目的:通过生物信息学分析方法来识别腹主动脉瘤破裂相关基因与高血压差异基因，筛选出共同关键基因并建立腹主动脉瘤破裂的分子诊断模型。方法:所有样本数据均从基因表达综合数据(GEO)下载。对36例样本(高血压组28例，对照组8例，2015年由法国图卢兹大学心脏病研究所测序获得)的全转录组数据进行差异分析以得到差异基因；对48例腹主动脉瘤样本(17例破裂，31例未破裂，2017年由德国慕尼黑大学检验医学研究所测序获得)的转录组数据进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)来识别与腹主动脉瘤破裂最为相关的基因模块。随后对得到的基因取交集并利用机器学习算法(Lasso回归)筛选出腹主动脉瘤破裂的关键基因。利用关键基因构建诊断模型并采用受试者工作特征(ROC)曲线计算诊断模型的ROC曲线下面积(AUC)。该研究中利用未配对的学生 t检验和Wilcoxon检验来比较两组间的差异。 结果:对高血压组及对照组样本进行差异分析共得到444个差异基因。对腹主动脉瘤样本利用WGCNA显示当软阈值为7时符合无尺度网络，淡绿色模块正相关性最高，包含848个基因。将444个基因与848个基因取交集共得到28个基因。利用Lasso回归对28个基因进行筛选，共得到4个关键基因(MAP2K1、KLF9、UTP4、RHOU)。利用这4个基因构建诊断模型来预测患者是否容易发生动脉瘤破裂。利用ROC曲线评估该诊断模型预测腹主动脉瘤破裂的效能，发现曲线下面积为0.825。结论:利用MAP2K1，KLF9，UTP4，RHOU构建的诊断模型有助于腹主动脉瘤破裂的预测。

脓毒症（sepsis）是指机体对感染的反应失调而导致危及生命的器官功能障碍 [1]。全球每年估计有4900万例脓毒症病例，病死率高达22.45%，是造成死亡的常见感染并发症之一 [2]。近年来研究发现，脓毒症进展过程中常诱发失控的炎症反应与免疫功能抑制 [3,4]，提示基于对脓毒症免疫学特征的认识可能有助于脓毒症的诊断、治疗和预后评估。Krüppel样因子4（Krüppel-like factor 4, KLF4）是一种高度保守的含锌指的核转录因子 [5]，通过与靶基因启动子区的GC盒、CACCC盒和基础转录元件等相结合 [6]，激活或抑制多种基因的转录活性，由此参与调控细胞增殖和分化过程，发挥促进伤口愈合、骨骼发育、精子发生、维持遗传稳定性等作用 [7]；并通过调控巨噬细胞极化 [8,9]、炎症介质释放 [6,10,11,12,13]、血管平滑肌细胞表型转换 [14,15]、氧化应激损伤 [16]、细胞凋亡 [17]与自噬 [18,19]等参与炎症反应。鉴于KLF4在免疫细胞分化成熟及炎症反应中的重要调控作用，本文拟综述其参与脓毒症病理生理过程的潜在意义与可能机制，以期为脓毒症治疗提供新思路。

Krüppel样因子(KLF)在肿瘤的发生发展中发挥极其重要的作用，同时KLF家族被证实影响肝癌细胞的增殖、分化和迁移。KLF家族中有9名成员(KLF2、KLF4、KLF5、KLF6、KLF8、KLF9、KLF10、KLF14和KLF17)可作为癌基因或抑癌基因以多种方式参与肝癌的发生发展，并有望成为肝癌的生物学治疗靶点。

目的 探讨口腔癌患者癌组织Krüppel样因子5(KLF5)、赖氨酸去甲基化酶2A(KDM2A)表达与临床病理特征及预后的关系.方法 回顾性收集2015年1月至2018年1月在自贡市第一人民医院进行手术治疗的80例口腔癌患者癌组织作为研究对象,另选取正常癌旁组织作为对照.采用免疫组织化学染色法检测口腔癌患者癌组织及癌旁组织KLF5和KDM2A表达情况,并采用Spearman相关性分析癌组织KLF5和KDM2A表达的相关性.收集口腔癌患者临床病理特征资料,分析癌组织KLF5和KDM2A表达情况与患者临床病理特征的关系,以及经多因素Cox回归分析口腔癌患者预后的影响因素,并进一步采用Kaplan-Meier法分析KLF5和KDM2A表达情况与口腔癌患者预后的关系.结果 口腔癌患者癌组织KDM2A和KLF5高表达率显著高于癌旁组织KDM2A和KLF5高表达率,差异有统计学意义(P＜0.05).Spearman相关性分析结果显示,口腔癌患者癌组织KLF5和KDM2A表达呈正相关(r=0.375,P＜0.05).口腔癌患者KLF5和KDM2A表达与TNM分期、临床分期、有无淋巴结转移、有无局部浸润和分化程度有关(P＜0.05).多因素Cox回归分析结果显示,KLF5、KDM2A表达水平、TNM分期、淋巴结转移、局部浸润和分化程度均为口腔癌患者预后不良的独立危险因素(P＜0.05).癌组织KLF5、KDM2A高表达患者5年生存率[依次为38.88％(21/54)、42.37％(25/59)],均低于癌组织KLF5、KDM2A低表达患者5年生存率[依次为65.38％(17/26)、61.90％(13/21)],差异有统计学意义(x2=6.554、4.046,P＜0.05).结论 口腔癌患者癌组织KLF5和KDM2A呈高表达且影响患者预后.

为了进一步解析鱼类在高原低氧环境下的适应性进化机制,确定相关基因KLF17是否在红细胞发育过程中发挥功能.将高原裂腹鱼亚科鱼类的代表物种——花斑裸鲤(Gymnocypris eckloni)作为实验对象,以实验室前期花斑裸鲤全基因组测序数据为基础,鉴定出红细胞发育相关基因KLF17启动子序列,以其启动子DNA为诱饵,对花斑裸鲤肾脏组织蛋白进行筛选,采用LC-MS/MS技术对候选结合蛋白进行鉴定分析,并进行生物信息学分析.结果表明,在花斑裸鲤肾脏组织中共筛选到576个与KLF17启动子区域特异性结合的蛋白,去除未能鉴定到的蛋白,共有306个候选结合蛋白,其中包括真核翻译起始因子2、细胞色素P450酶、转铁蛋白、含I型血小板结合蛋白基序的解聚蛋白样金属蛋白酶、丙酮酸脱氢酶、红细胞膜蛋白带4.1蛋白等与红细胞或造血相关的蛋白.GO功能富集分析表明,这些候选结合蛋白涉及多种生物学功能,包括参与细胞生长、细胞周期、免疫反应、信号传导、核酸与转录因子结合等过程.KEGG通路分析表明,以上蛋白参与多条信号通路,包括氨基酸代谢通路、细胞凋亡信号通路、PPAR信号通路、Hippo信号通路、细胞色素P450代谢信号通路、HIF-1信号通路及神经营养因子信号通路等.研究筛选出的KLF17启动子候选结合蛋白主要有参与红细胞发育相关的真核翻译起始因子2、细胞色素P450酶、转铁蛋白等,经过功能分析发现它们参与HIF-1信号通路,通过调控血红素、珠蛋白基因表达、铁代谢、血管生成、糖酵解等途径激发红细胞的生成与发育,提示KLF17在转录水平上参与调控红细胞中血红素、铁和珠蛋白间的相互作用,为红细胞分化机制研究提供重要信息.同时,转铁蛋白作为参与铁和氧调节的交叉调控因子,它能够促进血液中铁的运输和增强血氧的结合能力,使得机体在低氧环境中长期生存,这也揭示了花斑裸鲤的低氧适应机制与HIF-1下游的转铁蛋白有关.研究可对下一步验证该蛋白与KLF17的互作机制提供研究基础,为解析高原土著鱼类造血系统发育和低氧环境适应性进化的分子机制提供科学数据.

背景:铁死亡与骨关节炎发生、发展密切相关,但具体特征基因及调控机制尚不清楚.目的:运用WGCNA及多种机器学习方法识别骨关节炎铁死亡特征基因及免疫浸润分析.方法:从GEO数据库下载骨关节炎相关数据集,同时在FerrDb网站中获取铁死亡相关基因,采用R语言对骨关节炎数据集进行批次校正、提取骨关节炎铁死亡基因并进行差异分析,对差异基因进行GO功能及KEGG信号通路分析;同时运用WGCNA分析及机器学习(随机森林、LASSO回归及SVM-RFE分析)筛选骨关节炎铁死亡特征基因,并进行体外细胞实验,将软骨细胞分为正常组和骨关节炎组,运用数据集及qPCR验证表达并行相关免疫浸润分析.结果与结论:①经批次校正及PCA分析获得骨关节炎基因12 548个,同时获得铁死亡基因484个,进而得到24个骨关节炎铁死亡差异基因;②GO分析主要涉及对氧化应激反应、对有机磷反应等生物过程;涉及细胞顶端、顶端质膜等细胞组分;涉及血红素结合、四吡咯结合等分子功能;③KEGG分析显示,骨关节炎铁死亡差异基因与白细胞介素17信号通路、肿瘤坏因子信号通路等信号通路有关;④运用WGCNA分析及机器学习筛选后获得特征基因KLF2;通过基因芯片验证后发现实验组半月板组织中KLF2基因表达高于对照组(P=0.000 14);⑤体外细胞实验显示,骨关节炎组软骨细胞中Ⅱ型胶原、KLF2基因表达低于对照组(P<0.05),同时在骨关节炎铁死亡中肥大细胞与树突状细胞密切相关(r=0.99),KLF2与自然杀伤细胞(r=-1,P=0.017)、滤泡辅助性T细胞(r=-1,P=0.017)等密切相关;⑥结果显示,运用WGCNA分析及机器学习方法证实KLF2可作为骨关节炎铁死亡的特征基因,可能通过干预KLF2来改善骨关节炎铁死亡.

目的:宫颈癌(CC)组织角蛋白17(KRT17)、Kruppel样因子 4(KLF4)表达与患者预后的相关性.方法:选取2015 年4 月至2019 年4 月在我院妇产科确诊为CC的86 例患者为研究对象,取其癌组织和癌旁组织为CC 组和癌旁组.采用免疫组化法检测 KRT17、KLF4 的表达情况;利用 Kaplan-Meier法分析KRT17、KLF4 与 CC 患者预后的关系;COX 回归分析影响 CC 患者预后的危险因素.结果:与癌旁组相比,CC 组 KRT17 的阳性表达率显著升高,KLF4 阳性表达率显著降低(P＜0.05).KRT17 和KLF4 表达水平与肌层浸润深度、淋巴结转移、分化程度有关(P＜0.05).Kaplan-Meier 法分析结果表明,KRT17 阳性表达组患者3 年内累积生存率低于阴性表达组,KLF4 阳性表达组患者 3 年内累积生存率高于阴性表达组(P＜0.05).多因素COX回归分析,结果显示,肌层浸润深度、淋巴结转移、KRT17 和KLF4 表达是影响 CC 患者预后的危险因素(P＜0.05).结论:CC 组 KRT17 的阳性表达率显著升高,KLF4 阳性表达率显著降低,与临床病理特征存在密切关系,对CC 患者的预后有一定的评估价值.

Kruppel样因子(Kruppel-like factor,KLF)家族是一类广泛存在于生物体内的具有锌指结构的转录因子蛋白,可以结合到目的DNA上,在细胞分化和增殖方面进行转录调节[1].KLF家族共有17个因子,按照发现的时间分别命名为KLF1～l7.KLF因子C-末端含有3个高度保守的Cys2/His2锌指结构,优先结合富含GC核苷酸的靶序列或CACCC片段,而KLF因子N-末端结构的不同导致功能也不尽相同[2].已有研究报道,KLF家族成员与许多肿瘤的发生相关,例如KLF2与结肠癌[3]、乳腺癌[4],KLF5与食管癌[5],KLF10与胰腺癌[6].通过综述文献我们发现KLF家族中5个因子(KLF2、KLF 4、KLF 5、KLF 6和KLF 8)与泌尿系肿瘤关系密切,本文就KLF与泌尿系肿瘤相关性的研究现状综述如下.

目的 明确支气管哮喘患者外周血中性粒细胞内是否存在KLF2/RelA比例失衡,并探讨KLF2/RelA比例失衡与中性粒细胞凋亡的关系.方法 收集2011年4月至2012年4月在湖南省人民医院及长沙市第三人民医院住院的39例哮喘急性发作期患者,其中轻度哮喘组13例,中度哮喘组17例,重度哮喘组9例;另收集15例健康人为对照组.抽取受试者外周静脉血,分离纯化中性粒细胞,通过流式细胞术检测中性粒细胞凋亡率,Western blot检测KLF2和RelA在中性粒细胞内的表达.采用Pearson相关检验分析KLF2/RelA比值与中性粒细胞凋亡之间的关系.结果 轻、中、重度哮喘组中性粒细胞凋亡率较对照组降低[(4.45±0.76)％、(2.10±0.25)％、(1.81±0.67)％比(5.36±0.57)％,均P＜0.01],中、重度哮喘组中性粒细胞凋亡率较轻度哮喘组降低(P＜0.01),但中度哮喘组与重度哮喘组比较差异无统计学意义(P＞0.05).轻、中、重度哮喘组中性粒细胞内KLF2/RelA比值较对照组显著降低(0.667±0.351、0.384±0.203、0.536±0.293比4.038±2.011,均P＜0.01),轻、中、重度哮喘组间两两比较,差异无统计学意义(均P＞0.05).中性粒细胞凋亡率与KLF2/RelA比值呈正相关(r=0.592 0,P＜0.000 1).结论 哮喘患者外周血中性粒细胞内存在KLF2/RelA比例失衡,并且KLF2/RelA比例失衡可能是导致哮喘患者外周血中性粒细胞凋亡减少的机制.

目的 观察食管鳞癌细胞株中Krüppel样因子4(KLF4)启动子区甲基化水平对其表达及对顺铂耐药性的影响.方法 采用甲基化特异性聚合酶链反应(PCR)及反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测7种食管鳞癌细胞株中KLF4甲基化及表达水平,筛选KLF4高甲基化及低甲基化水平细胞株(TE1及KYSE140).不同顺铂浓度下,使用噻唑蓝(MTT)法检测不同细胞株的增殖活性,使用流式细胞仪检测不同细胞株细胞凋亡及细胞周期.结果 细胞株CAES17、EC109、KYSE140、KYSE70和KYSE30中KLF4相对高表达,其启动子区呈低甲基化,细胞株TE1和KYSE510中KLF4相对低表达,其启动子区高甲基化.使用5-Aza-CdR去除其甲基化可恢复TE1细胞株KLF4表达.MTT法示,在顺铂终质量浓度为0.5、1.0、5.0、10.0 mg/L时,使用5-Aza-CdR处理TE1后细胞抑制率均增加(t =5.053,P=0.007;t=3.792,P=0.019;t=5.119,P=0.007;t=7.213,P=0.002),KYSE140细胞抑制率高于TE1(t=6.156,P=0.004;t=5.463,P=0.005;t=10.211,P=0.001;t=13.278,P=0.000).流式细胞仪检测示,顺铂终质量浓度为1.0 mg/L时,使用5-Aza-CdR处理TE1前后差异无统计学意义[(6.2±0.9)％比(7.0±0.7)％,P=0.290],TE1细胞株凋亡率低于KYSE140细胞株凋亡率[(6.2±0.9)％比(9.1±1.5)％,P=0.045].顺铂终质量浓度5.0 mg/L及10.0 mg/L时,使用5-Aza-CdR处理TE1后细胞凋亡率均增加(t=7.838,P=0.001;t=5.196,P=0.007).同时,顺铂终质量浓度5.0 mg/L及10.0 mg/L时,KYSE140细胞株的死亡率高于TE1细胞株(t=4.260,P=0.013;t=10.535,P=0.000).顺铂终质量浓度0.1 mg/L和0.5 mg/L时,经5-Aza-CdR处理后TE1细胞株和KYSE140细胞株均与TE1细胞株在S期细胞比例上差异有统计学意义.结论 食管鳞癌细胞株中KLF4启动子区甲基化抑制表达,顺铂作用下,KLF4高表达可增加食管鳞癌细胞株对顺铂敏感性,使细胞周期阻滞在S期.