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右美托咪定抑制DEAD/H盒解旋酶11反义核糖核酸1表达调控胶质瘤细胞增殖和凋亡
编辑人员丨5天前
目的:探讨右美托咪定对SHG-44胶质瘤细胞增殖和凋亡的影响及其机制。方法:采用0.1 μmol/L(低浓度组)、1.0 μmol/L(中浓度组)和10.0 μmol/L(高浓度组)右美托咪定处理SHG-44胶质瘤细胞(购自中国科学院细胞库)。将si-DEAD/H盒解旋酶11反义核糖核酸1(DDX11-AS1)和pcDNA-DDX11-AS1分别转染至SHG-44胶质瘤细胞并采用10.0 μmol/L右美托咪定处理。采用噻唑蓝(MTT)法、克隆形成实验、流式细胞仪、实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)和蛋白质印迹法(Western blot)检测各组细胞增殖、克隆形成数、凋亡率、DDX11-AS1、裂解的半胱氨酰天冬氨酸特异性蛋白酶-3(cleaved-Caspase-3)、Caspase-3前体(pro-Caspase-3)表达。采用 t检验或单因素方差分析。 结果:低浓度组、中浓度组和高浓度组SHG-44胶质瘤细胞吸光度( A) 490值、克隆形成数、DDX11-AS1和pro-Caspase-3表达依次降低[ A490值为1.17±0.05、0.90±0.04、0.55±0.03,克隆形成数为(108.67±3.09)、(82.00±2.45)、(55.00±2.16)个,DDX11-AS1为0.96±0.04、0.68±0.03、0.36±0.02,pro-Caspase-3为0.72±0.04、0.48±0.02、0.24±0.02],凋亡率和cleaved-Caspase-3表达依次升高[凋亡率为(6.38±0.18)%、(16.78±0.71)%、(21.77±0.77)%,cleaved-Caspase-3为0.23±0.01、0.45±0.02、0.64±0.03],差异有统计学意义( F=140.693、198.187、262.395、321.333、611.199、135.429, P<0.05)。si-DDX11-AS1组SHG-44胶质瘤细胞 A490值、克隆形成数和pro-Caspase-3表达低于si-NC组SHG-44胶质瘤细胞[0.72±0.03比1.20±0.05、(65.00±2.45)个比(110.33±4.78)个、0.34±0.02比0.73±0.04, t=14.258、14.617、15.105, P<0.05],凋亡率和cleaved-Caspase-3高于si-NC组SHG-44胶质瘤细胞[(18.38±0.53)%比(6.45±0.20)%、0.53±0.02比0.21±0.01, t=36.477、24.787, P<0.05]。高浓度右美托咪定+pcDNA-DDX11-AS1组SHG-44胶质瘤细胞 A490值、克隆形成数和pro-Caspase-3表达高于高浓度右美托咪定+pcDNA组[0.98±0.04比0.54±0.03、(93.33±3.09)个比(56.00±2.16)个、0.63±0.03比0.24±0.01, t=15.242、17.150、21.361, P<0.05],凋亡率和cleaved-Caspase-3表达低于高浓度右美托咪定+pcDNA组[(13.93±0.33)%比(21.79±0.72)%、0.34±0.02比0.65±0.03, t=20.189、15.892, P<0.05]。 结论:右美托咪定通过下调DDX11-AS1表达来抑制胶质瘤细胞增殖并促进其凋亡。
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编辑人员丨5天前
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二甲双胍调控miR-340-5p/DDX17轴对高糖诱导成骨细胞增殖、凋亡的影响及分子机制
编辑人员丨5天前
目的:探讨二甲双胍调控miR-340-5p/DEAD-box解旋酶17(DEAD-box helicase 17,DDX17)轴对高糖诱导成骨细胞增殖、凋亡的影响。方法:MC3T3-E1细胞分为对照组、高糖组、二甲双胍组、inhibitor NC组、miR-340-5p inhibitor组、二甲双胍+mimic NC组、二甲双胍+miR-340-5p mimic组,qRT-PCR检测miR-340-5p表达;Western blot检测DDX17、细胞周期素D1(Cyclin D1)、增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)、Bcl-2相关X蛋白(Bcl-2-associated X protein,Bax)、裂解的天冬氨酸特异性半胱氨酸蛋白酶-3(Cleaved aspartate-specific cysteine protease-3,Cleaved caspase-3)蛋白;CCK-8、5-乙炔基-2’-脱氧尿苷(5-ethynyl-2’-deoxyuridine,EdU)染色检测细胞增殖;流式细胞术检测细胞凋亡;荧光原位杂交实验、双荧光素酶分别验证miR-340-5p与DDX17的定位、靶向关系。结果:与对照组比较,高糖组miR-340-5p表达、细胞凋亡率及Bax、Cleaved caspase-3蛋白表达升高( t=19.81,39.47,24.61,21.62, P均<0.001),OD 450值、EdU阳性细胞率及DDX17、Cyclin D1、PCNA蛋白表达降低( t=7.624,30.100,26.54,19.46,21.20, P均<0.001);与高糖组比较,二甲双胍组miR-340-5p表达、细胞凋亡率及Bax、Cleaved caspase-3蛋白表达降低( t=13.37,28.55,18.35,18.78, P均<0.001),OD 450值、EdU阳性细胞率及DDX17、Cyclin D1、PCNA蛋白表达升高( t=7.97,25.76,18.48,12.39,18.98, P均<0.001);与高糖组、inhibitor NC组比较,miR-340-5p inhibitor组miR-340-5p表达、细胞凋亡率及Bax、Cleaved caspase-3蛋白表达降低( F=85.92,301.11,142.64,170.35, P均<0.001),OD 450值、EdU阳性细胞率及DDX17、Cyclin D1、PCNA蛋白表达升高( F=26.54,447.72,249.31,113.46,393.27, P均<0.001);与二甲双胍组、二甲双胍+mimic NC组比较,二甲双胍+miR-340-5p mimic组miR-340-5p表达、细胞凋亡率及Bax、Cleaved caspase-3蛋白表达升高( F=36.27,395.56,94.90,18.59, P均<0.001),OD 450值、EdU阳性细胞率及DDX17、Cyclin D1、PCNA蛋白表达降低( F=21.44,128.47,24.28,25.89,18.06, P均<0.001)。miR-340-5p靶向调控DDX17表达,且二者共定位于细胞质中。 结论:二甲双胍通过下调miR-340-5p表达,上调DDX17表达进而促进高糖诱导的MC3T3-E1细胞增殖,抑制凋亡。
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编辑人员丨5天前
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DEAD盒RNA解螺旋酶5和微小RNA-205在前列腺癌中的表达及临床意义
编辑人员丨5天前
目的:检测DEAD盒RNA解螺旋酶5(DDX5)和微小RNA-205(miR-205)在前列腺癌(PCa)中的表达情况,并分析二者与PCa预后的关系。方法:选取2015年4月至2017年4月于北京市朝阳区双桥医院行前列腺癌根治术或穿刺活检术的86例PCa患者为研究对象,取患者术中切除的癌组织及癌旁组织分别作为PCa组和对照组。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测组织中DDX5 mRNA、miR-205的水平。采用免疫组化法检测组织中DDX5的表达情况。分析DDX5、miR-205表达水平与临床病理特征的关系。采用Kaplan-Meier生存分析DDX5、miR-205表达水平与PCa患者的预后关系。采用Cox回归分析PCa预后不良的影响因素。结果:PCa组的DDX5 mRNA及蛋白表达水平均高于对照组(均 P<0.05),miR-205表达水平低于对照组( P<0.05)。PCa患者中DDX5、miR-205表达与肿瘤分期、血清PSA、Gleason评分、肿瘤转移均有相关性(均 P<0.05),而与患者年龄、切缘性质均无相关性(均 P>0.05)。经Kaplan-Meier生存分析,DDX5阳性表达患者的3年累积生存率低于DDX5阴性表达患者( P<0.05);miR-205高表达患者的3年累积生存率高于miR-205低表达患者( P<0.05)。多因素Cox分析结果显示,DDX5水平偏高、miR-205水平偏低是PCa不良预后的危险因素( HR=2.598、3.342,均 P<0.01)。 结论:在PCa患者癌组织中DDX5高表达,miR-205低表达,二者与PCa的多种临床病理及预后有关,是PCa患者预后不良的危险因素。
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编辑人员丨5天前
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新型冠状病毒PLpro负调控DDX3诱导的β干扰素抗病毒免疫通路
编辑人员丨2024/7/20
目的 发现严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)木瓜样蛋白酶(PLpro)的宿主互作分子,探索其生物学意义.方法 邻近蛋白标记结合质谱分析筛选宿主互作分子DEAD-box解旋酶3(DDX3);免疫荧光法分析PLpro与DDX3的胞内共定位;免疫共沉淀法分析PLpro与DDX3的相互作用,以及PLpro对DDX3与IκB激酶ε(IKKe)和TANK结合激酶1(TBK1)、DDX3与线粒体抗病毒信号蛋白(MAVS)互作的影响;荧光素酶报告基因法检测PLpro对β干扰素(IFN-β)通路的影响和对底物的酶切效率.结果 DDX3能够与PLpro发生细胞内共定位和相互作用;PLpro可能抑制DDX3-MAVS复合体形成,抑制DDX3-IKKε-TBK1之间的相互作用,负调控Ⅰ型干扰素通路;DDX3过表达情况下,PLpro/PLP-TM对底物位点的切割效率显著升高,而DDX3表达降低时,切割效率则显著降低.结论 DDX3可能是PLpro的宿主相互作用分子之一;PLpro负调控DDX3活化的IFN-β表达,为病毒复制提供有利的免疫环境,提升蛋白酶切割活性,共同促进病毒复制.
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编辑人员丨2024/7/20
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去泛素化酶OTUB2通过诱导DDX54活性增加中性粒细胞外诱捕网的形成以及促进结直肠癌细胞活力和侵袭能力
编辑人员丨2024/7/6
目的 探讨含 OTU 结构域的泛素醛结合蛋白 2(OTUB2)影响RNA解螺旋酶 54(DDX54)的活性及其对中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)的形成和结直肠癌(CRC)细胞活力、侵袭的影响.方法 分离CRC患者和健康对照组的外周血中性粒细胞,并使用佛波酯(PMA)或脱氧核糖核酸酶Ⅰ(DNaseⅠ)刺激中性粒细胞4 h;Western blot检测NETs标记物髓过氧化物酶(MPO)和瓜氨酸组蛋白H3(Cit-H3)的表达;干预SW480 细胞中OTUB2 或DDX54 的表达并将其和中性粒细胞共培养,细胞分为如下组:对照组(不做任何处理),NETs 组、vector 组、OTUB2 组、NETs+si-OTUB2 组(SW480 细胞、转染了vector、OTUB2 过表达质粒和si-OTUB2的SW480 细胞分别与 PMA 处理的中性粒细胞共培养),OTUB2+DNase Ⅰ组(转染了OTUB2 过表达质粒的SW480细胞与DNase Ⅰ处理的中性粒细胞共培养),si-OTUB2 组、OTUB2+si-NC 组和 OTUB2+si-DDX54 组(转染了 si-OTUB2、OTUB2 过表达质粒和 si-NC、OTUB2 过表达质粒和si-DDX54 的 SW480 细胞分别与中性粒细胞共培养).ELISA检测 SW480 细胞上清液中 MPO-DNA 复合物相对表达量和Cit-H3 的浓度;MTT和Transwell检测SW480 细胞活力和侵袭能力;RNA测序筛选OTUB2 调控的下游基因并使用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)、免疫共沉淀(co-IP)和谷胱甘肽 S-转移酶(GST)亲和纯化(GST-pull-down)、His-tag pull-down实验验证 DDX54 和OTUB2 的相互作用.结果 与健康对照相比,CRC患者外周血中NETs的形成增加.与对照组相比,NETs组CRC细胞活力和侵袭增加(P<0.05).与vector组比较,OTUB2 组MPO-DNA复合物相对表达量和Cit-H3 的浓度增加,细胞活力和侵袭增加(P<0.05);而与OTUB2 组比较,OTUB2+DNase Ⅰ组MPO-DNA复合物相对表达量和Cit-H3 的浓度减少,细胞活力和侵袭减少(P<0.05).Co-IP 实验、GST pull down 实验和His-tag pull down实验表明OTUB2 和DDX54 之间存在相互作用.与 OTUB2+si-NC 组比较,OTUB2+si-DDX54 组MPO-DNA复合物相对表达量和Cit-H3 的浓度减少,细胞活力和侵袭减少(P<0.05).结论 去泛素化酶OTUB2 可以通过上调DDX54 的增加NETs的形成并促进CRC细胞活力和侵袭.
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编辑人员丨2024/7/6
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LncRNA PSMA3-AS1 调节miR-140-3p/DDX5 轴对肺癌细胞增殖、凋亡和上皮间质转化的影响
编辑人员丨2024/6/15
目的 探讨长链非编码 RNA人蛋白酶体 α亚基 3 型的反义 RNA1(PSMA3-AS1)调节 miR-140-3p/DEAD box p68 RNA 解旋酶(DDX5)轴对肺癌细胞增殖、凋亡和上皮间质转化(EMT)的影响.方法 qRT-PCR、Western blot、免疫组化法分别检测 40 例肺癌组织和细胞系中PSMA3-AS1、miR-140-3p、DDX5 表达.将A549 细胞分为:control组、si-NC组、si-PSMA3-AS1 组、si-PSMA3-AS1+inhibitor-NC组、si-PSMA3-AS1+miR-140-3p inhibitor组,qRT-PCR检测转染效率;MTT法、流式细胞仪、Transwell小室分别检测细胞增殖、凋亡、迁移与侵袭;Western blot方法检测增殖细胞核抗原(PCNA)、Bcl-2相关X蛋白(Bax)、基质金属蛋白酶-2(MMP-2)、波形蛋白(vimentin)、E-钙黏蛋白(E-cadherin)及DDX5 蛋白的表达;双荧光素酶报告基因实验验证miR-140-3p与PSMA3-AS1 和DDX5 的关系;构建肺癌裸鼠模型,分为si-NC、si-PSMA3-AS1 组,测量肿瘤质量与体积,qRT-PCR检测移植瘤组织中miR-140-3p表达,免疫组化法检测移植瘤组织Ki-67、DDX5 蛋白表达.结果 在肺癌组织/细胞系中,PSMA3-AS1 mRNA、DDX5 蛋白表达升高,miR-140-3p mRNA表达水平降低(P<0.05);敲低PSMA3-AS1 表达可显著抑制A549 细胞增殖、迁移与侵袭,降低PCNA、MMP-2、vimentin、DDX蛋白表达,促进miR-140-3p、Bax、E-cadherin表达及细胞凋亡(P<0.05);下调miR-140-3p,可减弱敲低PSMA3-AS1 对A549 细胞增殖、迁移和侵袭能力的抑制作用及对细胞凋亡的促进作用(P<0.05);双荧光素酶报告基因实验证实miR-140-3p与PSMA3-AS1、miR-140-3p与DDX5 存在靶向调控关系(P<0.05);体内实验显示,抑制PSMA3-AS1 表达可显著降低移植瘤质量和体积,降低 Ki-67、DDX5 表达水平,升高 miR-140-3p 表达(P<0.05).结论 敲低PSMA3-AS可能通过调节miR-140-3p/DDX5 轴,抑制肺癌细胞的增殖和EMT,促进细胞凋亡.
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编辑人员丨2024/6/15
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DDX3X/NF-κB通路介导蛛网膜下腔出血小鼠早期神经元凋亡
编辑人员丨2024/4/27
目的:研究DDX3X/NF-κB通路在蛛网膜下腔出血(SAH)小鼠早期神经元凋亡过程中的作用.方法:利用颈内动脉穿刺的方法构建SAH小鼠模型,对小鼠进行神经功能评分.使用表达DDX3X靶向shRNA的重组慢病毒(Lv-shDDX3X)预先敲低脑内DDX3X的表达,或者通过NF-κB抑制剂NF-κB-IN-1(简称IN-1)抑制NF-κB信号通路,利用Western Blot检测小鼠皮质DDX3X和NF-κB(p65)的表达,通过TUNEL/NeuN染色检测各组小鼠大脑皮质神经元的凋亡.结果:SAH术后24d小鼠神经功能显著障碍(P<0.05),皮质中DDX3X表达显著增加而NF-KB(p65)的表达显著降低(P<0.05).预先敲低DDX3X后,小鼠神经功能显著恢复,NF-KB(p65)蛋白表达显著高于SAH组(P<0.05);当在敲低DDX3X表达的同时使用IN-1抑制NF-κB活性,则小鼠神经功能恢复不明显.TUNEL/NeuN染色显示敲低DDX3X表达后小鼠脑组织中TUNEL阳性的死亡神经元数量少于SAH组(P<0.05),而如果在敲低DDX3X表达的同时使用IN-1抑制NF-κB活性,则TUNEL阳性的神经元数量减少不明显.结论:DDX3X/NF-κB通路介导了 SAH后早期脑损伤小鼠的细胞死亡.
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编辑人员丨2024/4/27
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结直肠癌组织和细胞中DEAD盒解旋酶10和Bystin样蛋白的表达及其临床意义
编辑人员丨2024/2/3
目的:探讨结直肠癌(CRC)组织及结肠癌细胞DLD-1中DEAD盒解旋酶10(DDX10)与Bystin-like(BYSL)的关系及其临床意义.方法:收集2017年3月至2018年3月间福建医科大学附属第二医院手术切除的78例CRC组织和配对癌旁组织,采用免疫组织化学Envision法检测癌组织和癌旁组织中DDX10和BYSL的表达水平,采用卡方检验、Pearson相关性分析和Kaplan-Meier法分别分析CRC组织中DDX10、BYSL蛋白表达与其患者的临床病例特征的关系,两者表达的相关性,以及与患者PFS和OS的关系.利用瞬时转染技术在DLD-1细胞中分别转染siDDX10和siNC,用qPCR法检测DLD-1细胞中敲减DDX10的表达对BYSL表达的影响,用CCK-8及Transwell实验验证DDX10及BYSL表达对结肠癌细胞增殖迁移及侵袭的影响.结果:免疫组织化学Envision法检测显示,与癌旁组织相比,DDX10和BYSL在CRC组织中呈高表达(73.08%和74.36%).CRC组织中DDX10与BY肿瘤分期、是否发生淋巴结转移及复发等临床病例特征均有关联(均P<0.05).Pearson相关分析结果显示,DDX10与BYSL的表达呈正相关(r=0.636,P<0.001).Kaplan-Meier生存分析结果显示,DDX10与BYSL的高表达与患者更差的预后相关.Logistic回归分析发现,DDX10与BYSL均是CRC复发的独立风险因素.CCK-8法及Transwell实验检测结果显示,敲降DDX10的表达可使BYSL表达降低,且可抑制DLD-1细胞的增殖、迁移、侵袭能力(均P<0.05).结论:DDX10和BYSL在CRC组织中呈高表达,两者表达水平呈正相关,且与患者更差的预后相关,是CRC复发的独立风险因素.可调控结直肠癌DLD-1细胞的增殖、迁移、侵袭能力.
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编辑人员丨2024/2/3
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乌头碱调控miR-181d-5p/DDX3轴对宫颈癌HeLa细胞增殖、凋亡的影响
编辑人员丨2023/9/30
目的 探讨乌头碱通过调控微小RNA-181d-5p(miR-181d-5p)/DEAD-box RNA解旋酶3(DDX3)轴对宫颈癌HeLa细胞增殖、凋亡的影响.方法 使用不同剂量乌头碱处理宫颈癌HeLa细胞,四甲基偶氮唑盐法检测细胞增殖确定给药剂量.将HeLa细胞分为对照组(正常培养,不进行处理),乌头碱低剂量组(4 mg/L)、中剂量组(8 mg/L)、高剂量组(16 mg/L),顺铂组(5 mg/L),乌头碱高剂量+miR-NC组[16 mg/L乌头碱+转染miR-181d-5p siRNA阴性对照(miR-NC)质粒]及乌头碱高剂量+miR-181d-5p低表达组[16 mg/L乌头碱+转染miR-181d-5p小干扰RNA(siRNA)质粒].平板克隆形成实验及流式细胞仪分别检测各组HeLa细胞克隆形成数与凋亡情况;实时荧光定量PCR检测HeLa细胞中miR-181d-5p和DDX3 mRNA表达水平;蛋白免疫印迹法检测HeLa细胞中DDX3、细胞周期蛋白D1(Cyclin D1)、增殖细胞核抗原(PCNA)、B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)、Bcl-2相关X蛋白(Bax)、胱天蛋白酶-3(Caspase-3)蛋白表达水平;双萤光素酶报告基因实验验证miR-181d-5p与DDX3的靶向关系.结果 以0.5~64 mg/L的乌头碱分别处理HeLa细胞24 h、48 h、72 h后,对HeLa细胞均有不同程度的抑制作用,选择剂量为4 mg/L、8 mg/L、16 mg/L的乌头碱用于后续实验.与对照组比较,乌头碱低、中、高剂量组及顺铂组HeLa细胞克隆形成数、DDX3 mRNA和蛋白、Cyclin D1、PCNA、Bcl-2 蛋白表达水平依次降低(P<0.05),凋亡率、miR-181d-5p、Bax、Caspase-3蛋白表达水平依次升高(P<0.05);与乌头碱高剂量组和乌头碱高剂量+miR-NC组比较,乌头碱高剂量+ miR-181d-5p低表达组HeLa细胞克隆形成数、DDX3 mRNA和蛋白、Cyclin D1、PCNA、Bcl-2蛋白表达水平升高(P<0.05),凋亡率、miR-181d-5p、Bax、Caspase-3蛋白表达水平降低(P<0.05);双萤光素酶报告基因检测证实miR-181d-5p与DDX3存在靶向关系.结论 乌头碱可调控miR-181d-5p/DDX3轴,促进miR-181d-5p表达,抑制DDX3表达,进而抑制宫颈癌HeLa细胞增殖,促进细胞凋亡.
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编辑人员丨2023/9/30
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老年胃癌患者DEAD-box蛋白家族RNA解旋酶3的表达及临床意义
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究老年胃癌患者DEAD-box蛋白家族RNA解旋酶3(DDX3)的表达情况,分析其表达与临床病理参数的相关性.方法 选择70例经病理证实的老年胃癌患者,采集胃癌组织和癌旁组织标本,分别采用免疫组化法和 RT-PCR 法检测 DDX3蛋白及 mRNA,分析 DDX3的表达与病理参数的相关性.结果 DDX3蛋白在胃癌组织中的阳性表达率(51.4%)高于癌旁组织(8.6%),差异有显著性(Х2=30.6122, P=0.000).DDX3 mRNA 表达吸光度值(1.48 G 0.19)高于癌旁组织(1.05 G 0.23),差异有显著性(t=11.8809,P=0.000).胃癌分化程度、临床分期、肿瘤浸润深度及是否存在淋巴结转移与DDX3表达阳性率有关,胃癌低分化、临床分期Ⅲ~Ⅳ期及出现淋巴结转移者DDX3表达阳性率较高.DDX3 mRNA的表达与胃癌分化程度、临床分期、肿瘤浸润深度及是否存在淋巴结转移显著相关(P<0.05).结论 DDX3的高表达与老年胃癌的发生、发展相关.
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编辑人员丨2023/8/6