目的:建立一种快速、灵敏、可视化的H7亚型禽流感病毒等温核酸扩增检测方法。方法:针对H7N9禽流感病毒的HA片段保守区序列设计引物、探针，优化反应温度，建立H7亚型禽流感病毒的重组酶聚合酶扩增结合侧流层析试纸条检测技术，评价其特异性和敏感性，并与Real time PCR方法进行比较。结果:该方法检测H7亚型禽流感病毒的最低检出限为20拷贝/μL，与其他流感/禽流感病毒无交叉反应，反应可在20~50℃温度范围内进行，临床样本检测结果与Real time PCR法一致性为100.0％。结论:该检测方法具有快速、特异及灵敏的特点，为在基层和现场快速检测H7亚型禽流感病毒提供了新的方法。

目的:开发用于甲型流感病毒快速分型的Taqman低密度芯片(Taqman low density array，TLDA)，可以同时开展甲型流感病毒通用、H1-H16及N1-N9亚型高通量快速鉴定，适用于流感样病例及禽流感标本中甲型流感病毒的快速分型鉴定。方法:设计甲型流感病毒通用、H1-16亚型、N1-9亚型的引物探针，并将其预先定制在TLDA反应芯片上；优化TLDA退火温度；用多种亚型的甲型流感病毒核酸进行10倍梯度稀释，结合微滴式数字PCR定量方法评价TLDA检测灵敏度；用乙型流感病毒、腺病毒、呼吸道合胞等其他多种常见的呼吸道病毒验证该TLDA检测特异性，同时选用多种已经明确分型的甲型流感病毒评价该TLDA的特异性和有效性；采集16例流感样病例标本及24例禽流感外环境标本用该芯片开展检测。结果:该TLDA的最佳退火温度为60 ℃；针对甲型流感病毒H1N1、H3N2、H5N6、H7N9和H9N2，其检测灵敏度为1.52~8.00拷贝/μl；能特异性检测甲型流感病毒，与其他常见呼吸道病毒无交叉反应，并能精准鉴定多种甲型流感病毒的亚型；应用该方法检测16例流感样病例标本和24例禽流感外环境监测标本，均可分型。结论:基于TLDA技术建立的甲型流感病毒高通量快速分型检测方法具有较好的灵敏度和特异性，适用于流感样病例和禽流感标本的病原快速检测，特别是对目前用常规商业化试剂尚无法鉴定的新型甲型流感病毒能够进行快速的亚型筛查与鉴定。

目的:为了解福建省禽类养殖业发达地区环境禽流感病毒的分布特征，对2021年12月至2023年12月地处山区的南平市禽类相关环境禽流感病毒分布开展调查。方法:采集2021年12月至2023年12月南平市禽类相关环境样本，运用实时荧光定量RT-PCR法进行甲型流感病毒核酸检测，对阳性样本进行H3、H5、H7、H9和H10亚型鉴定。应用SPSS 26.0软件分析不同时间、禽类相关场所、样本类型禽流感病毒的分布特征和差异性。结果:2021年12月至2023年12月，南平市禽类相关环境样本甲型流感病毒阳性率为49.16%(1 435/2 919)，其中H3、H5、H9、H10亚型阳性率分别为0.72%(21/2 919)、9.42%(275/2 919)、33.20%(969/2 919)、0.89%(26/2 919)，H7亚型未检出，混合型(含一种以上亚型)阳性率6.51%(190/2 919)，未分型(甲型流感病毒检测阳性但H3/5/7/9/10均为阴性)阳性率11.58%(338/2 919)。甲型流感病毒阳性率高峰主要出现在秋冬季(9月至次年2月)，活禽市场和屠宰场的甲型流感病毒、H9亚型、混合型以及未分型阳性率显著高于养殖场，禽饮用水、粪便样本的甲型流感病毒阳性率较高，阳性样本以H9亚型居多。结论:南平市禽类相关环境中禽流感病毒阳性率以秋冬季为高；病毒在禽饮用水和粪便样本中的阳性率更高，并且在活禽市场与屠宰场等多种禽类聚集的场所呈现更高的多样性。

禽流感病毒通常在野生鸟类和家禽中传播，但也可感染人类和其他哺乳动物。可感染人类的禽流感病毒主要有H3、H5、H6、H7和H9等亚型。2024年1月27日，中国安徽出现一例人合并感染H10N5亚型禽流感病毒和季节性H3N2流感病毒确诊病例。这是全球报告的首例人感染H10N5亚型禽流感病毒病例。该患者死前曾接触过活禽，而家禽样本经检测也呈H10N5阳性。在全球范围内，H3N2亚型感染最为普遍，与H10N5合并感染可能会增加死亡率。全球家禽养殖场数量庞大，这大大增加了人与禽类的接触，而病毒可以通过直接或间接接触被感染的禽类或鸟类传播。H10N5和H3N2合并感染可能对公共卫生构成全球性风险，而人群中尚未形成针对此种合并感染的免疫力，这可能会迅速升级为严重的全球大流行。此外，禽流感病毒在禽类中的固有储存库将持续加剧对公共卫生的威胁。接种流感疫苗、做好个人防护以及定期对禽类相关场所进行清洁、消毒等措施可以有效预防人感染禽流感病例发生。

上海市CDC试点实施了成年人急性呼吸道感染综合监测，对流感样病例（ILI）和严重急性呼吸道感染（SARI）开展主动监测和多种呼吸道病原体的检测鉴定。在2019年172例ILI中以流感病毒感染为主，其中新甲型H1N1型、H3N2亚型和B/V亚型流感病毒的检出阳性率分别为30.81%、14.53%和30.55%，新甲型H1N1型的流行高峰为第一季度。肠道病毒/人鼻病毒总检出阳性率为6.40%，高峰在第三季度。腺病毒总检出阳性率为4.65%，高峰在第二季度。人类冠状病毒OC43型2份、HKU1型和NL63型各1份、229E型未检出；金黄色葡萄球菌检出率为17.44%，肺炎克雷伯菌检出率为9.88%；1 447例SARI病例也以流感病毒感染为主，其中新甲型H1N1型、H3N2和B/V亚型流感病毒的检出率分别为5.46%、1.73%和0.30%，新甲型H1N1型流感流行高峰也为第一季度，检出阳性率为17.50%。肠道病毒/人鼻病毒总检出阳性率为2.97%，高峰在第一季度。肺炎支原体检出阳性率为3.25%，军团菌检出阳性率为1.04%。检出人类冠状病毒229E型5份、OC43型10份、HKU1型7份、NL63型6份；细菌培养检出金黄色葡萄球菌8株，铜绿假单胞菌4株，肺炎克雷伯菌3株。通过开展主动监测，不仅发现了个别少见的新发传染病如人感染H7N9禽流感病例，同时也初步掌握了上海市急性呼吸道感染病例的流行病学特征、病原谱特征及其季节性变化趋势。近年来，通过逐步增加监测哨点医院，不断改进监测方法，尤其是在应对新型冠状病毒肺炎过程中在全市推广了基于医院HIS系统的监测信息上报系统，初步建立了覆盖全市的急性呼吸道感染综合监测网络，为开展新发呼吸道传染病主动监测预警打下了基础。

目的:分析2017—2021年福建省外环境禽流感病毒流行特点，为禽流感防控、预测工作提供参考。方法:在福建省6地市监测点的4类禽类相关不同场所进行6类不同类型标本的采样，采用荧光定量PCR法对环境标本进行A型、H5、H7和H9亚型核酸检测，并采用流行病学方法对检测结果进行分析。结果:2017—2021年共采集6个监测点标本4 214份，其中A型禽流感病毒阳性率为41.53%(1 750份)，H5、H7和H9亚型阳性率分别为2.33%(98份)、1.16%(49份)和23.16%(976份)，H5+H7亚型阳性率为0.05%(2份)，H5+H9亚型阳性率为1.83%(77份)，H7+H9亚型阳性率为0.83%(35份)，H5+H7+H9亚型阳性率为0.09%(4份)，A型阳性未分型的阳性率为12.08%(509份)。不同检测场所和不同类型标本A型阳性率的差异具有统计学意义( χ2＝517.57, P<0.001; χ2＝51.58, P<0.001)：城乡活禽市场的禽流感病毒阳性率最高(49.72%)；不同类型标本中笼具表面擦拭标本(48.09%)、清洗禽类的污水(47.34%)和宰杀或摆放禽肉案板表面(45.66%)的阳性率较高。不同地区监测点的A型阳性率差异具有统计学意义( χ2＝458.34, P<0.001)：A型阳性率最高和最低的地市分别是三明市(56.00%)和漳州市(3.34%)。在时间分布方面，冬春季(11月至次年2月)和夏季(6~8月)的阳性率较高。 结论:福建省禽流感病毒总体阳性率较高，以H9亚型为主，应重点加强冬春季和夏季禽流感病毒的监测，加强对城乡活禽市场的监管力度。

目的:研究2017—2018年佛山市活禽交易市场禽流感病毒检出率、混合流行情况和基因变异分析，评估活禽市场禽流感的潜在风险。方法:采用荧光PCR检测2017年4月至2018年3月间1 440份活禽交易市场环境监测标本，对部分H9N2阳性标本进行血凝素（hemagglutinin，HA）全长测序，结合采集时间、采集地点、标本种类和基因进化情况综合分析。结果:1 440份标本中甲型流感阳性422份。阳性标本中检出H9N2单独阳性标本213份（213/422，50.47%），混合阳性标本38份（38/422，9.00%）。H5N6单独阳性标本44份（44/422，10.43%），混合阳性标本26份（26/422，6.16%）。H7N9单独阳性标本4份（4/422，0.95%），混合阳性标本16份（16/422，3.79%）。来自外环境标本混合阳性检出率明显高于来自活禽标本（14.7% vs 1.75%， x2=20.10， P<0.01），零售市场混合阳性检出率高于批发市场但无明显差异（13.46% vs 8.18%， x2=1.97， P=0.1602）。9株测序的H9N2标本HA基因序列与国内疫苗株共同处于h9.4.2亚分支上。 结论:H9N2亚型禽流感病毒在佛山市活禽市场中存在比例较高，是与其他禽流感病毒混合感染率最高的亚型，后期应重点监测。

目的:对活禽市场家禽中分离的H5N6禽流感病毒(avian influenza virus, AIVs)进行遗传进化和分子特征分析。方法:2018年12月于乌鲁木齐市活禽市场采集家禽双腔拭子和环境样本，通过接种鸡胚、血凝试验和RT-PCR等方法分离鉴定AIVs，以甲型流感病毒通用引物扩增病毒全基因组并测序，利用BLAST、Clustal W、MEGA-X和DNAStar等软件进行序列比对、系统进化和分子特征分析。结果:从家禽样品中分离到6株H5N6亚型AIVs，其各基因之间的一致性较高(99.4%～100.0%)，为同一来源。BLAST分析显示除 NP基因与苏州家禽中分离的H5N6毒株一致性最高(99.7%)，其余7个基因片段均与2017—2018年广东环境中分离的H5N6毒株一致性最高，在99.0%～100.0%之间。遗传进化分析显示分离株的 HA属于Clade2.3.4.4.C分支， HA、 NA、 PB1、 PA、 NP、 MP这6个基因均与2018年自华东地区水貂中分离的H5N6病毒株聚在同一分支， PB2和 NS均与2017—2018年于广东环境中分离的H5N6病毒株聚在一起。分离株HA的裂解位点含多个连续的碱性氨基酸，为高致病性AIV， HA的S137A和T160A突变可增强病毒与人源受体SAα2，6-Gal的结合。另外， NA茎部缺失、 PB2的L89V、G309D、R477G、I495V、I504V、D391E和A661E以及 NS1的P42S、D92E和80～84位氨基酸缺失等突变均可增强病毒对哺乳动物的毒力和致病力。 结论:分离的6株高致病性H5N6 AIVs与2017—2018年分离自华东地区水貂和广东环境的H5N6 AIVs的遗传关系较近，存在的多个突变可增强病毒对哺乳动物的致病性，存在较大的公共卫生风险。

目的:通过对2021—2022年北京市通州区农贸市场的外环境及相关人员标本的禽流感病毒检测结果及基因特征分析，为我市禽流感防控策略提供依据。方法:2021—2022年共采集外环境及食品涂抹标本2 184例，相关人员咽拭子标本124例。利用实时荧光RT-PCR法对标本进行核酸检测，采用illumina二代测序平台对病毒载量高的阳性标本进行全基因组测序，分析其基因特征。结果:实时荧光RT-PCR核酸检测结果显示，外环境及食品涂抹标本检出2例H5N8阳性、78例H7N9阳性、177例H9N2阳性、2例H5N8和H9N2共感染、1例H7N9和H9N2共感染，124例人员标本检测结果均为阴性。对病毒载量高的阳性标本进行全基因组测序分析，1例H5N8病毒的HA基因属于为2.3.4.4分支，HA基因的HA0裂解位点序列为多个连续性碱性氨基酸（REKRRKR/ GLF），2例H7N9病毒的HA基因与Yangtza river delta属于同一分支，HA基因的HA0裂解位点序列为多个连续性碱性氨基酸（VPKRKRTAR/GLF），均属于高致病性禽流感病毒。遗传进化树分析提示，H5N8和H7N9的HA基因与国内报道的病毒株亲缘关系较近。结论:农贸市场是禽流感病毒分布的主要场所，高致病性及低致病性禽流感病毒同时空交叠感染现状，提示应加强禽流感病毒的监测防控工作及防范知识的宣传。

目的:描述增城区2019年1月至2020年6月年农贸市场中禽流感病毒的污染特征，分析新冠疫情暴发对禽流感病毒市场污染的影响。方法:在增城区各街镇农贸市场中抽检禽流感病毒核酸，A型流感病毒阳性的再进行H5、H7、H9分型，采用SPSS26.0进行统计描述。结果:共检测了1 978份环境样本，A型流感病毒阳性率为31.24%（618/1 978），其中H9亚型占92.07%（569/618）；2019年与2020年的阳性率无统计学差异（ x2=0.052， P=0.082）；不同类型样本中脱毛机内壁的阳性率最高（44.08%），冰柜（箱）内壁最低（13.33%）。 结论:污染增城区农贸市场的禽流感病毒优势亚型为H9，与活禽直接接触的样本更易检出禽流感病毒。新冠肺炎暴发后环境禽流感病毒阳性率与疫情暴发前没有差异，建议加强对农贸市场的监管力度。