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lncRNA MIR210HG在子痫前期胎盘组织中的表达及其功能分析
编辑人员丨1周前
目的:研究子痫前期(PE)产妇胎盘组织中长链非编码RNA(lncRNA)的差异表达及其中之一MIR210HG对绒毛膜滋养层细胞系HTR8/SVneo细胞生物学特性的影响,并对MIR210HG进行功能分析。方法:选取2018年7月至2019年7月青岛大学附属医院收治的PE产妇39例(PE组)和同期正常妊娠产妇39例(对照组)。(1)采用转录组测序(RNA-seq)技术分析两组产妇胎盘组织中差异表达的lncRNA;实时荧光定量PCR技术方法检测两组产妇胎盘组织中差异表达的lncRNA之一MIR210HG的表达水平,并分析MIR210HG表达水平与收缩压、舒张压和新生儿出生体重的相关性。(2)构建小分子干扰RNA(siRNA),转染HTR8/SVneo细胞以敲低MIR210HG的表达,实验分为两组,即MIR210HG敲低(KD)组(HTR8/SVneo细胞转染siRNA敲低了MIR210HG的表达)和阴性对照(NC)组(HTR8/SVneo细胞转染NC siRNA),采用活细胞计数(CCK-8)法、穿膜小室(transwell小室)体外实验检测两组HTR8/SVneo细胞增殖和迁移能力的变化。(3)采用RNA相互作用百科全书(ENCORI)数据库预测与MIR210HG相互作用的RNA,并采用基因本体(GO)功能注释、京都基因和基因组百科全书(KEGG)和BioCarta通路富集方法对MIR210HG的功能进行分析。结果:(1)RNA-seq技术共检测出显著差异表达的lncRNA 26个,其中表达上调21个、下调5个。MIR210HG在PE组产妇胎盘组织中的表达水平显著高于对照组(分别为9.30 ±1.90、1.10 ±0.20; t=4.425, P<0.01);MIR210HG的表达水平与收缩压( r2=0.234, P<0.05)和舒张压( r2=0.190, P<0.05)均呈线性正相关关系,与新生儿出生体重呈线性负相关关系( r2=0.157, P<0.05)。(2)与NC组相比,KD组HTR8/SVneo细胞的增殖和迁移能力均显著增强( P均<0.05)。(3)ENCORI数据库分析共预测出可能与MIR210HG相互作用的RNA 38个。GO功能注释分析显示,MIR210HG可能参与免疫应答分子中介物产生的调控等27条通路的功能;KEGG通路富集显示,MIR210HG可能参与同种异体移植物排斥等8条通路的功能;BioCarta通路富集显示,MIR210HG可能参与翻译起始因子通路等8条通路的功能。 结论:lncRNA MIR210HG在PE产妇的胎盘组织中表达上调,降低MIR210HG的表达水平可促进HTR8/SVneo细胞的增殖和迁移,MIR210HG可能是滋养层细胞生物学行为的调节因子。
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编辑人员丨1周前
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子痫前期孕妇胎盘组织中circRNA表达谱及circRNA-miRNA-mRNA相互作用网络分析
编辑人员丨1周前
目的:通过高通量测序鉴定子痫前期(PE)孕妇胎盘组织中环状RNA(circRNA)的表达谱,构建circRNA-微小RNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)相互作用网络,揭示PE发病的相关通路及调控机制。方法:收集2019年11月至2021年6月在四川大学华西第二医院分娩的42例PE孕妇(PE组)和30例正常妊娠孕妇(对照组)的临床资料并采集其胎盘组织。(1)采用高通量测序技术建立其中5对PE组和对照组孕妇胎盘组织中的差异表达circRNA谱。(2)实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术验证其中6个差异表达circRNA在PE组和对照组胎盘组织中的表达水平。(3)使用生物信息学方法预测靶miRNA和分析共表达mRNA,构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络;并对差异表达circRNA进行基因本体(GO)功能注释分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。(4)采用logistic回归分析、Pearson相关、Kendall tau-b相关分析检验3个差异表达circRNA与PE发生风险、临床特征的相关性。(5)选择circRNA_05393进行后续功能研究,使用小分子干扰RNA、过表达质粒分别敲低或提高滋养细胞系HTR-8/SVneo细胞中circRNA_05393的表达水平,采用穿膜小室(transwell小室)体外实验检测细胞的迁移、侵袭能力,活细胞计数法检测细胞的增殖能力,细胞成管实验检测细胞的成管能力。结果:(1)高通量测序发现了72个差异表达circRNA,其中35个上调,37个下调。(2)qRT-PCR技术检测显示,与对照组比较,PE组孕妇胎盘组织中circRNA_00673(分别为1.306±0.168、2.059±0.242; t=2.356, P=0.021)和circRNA_07796(分别为1.275±0.232、1.954±0.230; t=2.018, P=0.047)的表达水平显著升高,而circRNA_05393(分别为1.846±0.377、0.790±0.094; t=3.138, P=0.002)的表达水平显著降低。(3)circRNA-miRNA-mRNA相互作用网络中包含3个circRNA、8个miRNA和53个mRNA。GO分析显示,生物过程方面主要富集于铁离子稳态、动作电位膜去极化和神经元动作电位等通路,细胞组分方面主要富集于皮质细胞骨架,质膜成分等,分子功能方面主要富集于电压门控钠通道活性、碱性氨基酸跨膜转运蛋白活性等。KEGG信号通路富集分析显示,相互作用网络中的mRNA主要富集于补体和凝血级联反应、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢,p53信号通路,过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路。(4)logistic回归分析结果显示,circRNA_05393表达下调是PE发生的危险因素( OR=0.044,95% CI为0.003~0.596; P=0.019);相关性分析结果显示,circRNA_05393与PE孕妇的收缩压、舒张压显著相关( P均<0.05)。(5)敲低或过表达circRNA_05393显著降低或增加HTR-8/SVneo细胞的迁移、侵袭能力( P均<0.05),但对细胞成管能力、增殖能力无显著影响( P均>0.05)。 结论:胎盘组织中circRNA表达谱的构建、circRNA-miRNA-mRNA相互作用网络的探索为揭示特定circRNA在PE发生中参与的调控机制提供了可能。抑制circRNA_05393可能通过减少滋养细胞的迁移和侵袭来参与PE的进展。
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编辑人员丨1周前
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微小RNA-216a-5p在妊娠期糖尿病患者胎盘中的表达及其对滋养层细胞转移的影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨微小RNA(miR)-216a-5p在妊娠期糖尿病(GDM)患者胎盘中的表达及其对滋养层HTR-8/SVneo细胞侵袭、迁移的影响及可能机制。方法:收集2018年10月至2019年10月烟台市烟台山医院的28例GDM孕妇(GDM组)和28例正常孕妇(对照组)胎盘组织,将体外培养HTR-8/SVneo细胞分为空白组(正常培养)、模拟物(mimics)-NC组(转染mimics-NC)和miR-216a-5p mimics组(转染miR-216a-5p mimics),采用实时荧光定量PCR检测胎盘组织和各组HTR-8/SVneo细胞中miR-216a-5p表达水平,Transwell实验检测各组HTR-8/SVneo细胞侵袭和迁移,免疫印迹法(Western blot)检测各组HTR-8/SVneo细胞中E-钙黏附蛋白(E-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)、锌指E盒结合蛋白-1(ZEB1)和N-钙黏附分子(N-cadherin)蛋白表达,双荧光素酶报告基因实验检测miR-216a-5p和ZEB1的靶向关系。结果:与对照组比较,miR-216a-5p在GDM组胎盘组织中表达明显升高(2.86±0.35 vs 0.96±0.07, P<0.05);与mimics-NC组比较,miR-216a-5p mimics组细胞中miR-216a-5p和E-cadherin蛋白表达水平明显升高[(1.01±0.08)vs(22.48±3.26),(0.25±0.03)vs(0.68±0.05)],而细胞侵袭、迁移能力和细胞中Vimentin、N-cadherin、ZEB1蛋白表达水平明显降低[(106.83±9.35)vs(59.16±5.28),(205.48±18.25)vs(87.32±6.50),(0.65±0.05)vs(0.35±0.02),(0.55±0.04)vs(0.32±0.03),(0.50±0.03)vs(0.36±0.02)]( P<0.05)。双荧光素酶报告基因实验结果证实miR-216a-5p可与ZEB1靶向结合。 结论:miR-216a-5p在GDM患者胎盘组织中表达上调,可能通过靶向调控ZEB1表达抑制滋养层HTR-8/SVneo细胞转移。
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编辑人员丨1周前
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5-HTR1A、5-HTR2A基因多态性与SSRIs抗抑郁疗效的关系
编辑人员丨1周前
目的:探讨5-羟色胺1A(5-HTR1A)rs6295位点、5-羟色胺2A(5-HTR2A)rs6311位点基因多态性与选择性5-羟色胺再摄取抑制剂(SSRIs)抗抑郁疗效的关系。方法:选择2018年5月至2020年10月烟台市心理康复医院收治的150例抑郁症患者,均采用SSRIs抗抑郁治疗8周。根据治疗8周后汉密尔顿抑郁量表(HAMD)评分将患者分为有效组(HAMD评分较治疗前下降≥50%,85例)和无效组(HAMD评分较治疗前下降<50%,65例)。采集外周静脉血,TaqMan探针SNP基因分型技术检测5-HTR1A rs6295、5-HTR2A rs6311位点基因多态性,分析其与SSRIs抗抑郁疗效的关系。结果:两组5-HTR1A rs6295位点等位基因G、C分布、基因型分布差异无统计学意义( P>0.05)。5-HTR2A rs6311位点等位基因C、T分布、基因型分布差异均具有统计学意义( P<0.05)。5-HTR2A rs6311位点基因CC型患者对SSRIs抗抑郁疗效敏感度高于TT型患者( OR=2.139,95% CI:1.612~9.354),C等位基因抑郁症患者对SSRIs抗抑郁疗效敏感度高于T等位基因患者( OR=2.926,95% CI:1.512~13.265)。5-HTR1A rs6295位点不同基因分型患者治疗期间HAMD评分差异无统计学意义( P>0.05),5-HTR2A rs6311位点基因CC型患者治疗2、4、6、8周时的HAMD评分低于TT型和CT型( P<0.05),TT型和CT型之间差异无统计学意义( P>0.05)。 结论:5-HTR2A rs6311位点基因多态性可能与SSRIs抗抑郁疗效有关,携带CC基因型可能是对SSRIs抗抑郁治疗敏感人群。
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编辑人员丨1周前
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lncRNA KCNQ1OT1和miR-146a-3p在子痫前期胎盘组织中的表达及调控机制的初步研究
编辑人员丨1周前
目的:观察长链非编码RNA(lncRNA)钾电压门控通道亚家族Q成员1反向转录物1(KCNQ1OT1)和微小RNA(miR)-146a-3p在子痫前期(PE)胎盘组织中的表达,并初步探索两者相互调控后对滋养细胞生物学特性的影响及作用机制。方法:(1)选择2017年7月—2018年7月在海南省人民医院住院的PE孕妇45例为PE组,选择同期正常孕妇55例为对照组,采用实时荧光定量PCR技术检测两组胎盘组织中KCNQ1OT1 mRNA、miR-146a-3p的表达,并分析两者的相关性。(2)采用绒毛膜滋养细胞层细胞系HTR8/SVneo细胞,先分为空白对照组和脂多糖(LPS)组,经LPS处理24 h的HTR8/SVneo细胞再进一步分为短发夹状RNA(sh)-KCNQ1OT1组(即沉默KCNQ1OT1的表达)、miR-146a-3p抑制物(inhibitor)组和sh-KCNQ1OT1+miR-146a-3p inhibitor组,共5组。应用生物信息学软件预测KCNQ1OT1和miR-146a-3p的靶向关系,并采用双荧光素酶报告基因实验加以验证;分别采用活细胞计数(CCK-8)法、划痕实验、穿膜(transwell)小室实验检测HTR8/SVneo细胞的增殖、迁移、侵袭能力,实时荧光定量PCR技术检测细胞中KCNQ1OT1 mRNA、miR-146a-3p的表达,蛋白印迹(western blot)法检测细胞中趋化因子12(CXCL12)和趋化因子受体4(CXCR4)蛋白的表达。结果:(1)PE组胎盘组织中KCNQ1OT1 mRNA的表达水平低于对照组(分别为0.23±0.03、0.51±0.04),miR-146a-3p的表达水平高于对照组(分别为0.49±0.03、0.31±0.03),两组分别比较,差异均有统计学意义( P<0.05);PE组胎盘组织中KCNQ1OT1 mRNA的表达水平与miR-146a-3p的表达水平呈负相关( r=-0.79, P=0.031)。(2)生物信息学软件预测并经双荧光素酶报告基因实验验证显示,KCNQ1OT1与miR-146a-3p存在靶向关系。与空白对照组相比,LPS组细胞中KCNQ1OT1 mRNA的表达水平下降(分别为0.91±0.03、0.35±0.03),miR-146a-3p的表达水平升高(分别为0.22±0.03、0.63±0.04),细胞的增殖、侵袭、迁移能力及CXCL12、CXCR4蛋白的表达均下降,分别比较,差异均有统计学意义( P<0.05);sh-KCNQ1OT1组细胞中KCNQ1OT1 mRNA的表达水平(0.23±0.03)进一步下降,miR-146a-3p的表达水平(0.85±0.03)进一步上升,细胞的增殖、侵袭、迁移能力及CXCL12、CXCR4蛋白的表达均进一步下降,分别比较,差异均有统计学意义( P<0.05);而miR-146a-3p inhibitor组、sh-KCNQ1OT1+miR-146a-3p inhibitor组分别与sh-KCNQ1OT1组比较,KCNQ1OT1 mRNA的表达水平(分别为0.78±0.04、0.50±0.03)升高,miR-146a-3p的表达水平(分别为0.42±0.03、0.46±0.03)下降,细胞的增殖、侵袭、迁移能力及CXCL12、CXCR4蛋白的表达均增高,分别比较,差异均有统计学意义( P<0.05)。 结论:KCNQ1OT1负调控miR-146a-3p的表达,激活CXCL12/CXCR4信号通路后,可促进滋养细胞的增殖、迁移和侵袭,可能参与了PE的发病。
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编辑人员丨1周前
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复合发酵乳改善便秘小鼠的作用及其机制研究
编辑人员丨1周前
目的:探讨复合发酵乳改善便秘小鼠的作用及其对肠道菌群、短链脂肪酸(short chain fatty acid, SCFA)、肠动力、肠黏膜屏障的影响。方法:C57BL/6JNifdc小鼠27只,随机平均分为对照组、模型组及干预组。模型组及干预组连续给予洛哌丁胺灌胃2周,从第2周开始,干预组灌胃洛哌丁胺后加灌复合发酵乳连续治疗7 d。对照组给予生理盐水灌胃。测定各组小鼠摄食量、饮水量、体重变化、粪便含水率、首粒黑便时间及小肠推进率。检测小鼠结肠五羟色胺2C受体(serotonin C receptor,5-HTR2C)、闭锁小带蛋白-1(zona occludins-1 ,ZO-1)、组织黏蛋白-2(mucin-2,MUC-2)mRNA的表达量;Western blot检测Raf/ERK/MAPK相关蛋白质;气相色谱法检测肠道内SCFA水平;高通量测序分析肠道菌群变化。结果:与对照组相比,模型组小鼠首粒黑便排出时间显著延长( P<0.01),粪便含水率、小肠推进率、结肠5-HTR2C、ZO-1 mRNA表达显著降低( P<0.01)。与模型组相比,干预组的首粒黑便排出时间显著缩短,粪便含水率、小肠推进率显著增加( P<0.05),结肠5-HTR2C、ZO-1 mRNA表达上调( P<0.05),结肠Raf/ERK/MAPK通路磷酸化增加,肠道产SCFA菌增加且肠道内SCFA含量增加。 结论:复合发酵乳可能通过调节肠道菌群多样性,增加产SCFA细菌丰度,并提高SCFA含量,增强结肠中Raf/ERK/MAPK通路的磷酸化上调5-HTR2C mRNA的表达,同时增加结肠中ZO-1 mRNA的表达,从而促进肠道蠕动并增强肠黏膜屏障功能,起到改善便秘的作用。
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编辑人员丨1周前
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舒肝解郁胶囊抗抑郁疗效标志物评价及机制
编辑人员丨1周前
目的:比较舒肝解郁胶囊治疗抑郁症前后候选基因的表达水平变化,分析其与抑郁症状、认知功能的相关性。寻找和明确与舒肝解郁胶囊药效相关的生物标志物。方法:经舒肝解郁胶囊治疗前后的27例轻中度抑郁患者(mild to moderate depression,MMD)分别使用24项汉密尔顿抑郁量表(24 items hamilton depression rating scale,HAMD-24)评估抑郁严重程度,韦氏智力量表中国修订版(Chinese revised Wechsler adult intelligence scale,WAIS-RC)和韦氏记忆量表中国修订版(Chinese revised Wechsler memory scale,WMS)评估认知功能,然后采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测舒肝解郁胶囊治疗前后抑郁症患者外周血候选基因的表达水平。最后,对其基因表达和临床资料进行相关性分析及疗效评价判定。统计分析采用SPSS 25.0软件,采用配对 t检验、非参数检验、Spearman相关分析、受试者工作特征曲线进行数据统计。 结果:MMD患者经舒肝解郁胶囊治疗后,HAMD-24评分降低[基线:14.00(9.75,18.25)分,8周:4.00(2.00,7.25)分, Z=-4.462, P<0.01],WMS言语智商升高[基线(123.00±10.24)分,8周(128.00±6.77)分, t=4.372, P<0.01];脑源性生长因子(brain derived neurotrophic factor,BDNF)[基线:1.68(0.92,2.63),8周:2.30(1.47,4.34), Z=-2.781, P=0.005]、胶质细胞源性神经营养因子[基线:0.74(0.31,1.15),8周:0.97(0.50,1.71), Z=-2.159, P=0.031]、5-羟色胺2A受体[基线:0.60(0.39,1.60),8周:0.98(0.44,2.29), Z=-1.994, P=0.046]和谷氨酸离子型受体AMPA型亚基1[基线:1.19(0.66,2.40),8周:1.76(0.86,4.13), Z=-2.756, P=0.006]基因表达升高。BDNF表达变化率与HAMD-24评分( r=-0.35, P=0.038)和操作智商( r=0.40, P=0.022)显著相关。 结论:BDNF可能作为舒肝解郁胶囊治疗MMD患者临床症状和认知功能的一个疗效标志物,用于评估抗抑郁疗效。
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编辑人员丨1周前
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腹部推拿通过5-HTR1A/cAMP/PKA信号通路对新生缺氧缺血性脑损伤大鼠运动平衡功能的影响
编辑人员丨1周前
目的:观察腹部推拿对新生缺氧缺血性脑损伤(hypoxic-ischemic brain damage,HIBD)模型大鼠行为学的影响,探讨其作用机制。方法:7日龄SD大鼠采用经典RICE造模法制备HIBD模型。将造模成功大鼠按随机数字表法分为腹部推拿组和模型组,每组12只,选取12只大鼠作为正常组。腹部推拿组在造模24 h后予腹部推拿,连续干预28 d。各组大鼠于干预第7、14、21、28 d进行平衡木试验,采用HE染色观察大鼠海马CA1区形态结构;荧光PCR法测定海马区5-羟色胺受体(5-HTR1A)基因相对表达量,免疫组化染色法测定海马环磷酸腺苷(cAMP)、蛋白激酶 A(PKA)、cAMP 反应元件结合蛋白(CREB)表达,Western blot法测定突触蛋白(synaptophysin,SYP)蛋白表达量。结果:干预结束后,模型组大鼠海马CA1区细胞呈弥漫性分布,神经元数量减少,出现炎性水肿;腹部推拿组海马CA1区细胞排列层次清晰,炎性水肿改善明显;与模型组比较,腹部推拿组干预第21、28 d平衡木试验评分显著降低( P<0.05),腹部推拿组5-HTR1A基因[(1.18±0.08)比(0.77±0.04)]相对表达量显著升高( P<0.05);腹部推拿组海马区cAMP[(0.32±0.02)比(0.31±0.01)]、PKA[(0.32±0.02)比(0.29±0.01)]、CREB[(0.31±0.02)比(0.28±0.01)]、SYP表达增加( P<0.05)。 结论:腹部推拿对新生HIBD大鼠的行为学有改善作用,可能是通过调节5-HTR1A/cAMP/PKA信号通路发挥神经修复作用。
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编辑人员丨1周前
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过量碘诱导绒毛膜滋养层细胞凋亡与早期妊娠稽留流产相关机制研究
编辑人员丨1周前
目的:探讨过量碘诱导绒毛膜滋养层细胞凋亡与早期妊娠稽留流产的相关机制。方法:选择2019年9月至2022年9月于天津市中心妇产科医院就诊的孕周≤12周的不明原因早期妊娠稽留流产患者(MA组, n = 43)和正常孕妇(对照组, n = 64)作为研究对象,采集绒毛组织,进行增殖细胞核抗原Ki67免疫组织化学检测和细胞凋亡检测;采集尿样,进行尿碘含量检测。另用不同剂量碘刺激培养人绒毛膜滋养层细胞株(HTR8/SVneo细胞)24 h,采用细胞计数试剂盒8(CCK8)检测细胞增殖活力,流式细胞术检测细胞凋亡情况。 结果:(1)对照组尿碘为159.70(114.21,218.73)μg/L,MA组为210.80(143.10,336.70)μg/L,二者比较差异有统计学意义( Z = 2.26, P = 0.024)。(2)MA组绒毛组织Ki67免疫组织化学染色阳性和强阳性比例明显低于对照组(χ 2 = 37.00, P < 0.001)。(3)MA组绒毛组织细胞凋亡率明显高于对照组[(26.24 ± 1.06)%比(2.96 ± 1.97)%, t = 92.23, P < 0.001]。(4)50、100、300、500 μg碘组HTR8/SVneo细胞增殖率均明显低于0 μg碘组(均 P < 0.05),其中500 μg碘组低于半数致死量。(5)0、50、500 μg碘组细胞凋亡率分别为(8.79 ± 0.12)%、(9.56 ± 0.08)%、(19.86 ± 0.05)%,3组间比较差异有统计学意义( F = 7.32, P = 0.007);其中,50、500 μg碘组均高于0 μg碘组,且500 μg碘组高于50 μg碘组(均 P < 0.05)。 结论:早期妊娠稽留流产患者尿碘含量明显增高,过量碘摄入可能导致绒毛膜滋养层细胞的增殖活力下降,细胞凋亡增多。
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编辑人员丨1周前
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基于网络药理学及分子对接和基因芯片验证右美托咪定治疗脑缺血再灌注损伤的作用机制
编辑人员丨1个月前
目的 基于生物信息学分析右美托咪定治疗脑缺血再灌注损伤的作用机制,结合分子对接和基因表达综合库(GEO)芯片验证明确核心基因.方法 采用PubChem和GeneCards筛选右美托咪定和脑缺血再灌注损伤交集靶点,建立蛋白相互作用(PPI)网络确定Hub基因,进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,最终采用分子对接和GEO芯片数据验证Hub基因.结果 右美托咪定和脑缺血再灌注损伤有 43 个交集靶点,PPI筛选得到41 个节点和 103条边的拓扑网络,Hub基因为5-羟色胺受体 2A(HTR2A)、阿片受体mu 1(OPRM1)、多巴胺受体D2(DRD2)、溶质载体家族 6 成员4(SLC6A4)、谷氨酸代谢型受体 5(GRM5)、细胞色素P450 家族2 亚家族C成员 19(CYP2C19)、溶质载体家族 6 成员3(SLC6A3)、核受体亚家族 3C组成员1(NR3C1)、糖原合成酶激酶 3β(GSK3β).GO和KEGG分析显示右美托咪定干预脑缺血再灌注损伤涉及254种生物学功能和58条信号通路.分子对接验证Hub基因均具有良好的亲和力,GSE23160芯片验证预测DRD2、GSK3β和NR3C1 具有差异性(P<0.05).结论 基于网络药理学及分子对接和基因芯片验证了右美托咪定通过多靶点、多生物学功能、多通路干预脑缺血再灌注损伤,并验证DRD2、GSK3β、NR3C1可能是核心基因,预测关键诊断基因和潜在治疗基因,为进一步研究奠定坚实基础.
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编辑人员丨1个月前
