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甲基转移酶样蛋白3及去甲基化酶肥胖相关蛋白对H7N9病毒复制的影响及转录组学分析
编辑人员丨4天前
目的:探究甲基转移酶样蛋白3(methyltransferase like 3,METTL3)和去甲基化酶肥胖相关蛋白(fat mass and obesity-associated protein,FTO)在H7N9病毒感染中发挥的作用及可能的分子机制。方法:利用Western blot(WB)检测H7N9病毒感染A549细胞后METTL3和FTO的表达。敲低和过表达METTL3和FTO,H7N9病毒感染后用WB和TCID 50检测其对病毒复制的影响。利用转录组测序方法对METTL3或FTO敲低及野生型对照细胞进行了转录组水平基因差异表达分析,对发挥作用的潜在靶标进行初步分析。 结果:H7N9病毒感染A549细胞24 h后METTL3的表达上调,FTO无明显变化。敲低METTL3和FTO后,病毒核蛋白(nucleoprotein, NP)表达水平和病毒滴度显著下降,过表达METTL3和FTO后,病毒滴度显著增加。转录组测序结果显示在METTL3或FTO敲低组与对照组之间分别发现314和555个差异表达基因,GO功能富集分析和KEGG通路富集分析结果表明这些基因与宿主免疫应答相关。结论:METTL3和FTO可能通过调节宿主-病毒相互作用在H7N9病毒感染中起关键作用。
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编辑人员丨4天前
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FTO基因单核苷酸多态性对肥胖运动减重效果的影响存在性别差异
编辑人员丨4天前
携带肥胖易感基因的个体在发生肥胖后,运动减重的效果是否仍然受基因多态性影响,在国内外为数不多的研究中存在较大争议,在客观上也需要针对不同人种和不同民族开展研究。解放军总医院第二医学中心健康管理研究院联合北京博奥晶典生物技术有限公司等机构的科研团队,首次发现在中国汉族成年肥胖人群中,不同FTO基因型的运动减重效果存在差异,尤其在男性肥胖者中这种差异性更为显著。该研究自2018年至2019年,在解放军总医院第二医学中心健康管理研究院医学减重门诊招募成年肥胖者240例(男女各120例,28≤BMI≤40),利用其与中国科学院合肥物质科学研究院联合开发的慢性病运动康复系统,对受试者开展12周精准化中等强度的有氧运动干预,精准控制运动强度和运动量,对完成者进行FTO基因(rs8050136)分型检测,分析运动干预前后肥胖相关指标的变化程度与FTO基因单核苷酸多态性的相关性。研究发现,携带FTO基因的中国汉族成年肥胖者可以通过运动实现减重,且在男性肥胖者中,携带FTO基因者比未携带者的体重和体质指数下降程度更为显著。该发现提示,想要获得更佳的运动减重效果,可根据基因检测结果制定个体化运动减肥方案,对于经基因检测判断为运动减重速度偏慢的肥胖者,可考虑突破中等强度有氧运动的局限性,通过运动要素的新组合来提高减重速度。
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编辑人员丨4天前
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脂肪量和肥胖相关基因在结肠癌组织的表达及生物学功能
编辑人员丨4天前
目的:探讨脂肪量和肥胖相关基因(FTO)在结肠癌组织的表达及其生物学功能。方法:采用实时定量聚合酶链反应检测并分析FTO在结肠癌组织与癌旁组织中的表达特征及临床意义。利用RNA干扰(RNAi)技术构建FTO稳定下调表达的结肠癌细胞株SW620和Caco-2,通过细胞计数试剂盒(CCK-8)细胞增殖实验、划痕实验进一步研究FTO下调表达对结肠癌细胞株生物学行为的影响。结果:结肠癌组织中FTO的mRNA表达水平显著高于癌旁正常组织( t=10.310, P<0.01);FTO mRNA在肠癌细胞中的表达水平显著高于正常肠上皮细胞株(HT-29为, t=18.730, P<0.01;HCT-116为, t=3.700, P<0.05;SW620为, t=4.060, P<0.05;LoVo为, t=5.580, P<0.01;SW48为, t=16.640, P<0.01;DLD-1为, t=7.260, P<0.01;Caco-2为, t=9.640, P<0.01),差异均有统计学意义。CCK-8增殖实验结果显示,LV-FTO-shRNA组中结肠癌细胞的增殖能力低于shNC组(SW620,24 h为, t=4.660, P<0.01,48 h为, t=3.760, P<0.01,72 h为, t=3.370, P<0.05;Caco-2,24 h为, t=3.680, P<0.05,48 h为, t=3.630, P<0.05,72 h为, t=4.180, P<0.01),差异均有统计学意义;划痕试验结果显示,划痕24 h后,LV-FTO-shRNA组的无细胞区域显著宽于LV-NC组(SW620为, t=34.070, P<0.01;Caco-2为, t=31.680, P<0.01),差异均有统计学意义。 结论:FTO在结肠癌组织及结肠癌细胞株中高表达,FTO的下调表达显著抑制结肠癌细胞的增殖和迁移能力,提示FTO异常表达是促进结肠癌进展的重要因素。
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编辑人员丨4天前
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N6-甲基腺苷修饰与非小细胞肺癌淋巴结转移相关
编辑人员丨4天前
目的:探讨N6-甲基腺苷(m6A)修饰与非小细胞肺癌(NSCLC)淋巴结转移的相关性。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载NSCLC患者的转录组测序数据,共包含1 037例原发肺癌组织样本和108例癌旁组织样本。分析参与m6A修饰过程的调控蛋白在肿瘤组织和癌旁正常组织样本中表达水平的差异,利用加权基因共表达分析(WGCNA)算法识别与m6A调控因子存在共表达关系的信使RNA(mRNA)和非编码RNA(ncRNA)并根据RNA的表达模式对NSCLC患者进行共识聚类。采用 t检验比较聚类亚组间m6A甲基化丰度的差异,采用 χ2检验比较组间淋巴结转移发生率的差异。 结果:共纳入20个m6A调控因子,肿瘤组织中15个调控因子的表达水平显著上调[甲基转移酶样蛋白3(METTL3)、YTH结构域蛋白1(YTHDC1)、YTH结构域结合蛋白1-3(YTHDF1-3)、异质核核糖蛋白A2B1(HNRNPA2B1)和HNRNPC、ALK B同源物5(ALKBH5)等],3个调控因子显著下调[M0ETTL14、含锌指CCCH结构域蛋白13(Zc3h13)、脂肪和肥胖相关蛋白(FTO)],差异有统计学意义( P<0.05),YTHDC2和METTL16差异无统计学意义。通过WGCNA算法识别出454个与调控因子存在共表达关系的mRNAs和400个ncRNAs[325个长链非编码RNAs(lncRNAs)、23个微小RNAs(miRNAs)、28个核仁小RNAs(snoRNAs)、24个核内小RNAs(snRNAs)]。根据854个RNAs的表达模式进行共识聚类,将NSCLC患者分为2个聚类亚组(聚类1和聚类2)。WT1相关蛋白WTAP( t=14.322, P<0.01)和HNRNPC( t=15.424, P<0.01)等11个调控因子的表达水平在聚类1中均显著上调,其他9个调节因子在聚类亚组间差异无统计学意义,聚类1患者具有较高的m6A甲基化丰度。聚类1患者淋巴结转移发生率38.16%(292/765)明显高于聚类2组的22.27%(55/247),差异有统计学意义( χ2=19.487, P<0.01)。 结论:通过m6A甲基化与非小细胞肺癌淋巴结转移的相关分析,有助于探讨肺癌淋巴结转移相关机制。
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编辑人员丨4天前
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Gene-diet interaction of FTO-rs9939609 gene variant and hypocaloric diet on glycemic control in overweight and obese adults: a systematic review and meta-analysis of clinical trials
编辑人员丨4天前
Background::The hypocaloric diets improve glycemic status in obese individuals, but the response to hypocaloric diets in fat mass and obesity-associated gene ( FTO)-rs9939609 gene variant is unknown. This systematic review and meta-analysis aimed to assess the gene-diet interaction of FTO-rs9939609 gene variant and hypocaloric diets on glycemic control in overweight and obese adults. Methods::Cochrane Central Register of Controlled Trials, PubMed, ISI Web of Science, Embase, Scopus, and Google scholar were searched up to December 2018, for relevant clinical trials. Mean changes in fasting blood sugar (FBS), serum insulin, and homeostasis model assessment of insulin resistance (HOMA-IR) were extracted.Results::The pooled analysis of nine studies showed that there was no significant difference between AA/AT and TT genotypes in FBS (weighted mean difference [WMD] = 0.01, 95% confidence interval [CI]: -1.08, 1.10, P = 0.984) and serum insulin (WMD = 0.20, 95% CI: -0.85, 1.26; P = 0.707) after intervention hypocaloric diets. The overweight/obese participants in AA/AT group showed the greatest reduction in HOMA-IR compared with TT genotype following intervention, and this difference was not statistically significant (WMD = -0.38, 95% CI: -0.94, 0.16, P = 0.167). Conclusion::This meta-analysis suggests that there was no significant difference between AA/AT and TT genotypes of FTO-rs9939609 on FBS, serum insulin level, and insulin resistance in response to hypocaloric diets.
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编辑人员丨4天前
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mRNA N6-甲基腺苷甲基化在阿尔茨海默病患者血液中的变化
编辑人员丨4天前
目的:研究阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)患者血液中mRNA N6-甲基腺苷甲基化水平以及甲基转移酶3(methyltransferase-like 3,METTL3)和去甲基化酶脂肪与肥胖相关基因(fat mass and obesity-associated gene,FTO)蛋白的变化情况。方法:选取2020年1月至2021年6月在济宁医学院附属医院神经内科门诊及住院就诊的40例AD患者作为患者组,另选40例健康志愿者作为对照组。采集所有被试血样,提取血浆和外周血单个核细胞,采用酶联免疫吸附测定(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)、蛋白质印迹(Western blot,WB)、实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)以及m6A甲基化定量等实验对METTL3、FTO和m6A甲基化水平进行检测,所得数据采用SPSS 23.0统计软件进行 t检验。 结果:两组被试血浆METTL3、FTO蛋白浓度比较,AD组均小于对照组[METTL3:(22.33±3.01)ng/mL,(25.63±1.70)ng/mL, t=6.055, P<0.01;FTO:(63.51±4.95)pg/mL,(69.60±4.60)pg/mL, t=5.704, P<0.01]。两组外周血单个核细胞METTL3、FTO蛋白条带灰度值比较,AD组均小于对照组[METTL3:(0.399 5±0.028 7),(0.676 6±0.053 3), t=7.935, P=0.001;FTO:(0.439 4±0.017 8),(0.782 6±0.087 6), t=6.652, P=0.003]。两组外周血单个核细胞RNA中METTL3、FTO表达水平比较,AD组均小于对照组[METTL3:(0.387 8±0.020 3),(1.010 0±0.177 0), t=6.041, P=0.004;FTO:(0.442 8±0.037 1),(1.003 0±0.090 4), t=9.931, P=0.001]。两组外周血单个核细胞RNA中m6A水平比较,AD组小于对照组[(0.000 571±0.000 167)%,(0.002 514±0.001 284)%, t=6.041, P=0.004]。 结论:AD患者血浆和外周血单个核细胞中METTL3、FTO和m6A甲基化水平均下降,表明mRNA N6-甲基腺苷甲基化与AD的存在一定的关联。
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编辑人员丨4天前
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孕鼠暴露于射频电磁场对子鼠海马超微结构及神经生长因子的影响
编辑人员丨4天前
目的:探究孕鼠暴露于射频电磁场对子代大鼠海马超微结构和肥胖相关蛋白(FTO)及神经生长因子(NGF)水平的影响。方法:于2019年9月,选择36只健康7周龄Wistar大鼠,其中雌鼠24只(150~200 g),雄鼠12只(200~250 g)。雌雄鼠以2∶1比例于每晚18∶00合笼交配,涂片结果精子阳性为交配成功,当日作为孕0 d。将孕鼠随机分成3组实验组和3组对照组,每组4只。实验组分别给予1 800 MHz暴露、Wi-Fi暴露和1 800 MHz+Wi-Fi暴露,3个对照组给予虚拟暴露。每天12 h,连续21 d,分三批进行。暴露结束后,各组子鼠饲养到7周,透射电镜观察大脑海马超微结构变化,Western Blot法测定海马内FTO水平,ELISA法测定脑组织中的NGF水平。结果:透射电镜观察发现,1 800 MHz暴露组子代雌、雄大鼠海马组织胞核轻微收缩,胞质轻微水肿,雄鼠胞核明显不规则。Wi-Fi暴露组子代雌、雄大鼠海马组织胞核收缩较严重,胞膜不规则,胞质出现明显水肿。1 800 MHz+Wi-Fi暴露组子代雌、雄大鼠海马组织胞核均严重收缩,核膜不规则,胞质严重水肿。各组间比较,子代雌、雄大鼠FTO水平差异均无统计学意义( P>0.05)。与其他各组比较,1 800 MHz+Wi-Fi暴露组子代大鼠海马内的NGF含量明显升高( P<0.05)。 结论:射频电磁场孕期暴露可能会对子鼠海马组织的超微结构造成影响,且1 800 MHz+Wi-Fi叠加暴露可刺激海马内的NGF表达上调。
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编辑人员丨4天前
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Mettl3通过PI3K/AKT信号通路调控Ang Ⅱ诱导肾脏纤维化的机制研究
编辑人员丨4天前
目的:探讨甲基转移酶3(Mettl3)在血管紧张素Ⅱ(Ang Ⅱ)诱导周细胞向肌成纤维细胞转分化及肾脏纤维化过程中的作用及相关机制。方法:使用C57BL/6J小鼠,(1)细胞实验中,采用磁珠分选法培养纯化小鼠肾脏周细胞,并予以1×10 6 mmol/L的Ang Ⅱ诱导周细胞-肌成纤维细胞转分化,为Ang Ⅱ组;正常培养的周细胞为对照组。采用免疫荧光染色、蛋白质印迹(Western blot)及实时反转录PCR(RT-qPCR)检测α平滑肌肌动蛋白(α-SMA)以验证转分化成功。采用斑点印迹、RT-qPCR、Western blot检测N6-甲基腺苷(m6A)修饰水平及相关酶[Mettl3、Mettl14、Wilms肿瘤蛋白1相关蛋白(WTAP)、肥胖相关蛋白(FTO)、ALKB同源蛋白5(ALKBH5)、YTH结构域家族蛋白(YTHDF)1、YTHDF2、YTHDC1、YTHDC2、YTHDC3]的表达水平。采用慢病毒转染Mettl3 shRNA的方法抑制细胞中的Mettl3表达,为sh-Mettl3组、Ang Ⅱ+sh-Mettl3组;以转染慢病毒空载体作为阴性对照,为Ang Ⅱ+sh-NC组,观察Ang Ⅱ对周细胞转分化的影响,并检测下游磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)信号通路蛋白的表达,包括PI3K、AKT(丝氨酸磷酸化位点473)[p-AKT(S473)]、AKT(苏氨酸磷酸化位点308)[p-AKT(T308)]等。加入放线菌素D与各组周细胞共培养以抑制PI3K基因的转录,通过检测不同共培养时间残余PI3K mRNA表达量以计算PI3K mRNA半衰期。在Ang Ⅱ+sh-Mettl3组周细胞中加入AKT激动剂SC79,观察是否可逆转Mettl3抑制对Ang Ⅱ诱导周细胞-肌成纤维细胞转分化的作用。(2)动物实验中,分为假手术组(仅给予0.9%无菌生理盐水)、Ang Ⅱ组(泵入Ang Ⅱ溶液)、sh-Mettl3组(注射Mettl3 shRNA慢病毒溶液)、Ang Ⅱ+sh-Mettl3组(泵入Ang Ⅱ溶液+注射Mettl3 shRNA慢病毒溶液)、Ang Ⅱ+sh-Mettl3+SC79组(Ang Ⅱ+sh-Mettl3组处理基础上注射SC79),每组6只。手术前后采用尾夹法测定血压,术后4周测定血清肌酐、尿素含量及尿液白蛋白含量。28 d后取肾脏组织,采用苏木精-伊红(HE)及Masson三色法对组织切片进行染色,检测肾脏纤维化程度。 结果:(1)磁珠分选法可获得原代肾脏周细胞,以1×10 6 mmol/L的Ang Ⅱ处理周细胞48 h可成功诱导其向肌成纤维细胞转分化。斑点印迹结果显示,Ang Ⅱ组总RNA的m6A修饰水平高于对照组( P<0.05),RT-qPCR及Western blot结果显示,与对照组相比,Ang Ⅱ组中Mettl3 mRNA及蛋白表达水平上调( P均<0.05)。Ang Ⅱ+sh-Mettl3组细胞中的Mettl3蛋白表达水平低于Ang Ⅱ组,α-SMA、波形蛋白、肌间线蛋白、成纤维细胞激活蛋白a(FAPa)以及Ⅰ型胶原蛋白的表达水平亦低于Ang Ⅱ组( P均<0.05)。与对照组相比,Ang Ⅱ组的PI3K mRNA表达水平上调,且p-AKT(S473)和p-AKT(T308)蛋白高表达;Ang Ⅱ+sh-Mettl3组的PI3K mRNA表达水平低于Ang Ⅱ组,p-AKT(S473)和p-AKT(T308)蛋白表达下调( P均<0.05)。Ang Ⅱ+sh-Mettl3组的半衰期短于Ang Ⅱ+sh-NC组(2.34 h比3.42 h)。而Mettl3抑制对Ang Ⅱ诱导周细胞-肌成纤维细胞转分化的改善作用可被SC79逆转。(2)动物实验结果显示,与假手术组比较,Ang Ⅱ组小鼠的血压更高,血清肌酐、尿素及24 h尿蛋白测量值更高,纤维化面积更大( P均<0.05);而Ang Ⅱ+sh-Mettle3组的纤维化面积小于Ang Ⅱ组( P<0.05),但在加入SC79后肾脏纤维化又加重。 结论:Mettl3介导的RNA m6A表观遗传调控参与Ang Ⅱ诱导的肾脏周细胞-肌成纤维细胞转分化及肾脏纤维化,Mettl3可能通过影响PI3K的稳定性,进而影响PI3K/AKT信号通路发挥调控作用。
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编辑人员丨4天前
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肥胖相关基因在神经胶质母细胞瘤中的探索与展望
编辑人员丨4天前
胶质母细胞瘤是中枢神经系统常见的恶性神经上皮肿瘤,具有快速发展和高度耐药的特性。肥胖相关基因(FTO)作为N6-甲基腺苷修饰过程中最主要的去甲基化酶,与异柠檬酸脱氢酶之间存在紧密的联系,并广泛参与胶质母细胞瘤的发生、发展,其在肿瘤功能学、维持肿瘤干细胞的自我更新以及化疗耐药中发挥的作用仍有争议。本文通过生物信息学和目前的研究状况对FTO进行了初步阐述,并从能量代谢、小分子RNA调控和翻译后修饰3个角度对以后的研究进行展望。
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编辑人员丨4天前
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肥胖相关基因多态性与妊娠期糖尿病发病风险的关系
编辑人员丨4天前
目的:探讨肥胖相关( FTO)基因及多态性位点与妊娠期糖尿病(GDM)发病风险的关系,为GDM机制研究提供线索与依据。 方法:以2012年3月1日至2014年7月30日在山西医科大学第一医院产科分娩的孕妇为研究对象,将诊断为GDM的孕妇作为病例组,并按年龄、妊娠时间及居住地1∶1频数匹配非GDM孕妇作为对照组,最终纳入324例病例和318例对照,提取孕妇外周血DNA并进行基因分型,应用min P检验和非条件logistic回归分析 FTO基因及多态性位点与GDM发病风险的关系。 结果:min P法结果显示, FTO基因与GDM发病风险无关( P>0.05)。在调整糖尿病家族史、孕前BMI且调整多重比较后,非条件logistic回归分析结果显示,在 FTO基因的多态性位点中,携带rs11075995位点TT基因型与AA基因型孕妇相比( OR=0.59,95 %CI:0.35~0.89),携带rs3826169位点GG基因型与携带AA基因型孕妇相比( OR=0.59,95 %CI:0.35~0.88),携带rs74245270位点GA基因型( OR=0.69,95 %CI:0.49~0.98)、GA或AA基因型( OR=0.70,95 %CI:0.50~0.97)与GG基因型孕妇相比,均是GDM的保护因素;相反,携带rs74018601位点GA基因型( OR=1.51,95 %CI:1.07~2.12)、GA或AA基因型( OR=1.46,95 %CI:1.06~2.02)与GG基因型孕妇相比,携带rs7205009位点AA基因型( OR=1.83,95 %CI:1.18~2.86)、GA或AA基因型( OR=1.53,95 %CI:1.08~2.19)与携带GG基因型孕妇相比,携带rs9888758位点AG基因型与携带AA基因型孕妇相比( OR=1.43,95 %CI:1.02~2.00),均是GDM的危险因素。 结论:FTO基因rs11075995、rs3826169、rs74245270、rs74018601、rs7205009与rs9888758位点多态性与GDM的发病风险有关。
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编辑人员丨4天前
