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一例罕见Guion-Almeida型下颌骨颜面发育障碍胎儿的遗传学分析
编辑人员丨6天前
目的:对1例超声检查表现为小下颌畸形伴双耳低位、小耳畸形、羊水过多、胃无回声的胎儿进行临床和遗传学分析,以明确其遗传学病因。方法:应用全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)技术对1例常规染色体核型分析和染色体微阵列分析(chromosome microarray analysis,CMA)未见异常的超声结构异常胎儿行基因变异检测,针对可疑变异进行先证者及其父母Sanger测序验证和生物信息学预测。结果:WES检测发现胎儿 EFTUD2基因第23外显子存在一个无义变异c.2302C>T(p.Q768X),其父母未检测到该变异。该变异为未报道过的新变异,导致其编码的EFTUD2蛋白在768位氨基酸处翻译提前终止。经生物信息学预测,768位氨基酸在不同物种中高度保守,Q768X变异体改变了EFTUD2蛋白空间结构,可能影响蛋白的功能。 结论:应用WES技术明确 EFTUD2基因c.2302C>T变异是引起胎儿Guion-Almeida型下颌骨颜面发育障碍的遗传学病因。该变异丰富了 EFTUD2基因的变异谱,为家系的遗传咨询和产前诊断提供依据。
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编辑人员丨6天前
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EFTUD2基因新型变异引起的罕见胎儿Guion-Almeida型下颌骨颜面发育障碍1例
编辑人员丨6天前
孕妇,26岁,孕2产0,丈夫32岁。该夫妇表型及染色体核型分析结果均正常,否认近亲婚配及遗传病家族史。该孕妇于2019年首次妊娠,孕22 w系统超声提示胎儿小下颌,耳廓形态发育异常考虑小耳畸形、低耳位,胃泡未显示,羊水过多,足内翻等,进行介入性产前诊断羊水染色体核型分析及染色体微阵列检查(array comparative genomic hybridization,aCGH)均无明显异常,该孕妇于孕31 w选择终止妊娠。2021年5月该孕妇因孕22 +1 w系统超声提示胎儿小下颌畸性,消化道闭锁,羊水过多,胃泡未显示(见图1),来西北妇女儿童医院遗传中心就诊。本次妊娠孕12 +1 w NT超声检查显示NT 1.4 mm,顶臀径(crown-rump length,CRL)约54 mm。该孕妇于孕33 w选择终止妊娠,引产胎儿主要表现为面容异常如小下颌、低耳位、环状耳、眼距较宽、鼻头外翻、无明显鼻弓等(见图2)。对该夫妇进行遗传咨询,并签署知情同意书。本研究符合《世界医学会赫尔辛基宣言》。
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编辑人员丨6天前
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延伸因子Tu GTP结合域蛋白2功能研究进展
编辑人员丨2024/3/16
延伸因子Tu GTP结合域蛋白 2(elongation factor Tu GTP binding domain containing protein,EFTUD2)是剪接体复合物U5小核糖核蛋白的核心组件,通过调节剪接体的剪接功能进而调控相关基因的表达.本文旨在总结EFTUD2在免疫调节、胚胎发育和肿瘤进展等方面的重要作用.
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编辑人员丨2024/3/16
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人EFTUD2启动子的鉴定及初步分析
编辑人员丨2023/8/5
目的:鉴定并分析EFTUD2 (elongation factor Tu GTP-binding domain-containing 2)基因的启动子区域.方法:应用生物信息学技术对EFTUD2基因结构及潜在启动子区域进行分析,预测4个EFrUD2启动子序列.使用全基因合成技术以及高保真PCR扩增得到目的启动子序列,通过BglⅡ和Nhe Ⅰ双酶切,将目的条带克隆到双荧光素酶报告基因载体psiCHECK-2中,得到4个长度不同并覆盖EFTUD2基因转录起始位点附近约2 kb的EFTUD2基因启动子双荧光素酶报告基因重组体.荧光素酶分析检测启动子活性.结果:经酶切、测序鉴定,成功构建了人EFTUD2启动子荧光素酶报告基因重组质粒.通过荧光素酶活性检测,重组体EFTUD2-0.5的相对荧光素酶活性增加(P<0.05),提示EFTUD2基因核心启动子序列位于转录起始位点附近约500 bp的区域内.结论:EFTUD2基因转录起始位点上游500 bp具有启动子活性,初步判定其核心启动子位于该区域.
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编辑人员丨2023/8/5
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含Tu GTP结合结构域延伸因子2(Eftud2)增强小鼠巨噬细胞功能的生物信息学分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 通过生物信息学方法分析含Tu GTP结合结构域延伸因子2(Eftud2)增强小鼠巨噬细胞免疫功能的作用机制.方法 分别收集10例Eftud2髓系细胞特异性敲除(MKO)小鼠及野生型(WT)小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDM),经100 ng/mL脂多糖(LPS)刺激2h.采用生物信息学方法对样本进行基因表达差异以及mRNA水平可变剪接差异的检测.分别利用RNA序列差异表达基因(DEGseq)软件包、复制转录本剪接多变量分析(rMATS)软件对两组小鼠BMDM样本中基因表达及可变剪接差异进行统计;利用京都基因与基因组百科全书(KEGG)分类与富集法统计两组小鼠BMDM样本中基因表达与可变剪接差异所影响的信号通路.结果 与WT小鼠相比,MKO小鼠的BMDM经LPS刺激后白细胞介素6(IL-6)、IL-1β、肿瘤坏死因子α(TNF-α)及与免疫反应相关的基因显著下调;KEGG通路分析表明,BMDM基因表达差异及可变剪接差异主要影响信号转导及免疫系统相关代谢通路,且与磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3 K-AKT)信号通路相关性较强.其中可变剪接差异还存在于泛素化及细胞内吞作用中.与WT小鼠相比,MKO小鼠BMDM可变剪接差异共232处,其中跳过外显子的可变剪接共有125处,占比最多.此外,对可变剪接差异的分析也证实了前期实验结果,即Eftud2可通过影响Toll样受体4/核因子κB (TLR4/NF-κB)信号通路中髓样分化因子88(MyD88)等关键分子的可变剪接,调控相关炎性信号通路的激活,增强巨噬细胞的功能.结论 Eftud2通过影响基因的表达及可变剪接促进巨噬细胞释放炎性细胞因子,从而增强巨噬细胞免疫功能.
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编辑人员丨2023/8/5
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人EFTUD2基因靶向小分子化合物筛选细胞模型的建立
编辑人员丨2023/8/5
目的 体外建立一个以荧光素酶为报告基因,靶向人EFTUD2基因的化合物筛选细胞模型.方法 应用限制性内切酶双酶切LV6载体,将人EFTUD2pro-0.5kb启动子和荧光素酶报告基因的融合片段重组入LV6慢病毒载体.以重组慢病毒感染HepG2细胞,采用嘌呤霉素筛选和有限稀释法获得Epro-LUC-HepG2细胞株.利用荧光素酶报告基因系统挑选最佳单克隆细胞株并扩大培养.结果 准确构建了LV6-Epro0.5-LUC慢病毒载体,并成功筛选出可稳定表达荧光素酶的Epro-LUC-HepG2单克隆细胞株.根据荧光素酶报告基因检测结果,挑选了最佳克隆株细胞,被命名为Epro-LUC-HepG2细胞.结论 我们成功构建了以人EFTUD2基因为靶点的Epro-LUC-HepG2细胞化合物筛选模型,有助于后续筛选新型靶向免疫调节药物.
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编辑人员丨2023/8/5
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下颌骨颜面发育不全伴小头畸形1例及文献复习
编辑人员丨2023/8/5
目的:分析探讨罕见的下颌骨颜面发育不全伴小头畸形(MFDM)的临床诊断、耳科学治疗以及分子病因学特征.方法:对先证者进行详细的病史采集,系统查体及表型特征分析,以及听力学检查,胸部X线、颞骨CT和颅脑MRI等影像学检查.同时提取先证者及其父母血液DNA进行全外显子组测序,并检索PubMed、中国知网数据库,对截止2020年底前报道的由EFTUD2基因突变导致的MFDM临床特征进行筛选、归纳和总结.结果:患儿表现为耳廓发育不良、小下颌、小头畸形,同时合并发育迟缓、双耳极重度感音神经性聋,中耳及内耳发育畸形,基因学检测发现EFTUD2基因的新生缺失变异c.623_624delAT.根据临床特征及基因学检测结果诊断为MFDM.行双侧人工耳蜗植入手术,术中及开机后部分电极反应良好.结论:这是国内首次报道的EFTUD2基因突变导致的MFDM,对该患儿进行人工耳蜗植入术的关键在于术中避免损伤畸形的面神经,术后言语康复效果与患儿智力发育等多因素相关.
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编辑人员丨2023/8/5
