只,分别灌胃蒸馏水、白酒、葡萄酒、黄酒和酒基,连续灌胃90d.采用全自动生化分析仪检测大鼠血清总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)及血糖(Glu)水平,HE染色观察肝脏病理变化,16SrRNA基因测序分析各组肠道菌群变化.结果 实验周期内,适量饮酒未增加大鼠体重与各脏器质量,未显著升高大鼠血清Glu、TG和TC水平.病理分析显示适量饮酒可引起肝组织结构异常与肝细胞脂肪变性.长期适量饮酒可增加芽胞杆菌门(Bacillota)的梭菌属(Clostridium_Ⅺ Ⅴ a)、颤杆菌属(Oscillibacter)、Flavonifractor、罗斯菌属(Roseburia)及拟杆菌门(Bacteroidota)的普雷沃菌属(Prevotella)、拟杆菌属(Bacteroides)相对丰度,降低乳杆菌属(Lactobacillus)、优杆菌属(Eubacterium)及瘤胃球菌属(Ru-minococcus)相对丰度.结论 长期适量饮酒会引发肝脏轻度炎症,肠道菌群有益菌丰度降低,条件致病菌丰度升高,进而影响机体健康.

目的 探究台湾乳杆菌Lt259对非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)大鼠肝脏的保护作用以及肠道菌群的影响.方法 通过溶血、明胶酶活性及抗生素敏感性实验评价Lt259的安全性;通过疏水性、自聚集实验评价其肠道定植能力;通过喂食高脂饲料构建大鼠NAFLD模型,灌胃Lt259菌悬液干预8周后,观察大鼠肝脏的病理变化,检测大鼠血脂水平、血清促炎因子及内毒素水平;采用16SrRNA基因高通量测序检测肠道菌群.结果 Lt259无溶血、明胶酶活性,对所测抗生素均敏感,其疏水性与自聚集结果分别为67.00％±5.77％和63.33％±5.77％.Lt259干预改善了 NAFLD大鼠肝脏损伤以及肝功水平(P＜0.01);显著降低了 NAFLD大鼠血脂、促炎因子及内毒素浓度(P＜0.05);改善了 NAFLD大鼠肠道菌群结构,降低了变形菌门相对丰度(P＜0.05),提高了酪氨酸菌属、经黏液真杆菌属、拉克氏梭状芽孢杆菌属及阿克曼菌属等益生菌属丰度,降低了嗜胆菌属等有害菌属丰度.结论 台湾乳杆菌Lt259具有改善NAFLD大鼠肝脏病理改变、脂质沉积、炎症损伤的功效,其机制可能与改善肠道菌群紊乱、提升益生菌丰度有关.

沙漠土壤蕴藏丰富的放线菌资源,尤其是稀有放线菌类群,是挖掘新放线菌资源的理想生境.本研究开展库姆塔格沙漠可培养放线菌抑菌活性筛选,以期为该地区放线菌资源开发和利用提供菌株资源.根据分离菌株的16S rRNA基因序列分析放线菌多样性;从库姆塔格沙漠4份土样中分离纯化到370株放线菌,分布于11个目12个科的22个属,其中链霉菌属和糖丝菌属为优势菌属,分别占分离放线菌菌株的63％和13.8％.对14株放线菌潜在新种(16S rRNA基因序列相似性低于98.65％)进行高氏一号、ISP2、TSB培养基液体发酵,获得提取浓缩物样品进行抑菌活性筛选,发现11株潜在新种的发酵产物有广谱抗菌活性.本研究表明,库姆塔格沙漠中含有丰富的放线菌资源,具有从中发现放线菌新菌种和抗生素的潜力.