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一例 KAT6A基因新发变异导致的智力障碍患儿的分析
编辑人员丨1周前
目的:分析1例智力障碍、语言发育滞后患儿的遗传学病因,并为其家系提供遗传咨询及产前诊断。方法:收集患儿的临床资料,采集患儿及其家系成员的外周血样,提取DNA,进行全外显子组测序,对候选变异进行Sanger测序验证,并对高危胎儿进行产前诊断。结果:患儿主要表现为智力障碍、语言发育滞后、睑下垂、斜视、畏光、多动和脾气暴躁等。全外显子组测序结果显示患儿存在 KAT6A基因c.5314dupA(p.Ser1772fs*20)致病性杂合变异,其父母均为野生型,诊断患儿为Arboleda-Tham综合征。另外患儿还存在 AIFM1基因c.56T>G(p.Leu19Trp)半合子变异,其母亲为杂合变异,表型正常的外祖父为半合子变异,可排除其致病性。高危胎儿未携带 KAT6A基因c.5314dupA变异。 结论:KAT6A基因c.5314dupA(Ser1772fs*20)杂合变异可能是患儿的致病原因,基因检测为该家系的遗传咨询及产前诊断提供了依据。
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编辑人员丨1周前
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AIFM1基因突变相关疾病研究进展
编辑人员丨1周前
线粒体凋亡诱导因子1(apoptosis-inducing factor,mitochondrion-associated 1,AIFM1)基因编码具有细胞凋亡作用及氧化还原功能的细胞凋亡诱导因子(apoptosis-inducing factor,AIF)蛋白。AIF在人体组织细胞内广泛表达,在线粒体中发挥重要作用。AIFM1基因突变与严重的X连锁线粒体脑肌病、Cowchock综合征、X-连锁的脊椎外骺端发育不良伴髓鞘性脑白质营养不良、听神经病变等疾病相关。AIFM1基因突变表现出广泛的临床表型,但突变与表型、表型严重程度之间的发病机制仍不明确。该文总结已报道的AIFM1基因突变相关位点、表型、可能致病机制,对AIFM1基因突变相关疾病及进展作一综述。
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编辑人员丨1周前
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12个铁代谢相关基因的多元回归模型可预测乳腺癌的发展
编辑人员丨1周前
目的:探讨铁代谢相关基因(IRGs)的异常表达与乳腺癌的发生发展的关系,寻找相关基因构建分子标记以预测乳腺癌的发生发展。方法:通过GSEA数据库发现与铁代谢相关的基因本体(GO)通路。在这些GO富集分析通路中有367个与铁代谢相关的基因,然后从肿瘤基因组图谱(TCGA)获得乳腺癌的RNA数据和临床数据,通过差异基因的数据分析,发现与乳腺癌特异性相关的铁代谢基因,然后对这些基因进行统计筛选后构建多元回归差异模型。结果:由ATP6AP1、ABAT、TTYH1、AIFM3、P4HA3、CCNB1、TFRC、CH25H、CYP46A1、BRIP1、ATP6V0B、SLC11A1铁代谢基因构建的模型可预测乳腺癌的发生和发展,其中高危组的存活率明显低于低危组[(21.5%比37.5%),生存分析(Kaplan-Meier), P<0.01]。ROC曲线用于验证1、3、5、10年的预测准确性高[1年曲线下面积(AUC)=0.673,3年AUC=0.704,5年AUC=0.629,10年AUC=0.701)。 结论:铁代谢相关基因可预测乳腺癌的发生发展。
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编辑人员丨1周前
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人参皂苷Rb1通过KEAP1/PGAM5/AIFM1通路促进肝细胞癌HepG2细胞发生氧死亡
编辑人员丨2024/7/6
目的:探讨人参皂苷Rb1(Gn-Rb1)对肝细胞癌(HCC)HepG2细胞氧死亡的影响及其可能的分子机制.方法:采用生物信息学方法分析氧死亡的关键基因PGAM5表达对HCC患者生存期的影响.选取辽宁省肿瘤医院收治的8例HCC患者的HCC组织与癌旁组织,通过WB法及qPCR检测氧死亡相关基因蛋白与mRNA的表达情况.将HepG2细胞随机分为对照组与Gn-Rb1组(予以200 μmol/L Gn-Rb1干预),采用细胞克隆形成实验、划痕愈合实验分别检测Gn-Rb1对HepG2细胞的集落形成能力、迁移能力的影响,ELISA检测对细胞ROS生成水平的影响,微板法检测对细胞LDH释放水平的影响;WB法、qPCR法检测Gn-Rb1对HepG2氧死亡关键基因蛋白质与mRNA水平表达的影响.结果:生物信息学分析发现,PGAM5高表达肝癌患者总生存时间较低表达患者更长(P<0.05).在临床HCC组织与癌旁组织样本中发现,相较于癌旁组织,在蛋白质与mRNA水平上,肿瘤组织KEAP1与PGAM5表达显著降低,NRF2表达显著升高(均P<0.01),p-AIFM1蛋白水平显著升高(P<0.05).对HepG2细胞予以200 μmol/L Gn-Rb1干预后,相较于对照组,Gn-Rb1组HepG2细胞的迁移能力与集落形成能力显著降低(均P<0.01),而LDH水平显著升高(P<0.05);相比于对照组,在mRNA和蛋白质水平上,Gn-Rb1组细胞中KEAP1、PGAM5表达均显著升高而NRF2表达均显著降低(均P<0.05),p-AIFM1蛋白表达显著降低(P<0.01).结论:HCC组织中氧死亡被抑制,而Gn-Rb1能够通过调控KEAP1/PGAM5/AIFM1通路促进HepG2细胞氧死亡的发生,抑制细胞增殖和迁移能力.
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编辑人员丨2024/7/6
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应用CRISPR/Cas9技术建立敲除AIFM1基因的稳定肺癌细胞株
编辑人员丨2023/12/2
目的 利用CRISPR/Cas9技术在肺癌细胞系A549和NCI-H3255中敲除凋亡诱导因子1(AIFM1)基因,并通过筛选,获得稳定的细胞株.方法 利用在线数据库GEPIA、CPTAC、Prognosis和SangerBox分析AIF在肺癌的表达和功能.以AIFM1基因为靶点,设计向导RNA(sgRNA)并利用CRISPR RGEN Tools分析其脱靶效率,CRISPR/Cas9技术敲除肺癌细胞的AIFM1基因和倍比稀释法筛选稳定的单克隆细胞株.采用Western blot检测细胞AIF表达水平.结果 TCGA和GTEx数据集结果显示,AIF蛋白在肺癌组织阳性表达率比正常组织高,差异有统计学意义(P<0.05);单因素cox和多因素cox分析发现,pT分期和pN分期是独立危险因素(P<0.05);CPTAC数据库显示,与正常阶段相比,AIF蛋白在肺癌的不同分级分期阶段的表达增加(P<0.05).AIFM1基因在TCA循环、亨廷顿氏症疾病、氨基酸-核苷酸-糖的代谢和氧化性磷酸化通路中富集显著,差异有统计学意义(|NES|>1,P<0.05);3条sgRNA的序列脱靶效率均为0;与野生型肺癌细胞株相比,用CRISPR/Cas9基因编辑技术修饰的肺癌细胞未检测到表达AIF蛋白,且筛选的杀死A549和NCI-H3255的嘌呤霉素浓度分别为0.60~0.80 μg/mL和0.60 μg/mL.结论 AIF在肺癌中表达上调.利用CRISPR/Cas9技术成功建立AIFM1基因敲除的肺癌细胞株,这将为研究AIF在肺癌发生发展机制提供合适的研究材料.
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编辑人员丨2023/12/2
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性连锁遗传性耳聋基因研究进展
编辑人员丨2023/9/16
耳聋是严重影响人类社会交流及生活质量的感觉神经缺陷疾病之一.约50%的耳聋是由遗传因素导致的,伴性染色体连锁遗传是重要的遗传方式,本文就与性染色体有关的聋病基因AIFM1、GPRASP2、COL4A5、NDP、TIMM8A/DDP、PRPS1、POU3F4、SMPX、COL4A6和TBLIY的概况、功能以及致聋机制等进行文献复习.
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编辑人员丨2023/9/16
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灵芝酸A对前列腺癌LNCaP细胞的生长抑制作用及机制
编辑人员丨2023/8/6
本研究利用alamarBlue(R)测定细胞活力法、流式细胞术(annxin V-FITC) /PI双染色测定细胞凋亡法和高效液相色谱(high performance liquid chromatography,HPLC)测定5α-还原酶活性法评价灵芝酸A对前列腺癌的体外抗肿瘤活性,并进一步利用流式细胞术2',7'-二氯荧光素二乙酸酯(2',7'-dichlorofluorescindiacetate,H2DCFDA)染色测定ROS释放量法、实时荧光定量PCR (quantitative real-time PCR,qPCR)和蛋白质免疫印迹(western blot,WB)检测雄激素受体(androgen receptor,AR)基因和凋亡相关基因表达的方法,探讨其作用机理.研究结果表明灵芝酸A可通过抑制5α-还原酶活性,抑制睾酮诱导的前列腺癌LNCaP细胞增殖,诱发细胞早期凋亡来发挥抗肿瘤活性;进一步研究表明,灵芝酸A降低前列腺癌细胞中AR的表达,并通过引发细胞线粒体功能障碍释放过量活性氧(reactive oxygenspecies,ROS)诱发细胞凋亡,而qPCR和WB的数据进一步表明细胞线粒体功能障碍与抑癌基因caspase-3、bad和aifm1的高表达密切相关.
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编辑人员丨2023/8/6
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凋亡相关基因在牙龈瘤中的特征性表达
编辑人员丨2023/8/6
目的:比较不同类型凋亡基因在牙龈瘤中的特征性表达,探讨细胞凋亡在牙龈瘤发病中的作用机制.方法:2017年12月-2018年5月治疗36例牙龈瘤患者,收集对应的牙龈瘤组织和正常牙龈组织.其中6对用PCR芯片检测84个凋亡相关基因的表达,30对用实时荧光定量PCR验证芯片结果.根据内参基因△△Ct法计算基因表达改变,采用SPSS 17.0软件包对数据进行统计学分析.结果:与正常牙龈组织相比,牙龈瘤组织中AIFM1、BCL2、BCL2L1、BCL2L2、BFAR、BIRC2、BIRC3、BIRC6、BNIP2、BNIP3、CD40LG、XIAP表达升高,TNFRSF25表达下降.结论:BCL-2家族抗凋亡基因和IAP家族基因过表达,抑制牙龈组织正常凋亡的发生,最终引起牙龈瘤.
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编辑人员丨2023/8/6
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听神经病相关基因的研究进展
编辑人员丨2023/8/5
听神经病(Auditory neuropathy,AN)是一种耳蜗内毛细胞和听神经突触和/或听神经本身功能不良导致的听功能障碍性疾病.其病因很多,包括早产、高胆红素血症、缺氧、耳毒性药物和遗传因素.据估计,约40%的AN为遗传性的,是AN的主要致病因素.目前至少发现20个与听神经病发病相关的基因,包括与非综合征型听神经病相关的基因:DIAPH3、OTOF、PJVK、SLC17A8,与综合征型听神经病相关的基因AIFM1、WFS1、PMP22、MPZ、OPA1、PCDH9、TYR、PTPN11、NF-L、NDRG1、GJB1、GJB3、TMEM126A、FXN、TIMM8A以及线粒体突变相关12SrRNA(T1095C),本综述主要介绍听神经病相关基因的研究进展.
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编辑人员丨2023/8/5
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氧死亡:一种新型调节性细胞死亡
编辑人员丨2023/8/5
氧死亡(oxeiptosis)是2018年提出的一种新的调节性细胞死亡方式(regulated cell death,RCD).其特点是活性氧诱导的Caspase非依赖性的凋亡样细胞死亡.它有自身独特的损伤诱因(活性氧)、关健基因与通路(KEAP1-PGAM5-AIFM1),不同于坏死、细胞凋亡、坏死性凋亡、焦亡、铁死亡等其他的细胞死亡方式.本文就从氧死亡的历史、特点、主要通路、鉴别等方面作一综述.
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编辑人员丨2023/8/5
