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Hunter综合征家系的临床表型、遗传学特征及永生化细胞系的构建
编辑人员丨1周前
目的:探讨1个Hunter综合征家系的临床表型和遗传学特征,并为其构建永生化类淋巴母细胞系。方法:选取2022年7月就诊于西安市儿童医院的1例Hunter综合征患儿及其家系成员(2代共6人)作为研究对象。回顾性分析患儿的临床资料,对其进行家系全外显子组测序,对候选变异进行Sanger测序家系验证,并进行生物信息软件分析。通过EB病毒转染构建患儿及其父母的外周血B淋巴细胞永生化细胞系并进行酶活性分析。结果:患儿为5岁7月龄男性,表现为手足关节不能伸直、四肢关节大,3月龄出现疝气、舟状头、桶状胸等。患儿的舅舅表现为四肢关节不能伸直、听力差、失明、右侧腹股沟斜疝等。基因检测显示患儿及其舅舅均携带 IDS基因(NM_000202.8)c.823G>A(p.D275N)变异。生物信息学分析表明,D275是一个具有高度保守性的位点,D275N变异可能会影响蛋白质空间构象的稳定性,从而降低酶的催化活性。患儿及其父母的永生化类淋巴母细胞系在构建过程中细胞体积增大、呈不规则形状,周围存在毛刺状结构和聚团生长。患儿永生化类淋巴母细胞的IDS酶活值低于检测限。根据美国医学遗传学和基因组学学会(ACMG)相关指南, IDS: c.823G>A(p.D275N)被评级为可能致病变异(PS3+PM2_Supporting+PM5+PP1+PP3)。 结论:IDS:c.823G>A考虑为该Hunter综合征患儿手足关节不能伸直、四肢关节大的遗传学病因。永生化细胞系的构建为进一步研究上述变异对IDS功能的影响提供了细胞模型。
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编辑人员丨1周前
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艾杜糖-2-硫酸酯酶活性测定在黏多糖贮积病Ⅱ型产前诊断中的应用
编辑人员丨1周前
目的:评估黏多糖贮积病Ⅱ型(MPSⅡ)高危孕妇胎儿绒毛和孕妇外周血血浆艾杜糖-2-硫酸酯酶(IDS)活性以及基因分析在MPSⅡ产前诊断中的应用。方法:回顾性分析2013年2月至2020年12月在广州市妇女儿童医疗中心进行产前诊断的23例MPSⅡ高危孕妇的酶学检测及基因分析结果,采用人工底物荧光法检测胎儿绒毛(30例)和血浆(28例)IDS酶活性,以非高危妊娠孕妇的28例绒毛和34例血浆检测值为对照,绒毛同时送检基因检测和胎儿性别鉴定。组间比较采用独立样本 t检验。 结果:非MPSⅡ高危孕妇胎儿绒毛和血浆IDS活性正常参考值为绒毛(71.2±23.4) nmol/(mg·4 h),血浆(611.1±114.5) nmol/(mL·4 h);30例高危胎儿绒毛中8例男性受累胎儿绒毛IDS酶活性为(1.7±0.3) nmol/(mg·4 h),显著低于11例男性非受累胎儿[(83.2±6.3) nmol/(mg·4 h)]和9例女性非携带者胎儿[(80.0±7.5) nmol/(mg·4 h)]( t=10.8、8.8,均 P<0.01)。28份MPSⅡ高危孕妇外周血血浆IDS酶活性中8例受累男性胎儿孕母外周血IDS酶活性(225.4±20.5) nmol/(mL·4 h),显著低于男性胎儿非受累孕母IDS酶活性[(451.0±15.1) nmol/(mL·4 h)]和女性非携带者胎儿孕母IDS酶活性[(467.7±45.3) nmol/(mL·4 h)]。30例MPS Ⅱ高危胎儿绒毛中找到已知致病性突变8例,突变位点分别为c.1048A>C、c.212G>A、c.514C>T、c.257C>T、c.425C>T、c.998C>T,其中6例IDS酶活性显著降低,均为男性受累胎儿,另2例IDS酶活性正常,为女性携带者胎儿。 结论:孕妇外周血血浆与绒毛IDS酶活性及基因结果有很好的相符性,对孕早期产前诊断MPS Ⅱ有重要参考价值;当先证者未找到基因突变或新突变的致病性尚不清楚时可单独检测绒毛酶活性进行产前诊断MPS Ⅱ。
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编辑人员丨1周前
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全外显子测序对二例黏多糖贮积症的遗传病因研究
编辑人员丨1周前
目的:对2例黏多糖贮积症(mucopolysaccharidosis,MPS)患者进行全外显子测序以明确其遗传病因。方法:采集2例MPS患者及家属外周血提取基因组DNA,采用全外显子组测序进行基因检测,寻找致病位点。对全外显子测序筛选出的致病基因进行Sanger测序、生物信息学分析及家系验证,并应用RT-PCR进一步明确剪切突变对于mRNA的影响。结果:先证者1为25岁男性,基因检测发现该患者携带α-L-艾杜糖苷酶(IDUA)基因复合杂合突变:p.T179R及p.S633L,诊断为MPSⅠ型。其母亲和姐姐携带杂合突变p.T179R,其父携带杂合突变p.S633L,符合常染色体隐性遗传。先证者2为3岁男性,基因检测发现该患者携带艾杜糖醛酸硫酸酯酶(IDS)基因IVS 6-8A>G剪切突变,其母亲和外祖母均为IVS 6-8A>G杂合突变携带者,临床表型正常,符合X-性连锁遗传病,诊断为MPSⅡ型。RT-PCR产物序列分析显示IDS基因IVS 6-8A>G剪切突变激活了内含子6区域上游的隐藏剪切位点,导致外显子7中插入7个核苷酸,引起框移及肽链截短。结论:本研究在2例MPS患者中通过外显子测序分别发现了IDUA p.T179R、p.S633L及IDS IVS 6-8A>G突变,进一步扩展了MPS的突变和表型谱。
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编辑人员丨1周前
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Ⅱ型粘多糖贮积症致病基因 IDS内含子中一个新的RNA剪切变异
编辑人员丨1周前
目的:对1个粘多糖贮积症Ⅱ型(mucopolysaccharidosis Ⅱ,MPSⅡ)家系的艾杜糖-2-硫酸酯酶(iduronate-2-sulfatase, IDS)基因进行变异分析,探讨其分子遗传学发病机制。方法:应用高通量测序和Sanger测序技术对先证者进行基因变异分析,基因变异确定后,对其母亲、父亲进行致病基因位点确认,确定变异基因的遗传关系;应用逆转录-聚合酶链反应检测变异对mRNA的影响。结果:先证者 IDS基因存在IVS1-3T>G半合子变异,导致变异等位基因产生了两种转录本,一种转录本保留了第1内含子的3′端c.104-216到c.104-1的216个核苷酸,并提前出现终止密码,导致肽链从550个氨基酸截短至38个;另一种转录本缺失了第2外显子5′端c.104-c.212的109个碱基,产生移码变异,IDS肽链由550个氨基酸缩短至92个。先证者为IVS1-3T>G变异的半合子,而其母亲为IVS1-3T>G变异的杂合子;其他家系成员及100名正常对照则未见该变异。 结论:IDS基因的IVS1-3T>G变异导致 IDS基因表达异常,进而引起IDS蛋白异常,从而成为该粘多糖贮积症Ⅱ型患者的致病原因。
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编辑人员丨1周前
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一例黏多糖贮积症Ⅱ型患儿的临床特点及 IDS基因变异分析
编辑人员丨1周前
目的:总结1例罕见的黏多糖贮积症Ⅱ型(mucopolysaccharidosis type Ⅱ,MPS Ⅱ)患儿的临床特点及基因检测结果。方法:分析患儿的临床特点、酶学、相关代谢产物及家系 IDS基因变异检测的结果。 结果:患儿表现为全面发育迟缓、粗犷面容、反复呼吸道感染、听力下降、腹股沟斜疝、肝脾肿大、骨骼畸形等。尿黏多糖明显升高,尿硫酸皮肤素阳性,白细胞IDS酶活性显著降低。基因检测提示患儿携带 IDS基因c.676C>G变异,遗传自母亲。 结论:患者被确诊为MPS Ⅱ, IDS基因c.676G为其致病变异,既往未见报道。基因分析结合酶学分析是MPS诊断分型的有效方法。
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编辑人员丨1周前
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基于网络药理学及分子对接探讨黄柏调控铁死亡治疗类风湿关节炎的作用机制
编辑人员丨1周前
目的:基于网络药理学分析黄柏通过铁死亡途径治疗类风湿关节炎(RA)的可能作用机制。方法:通过TCMSP数据库、Herb数据库筛选黄柏的主要活性成分及其对应的靶点蛋白,并使用Uniprot数据库将靶点蛋白名称转化为基因ID。在GenCards、OMIM、DrugBank、DisGeNET数据库中获取RA疾病靶点。利用FerrDb数据库收集铁死亡在激动物、抑制物和标志物3方面的基因。然后,利用Venny平台获取黄柏活性成分靶点基因、RA靶点基因和铁死亡相关基因的交集基因,并使用Cytoscape 3.9.1软件绘制"活性成分-靶点-RA-铁死亡"网络图。使用String和DAVID数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)、基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。使用PyMOL、AutoDock Vina软件和RCSB PDB数据库对活性成分与关键基因进行分子对接。结果:共筛选出11个黄柏活性成分(槲皮素、β-谷固醇、苦楝酮、烛毒素A、黄柏呈、掌叶大黄二蒽酮A、黄连宁、鬃毛酮、Kihadalactone A、尼洛替星、豆甾醇)和34个交集基因(PTGS2、AR、JUN、PRKCA、TGFB1、EGFR、CDKN1A、MAPK1、RB1、IL6、TP53、HIF1A、HSPA5、HMOX1、CAV1、IFNG、ALOX5、PTEN、NFE2L2、PARP1、PPARA、GSTM1、MTOR、PIK3CA、MDM2、MAPK8、GSK3B、SIRT1、DHODH、EZH2、AKR1C2、AKR1C1、STAT3、MAPK3)。预测得到TP53、JUN、STAT3、HIF1A、PTEN、SIRT1、EGFR、MTOR、MAPK3、AR 10个黄柏调控铁死亡抗RA的可能作用靶标,介导细胞对氧化应激的反应、对药物的反应、HIF-1、FoxO和ErbB等信号通路调控铁死亡途径,从而对抗RA的发生及进展。对接结果显示,关键基因与其对应的黄柏活性成分间存在分子结合位点。结论:黄柏可能通过铁死亡效应以多成分、多靶点、多通路、多种作用机制治疗RA。
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编辑人员丨1周前
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一个黏多糖贮积症Ⅱ型家系的IDS基因致病变异特征分析
编辑人员丨1周前
目的:鉴定1个黏多糖贮积症Ⅱ型(mucopolysaccharidosis type Ⅱ,MPS Ⅱ)家系的遗传变异,并对变异位点艾杜糖醛酸-2-硫酸酯酶(IDS):c.323A>C进行功能学研究。方法:收集中国北方地区1个五代83名个体的MPS Ⅱ家系,其中包括4例患者。通过尿液黏多糖、Alder-Reilly小体检测对该病进行辅助诊断,并对核心家系成员进行IDS酶活性检测;通过对MPS Ⅱ家系患者进行全外显子组测序及生物信息学分析,筛选出该家系候选变异位点,并通过PCR-Sanger测序进一步确定变异位点。最后,针对致病基因变异位点,将野生型IDS过表达质粒(pCMV-hIDS-WT)及携带突变位点的IDS过表达质粒(pCMV-hIDS-c.323A>C)分别转染COS-7细胞,进行IDS酶活性检测。结果:先证者(Ⅳ3)及Ⅳ4经尿液黏多糖、Alder-Reilly小体及IDS酶活性检测诊断为MPS Ⅱ,Ⅳ3、Ⅳ4、Ⅲ19和Ⅲ32基因检测均携带IDS:c.323A>C错义变异,确诊为MPS Ⅱ患者;并有8名个体为IDS:c.323A>C错义变异携带者,Ⅱ2、Ⅱ4、Ⅱ8、Ⅱ12、Ⅱ14、Ⅲ5、Ⅲ7、Ⅳ14排除MPS Ⅱ诊断。COS-7细胞体外实验结果显示,该错义变异可导致IDS酶活性显著降低。结论:本研究确定了IDS:c.323A>C:p.Y108S在体内和体外均可导致IDS酶活性显著降低,判定为MPS Ⅱ的致病性变异。
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编辑人员丨1周前
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1例 IDS基因新发变异位点致黏多糖贮积症Ⅱ型
编辑人员丨1周前
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编辑人员丨1周前
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基于m 6A相关lncRNA的女性肺腺癌预后风险模型
编辑人员丨1周前
目的:建立m 6A相关长链非编码RNA(lncRNA)女性肺腺癌患者的预后风险模型,并分析有代表性的m 6A相关lncRNA在女性肺腺癌患者治疗和预后中的作用。 方法:从TCGA数据库下载女性肺腺癌患者的RNA表达数据(291例肿瘤组织和34例正常组织)和临床数据(280例)。采用limma包分析23个m 6A甲基化修饰基因的表达情况。根据TCGA上关于基因集合ID的说明,检索并收集女性肺腺癌lncRNA表达的数据。从GENCODE下载m 6A调节基因的转录组学数据。采用共表达相关性分析筛选m 6A相关lncRNA。采用limma包对筛选的m 6A相关lncRNA进行差异分析。采用survival、Cox回归分析包进行Kaplan-Meier、单因素和多因素Cox回归分析、受试者操作特征曲线[曲线下面积(AUC)>0.65]分析,进一步筛选预后lncRNA。选取AUC最大的lncRNA(AP001981.2)作为代表性的m 6A相关lncRNA,用于确认预测特征。采用rms包,通过将AP001981.2表达水平与年龄和临床分期相结合建立列线图。采用校准曲线检验预测与现实之间的一致性。按照AP001981.2的logFC进行分组,logFC>0为高表达组(131例),logFC<0为低表达组(131例)。采用oncoPredict包进行2组患者的药物敏感性分析。通过enrichplot包行基因集富集分析,探讨AP001981.2的参与通路。 结果:23个m 6A调节器分子中有15个基因差异表达,其中有6个基因表达下调,9个基因表达上调。共识别了16 876个lncRNA,并鉴定出了2 910个m 6A相关lncRNA,其中有1 156个差异表达m 6A相关lncRNA。经Kaplan-Meier、单因素Cox回归分析筛选,共有17个与女性肺腺癌患者预后相关的lncRNA。多因素Cox分析显示有10个lncRNA可作为独立预后因子,其中9个lncRNA可作为独立危险因子(AL157931.1、AL359853.1、AC007128.1、AC005618.1、LINC01138、AC103591.4、AP001981.2、AC243772.2和AC078983.1),1个lncRNA可作为独立保护因子(AC018529.1)。选择AUC最大(0.736)的AP001981.2作为代表性的m 6A相关lncRNA。构建了预测女性肺腺癌患者1、3、5年生存率的列线图,校准图显示列线图预测与实际观察之间的良好一致性。低表达组和高表达组患者对11种药物(UMI-77、BMS-754807、AZD8055、Sabutoclax、Entinostat、PRT062607、ABT737、WEHI-539、Doramapimod、Elephantin、GSK269962A)的敏感性比较,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。AP001981.2参与α-亚麻酸代谢、致心律失常性右心室心肌病、胰岛素信号通路、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号通路和血管平滑肌收缩相关代谢通路。 结论:构建了一个m 6A相关lncRNA女性肺腺癌预后风险模型。AP001981.2作为代表性的m 6A相关lncRNA参与肿瘤相关通路,是潜在的治疗靶点,也是女性肺腺癌预后的独立危险因子。
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编辑人员丨1周前
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黏多糖贮积症Ⅱ型临床诊断与治疗专家共识
编辑人员丨1周前
黏多糖贮积症(MPS)Ⅱ型是一种X连锁隐性遗传的罕见病,由IDS基因变异导致艾杜糖醛酸-2-硫酸酯酶活性缺乏,造成硫酸皮肤素和硫酸类肝素在各组织器官的溶酶体中贮积,引起细胞和组织结构、功能改变,进而导致多器官、多系统功能异常。本病诊断需结合临床表现、影像学检查及多种检测结果(尿酸性黏多糖、酶活性、基因分析)等对患儿进行综合诊断。中华医学会儿科学分会内分泌遗传代谢学组以循证医学为基础,结合我国现阶段临床经验,为提高医务工作者对MPSⅡ型的认识,推动MPSⅡ型的规范化诊断和治疗,特制定本共识。
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编辑人员丨1周前
