目的:探讨宏基因二代测序技术检测尿路感染患者尿液中多瘤病毒的临床价值。方法:2018年9月至2020年4月复旦大学附属中山医院收治的送检尿液宏基因二代测序的尿路感染患者共33例。采用随机扩增法、脱氧核糖核酸纳米球、华大基因公司BGI-500测序平台及BWA算法为基础的比对法等技术对尿液标本的核酸提取物进行二代测序分析，以尿标本中多瘤病毒核酸序列数>100为入选标准，分析检出多瘤病毒的类型、深度、覆盖度、丰度及序列数等参数。采用Taq Man探针实时定量聚合酶链反应（PCR）法验证并检测多瘤病毒DNA载量。结果:30.3%（10/33）的患者尿标本中检出JC多瘤病毒，其中1例合并检出BK多瘤病毒。所有患者在检测前均使用抗菌药物治疗，但仅一例尿培养阳性。JC多瘤病毒检出的深度均值为35.9，覆盖度均值96.8%，相对丰度均值92.6%，唯一比对序列数均值为3 154。实时定量PCR法检测10例患者尿中JC多瘤病毒DNA载量在5.84×10 3~6.55×10 8拷贝/ml，均值为6.82×10 7拷贝/ml，其中9例患者（均为免疫受损者）的病毒载量超过5×10 4拷贝/ml，与宏基因二代测序结果基本相符。每1 M数据中的严格比对序列数（RPM）与CD4 +T细胞计数存在线性负相关（ R2=0.84， P=0.004）。其中1例患者经西多福韦治疗后症状及尿检指标好转，随访尿液宏基因二代测序检查JC多瘤病毒的序列数及RPM值明显下降，实时定量PCR法证实尿中病毒DNA载量亦下降。 结论:宏基因二代测序技术在病毒性尿路感染的诊断中有着重要意义。西多福韦可能是治疗多瘤病毒尿路感染的一个选择。

目的 基于国家人口健康科学数据中心《慢性阻塞性肺疾病方剂数据库》数据分析慢性阻塞性肺疾病(COPD)古方用药特点,并筛选急性加重期和稳定期用药核心组方,为中医防治COPD的临床用药提供借鉴.方法 从国家人口健康科学数据中心平台《慢性阻塞性肺疾病方剂数据库》获取、筛选后纳入治疗COPD的中药古方743首,建立COPD古方常用药物数据库.运用描述性统计方法对纳入古方的药物频次、高频药物功效类别、药物性味归经进行归纳总结,分析COPD古方的用药特点.借助共现分析、关联规则分析观察COPD急性加重期、稳定期古方中药物组合的支持度、置信度、提升度,以关联规则分组矩阵结果为依据,参照药物频次统计结果、高频药对共现分析结果,将高置信度的药物组合中药物重复度较高的组合进行归纳合并,筛选COPD不同时期用药的潜在核心组方.利用改良后的BK算法计算潜在核心组方核心性的置信度(CBWN)和其在α置信度水平下的支持度(SBCα),评估潜在核心组方的代表性和核心性,筛选核心组方.结果 建立的COPD古方常用药物数据库中涵盖药物447种,高频药物为甘草、杏仁、肉桂,药物功效以化痰止咳平喘药、补虚药、理气药为主,药性以温、寒、平为主,药味以辛、苦、甘为主,归经以肺、肝、脾、胃为主.COPD急性加重期、稳定期古方用药频次前三位均是甘草、杏仁、肉桂.急性加重期药物组合80对、稳定期药物组合121对.COPD急性加重期的潜在核心组方包括"款冬花-细辛-紫菀-干姜-肉桂-甘草"、"半夏-桔梗-甘草-陈皮"、"肉桂-麻黄-杏仁-甘草-石膏",其中"半夏-桔梗-甘草-陈皮"组方的CBWN和SBC0.7均为最大,明确为COPD急性加重期的用药核心组方.COPD稳定期的潜在核心组方包括"黄芪-肉桂-人参-茯苓-甘草"、"茯苓-麦门冬-人参-肉桂-甘草"、"半夏-人参-肉桂-甘草"、"白术-陈皮-肉桂-人参-半夏"、"甘草-干姜-紫菀-肉桂-款冬花",其中"半夏-人参-肉桂-甘草"组方的CBWN和SBC0.7均为最大,明确为COPD稳定期的用药核心组方.结论 COPD古方用药以益气补中、化痰止咳为主要治疗思路,以化痰止咳平喘药、补虚药、理气药为主."半夏-桔梗-甘草-陈皮"为急性加重期的核心组方,"半夏-人参-肉桂-甘草"为稳定期的核心组方.

目的 采用数据挖掘技术辅助研究陈以平教授治疗特发性膜性肾病的用药规律.方法 收集陈以平教授辨治特发性膜性肾病的门诊病例资料和处方,采用复杂网络工具箱实现网络信息统计及分析,采用基于信息熵的互信息方法进行相关性评估,并引入随机置换检验自动确定关联度的显著性阈值;在此基础上建立复杂网络,采用支持度和置信度衡量药物之间关系的重要性,通过关联规则对方剂中的核心药对进行挖掘.结果 ①共收集218例患者的资料,提取613首处方,涉及198种药物,药物的累计使用频次为10140次.②使用频次超过60的药物有21种,即白术、黄芪、当归、苍术、山药、茯苓、猪苓、白花蛇舌草、僵蚕、薏苡仁、丹参、党参、半枝莲、芙蓉叶、金樱子、狗脊、淫羊藿、菟丝子、葛根、川芎、重楼,可以视为陈以平教授治疗特发性膜性肾病的基础药物;其中白术、黄芪、当归、苍术、山药、茯苓的使用频率超过90％,可以视为核心药物.③补气药、清热药、利水渗湿药、活血祛瘀药、化湿药的使用频次较多.④通过关联规则的分析,共得到627个药对,其中AVCH＞1的核心药对24个;同时,根据BK算法得到4个基本方.结论 陈以平教授治疗特发性膜性肾病多从脾虚湿热、瘀阻脉络人手,采用益气清热、利水渗湿、活血化瘀等治法;核心药物有白术、黄芪、当归、苍术、山药、茯苓,并得出24个核心药对,4个基本方.

王庆其主任中医师系全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师,长期从事中医药治疗脾胃病的临床实践,积有丰富的经验,尤其在治疗胃癌前疾病方面具有独到心验,曾经有多篇学术论文在核心期刊上发表.为了进一步继承和总结王庆其辨治胃癌前疾病的学术经验,本研究拟采用回顾性研究的方法,收集王师在龙华医院门诊HIS系统中的处方用药,建立结构化病历资料数据库,运用复杂系统熵网络、BK算法等数据挖掘技术,多维动态分析、定性和定量结合研究王师临床治疗胃癌前病变的基本处方和经验药对,探讨总结其治疗胃癌前疾病遣方用药的规律.

目的 探讨不同证型高血压肾病中药组方的用药规律.方法 随机抽取2年内肾病科门诊高血压中药处方共1209张,复杂网络结合BK算法挖掘其核心处方.结果 发现4种主要证型(脾肾两虚、脾虚血瘀、肝肾阴虚、脾虚湿热),其核心处方中各有10种药味.结论 数据挖掘可用于分析中药组方规律,本研究所得核心处方为高血压肾病的治疗提供了参考.

目的 基于古今文献,运用BK算法探索突发急性呼吸道传染病的中药复方用药规律,为临床治疗提供借鉴.方法 计算机检索中国知识资源总库(CNKI)、中国科技期刊数据库(万方数据)、维普期刊资源整合服务平台(VIP)和上海研发公共服务平台"方剂资源库"中关于中药治疗突发急性呼吸道传染病的文献,人工阅读文献后收集中药复方,复方信息经数据标准化处理后建立数据库,运用BK算法挖掘其用药规律.结果 共纳入中药复方186首,分析发现风温肺卫证17个高频药物(频次≥15,以发散风热、清热泻火药为主)、热壅气分证14个高频药物(频次≥10,以清热泻火解毒药为主)和正虚邪恋证15个高频药物(频次≥3,以益气养阴清热药为主),并得到3个证型的常用配伍组合,发现了风温肺卫证和热壅气分证共2首基本方(桑叶,菊花,连翘,金银花,牛蒡子,薄荷,芦根,桔梗,苦杏仁,甘草;石膏,鱼腥草,金银花,连翘,板蓝根,绵马贯众,薄荷,大黄,麻黄,苦杏仁,甘草).结论 将BK算法用于突发急性呼吸道传染病用药规律的挖掘研究,可为提高临床疗效提供有益尝试.

目的 通过数据挖掘探讨陈以平教授治疗IgA肾病(IgAN)的核心有效处方.方法 选取陈以平教授治疗IgAN的门诊病例,根据临床疗效评判标准,分别按照估算肾小球滤过率(eGFR)斜率和24 h尿蛋白定量,判定有效病例和无效病例.在对患者的阶段用药强度标准化后,使用基于倾向评分的加权t值法挖掘潜在获益药物,并在药物配伍网络的基础上,通过BK算法发现潜在核心有效方的候选方,采用复杂网络结合基于倾向评分加权的Logistic回归分析对候选方的核心性和有效性进行评估,最终获得核心有效处方.结果 共纳入309例患者资料,6 323首处方,共获得26味对eGFR斜率、9味对24h尿蛋白定量有潜在获益的药物,最终发现4个以eGFR斜率和2个以24h尿蛋白定量为评判标准的核心有效处方,分析结果基本符合临床实际情况.结论 陈以平教授治疗IgAN中减少蛋白尿或改善肾功能用药多以益气活血为主.

目的 运用复杂系统熵网络方法对徐蓉娟教授治疗桥本甲状腺炎的用药经验进行数据挖掘和分析.方法 收集2017年1月至2018年12月徐蓉娟教授辨证治疗桥本甲状腺炎患者的门诊资料和处方,借助Netdraw 2.0软件进行复杂网络构建及可视化,用于"基础方"的数据挖掘分析,采用MATLAB编程方法进行网络信息统计及分析,采用复杂系统熵网络方法挖掘核心药对.结果 共收集162个病例,提取处方1704张,涉及中药239味,累计使用频次25173.使用频次>500次者有灵芝、柴胡、黄芪、生甘草、白芍、生牡蛎、当归、郁金、陈皮、熟地黄、浙贝母、香附、白术、生地黄、党参、茯神、连翘.使用频率>70％的有灵芝、柴胡、黄芪.通过关联规则的分析,药对使用频次较高者为柴胡-郁金、生牡蛎-浙贝母、白芥子-浙贝母、太子参-麦冬、当归-生地黄.使用频率最高的药味为苦味,其余依次为甘味、辛味、咸味、酸味;使用频率最高的中药四气当属平性,其余依次为温性、寒性、微寒、微温.根据BK算法得到基本方5个,总结得出基本方药物组成:柴胡、黄芪、灵芝、白芍、当归、生地黄、生甘草、生牡蛎、熟地黄、浙贝母.结论 徐蓉娟教授治疗桥本甲状腺炎多基于肝郁脾虚、痰瘀互结证,治以疏肝健脾为主,佐以化痰祛瘀.核心药物为柴胡、灵芝、黄芪.

目的 采用数据挖掘方法探索肾综合征出血热(HFRS)的中药复方用药规律.方法 检索中国知识资源总库(CN KI)、中国学术期刊数据库(万方数据)、中文科技期刊数据库(维普网)、中国生物医学文献数据库(CBM)、PubMed、Web of Science和Wiley Online Library收录的1989年1月1日-2019年6月1日中医治疗HFRS的临床研究文献,人工阅读文献后收集中药复方,经过数据规范化处理后建立中药复方数据库,然后运用BK算法和复杂系统熵网络方法挖掘其用药规律.结果 共筛选出文献469篇,涉及中药复方216首.筛选出气营两燔证24个高频药物、15个核心药对和5个基本方,瘀热互结、阴伤津亏证22个高频药物、19个核心药对和3个基本方,肾气不固证16个高频药物、8个核心药对和1个基本方,气阴两伤证17个高频药物和4个核心药对.结论 HFRS发热期治以清气解毒、凉营活血,用药以清营汤为主,佐以疏散风热、活血止血等药物;少尿期治以泄热通腑,凉血逐瘀,兼顾养阴,用药参照犀角地黄汤、桃核承气汤、调胃承气汤等,重视清热凉血药、泻下药和利水渗湿药的配伍;多尿后期肾气不固者治以补肾培元、固摄保津,用药以补益药、收涩药为主;恢复期治以益气养阴、扶助正气,用药以益气养阴药为主,佐以理气、化湿药.

目的 运用复杂系统熵网络方法研究唐汉钧教授治疗桥本甲状腺炎的用药经验及用药规律.方法 收集2012年1月至2021年1月上海中医药大学附属龙华医院唐汉钧教授辨证治疗桥本甲状腺炎患者的门诊资料和处方,借助Netdraw 2.0软件进行复杂网络构建用于"基础方"的数据挖掘分析,采用MATLAB编程方法进行网络信息统计及分析,采用复杂系统熵网络方法挖掘核心药对.结果 共提取处方546张,涉及中药202味,累计用药频次12324,使用频率＞60％的有甘草、大枣、仙灵脾、黄芪、黄芩、玄参、丹参、浙贝母、灵芝、茯苓、白术.根据BK算法得到基本方4个,总结得出基本方药物组成:黄芩、浙贝母、黄芪、党参、白术、茯苓、灵芝、仙灵脾、大枣、甘草.结论 唐汉钧教授治疗桥本甲状腺炎多基于正气内虚、外邪侵袭的病机认识,采用"扶正清瘿"法治疗,甘草、大枣、黄芪、茯苓、白术、党参等健脾益气,是其"扶正"的核心,黄芩、玄参、浙贝母其"清瘿"的核心.